1ST9A

Crystal structure of a soluble domain of resa in the oxidised form
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
137
structure length
137
Chain Sequence
EGSDAPNFVLEDTNGKRIELSDLKGKGVFLNFWGTWCEPCKKEFPYMANQYKHFKSQGVEIVAVNVGESKIAVHNFMKSYGVNFPVVLDTDRQVLDAYDVSPLPTTFLINPEGKVVKVVTGTMTESMIHDYMNLIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thiol-disulfide oxidoreductase resA
publication title Structural Basis of Redox-coupled Protein Substrate Selection by the Cytochrome c Biosynthesis Protein ResA.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 137
sequence length 137
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1st9A00
4NV5A 1WOUA 4ZB9A 1U6TA 2IFQA 5H5RA 1PD21 3EMPA 4GSNA 3LORA 1DE1A 1PGTA 5GAND 3Q6OA 2H30A 3W8JA 3FY7A 5ABRA 2H19A 4ECIA 5AIXA 1EOGA 4KH7A 4ECBA 1TRVA 3Q18A 5CNWA 1SK0A 2DIYA 1U3AA 4Z7XA 4GXZA 2H75A 1EP8A 3DYRA 3M0FA 3HJMA 3BJ5A 3GV1A 2DBCA 3TRXA 4WETA 1GUMA 1M2DA 1FVKA 4KSMA 3O6TA 2R3XA 1MD3A 2GZYA 4L5LA 2FLSA 3ERFA 1GSDA 2O85A 1K3YA 5DDLA 1Z6NA 4MH2A 2VCZA 1ST9A 3FR3A 4O92A 2V2GA 1EEJA 1Y6EA 12GSA 2E0QA 3TKSE 2B5EA 2DMMA 2E2MA 1DSBA 1SU9A 1X9SB 1RQMA 3DEXA 1MEKA 3UBLA 3D4MA 1EWXA 5D9TA 2KP1A 1A23A 1Y25A 3KTLA 3VK9A 2GT5A 2X8HA 1O73A 3LYPA 5IO0A 4I97A 1K0BA 3WGEA 1OC3A 4IW9A 2CZ2A 2R37A 4K0GA 2H70A 4EDZA 1AQXA 1S3AA 3GURA 2H66A 1SKSB 4K1FA 2K8SA 4EE0A 3IDVA 2GSRA 1CQHA 2VAFA 4ZXGA 4FYBA 1K0OA 2DJ0A 1YF1A 2H1GA 2LRTA 2H73A 1XBSA 2H1AA 4IJIA 5ECIB 4I5QA 8GSSA 4CW9A 4MPGA 4LL1B 3ZZXA 1T3BA 2A2RA 5JCGA 5DVBA 2DSAA 2B5XA 3TOTA 1A0FA 1MDJA 2LRCA 1T4ZA 6GSTA 22GSA 2YOIA 1KBNA 4JBBA 2ON7A 5DALA 2PVQA 4F0CA 3APQA 2CVDA 1T7PB 5AGYA 1QQ2A 3DMLA 5ID2A 2LQOA 1X9WB 2VL2A 5GSSA 3VFIA 3FRCA 2FD3A 3UOMA 4OMVA 5J3RA 3V1WA 1U3IA 5B6MA 3ZVJD 1FO5A 3GX8A 1V58A 1PKWA 3RPNA 3F63A 3P90A 3IBHA 3QMXA 1Z7PA 2DJKA 4DSSB 3G7JA 2C1YA 2NPBA 4IKHA 2L59A 3QDNA 3OR5A 4G2EA 2M72A 1FHEA 3GFKA 3APOA 2PBJA 4HJ2A 2YZUA 3UMAA 2I1UA 5B8AA 14GSA 1B9YC 3FKFA 5HR3A 2ZCTA 2NBSA 2YWIA 1ZYEA 2K8VA 5KN0A 4ZL7A 2EC4A 