2IMDA

Structure of semet 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase (hcca isomerase)
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
MIVDFYFDFLSPFSYLANQRLSKLAQDYGLTIRYNAIDLARVKIAIGNVGPSNRDLKVKLDYLKVDLQRWAQLYGIPLVFPANYNSRRMNIGFYYSGAEAQAAAYVNVVFNAVWGEGIAPDLESLPALVSEKLGWDRSAFEHFLSSNAATERYDEQTHAAIERKVFGVPTMFLGDEMWWGNDRLFMLESAMGRLCRQNADLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase
publication title 2-Hydroxychromene-2-carboxylic Acid Isomerase: A Kappa Class Glutathione Transferase from Pseudomonas putida
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas putida
total genus 69
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 5.99.1.4: 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase.
pdb deposition date 2006-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2imdA00
2H66A 4O7HA 1Z7PA 3GN3A 4WKWA 5F05A 2B1LA 2E2MA 2H74A 2IMKA 2PU9C 1WOUA 3QOUA 4ML1A 3EC3A 4P3YB 1BX9A 1OE7A 3D6IA 2YV7A 4XIHA 1VF2A 1MDJA 2OE3A 3M3MA 1TP9A 4ZL9A 2K8VA 1WRYA 5ELGA 2FA4A 3APSA 2VOCA 3KMNA 2IPAA 1K0DA 3TOTA 1T7PB 1SD8A 6GSTA 5DQYA 4F03A 2BJXA 1DSBA 2LRNA 1IYHA 4EUYA 5G31A 1JZWA 2X64A 3UL3A 1UC7A 3HZ4A 5KEJA 2LNSA 4I5QA 3LJRA 3FEUA 2E7PA 5JWRB 4IBPA 4QQ7A 1DE2A 1JZOA 1NW2A 2PVQA 1THOA 1U87A 4GSTA 2YN1A 2PMTA 2DJ2A 2C0DA 4PX1A 4OFMA 3TB2A 1I9DA 3ISOA 4GCIA 4IHUA 5A4WA 3UVTA 1RQMA 2F8FA 4IKHA 4L0WA 4V1Ap 4NPBA 2LJRA 1GUMA 4ZIJA 1JLVA 1VGLA 3M0FA 5F0GA 2J23A 4ZBBA 2BMXA 4TR1A 4K7NA 1U6TA 4N11A 2HT9A 1UVZA 1FB0A 3EINA 4F0CA 4IJIA 2KUCA 1AC1A 4OMVA 2N5FA 5J4UA 2TIRA 2L5OA 3SBCA 1XFLA 2YANA 1TK0B 3L9VA 3D21A 4POBA 3LG6A 1TRWA 4JR6A 1CQGA 5ECMB 5HFIA 14GSA 3D5JA 3GSTA 2VLTA 2ON7A 3U6VA 4J2FA 4GQCA 4K2DA 