3IRAA

The crystal structure of one domain of the conserved protein from methanosarcina mazei go1
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
172
structure length
172
Chain Sequence
AEPNRLIKEKSPYLLQHAYNPVDWYPWGEEAFEKARKENKPVFLSIGYSTCHWCHMMAHESFEDEEVAGLMNEAFVSIKVDREERPDIDNIYMTVCQIILGRGGWPLNIIMTPGKKPFFAGTYIPKNTRFNQIGMLELVPRIKEIWEQQHEEVLDSAEKITSTIQEMIKESS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanosarcina mazei
publication title The crystal structure of one domain of the conserved protein from Methanosarcina mazei Go1
rcsb
molecule keywords Conserved protein
total genus 50
structure length 172
sequence length 172
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03190 Thioredox_DsbH Protein of unknown function, DUF255
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3iraA00
2H0HA 3J7Yb 2L4QA 4MMMA 2YOIA 4IQ1A 1R5AA 2VLVA 3RBTA 3D22A 2HZEB 3GRXA 4ECBA 1SD9A 1T8EB 3TJBA 1FG4A 17GSA 1A2MA 4K0GA 1DE1A 4LL1B 2GSTA 3LG6A 2D2ZA 4MF6A 4NAXA 2DMMA 2YWIA 2LRCA 2PWJA 4HDEA 16GSA 1EV9A 5E59A 1G6YA 5A4UA 2CAQA 3KTBA 4EDZA 2MZCA 1PN9A 1TRSA 5JWQB 3GIXA 3HHVA 4AJ7A 4HJ2A 4GXZA 1K3OA 13GSA 2H0IA 4WF4A 2XBQA 1Z7RA 1HNBA 3QAGA 1MDKA 3M8NA 1U87A 5D93A 4JZQA 2FWHA 4G2EA 5ECMB 4MDCA 2LJAA 4V2MA 3IK9A 3IAM2 4YAVA 3HYPA 5FHIA 2V32A 3GKXA 4FIWA 2YV7A 2GSQA 2WB9A 3NOFA 4GSTA 2V6KA 3ZITA 1ILOA 3GUSA 2A2RA 1EEJA 4PQIA 2WJUA 5ECNB 5CYYA 2EIRA 1VRSD 3GFKA 2IMFA 1KNGA 10GSA 2B7KA 4OFTA 1GSFA 3TJGA 3ZFLA 5HR3A 3LYKA 3EU4A 2M72A 1G6WA 2NVLA 2LS5A 8GSSA 2FA4A 1USBA 4HI7A 3L0HA 3CRUA 3KMNA 4MZBA 2J9HA 2GGTA 4GF0A 1WRYA 1LBKA 5AIVA 1YKAA 4HZ2A 4F0BA 1WWJA 1FW1A 5COHA 2VCVA 2JACA 3IR4A 3VI5A 4ZXGA 4MPFA 3L4NA 2G0FA 1WP0A 3CMIA 