2FNOA 2GGTA 4TR1B 2EIQA 3P7XA 3LQ7A 2PVOC 2KP2A 5IMZA 1A8LA 4XS4B 2IIYA 5ECLB 3FZ4A 4IGJA 2CAIA 1G7OA 3PR8A 4WXTA 5IMAA 3TKRA 1UVZA 2J23A 2HZEA 2DJ1A 5IO2A 1XOBA 2X99A 3FR9A 6GSWA 3LFLA 3ZITA 1RW1A 3CSHA 1O85A 1OC8A 2XC2A 2IWTA 3D22A 3L0HA 4KAEA 4EXJA 2H8LA 5KN1A 2L5LA 4POMA 4F0BA 5FT3A 3MSZA 3VLNA 3IV4A 3HVXA 2LV3A 3QFAC 1A24A 4FH8A 2RUEA 1Z9HA 4WBRD 2MZCA 3D6IA 5E4WA 5IPHA 4AJ7A 2LJAA 4IS0A 5D9VA 2CX4A 1GNEA 2ALBA 4IQ1A 1THXA 1FW1A 5HFIA 2KUCA 5IQYA 4J56E 4X0XA 2WS2A 4ZIJA 5IMFA 2P31A 3R2QA 3HCZA 2QSIA 4G19A 2A4VA 3TB2A 2V41A 3E0UA 1WRYA 2LRNA 2YWMA 3GSSA 2DMLA 2OE1A 1F3BA 2VM1A 5G2ZA 2BTOT 3EU4A 1PKZA 4LA1A 3KH7A 3IR4A 3P2AA 2LUSA 1THOA 3DD3A 5A5KA 1ML6A 4HEA2 2PN8A 3PH9A 1XOAA 4EDYA 3L4NA 4GSSA 4HJMA 1VF4A 2JZTA 6GSXA 3LEFA 4QL9A 1TOFA 1VGLA 3VI5A 1PA3A 2IMEA 4XCSA 1Z5YE 2TIRA 1TJDA 1LBKA 1OC9B 3H8QA 4IP6A 1YKCA 2GZPA 1B4PA 3EMXA 2XPDA 4HU7A 2DJ3A 1XXUA 4MP4A 4MJEA 4K9ZA 1H75A 2CT6A 4O32A 3NZNA 3QAGA 3IAS2 3ZVJA 4KCAA 4HU9A 3K8NA 2OKAA 1XWAA 2VCWA 3W6GA 2N5BA 3J7Yk 3BCKA 2YN1A 5J9CA 1GUHA 4PNFA 3GIXA 3DKSA 2Z9SA 5GAPD 3L9UA 4KW6A 1OKDA 1K3LA 4EVMA 4N10A 2JZSA 1ACVA 3P8WA 3QAWA 3QAVA 4KSOA 1MD4A 3KCMA 3U5RE 2H01A 1SD9A 2HI7A 5LNKe 3ZL5A 1O8WA 3ZIJA 4K2DA 4K7NA 3IE3A 3W8SA 2VOCA 2YJHA 4MJAA 1F6MC 2VLVA 2PGTA 18GSA 4ECCA 4TKYA 4O5RA 5DQSA 1PX7A 2CA8A 4MJBA 5B6NA 3D4TA 1V57A 1V2AA 3KEBA 2VD0A 6GSYA 1KTEA 2WULA 2H72A 1T1VA 4AF2A 1ON4A 3GTUB 1VF1A 2FWFA 4IELA 2RLIA 1SJZA 2VL2C 3F8UA 4KUNA 1O81A 1GTUA 1DBYA 1WJKA 3IPZA 1TRSA 4EUYA 2WRTA 4K7IA 4NHWA 4HS1A 3HJPA 2WFCA 3ZTLA 1NW2A 3FEUA 4N0VA 4BVXA 4HQSA 2CX3A 2NVLA 1QMVA 2V6KA 2YANA 2YV7A 2N5AA 1ERUA 4TXOA 4LL4B 3HZ4A 5G1LA 3HXSA 4ZBBA 1ERVA 5ECSA 4XS6A 2FUG2 3M1GA 3GYKA 4YAVA 2R6KA 1EV9A 3LJRA 1G6WA 5EVOA 2WB9A 2IFQB 4EO3A 4EL1A 2R5GA 3TOUA 3FK8A 1ERWA 2C80A 2M80A 1CQGA 2AHEA 2ZUPA 4OO5A 3GKKA 1FOVA 3GL3A 4MF7A 1JHBA 3FYGA 1M2BA 4MDCA 5DCGA 5DAKA 1R7HA 5DQYA 2MMNA 2OJLA 4LMVA 3KMOA 1HQOA 1PRXA 1XWGA 2H0GA 2QC7A 4MA9A 3A2VA 2HFDA 2F8FA 3KZQA 2WZ9A 5EPFA 3KD0A 5IOXA 