4F82A

X-ray crystal structure of a putative thioredoxin reductase from burkholderia cenocepacia
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
171
structure length
171
Chain Sequence
HHHMIQVGDALPDAQLFEFIDDAREGCTLGPNACSVRDQVAGKRVVIFGLPGAFTPTCSAQHVPGYVEHAEQLRAAGIDEIWCVSVNDAFVMGAWGRDLHTAGKVRMMADGSAAFTHALGLTQDLSARGMGIRSLRYAMVIDGGVVKTLAVEAPGKFEVSDAASVLATLTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia cenocepacia
publication title X-ray crystal structure of a putative thioredoxin reductase from Burkholderia cenocepacia
rcsb
molecule keywords Thioredoxin Reductase
total genus 46
structure length 171
sequence length 171
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4f82A00
2HT9A 3BOAA 5F05A 3NOFA 3CMIA 1K3OA 2X99A 3EU3A 3GN3A 3A2WA 2FGXA 3RHCA 1XIYA 3GTUB 2DSAA 1JLVA 2GTUA 3HZ8A 4MDCA 2JZRA 3GA4A 5CREA 2VUPA 4O5RA 4LL1B 1V40A 3FYGA 2AB6A 5ECQB 4JU5A 4K1FA 2C1YA 2IJYA 2PVOC 1EP7A 5AGYA 2VL2C 2WULA 5ECOB 2GLRA 4HS1A 4K7OA 2RUFA 3APQA 1GUKA 3LGCA 3NIVA 5CO3A 1B9YC 1HNBA 3LWAA 1R4WA 3QOUA 3HYPA 1T3BA 4KAEA 4XIHA 3TKSE 5ECHB 4F82A 1Z6NA 2O87A 4OMVA 3ZVJD 5AISA 4ZXGA 3U5RE 2KP1A 4OFTA 3CRTA 5ELAA 1DUGA 1K3LA 3A2VA 3TJFA 2CVBA 1ZZYA 1OE7A 1OC9B 12GSA 1PX7A 4K0NA 1A0FA 5CAXA 4WKWA 4K0GA 4YAPA 1VF1A 4JBBA 4EDYA 2X8GA 2WCIA 1JLWA 2N5FA 4XS6A 2H01A 5ECKB 5HFGA 3JCML 4HQSA 1V98A 3EURA 5D9WA 3I6AA 1CQGA 2YWMA 3K8NA 1YF1A 4WETA 3UMAA 1SJZA 1N8JA 5IIZA 1KEBA 4WBRD 5KEJA 3GNJA 1K0AA 3ZRDA 2HSHA 3ZFBA 2QGVA 1CQHA 1K0CA 4GSNA 2ZNMA 4QL7A 2O89A 5EVOA 4EE0A 4WF4A 1AQWA 5AN1A 1FW1A 4FYBA 4FIWA 1LU4A 3KD0A 4PUFC 1HD2A 3HHVA 2PMTA 2N5AA 1XFLA 5GZZB 3CSIA 1SKWB 2R6KA 1B48A 2KHPA 3IV4A 2HFDA 4V1Ag 