1X5DA

The solution structure of the second thioredoxin-like domain of human protein disulfide-isomerase a6
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
133
structure length
133
Chain Sequence
GSSGSSGDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
publication title The solution structure of the second thioredoxin-like domain of human Protein disulfide-isomerase A6
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A6
total genus 26
structure length 133
sequence length 133
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2005-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1x5dA01
5EL8A 4TR1A 4MPFA 3DVXA 3TJFA 1SL1B 3HD5A 3VWWA 2H8LA 3C1RA 2O7KA 4IP6A 2CT6A 2FWHA 2IMEA 3LGCA 4TR4A 2FWFA 5DAKA 1XW9A 4F2IA 1SKRB 2VCXA 1Q4JA 5HFGA 3VURA 2GSSA 2LJAA 1TK8B 2LRTA 2OACA 5B6NA 2HFDA 1O8XA 1M99A 5D93A 1TU7A 2A2RA 3VLNA 4AJ8A 3FW2A 4OCEA 3TOUA 3GSSA 2IWTA 4IP1A 5IMAA 1R5PA 5ECIB 4GRFA 3LXTA 2TIRA 4J2FA 4Q5QA 2DJJA 3VI7A 1N2AA 1YY7A 1GTIA 3G7YA 4TN8A 3IE3A 3M0FA 3N9JA 4EUYA 1WPIA 5ELAA 3BD2A 1MDKA 1S3DA 2IL3A 2R37A 2GSQA 2K6VA 2CVDA 1A24A 2PVQA 2C8UA 3FZ9A 6GSSA 4ZBDA 2O8VB 5EY6A 1Z6NA 2VL2A 4K0GA 4K9ZA 2OKAA 5J4UA 3ZMLA 1IYIA 1FB6A 4EDYA 3F6DA 3DGQA 10GSA 3GKNA 2YNXA 1K3YA 1XXUA 2O89A 2H73A 4F0BA 5HQPA 2N5AA 3QAVA 2MBSA 2YANA 2G2QA 5HR3A 2WRTA 3GIXA 3KH7A 4OMVA 1M2BA 3TKPA 4BVXA 5DALB 3EU3A 1ZL9A 1HNBA 4PUFC 4L5LA 2KUCA 2AHEA 2KHPA 1PSQA 2C3TA 2KLXA 1T7PB 6GSUA 1B4PA 2GQMA 2YP6A 4HQSA 1TK0B 5H5QA 2LRCA 1XWCA 3EURA 4AGSA 1MD3A 4TVEA 1HQOA 2L59A 5F07A 2LKUA 1SJZA 2H1AA 3HKRA 4GTUA 1OKDA 3BCKA 3P8WA 2VCQA 1FB0A 3IXRA 3CTGA 3KJYA 2B3SA 2B7KA 3W6GA 3RPPA 2PVOC 3WGXA 2VL2C 1YF1A 2E7PA 3BJ5A 2VCVA 4KDYA 3P2AA 4MPGA 1F9MA 2H66A 1WWJA 2H0IA 4GSTA 1K0DA 5HFKA 4HJ2A 5LNKe 1SYXA 2L4CA 1M9BA 2J23A 4ZBBA 4ML1A 1N8JA 2VD0A 3GX0A 4IELA 2R6KA 3ZMKA 5DQYA 1QK8A 1PKZA 3HJMA 3F4SA 4NV5A 4NMUA 3C73A 3C1SA 5IOWA 3KEBA 4F82A 1HYUA 2FY6A 5IQYA 3GFKA 3ISOA 2H19A 3F3QA 4HJMA 2AV4A 3EINA 1ZMAA 1HD2A 3KIJA 5J41A 