1BEDA

Structure of disulfide oxidoreductase
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
AQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVRRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSVKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of TcpG, the DsbA protein folding catalyst from Vibrio cholerae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA OXIDOREDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
total genus 56
structure length 181
sequence length 181
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1bedA00
1FB6A 2YP6A 1A2LA 4JU5A 2YJHA 4HU7A 2B7KA 2ZCTA 5CRWA 5HR1A 5D73A 3L78A 1V40A 2MMAA 1SU9A 2YWMA 4K7NA 3W8JA 4MF5A 1Y6EA 3CTFA 1YDKA 4O7HA 1FVJA 1QUWA 2HI7A 2HYXA 3F6DA 2VLVA 2YWOA 3IOSA 3ZL5A 1JLVA 1PQNA 1A0RP 3FYGA 2ON5A 3P7XA 1DE1A 1OYJA 2DJ0A 2XPDA 4EO3A 4KSMA 2P5RA 5IO2A 4BVYA 3GN3A 2YV7A 3R2QA 3KTLA 3TOTA 1SYRA 2X8HA 3BCIA 4IN0A 4TR1A 1SJIA 2VO4A 2H0GA 2A2RA 2FWHA 2RUFA 1GULA 2AJQB 2YZUA 2KOKA 5DVBA 1X5DA 2LKUA 4K7IA 1DE2A 4HU9A 3QAWA 3F0IA 5B8AA 1YZXA 1HNAA 4ZB9A 2JADA 3DEXA 4MJAA 2LRNA 2FLSA 4D73A 3FR3A 2HZFA 3HVSA 1PD21 1K0DA 2BJXA 2C0DA 2VCXA 1T1VA 3TKSA 4YAPA 2RM6A 4J2FA 3SBCA 1MDIA 4KX4A 1ERVA 3I43A 1GSEA 1SK2A 3EVIA 3LEFA 2O87A 1PX6A 16GSA 1JFUA 4POLA 5DCHA 3HVXA 3TB2A 2C0GA 4HJMA 4HJ2A 5B6NA 4KSOA 3UBKA 1SL2B 4N0ZA 2LNTA 3F4SA 4OCFA 2B3SA 5A5KA 4EXJA 4F2IA 1GSFA 3F3QA 4ZXGA 4NWYA 2PBJA 1A24A 3TOUA 4LLRA 13GSA 1EEMA 1THOA 1RQMA 2FNOA 2JL4A 1FO5A 4Z7XA 1TK0B 4K0GA 1SJ6A 3RDWA 2QSIA 4FO5A 4X1UA 4FYBA 3F8UA 4KH7A 1FVKA 1WWJA 5AN1A 2B5EA 3IE3A 3VLNA 4OFNA 2PUKC 1K0AA 4F82A 1YF1A 3MDKA 4BWSA 1OE7A 1WMJA 2CX3A 4KAEA 2WRTA 1VF4A 1AUCA 4FYUA 2WZ9A 2ALBA 4FYCA 5ECIB 2JSYA 1U87A 1SL0B 1USBA 1B9XC 1H4OA 2P5QA 1O6JA 4AGSA 2GT5A 1GSUA 1BJXA 4ULXA 2H8LA 3ZTLA 4L5LA 4XS4A 3W8SA 2JZTA 1A8LA 2H73A 3Q18A 2B1LA 2DJKA 3VFIA 2CZ3A 2V32A 3IBHA 1V57A 4D73B 2A2SA 4PXOA 3JCML 3A2VA 9GSSA 4BPYA 4OWYA 2LJRA 1XXUA 3RBTA 4RQRA 1VF2A 3KJYA 5EPFA 2LQQA 4TXOA 