2MMZA 1AUCA 1TXXA 1GUHA 3TKQA 3CRTA 2HXKA 2NBSA 4FO5A 2LRNA 5J5NA 5CRGA 4KW6A 1JFUA 2EIQA 1B9YC 5JWOB 1J0FA 3KH9A 1ZYEA 4ZILA 3ZTLA 4KNDA 1EZKA 1ML6A 4KH7A 4FYBA 2FGXA 3E0UA 1DUGA 4X0XA 3MWHA 1EGRA 2FWFA 2AB6A 1WIKA 1GNEA 1C72A 4XIHA 1IYIA 5HQPA 2M46A 3G7IA 5ECOB 1E6BA 1DBYA 2O87A 4G9HA 4JR6A 3LORA 1XWAA 3WGEA 4MJEA 1XXUA 2CT6A 2JZTA 6GSVA 3LJRA 3DD3A 1JZRA 5IMFA 2DJ2A 2DIZA 2A2SA 4RQRA 1DE2A 2EIOA 4IVFA 3UL3A 3G7YA 3C1RA 1FOVA 2P0GA 1M7TA 3DWVA 1GTUA 2KP1A 2C0EA 2R6KA 3PINA 2F8FA 4PXOA 1GSSA 5G30A 4NMUA 4P3YB 1A0FA 4O92A 1TRUA 1SK2A 3VWUA 1HD2A 1EWXA 2L6CA 4HU9A 3KIJA 1GUKA 4PNFA 3P7XA 18GSA 2H74A 1OE7A 5ENUA 1YF1A 4I2TA 1PKWA 1TU8A 3GSTA 3D21A 5G1LA 2VCWA 2AV4A 5CRDA 3UARA 5G5FA 1JZOA 1M2DA 4KSMA 3GL3A 2VAFA 3KH7A 2OE0A 3HXSA 4IJIA 3LWAA 5DQYA 3QAVA 3FZ5A 5J3RA 4EKZA 4DSRA 5DQSA 1F6MC 3HA9A 3H4KA 1Q4JA 3KP8A 2PERA 2GQLA 2IFQA 3F3RA 2GSSA 4LA1A 1KEBA 2LTKA 4GQFA 1WOUA 4GCIA 2I1UA 1GTIA 1UA5A 2PMTA 2VL9A 2YWMA 3F6FA 19GSA 2I81A 1BEDA 3D5JA 1Z6NA 2GLRA 3TB2A 3U6VA 4F2IA 2N5BA 4POLA 2DMLA 5G2ZA 2OE1A 4MZCA 2H73A 3G9BA 4Q5RA 4FH8A 4ULXA 1GRXA 3QDNA 5ECKB 1MEKA 3IPZA 2XHFA 2K8SA 3ZZXA 2WCIA 2KUCA 4I5QA 5DJLA 2H76A 3GHAA 2OE3A 1V40A 5HR0A 1PGTA 2BTOT 5IMVA 4OO5A 3SBCA 4E8HA 5J4UA 5E4WA 5LCZA 1X9SB 3CYNA 1SL2B 2TRXA 1PL2A 4TR3A 20GSA 1JHBA 1NHYA 3L9SA 1J08A 4EUYA 2R5GA 2CZ3A 1B4QA 3W8JA 2YN1A 1W4VA 1FHEA 1X9MB 1YF0A 1T00A 1WMJA 2C8UA 1T4YA 3ZYWA 2MBTA 4XS1A 2VLTA 2YWOA 4KUNA 4LL4B 3KMOA 5LD0A 4ECCA 1T3BA 2O85A 4WBRD 2KLXA 1X9WB 3ZFBA 1U3AA 4NHZA 3GKKA 2RUFA 4Q5NA 3RHCA 2LKUA 4ILFA 2QKEA 5CREA 1YY7A 1ACVA 1S3AA 3A2VA 2BJXA 3FZ9A 1TJDA 5EPFA 3ZREA 2JSZA 2PN8A 1FAAA 2F8AA 1XWBA 5A4WA 2X8GA 2B5YA 1YEXA 3RHBA 4Z7XA 1T1VA 3KCMA 1U6TA 5DCGA 4BWQA 4IP1A 2DBCA 1M2BA 2YJ7A 4EXJA 3Q19A 1XVQA 2F3MA 1XOBA 1X5CA 1VF1A 2HYXA 2YCDA 2VO4A 3HJOA 5ECLB 1I9DA 3GL5A 3F4RA 2VD0A 4YAPA 2OADA 1X0RA 2XPEA 4ID0A 1Q98A 5KN1A 1Z6MA 1K0CA 5DVBA 2L5OA 3IK7A 1Z7PA 2O8VB 4PURA 1O8XA 1SL0B 1ZOFA 1OYJA 2FNOA 1AQVA 4K8MA 4ZBAA 5HR1A 2HSYA 1A23A 4XHMA 5JCUA 1ABAA 2P31A 2C80A 2F51A 3HVVA 1G0TA 2FD3A 2H1BA 1TRWA 3D4TA 3TKRA 4WR4A 1HNAA 2IMIA 1MD3A 4XRAA 2WDUA 4TR1A 3VWVA 2JADA 4IBPA 4EF0A 1MTCA 5DJMA 5JCGA 3W6GA 1EP7A 2B3SA 4MA9A 1YDKA 2HZFA 1AQWA 5IO2A 2PVOC 5F06A 5HR2A 1FB6A 2OA7A 2LJKA 5D73A 3R2QA 1XW5A 3IC4A 3ZMKA 2C3TA 4EVMA 2DJ3A 5F8BA 1W89A 2L59A 3DXBA 1AAZA 5B6MA 3HZ8A 4AJ8A 1V98A 2HNLA 4I2UA 3VWXA 5DALA 1O73A 1QQ2A 4ML6A 3WD6A 1QUWA 3BD2A 1XW9A 5F0GA 2KP2A 1Y6EA 1DSBA 2I3YA 2ON7A 1ZYQB 7GSSA 1N8JA 4LMWA 1ERVA 4ZB9A 2ALBA 3EINA 4BVYA 1XVWA 4HZ4A 2E2GA 2CAIA 3E3EA 3GTUA 3FEUA 2CVBA 4POKA 1OC9A 1O8WA 2LQOA 1BX9A 3GNJA 2WRTA 1M2AA 4BA7A 1GL8A 1QMVA 1T7PB 4ZBDA 3WGXA 1QGVA 2CQ9A 3ERGA 4N0ZA 4TR1B 5C04A 2DJKA 1OC8A 14GSA 5CNWA 5DAKA 2X8CA 1TK8B 3LXZA 3EC3A 1XOAA 5CO3A 4L5OA 3L9VA 5F05A 2ZCTA 5IMAA 4OCFA 4CDOA 3ZVJA 1X5DA 1XWGA 4J56E 5C00A 1F2EA 3VK9A 2C1YA 2RUEA 3CBUA 3TOTA 2CX3A 2V1MA 1MD4A 1OVNA 5A5KA 1BJXA 5DALB 4I97A 2MBSA 3MSZA 1YQ1A 3UBLA 3F6DA 3TJFA 1SK0A 1OKDA 4KGIA 1VF2A 4JBBA 4PQHA 1TW9A 1YKCA 3RDWA 4MF7A 5IO0A 2OJLA 3EE2A 1V58A 1JLWA 3A5WA 2CVKA 1B8XA 4TR0A 4ZL9A 4KE3A 5B6NA 1M9AA 2LUSA 4IQAA 4HOJA 2I4AA 2PVQA 4QQ7A 3FY7A 1F3BA 4KDXA 1SKRB 1VGLA 4L0WA 3GTUB 3APSA 1OC9B 2P5QA 4O7HA 4WF5A 3HJMA 2LSTA 4KDUA 3V1WA 1O81A 4HJMA 4GQCA 5H5RA 3TKPA 3QD9A 2F9SA 5DAKB 2I9HA 3M0FA 3LYPA 1TK5B 2GZYA 2PGTA 5KN2A 3CSJA 3IHQA 2GSRA 12GSA 2N5FA 1NSWA 2JZSA 2B1KA 1K0BA 4OD7A 5KEJA 