2GZPA 1FOVA 3QCPA 1WE0A 2I4AA 2LJRA 4FO5A 3Q74A 3HY2A 1K0AA 4G10A 4EVMA 4ZB8A 1QFNA 5COHA 3KXOA 2IMDA 3HXSA 4ULXA 4YQUA 3P7XA 5IOXA 4P3YB 4KSMA 2GQLA 2A2SA 3IK7A 2CV4A 1GH2A 1EP7A 1V58A 5DVBA 2HZEA 1FAAA 1PD21 1PX6A 2F51A 20GSA 5KEJA 2XPEA 1S3AA 4NWYA 1EV9A 1JZWA 1VF1A 2P0GA 4OFNA 2RM5A 1G6WA 4TXOB 3LJRA 1EGOA 2X64A 1PRXA 4MZWA 4Q5FA 4N30A 1SJ6A 2YN1A 1GLQA 2GQKA 3UEMA 1M2AA 1THXA 3IOSA 5LD0A 1B48A 2LNTA 3J7Yb 2FCHA 1BAYA 1F37A 1FVJA 5ECQB 3J7Yk 1SKWB 4KA0A 4MP4A 4WKWA 2VL9A 1O73A 1XVQA 4MMMA 1AUCA 5E59A 2KOKA 1TRUA 2GVPA 2VCTA 1X5CA 2VO4A 5GAPD 1W89A 2VOCA 3C7MA 4V2LA 3GNJA 1OC8A 1S3CA 1CQGA 1AIUA 1VF2A 2O85A 4V2MA 2AJQB 2MMAA 3GSTA 2RLIA 1RW1A 2RUFA 1URMA 5L71A 4K7IA 2ZNMA 4CDOA 3C71A 4NXIA 3UBLA 3TKSA 5JCGA 4BPYA 5HR0A 4DSSA 2FHEA 4N10A 1QUWA 2HNLA 4N0ZA 4ISDA 5CYYA 2HLSA 5B7CA 1M9AA 3G7JA 2H0GA 5KN2A 3O3TA 2B5XA 1GSUA 4J56E 1YJ6A 1OE7A 3ME7A 1PX7A 5CRDA 3S9FA 2EIOA 1WJKA 2LQQA 5HR2A 9GSSA 1U88A 3HVVA 3GH6A 3HDCA 3L0HA 2V6KA 3DMLA 1USBA 1LBKA 2PMTA 3IRAA 4IN0A 3IDVA 1U3IA 2L4QA 4ECCA 4POMA 1Z5YE 2JSYA 1TK5B 4PQHA 1Y25A 4ECIA 5D8IA 5JWQB 2TRCP 4BA7A 5IPGA 1H75A 5CRWA 2HSYA 4I97A 1W4VA 2IMFA 5G31A 1GTUA 4N11A 4Q5NA 1IYHA 4HOJA 4GLTA 3PH9A 4LL1B 2JADA 1GSYA 2GT5A 2V32A 3GMFA 5GSTA 4KE3A 4LMVA 4AJ7A 3TRPA 1DE1A 4ZB6A 1SD9A 5DDLA 1TXXA 2L5LA 1SYRA 1EOHA 3D0ZA 2H01A 1GTBA 1FG4A 13GSA 5G2ZA 4MDCA 2YZHA 3UOMA 3EYTA 2L6DA 2M46A 3M1GA 1Z7PA 2PUKC 3U6VA 2AYTA 3WYWA 5DQSA 4YAVA 7GSSA 1YDKA 1JFUA 1NHOA 2XC2A 3DD3A 1K3LA 4PGTA 3GX8A 4HZ2A 4JR6A 1XOBA 1TP9A 1EV4A 3D21A 1B4QA 2LTKA 2LSTA 4ZL9A 1HNCA 3M9JA 8GSSA 1DSBA 1UC7A 3KTBA 5ENUA 2JSZA 2GT6A 2HRFA 1B8XA 4GQFA 4I2TA 2FWGA 1ZYQB 3EE2A 1Z9HA 2IN3A 1M7TA 1A2MA 2ON5A 1G0TA 4G9HA 3W8SA 2MYGA 3QOUA 1JLVA 1GULA 1JZDA 5G5FA 4IGJA 3MAKA 3I43A 3D5JA 5ECKB 3APSA 1XW6A 3EVIA 4MZBA 1O7UA 3FR3A 2H1BA 1T3BA 1AAZA 1JZRA 3TRXA 1TI3A 2H6YA 1C72A 2CQ9A 1I9DA 1ZYEA 3HCZA 2M80A 4KGIA 4WF4A 3US3A 3LYKA 2HT9A 2RM6A 3E9JB 1GUHA 1A2JA 1J9BA 1K0CA 5ECNB 1OAZA 1R4WA 1ON4A 3CYNA 3KMNA 2TRXA 