3G7YA 2IMDA 2OE3A 3QDNA 1T1VA 4J56E 4PURA 4DSSA 2L5OA 3EMPA 4J2FA 2F51A 1BEDA 3F9UA 2NDOA 5JCGA 4ULXA 2V6OA 3HA9A 3FEUA 1MDKA 3GMFA 3E0UA 5GAND 1AW9A 2OE0A 4HEA2 2CZ3A 1PMTA 1A24A 4TR3A 5ECMB 2VD1A 3CTFA 1NM3A 2OA7A 1TJDA 2HZEA 3P90A 1QFNA 2OADA 1TI3A 3RPPA 2IMKA 3L9SA 2L5LA 2R5GA 3A5WA 1M2AA 4KDXA 2YWOA 4MP4A 4HZ2A 5CYYA 3DYRA 3C1SA 2HYXA 4OD7A 3IAM2 1SYRA 2AHEA 2LUSA 6GSWA 1OAZA 1ZMAA 2GSTA 4GWRA 2MBTA 9GSSA 2CX4A 2OE1A 3FZ4A 2IWTA 4ZBAA 4MA9A 1TTZA 3LQ7A 1ABAA 3HZ4A 5G2ZA 2H1BA 2VIMA 5HR0A 1XVWA 1X5EA 4OFNA 3LYKA 1QMVA 2PN8A 5D8IA 1TDIA 4F03A 4ECBA 4L5OA 2HI7A 1JFUA 2V6KA 3WGDA 2FY6A 3LYPA 4JZQA 3GSSA 4MH2A 1XZOA 1HNAA 2PBJA 4Q5RA 1S3CA 2GQKA 2I9HA 2JZTA 4G9HA 3IRAA 4IP1A 1WE0A 3D22A 1H75A 4GCIA 1TP9A 2B7JA 1VF3A 1ZYQB 1XWCA 5HR2A 3EWLA 1G0TA 3GV1A 4MJEA 4MF7A 5DDLA 1GUMA 5GAPD 2A2SA 2X8CA 3GKXA 2FA8A 1A8LA 2PU9C 1PKWA 5CP1A 1SL2B 2DIZA 4JR4A 3LG6A 1Z9HA 1K0OA 5HFIA 2CZ2A 4TVEA 5F07A 2IFQA 2KP2A 2H0GA 1M9AA 3CYNA 1EGOA 1ZL9A 1EOGA 1GP1A 1YKCA 4HU9A 3GH9A 2BJXA 3UJ1A 3DKSA 2FLSA 1HNCA 1UVZA 5KN1A 2AUVA 2L4CA 4AJ7A 1KBNA 3P7XA 2HSYA 2H0IA 3GKMA 2H1GA 4L0WA 8GSSA 2H74A 2V2GA 3ZMKA 3EU4A 2YJHA 5DQYA 3M9KA 2GZYA 4RI7A 2E2GA 4BPYA 3KTLA 4K8MA 5IMCA 3PGTA 3LFLA 4MK3A 2PVQA 3Q6OA 1JZWA 2CT6A 4POMA 3DWVA 3TRPA 5G31A 3DXBA 4OCEA 1KNGA 3QFAC 1TRVA 6GSVA 2DJKA 4GXZA 4O32A 3HD5A 4LA1A 3L0HA 3GKNA 1EWXA 1GLPA 4LMVA 1TW9A 1SD8A 3A2XA 3RAZA 4ZILA 5INYA 2YNXA 1OKTA 1XWAA 4QL9A 4AJ6A 1PQNA 3P2AA 2TIRA 2C0DA 1DSBA 1ON4A 3F6FA 3DMLA 2JACA 1GSEA 2YV7A 4CDOA 5COHA 2EIOA 4G10A 5G5EA 5DAKB 11GSA 3IK7A 2XBQA 2H1AA 2KUCA 3HKRA 2BTOT 1VF4A 1AAZA 2WZ9A 2A4VA 2PUKC 3P8WA 1A2LA 3QMXA 1XOBA 22GSA 1OE8A 1B9XC 4DSQA 5IOWA 