2CX4A

Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the aeropyrum pernix k1 (form-2 crystal)
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
GLVELGEKAPDFTLPNQDFEPVNLYEVLKRGRPAVLIFFPAAFSPVCTKELCTFRDKMAQLEKANAEVLAISVDSPWCLKKFKDENRLAFNLLSDYNREVIKLYNVYHEDLKGLKMVAKRAVFIVKPDGTVAYKWVTDNPLNEPDYDEVVREANKIAGELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
publication title Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the Aeropyrum pernix K1 (form-2 crystal)
rcsb
molecule keywords bacterioferritin comigratory protein
total genus 38
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cx4A00
1PKZA 1TU8A 4K6XA 5AGYA 1OC8A 5D9VA 3APOA 4NV2A 1ZMAA 2C0FA 3ZIVA 4EL1A 2VM1A 2RLIA 3HDCA 1UVZA 2O89A 3ZFBA 4L8EA 3VWUA 1AW9A 3IV4A 3I6AA 3ME8A 1GL8A 2L57A 2CX4A 1QXHA 1A2LA 3GA4A 1AQVA 2LSTA 3O3TA 3IRAA 4JR6A 2H74A 3DIEA 3TJFA 4HQZA 1QFNA 2O7KA 3F0IA 2H1DA 3QCPA 4LMVA 4HJMA 2OADA 1BQ7A 4NHWA 1EZKA 2LNSA 3EC3A 5E59A 1RW1A 2XC2A 6GSYA 5B6MA 5A4UA 4L5OA 1Z7PA 2VCXA 4JEDA 1OC9B 4MZWA 3M8NA 4IBPA 3KCMA 3EMPA 2CZ2A 2IIYA 3FRCA 2L5OA 4KCAA 3D4MA 1T4YA 4PURA 2P0GA 3H1NA 3H4KA 4ZB9A 12GSA 2O87A 3HJPA 4I97A 4HU7A 3HZ8A 1LJRA 2QSIA 5C00A 3I9V2 1G7OA 2B5YA 3UAPA 3UBLA 3GRXA 3MDKA 4L5LA 4ID0A 3ZZXA 1O6JA 5H5SA 3VWXA 1GH2A 3KD0A 3GKNA 3IPZA 1ZYQB 1K3LA 3ZREA 2V1MA 4AJ6A 3IXRA 4ZB6A 3CRUA 3F4SA 2PBJA 3FZ4A 3CMIA 1GUMA 1THXA 3IBHA 1Y6EA 2OE3A 4X1UA 2XBIA 1USBA 1X5CA 3ZITA 4MF7A 2H76A 4FYUA 3V1WA 5EPFA 5ECHB 2JADA 3UJ1A 5D9XA 3TKRA 1OVNA 3KH9A 3VPQA 5ID2A 4K7NA 4ML1A 5IPGA 2PERA 2NBSA 1ZGNA 4EDZA 2GT5A 2IMEA 2FY6A 2L59A 5HFIA 4WBRD 2YWNA 4N0ZA 4KAEA 4JE1A 3HCZA 3EWLA 3GHAA 3DWVA 4GXZA 1PGTA 3GX0A 3ZVJD 2MZCA 1TRVA 4NPBA 4KH7A 2I1UA 4ML6A 4X43A 3M9KA 5G5EA 1FOVA 4I2TA 3W8JA 3ZFLA 2JZTA 1GWCA 2KUCA 3ISOA 6GSSA 5CO3A 3IK9A 2R5GA 1ERVA 1SENA 1JZOA 2V32A 2I4AA 1Q98A 4NAXA 2VL2C 4ZILA 2YWIA 5J3RA 3GL5A 4ZL7A 1B9YC 4YQUA 1A0RP 2IFQB 1JLWA 2JZRA 3LWAA 2YP6A 3TRXA 3ED3A 3NOFA 4X0XA 5GSTA 5IO0A 18GSA 2IMDA 1VF1A 5DALB 1ILOA 