1BEDA

Structure of disulfide oxidoreductase
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
AQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVRRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSVKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords DSBA OXIDOREDUCTASE
publication title Structure of TcpG, the DsbA protein folding catalyst from Vibrio cholerae.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 56
structure length 181
sequence length 181
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1bedA00
2F3MA 3GX8A 3N5OA 4JBBA 4XCSA 7GSSA 2ES7A 3BCIA 3O6TA 1K0CA 1GNEA 1HQOA 1JZRA 1MTCA 4NPBA 2PU9C 4NWYA 4AGSA 2LNTA 4MCUA 4OFTA 4WR4A 3ZYWA 1TK5B 3MWHA 4AJ6A 3BCKA 2AB6A 4K7NA 1WP0A 1EOGA 2LKUA 4ZIJA 1M7TA 3GFKA 3W8SA 4XS6A 4F82A 4YQVA 3HA9A 1GUKA 4FYBA 2LSTA 3HVSA 4KX4A 3VI5A 2HSHA 1TW9A 1JLVA 2LRNA 1XOBA 3M0FA 5D96A 4TN8A 2VCQA 1EGOA 3GYKA 4BVXA 3G7IA 5HR2A 3E9JB 3C71A 3GH6A 3BOAA 5AISA 2YP6A 2EIQA 1YF1A 2DSAA 4MH2A 2H66A 4WBJA 2GQKA 3HZ4A 2IWTA 2WS2A 4OFNA 3P7XA 4IVFA 2YWMA 4GQCA 2F8FA 4YQMA 4G2EA 3TKSA 2DJJA 2X8GA 1TU7A 4K9ZA 4J56E 6GSWA 2JZSA 2OA7A 4EO3A 1ZOFA 1GWCA 3A2VA 5ECQB 1NHYA 4ZBAA 3GL3A 3PR8A 1AQXA 1XWCA 1SYXA 1XW5A 3H4KA 4WF4A 5D8IA 2M72A 3WGEA 2VIMA 5C04A 4AJ7A 2VOCA 2MBTA 5J9CA 5DJLA 3CSIA 3O3TA 3CSJA 4POKA 5IIZA 1GTAA 1TJDA 2C0EA 1U6TA 3ZFBA 4XHMA 4OCEA 1H4OA 1OE7A 4PQHA 2M80A 1RW1A 1OC3A 1XBSA 1RK4A 3Q6OA 1TDIA 3WT2A 4MJCA 3TOTA 1USBA 3UAPA 3HJOA 1QGVA 2B5YA 2N5AA 1O73A 2K18A 2CZ2A 3QCPA 4HU7A 1TU8A 4F0BA 3PH9A 4MJBA 2DJ3A 3U5RE 2K9FA 1QK8A 3PINA 3GL5A 5F0GA 5HR1A 4LL4B 2R3XA 1ILOA 2L4CA 2H1BA 1TK0B 5ELAA 2P31A 5G1LA 4MDCA 1EV9A 3D0ZA 2P5QA 1WJKA 2AYTA 1YQ1A 4FYUA 4L5OA 3GHAA 1U87A 5AGYA 1U3AA 1Z7PA 5DQSA 3KP8A 4JZQA 1FHEA 2KP2A 1F3BA 5ID2A 1YY7A 1FVJA 3FZ5A 4LL1B 3TDGA 2B5EA 2HYXA 4DVCA 2YWNA 3I6AA 5COHA 3TGZA 3KH7A 1GTBA 3W8JA 3VPQA 1B4PA 3RAZA 3TJGA 3H8QA 2OBIA 3CMIA 3CRUA 2VD0A 4BA7A 1NHOA 2I81A 5EVOA 3FHKA 3M3MA 1X9WB 4IJ3A 5ABRA 3DGQA 