4KDYA 1FHEA 3BBYA 3KEBA 4WBRD 5IMCA 3EWLA 5J41A 2LJAA 2O8VB 3VWXA 1JFUA 2L4CA 3J7Yb 2H1DA 2YJ7A 2C4JA 1XVQA 4DSSA 4H86A 2EC4A 3ZVJA 1ZOFA 2OBKA 2H75A 1QK8A 4MF7A 1EGOA 4PURA 4KX4A 1TI1A 2LQOA 2IIYA 5CREA 1FG4A 1TTZA 1WJKA 3F3RA 3UOMA 4LL4B 3APOA 3FZ4A 1XXUA 3GX8A 1LJRA 2OJLA 4TR0A 4YAPA 5IM9A 4ACSA 2VL9A 4PUAA 4J57E 2HLSA 4IELA 3O3TA 2IMDA 2K18A 4JR4A 3GKMA 1M9AA 3M9KA 1TKDB 3APQA 5DCGA 3HKRA 1SENA 4GWRA 1GSUA 1F3AA 3V1WA 3AY8A 5IMDA 1B9XC 1OYJA 1DE1A 4K9ZA 4HOJA 3NIVA 1SD9A 5HFKA 2EIOA 1ABAA 1ERTA 5COHA 1UN2A 3GTUA 4NHZA 1XWGA 5J9BA 2VL2C 2AAWA 1O73A 1GSYA 4MF6A 3I6AA 3KIJA 4RUVA 1Y6EA 2H1AA 3ZFLA 1YF1A 2GQLA 4PQIA 2E0QA 1GULA 3FKFA 2FUG2 4Q5FA 5GSTA 4JRRA 3EE2A 2DJJA 3LORA 3ZZXA 4O32A 3DVWA 4IN0A 4ID0A 4POKA 4V1Ag 5DALA 1R5AA 3KH9A 3QMXA 1KNGA 2KOKA 4EC0A 3KZQA 1MEKA 4IW9A 1PL1A 4EE0A 4TR4A 3UBKA 4ULXA 5HQPA 2GDRA 2LNTA 4ECIA 4PQHA 2CVBA 3IOSA 1KTEA 2O85A 1X9MB 2AJQB 5KN0A 1AXDA 2OA7A 1JZDA 1O6JA 5G5FA 4XHMA 2QKEA 1F9MA 3VPTA 1FVJA 1GTBA 3DKSA 4HZ4A 2X8HA 3D0ZA 5G1LA 3HCZA 4ZB8A 3UARA 3VI5A 3TRQA 2JACA 4MPFA 1GSFA 3M9JA 1A8YA 3C1RA 2A2SA 5D96A 3ZREA 1OAZA 1X5CA 1Z3EA 3IA1A 3ZTLA 3ME8A 5F06A 2PGTA 1ZZYA 3G7YA 1TK8B 2B7KA 3SWLA 1J9BA 4HQSA 2PVOC 1M7TA 1K0CA 3ME7A 3QAWA 2FCHA 1MDKA 1ZCPA 4WETA 4FYBA 4HEA2 5L71A 2ZUPA 5AISA 3ZMLA 1R7HA 3MDKA 2V6KA 2I4AA 1S3CA 3KXOA 1KEBA 4HS1A 2OADA 4TXVA 1E6BA 5IOXA 3A5WA 4TXOB 5KN2A 3F3QA 2H6ZA 2HNLA 2H19A 3E9JB 2CT6A 2H72A 5LD0A 1OC3A 1K3OA 2ZCTA 3GKKA 3HXSA 5ECIB 3ERGA 3CSIA 5JWOB 3F6FA 2VD1A 3ED3A 1GL8A 3RHBA 3KCMA 3TJBA 3N5OA 2XPEA 4WXTA 5DAKB 1PSQA 3ZL5A 3GH9A 2JL4A 2VO4A 1AIUA 2YP6A 3CMIA 2GTUA 3VLNA 1V98A 3EYTA 2IWTA 2C80A 3QD9A 2GQMA 2R6KA 2JZSA 2CQ9A 2NDOA 4IGJA 4KA0A 1USBA 13GSA 