2CX4A

Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the aeropyrum pernix k1 (form-2 crystal)
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
GLVELGEKAPDFTLPNQDFEPVNLYEVLKRGRPAVLIFFPAAFSPVCTKELCTFRDKMAQLEKANAEVLAISVDSPWCLKKFKDENRLAFNLLSDYNREVIKLYNVYHEDLKGLKMVAKRAVFIVKPDGTVAYKWVTDNPLNEPDYDEVVREANKIAGELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords bacterioferritin comigratory protein
publication title Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the Aeropyrum pernix K1 (form-2 crystal)
rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Oxidoreductase
total genus 38
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cx4A00
4HU7A 1ERTA 1MDIA 5J9BA 1T00A 2PBJA 1G6YA 1BYEA 2B7KA 2VCXA 4F9ZA 3HA9A 3IE3A 4TR3A 2C0DA 4TW5A 2B5XA 3LQ7A 5H5RA 5DQYA 3FKFA 3L9UA 1G0TA 1JZDA 2FGXA 2L4QA 3GX8A 1R5AA 2XC2A 3ZLPA 2H0HA 2CQ9A 3G7YA 2TIRA 5JCUA 2L5LA 4ECBA 3F4RA 2PMTA 3APOA 2GTUA 1MDKA 4HQZA 4EF0A 1G6WA 4KDUA 3UMAA 4KW6A 4ZL7A 1Z5YE 1ZYEA 2WS2A 2VL2A 5GAPD 5IMFA 2CVBA 1XWKA 3M8NA 2YPMA 4GRFA 3RPNA 5GSSA 3KP8A 3KMNA 3GKKA 3WT2A 5IMVA 2OJLA 5CNWA 4HI7A 2IPAA 4ACSA 1BAYA 1HYUA 4MF5A 5J41A 1JZRA 4POBA 4F0BA 4K6XA 2JL4A 1HNAA 1GUKA 3HVSA 1IYHA 4CDOA 1GH2A 4L0WA 4L5OA 2PN8A 2LRTA 3EU4A 4X43A 4DSSB 3D4MA 3V1WA 2ZCTA 3F63A 1ZCPA 6GSYA 3VWWA 3LYPA 4PNFA 3GN3A 2FY6A 3CSHA 1T4ZA 1OE8A 2PWJA 1PGTA 1OAZA 4L5LA 2AYTA 2MZCA 5B6NA 1QQ2A 4NV5A 4NWYA 5CYYA 16GSA 4IN0A 4IELA 4K0GA 2OA7A 3H4KA 3EE2A 1RQMA 2LV3A 4NHZA 2YZUA 4ML6A 3DVWA 19GSA 3F3QA 1LBKA 1O6JA 2BMXA 2H01A 4PURA 1ERUA 1T4YA 4LMWA 2YZHA 2GT6A 5IOXA 3CXGA 5G5EA 5HFGA 2PVOC 3RDWA 2PGTA 2DMMA 5G1KA 3HJPA 2VCTA 1V57A 4XHMA 5IPHA 14GSA 4V2LA 5KN2A 3ME8A 4FIWA 2M80A 2IWTA 1A23A 1PN9A 4IQAA 2K9FA 2CAIA 1JHBA 3TRXA 4DSRA 3KJYA 3RHBA 1RK4A 3F3RA 1OYJA 2R6KA 1NM3A 1A8YA 1GL8A 2MBTA 4V1Ag 4YAVA 3IAS2 5ECNB 2O7KA 4BWSA 5AIVA 1XWAA 4FYUA 1NHYA 6GSVA 1PMTA 2ZUPA 3MWHA 3MDKA 3IK7A 3JCML 1J9BA 2E2GA 4I97A 3GKMA 1XWBA 3EMXA 4PUAA 4YAPA 4JR4A 3BJ5A 4YQVA 3D0ZA 3SBCA 1KNGA 