1A0FA 1H75A 3QR6A 1CQGA 2DJ1A 1DSBA 4BVXA 1EOHA 4ISDA 1Q98A 2H1BA 4ZB6A 2LJKA 5HFKA 4ECBA 3F4RA 3TKPA 4EDYA 2GZPA 4HZ2A 1ZL9A 3CSIA 5DALA 5HR3A 3HJOA 1M2AA 3EURA 1GTIA 1GUMA 2WJUA 2HXKA 3CRTA 3UBLA 4GXZA 3I6AA 5CYYA 2MMZA 1FHEA 1WPIA 1K0BA 1SD8A 2F9SA 2EC4A 4EKZA 3E0UA 3TRXA 3HCZA 5DQSA 3BBYA 1A2JA 4I97A 5DJMA 2V2GA 3G9BA 4EL1A 2DJJA 4PUFC 1GLQA 3L0HA 4IKHA 3UMAA 3HZ4A 2JACA 4TVEA 2FY6A 1AQWA 1AIUA 3L4NA 2K8VA 1OAZA 1BEDA 3CRUA 3ED3A 1K3YA 5H5RA 4PNFA 3APQA 3C7MA 4XRAA 5KN0A 4IQAA 5JCUA 1FAAA 3KXOA 2VL3A 5INYA 5ENUA 1SK0A 2JSZA 1UVZA 2VCZA 1E2YA 2IWTA 5D93A 1MDKA 2PVQA 2CAQA 1ST9A 4NXIA 2C4JA 2C3NA 3ZIJA 3W6GA 2OA7A 1QMVA 5ECPB 2VM1A 4MPGA 4WR4A 4HEA2 1WJKA 3QFBC 2L5OA 4MH3A 1XIYA 5IO0A 5AIXA 2GSTA 4YQVA 4K2DA 4TXOB 4NHWA 2H70A 3K8NA 2PERA 5D9XA 1M9AA 1GLPA 1V58A 1S3AA 2KP1A 5F0GA 5KN2A 4JRRA 1BG5A 1EGRA 1NW2A 3V1WA 2I3YA 5DALB 2YV9A 5H5SA 1TXXA 1M0UA 1AAZA 3TRPA 3ME8A 3KEBA 2L59A 4BA7A 1OKTA 1J0FA 4Q5NA 3LGCA 6GSTA 1A23A 4NV5A 1F9MA 2H19A 4ZBAA 2HZEA 2LTKA 1PA3A 2DMLA 1XZOA 2L57A 5B7CA 3GYKA 1PX7A 3HDCA 2OE3A 1U88A 1GSSA 2IFQA 5IPGA 5G1KA 1X9WB 3KGKA 1WIKA 1J08A 3S9FA 1Z6NA 3C71A 1Y25A 2PU9C 4V2LA 2CVBA 2FCHA 3FHKA 3GA4A 2H76A 2GLRA 2KHPA 2RUEA 3QAVA 3IA1A 1F3AA 2H66A 3QD9A 4DSQA 3TKSE 5ECNB 2YZHA 1YEPA 1HD2A 3VPQA 1XWBA 3KP9A 2FWGA 4TW5A 4IQ1A 2IJYA 1V2AA 5GSSA 1MTCA 1F6MC 3DVXA 2B5YA 3TJGA 1PKZA 5LD0A 5ABRA 1SKRB 3IK9A 3AY8A 2HRNA 1SKWB 5ECKB 4ZL7A 3Q6OA 1OC9B 3EE2A 3UAPA 1WOUA 4MJBA 1A8YA 1X5CA 3H79A 4MA9A 3EMXA 2CT6A 3BJ5A 1NHYA 1F3BA 7GSSA 6GSYA 1T7PB 3GKNA 2HE3A 2WCIA 1KNGA 5D9WA 2GQLA 2J23A 3ZYWA 1YQ1A 5A4UA 3GKKA 5CRGA 4P3YB 3WGDA 1JLWA 3DRNA 1EP7A 2LS5A 2NPBA 3GRXA 2H30A 2C80A 2HNLA 2OE1A 2L4QA 4K1FA 2K6VA 4KCAA 5GAND 1ILOA 3A5WA 4QQ7A 3TJKA 1XOAA 2DIYA 5AIVA 3N9JA 3A2XA 1V98A 4MH2A 2M72A 1A2MA 3D6IA 5E59A 4JZQA 1TJDA 1VGLA 4PGTA 4POKA 4KW6A 1R7HA 2CV4A 1SK1A 3F3RA 3UL3A 4ACSA 4X43A 2GTUA 4I8BA 4HQSA 1T3BA 2VCTA 2O7KA 1T4YA 4PQ1A 5FWGA 2D2ZA 1M99A 2H1DA 3LSZA 1UA5A 3ZLPA 4WR5A 4IBPA 