4TR4A 4XRDA 3QOUA 2YWOA 1MDKA 1YKCA 1DUGA 2YPMA 1A0FA 2YV7A 1TW9A 1XPVA 3TB2A 3GX8A 1VGLA 4ECIA 1X5EA 2GDRA 2LQQA 2GZZA 2L5LA 3EVIA 4F82A 1Z7RA 3L9VA 1EOGA 2LS5A 3BOAA 2CZ3A 5EY6A 1BJXA 3ZTLA 2NDOA 3RHBA 4AGSA 4I5QA 3CRTA 3F6DA 3IHQA 5CRHA 1K0MA 1QQ2A 3TOTA 1C72A 4HQSA 4K2DA 1XVQA 2FCHA 2X8GA 3VI5A 3KMNA 3FEUA 1KTEA 11GSA 1OKTA 4V1Ap 4DVCA 5KN1A 4MLYA 3IDVA 1YY7A 4IHUA 1K3OA 1XFLA 2C3NA 4F2IA 1DBYA 2E0QA 4HOJA 3GH9A 1VF3A 2FGXA 2XHFA 4PQIA 2P5RA 3HD5A 1EEMA 3WT1A 2NVLA 3VI7A 4HEA2 4G19A 5CREA 2GQLA 5F0GA 2FUG2 1SYXA 2TRCP 2RM6A 3G7JA 1R26A 3G7YA 4IELA 2VL2A 1PN9A 1U87A 5HR1A 2G0FA 1EP7A 1GUHA 3BBYA 4MABA 4WF5A 1PD21 4XRAA 3FHKA 1M7TA 3FW2A 2C8UA 2LNTA 2VD1A 4TR1B 3GYKA 1Z6MA 1WJKA 2E7PA 4NXIA 4TKYA 4V2NA 2WULA 2H19A 3ZLPA 1KEBA 1YKAA 4XIHA 5ECOB 4NHZA 5DQYA 2WJUA 1A24A 5ECNB 3U5RE 1CQGA 4OO4A 2REMA 4F03A 1GSDA 3Q19A 1OAZA 1T7PB 4HZ4A 1F2EA 5IMFA 4IJ3A 2J23A 1GLQA 1ERWA 1ZYEA 3KJYA 4TXOB 3KTBA 3HYPA 1H75A 1TRUA 2VL9A 5HQPA 4FYBA 1ABAA 1J0FA 3G9BA 2N5AA 1O8WA 3GH6A 4DSQA 1F6MC 4N0VA 2VL3A 3F9UA 2D2ZA 4DSSA 5KN2A 2H71A 2CVKA 2DJ3A 1XVWA 1EWXA 2QC7A 2H0GA 2LJRA 3DEXA 4PNFA 2HZEA 3GKMA 2MYGA 1TJDA 4HDEA 1ERTA 4Q5QA 1TK0B 1VF2A 2H72A 5F05A 1X5DA 3VFIA 1O73A 2CA8A 3KGKA 5ECIB 3RAZA 5ENUA 4MA9A 4ECBA 4FYCA 4NWYA 3L4NA 4CW9A 3R2QA 1K0DA 1LU4A 3LGCA 1WP0A 3CTGA 3QR6A 2V41A 2AHEA 3ERGA 3WGXA 3LXTA 3HY2A 2GVPA 2DJ0A 3Q18A 5J4UA 2AYTA 2RUEA 5H5RA 1DE2A 1U3IA 2X8HA 2CX3A 2FWGA 4PQHA 2C3QA 3QD9A 3GURA 1GSSA 2HYXA 2PMTA 4BVYA 4XTSA 5JWRB 5A4WA 3LXZA 4XS6A 4QQ7A 1AXDA 1JZWA 1TP9A 4OFTA 2F51A 1NM3A 3DD3A 4EF0A 3DXBA 4JU5A 1JZDA 2B1LA 1GLPA 1JZRA 3QFAC 3VURA 1V9WA 2I3YA 3MAKA 4RQXA 13GSA 1SU9A 2N5FA 3RPNA 3DVXA 3VLNA 4TW5A 2GSQA 3UOMA 3ZL5A 4F9ZA 3CBUA 2OBIA 3GTUA 2GZYA 2H66A 3O76A 4ECCA 1Z6NA 3W6GA 4POMA 2WRTA 1MD3A 2DLXA 3LORA 3H93A 1M9BA 3TOUA 3A2WA 3EINA 5GSSA 3FZ9A 3F4TA 2B1KA 2VCZA 3F3RA 1ERUA 2M46A 3I43A 2B5EA 3F63A 2VCTA 4K9ZA 3H79A 2PGTA 4RI6A 1SL1B 2DJ2A 4K0GA 4D73B 4IN0A 3P8WA 2HRFA 2IMIA 3A5WA 2I81A 4IJIA 4K1FA 