3ZITA 1WRYA 2HXKA 2QSIA 3KGKA 1S3CA 4Q5RA 2YV7A 1UA5A 4NMUA 3CYNA 3TOUA 4POMA 1SK2A 1HNBA 2M72A 4HZ4A 1E6BA 3GV1A 1KTEA 5CAXA 3HXSA 3ED3A 1X9WB 4MF6A 1SJIA 4JE1A 1NW2A 1XWCA 3GKXA 3L9VA 3FHKA 1R4WA 2HSYA 1GWCA 5DALA 4O32A 5F07A 3EWLA 3UBLA 3KP9A 1UN2A 2MMNA 3HHVA 3LEFA 5HFKA 5G31A 1GRXA 2DLXA 1XVQA 1XBSA 4YQUA 1EOGA 1O7UA 3CSIA 4NV2A 3IV4A 2J23A 3K8NA 2R4VA 4K0NA 4N0ZA 3FW2A 3KTLA 2YCDA 1PD21 3QOUA 1MEKA 1GNWA 5B6MA 4K2DA 3VWUA 3QMXA 4TRXA 3KTBA 1EV4A 2X99A 3I43A 3GYKA 2FWFA 1PRXA 2VLUA 1Q98A 1SD8A 2CVKA 1K0AA 1YEXA 2VLVA 4N10A 2LSTA 1XW9A 1G7EA 1GTIA 3UVTA 2DJJA 2C1YA 9GSSA 2VUPA 3J7Yk 3M0FA 5DDLA 4QQ7A 4O7HA 1TDIA 2LNTA 3QAGA 2DJ2A 4OWYA 3GFKA 4J56E 3TJGA 5IO0A 4RI6A 4K7IA 3E0UA 3F9UA 3TKPA 2IMEA 3GKNA 1URMA 1CQGA 1DSBA 3KMOA 6GSSA 5IPGA 2NDOA 4MK3A 2FA8A 2CX4A 1N8JA 4IS0A 4MJAA 2QGVA 3P2AA 4NAXA 4Q5QA 5ECIB 1F37A 1TK5B 2RUFA 2HRFA 2WZ9A 2EC4A 3MAKA 1WWJA 4AJ8A 1RW1A 2VM2A 2RLIA 4I8BA 4ZBAA 2HZFA 1HQOA 3W8JA 4NXIA 4Q5NA 1H75A 2GDRA 4WR5A 3GH6A 2IMKA 5AN1A 2LRCA 3TUEA 1M2AA 1SK1A 1OC8A 4F03A 3CMIA 2PPTA 2WRTA 3O76A 3DWVA 1SJ6A 4YH2A 2VCVA 4E8HA 5JWOB 3O6TA 4MA9A 4N11A 1VF2A 1F2EA 2YWNA 1FG4A 2R2JA 1SYXA 3VWXA 4V2MA 5A5KA 1JLWA 1TU8A 1ZL9A 3S9FA 2LTKA 4ZB9A 1JFUA 1XOAA 4AJ7A 3GL5A 3KCMA 1Z7RA 2A2SA 2A2RA 4DSSA 4PUFC 1GUHA 4FO5A 3U5RE 4EDYA 3F6FA 1JLVA 2H30A 3A2VA 1SKRB 3IC4A 5IMZA 1YQ1A 5DCGA 2HI7A 3FEUA 1U88A 4MJCA 2MMAA 3W8SA 2QC7A 2V6KA 4WETA 3BCIA 3M3MA 5INYA 4L0UA 1VF1A 3IOSA 3TB2A 2H72A 2L6CA 2DMLA 1EEMA 2VCQA 3GX0A 4BVXA 3HJOA 2H71A 3RPPA 2H75A 2H6XA 3EINA 5ECMB 3UARA 2GT5A 1Z7PA 3A2XA 3IDVA 4WXTA 5CREA 1YZXA 2OACA 4FYBA 1PL1A 5CP1A 3HZ8A 3EVIA 5D73A 3EURA 3D22A 4ID0A 2VCZA 2WFCA 1YF1A 3TKQA 5ECHB 2YOIA 1R7HA 4V1Ap 4O5RA 2CT6A 2JSYA 1GTBA 3FR6A 3ME7A 3C73A 3MSZA 4ZIJA 5G5FA 17GSA 5C00A 1QK8A 2X8HA 11GSA 1O8WA 4ZB6A 3G7IA 2VCWA 1J08A 1FB0A 2NTOA 2DSAA 4MMMA 1F6MC 2VD0A 3LJRA 4TXVA 2YN1A 1GSQA 2RUEA 5IMDA 3VLNA 3GUSA 2F3MA 1WE0A 5L71A 2AAWA 3TRQA 1R26A 3QR6A 5JWQB 3GL3A 5ECSA 3LORA 4HJ2A 1Z3EA 2F51A 4GXZA 