4HJMA 1Z9HA 1G7OA 2L57A 5DVBA 4MMMA 3VK9A 2VO4A 4DSQA 2NTOA 5GSSA 1SKSB 3BD2A 2HXKA 3G7YA 2HZEA 4EUYA 4K7IA 6GSVA 3K8NA 5D9VA 2DC5A 3GV1A 4IBPA 2C3NA 3ERFA 3P2AA 4YH2A 2IPAA 1XWAA 1PA3A 4JE1A 3HHVA 3NZNA 2RM5A 4DSSB 3GX0A 3QAWA 1ZGNA 1FG4A 4QQ7A 1GNWA 1BX9A 4G10A 10GSA 3QAGA 5D9WA 3HJMA 1FOVA 1URMA 2ON7A 3IBHA 2O89A 1SD9A 3JCML 2VAFA 3ZIVA 2YV7A 2AJQB 2YPMA 1ZL9A 1DUGA 5KN1A 2GGTA 3KMOA 5LCZA 3EU3A 2K8SA 1CQHA 2RUEA 4IJIA 5GAPD 3VLNA 2E0QA 1H75A 5CRHA 2VCTA 3ZVJA 1LBKA 3J7Yk 3TKRA 3GKMA 1UN2A 1Y6EA 1K3LA 3S9FA 5CRGA 1I5GA 2V1MA 4O32A 1GSEA 3M8NA 5DQYA 5C00A 1JFUA 1OVNA 2LJRA 4V1Ag 3L4NA 4I2UA 3KGKA 3DVXA 1X9MB 3EMXA 1PX7A 4F9ZA 4HJ2A 3F8UA 2RM6A 5ECRB 2VLUA 4L0WA 2GTUA 3TOUA 4GLTA 3WT1A 2BMXA 4IKHA 4LMVA 3TKSC 4NHZA 4F2IA 4Q5RA 3DYRA 5CRWA 2OE3A 2XC2A 4L8EA 2B1LA 3WYWA 3Q74A 4V1Ap 2LNSA 1T7PB 20GSA 4MZWA 2DIZA 3I9V2 1M99A 2QSIA 1WIKA 4FIWA 2NPBA 3ZIJA 1YKCA 1TRUA 5IOWA 3HCZA 5J3RA 4TXOB 3F6FA 1T1VA 5CAXA 5A4UA 3F4TA 4KDUA 2IMIA 9GSSA 4K2DA 2C80A 1SL1B 1OKTA 2H19A 4MZBA 4EXJA 1A2MA 1GTIA 1WPIA 4KA0A 1DSBA 1G6YA 4GF0A 2M46A 4TR4A 2CVKA 2NDOA 5CREA 1X5CA 1XFLA 2A2SA 3TJFA 3LSZA 3M9JA 4OWYA 1XW6A 1NSWA 1VF1A 4MZCA 4KCEA 3VURA 1J0FA 3FR6A 3FZ9A 3RHCA 2YWOA 2LQOA 1HNCA 4O92A 2J9HA 2OKAA 1GSFA 4EC0A 2LRTA 1B48A 3APQA 2ZNMA 2LV3A 1YZXA 3F63A 1EZKA 4CHSA 3ZRDA 4Z7XA 2WJUA 5IO2A 1XXUA 3D21A 1K0MA 4WXTA 2C4JA 4QL7A 5E59A 2H01A 5F8BA 5J4UA 1X5DA 3CRTA 1N2AA 3TJBA 1GH2A 4TOPA 4KDYA 3KP9A 5ECSA 2H72A 2FGXA 3P8WA 2H1DA 4IGJA 1DBYA 3EE2A 4LMWA 3D5JA 2DMMA 5B6MA 2CQ9A 1Z7RA 1MD4A 3FYGA 1M2DA 3FZ4A 4I5QA 1O81A 3BBYA 4J57E 5ECLB 2LTKA 5INYA 4EVMA 3ZZXA 2MMZA 4PNFA 1OE8A 3KTLA 3QMXA 3TUEA 3ZMKA 2VM2A 1VF3A 3QFBC 2OADA 3IHQA 2LRCA 5ECNB 1B9XC 1FO5A 2PGTA 3GN3A 2KLXA 3IA1A 3F9UA 3VPTA 1TK8B 3QFAC 1ABAA 2Z9SA 4PQIA 1U88A 5A5KA 3L78A 3GIXA 1K0OA 3TRPA 1DE2A 2G2QA 3HJPA 2VL9A 3US3A 5A4WA 2LEGA 1LJRA 5DAKB 4TR3A 5JCWA 4TVEA 4FYCA 3FR3A 1C72A 4GTUA 5AIXA 4I2TA 4ML6A 4RQRA 3I69A 1TI3A 2EC4A 1MDIA 5ECKB 3UMAA 4OCFA 