1SJ6A 3L9SA 3RPPA 4JZQA 2HI7A 3PH9A 4K0GA 4OFNA 4BA7A 2IFQB 1YZXA 4DSRA 4MH2A 3UEMA 4IS0A 1XIYA 4KCAA 2C3TA 1K0BA 1EGRA 4HU9A 1XCCA 5E59A 3HDCA 2CX3A 2C3NA 3IE3A 3IK9A 3DVXA 2O87A 3LSZA 3O6TA 1Z9HA 1NHOA 2RM5A 2L6DA 3HJMA 5DDLA 3VWWA 1ERVA 1XBSA 4TW5A 4KNDA 1VF4A 1EP7A 1EOHA 2ZNMA 4KAEA 3RDWA 2D2ZA 4IP6A 1XPVA 3O76A 3GKXA 5ECRB 5IMFA 1GUKA 1BYEA 2H0IA 3RHCA 3IK7A 4RI7A 5JCGA 3VWUA 4MH3A 1G7EA 1F6MC 2F51A 1SYRA 4FYUA 3TKPA 2HZEA 2X99A 4MK3A 4ZB6A 3RAZA 3F4RA 1BEDA 1GTUA 1A23A 3TRXA 4GRFA 3G7JA 2H30A 4BPYA 4DSSB 2DJ3A 4CW9A 1MTCA 3IBHA 5GAPD 2YCDA 1LU4A 1HD2A 1TI3A 2WGRA 1XZOA 4POMA 1ZMAA 3US3A 4XTSA 2NPBA 2C0EA 3CRTA 3TUEA 4V2MA 16GSA 4MLYA 4KH7A 1G7OA 3TJFA 4L8EA 2F3MA 3A2WA 1TXXA 5HR1A 4EO3A 1HNAA 4DEJA 2G2QA 1TRVA 2QGVA 1Q98A 2HFDA 3BCIA 19GSA 4NAXA 1CQHA 1R4WA 1X9SB 1QFNA 4LA1A 4EDZA 7GSSA 3GURA 2GSRA 5GZZB 3TOUA 1BG5A 4XS4B 1GLQA 1MDIA 3WD6A 1ACVA 1WMJA 2H01A 3PINA 3DYRA 1WPIA 3QR6A 2JSZA 3IC4A 4ISDA 1G0TA 2V6OA 2WFCA 3F4TA 2GQKA 3HY2A 1DUGA 4GSSA 2DJ0A 1FW1A 5AN1A 5DALB 2NVLA 1SKWB 3H1NA 2B5EA 4KGIA 2HRFA 1EWXA 3PGTA 5D9VA 4BVXA 3Q19A 5CRDA 1RK4A 1U88A 3P7XA 5ID2A 5IQYA 5DBQA 1PN9A 3LXTA 2H70A 2VCTA 3HJOA 5ELAA 3TKRA 1X0RA 1M2DA 4OO4A 18GSA 2VIMA 2CZ3A 1W89A 3GNJA 2P31A 1T4YA 3UAPA 2WCIA 1ON4A 3I69A 2HSHA 2DMLA 1X5EA 4X43A 1FAAA 1MD3A 2YZHA 3ZMKA 2H0HA 4LMWA 1AUCA 5ECLB 3M1GA 3VWVA 3TGZA 1V58A 1U3IA 2TRCP 1YEPA 3GFKA 2KHPA 4FYCA 3I9V2 1OKTA 1TOFA 3EMXA 1GSQA 2K9FA 3UJ1A 2HZFA 3QPMA 3ZRDA 1X5DA 2FLSA 5B6NA 1B4PA 1O7UA 3L0HA 4ZILA 4K1FA 2H73A 1UA5A 4WEYA 4G10A 3DRNA 4KSOA 2VUPA 2M80A 2MMZA 3WGDA 5KN3A 4BL7A 3FW2A 2CZ2A 3L78A 4G2EA 1IYIA 3RPNA 5A4UA 4D73B 3IAS2 5A5KA 4G19A 1ZGNA 2E2GA 1FB6A 2F8AA 2N5AA 5ECOB 2LUSA 4I2TA 