3VWUA 5AISA 3D22A 2R4VA 5ECSA 2NTOA 5J9CA 1FO5A 3TJBA 4QL7A 4RUVA 3UBKA 3A2XA 3DVWA 3E3EA 4IQ1A 3FZ5A 1XOAA 2DIYA 3GUSA 4ILFA 2YJ7A 5HR1A 5JWOB 2PN8A 2DJKA 3NOFA 1MDIA 2H72A 2V1MA 2MBTA 3VWVA 1GSSA 3I6AA 3D6IA 3EWLA 4L0UA 3R2QA 4LLRA 1J0FA 3WD6A 1JHBA 1A0FA 2QGVA 3ERWA 2J9HA 1A2LA 5FWGA 4JU5A 3CSHA 4HZ4A 1V57A 2I3YA 3CBUA 2K18A 1KBNA 3KTLA 1PMTA 4GCIA 5ECOB 4OFTA 4I8BA 2H6XA 1F2EA 1THOA 1EOGA 1SENA 3ZTLA 4IQAA 1R7HA 2YOIA 3GTUB 2IIYA 1GTAA 4KSOA 1TI1A 2VAFA 1SJIA 1B9YC 4I2UA 2C80A 2WFCA 4ZIJA 1V40A 2MMOA 3GURA 1PN9A 4O5RA 4BWSA 2I81A 4X1UA 3ZL5A 2C0GA 2GDRA 4NV2A 4G19A 1AW9A 4TXOA 5F05A 2XHFA 1X9WB 2N5FA 5A4VA 1SU9A 2VLUA 1FVKA 2XBQA 1AQWA 1EEJA 1MTCA 1X5DA 2ALBA 4YH2A 3ME8A 4EDZA 4GQCA 3DEXA 4ECJA 3IK9A 3LSZA 5IIZA 5DAKB 2OE0A 3GA4A 1XW5A 5J9BA 2HRNA 4TXVA 1GNEA 2I9HA 2KP1A 5CRGA 5EPFA 2C0DA 4XRAA 4PURA 1EZKA 4OO4A 4PQIA 3UL3A 3O76A 3L9VA 2FWEA 2BJXA 1F3BA 1NM3A 2VCWA 3H4KA 3RBTA 3CMIA 4LMWA 1Y6EA 4MZCA 1U3AA 3PR8A 3FY7A 3IPZA 1GSDA 2H71A 4PXOA 4G2EA 2F8AA 4JEDA 1R26A 2B1KA 5A5KA 4OD7A 4EXJA 3RDWA 3HVXA 3AY8A 2FD3A 2X8HA 1B9XC 4YQVA 5H5SA 2WJUA 4L5OA 2N5BA 2YCDA 2DJ2A 2JZTA 3FYGA 3GKXA 2OE3A 4EKZA 5D73A 3UVHA 1YKAA 4GXZA 2VIMA 5ECPB 1VF4A 2CVKA 4MH3A 3KP8A 5H5RA 3PINA 3CSIA 3VPTA 1F3AA 14GSA 4K6XA 1T4YA 3FR9A 4HEA2 4X43A 4LL4B 2B7JA 2D2ZA 5G1LA 3EU4A 3QDNA 2JZSA 4IW9A 5ECHB 3DIEA 2YWIA 2LUSA 4JR4A 1X0RA 2GSTA 2H30A 3IBHA 2WULA 3HJPA 4WR5A 3TJKA 3IV4A 3G9BA 1A0RP 1ST9A 1LU4A 3WGEA 4WBRD 2VLVA 1YQ1A 4WXTA 4HQZA 3N5OA 2VLTA 4V2NA 5J5NA 4MCUA 3D4TA 3L78A 2IMIA 2O87A 2OBKA 4WF5A 4BVYA 4TKYA 1VF3A 1BX9A 3WT1A 2DBCA 1GL8A 3ZLPA 2EIQA 5IMCA 1FHEA 2B5EA 5ID2B 1M0UA 3DYRA 4EC0A 1PQNA 2M72A 2P5QA 4BL7A 2NDOA 2IMKA 1TJDA 5A4WA 1WP0A 2L5OA 5GZZB 2F3MA 1TDIA 4ECBA 2YV9A 4DVCA 2LS5A 3RHCA 2L57A 2GGTA 4K7NA 1FW1A 4OO5A 3TJGA 2JZRA 1K0OA 1PKWA 2GZYA 4EO3A 1TOFA 1QGVA 3FRCA 2WB9A 5B8BA 2E2GA 4WBJA 1K0NA 4MABA 1E2YA 2K8VA 1GUMA 3GV1A 3RPNA 2DLXA 5DJMA 3ZYWA 4MA9A 2DJ0A 1NSWA 1CQHA 2IFQB 3TCOA 3F6FA 1AQXA 2F8FA 2PU9C 1AC1A 