4IN0A 4IHUA 2H1AA 3LXTA 4DSSA 1TOFA 1KBNA 3ZITA 2C8UA 1YEPA 5IMCA 1FB0A 2H0HA 1QFNA 1M2BA 2MMNA 5ECOB 3VWXA 2ALBA 2PMTA 3ZVJD 2E2GA 3E0UA 1I9DA 3G9BA 2F9SA 4IS0A 4ZXGA 4IQAA 4KUNA 2JZRA 4WETA 2AV4A 2P0GA 1K0NA 3KJYA 1BQ7A 3VWVA 1QQ2A 3GKXA 2ZCTA 3TRXA 4JU5A 3NIVA 1EV4A 2YV9A 3CTGA 4BL7A 5EL8A 3IR4A 1A8LA 1PL2A 1K3YA 5ELGA 2X99A 3QD9A 1PGTA 1A24A 4HOJA 1FAAA 4Q5FA 3LG6A 1V2AA 4ECCA 1G0TA 4KGIA 3GKKA 3VFIA 1KNGA 1YEXA 4Q5NA 4I97A 1OAZA 4ZBDA 4WF5A 3TB2A 1YF0A 1A2LA 4XS4B 2KOKA 2IJYA 4TKYA 3ZREA 1FB6A 2MZCA 3FZAA 4TXOA 1SK0A 4OO5A 1HNBA 2H71A 5LD0A 2H8LA 2WB9A 4KCAA 4YAPA 3ERWA 3CSHA 3FKFA 3GTUB 2X8HA 4MK3A 4NMUA 4F03A 2H6XA 2GS3A 2L5OA 3UL3A 1Z6MA 1UA5A 2PVOC 4AJ8A 5HFGA 4ECIA 1XWKA 3DVWA 4ID0A 2H30A 1MEKA 4H86A 5CP1A 1M9BA 2V41A 1ZYEA 2C0GA 2GT6A 1GSUA 4L0UA 4ISDA 2DJ1A 3VWUA 1PL1A 5D73A 3DWVA 3GH9A 3UIWA 2CA8A 3F0IA 2IL3A 5J5NA 2I4AA 4I8BA 2EIRA 3APSA 5HFKA 1OYJA 4LLRA 5H5RA 4ZB6A 3KZQA 18GSA 3EYTA 4XRAA 2B7JA 3ZMLA 5B8AA 2BJXA 1EP8A 2H6ZA 1S3AA 2C0FA 4KH7A 2A2RA 4ZBBA 3UEMA 4K0GA 4NV2A 1CQGA 4MF7A 3HD5A 5IOXA 3DEXA 5D9XA 5IQYA 5IMVA 5CO3A 1V9WA 1GSSA 4LA1A 1O6JA 4CW9A 3FEUA 2YWIA 3DD3A 3IC4A 2YOIA 1F9MA 3H1NA 4L5LA 1E2YA 1VF2A 2DJ0A 5F05A 5G2ZA 4MABA 3ZFLA 4XTSA 2CT6A 1QMVA 4RI7A 3DKSA 1GSQA 5IMZA 3HVVA 1B4QA 3LJRA 3IAM2 4HZ4A 2B6MA 3IAS2 2VLVA 3J7Yb 1Q4JA 1GUMA 1BG5A 3L9UA 1SJIA 1XVQA 4RQXA 2MYGA 1VGLA 1WWJA 2L5LA 4HZ2A 4PURA 4ZB9A 2V32A 1OC9B 1WMJA 3ED3A 4TW5A 3HZ8A 2XBQA 5G30A 2EIOA 1X5EA 3FR9A 1UVZA 4XS1A 4TR1B 1PX6A 2JSZA 1B9YC 2O7KA 1K0BA 2DJ2A 4G19A 3KXOA 2GSQA 3DXBA 1O8WA 4KSMA 4WBRD 2X64A 3GA4A 1FW1A 1TTZA 5GAND 2JADA 1A0FA 3HKRA 1PRXA 5DAKA 3PGTA 3LGCA 3LXZA 3H79A 2VCXA 3C73A 1V40A 4KB3A 3MSZA 5HFIA 1SD8A 3KIJA 3TJKA 2C3QA 2WCIA 3HVXA 1G6WA 1Q98A 4ZL8A 2YN1A 4E8HA 1AQVA 3C8EA 2H0IA 5KN3A 3CBUA 1ERUA 2R5GA 2N5FA 1O85A 2AAWA 3IXRA 3EWLA 3FW2A 4N0VA 2OJLA 2G0FA 2CVBA 1OC8A 2GT5A 1AUCA 4TR0A 22GSA 2F8AA 1WOUA 1VRSD 4DSRA 4EDYA 2IN3A 1R7HA 4PUAA 1PN9A 2KUCA 3W6GA 1JZDA 2R37A 1M0UA 3VI7A 