2IMDA

Structure of semet 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase (hcca isomerase)
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
MIVDFYFDFLSPFSYLANQRLSKLAQDYGLTIRYNAIDLARVKIAIGNVGPSNRDLKVKLDYLKVDLQRWAQLYGIPLVFPANYNSRRMNIGFYYSGAEAQAAAYVNVVFNAVWGEGIAPDLESLPALVSEKLGWDRSAFEHFLSSNAATERYDEQTHAAIERKVFGVPTMFLGDEMWWGNDRLFMLESAMGRLCRQNADLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas putida
publication title 2-Hydroxychromene-2-carboxylic Acid Isomerase: A Kappa Class Glutathione Transferase from Pseudomonas putida
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase
total genus 69
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 5.99.1.4: 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase.
pdb deposition date 2006-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2imdA00
3W6GA 1MEKA 5LD0A 3TJKA 4MZCA 2OA7A 3FR9A 1JZWA 3PINA 3UEMA 3ZL5A 1URMA 1B9XC 4JE1A 5C00A 1SJ6A 1O8WA 2DSAA 3RHCA 4YQVA 3ZIVA 5DQSA 1ABAA 3UOMA 1G6WA 2VIMA 3A2WA 2GS3A 1C72A 4PUAA 3G7JA 3ZVJD 5G1LA 3O76A 2HXKA 2CA8A 4MK3A 2YZHA 2CVDA 2GSRA 1XFLA 4HJMA 4ILFA 4QL9A 2O89A 4N11A 4V1Ap 5DALB 3ED3A 3ZIJA 1EGOA 2V6KA 4K7OA 4CW9A 3G7IA 4OO5A 22GSA 4KCEA 1A23A 1PKWA 4Q5NA 1WIKA 1F37A 3BCIA 1SJZA 5LNKe 5KN3A 1ST9A 1ZYEA 2K8VA 5J3RA 2C3QA 2XBIA 2AUVA 2LNSA 3IAS2 5B8AA 3HYPA 3P90A 2Z9SA 1XZOA 2I3YA 2HT9A 4MZWA 1I9DA 3LEFA 2NTOA 3HA9A 1USBA 2H0IA 2ON7A 1XXUA 3LGCA 4OCFA 2LRTA 2GQLA 2N5FA 2WRTA 1FHEA 5DAKB 1Y6EA 4F03A 4GLTA 2MYGA 5C04A 4DSSB 2IMDA 1MD4A 1Z6NA 1XOBA 4WBRD 2EIOA 2FA8A 3QOUA 2HZFA 1X9WB 3HD5A 5GSTA 4JR6A 5ECPB 4TR1A 2TIRA 3Q6OA 1S3DA 4ZILA 1TRSA 4XS4B 16GSA 3QFAC 5G2ZA 3ME8A 4K0GA 1SYRA 2DLXA 3S9FA 3JCML 1Z7RA 4HZ4A 3UMAA 2GSQA 2DJ1A 4EUYA 2LJRA 2QKEA 4V2NA 12GSA 2NDOA 3QAGA 4JR4A 4LA1A 6GSTA 5IMDA 1YY7A 5IMFA 1T7PB 5GAND 5IOWA 2F8FA 2X8CA 5KN2A 3DXBA 3MDKA 4N10A 1WOUA 1FO5A 4XS1A 3ZVJA 4MH2A 4ZL8A 2VL3A 3F8UA 3J7Yk 4OMVA 2LV3A 2DJKA 1VF3A 2D2ZA 2IL3A 3TCOA 1G6YA 4ECJA 2IMFA 3CTFA 3DYRA 4DSQA 3C73A 4G10A 1M9BA 3C8EA 1VF1A 4TR0A 2VLTA 3GHAA 1K0NA 1GSUA 1XOAA 1ZZYA 4KB3A 4WETA 1SJIA 2JZSA 3HJPA 5H5RA 3PGTA 2H0GA 1MDJA 2PGTA 1T4ZA 2DIZA 5IMCA 19GSA 5IM9A 5G1KA 4IP6A 3UIWA 4IBPA 4CHSA 2V2GA 2P5QA 1SKRB 1XWGA 1SKWB 1SK2A 4KX4A 4F0CA 2AHEA 1SYXA 2CAQA 5GZZB 3GRXA 2OBIA 3F0IA 2JADA 2XPDA 5HFKA 2B5EA 4NV5A 5GSSA 2LKUA 5ECHB 4IN0A 2JZTA 1HYUA 1DSBA 1ML6A 2GZPA 4IGJA 3HZ4A 4FYBA 5JCUA 2JACA 3GYKA 4O7HA 3APSA 4GTUA 5HFIA 3HVVA 3OR5A 2HI7A 3TRPA 3KIJA 2V1MA 2C3TA 1XBSA 2YWMA 1A0RP 1R26A 2DJ2A 3QR6A 1W89A 4MJAA 4HOJA 1X5CA 4L0UA 4WEYA 1K0CA 4X1UA 1ZYQB 3D0ZA 2E2GA 3IR4A 2IN3A 4MMMA 4JBBA 4Z7XA 1AIUA 2LQQA 3F4SA 3GL3A 2EC4A 1PRXA 2JSYA 5ECLB 2EIRA 1RW1A 3GTUA 2H6XA 4KW6A 1ERWA 2WB9A 4MCUA 1ACVA 2GSSA 2N5BA 3FK8A 1N8JA 2L6DA 1THOA 1T1VA 2B3SA 1TU8A 2BTOT 2PU9C 5G30A 4MF5A 4XTSA 4YH2A 4FIWA 1GLQA 3M9KA 5E4WA 5A4VA 3L9UA 1KEBA 1GSFA 2VCZA 5IPHA 5ECKB 2H70A 4ZXGA 1FOVA 6GSXA 4YAVA 1B4QA 5CYYA 1ERUA 5IIZA 3Q18A 3FY7A 1QQ2A 2PVQA 2YJ7A 3DMLA 4G19A 3CTGA 3MWHA 2VO4A 4MF7A 5CRGA 3GKMA 3TGZA 2RUFA 2WJUA 2L57A 4KNDA 5CRHA 1GH2A 3WGXA 4ZB6A 3GKXA 3ZZXA 5JCWA 1SL0B 1OE7A 3GX8A 3NOFA 2C4JA 3GSSA 2IMKA 2F8AA 4MJEA 1OKTA 2PBJA 2HSHA 1H4OA 1QFNA 3WYWA 2ZNMA 3ERGA 4RI6A 5IMZA 1Z6MA 1X5DA 3D5JA 1X0RA 2QSIA 5G5EA 2TRXA 1U6TA 3UBKA 4EL1A 6GSSA 3QFBC 1XWCA 3IBHA 2V41A 5D96A 2ALBA 1WMJA 2M80A 4QL7A 5INYA 5DVBA 3P8WA 3E3EA 1YEPA 2B5XA 3DD3A 2L5LA 4K1FA 5FT3A 1O6JA 3QAWA 1OKDA 3UL3A 4HDEA 2MZCA 5B6NA 4GF0A 3AY8A 1CQGA 4DVCA 3IA1A 4GXZA 5JWQB 1V2AA 3I6AA 3RHBA 2MMAA 1TK5B 5IQYA 2C8UA 3FYGA 1NSWA 3VWUA 1AQWA 3FW2A 4IS0A 1J0FA 4PQIA 3WD6A 1ILOA 5F06A 4YQMA 4OCEA 2VL9A 2CVKA 3GURA 1FW1A 2HLSA 2PWJA 3ZITA 3H1NA 2LSTA 2VCQA 4N0ZA 3LG6A 2XC2A 3L9SA 2YV9A 3FRCA 3ZREA 1QK8A 2FWFA 3DKSA 6GSVA 3SBCA 1GSEA 1Z3EA 2KLXA 4V1Ag 1TP9A 2ON5A 3WT2A 3A2VA 3C1SA 3IRAA 2REMA 2YWNA 2MMZA 5H5SA 4IW9A 1XW6A 1SL2B 5A5KA 1R7HA 2L6CA 1FAAA 2OE3A 5ID2A 5EPFA 3G7YA 1NW2A 4CDOA 3L0HA 2VL2A 2HSYA 3GTUB 1Q98A 1K0OA 1TXXA 1X5EA 1EP8A 1HNAA 2H1GA 1LJRA 3E0UA 1ON4A 3FR3A 1PX6A 1GSDA 2N5AA 1M0UA 2VCTA 3VPTA 3LJRA 2DJJA 1R5PA 4JRRA 2K8SA 3F4RA 2LNTA 4TW5A 4ZB8A 1AUCA 3IXRA 4MPFA 2FY6A 1KBNA 4GSTA 1TKDB 1OC8A 2MBSA 4OO4A 2O85A 3H4KA 3UARA 1U3AA 3HJMA 3GA4A 2H6ZA 1UC7A 3R2QA 5ELAA 2IJYA 3PH9A 1JLVA 2O8VB 2HZEB 3L78A 5JWOB 20GSA 1RQMA 2LQOA 4HQZA 4TKYA 1A8LA 5B7CA 2FGXA 3HHVA 1RK4A 4KSOA 2H73A 4D73A 1W4VA 1XW9A 2F3MA 1U3IA 3FZ4A 3LWAA 1TU7A 2G2QA 4HZ2A 4TXOA 4ZBDA 1VGLA 