1YEPA 3PGTA 1JLWA 1EP8A 2QKEA 2GS3A 3GHAA 2DJ1A 3ZRDA 1G7EA 3VK9A 4GF0A 3I69A 4QL9A 1F6MC 1BYEA 1V98A 2DC5A 3QAWA 4LA1A 3TRQA 3V1WA 3ZZXA 1SK1A 2GTUA 5E4WA 3FR6A 3LWAA 3MDKA 2FNOA 3GYKA 5IMFA 2YJHA 1T1VA 2CZ3A 1GP1A 5GAND 3KD0A 1BJXA 2ON7A 3ED3A 2C1YA 3L4NA 3EMPA 4RI7A 5AIXA 1ILOA 2AB6A 4XTSA 2Z9SA 2OJLA 1XWGA 4K8MA 1E6BA 1ERVA 4D73B 6GSYA 4K2DA 4RI6A 11GSA 3LG6A 4K1FA 4IHUA 4E8HA 5IMVA 4IJIA 5ABRA 2C0EA 1PA3A 1O8WA 4QQ7A 4GWRA 4KCAA 4OCFA 3QFBC 2MMZA 2ZUPA 3QPMA 2OADA 2V6OA 2CX4A 4HU9A 1MD4A 5FT3A 5DALA 3BOAA 2DMMA 3DXBA 3TJJA 3UJ1A 2REMA 3LYPA 4F0CA 3IAM2 2HI7A 1XZOA 1BEDA 3GTUA 5CO3A 1ZOFA 1O81A 4IVFA 4KDUA 5J3RA 3FHKA 1WOUA 4MJEA 4MK3A 5LCZA 3M9KA 2C3QA 4N0VA 2WZ9A 3EMXA 1Q98A 3GKKA 2NPBA 3WGDA 3LORA 1XPVA 4DSSB 2FUG2 2X8CA 2DSAA 3RHBA 1PL2A 5AGYA 5HFIA 16GSA 6GSVA 3Q19A 2B1LA 3LXZA 1I5GA 3F3RA 22GSA 1ERUA 2WDUA 4CW9A 2JU5A 1XVWA 4BWQA 2QC7A 1H4OA 3NIVA 5ELGA 1TTZA 1GWCA 3OR5A 3L9SA 2V41A 4Q5RA 1MEKA 1DBYA 3L9UA 3IC4A 3TGZA 3MNGA 2GSRA 2VM1A 1SK2A 1U6TA 2IPAA 2DJ3A 3F4TA 2CA8A 4KNDA 4JZQA 2IJYA 5DBQA 2K8SA 3KM6A 2YWMA 3H79A 2YWOA 5INYA 4MLYA 4XS4B 5A4UA 3TB2A 3QAGA 12GSA 1GNWA 4MF6A 1GSQA 1OC9B 3H1NA 2VD1A 4XRDA 4YQMA 4L0WA 5CAXA 2HXKA 3LFLA 5FHIA 3IA1A 2YPMA 1XWAA 2XPDA 3A2WA 3HYPA 3UMAA 4TR3A 1SK0A 4ZILA 1T8EB 2H6ZA 3ZVJA 5CP1A 4HDEA 2E2MA 3MWHA 1Z6MA 1HNAA 3FKFA 4IJ3A 5KN1A 1SL2B 5D9WA 4O92A 5G30A 3IAS2 5IM9A 4HU7A 4ID0A 1TKDB 3M8NA 5KN0A 2GZZA 4YAPA 1JZOA 3IHQA 4FH8A 5CNWA 2ZCTA 1TW9A 1OVNA 2DIZA 5CREA 1G6YA 1ABAA 4ZB9A 5B8AA 2FGXA 4TR1B 2F9SA 2NBSA 5AIVA 3UARA 1X5EA 4KW6A 2I1UA 3KCMA 5IMDA 2X99A 2A4VA 2H1GA 1M2DA 1YF0A 2P31A 2E0QA 5IO0A 2H76A 4I5QA 1K0BA 4NPBA 3E0UA 4WEYA 3JCML 2ES7A 2RUEA 4PNGA 3KP9A 3WT2A 3G7IA 3I9V2 4NAXA 4FYUA 5ID2A 1A8YA 3VFIA 3LQ7A 5D9TA 2HSHA 5F06A 2H74A 2VL3A 3IR4A 1PGTA 4E8EA 17GSA 3H8QA 2LNSA 1WRYA 4TW5A 2B5YA 2PERA 2CVBA 4XCSA 3Q18A 4I6XA 3ZFLA 1J08A 1TU8A 2LQOA 5JCWA 4MF5A 3H93A 4NHZA 4OFMA 1ZGNA 2G0FA 4MJAA 1V2AA 1RK4A 3GN3A 5DCHA 4POKA 1YZXA 1NHYA 4JRRA 1UN2A 1X9SB 