1SENA 3LYPA 3M9KA 1BYEA 4OD7A 4KE3A 2IFQB 2H73A 2H74A 5CYYA 2LQQA 4ZL9A 4N0ZA 2F51A 2KHPA 3UBLA 1YKAA 1RQMA 3O76A 1M9AA 2ON5A 1K3OA 1TRVA 2GSSA 4XS4A 2CX4A 3C7MA 1R4WA 2K8VA 2IMKA 4TRXA 3GURA 5AIVA 2JSYA 3A2XA 2ZUPA 4IP1A 1GSDA 4MF5A 1K0DA 3KTBA 5EPFA 1ON4A 1SL2B 3EURA 3GRXA 3GTUA 1T8EB 1W4VA 3P90A 2WZ9A 2YZHA 2VM1A 1PMTA 4ECBA 1G7EA 2WULA 1QXHA 3F4SA 4HQZA 3LEFA 3GKNA 5IO0A 4PUFC 5FT3A 1ZZYA 4IW9A 2H70A 2TRCP 3SBCA 19GSA 2VL3A 1E6BA 3UBKA 3F4RA 3U6VA 1O7UA 3LFLA 5G31A 3UARA 1GP1A 5HR0A 3BJ5A 3QR6A 5DCGA 4BPYA 5JWOB 2HSYA 2P5RA 4MJAA 1ZMAA 2OBKA 1AW9A 5GSTA 2VD1A 1TKDB 3V1WA 5KN2A 3MNGA 2CVDA 1AIUA 2FWHA 4MJEA 3L9VA 2FY6A 2H76A 2QKEA 4K6XA 5CNWA 1T00A 4ZILA 3EVIA 2MBSA 3TKSE 3KEBA 3LQ7A 2FHEA 4NHWA 1UC7A 4IQ1A 4JRRA 4OMVA 1T3BA 4GXZA 3D22A 3D4MA 2GSTA 4K1FA 4MP4A 2GZZA 16GSA 1B8XA 4ECJA 1XVWA 1JHBA 1SL0B 5E4WA 3MAKA 1PKZA 2TRXA 1XW9A 1R5AA 6GSSA 2NVLA 5J41A 2V6KA 1BAYA 5JWRB 5LNKe 2HLSA 5ECPB 1K0AA 2LUSA 1GL8A 5DALA 2H75A 4QL9A 3I43A 5IMDA 1TRSA 3EINA 6GSYA 2RUFA 1WE0A 3DRNA 1F2EA 2OACA 1LU4A 1U3IA 3QOUA 1PQNA 4D73B 1OC9A 3KMNA 3IDVA 5IM9A 1GRXA 2I3YA 4X1UA 4JR4A 3R2QA 1SKRB 2XHFA 2KP1A 3ZTLA 2HFDA 4V2NA 1HNAA 4HUAA 3M1GA 4TR1A 2XPEA 3TKPA 1N8JA 4J2FA 3FRCA 1JLWA 4FO5A 2JACA 2GZYA 2RIIA 2HI7A 2GSRA 4JR6A 1V58A 2MMOA 2WFCA 1QUWA 3ERGA 3Q19A 2YJHA 2RLIA 2GZPA 1EWXA 2FA4A 2GLRA 5KEJA 4XIHA 3NOFA 2DJKA 4PXOA 1XWBA 3EC3A 4Q5QA 2A4VA 3MDKA 2DMLA 2J23A 2HZFA 4G9HA 1XWGA 1GLQA 1WRYA 2BTOT 2H1GA 3E3EA 4N10A 5H5QA 1ERTA 3OR5A 1ZCPA 5B7CA 2PN8A 4NV5A 1TI1A 4N30A 2PWJA 1R5PA 2PUKC 4RUVA 4KDXA 4ILFA 3L9SA 3QDNA 2L4QA 3ZLPA 3KD0A 3KM6A 3ME7A 3UOMA 1HD2A 4X43A 5G5FA 3AY8A 4EE0A 2YJ7A 3GMFA 3A5WA 3IOSA 4ZL7A 1Z6NA 1XOAA 3DMLA 1AQWA 2DLXA 2XBIA 4CDOA 1FVKA 6GSUA 3TKQA 1AAZA 1SKWB 3WGDA 2GQLA 4GCIA 5ECHB 2WGRA 2WDUA 3SWLA 1TRWA 2IFQA 1JZOA 4I6XA 1J9BA 1EP7A 5DJMA 2OE0A 4OO4A 1V98A 4EF0A 3RPNA 4GSTA 1MDJA 1A2JA 3QPMA 2AUVA 2VCZA 1KTEA 4O7HA 2FD3A 4MPGA 3ISOA 2PPTA 2HRFA 2HT9A 4EKZA 3HY2A 3IRAA 2L6CA 1S3DA 