5JWQB 4BA7A 1XWKA 3IC4A 2OACA 1H4OA 2B6MA 2LJKA 5D8IA 1R4WA 4RQXA 3MNGA 1ILOA 4PGTA 2I81A 3G9BA 5IMCA 2AAWA 1KEBA 1QFNA 2B7JA 5HFKA 1K0NA 5DJMA 1DUGA 1BYEA 4AJ6A 2CAQA 5G5FA 4ZB8A 3IK9A 4IN0A 1GTBA 3H1NA 3AY8A 2L6DA 3RHCA 2K18A 3FHKA 1JZOA 3KMNA 2CVBA 1B8XA 1EV4A 3A2WA 1XIYA 3GHAA 1XPVA 1SK1A 5CYYA 1GLQA 2L4CA 3HY2A 2IMDA 1U88A 1B48A 5HR1A 5CO3A 2JZRA 4POLA 4POKA 3TJJA 4FYCA 3HD5A 3UL3A 1QK8A 3GKNA 3HKRA 4IVFA 1V40A 2GDRA 2QKEA 1FAAA 4I8BA 4YQVA 4HUAA 2JADA 5JWOB 2C3QA 5LCZA 3IK7A 5AISA 2HSHA 4QQ7A 2FWEA 3GNJA 3QFBC 4I2TA 1TI3A 4JU5A 5HR2A 6GSSA 2YV9A 1A2LA 4POBA 1GH2A 2GVPA 1YY7A 4TW5A 2P0GA 1A2JA 2C3NA 1SYXA 2HRNA 3N5OA 5LD0A 5DALB 2GQLA 3VWWA 5ID2B 1I9DA 1HD2A 2BJXA 2F3MA 4PUFC 1B9XC 2I9HA 3TUEA 2DJJA 2CVKA 2IMKA 3CRTA 3BOAA 1SL0B 3GRXA 3NIVA 4MH3A 2PUKC 4GQCA 1VF2A 3LXZA 3D0ZA 4KDUA 2DLXA 4PQ1A 4WEYA 3DVWA 3I6AA 3DIEA 3VWVA 3S9FA 4NWYA 1XCCA 5FWGA 2L5OA 3DRNA 3GL5A 1R5PA 4LLRA 2EIOA 1TRUA 5D73A 2LNSA 5E59A 1TW9A 1YDKA 3UVHA 4ACSA 3UJ1A 1GSFA 2IMFA 5EY6A 2FWGA 4ZL9A 1GLPA 2MMAA 4V1Ag 1F9MA 4GWRA 5ELAA 1OKTA 19GSA 1T00A 1OYJA 2IN3A 4JR6A 5F07A 1AC1A 2YJ7A 3IAM2 4JZQA 1Z3EA 5ECPB 13GSA 3UARA 5J9BA 1SD8A 4RUVA 4MZCA 5G1KA 3H4KA 1W89A 4ILFA 4K6XA 2X8CA 3ZIVA 4KA0A 1Z6MA 1R5AA 1X9MB 1ERTA 1J08A 1SKWB 4F9ZA 2JACA 2ES7A 1PSQA 2VLTA 5KN3A 3UIWA 2G0FA 2PWJA 3GUSA 3UBKA 3WGDA 4IP1A 1K0MA 3F6FA 2IPAA 3EE2A 2KLXA 3DXBA 1ZL9A 4YH2A 2VCQA 2G2QA 3QOUA 1BAYA 1WIKA 1FVJA 3PINA 2H6ZA 5IM9A 2GSQA 3ZYWA 4JEDA 1M99A 2RIIA 4WBJA 3EURA 1S3DA 1BQ7A 5D96A 1M9AA 1A2MA 2IL3A 2DIZA 2LTKA 2L57A 5ECRB 3IRAA 4OWYA 2NDOA 4ML1A 3VPQA 2OBIA 5B8BA 4ZL8A 1GUKA 3TDGA 1ZOFA 3TGZA 3ERWA 1XW5A 4IHUA 3CYNA 3CRUA 3GSTA 1M7TA 2B5YA 3CXGA 4H86A 3EYTA 2RM6A 3US3A 3ME8A 1LJRA 1FG4A 3GN3A 1JFUA 2EIRA 3HZ8A 3KGKA 3CBUA 2YWNA 2AUVA 3TCOA 4NAXA 2C4JA 5D93A 4F03A 2LS5A 3TKPA 5F06A 4N30A 3C71A 4NV2A 1SJIA 4FIWA 2JSZA 1EOHA 4YQMA 4D73A 2HSYA 5GSTA 1BEDA 2IMIA 1WMJA 1PN9A 2LJRA 3HVVA 2VM2A 5ENUA 5IMVA 5H5SA 3N9JA 2FWHA 4N0ZA 2LSTA 1M9BA 2HYXA 4OFMA 2M46A 1OE7A 