2YZUA 1PSQA 4YQMA 4G2EA 5CNWA 1WOUA 2GT6A 3FZAA 4ZBDA 1HQOA 5INYA 5ELAA 2K6VA 2QGVA 1JLVA 5G31A 2AB6A 2A2RA 2LEGA 4PGTA 3KXOA 2XPEA 2FD3A 2K18A 4KDUA 3W8SA 1XWBA 4GWRA 3LFLA 1V98A 4WBJA 5IO2A 4PUFC 2A4VA 5G1KA 1OE8A 4J57E 3M9JA 4MMMA 1Z5YE 3EMXA 4IGJA 4MDCA 2H6ZA 1HNAA 2OJLA 2VD0A 4I8BA 4Q5RA 5B6NA 2JL4A 2JU5A 2JZSA 6GSUA 4DEJA 5HFKA 5IMVA 2YANA 1Z3EA 1U3AA 1FVJA 5HR3A 4ZL8A 2MBSA 1SD8A 3MWHA 4QL9A 1M0UA 3UIWA 2CVDA 1YZXA 3TJJA 1R5PA 2H75A 3IAS2 4FH8A 2PWJA 4HU9A 2PN8A 4RQRA 3RPPA 2B7KA 5KN3A 2GLRA 1T00A 2CQ9A 2NPBA 4KNDA 1F9MA 1QK8A 3RHCA 1GSYA 5D8IA 2H0HA 1O85A 2KHPA 3TJKA 2ES7A 1FO5A 1AAZA 4HZ2A 4H86A 5GAND 1EV9A 3ZIJA 1WIKA 1YJ6A 1R4WA 4AJ8A 1ACVA 5LCZA 2K9FA 2O8VB 2CT6A 4KW6A 3F4RA 2ZNMA 5E4WA 1DE1A 1MDIA 3IAM2 1FHEA 4HUAA 5ECKB 5IOXA 1V57A 3GV1A 4WETA 1TU7A 4MJCA 3HKRA 2RIIA 3KEBA 2C0DA 1V58A 4AF2A 2ON5A 5HR2A 2P31A 4ZIJA 2LV3A 2JSZA 3ZYWA 3D4TA 1URMA 2FWEA 4GLTA 1O8XA 4ZBBA 4XS4A 3EURA 2WDUA 2KP1A 2JACA 2LQOA 2DSAA 4MP4A 2VLVA 2P5QA 4I2UA 4RI7A 2GTUA 2IMKA 4WKWA 2H8LA 3UL3A 1RQMA 2HFDA 5IIZA 2DIYA 4E8EA 4EDYA 5HR0A 3WGDA 2IWTA 5CRDA 1A8YA 1FW1A 3C1SA 4IP6A 2L4CA 1YDKA 3P7XA 1ST9A 4TRXA 2IN3A 5ID2B 3LJRA 3L0HA 4PXOA 3KM6A 3EU3A 5J5NA 4MJBA 2PPTA 2LTKA 4MF5A 2OACA 4PNGA 1FB0A 2LRTA 1XWGA 2IL3A 2TRXA 1PA3A 5LD0A 5DAKA 5F07A 1VRSD 3LG6A 3HJOA 1MEKA 1JHBA 1IYHA 1M2BA 2BJXA 3KH7A 4EKZA 2DJJA 2OBKA 3GUSA 4JBBA 3KTLA 3J7Yb 3DVWA 3TKQA 3GKKA 3KP8A 4O32A 3E0UA 5CRWA 5IQYA 4QL7A 5IMCA 4IQAA 2HSHA 4LLRA 3GIXA 1K3YA 3ZMLA 2F8AA 2XBQA 1TKDB 3SBCA 1F37A 1GSUA 5AIVA 4ZB8A 3QAWA 4POBA 5JCUA 3H8QA 4ZL9A 2AUVA 3DYRA 2C80A 5ECSA 1OYJA 2IJYA 1O7UA 4YH2A 3AY8A 4JZQA 5EL8A 5CAXA 5B8BA 1IYIA 3VK9A 1K0AA 4CHSA 1NHOA 1TXXA 2TIRA 2IMFA 2CVBA 1TDIA 4GQCA 2FNOA 1T1VA 2OE1A 3TKPA 4F0CA 1M9AA 1G6WA 1T8EB 3C71A 1UC7A 2HLSA 5G2ZA 1LBKA 2X99A 4YAVA 4GRFA 4HJ2A 5D9TA 2VAFA 2VLUA 1NSWA 1I9DA 3UVHA 4EUYA 1M99A 1XBSA 3LQ7A 2F3MA 5CRGA 1YF0A 5FHIA 3ZRDA 3GFKA 2V6OA 2HSYA 5A4VA 1SKWB 3HZ4A 17GSA 3BJ5A 2B6MA 1SL2B 3M1GA 2YCDA 2YJHA 1HYUA 4MJAA 3G7IA 4O5RA 1QGVA 3HHVA 2N5BA 5DJLA 4Q5FA 4TOPA 1XZOA 3D6IA 2VCVA 2PU9C 4HI7A 2V2GA 3BCIA 1T3BA 3VWWA 4G9HA 2ZCTA 3QAGA 1MTCA 4KGIA 3L78A 6GSXA 1PQNA 1K0BA 2HT9A 2OE0A 4MJEA 3KZQA 4ULXA 3D22A 2FA4A 1R7HA 2MMAA 4O92A 1DSBA 3QPMA 4EO3A 1TTZA 5KEJA 1FAAA 4HS1A 4IKHA 2YZHA 4ZXGA 1OC3A 5DVBA 1BEDA 4KDXA 3MSZA 5ECRB 4K7OA 1BAYA 2BTOT 2I9HA 3GKXA 1OC9A 1SK0A 1FB6A 1XIYA 1B4QA 4DSRA 4V2MA 4KE3A 2L6DA 3GSTA 2ON7A 2B5XA 3IE3A 1T4ZA 2FWFA 3A3TA 22GSA 3RDWA 1J9BA 2VLTA 1GTAA 5ECLB 5B8AA 1MD4A 2MMOA 3QMXA 4GSNA 1O81A 4IS0A 4BL7A 3US3A 4N11A 2VCWA 1PL1A 3LYPA 2GGTA 2FHEA 2CAIA 2CAQA 3FR9A 4LL1B 2FA8A 4BA7A 2HRNA 1S3CA 1SJZA 3CYNA 4RUVA 2LKUA 1W4VA 3PH9A 1TRWA 5C04A 1AUCA 4DSSB 1UA5A 4KSMA 2H01A 2B3SA 5FWGA 1GSEA 4MH3A 2WGRA 1N8JA 3EE2A 3GN3A 2HZEB 1XW5A 3HXSA 5HFGA 3APQA 1J08A 2GQMA 14GSA 3PINA 1AC1A 1ZOFA 9GSSA 3WD6A 4BPYA 4KUNA 1NW2A 2LJAA 2QKEA 4MF6A 3C1RA 4LMWA 1B4PA 3L9SA 3UBKA 5H5QA 1V2AA 2KP2A 1G7EA 2KOKA 1ML6A 1EV4A 4NMUA 3D0ZA 3PGTA 3M0FA 4TVEA 2E2MA 4KDYA 5J41A 3C7MA 1GNEA 2R3XA 1YEXA 1WPIA 3CSIA 3FR6A 5DCGA 4FIWA 3UEMA 3GNJA 4N10A 4KCEA 4K0NA 5ELGA 3N5OA 2H6XA 4WXTA 1FVKA 1B8XA 1GTUA 3NZNA 2YWMA 3ERFA 3BCKA 4IVFA 2R37A 3HJMA 5COHA 1XW9A 3FK8A 2DMMA 1K0CA 2H1BA 2V6KA 2MBTA 1EGRA 2M80A 3IK7A 4GSSA 2L4QA 2JSYA 3O6TA 2H0IA 2IFQA 1A23A 2LJKA 1Q4JA 3DKSA 4J56E 3FY7A 4KA0A 1AQWA 1YF1A 4KB3A 1XOAA 5DALA 5IMAA 1TK8B 3DRNA 2EIQA 2GSRA 5G30A 4MPGA 2YJ7A 2WFCA 4G10A 2H70A 2HE3A 4P3YB 2B7JA 2VOCA 1EP8A 4E8HA 1WRYA 3GTUB 1SK2A 4IW9A 3A2XA 10GSA 3E9JB 4TR0A 4OFNA 2DJKA 5EVOA 5G5FA 5ECPB 1PX7A 3U6VA 3TDGA 2FWHA 1OE7A 4MPFA 1YEPA 2LRCA 1M2DA 3TRQA 1K0OA 3APSA 4GCIA 4KSOA 3QFBC 5LNKe 2X8CA 1NHYA 3UVTA 1PRXA 1SKSB 4TN8A 3NIVA 4GQFA 2H1AA 4V2LA 1GULA 4OMVA 5GAPD 3TJGA 3L9UA 4FO5A 2E2GA 1PKWA 3Q6OA 3TUEA 1XWAA 4CDOA 4NV5A 1XWKA 1V40A 2PVQA 2K8VA 2Z9SA 5A5KA 5ECQB 3IA1A 3TGZA 3CTFA 4V1Ag 1B48A 1S3AA 1BG5A 4ACSA 4OCEA 3IR4A 4GTUA 2ALBA 2AJQB 1SKRB 3D5JA 4WF4A 4TR1A 1R5AA 2H1GA 3M3MA 2H73A 2DMLA 3VPTA 5IOWA 3ZVJA 1TI3A 5L71A 