2L6DA 5CRDA 2LJAA 5FHIA 1SK1A 1ERWA 4EL1A 2FA8A 2PERA 3RPPA 3D4TA 3LORA 4KNDA 3RHBA 1DE1A 5KN0A 11GSA 4K8MA 6GSXA 2C1YA 1EOHA 2JL4A 2I9HA 1TP9A 5D9TA 4XRDA 2R2JA 4EDZA 2H0GA 5HQPA 5JWQB 4K7OA 14GSA 3H93A 2VL2A 1BJXA 1EEMA 2E7PA 1MD3A 1IYHA 2FWGA 1SJZA 4GRFA 2GQMA 2DBCA 3CTFA 5DALB 1ML6A 4AF2A 3Q18A 2CAQA 1THXA 2FNOA 2TIRA 1GLPA 3FK8A 2V6OA 4P3YB 1F3AA 4MH3A 3IE3A 4PQ1A 2FWFA 1F6MC 3RBTA 2CAIA 2PVQA 4HDEA 3C1SA 4HS1A 4IP6A 4KAEA 5ECMB 2C0DA 4X0XA 1GULA 2O85A 3A3TA 4F0CA 8GSSA 2O87A 4MF6A 2WRTA 5IPHA 1J08A 5F07A 2IIYA 4POMA 2HNLA 4MLYA 2B3SA 1TXXA 3QAVA 2N5BA 3G7JA 1W89A 1A0RP 3LWAA 5IPGA 2VCVA 4BWSA 2QGVA 1A8YA 3APOA 4O5RA 5D93A 2B7KA 1HYUA 1THOA 3F3RA 2JU5A 3HXSA 1PSQA 1OKDA 5DCHA 4GWRA 4JEDA 1EGRA 4N11A 4RI6A 3HDCA 6GSTA 1PKWA 13GSA 5J9BA 4WR5A 3F3QA 2LS5A 2YNXA 4HEA2 1ZYQB 1JZWA 5EY6A 5HR3A 1M2AA 2DIYA 1PD21 4PNGA 1ST9A 4FH8A 5G5EA 2B5XA 1ERVA 2CV4A 2E2MA 2R6KA 1YDKA 4D73A 5IMFA 2OE1A 2HE3A 2YZUA 1NW2A 5JCUA 4GSNA 5F06A 2QC7A 3F6DA 3IK9A 2GVPA 1A23A 5JCGA 3CXGA 2MMAA 1VF4A 4POBA 2VCWA 4NAXA 2AHEA 2C3TA 4MA9A 4PGTA 17GSA 5FWGA 1NM3A 2X8CA 2HRNA 2GDRA 1S3CA 3TJJA 1Z5YE 2O8VB 3KCMA 5IMAA 1O8XA 2K6VA 4K0NA 1V57A 2IMEA 3ME8A 2NBSA 5GZZB 3A2WA 3ZL5A 4ULXA 2H6YA 2IMDA 4WEYA 4OFMA 2R4VA 4YAVA 5ENUA 4NXIA 1XCCA 3RDWA 3L0HA 4HI7A 4MPFA 4GQFA 1AXDA 3CYNA 4ML1A 3EMPA 3IK7A 1SJ6A 1T4YA 2V2GA 3VWWA 2B1KA 4POLA 2VUPA 3WD6A 2FUG2 5AN1A 2I1UA 3IV4A 2JZTA 3GNJA 3UVHA 2FWEA 1SYRA 4V2MA 1Z3EA 5H5SA 3WGXA 3N9JA 3IPZA 2FLSA 4V2LA 4TXVA 5ID2B 2LJKA 4IELA 1GUHA 3UJ1A 1T4ZA 3UVTA 4PX1A 4GSSA 1X9SB 5L71A 3GUSA 3D6IA 1XPVA 5A4VA 1X0RA 5B6NA 1AC1A 2VLTA 3GSSA 1XZOA 2D2ZA 1IYIA 3FY7A 3KH9A 2CX3A 3TRQA 2CZ3A 3LYKA 1F37A 4ACSA 3C1RA 1ACVA 4KW6A 2YANA 12GSA 1SK2A 2HZEB 3HYPA 2L59A 4BWQA 2PBJA 1SU9A 1XIYA 5ECIB 4HU9A 4WKWA 4BVYA 2VL2C 1EEJA 5G1KA 2FCHA 4HQSA 1Y25A 5DBQA 4YQUA 1KEBA 1MDKA 3TCOA 4E8EA 4KSOA 2IMFA 2REMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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