4FYBA 1ML6A 5JCUA 2V2GA 1G7OA 4K7OA 3SWLA 2HYXA 4FYCA 3VPQA 3W8JA 3QFAC 3HVSA 4XHMA 2IFQA 2AUVA 2JL4A 2WGRA 3ZFBA 2GLRA 1ACVA 3CRUA 1BG5A 6GSTA 1K0MA 3QD9A 3HZ8A 3ZIJA 3ZREA 2OA7A 3O6TA 4RQRA 3ZITA 4NHWA 2VUPA 3C8EA 3CSJA 2YV7A 1T00A 1NW2A 3A3TA 2BTOT 2XBIA 3SBCA 1WIKA 2KP2A 2VM2A 5C00A 4AF2A 1YEXA 2X8GA 3CTFA 1ZZYA 5KN3A 2WCIA 1TRWA 1EEMA 3FK8A 4KH7A 1GUKA 2PBJA 1KTEA 4XS1A 3F8UA 3M3MA 1AQVA 4KX4A 4EF0A 1Z7RA 6GSXA 1YKCA 5F0GA 4PNFA 4EE0A 1QQ2A 5ECMB 1DUGA 1GLPA 1DE2A 3GKMA 1O6JA 4H86A 3ZIVA 5ECRB 1TRVA 4PQ1A 4X0XA 1SL0B 1ZCPA 3ERFA 1AXDA 3VI5A 3FZ4A 3U5RE 2QSIA 2CAQA 4EL1A 4O32A 4D73A 4IBPA 5DJLA 1A8LA 2HZFA 3FEUA 2FLSA 5D9XA 2PWJA 4JBBA 2H70A 3KGKA 4ACSA 4CHSA 3F63A 4AJ6A 2WS2A 4K0NA 2MMNA 1VRSD 1O85A 4MJBA 2CZ2A 2AAWA 5B6MA 3APOA 4ZBAA 2CX3A 1RQMA 4TRXA 2C4JA 1LJRA 3GH9A 3F9UA 4DEJA 3UVTA 4MJCA 2FA4A 3KZQA 1V9WA 3P90A 2P5RA 1GSFA 6GSWA 1GRXA 4PX1A 4XIHA 3A2VA 3UAPA 3KH9A 4KUNA 2VCZA 4MF7A 3CRTA 2R5GA 1BQ7A 3HA9A 3HJOA 3KMOA 2CAIA 5DCGA 5JWRB 4MH2A 1SKSB 1XWKA 1T4ZA 1U87A 2R2JA 3QR6A 5AN1A 1XFLA 4GSNA 1XCCA 1XIYA 1ERWA 2K9FA 1QMVA 4F03A 4WETA 2RIIA 4HUAA 2HE3A 3DWVA 3TDGA 3NZNA 5D96A 3CXGA 4FIWA 4KCEA 3HZ4A 3GL5A 2FA8A 4ML6A 4TOPA 3F0IA 2LEGA 3ZVJD 1K3OA 3Q6OA 2YWNA 2LV3A 5GSSA 2MZCA 2NVLA 3UIWA 2OBIA 3TUEA 5IPHA 4XS6A 1UVZA 2C0FA 3DKSA 1SD8A 2R3XA 4V1Ap 18GSA 3TKSE 3DRNA 3FZAA 4HI7A 4KDXA 2L6CA 2OE1A 3BCIA 1OE8A 1X9MB 3BBYA 2LJKA 1KEBA 5G5EA 3VWXA 4V1Ag 1EWXA 4ZL7A 1UA5A 5C04A 2HZEB 1EGRA 5D9VA 4O7HA 5IO2A 1R5AA 1QXHA 1WMJA 4Z7XA 3TKRA 1Z3EA 3GL3A 3D4MA 4XS4A 4ZXGA 4OWYA 4WR4A 2BMXA 2EC4A 3GRXA 3ERGA 4J57E 1OC9A 3LEFA 4TR0A 1VGLA 3RAZA 5IMZA 3EC3A 3MSZA 5G1KA 3HHVA 2C3NA 3APQA 5ECLB 4POBA 2H75A 2EIRA 4PUAA 2LRNA 1XWBA 2PPTA 1OKTA 4IKHA 4JE1A 4KB3A 5CRHA 3TKQA 2B6MA 4DSRA 3TKSC 2H1DA 1KNGA 3F4RA 4HS1A 1OYJA 4RQXA 3TOTA 2DMLA 4GSSA 19GSA 4DSQA 1GSEA 1PL1A 3K8NA 1OC3A 2JACA 2YZUA 3QMXA 2PGTA 1MDJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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