3CBUA 4IGJA 3IRAA 4PX1A 5ECOB 3LSZA 2C4JA 2I4AA 1OKTA 2GGTA 1SK0A 4AJ6A 2OBKA 3GRXA 1Q4JA 2ZNMA 3SWLA 1KBNA 1GTUA 3KH9A 3LGCA 2K6VA 3C71A 3Q19A 4ISDA 1A24A 2E0QA 2H1GA 1M2DA 2WGRA 4WBRD 1BG5A 4TR1B 1XIYA 2FHEA 1B9XC 4KGIA 3P90A 4GSTA 4XIHA 5A4VA 4WEYA 3ZFLA 3TJFA 4WF4A 3TKRA 4F82A 2H1BA 1GP1A 3Q6OA 2MMZA 1PKWA 3TOTA 4OMVA 2C3TA 2LUSA 4NPBA 1ST9A 1GTAA 1GULA 1AQWA 1DBYA 5G2ZA 3DKSA 1YEPA 2WB9A 2V1MA 4EL1A 1V98A 3DYRA 4ZB8A 1M9AA 3MNGA 1USBA 1TRSA 1EWXA 1B48A 3I6AA 3KIJA 1SKWB 4GQFA 2H66A 3HVXA 4MDCA 2ES7A 2J9HA 3UJ1A 4K1FA 2F8AA 5ECQB 2OE1A 1S3DA 1V2AA 3WGEA 2IN3A 2OADA 1LU4A 1K0OA 1YDKA 4BPYA 2C3NA 4OO4A 1FVKA 4K9ZA 3LXTA 1AUCA 1UVZA 2YWIA 1CQHA 2LS5A 1OVNA 1LJRA 2YWMA 4PQIA 3F4SA 3GSSA 3QAVA 4JEDA 2WULA 3HYPA 1TU7A 1E2YA 2QKEA 1U3IA 4JZQA 2CV4A 4XTSA 2H6YA 4BA7A 2Z9SA 2JZRA 3IXRA 1WIKA 5ELAA 4JBBA 2I9HA 2P5QA 1I5GA 4GSSA 4KNDA 3H1NA 1V40A 3RAZA 3GURA 3DMLA 1AXDA 5F0GA 2V32A 2PVQA 1M9BA 4IVFA 1FVJA 4IKHA 3QFBC 10GSA 1SENA 4IJIA 4OCEA 4XS4B 3EC3A 1ZGNA 4ECIA 3A2WA 3UIWA 5A4WA 1Y6EA 1EV9A 5IOWA 2DBCA 3PR8A 2XBIA 4GWRA 1XCCA 2FD3A 2FWHA 3VWVA 1F9MA 1T7PB 1S3AA 1A2MA 2V2GA 2GZZA 1T1VA 3LYKA 8GSSA 2JZSA 1OE7A 3QDNA 1ERWA 5CRWA 1X9SB 1GLPA 1TK8B 4Z7XA 5DAKB 1K0DA 20GSA 1T3BA 3ZFBA 1JZWA 1O85A 4I2TA 13GSA 4RUVA 2MMOA 2C8UA 4X1UA 3HCZA 2YV9A 1M0UA 1OC9B 5ECLB 2DC5A 2H19A 1XZOA 3F4TA 5COHA 2EIQA 1EP7A 1YY7A 2L57A 1AAZA 3BD2A 1H4OA 5D9VA 1ABAA 2V6OA 4EC0A 2D2ZA 2IJYA 3I69A 4KH7A 3IPZA 5EL8A 5HR1A 1MDJA 1U87A 1QFNA 5KN1A 1M7TA 4WBJA 3Q18A 4ZILA 1THXA 2JSZA 2LNSA 3VI5A 1SJZA 3IBHA 3FZ5A 5F8BA 1O8XA 2DJKA 3LWAA 4K8MA 2F9SA 3WT1A 4ML1A 2F8FA 2VIMA 1J0FA 4J57E 1A0RP 3WYWA 5ECPB 3CRTA 1A8LA 4ZXGA 4OCFA 5J9CA 3PINA 2YANA 3QPMA 1WOUA 3D4TA 4POLA 1EGRA 4IHUA 1EZKA 4I6XA 4RQRA 2AHEA 2ON7A 3L78A 1TJDA 2B6MA 5G30A 3ZTLA 2B3SA 4XS6A 2CVDA 4MZBA 3EYTA 5AISA 3ZIJA 5EY6A 2HFDA 5GAND 4MJEA 2R5GA 2LEGA 6GSTA 4BWQA 3N5OA 3CRUA 3KM6A 4BVYA 4EVMA 1GSYA 2WDUA 2YNXA 5B8AA 2IFQB 4BL7A 2GQMA 3HDCA 2DIYA 4EDZA 2KOKA 3UBKA 4TR0A 5IQYA 1TKDB 2I81A 