4WXTA 1GNWA 4WBJA 4Q5RA 1BAYA 2EIOA 1MD3A 5HR2A 3VPTA 1XW6A 1O73A 1V9WA 3KCMA 3KH9A 3HA9A 1OKDA 4N0VA 2GGTA 5JCWA 1JZDA 3LORA 5KN1A 3GNJA 2LEGA 4ZBBA 3O76A 3TUEA 3UARA 4POBA 2GSSA 3WT1A 3NZNA 1IYHA 5COHA 1EEJA 1VRSD 3Q74A 1PSQA 3IAM2 2M46A 5JCGA 4YQUA 5DAKB 3WT2A 5IQYA 4MK3A 1CQHA 3O3TA 5D96A 22GSA 1GNEA 4NHZA 10GSA 4GRFA 3HXSA 3ZREA 5H5QA 2C0FA 2JZRA 3FEUA 2CA8A 3EYTA 1WE0A 2REMA 2XBIA 5KEJA 1Z7RA 1JZOA 2VLUA 2VOCA 1Z7PA 4ZB8A 1FB0A 1M2BA 4EF0A 4WETA 5D9TA 1TRVA 2MYGA 1K0NA 3HJPA 2LUSA 2E2MA 12GSA 1NM3A 4IW9A 4I5QA 1PL2A 2VM2A 1SYXA 4MPFA 2QKEA 3RHBA 8GSSA 1AW9A 1QQ2A 1K0MA 5J9BA 2PGTA 5CREA 1LJRA 20GSA 1Z3EA 5ECQB 2IN3A 3D5JA 4XS6A 1XPVA 4MJCA 1TI1A 3GSSA 2I81A 1GRXA 1PKWA 4LMVA 1ZYQB 2V1MA 5D8IA 5DCGA 3N5OA 1TP9A 5CP1A 4WKWA 1X9SB 2YNXA 3RPPA 1B8XA 4L0WA 2R2JA 17GSA 1TRUA 1Z5YE 3CTGA 2OBKA 4TR1B 2I4AA 1TKDB 2N5AA 4J57E 2H0HA 4EVMA 1EV9A 1HNCA 1O8XA 1G0TA 3FRCA 1K0OA 1KEBA 1U3IA 2JU5A 5ECLB 1X9MB 3DWVA 2AUVA 4L5OA 4KGIA 5ECRB 2MBTA 4RI6A 2RLIA 1S3CA 4KCEA 3VWVA 5E4WA 4IHUA 1UN2A 4LA1A 3ZVJD 5ID2A 5IM9A 4TKYA 1SENA 2QGVA 1O8WA 1Z6MA 14GSA 2BMXA 4PURA 1B48A 2PVOC 3BCKA 2YCDA 3H1NA 2P31A 5IMAA 5ELAA 1NSWA 2YOIA 1NHOA 5A4VA 4IVFA 3P2AA 1EZKA 5EVOA 1RK4A 5J5NA 1J9BA 2DSAA 1XFLA 3KM6A 3Q19A 2E2GA 19GSA 4CW9A 4DEJA 1GSYA 5B8BA 4F0BA 3M9JA 1QXHA 2VD1A 3EC3A 3VI5A 1XWAA 4KDYA 3ZMKA 1G7EA 4HZ4A 5J4UA 5C04A 1M2DA 1GWCA 3PR8A 2I9HA 2N5BA 4YH2A 2VIMA 5G1LA 4RI7A 2FGXA 5J3RA 5ELGA 2O85A 2IMFA 3F4TA 2LRTA 1O81A 3GHAA 1OC3A 1BX9A 2F8FA 1GSDA 2MMNA 1Q4JA 2HT9A 4YAVA 3GL5A 4YQMA 1DUGA 1EV4A 1XVQA 1THXA 2HFDA 1FG4A 1ACVA 4IGJA 2E7PA 3PGTA 4EUYA 3TCOA 2O8VB 1ON4A 4EE0A 3WD6A 1SKSB 1XWKA 4IS0A 5DDLA 2HSYA 4XS4B 3DIEA 4KDUA 3QPMA 2FA4A 4GQFA 2YJ7A 4EDZA 4ECIA 2OBIA 1F37A 1N2AA 2YWIA 2VUPA 2K8SA 1ZCPA 3IK7A 4RUVA 3KP8A 2XPEA 1ABAA 2PN8A 5ECSA 2X8CA 4AJ6A 11GSA 1GTAA 2RM5A 3GUSA 4DSRA 3FZ5A 4N30A 4MP4A 1IYIA 2OKAA 2DLXA 5F05A 4TXVA 4G19A 3MWHA 3M1GA 5IMDA 4TOPA 3DXBA 2WFCA 4FH8A 3NOFA 1OC8A 2GZZA 1BYEA 3LQ7A 1PRXA 