2DC5A 5CO3A 2VL2A 2C8UA 4XS6A 3KH7A 2MZCA 2A2RA 12GSA 2RUEA 3ERFA 3VURA 3QCPA 3EURA 2H1BA 4HU7A 4HI7A 3QAVA 3CXGA 1A0FA 3Q6OA 2LEGA 4JEDA 4IJ3A 1XVWA 4RQRA 1XWKA 2NTOA 3W8JA 3TRPA 5D9WA 1TK5B 1Z6NA 2XPDA 4TOPA 3D4TA 3W8SA 4KDUA 1PRXA 2FWHA 2X8CA 3IDVA 2P0GA 5B8AA 2FNOA 2DJ1A 3GKNA 3E0UA 3NOFA 5AIXA 5ABRA 2M46A 2QSIA 2WULA 3C7MA 1K0NA 4HZ2A 4QL9A 1ERUA 5CRWA 3CBUA 2O89A 5GSSA 1B48A 1S3AA 1A0RP 3FR3A 3GA4A 4E8HA 3PR8A 4ZBAA 1SL2B 1K0MA 4F82A 4IP1A 4OWYA 4L5OA 3GUSA 1M2AA 2MMAA 2FD3A 3KD0A 4WF5A 1QUWA 20GSA 4OFTA 2RUFA 3GMFA 1HQOA 2EIRA 1AQWA 3MAKA 2YWMA 3JCML 5FT3A 3HYPA 3LYPA 1B9YC 1NHYA 1XWCA 2LSTA 2JZTA 2O7KA 1FO5A 2WS2A 1OVNA 1M2BA 3S9FA 3FHKA 4MZBA 2LRCA 4O5RA 4WF4A 3BOAA 3MSZA 3WYWA 1TU7A 4YQMA 3TJKA 3UIWA 1WWJA 2JSYA 2GT6A 1T4ZA 1ZYEA 2C1YA 5AGYA 4TR3A 4WR4A 1XWBA 5B7CA 5ECQB 3RBTA 4F0BA 3CTGA 1XWAA 1Z6MA 3H4KA 3OR5A 1GP1A 2IMFA 4KCEA 4K0NA 2LV3A 2JZRA 4MCUA 3DMLA 1F3BA 4YQVA 3NZNA 3IHQA 4POLA 4PNGA 1LBKA 3F63A 2DLXA 4I97A 2J9HA 1EZKA 2YV9A 5HR3A 3UBLA 2GS3A 1N2AA 1XW9A 5CNWA 3WT1A 3F4SA 1ML6A 1XOAA 1U3AA 2F9SA 4X1UA 2I9HA 5AIVA 4Q5NA 2L57A 3H93A 1I5GA 4AJ7A 1BQ7A 3F0IA 1XW6A 4K7IA 2MMOA 3A3TA 5D73A 3P8WA 1V9WA 4JBBA 5CYYA 1THXA 3KTBA 5DVBA 5H5RA 3EVIA 2LTKA 1TRSA 5INYA 2IMEA 4XRAA 4CHSA 5J5NA 4ML6A 2YPMA 2GLRA 2N5BA 5IPGA 3ERWA 4LMVA 3IV4A 3TDGA 2XHFA 4HJ2A 2V2GA 3MNGA 1URMA 1BAYA 5G30A 3TKQA 4EF0A 4GQFA 2VLUA 3MWHA 5CP1A 1GSSA 4N10A 4TR1B 4N30A 1T1VA 2XBIA 2I81A 1T3BA 4OCEA 2PPTA 4IQAA 3GX0A 3BJ5A 3L4NA 3U5RE 3FK8A 1SK2A 4RI6A 3GL5A 1YF0A 22GSA 1GTAA 1EEJA 2OACA 3ZLPA 5B6MA 5CAXA 2OBIA 4K6XA 4BVYA 2FHEA 3KP9A 3VK9A 1Z7RA 1MD4A 4Q5RA 3EMPA 5F8BA 3Q18A 1AW9A 2B6MA 4IQ1A 4MDCA 4FIWA 1ILOA 1ZYQB 2VAFA 1SU9A 3TJGA 1F37A 