5GZZB 3TKSE 2DJJA 3HVSA 3FHKA 4RQXA 3ZLPA 5B8AA 1THXA 1OC3A 1I5GA 3MDKA 5ECIB 3TUEA 2OKAA 3P2AA 1CQHA 4MP4A 3DEXA 4FYUA 5D9TA 4PQ1A 3FK8A 4JR4A 3QCPA 4LMVA 5JWRB 2O89A 3PH9A 2K8VA 2LRTA 5IPGA 3LSZA 2QC7A 3GA4A 2LEGA 2TRCP 3WGDA 2HE3A 1B9XC 2YWNA 1FB0A 1XFLA 3DVXA 1SD8A 1A8YA 2OACA 1SKWB 4MH3A 2HSHA 3EURA 2K9FA 2AUVA 4MLYA 3M3MA 4LLRA 3DGQA 1B48A 2VOCA 4L5LA 3HJPA 1XWKA 1PX7A 3HKRA 1PQNA 2CZ2A 5G5EA 2E2MA 2FUG2 3EWLA 3IDVA 2LNSA 3UOMA 1F9MA 5ELGA 3D0ZA 1TDIA 1FVKA 4ZIJA 1Z3EA 3WT2A 5ABRA 2CA8A 6GSUA 1PSQA 1V9WA 5D96A 4ZL8A 4KB3A 2NPBA 3HDCA 3F4TA 1GLQA 2XC2A 2PPTA 3TDGA 1MDJA 4NHWA 3TGZA 1T4ZA 5HFKA 4OFNA 1OAZA 2B1LA 1ZZYA 2XPDA 2KHPA 3WT1A 5ECSA 4ML1A 2HLSA 1SYXA 1WJKA 4I8BA 5AGYA 1HQOA 4F0CA 4KSOA 1GTAA 2IMKA 3IA1A 4N10A 1EP8A 4ECIA 2IMDA 4YQMA 5IOWA 2H1DA 3C7MA 1R7HA 5J9BA 4D73A 5G31A 3KP9A 2ES7A 1CQGA 1F3AA 4POBA 3KM6A 4GWRA 1M9BA 2CVDA 4IKHA 2GDRA 2REMA 1XPVA 9GSSA 4NV2A 1SL1B 1K0MA 5D9VA 4N30A 4EO3A 4Q5FA 2K6VA 3M1GA 3TCOA 2Z9SA 4V2NA 4PNGA 3UAPA 4KCEA 1FO5A 2H8LA 4V2LA 1XW6A 3UJ1A 3ZRDA 2IMEA 2FWGA 1XZOA 5KN3A 1BAYA 5CRHA 2JSYA 2PBJA 4GSSA 1XCCA 4IELA 3JCML 1SU9A 2WULA 4H86A 3IBHA 4XRDA 4PX1A 1ERWA 1TI1A 5D9XA 1OE8A 4EL1A 3S9FA 5IPHA 4WXTA 3F8UA 3UEMA 4XS4A 4K2DA 1GSYA 2FWEA 3ZIVA 1A2JA 4TVEA 1AW9A 2GZPA 4MCUA 1SYRA 3BBYA 1BQ7A 5AIXA 4F9ZA 2LV3A 1RW1A 2YP6A 3D6IA 4G19A 5AN1A 4BPYA 1F37A 2H66A 3KXOA 4D73B 3N9JA 4ZB8A 1PL1A 4HQZA 3UVTA 3F9UA 1V2AA 1O7UA 2O7KA 3MAKA 3U5RE 4JEDA 1ERTA 2V2GA 3DMLA 5GAND 1TRVA 5D9WA 3GURA 3AY8A 4N11A 5IMDA 1RQMA 3EMXA 2VD1A 2DJ1A 3GV1A 2G2QA 2VUPA 1JZDA 4NPBA 3NZNA 3VLNA 3EMPA 2VM1A 4QL7A 1H4OA 4ISDA 3ISOA 4WKWA 4WEYA 3DIEA 5J41A 1PRXA 2H01A 4O5RA 1IYHA 2IIYA 3TKSA 4ACSA 2R37A 2B5EA 