3RPNA 1SL1B 5G5EA 2YN1A 5IPHA 1SJZA 3US3A 2ZUPA 3LYPA 2C0EA 2H6YA 5JWOB 5J9CA 1EOGA 1U3AA 2VCWA 3VWWA 1JZRA 1VF3A 4ML6A 4JBBA 2HRFA 3H4KA 1JZWA 3D4TA 5IIZA 3D0ZA 2XC2A 2IMKA 3HJMA 3KMNA 2YWNA 3L9UA 3HY2A 3O6TA 2QC7A 2A4VA 4LL4B 2IMDA 3HHVA 4AJ8A 3M8NA 2DC5A 1R5AA 3I69A 3C1RA 4DSSA 3CSJA 3TJJA 1T00A 3BOAA 3QCPA 3GX8A 5G30A 4MF6A 4GLTA 5GSTA 3EU4A 2IMEA 4XCSA 4AJ7A 4K0NA 1ZYEA 3E9JB 2FA8A 5HFGA 1XCCA 5EY6A 2R37A 5A4WA 2CVDA 5G5FA 3KH7A 3WGXA 1GUKA 3APOA 2VCVA 4I6XA 2L6DA 2AHEA 1EGOA 3BD2A 3APSA 1TW9A 3M0FA 4GSNA 4GCIA 2B7JA 3FZAA 3M9KA 4F0CA 3FZ4A 4HUAA 3VURA 6GSVA 4I2UA 1EP8A 3KIJA 2P0GA 2GT6A 2FUG2 2LSTA 5LCZA 1WRYA 4ZIJA 1YY7A 5F8BA 5FT3A 1TU8A 3LYKA 3QOUA 2WDUA 5JWRB 1ZZYA 2CX4A 3FY7A 2KUCA 3MSZA 2FWEA 5IOWA 2R3XA 4BWQA 4J56E 4WBRD 4OO4A 2HZEB 3EINA 4JEDA 2HLSA 3H93A 5IMZA 5HFIA 3ZIVA 4V1Ag 2V41A 4TR4A 1QFNA 6GSUA 2H1GA 1W89A 5C00A 2IFQB 1YKAA 2CVKA 2CQ9A 4XHMA 2GDRA 3IDVA 3UJ1A 5F06A 4GQCA 2E0QA 4MLYA 1TDIA 4IP1A 3FK8A 3ERFA 1YEXA 2V6KA 2VD0A 3PH9A 3QAGA 3ZVJA 2B5XA 5J41A 1PMTA 1K0CA 4GWRA 3FR9A 1I5GA 3HZ8A 1AQVA 2FD3A 1PN9A 1K3OA 4ID0A 3D21A 3LJRA 3FZ9A 1LU4A 4HOJA 4O5RA 3GMFA 2H01A 2GSQA 1JHBA 2GQMA 2PMTA 5CO3A 1ERTA 4H86A 1M9BA 2NVLA 2GQKA 3DVWA 4JR4A 1ERWA 4QL9A 1KTEA 3D22A 3LXZA 5JWQB 2DJ3A 2VL2C 1G7OA 3CBUA 3G7IA 4LMWA 4WF4A 1TI3A 4X0XA 2LV3A 1X5EA 2NDOA 4NMUA 1FOVA 2XBQA 1XWGA 3PINA 4O32A 5AGYA 2IPAA 3H8QA 1AC1A 3LWAA 5L71A 4WF5A 1TTZA 1XW9A 4ML1A 1MD4A 2AYTA 3GH9A 2H6ZA 3IV4A 2F3MA 1ZGNA 2DBCA 3ZMLA 1PGTA 4HQZA 2L6CA 1BQ7A 4KA0A 1TRWA 2VCQA 1GTUA 4PUAA 2DJ2A 1I9DA 3J7Yk 4ZILA 3LFLA 3CYNA 4IP6A 2DMMA 4KUNA 1XW5A 3G7JA 4EC0A 1VF1A 2N5FA 3ZFBA 1TRSA 4O92A 3KTBA 2K9FA 3TJBA 1GL8A 5F07A 2C1YA 2H0IA 1HQOA 4NPBA 4KE3A 2JZSA 1FW1A 2AB6A 4XTSA 3LG6A 3TRQA 2CAIA 3ZITA 3L9VA 3HVVA 1N8JA 3C73A 4MZBA 1O7UA 3J7Yb 2FWFA 2L5LA 4KDXA 4POMA 1R5PA 3WYWA 1MEKA 2G0FA 1C72A 2X99A 1K3LA 2MBSA 2CZ2A 4MZWA 3UOMA 2WULA 2HSHA 2LJAA 2ON7A 3IRAA 4TR0A 3GL3A 3FR6A 4G2EA 3GV1A 2OADA 3DD3A 4IJ3A 4FIWA 5IMCA 1X0RA 