3KMOA 3QDNA 2DBCA 4ECJA 4IQ1A 5D9WA 4N30A 4IP1A 6GSVA 2WS2A 3TRPA 4EE0A 3C8EA 2LUSA 1EOHA 1QMVA 4MZCA 2KLXA 3IOSA 2HNLA 1GNWA 1XCCA 4JR4A 3A2VA 1W89A 4PQ1A 1AIUA 4LL4B 4F0BA 1TI1A 3EU4A 5IMDA 4POLA 2A2SA 2GSSA 1G6YA 2HZFA 3S9FA 1OKDA 4TXOA 4GSTA 2PUKC 3LSZA 3CSJA 3DMLA 4Z7XA 1SYRA 2DIZA 5G1LA 3GL3A 1GUKA 4TR3A 4OD7A 4EVMA 5AISA 2CV4A 1X9SB 2C4JA 5F06A 5JCWA 4TXVA 3Q74A 19GSA 2IPAA 3F3QA 2YOIA 2GS3A 1A8LA 5CYYA 5DBQA 1SD9A 1ZL9A 3J7Yk 1X9WB 4GF0A 3FYGA 3HVXA 4Q5NA 5DDLA 3JCML 1BX9A 4PUAA 2ZUPA 4OCFA 5GZZB 1HNBA 2WCIA 3EYTA 1GRXA 16GSA 1G0TA 5J9CA 4ZBAA 4EC0A 2RUFA 2GZPA 1H4OA 4JRRA 1I5GA 1KBNA 4WR5A 1MDJA 5DCHA 3TKSE 3LEFA 2O85A 4ILFA 2R2JA 1THOA 3VWVA 4XCSA 3FKFA 5DJMA 1E6BA 4XS4B 5F8BA 2C3TA 2F8FA 3TKSC 5IPHA 1SK1A 2EC4A 3CSHA 3WGEA 2BMXA 1WWJA 5AIXA 3IC4A 7GSSA 3I69A 1U6TA 3F8UA 4L0WA 4BWSA 4K8MA 2OKAA 2F9SA 3QAVA 3F6FA 2AAWA 1X9MB 2M72A 4POKA 3ZMKA 4MZBA 3WT2A 2R6KA 2J9HA 1XWCA 3P90A 1UN2A 1PX6A 1XXUA 2GQKA 1RK4A 4WEYA 1SL0B 2DJ1A 4XHMA 4OFMA 3D21A 3FZ5A 4I6XA 5DQSA 5KN0A 1HD2A 3RBTA 2YNXA 1Y25A 4J2FA 2C0EA 1GTBA 5JWQB 2EIOA 2DC5A 6GSWA 1U88A 1ZCPA 1XW6A 4LA1A 2PVOC 2K8SA 1QUWA 2WZ9A 1GSFA 4AJ7A 5CP1A 3ERWA 1CQHA 2RM5A 2VIMA 3HVSA 1PL2A 1TK5B 5DAKB 1E2YA 2VO4A 1KNGA 3HVVA 1SJ6A 2H30A 4L0UA 3C73A 1F3AA 4MH2A 1JFUA 4YQVA 1BYEA 3E3EA 2L6CA 4KX4A 5B7CA 5D93A 3GMFA 2OA7A 4WR4A 1HNCA 2AV4A 4BWQA 2MMNA 1TRSA 3N9JA 1A2JA 3FR3A 2G2QA 1ON4A 4MCUA 1X0RA 3OR5A 1B9XC 3ME7A 2EIRA 5AN1A 1EEJA 2GSTA 2YV9A 1TOFA 1PMTA 4ISDA 5IMZA 3KIJA 5D96A 20GSA 2R4VA 1ZZYA 3UARA 3WYWA 4D73A 2VCQA 5ECMB 3TKSA 2HXKA 1XOBA 4PX1A 3DGQA 3SWLA 1FG4A 1S3DA 2C0GA 1YQ1A 3LYKA 1M2AA 1VF4A 1A2MA 4YAPA 1SJIA 1GP1A 2HI7A 2FLSA 4XS1A 1WMJA 3PR8A 6GSTA 1GSQA 3CXGA 4EXJA 1AQXA 1Z9HA 2H6YA 5IM9A 5JCGA 2XPDA 4OWYA 5FT3A 3K8NA 5D73A 5J9BA 4BVXA 2C1YA 3TJBA 1F3BA 2MMZA 3HA9A 2NTOA 2VUPA 2WB9A 5ABRA 3MNGA 3BD2A 8GSSA 3KP9A 2YN1A 1GTIA 2LRNA 1EGOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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