4YQUA 2CAQA 5JWQB 4ZL7A 2FGXA 2PERA 3ZITA 3LEFA 2YZUA 1PX6A 2C0GA 4MZWA 4EKZA 3I43A 2WRTA 4KB3A 4JE1A 2B7JA 4J56E 1PA3A 4JU5A 2V32A 3VFIA 1K3LA 2R2JA 3D4MA 3TKSC 2I1UA 1O8WA 2DSAA 1JZRA 2H0GA 5E4WA 4HQZA 2L6CA 4AGSA 3HZ8A 1OC9A 2VM2A 2GZYA 3FZ9A 5IMZA 2V41A 4KW6A 1AAZA 2VCXA 4ECJA 1WE0A 2WJUA 1YJ6A 2FWEA 3GRXA 2GSQA 1TRUA 3K8NA 2REMA 3EU3A 4TXOA 1SJZA 2HSYA 3GV1A 3P90A 1HYUA 3GH6A 1VRSD 4Z7XA 5ENUA 5EVOA 4TKYA 1NSWA 4WBJA 1YKCA 1EEMA 1PMTA 3GTUB 1AQVA 1OKDA 3C8EA 4Q5QA 6GSXA 2B1KA 1PQNA 4N0ZA 4EL1A 2KP1A 1FOVA 5HR2A 5DAKA 1ERWA 1EP8A 4LL1B 4I2UA 1ST9A 2A4VA 2TRXA 4YH2A 4OCFA 2FWFA 1OC8A 2M72A 1HNCA 4GLTA 3G7IA 4FH8A 4MZCA 1M9BA 1B4QA 3FZ5A 2CAIA 1TU8A 2DIYA 2OKAA 1PX7A 4I8BA 2PUKC 5D9XA 3A2VA 1ZL9A 4MA9A 3LGCA 5ECPB 2IL3A 2R4VA 4NHWA 2C0FA 1X9WB 1Y25A 2YWIA 3J7Yk 2IFQA 4KUNA 5JCWA 3QFAC 4MP4A 3KJYA 1F2EA 2B5YA 4LLRA 3FR9A 2YWNA 3CRUA 3Q74A 2CV4A 2WDUA 1JHBA 5DJMA 4PNFA 2GSTA 3DEXA 1QGVA 1T8EB 3H79A 3ZVJD 3IXRA 5A4VA 4NXIA 5ECNB 2LQQA 5D93A 5IMAA 2R3XA 2H8LA 3FZAA 2ON5A 4AF2A 1YY7A 2IJYA 1GUHA 2AYTA 4N0VA 1FVKA 3N9JA 4QL7A 3DIEA 4OO5A 1W4VA 3UMAA 1PL2A 2WB9A 2IMIA 1QQ2A 2WZ9A 4L0UA 2LJKA 4X0XA 2PN8A 1O81A 2MYGA 2PBJA 5FWGA 4MJAA 2VM1A 1GLPA 1PKZA 4ECCA 3EU4A 3TKSE 3GIXA 1SYXA 3C71A 1A2LA 2AHEA 2MBTA 1A8LA 1H75A 3DD3A 1E2YA 2LS5A 3IAM2 3DXBA 4ILFA 4XS1A 5DJLA 2DJKA 2CA8A 4NMUA 2GSSA 1GRXA 4ZB9A 4G9HA 2NBSA 2GT5A 2KLXA 6GSSA 1T00A 2GVPA 3KMOA 4DSQA 3GHAA 5HR0A 1SL1B 3F9UA 4CDOA 3FRCA 1YEXA 3WGXA 4FO5A 2VCWA 3HD5A 2JU5A 2CVDA 1GNEA 1AQXA 3QDNA 2VCZA 3LQ7A 4TN8A 5HFGA 4MJEA 3KM6A 2GZZA 1DBYA 3GYKA 1G6YA 3D22A 1XW5A 3L9UA 2FA8A 1V57A 2K6VA 3ZFBA 2ES7A 1TJDA 5H5SA 2AV4A 4L5LA 2R37A 4DVCA 4HDEA 2VCQA 2DIZA 4MF5A 4PGTA 4XCSA 2QC7A 