1VRSD 1XW6A 5HQPA 6GSVA 4K0NA 1WPIA 1FB0A 1MTCA 5J41A 3CMIA 3KP9A 1X0RA 1TP9A 2C0FA 1PX6A 3ZLPA 2P5QA 2X64A 1EZKA 2FY6A 4PXOA 1R26A 2PU9C 3I69A 3BD2A 4L5OA 5F8BA 3L9SA 4EKZA 3ZMKA 2V1MA 1SENA 1A8YA 2YWOA 2YP6A 3F3RA 4PQIA 5A4VA 2H1BA 2ON5A 2C0GA 3TKSA 4BVYA 2CZ3A 1BG5A 3DGQA 4EF0A 3HVSA 2WDUA 3QCPA 4GTUA 3IOSA 5IOWA 1RK4A 4YAPA 3D5JA 3M9JA 2R2JA 5J4UA 4KX4A 1LU4A 3ME7A 2WCIA 1OAZA 4TVEA 4ZBDA 4WR5A 5D9XA 5GZZB 5JCWA 2FA4A 2GLRA 1YKAA 3E9JB 5C04A 1TK8B 4P3YB 2WJUA 5ECHB 5CP1A 20GSA 3E3EA 2J9HA 3TKQA 1G6YA 4HQZA 3IA1A 1E2YA 4OCEA 4XHMA 1T4YA 1NHOA 2P5RA 5ECOB 3VURA 4ZBAA 2YNXA 4F82A 4DEJA 4OD7A 4FO5A 3CTGA 5ECQB 3IHQA 3I9V2 1TI1A 2H76A 2O89A 3MWHA 4XTSA 1AW9A 2A2SA 2GZZA 4LMWA 4K7OA 5ECMB 4ULXA 2OE3A 4GLTA 4X1UA 3GH9A 2PMTA 3HA9A 2XHFA 1GULA 3PGTA 3DWVA 3Q74A 4MF5A 3GX0A 4MK3A 4TXOB 1NM3A 2OBKA 3C8EA 2LQQA 4GF0A 5ELGA 3RPPA 3KJYA 1TK5B 3VWUA 1U87A 1SK2A 1XWBA 1YF0A 3UVTA 1SJ6A 2YCDA 1W4VA 1WWJA 4BPYA 2FA8A 3H79A 5CAXA 1EEMA 3FZ9A 2PERA 3H93A 4DVCA 4O7HA 2VCTA 16GSA 3WT1A 4TOPA 3HYPA 2HRFA 1B4QA 2HNLA 1BX9A 2O7KA 5DAKB 4PNGA 4J2FA 1GNWA 2REMA 1F2EA 3L9VA 1F37A 3F4SA 4ZB6A 3HJOA 3CTFA 3GMFA 1GTAA 2AV4A 1V9WA 9GSSA 4GRFA 1SYRA 4ID0A 2VD1A 4EC0A 2FGXA 2GS3A 5JCUA 17GSA 3KM6A 5L71A 1YJ6A 4RI7A 2MBTA 1S3CA 2GSTA 4L0WA 4I2UA 3M3MA 3I43A 2MMOA 1ZGNA 2VLUA 5DBQA 3M8NA 3ZRDA 2I3YA 5JWRB 4PUAA 2VL9A 3EINA 3M9KA 4NPBA 4TR0A 1GRXA 1TK0B 3GA4A 3TJKA 2AB6A 3ZFBA 4V1Ap 4L8EA 4XRDA 1C72A 3G7YA 2BMXA 5G31A 1HYUA 2O87A 1PQNA 1QGVA 3WT2A 1QXHA 2HE3A 1AQVA 1HNBA 2N5FA 3KXOA 1XW9A 4BL7A 3ISOA 2OE0A 5A4WA 4BWSA 2L4QA 3KP8A 2C8UA 2GSSA 3F3QA 4KGIA 1JZDA 1MDKA 4J57E 4TR4A 1GWCA 4AGSA 1AAZA 1G7EA 1I5GA 4WR4A 4IJ3A 4I6XA 3LSZA 2JU5A 2F9SA 2MMZA 4Q5RA 1HNCA 3GH6A 7GSSA 1XZOA 4DSSA 1GSSA 2HLSA 1GSEA 3WYWA 1PL1A 2LKUA 1TKDB 1J0FA 4KCEA 5G30A 2NTOA 5ECKB 1OVNA 4OO4A 2VCXA 3G7IA 1YEXA 2OADA 2PPTA 1TU8A 4X43A 1M2AA 3BBYA 2VIMA 1ZZYA 2F51A 4KE3A 4HZ4A 4MLYA 2AYTA 5A4UA 1Z7RA 1PL2A 1YEPA 1EGRA 4Q5QA 3C73A 3EWLA 3TRPA 3KTBA 2MBSA 4JRRA 3F4TA 4G9HA 