1QUWA 3WT1A 3KIJA 4KDYA 4MF6A 2OBIA 3GSTA 1B4PA 3G7JA 4IS0A 4EL1A 2P31A 1A8YA 3C8EA 1TU8A 2ZCTA 2H6ZA 2OKAA 2RM5A 1Z3EA 4NV2A 3HXSA 2YZHA 4OO4A 4HJ2A 1I5GA 4O92A 3QD9A 1O8WA 2NBSA 3KEBA 3MAKA 1G6WA 5IQYA 2H76A 4G19A 4MH3A 3KM6A 2H0HA 3GIXA 2IIYA 1NW2A 4N0VA 2GT6A 1XCCA 2O85A 3LSZA 2IL3A 3TUEA 2C3NA 3VWWA 2FA4A 3F3RA 3WGEA 2LQOA 3MNGA 1I9DA 2GZPA 2VLUA 1W4VA 3RBTA 1IYIA 1WRYA 1F6MC 18GSA 3G9BA 4GLTA 19GSA 1SU9A 2WFCA 3TJGA 3KZQA 5LNKe 4KNDA 3FY7A 4TN8A 5IMFA 1Y6EA 3TJBA 2K8VA 4V1Ap 1T4ZA 2JZSA 1SK2A 3GKKA 2R37A 5ECSA 16GSA 5G1KA 2JADA 1GLQA 4GQCA 4MPFA 2N5BA 6GSSA 1WJKA 5KN3A 2YN1A 1U3AA 3F3QA 1X9SB 2GSQA 1T00A 4ID0A 2NPBA 3BCKA 5ID2A 1PSQA 2J23A 1PA3A 5EL8A 1S3DA 1XOAA 2FWEA 1USBA 4XCSA 4G2EA 4RQRA 3UBKA 3KP8A 4TR4A 5D96A 4KSOA 4EUYA 2EIRA 2JSZA 3LXTA 4KH7A 2NTOA 2XHFA 4IKHA 4E8EA 3KJYA 2AYTA 3F8UA 1EP8A 3ZIVA 1TK8B 2LSTA 4NWYA 5ECIB 3QR6A 4YAVA 4Z7XA 1GRXA 1XWGA 5H5SA 4HU7A 2YCDA 2FWHA 1EZKA 4MF5A 3O6TA 2VO4A 5J4UA 4MLYA 3VLNA 2PERA 1MDJA 2XPDA 4V2NA 3D5JA 2F3MA 3H93A 3UIWA 1QQ2A 4KA0A 4MMMA 3TKSA 4RQXA 3HVSA 5DCGA 1VRSD 3ZREA 4XS1A 2DBCA 2RM6A 3GHAA 3UL3A 1M2BA 2KOKA 2QC7A 1BAYA 3DVWA 5ECPB 4YQUA 2VLVA 4TXVA 1F3AA 3L4NA 2E0QA 3O76A 2C8UA 2DJ1A 4K7IA 4DSSB 3VI7A 4PX1A 2I4AA 5IM9A 4MZWA 4MZCA 2L59A 1TRWA 5F8BA 4N30A 3C71A 4KSMA 1OC3A 3TKRA 2V41A 3ZFLA 2R2JA 3UARA 2CV4A 5J3RA 3FW2A 2HZEB 3M1GA 4JEDA 1UC7A 2WB9A 5CNWA 4I2TA 4FH8A 1YEXA 2YZUA 4MCUA 4ML1A 2OACA 4BA7A 3ERGA 3ZIJA 3VK9A 3NZNA 2CQ9A 4K6XA 3ZITA 4ML6A 1WWJA 2MZCA 4I6XA 4X43A 1Y25A 1K0MA 1E6BA 4ECCA 1YKAA 2X64A 3WGXA 2OJLA 4WXTA 5IMVA 1GSFA 4OO5A 3HY2A 3F4RA 2X8HA 5B6NA 3GX8A 1XW9A 4ECJA 2B1LA 1FB6A 4F2IA 3UBLA 4WEYA 3IAS2 1TK5B 3TOUA 