2NBSA 3D5JA 5ABRA 2C0GA 3HVVA 2XHFA 3CTGA 4ZL9A 5DQSA 1QUWA 1XOBA 1YJ6A 2H1DA 4AGSA 4IBPA 2DIZA 1AQVA 2PERA 3HD5A 2GQLA 1ERVA 1KEBA 3FZAA 1AC1A 3QD9A 4LL1B 4PGTA 3TDGA 2H70A 6GSXA 4LL4B 2HNLA 1B4QA 1O81A 1SU9A 2KP1A 2LJAA 1DE2A 3HJMA 2V41A 4XRAA 1TOFA 3ZMLA 3IAM2 2X8GA 4MPGA 2X8CA 1SL1B 2O85A 4CW9A 2EIOA 3UVHA 3GMFA 4HJMA 2LKUA 2B1LA 3M1GA 3F0IA 1BQ7A 1EEJA 1XPVA 3WGXA 4DSQA 1SKSB 1EP8A 3IA1A 1GSUA 1TRVA 4TR1A 2HRNA 4LA1A 3BBYA 2OE3A 4MPFA 3VPTA 3VPQA 3VK9A 5IM9A 3VFIA 1Z9HA 2CAQA 1PA3A 3Q74A 3TRPA 3FR3A 5LCZA 5IIZA 2P31A 4G9HA 2FCHA 4IP6A 3GTUB 3RHCA 5B7CA 2C0FA 1GLQA 2KP2A 2R37A 1A2JA 4GSNA 4F2IA 2GQKA 3BCKA 1ILOA 1AIUA 5ID2B 4OD7A 1K0NA 5H5QA 4MZCA 2LQOA 18GSA 2GSRA 3ERFA 3O3TA 4IP1A 1MD4A 2L6DA 5C04A 3TJBA 1TK0B 2HSHA 5CRDA 1TI1A 2XBQA 4EE0A 5JCWA 3DIEA 3QCPA 4YQMA 2VL9A 1HD2A 4WF5A 1G7OA 4ILFA 5FHIA 5KN3A 5FT3A 4H86A 2YJ7A 4PQ1A 4MH2A 3J7Yb 3DGQA 1SYRA 4ZL8A 4JRRA 1TXXA 1ZZYA 4O92A 2GS3A 4QL7A 4KAEA 2AB6A 3AY8A 5LNKe 3ZIVA 4LLRA 5CRGA 3UEMA 4K7NA 1SL0B 4OFTA 1W4VA 2AUVA 2OKAA 3D21A 2GLRA 1W89A 1OC3A 5HQPA 3IHQA 1K0BA 3P8WA 3ZYWA 1FHEA 3GIXA 2R3XA 4ECCA 1PKZA 5ECKB 1F3AA 3ZL5A 2JZTA 1K3LA 4MH3A 4G19A 4HDEA 3TJKA 3TKSE 5KN0A 3FYGA 2PU9C 2CZ2A 5B8BA 1VF3A 1X9MB 5EVOA 3US3A 2JACA 4XS4A 3IR4A 1THOA 2C80A 2LQQA 4EKZA 2NPBA 1AW9A 4MABA 3NZNA 3DD3A 1ZOFA 3APQA 4OFNA 2RM5A 1V9WA 3QFAC 3ZREA 3GSTA 2REMA 3C1RA 2XPDA 1K3OA 4I5QA 3TJJA 1ML6A 3ERWA 5D9WA 3PGTA 1PL2A 4AF2A 4HU9A 1I9DA 2CX3A 5DAKA 2HT9A 3U6VA 1T8EB 3VURA 1OC9A 2MYGA 1Z6MA 1ZYQB 2PUKC 1NHOA 4PXOA 3DEXA 4NHWA 4E8EA 1ON4A 4TXOB 4D73B 2HZEB 1QXHA 5G1LA 4ZBBA 2ON5A 1R5PA 2FUG2 4MP4A 4MJBA 2N5BA 5IMAA 2GZYA 3OR5A 4TR4A 3DVXA 2C0EA 2TRCP 2L59A 1O73A 2GSQA 3FY7A 4IJ3A 2B5EA 4OFMA 3ZVJA 2LRNA 2N5FA 4DEJA 3FRCA 3ZRDA 3ZZXA 4XCSA 2KUCA 4GF0A 4RI7A 4GTUA 5DCHA 3HY2A 3ZVJD 5IMCA 1X0RA 3IK9A 2KLXA 3GA4A 3P7XA 3GHAA 5CRHA 2LJKA 5E59A 1GSFA 12GSA 4X0XA 5JCGA 4TOPA 4EXJA 1BEDA 4HQSA 1U3AA 4HUAA 1EGOA 1YF0A 1XW6A 2CA8A 5J3RA 4XS1A 2H74A 2OBIA 5HR0A 2HLSA 1TI3A 1M99A 4L8EA 5DJMA 