3TCOA 6GSUA 4HUAA 5LCZA 2VCVA 5DCHA 2YWOA 4K7OA 3BCKA 4AJ8A 3KP8A 3QAGA 4XS4A 5H5QA 2G0FA 2R5GA 1QMVA 2H71A 2DBCA 1TW9A 3HA9A 2Z9SA 1GH2A 5IO0A 2YOIA 1WP0A 2RLIA 2HXKA 3UVHA 5J9CA 4ECBA 5KN1A 3HVXA 3C73A 3VI7A 1SKRB 1SL0B 4KE3A 1BJXA 1K0AA 2XC2A 3G9BA 1V40A 5CRHA 2HRNA 1XOBA 3C1SA 4I6XA 3W6GA 5ECKB 3ZIJA 1O8XA 8GSSA 2P5RA 5EPFA 2BTOT 5F07A 4XRDA 4F2IA 5FHIA 2L5LA 1EV9A 4K8MA 3WGEA 1O85A 3TJJA 2CX4A 6GSYA 1OE8A 2I3YA 4E8EA 2HZEB 4GTUA 5B8BA 1GSDA 3KGKA 1K0OA 1PKWA 2H1GA 3HVSA 4NWYA 3E3EA 3FY7A 5G2ZA 2JADA 4NV2A 2RM6A 3HHVA 2P5QA 4ZL8A 4HJMA 3IPZA 1G6WA 3LWAA 2FWGA 5GAND 5IMVA 3GSSA 1C72A 1SK1A 5G1KA 1OC9B 2GZPA 3CTFA 4MJBA 2HE3A 1H4OA 1EOGA 3BD2A 2H6YA 1RW1A 4YAVA 3CSHA 4V2NA 2B3SA 1M99A 5IIZA 2OE0A 3LXZA 2FY6A 4PQ1A 1HNBA 3F6DA 1Z5YE 4EDYA 1R26A 1B8XA 2H6XA 3DWVA 6GSVA 1VF3A 10GSA 1TDIA 1A2JA 9GSSA 5EL8A 5C04A 3F8UA 4MPGA 1SKSB 4D73A 2VD0A 4TVEA 1PD21 1R5PA 5ECSA 5EY6A 5G5EA 4AJ6A 1A2MA 2LRTA 1SJIA 4GSNA 6GSWA 4PXOA 5DQSA 2C3QA 3FR6A 1K3YA 5D9TA 3WT2A 2ALBA 5D8IA 2IN3A 1QXHA 1PGTA 1M0UA 3IRAA 3ZIVA 2K8SA 4EVMA 3HVVA 3P2AA 1Q4JA 2PWJA 4BWSA 5LNKe 1J0FA 5ID2B 2MMNA 1SK0A 3IR4A 2AB6A 1A24A 3QFBC 1J08A 3LYKA 4ZXGA 4IVFA 3HJPA 3CSJA 2KP2A 2L4QA 2LKUA 4TRXA 3M8NA 5J3RA 4MJCA 4EXJA 4MABA 1GNWA 1N8JA 1YKAA 5IPHA 1S3DA 1GSEA 3KTLA 4RQXA 2XBQA 5C00A 4GXZA 3FYGA 1GWCA 2OE1A 3GL3A 2VLVA 4KDXA 2B5XA 1V2AA 4NV5A 3R2QA 1VF1A 3CYNA 2CVKA 1WIKA 4BWQA 3A2XA 1YQ1A 2VL3A 1YDKA 3TKSA 4WR5A 2AUVA 3H8QA 1JLWA 1EV4A 5IO2A 2EIQA 5JCUA 4O92A 2HYXA 2MBSA 4MMMA 2GGTA 2H76A 2RIIA 5CRGA 3LFLA 3ZYWA 4V2LA 4KSMA 2YNXA 2YJHA 2L59A 2V1MA 1NM3A 4PUFC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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