1ON4A 3LEFA 2VCTA 4EDYA 2CV4A 3H93A 4V1Ag 5ID2A 4TN8A 4TRXA 1GSUA 5EL8A 3FR6A 4IP6A 4TOPA 2QSIA 2H71A 3BCIA 4NV5A 2C0DA 4XS4B 4L8EA 1EOGA 1GWCA 4MJAA 2LNTA 3UIWA 1GUMA 2HI7A 2E7PA 2JU5A 4CHSA 5JCWA 2QGVA 3GMFA 3RPPA 3UBKA 2YJHA 1X5EA 4KAEA 3F3QA 2EC4A 4K7OA 4ZBBA 4RI6A 2L6DA 4MZWA 4DSSA 1U3IA 1HNCA 5DDLA 1K3LA 5GSTA 3F63A 3KD0A 5DBQA 1SKSB 1TK0B 5IM9A 3ERWA 2GS3A 3G7JA 22GSA 1K3YA 1GULA 3I69A 1H75A 3BOAA 3VWWA 2X99A 2YNXA 3A2WA 5IMZA 3GN3A 1GH2A 2JL4A 2RIIA 2WZ9A 4X43A 1Z9HA 3TKSC 4E8EA 2AAWA 4KCAA 3ZIJA 4YQVA 4HQSA 3Q74A 3VURA 3US3A 2VIMA 2ON5A 2C3NA 3GKNA 2V6OA 3DVWA 6GSTA 5ID2B 3I43A 2FY6A 4MH2A 1YEPA 3IOSA 3QOUA 4RUVA 4MJBA 1QXHA 1PMTA 1YZXA 2H70A 5G1KA 2GZZA 1WPIA 2MMOA 2IN3A 4GLTA 1R4WA 2RM6A 2P5RA 2R2JA 2FLSA 1BG5A 1TP9A 3I9V2 1ZL9A 5CP1A 5FWGA 4OMVA 4K7IA 3VPTA 4MK3A 2C4JA 1E2YA 2OBKA 2L4CA 4DSSB 2H30A 4K6XA 4WR5A 1A2LA 3O3TA 5CAXA 2H1AA 2GTUA 4OFMA 3IV4A 3KGKA 3TRXA 3PGTA 1M99A 2H19A 1KTEA 3FKFA 5D8IA 3P8WA 2HT9A 3FZ4A 4DEJA 2V41A 3A2XA 3P90A 3FZAA 3FR9A 4IGJA 4EC0A 6GSYA 2DIYA 4NXIA 2RLIA 1GP1A 4K9ZA 3GX0A 1N2AA 3DKSA 1URMA 2HRNA 3ZVJD 2R3XA 5L71A 1PX6A 2H6YA 1TTZA 3FRCA 4PUFC 4RI7A 2LJRA 2B7JA 4AGSA 4BVXA 4HEA2 5CRWA 2H75A 1UN2A 3QFAC 2IJYA 2PU9C 4MPGA 3IAS2 1GTBA 1AXDA 3I6AA 3KTLA 3L78A 3APOA 5F07A 1SJZA 1ZMAA 3VFIA 4F03A 3QMXA 2H1GA 4TW5A 4HU7A 3D4MA 2VCZA 2XBIA 3IXRA 3TJKA 4WETA 4IHUA 4L0UA 3GYKA 4MF5A 2C0FA 3GH6A 2H0GA 4TKYA 1QFNA 1MDIA 3C1SA 1J9BA 4KDYA 5LNKe 1V57A 3CSIA 2IL3A 4QL9A 1QK8A 5HFGA 3SWLA 1JZWA 4K7NA 2DJ0A 1Y25A 1G7OA 1R5PA 4FYCA 5AISA 2YZHA 5H5QA 1K0DA 2YV9A 1K0NA 1A0RP 4OCEA 3HY2A 4GTUA 1PD21 6GSSA 4DSQA 4HUAA 2K18A 3BCKA 3GX8A 2DSAA 1M0UA 2GQKA 5J9CA 3UVHA 11GSA 3ERFA 3GKMA 2DLXA 2WGRA 2H72A 