4K2DA 2NVLA 1WOUA 2VL3A 1WIKA 1R26A 2A2RA 1F37A 4IQ1A 3US3A 4CHSA 4RUVA 2VOCA 3UVTA 2YOIA 3TRXA 1FVJA 4OWYA 5A4VA 1FB0A 1TK0B 1YDKA 2F9SA 4DVCA 1X5DA 2MMZA 3PR8A 1G7EA 3IBHA 1RW1A 1BX9A 3VPQA 4PQHA 2AJQB 2C3QA 5J41A 1IYHA 2LJKA 1AIUA 2DMLA 4ZBDA 4XS4B 4XRAA 1RK4A 2DJ3A 4OCFA 4PQ1A 1K0DA 2FWFA 3WYWA 3EVIA 5H5QA 5HFKA 3RHBA 1U88A 4PXOA 2Z9SA 1PD21 4WR4A 2VD0A 4BWQA 1VF2A 5JWQB 7GSSA 2IMEA 3ZZXA 1JZOA 1K3YA 4HUAA 1ZOFA 3KCMA 3KMOA 1SJIA 3FRCA 3HDCA 3MWHA 1A0RP 2IFQB 5F06A 2CAIA 4MZBA 4EO3A 3M3MA 2P5RA 2GDRA 4IGJA 1QGVA 1LJRA 3IC4A 3OR5A 1F3BA 1BQ7A 3IPZA 2L57A 5AIXA 4YQMA 3TKSC 2VCWA 2YANA 2YJ7A 1WP0A 2LJAA 3F6DA 2R4VA 3H79A 1B8XA 4Q5NA 1OC8A 2FD3A 5DQSA 1AXDA 2VCVA 2FWGA 3Q19A 2DLXA 3TKQA 4BL7A 1SK0A 1YEPA 5JWRB 4HDEA 4HZ4A 4HI7A 2KLXA 4PNFA 1GULA 5DALA 1FAAA 5EPFA 1URMA 2H73A 1Z6MA 5D9VA 3W8JA 3W8SA 1V57A 3S9FA 5HR3A 2B5YA 3HJPA 2REMA 4IBPA 1EGRA 2C0FA 3PINA 3QAGA 1T8EB 1AQVA 4AJ8A 1M7TA 1V2AA 1PKZA 3Q18A 4X1UA 3H8QA 1SKRB 1H4OA 4KX4A 2P0GA 2YV9A 5D9TA 3UVHA 4PUAA 4NXIA 3QFBC 5IO0A 4KE3A 4POBA 1XW5A 1A2MA 2GGTA 5J9BA 1GTAA 4ZB9A 5E59A 1R5AA 4IHUA 1OKDA 2WJUA 5CRHA 3R2QA 1ZGNA 3GURA 1X9WB 1JZDA 3H1NA 3UOMA 3D0ZA 3IE3A 2K9FA 4NAXA 1FOVA 3UAPA 2H6YA 3L78A 1E2YA 4ZIJA 1T4YA 3LJRA 1YJ6A 1V9WA 4FYCA 5B7CA 5JCUA 1TOFA 2V1MA 5G1LA 3KTBA 4E8HA 5J9CA 5KN0A 3PH9A 4ZL7A 3L9UA 4D73A 4GRFA 2XBIA 3GUSA 5FHIA 1GL8A 3TJKA 2IPAA 2RUEA 4KGIA 2K18A 2DMMA 1W89A 3VWXA 1F9MA 3DVXA 5JWOB 4TW5A 4IJ3A 3CBUA 2YWIA 2LTKA 2ON5A 1NHYA 1HYUA 1FVKA 2ALBA 4ZL9A 3RPNA 5G5FA 2VCQA 3C7MA 3IR4A 6GSTA 3FR3A 3FKFA 2GSSA 2TRCP 1PN9A 2VM2A 4I2UA 1GSUA 2VL9A 3APSA 2M80A 4LLRA 4EXJA 2FCHA 2DIYA 3N5OA 1S3AA 3ZVJA 3ZYWA 5G30A 1A2JA 2VM1A 