5ECHB 2WB9A 2BTOT 1XVWA 4IJIA 3WGEA 3TDGA 4BL7A 4K7OA 4E8HA 2MZCA 4L0UA 2OE0A 3GURA 4XS1A 4GSSA 5D9VA 1TK8B 2C8UA 2G2QA 3FW2A 2PWJA 1G6YA 3F9UA 4NV2A 4N10A 2WGRA 4E8EA 3KZQA 2GZYA 5ECOB 4I2TA 3D4MA 3A3TA 3HD5A 2TIRA 1YF0A 1G6WA 4F03A 4OFMA 5IOXA 2R6KA 4KNDA 4Q5QA 3UEMA 4K8MA 3MAKA 1XOBA 2R5GA 3VWXA 3A2WA 2H1AA 1GSQA 3CXGA 2WS2A 2LNSA 1B4PA 2F51A 5HR0A 4TN8A 1SD9A 1DBYA 3KMOA 2GVPA 1OVNA 3F6FA 4JE1A 2KLXA 4PQIA 3ZZXA 1YKCA 3E3EA 3OR5A 2YPMA 4PX1A 6GSXA 1Z9HA 2B1KA 2H71A 2KP2A 4ZL9A 5G2ZA 5GAPD 5CRHA 1XWCA 4OD7A 5CNWA 3DGQA 6GSWA 2ZNMA 3VK9A 5FHIA 2FHEA 3IPZA 1S3DA 3HYPA 3U5RE 5CAXA 5HQPA 3NIVA 3ERGA 4GSTA 2TRXA 4OMVA 4L8EA 4DVCA 2GS3A 2M80A 3DKSA 3EU3A 3IXRA 1T4ZA 4NAXA 3MNGA 4LL1B 1URMA 3GX0A 2VAFA 5LNKe 3GTUA 4JR6A 1R4WA 2OJLA 4K9ZA 4ZL8A 2GSRA 2X8GA 3L9SA 2X64A 2C3TA 3UIWA 1T8EB 1HNBA 3C8EA 2V6OA 2NBSA 4MZCA 2H72A 4ZBDA 3G7YA 3TKSC 5ID2B 4QL7A 3C1SA 3ZRDA 1ZMAA 2VL2A 18GSA 2H6XA 1UC7A 1OC9A 3GFKA 4PNGA 4KB3A 6GSSA 4V2NA 2YANA 2DIZA 3QDNA 3EMPA 2K18A 4GF0A 4XIHA 1LBKA 3RAZA 2AAWA 1GUHA 5B6MA 1O85A 5DJLA 3FKFA 1B9YC 3KD0A 4MMMA 2IIYA 5ECMB 4CDOA 3CSHA 3RHCA 1QK8A 3TGZA 2H74A 2L4CA 1XBSA 1B4QA 2VLTA 2J9HA 4AF2A 3SWLA 3U6VA 3GKMA 4XRDA 4V2MA 3F63A 4ILFA 1GH2A 2MMOA 3VI7A 2PPTA 2Z9SA 5G31A 5AISA 5IMFA 3TJFA 2AV4A 3IR4A 2B6MA 4OCEA 1R26A 1ZOFA 5CRDA 1F2EA 4MF7A 1YJ6A 4MABA 1TU7A 5EL8A 1E6BA 2RIIA 4OFTA 3ZFLA 1HYUA 4G9HA 3I9V2 2F8AA 3GH6A 2H75A 3GTUB 4MCUA 3IAS2 2ES7A 3P90A 2TRCP 4G10A 5DQYA 3GKXA 1W4VA 3QFAC 4CHSA 5DBQA 3HKRA 2IL3A 1KBNA 1TK5B 2I1UA 4GTUA 3M3MA 1EWXA 1QGVA 2XHFA 3TKRA 3IC4A 4TRXA 3QMXA 3EWLA 4OO5A 4V1Ap 1PL1A 2LQOA 4Q5FA 2O89A 4IELA 4RQXA 1AXDA 3UVHA 2EIQA 2VL9A 4ECJA 3UVTA 3ISOA 3IHQA 3DMLA 1M7TA 1GP1A 4HS1A 4TR3A 5DAKA 2EIRA 1GTBA 5KN3A 3ME7A 4ECCA 3GSTA 2LRCA 3ERWA 3CMIA 3VWUA 5GZZB 2OACA 1AQXA 2R4VA 4HDEA 5IMVA 2IMIA 3DYRA 2NTOA 4WEYA 1U6TA 4MDCA 3LXTA 4HI7A 2C3QA 4F9ZA 4PQHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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