3H8QA 3KJYA 2IPAA 4NWYA 3LQ7A 1TOFA 4KX4A 2M80A 3H1NA 1EV4A 3IRAA 1U88A 3IE3A 5KN0A 1RK4A 3HZ4A 2YPMA 3BJ5A 4MABA 3LXTA 4AJ6A 2FA8A 5H5SA 3TJJA 2HFDA 2MYGA 3QAWA 1ZGNA 4ZB6A 1BYEA 3Q6OA 1O6JA 2GT6A 1NW2A 2PUKC 1XIYA 3EVIA 1EOHA 2VLUA 2WFCA 3L9UA 3EU3A 2H6XA 2B5XA 3CTGA 2ZUPA 4GSNA 6GSWA 4Q5QA 2GQMA 1JLVA 4IN0A 2LQQA 2HRFA 1K0AA 1OKTA 4IW9A 4N0VA 5A4VA 2VCXA 5IQYA 1K0OA 3ED3A 1EEMA 2E0QA 4BWSA 5ECQB 3O76A 5IIZA 1AQXA 5IOXA 3VPQA 4X1UA 4YH2A 4PGTA 1TI3A 1SK1A 3F4SA 2GVPA 1VF4A 1A8LA 3F0IA 1YJ6A 1PKZA 3ME7A 3GH9A 3O6TA 4XCSA 4AF2A 3HVXA 4K0NA 1HYUA 4YQUA 3K8NA 3RPNA 5HFIA 1AC1A 3TOUA 3N5OA 3M9JA 1A24A 3RAZA 4TR4A 1ERUA 1FVJA 3A3TA 4IJ3A 1S3CA 2GT5A 2L57A 6GSXA 5ECRB 2AHEA 5ECPB 1G7EA 1NM3A 4JE1A 2X8HA 5ELAA 1UC7A 4POMA 3UMAA 4I6XA 2H6ZA 2RM5A 2DC5A 5INYA 2OBIA 5GAPD 4GRFA 4XTSA 3MNGA 3PR8A 4PUAA 2MMNA 1AIUA 1B4PA 2TIRA 1XWCA 4TXVA 4BL7A 2VL2A 3APQA 3FR3A 1UVZA 2FHEA 3LFLA 5IMCA 2C0GA 5EVOA 3C71A 3TRPA 3WYWA 3C73A 2WS2A 3ME8A 1GLPA 3KZQA 4WBJA 2IFQB 1VF3A 2AYTA 1LU4A 5EY6A 3NIVA 2JZRA 1R26A 2VM2A 4ZL7A 1GSQA 1ST9A 5FT3A 1SJIA 5B7CA 4J57E 3TRQA 2B6MA 1O85A 3HD5A 4XS6A 1NHOA 4OWYA 2J23A 1SENA 3C8EA 3J7Yk 3CXGA 2VCQA 4OO4A 4TXOA 3QR6A 4J2FA 3E9JB 1GSEA 4JRRA 2VL3A 1XBSA 2BMXA 3QPMA 2FCHA 3DYRA 2X64A 3GSSA 3FW2A 1KBNA 5DCHA 3LGCA 2VL2C 2HZEA 3FYGA 1WE0A 2YZUA 4V1Ap 3EYTA 3M9KA 3HCZA 3H79A 4G10A 1GNWA 1TU7A 2IWTA 1SJ6A 4MJCA 3VI7A 4F82A 2C3QA 3ZMLA 2A4VA 3QFBC 4K1FA 5B8BA 2MMAA 1TKDB 1LJRA 3CSHA 2YANA 4KA0A 2R4VA 4HS1A 2L5LA 4ECJA 2ZNMA 2NTOA 2NDOA 4O32A 1ZCPA 3DRNA 3KEBA 2N5AA 3W8SA 2AJQB 1EGOA 4TXOB 1S3DA 2CX4A 1GSDA 1PA3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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