2JL4A 5DAKA 4KDUA 5ELGA 3W6GA 1G7OA 1SYXA 1UN2A 4I97A 3J7Yk 1YY7A 1EEMA 2LQQA 4QQ7A 1Z7PA 1X5CA 2K6VA 2O7KA 3IDVA 3HJMA 1PX6A 4POKA 5A5KA 4IELA 5ID2B 1YF0A 4WBJA 2CVDA 5B8AA 5ABRA 10GSA 2C0GA 3APOA 4DEJA 1V58A 1AUCA 5H5RA 2E7PA 5A4WA 5IMDA 3IK9A 4F0BA 2HNLA 3GFKA 2HRNA 1TXXA 3LORA 4TR1A 5E4WA 1SJ6A 2DJ2A 5D9XA 2VCZA 2E2MA 6GSYA 1YZXA 1GNWA 3TJJA 3CRUA 3EINA 3TCOA 3VPTA 4POLA 5D93A 4F9ZA 3ISOA 3TDGA 2HRFA 5C00A 2CAQA 1TI1A 1X9MB 3D21A 1SD9A 2H19A 4NHWA 5JCWA 2K8SA 2O8VB 3KH9A 4TKYA 5ENUA 2GS3A 20GSA 5FWGA 1Q98A 4WR5A 2L6DA 3F4SA 4TXOA 1BYEA 2H70A 2CVKA 1J9BA 4FYUA 4N0ZA 17GSA 2H75A 4HQZA 4IP6A 2I3YA 2H1DA 1O81A 3G7IA 1WMJA 2GT5A 2XC2A 1SENA 5IPHA 1G6YA 5KN2A 1MEKA 3BJ5A 3N9JA 2GQMA 2DJ0A 3GRXA 1EOHA 4ECIA 4OFMA 1SK1A 3GYKA 3DRNA 3D4TA 3MDKA 1DE2A 1DE1A 4YH2A 2IN3A 2C3TA 3GTUA 4KB3A 3UEMA 3I43A 1MTCA 4NV5A 1XXUA 3KMNA 2VLTA 2LNSA 3TGZA 2R3XA 3BBYA 1ACVA 5HQPA 1WPIA 2QSIA 3DIEA 2LS5A 2L4QA 1THXA 4GF0A 3DGQA 1T7PB 1GSDA 1NSWA 4F0CA 1GTBA 3SWLA 1ERVA 5ECNB 1OVNA 3ME8A 2BMXA 1EV9A 3KP9A 2LNTA 2I81A 2WDUA 4L0UA 1GSSA 2HLSA 4XRDA 2LJRA 3J7Yb 2GZZA 4V2MA 5IMZA 1LBKA 1BJXA 1F2EA 3QPMA 5CRGA 5CRDA 4ILFA 4HOJA 4BVYA 5F0GA 5CRWA 2WRTA 2YWNA 1OC9A 3VWVA 3RDWA 1K0BA 3HJOA 3TOTA 1K0NA 2B5XA 2B3SA 2AAWA 2PWJA 1SL0B 3VWUA 5C04A 3QCPA 2YP6A 2G2QA 1XBSA 4MPGA 3WD6A 4N10A 3CTGA 1MDIA 4K7NA 6GSUA 3KGKA 3FZ5A 2MBSA 3ZTLA 2B1KA 3KH7A 1XVQA 1O6JA 4JRRA 2DJJA 1ERWA 1M99A 3IA1A 5L71A 1MD4A 1GNEA 3M0FA 3LXZA 3DD3A 3HVXA 3E9JB 1TRSA 2FHEA 2LRNA 2MMAA 3V1WA 2CA8A 1J08A 2V32A 4MJAA 3EMXA 1B4QA 4KCAA 1SKSB 3C73A 2EIQA 3L9VA 2VAFA 3VFIA 2FUG2 2LRTA 3F0IA 3TRQA 4LL4B 1GTUA 5AIVA 13GSA 5IMAA 2H6XA 4NPBA 1PL1A 2ZUPA 1O73A 5LD0A 