1Q4JA 4TR1A 2RM5A 3EVIA 4RI6A 3FZAA 3VPTA 3TKSC 4XS1A 4V2MA 2ZNMA 4XS4A 5F05A 3C1RA 2VL3A 4TN8A 1TRWA 4Q5FA 4KDYA 2B1KA 2DC5A 1VF3A 2HZFA 4PX1A 3GKXA 5IMDA 2V6OA 4IQAA 5J5NA 1YZXA 1SKRB 2C3TA 2KOKA 2YPMA 1Q98A 2LNTA 3F6DA 1XVWA 4F2IA 4CDOA 2E7PA 3FR6A 1AXDA 4KNDA 3KIJA 2K9FA 1TTZA 1XFLA 1ZMAA 2H6XA 3GKMA 4V2NA 2HT9A 5HR0A 1F3AA 4OCFA 2HZEB 3APSA 1TDIA 3DVXA 5KEJA 2GQMA 4MF6A 3QD9A 3LXTA 5C00A 2CV4A 3HHVA 1X5DA 5CRHA 4KDXA 2VO4A 1GP1A 5IPGA 3IXRA 5CRWA 3L78A 2HXKA 2XPEA 1EP7A 1OE8A 3LGCA 2H74A 4QL7A 3CSIA 2GQKA 3ZREA 3FZ5A 4NXIA 5AN1A 2CQ9A 3JCML 5INYA 1K0AA 1XVQA 2KHPA 3NOFA 3TJFA 4HDEA 2AJQB 5G5EA 4TXVA 3MAKA 5COHA 1SL2B 1GTIA 5CRDA 4PURA 1MDIA 3F4RA 3TRQA 2I4AA 2XBIA 3O3TA 4GSTA 3HDCA 1IYIA 2B3SA 1GSQA 3ED3A 4WF5A 1E6BA 4OFNA 1JZRA 4MZWA 2IJYA 2JL4A 3VI7A 4WF4A 3QPMA 3CSJA 4ECJA 2F8AA 4HOJA 1BJXA 3J7Yb 1JLWA 2VUPA 2GTUA 3BCIA 4BWQA 2JSYA 3EU3A 4AJ8A 1FB6A 3C7MA 1UN2A 4XIHA 4Q5NA 1QUWA 5CRGA 4G10A 1V98A 3RHBA 4HI7A 5CREA 4ISDA 5D9WA 3UAPA 4E8HA 5H5QA 3ZFLA 3FW2A 3TJGA 4JE1A 1GSYA 4GQFA 2H71A 1OC9A 1TXXA 2YZHA 4NHZA 2TRXA 3WD6A 3WGXA 3RDWA 4MZBA 1ZYQB 4D73B 1SL1B 2H0IA 4MABA 4TRXA 3O76A 2TRCP 1T8EB 3U6VA 3LYKA 1URMA 3MDKA 2LEGA 4MJCA 2L6CA 1N8JA 4E8EA 1KNGA 1USBA 4MMMA 1YQ1A 3QR6A 3LWAA 2D2ZA 3A2XA 4IBPA 2H0HA 2FCHA 4HZ2A 4ML6A 1O8XA 4K8MA 1GSUA 4CHSA 1TU7A 5B7CA 1XWCA 4DSRA 2RUFA 3RBTA 4JR4A 4GCIA 4MCUA 3RAZA 2OA7A 5AIVA 3D21A 2XBQA 2C0DA 4XRAA 4FYUA 1NSWA 1AIUA 1UC7A 1G0TA 2WGRA 3ERGA 1J9BA 2V32A 2QGVA 3TJBA 1JZWA 4ZILA 3LG6A 1JLVA 2DJ2A 3UEMA 11GSA 10GSA 2C0EA 1EGOA 1PMTA 1DE2A 1K3OA 2O8VB 1GL8A 5DJLA 3Q19A 4WKWA 1WP0A 2E2GA 2X8GA 1X5EA 4KB3A 1ZCPA 2VCVA 5ECNB 5KN2A 5IIZA 3GTUA 3ZMLA 3SBCA 4DSQA 2H6YA 4L0UA 4V2LA 1A0RP 1K0CA 3VWXA 3A5WA 3F9UA 1AQWA 6GSUA 3A3TA 2B7KA 1M0UA 2B1LA 5EL8A 3KH9A 4MPFA 4NMUA 3SWLA 1AUCA 1X5CA 2K6VA 2FHEA 1N2AA 1O7UA 1WE0A 5FHIA 4YQUA 1IYHA 3C1SA 2H1DA 1ABAA 1NHYA 4PQHA 5F0GA 1O6JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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