2BTOT 2P0GA 2VL3A 1Z6NA 2VAFA 4I2UA 2AJQB 2K8VA 1V58A 2IFQA 2VD1A 5DBQA 3HKRA 3C8EA 3H8QA 2B1KA 4KCEA 4KCAA 4PNGA 1HNCA 1VF4A 1WPIA 4TN8A 2IIYA 1X5DA 5ECRB 3CSJA 3VI7A 7GSSA 3PH9A 5D9TA 1WP0A 4KSMA 4RQXA 1F3BA 2DJ3A 3NOFA 4ECJA 2P5RA 1GNEA 2G0FA 1QMVA 4KX4A 1M2BA 5DJLA 2VOCA 5GZZB 2GVPA 4ULXA 3KZQA 3UAPA 4MCUA 3LFLA 4XRDA 2YJHA 4IQ1A 2BJXA 4KDYA 3TCOA 3E3EA 5F06A 1A2LA 3GNJA 5AGYA 3M9JA 2FA4A 5ELGA 5KEJA 3FZ9A 4GQCA 1YKAA 4JR6A 1DUGA 4EO3A 1EOHA 5D9XA 3EMPA 1WMJA 2FWEA 4KDXA 3ISOA 2HE3A 2L4CA 5D8IA 2TRXA 1TTZA 4FYCA 4DVCA 1NSWA 1OKDA 4POKA 1YKCA 1MTCA 5D93A 4TVEA 3GH9A 5FWGA 6GSUA 2O8VB 1FB6A 2H1AA 5D96A 5H5SA 1TP9A 4GLTA 4KSOA 3UOMA 2G2QA 3WGDA 1TRUA 4P3YB 5DVBA 2LJRA 3W6GA 2WJUA 3TKSC 3F6DA 5JWRB 4KE3A 3H93A 2DJ0A 3G7JA 2GSSA 3GTUA 2MBSA 3E9JB 3I9V2 3ERGA 2HYXA 4G10A 3N9JA 1XWGA 4LMVA 4K7OA 5J5NA 4MF7A 5HR3A 4GCIA 4HS1A 1JZOA 1FO5A 4FH8A 2IMDA 4IW9A 5ID2A 5CO3A 2H76A 1TW9A 2E7PA 5AIXA 1VGLA 1TRWA 5LD0A 1ACVA 1K3YA 1B4PA 2K18A 1N2AA 3G9BA 1PX6A 2YWOA 2VM1A 3L9SA 2DJ1A 2H6ZA 1SL2B 5HFIA 5A4UA 1Y25A 1UC7A 3L4NA 1VRSD 3BOAA 2EIRA 3EU3A 2JADA 2AV4A 4V2NA 2B7JA 1PX7A 4HEA2 3C7MA 4EUYA 4MZWA 3KXOA 5J4UA 5GSTA 4HOJA 2I1UA 3ZMKA 2OE0A 2H8LA 2VLTA 2I3YA 3KEBA 4KUNA 4F0CA 2X64A 3TGZA 2C3QA 2KHPA 2N5AA 2VL2C 5IO2A 2NVLA 3M9KA 5HR2A 1FAAA 1PQNA 3KD0A 2CZ3A 1B9YC 1K0CA 3A3TA 3LXZA 2ALBA 1FOVA 4JU5A 2FNOA 1A0FA 3L0HA 4KA0A 5E4WA 4TKYA 4MLYA 2K8SA 2RM6A 1IYIA 3A5WA 4OO5A 4N30A 2IMFA 1GSSA 5F05A 4CHSA 22GSA 2XPEA 4WKWA 1XVWA 2H0IA 5DALB 3H79A 4PQHA 1AQXA 1X5EA 2L5OA 3WD6A 1U6TA 3UL3A 1BX9A 3FK8A 1XXUA 1DE1A 4QL9A 1MD3A 1BJXA 3KH7A 3QAWA 1QGVA 1XFLA 3DXBA 3RBTA 1B8XA 1SD9A 2WCIA 1ZMAA 1GSDA 2GZPA 2IL3A 4TXOA 4D73A 2GSTA 2YP6A 3HZ4A 2HZEA 4ZBDA 3NIVA 2RIIA 2FWGA 1FW1A 4KB3A 1WJKA 2E2MA 3APSA 3DRNA 2VO4A 1XW5A 6GSWA 3TKSA 1K0MA 4N0VA 1PSQA 2H73A 3D6IA 5ENUA 4Q5FA 2FLSA 2O89A 2A4VA 5EPFA 1X5CA 2B5YA 2O87A 3LG6A 1GSEA 2JU5A 4HZ2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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