2I1UA 3F4TA 1GSQA 3ED3A 2MMNA 2F8AA 2GSRA 5EY6A 3HCZA 3ME7A 4EF0A 2LEGA 3CXGA 2PPTA 4YQVA 1VGLA 2H72A 2ON7A 2IMIA 1ERTA 3IOSA 1TKDB 5DJLA 1SL1B 2G0FA 2HE3A 4IN0A 2XPEA 4TRXA 3ZLPA 3CSJA 5GSSA 3GX0A 1M2DA 4ZL8A 1THOA 4TR0A 1QK8A 1AQXA 5DALB 5GSTA 2HZFA 3M8NA 1GTIA 1GSYA 1A23A 1GWCA 2B5EA 1JZRA 3IXRA 3D6IA 2D2ZA 1TU7A 4AGSA 4IW9A 2J9HA 3U6VA 3O3TA 4EKZA 4JR6A 3ERFA 1U6TA 5A4UA 4H86A 4PQIA 3FZAA 4RI6A 5DJMA 4XS4A 2TRXA 5IPGA 3EE2A 3TKPA 2OBKA 4IQAA 2MYGA 4I8BA 1UA5A 5LCZA 5J5NA 2ES7A 2IMFA 2JU5A 1ZCPA 1XW6A 4ZBBA 4IJIA 3GL5A 4GSTA 4ZB6A 3D4MA 3Q74A 3C1RA 4I5QA 1ILOA 3FHKA 4EVMA 2C80A 1NHOA 5ECLB 5IO2A 1Z5YE 1O85A 4P3YB 5IOXA 1XWBA 5B8BA 2B7KA 3TB2A 2LKUA 4MJCA 3QAWA 4NHZA 1U3IA 3VI5A 5B6MA 1ST9A 3ZMLA 1HQOA 2HXKA 1YQ1A 2PGTA 5DCHA 3F63A 1FO5A 3ZL5A 4CW9A 3HVVA 4D73B 3IHQA 3I9V2 3AY8A 1EEJA 3EC3A 1Z7RA 2VCXA 2L6CA 4GTUA 1M9BA 2B6MA 4WF5A 5D73A 4EC0A 4N11A 4Q5QA 2WS2A 1QXHA 4AF2A 2LRCA 2RIIA 4O7HA 4KCEA 5DVBA 1Q4JA 2VL2A 1ERUA 2GVPA 4V2LA 1PGTA 5ECRB 2MMOA 1XPVA 14GSA 3FZ9A 1XWKA 2JSYA 2H71A 2RLIA 1R5PA 1O8XA 3BD2A 2VCTA 3QAVA 5FT3A 2EC4A 4XTSA 4DSRA 2M72A 2WGRA 1MD3A 3EYTA 2DC5A 1JHBA 1R7HA 2CX3A 4ISDA 4L8EA 5HR1A 3GH6A 4GSSA 1ML6A 2AV4A 2C0EA 4MJBA 3WT2A 6GSXA 3CSHA 3E3EA 2H66A 4EDZA 1GUHA 2GQLA 3BCIA 4IVFA 3SBCA 1PL2A 2LV3A 1AC1A 2C4JA 3A3TA 1FG4A 3VURA 4FO5A 4XHMA 3DEXA 3FR9A 1RQMA 4JE1A 1TRUA 3KXOA 1GH2A 1PRXA 4TR1B 4Q5FA 3MSZA 4PNGA 4ZB8A 1U87A 2H8LA 4J57E 2YPMA 4ACSA 2H30A 4HJMA 4KUNA 1FHEA 4K9ZA 4LMWA 4MABA 4TOPA 4NMUA 3LEFA 1M0UA 1J0FA 4X0XA 3FR6A 2F8FA 3I69A 2P5QA 1ZYEA 2QKEA 1X0RA 4GQFA 1O7UA 5DBQA 1N2AA 4L5LA 2FNOA 3H4KA 3FK8A 4BWSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite