1THOA

Crystal structure of a mutant escherichia coli thioredoxin with an arginine insertion in the active site
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGRPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Mutant Escherichia Coli Thioredoxin with an Arginine Insertion in the Active Site
rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 30
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1thoA00
4N11A 3VWUA 4F82A 2YN1A 1NHOA 2GZYA 3UL3A 5IMFA 4GF0A 4AGSA 5G30A 2YPMA 5H5SA 3HVSA 2B1LA 2KHPA 2YOIA 2XPDA 2CQ9A 4MJEA 2H70A 5ABRA 2H01A 2P5RA 5ID2B 1A23A 2PN8A 1GTBA 2FY6A 1SENA 1PN9A 1M99A 5A4WA 3CMIA 1GRXA 1K0OA 3MAKA 2C0GA 3EINA 4LA1A 5GSSA 2G0FA 4F0CA 4QL9A 3M1GA 1V9WA 3KTBA 2R2JA 2VIMA 4V2LA 5GAPD 5A5KA 3W8JA 4KH7A 4F03A 5CRHA 1BG5A 1DBYA 4ZBDA 1U88A 2HZFA 5DALA 2I4AA 1ERWA 1EV9A 1HNBA 2YV9A 10GSA 5E4WA 5AIVA 4KDXA 1ABAA 1G7EA 2V41A 2NTOA 4TOPA 3UARA 3EYTA 4MMMA 1N8JA 1GUMA 3GL5A 1O8XA 1OE8A 2JZTA 4TR3A 1O6JA 1RQMA 1PRXA 1K0AA 4JR6A 1EOHA 1GWCA 5COHA 1AXDA 1OC9A 2B6MA 3TCOA 1R5PA 1WWJA 3GTUA 2CAQA 2GQMA 4YAPA 5IMZA 4WEYA 3GKMA 2WZ9A 3D4TA 2H0GA 3UIWA 2L57A 2L4CA 2YNXA 4NWYA 5IO2A 3QFBC 2DJ2A 1PSQA 3E0UA 1FOVA 1M2BA 3KJYA 1SL0B 2XHFA 4EL1A 3P7XA 3WD6A 4DSQA 5F8BA 2HSYA 2JZSA 1PQNA 1T7PB 3DD3A 1R4WA 3DKSA 1PMTA 4Q5RA 4MJBA 4IJIA 2JSYA 2NDOA 3QFAC 2YWMA 1Z7RA 4PQ1A 4MZBA 3FR3A 3F9UA 1PKZA 2OE0A 3CXGA 3NZNA 1URMA 3QMXA 3ZZXA 1O73A 3KH7A 2VL2C 3MWHA 3FZAA 1UN2A 3IHQA 4EXJA 1OE7A 3HZ4A 3F63A 4K8MA 2LJRA 5IM9A 1Q98A 2GSRA 1USBA 2XPEA 2C80A 3KP8A 3IDVA 4DVCA 1GSYA 2FWHA 2VO4A 4TR1B 1A2MA 3ZMKA 1PD21 1TRSA 3APOA 2JZRA 4FYUA 3UVTA 3Q19A 2GZPA 1GSUA 2ES7A 2VAFA 1AQXA 1XZOA 3LXZA 1Y6EA 4I8BA 3IAM2 4LL4B 1R7HA 5F06A 3K8NA 4MH3A 1MDIA 1SYRA 6GSWA 5ECNB 3FW2A 2GT6A 2LNSA 18GSA 3ZIVA 1T1VA 2GVPA 3QD9A 2JL4A 1K3OA 2OE1A 5AN1A 3QCPA 4L8EA 4K7IA 6GSSA 1M2DA 3E3EA 3M9KA 4KCEA 3FZ9A 3QPMA 2V2GA 2FGXA 2V6KA 1XVQA 3L9SA 3D21A 1A8YA 3DGQA 4LL1B 4IHUA 4V2MA 2H19A 5J3RA 2B1KA 2B5XA 1F2EA 4PNFA 5ELGA 3H93A 3TOTA 1WPIA 2C1YA 4V2NA 3F8UA 2X8HA 22GSA 3ME7A 1W89A 4K1FA 1FHEA 1XWBA 3GH9A 5A4UA 1ERTA 5ECLB 2IMDA 1HYUA 4E8EA 1OYJA 2L6DA 5KN3A 1I5GA 4TXOB 4CHSA 4K7OA 2C0FA 4Q5FA 3L9UA 1PX7A 3PR8A 1XWAA 2FA8A 2EC4A 4XS6A 2O87A 2O7KA 3HKRA 3N5OA 3APSA 3EMXA 4D73B 5IOWA 2H0IA 4J56E 4EUYA 2VUPA 1SK0A 1T4YA 1DSBA 5EY6A 2VM2A 3MSZA 3BCIA 4EE0A 4F9ZA 3HCZA 2DLXA 1IYIA 4WXTA 3A2VA 2X8GA 2GSTA 1ZMAA 6GSXA 1B4PA 2LNTA 2B3SA 1BYEA 1MDJA 3IR4A 3W6GA 1I9DA 3HVVA 1K0CA 1EP8A 4AJ6A 1TRVA 4IW9A 1A8LA 2I9HA 1X9MB 3TJGA 4KSOA 1V2AA 4JE1A 2KP2A 2VLUA 1OKTA 4MH2A 3DXBA 5HR1A 3I69A 2K9FA 1ST9A 4CDOA 3TDGA 2VL2A 2YP6A 4HOJA 4GLTA 2I3YA 4HZ2A 1K3LA 5J5NA 5DDLA 1TP9A 3DVWA 2H1DA 4J57E 3TKRA 5CP1A 4KW6A 5CYYA 2OBKA 1TW9A 4ZL7A 1ZYQB 3IC4A 3FZ5A 1FVJA 3A5WA 5LNKe 1TU8A 2YZHA 3KIJA 1GUKA 3ZREA 1OKDA 2MBTA 1XWGA 3HD5A 2LRTA 2CZ3A 1VRSD 3DIEA 4GSNA 3A3TA 1XW9A 2H30A 1AAZA 4WKWA 3GUSA 3WT2A 3FKFA 2E2MA 2G2QA 1EV4A 1X5DA 3IA1A 1GNEA 9GSSA 1XXUA 1EEMA 1O7UA 1TK5B 2WCIA 3Q18A 1T8EB 4OWYA 2BMXA 2QKEA 3Q6OA 3KCMA 4ECJA 1A2JA 2HXKA 4KDYA 4GRFA 2FWGA 5J9BA 5CRGA 3J7Yk 3WGXA 2F8AA 3CSIA 5KN2A 5DAKA 4O92A 5KN0A 2AV4A 4ACSA 2KOKA 2JADA 1SJZA 2F8FA 3ZFBA 1QQ2A 4PUAA 3GKKA 4MZWA 4F2IA 3UBKA 5DALB 5DBQA 2N5BA 5DCHA 1KNGA 1YKAA 4FYCA 3M8NA 1QGVA 17GSA 2N5FA 2KP1A 4YAVA 4XS4A 2PERA 3TB2A 1U3AA 1T4ZA 2X64A 2LQQA 3C1RA 2L5LA 3ERWA 3LQ7A 4O7HA 4PX1A 2IL3A 5CRDA 1ZL9A 2CVDA 2RUEA 1Y25A 3GN3A 3D0ZA 2K18A 4IQAA 3VFIA 3KMNA 5F05A 3DEXA 3GH6A 1V40A 1GULA 2GT5A 3H79A 4JRRA 1KEBA 1WJKA 2QSIA 1OC9B 4X43A 1HNAA 2GQLA 1X9WB 3ERGA 3GTUB 4POBA 1K3YA 2H8LA 1CQHA 4JEDA 2M46A 1TXXA 1O81A 3KXOA 3M9JA 3VURA 1GTIA 1CQGA 5HR0A 3GHAA 1MTCA 3APQA 2VD1A 3M0FA 2K8VA 3LYPA 2HNLA 2H75A 3PH9A 2R3XA 2C0EA 5HFKA 3U6VA 1SU9A 2J23A 5CO3A 1TJDA 3US3A 5ECQB 2VCZA 4QQ7A 2OKAA 2H6ZA 5INYA 3S9FA 4DSRA 4P3YB 3LFLA 2FCHA 3D4MA 1VF1A 1AC1A 2CV4A 2M80A 1QK8A 2DJKA 3UAPA 4ECBA 1Z3EA 3RPNA 1GTUA 4OCEA 1K0MA 4I2TA 3P8WA 4TW5A 4MF5A 8GSSA 1SJIA 1FB6A 5IOXA 1X9SB 4TR0A 4NHWA 1YY7A 3O3TA 3NIVA 2LJKA 4BWSA 1G7OA 4X0XA 3FEUA 1HQOA 1SK2A 3QDNA 3N9JA 14GSA 5KEJA 2DMLA 11GSA 1NM3A 3GFKA 3IBHA 2CA8A 2H0HA 4WR4A 5JCWA 3G7JA 1U6TA 1ZGNA 2B5EA 2DC5A 1F6MC 3L0HA 1GLPA 2YWNA 1M9BA 1MDKA 1V98A 4EDYA 1XCCA 3ZVJD 4NV5A 5E59A 3F3QA 4K6XA 2DJ1A 1WIKA 4XIHA 4HQZA 2VL9A 1B48A 4GTUA 2VCWA 3KZQA 5J41A 1ML6A 5J4UA 1ERVA 4K0GA 4OMVA 4NMUA 4GSTA 3CYNA 3C8EA 2B7KA 1YZXA 2XC2A 4BWQA 2LEGA 3A2XA 3FR9A 3ZRDA 1HNCA 5FT3A 2HRFA 2IPAA 4LLRA 2IWTA 2MZCA 3V1WA 2NVLA 5JCUA 4L0UA 2H74A 5CRWA 5CREA 2IJYA 19GSA 3C73A 1AQWA 1WOUA 2A2SA 2MMZA 2EIRA 5B6NA 5D8IA 2TRCP 2VL3A 2WB9A 3ISOA 2TIRA 4L5OA 4MF6A 2LTKA 4GXZA 2AYTA 1TI1A 4GQCA 3EE2A 4MCUA 3D6IA 3TOUA 3F4RA 3DYRA 4POMA 5IMCA 4ZB9A 1OVNA 2IIYA 5L71A 3FRCA 4MPFA 4KB3A 2JSZA 2P5QA 3LORA 2LRCA 1XOAA 2X8CA 2DMMA 2DJ0A 4HZ4A 6GSTA 3WT1A 4TVEA 3KP9A 2YV7A 4V1Ap 3RAZA 2C3NA 2KUCA 1ZZYA 1LJRA 2H66A 4ECCA 4N10A 1ERUA 2FLSA 3HY2A 2K6VA 5EVOA 3UEMA 3FYGA 1TI3A 1IYHA 4KGIA 2F3MA 4ZXGA 4MP4A 1WMJA 5ECSA 1FO5A 1VGLA 2AJQB 2D2ZA 1YKCA 2X99A 4IKHA 1TK0B 2OJLA 3KD0A 4MLYA 5G5EA 4XRDA 1ACVA 1Z6NA 3BD2A 3M3MA 1OC8A 4TKYA 4RQXA 2VCTA 5HR2A 3RBTA 2OBIA 4EC0A 1MEKA 3DMLA 6GSUA 4BPYA 1WP0A 5B8BA 4XS1A 20GSA 3IE3A 1B8XA 2GSSA 3L4NA 5H5QA 2JU5A 4H86A 4L0WA 4JU5A 4RI6A 3U5RE 2PU9C 1JLWA 4I2UA 4HEA2 4FYBA 5D9VA 4YQUA 3A2WA 3IPZA 1Z5YE 3R2QA 5ENUA 4IQ1A 1YDKA 2VOCA 2H71A 3DWVA 3PINA 5JWRB 1PL1A 3F4TA 3G9BA 4BL7A 3C71A 5GAND 3H4KA 4IP6A 2Z9SA 4WF5A 1QUWA 4K0NA 2LV3A 1TRWA 1SL1B 4EVMA 3KTLA 3G7IA 2C0DA 3I43A 2LQOA 3GRXA 2O8VB 2V1MA 1FG4A 3HXSA 4HJMA 3GV1A 3MNGA 3KH9A 3D5JA 2DSAA 5D9XA 1JHBA 1AIUA 3TUEA 1JZDA 4HU7A 3VI7A 1PL2A 1KTEA 2V6OA 5H5RA 1GSQA 1J9BA 2VD0A 3TKSC 3CSJA 1XWCA 6GSVA 3LJRA 5D9TA 5DJMA 2AUVA 1HD2A 4OO4A 5G5FA 2QGVA 2PUKC 3KEBA 1Z6MA 3DRNA 4OFNA 1ZCPA 5DAKB 5D93A 1S3CA 2R4VA 4OD7A 1ZOFA 3CSHA 1T00A 2N5AA 3ZTLA 3KM6A 3BCKA 2WRTA 2I1UA 1WRYA 3QAVA 1EGOA 1M0UA 2FUG2 3VWXA 4G9HA 4ZBBA 1M2AA 5F0GA 4I97A 1PKWA 1XOBA 2HRNA 16GSA 2GDRA 2HLSA 4TXOA 4XS4B 3VLNA 4G10A 2WJUA 2HE3A 2OE3A 2C8UA 3F4SA 5IO0A 3IXRA 3GMFA 5ELAA 4D73A 4MABA 2FHEA 4ZL9A 1O85A 2WULA 4PGTA 3SBCA 1YQ1A 2VM1A 2LRNA 1XBSA 3TKPA 1W4VA 1J08A 3CBUA 5B6MA 1A24A 4Z7XA 2YWOA 13GSA 5LCZA 1YJ6A 2P0GA 4G2EA 2AAWA 1E6BA 1B9XC 1JZRA 3JCML 1SKWB 1SKRB 4YQVA 2H1AA 1AQVA 4EO3A 3ZLPA 3UBLA 3ERFA 3SWLA 4IS0A 2HZEA 4DEJA 4PURA 1EOGA 2ZCTA 4YH2A 1THXA 3Q74A 2HYXA 3FR6A 4HJ2A 2DIYA 3HA9A 3RHBA 1K0DA 4XHMA 5JWOB 2GGTA 3CRTA 2RIIA 1XW6A 2DIZA 5ECIB 2E0QA 2LKUA 5IMVA 1MD4A 2IFQA 2GZZA 2NPBA 4WF4A 4WBRD 1YF1A 4PUFC 1VF2A 1THOA 4TRXA 2FNOA 2O89A 1O8WA 5JCGA 2L59A 3HDCA 2IMFA 5IIZA 2BTOT 3BBYA 2FD3A 2CVKA 1K0BA 2WDUA 1SL2B 4KX4A 4JBBA 1VF3A 3WYWA 5DQYA 4AJ8A 4OO5A 3QOUA 12GSA 3FK8A 1G6WA 2E2GA 4K7NA 3ZVJA 5A4VA 3EURA 2C4JA 1MD3A 5B7CA 2TRXA 3KGKA 4ZB8A 1X5EA 4ECIA 1T3BA 3VPQA 4ML1A 2YANA 3TRPA 4XCSA 5G2ZA 2IMKA 1GSSA 3UVHA 4IJ3A 3TKSA 4JR4A 5IMDA 1NW2A 4EDZA 4KA0A 2DJ3A 2A4VA 3TGZA 5CAXA 5AISA 2ZUPA 5HR3A 5G1LA 3I9V2 1XPVA 2B7JA 2PPTA 4O32A 4LMVA 2E7PA 2IN3A 3LYKA 4OFMA 1PGTA 4Q5QA 1TTZA 3GX8A 4KE3A 3GA4A 1RK4A 3EC3A 1H4OA 2K8SA 3DVXA 1LBKA 1C72A 2R37A 4NAXA 4MPGA 4HUAA 4KAEA 4G19A 1SYXA 3WGDA 1PX6A 4HQSA 4DSSA 1GUHA 3GSSA 1SD9A 3HHVA 4ISDA 1RW1A 3AY8A 1A2LA 1F3AA 1G0TA 1AUCA 1JFUA 1Z7PA 1PA3A 2ALBA 2BJXA 3VWVA 1QFNA 2H6YA 5AGYA 4I6XA 3C1SA 4MA9A 2WS2A 3KMOA 4ULXA 2HI7A 2RM6A 1BAYA 2OACA 4AF2A 5FWGA 7GSSA 4HDEA 4POLA 5IPGA 5J9CA 4IP1A 3TJJA 4ZBAA 1A0FA 3G7YA 2CX4A 2RLIA 1GH2A 3GKNA 1F9MA 5ID2A 1BEDA 2R6KA 1DE2A 1GL8A 2I81A 3UMAA 1UVZA 3W8SA 2AB6A 3EMPA 3HZ8A 2GS3A 1F3BA 2RM5A 5LD0A 4EF0A 5D9WA 3RHCA 1V58A 4PQIA 4FO5A 1JZOA 2PMTA 4ML6A 4EKZA 5JWQB 3IK7A 1X5CA 1GP1A 5HQPA 4K2DA 3VI5A 2CT6A 1EWXA 4ZB6A 4NV2A 3NOFA 1TKDB 1ZYEA 4N0ZA 4L5LA 4ID0A 5EPFA 2L5OA 1R5AA 3VWWA 5G1KA 3C7MA 1H75A 2ZNMA 4GCIA 1GLQA 5DJLA 3TJBA 3BJ5A 4FIWA 4N0VA 2PBJA 4MJCA 1XFLA 1TU7A 3ZMLA 2VCVA 2H72A 3QR6A 3IAS2 2A2RA 3EU3A 1B9YC 1SD8A 3HYPA 1U87A 2MBSA 1X0RA 4KNDA 2XBQA 1NSWA 4TR4A 5C00A 1FW1A 4NPBA 1QXHA 2PGTA 3CTFA 5ECRB 5IMAA 3PGTA 2IMIA 4HU9A 2GTUA 1XWKA 4F0BA 5HFGA 4PNGA 4ZILA 6GSYA 2ON7A 2VLVA 3F3RA 2CAIA 2VLTA 1JLVA 4NHZA 4KCAA 3H8QA 1TK8B 2H1BA 4Q5NA 4X1UA 3TJFA 1LU4A 4FH8A 2LS5A 2P31A 2MMAA 2CX3A 1XVWA 1VF4A 1Q4JA 3MDKA 1J0FA 1OAZA 1AW9A 2H1GA 1FVKA 3LXTA 3LSZA 3EU4A 1GSEA 3ZFLA 3HVXA 1M7TA 2YWIA 2C3TA 1EZKA 1FB0A 2F51A 4I5QA 3ZL5A 3QAWA 4PQHA 1ILOA 1BX9A 3L9VA 5ECKB 1UC7A 3GURA 4POKA 3J7Yb 2FWEA 4TR1A 3D22A 1QMVA 4KUNA 2QC7A 3GL3A 3O6TA 4N30A 4RUVA 4HI7A 5ECMB 5ECOB 4E8HA 5AIXA 5C04A 2HT9A 1EGRA 4WR5A 4MDCA 1V57A 1GTAA 2VCQA 3ME8A 1N2AA 2PVQA 5F07A 4KDUA 3GNJA 4K9ZA 4MZCA 5GSTA 2IMEA 2WFCA 3I6AA 1GNWA 2HFDA 4GWRA 3LGCA 5FHIA 5IPHA 4OFTA 2M72A 2FA4A 1GSDA 1G6YA 3CRUA 4NXIA 3H1NA 4AJ7A 4TN8A 3GYKA 5D73A 1OC3A 2MYGA 4O5RA 2REMA 1EP7A 1YEXA 3VK9A 2F9SA 1YEPA 2GLRA 1TOFA 3HJPA 2YJ7A 5KN1A 2VCXA 3LEFA 2HZEB 2YCDA 4HS1A 1YF0A 4JZQA 1SK1A 4RQRA 4ZL8A 3HJMA 2RUFA 1B4QA 2OADA 4YQMA 2LJAA 2YJHA 3CTGA 2CVBA 2WGRA 1ON4A 1U3IA 2IFQB 1K0NA 3EWLA 3BOAA 1XIYA 4KSMA 2FWFA 4TXVA 2H73A 4PXOA 5DCGA 2B5YA 1S3AA 4BVYA 1DE1A 4IN0A 3ED3A 2MMOA 3TKQA 3IOSA 1EEJA 3ZIJA 2NBSA 4ZIJA 2LUSA 2LSTA 2PVOC 1XW5A 4IELA 3E9JB 3GKXA 4QL7A 2R5GA 3IV4A 2H6XA 4GSSA 3ZYWA 3RPPA 2HSHA 4ILFA 1F37A 4OCFA 4LMWA 2CZ2A 4IVFA 3WGEA 3F6DA 3HJOA 4GQFA 1BQ7A 1DUGA 3F0IA 3GX0A 1M9AA 3UOMA 3ZITA 3TKSE 2O85A 2ON5A 1GSFA 1A0RP 1TRUA 3IK9A 3UJ1A 4MK3A 4XRAA 4BVXA 5IQYA 3EVIA 4CW9A 3FZ4A 2YZUA 2KLXA 5G31A 3TRQA 1R26A 5DVBA 3FHKA 2V32A 2XBIA 4XTSA 3IRAA 3OR5A 2OA7A 3VPTA 1SKSB 2EIOA 4V1Ag 1JZWA 3FY7A 3GSTA 2L6CA 3GIXA 2DBCA 1BJXA 5ECPB 2GQKA 2AHEA 5CNWA 5GZZB 3L78A 2DJJA 4WETA 4IGJA 1TDIA 1WE0A 3P2AA 3LG6A 4MF7A 2GSQA 1SJ6A 5DQSA 1S3DA 5ECHB 1E2YA 2EIQA 2J9HA 1Z9HA 3QAGA 2PWJA 3RDWA 1KBNA 4DSSB 1FAAA 5EL8A 2MMNA 2L4QA 3F6FA 3O76A 3TJKA 3P90A 2H76A 2C3QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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