1JZRA 5DJMA 3FR6A 3D4TA 3DVXA 4K6XA 1OC9B 3TOUA 3GX0A 4FO5A 4TR4A 1B4PA 3TKSE 3Q74A 2JU5A 2VD1A 17GSA 4POLA 5GAPD 3FKFA 5H5QA 1ZOFA 4PGTA 4BWSA 1TJDA 3F6FA 3NIVA 4G9HA 1DE1A 1GUMA 4IP1A 1GTAA 4FYCA 2P0GA 3EMXA 4FYUA 2MMOA 5G31A 4TN8A 1DE2A 2CV4A 3U6VA 1GWCA 4GWRA 4LMVA 1GSSA 5CP1A 4QQ7A 5ECNB 1M99A 1GSQA 4ECIA 5D9VA 3RPPA 4ISDA 2K6VA 3GUSA 1K0MA 3BD2A 5B8BA 1K0DA 1EEJA 1ERVA 1VF4A 5HR0A 2CQ9A 2IIYA 3TKRA 1VF2A 1WPIA 2VAFA 5CRDA 3CSJA 2I4AA 1XCCA 1UA5A 2YWOA 5ECIB 4ZL7A 2O87A 1U88A 1PA3A 2IMIA 2WZ9A 1A2JA 2YZUA 3P7XA 4HQSA 2PERA 2I1UA 1T00A 3GMFA 4GCIA 5D73A 4IJIA 3A5WA 2C0EA 4E8EA 3DIEA 3TKSC 3HVXA 3I9V2 4XHMA 2PMTA 1LBKA 1Q4JA 3F4TA 4EF0A 2CAIA 2JL4A 1K3LA 2GQMA 2B6MA 4EDYA 4POBA 4TXVA 4JU5A 1TW9A 4WBJA 1O85A 1AW9A 1V58A 3O3TA 2OE1A 3VWWA 2H8LA 1T8EB 5F0GA 1S3CA 5D9TA 1OYJA 3GKKA 3TKPA 4I6XA 2FHEA 3GH9A 3RAZA 3DEXA 13GSA 4POKA 5HFGA 1R4WA 2MMNA 2K18A 3ZYWA 2ZUPA 2BMXA 1JHBA 1ZCPA 3CYNA 1M9AA 2PUKC 5DDLA 4NPBA 3D6IA 2NBSA 5D93A 1FB6A 3QD9A 4K8MA 4MZBA 1PX7A 2OBKA 1SK0A 3GKNA 4PNFA 1QGVA 1MDIA 4K7NA 2VM2A 2R6KA 3LYPA 4RI7A 2HE3A 4K0NA 4WF4A 1TRUA 1YF1A 2EIQA 1AQXA 3L9VA 4D73B 5IO2A 1F3BA 2HNLA 1AXDA 2LEGA 2H74A 1YDKA 4RUVA 4TRXA 1Z7PA 2GLRA 2XHFA 5CNWA 5DJLA 1B48A 2HYXA 3M8NA 3A2XA 1TI3A 2OE0A 4J57E 3HCZA 3CBUA 2QC7A 4IELA 6GSUA 4DEJA 2R2JA 2QGVA 3GSTA 3BOAA 2OADA 4PXOA 1BJXA 2CZ2A 5KN1A 2NPBA 1R5AA 1K3YA 2ES7A 3VWXA 1AAZA 4X43A 4GQFA 3WT1A 2H1BA 2H30A 1BEDA 4MH3A 4O5RA 4EO3A 3ME7A 2R37A 5JCGA 1PSQA 2H01A 2VCVA 5EY6A 4IQAA 3FZAA 1A2LA 1NHYA 2R4VA 1ZMAA 1GNWA 4AGSA 6GSWA 2B1KA 2PN8A 2H66A 4BA7A 1PKZA 3ZMLA 1BYEA 7GSSA 1EV4A 5COHA 2OACA 4TR1B 1SU9A 2H19A 3IC4A 3GV1A 3KMOA 2B1LA 1EEMA 5IOXA 3VI7A 5E59A 3FZ5A 4MA9A 1M2AA 3VLNA 4KGIA 3EINA 3SWLA 3CRTA 1GSYA 4MP4A 1WP0A 4ZB9A 3KM6A 4KSMA 5J41A 4F9ZA 3K8NA 2CX3A 2C0FA 5HR2A 2GTUA 4L5OA 4PX1A 3KH7A 5A4UA 1KNGA 5KN0A 2IWTA 1F9MA 3TRQA 3CSHA 5ECSA 3V1WA 2YPMA 3VPQA 1IYHA 2H76A 2XBQA 2KOKA 2X8GA 3MAKA 3ZMKA 2L59A 5ECOB 1G7OA 2B7JA 1GTIA 5F07A 1A8YA 3KTLA 2L4CA 5DALA 1YEXA 5FHIA 2FD3A 2E0QA 1PQNA 1F6MC 4Q5FA 1N2AA 4ZBAA 3F3RA 4TR3A 5AIXA 4GRFA 4TOPA 4ZIJA 2C80A 4EC0A 2A2SA 2YV7A 3A3TA 2DMLA 4GQCA 1HQOA 2C0GA 1ZGNA 1DUGA 3F3QA 1A2MA 3RPNA 1ERTA 2M46A 2FCHA 4AJ6A 4YQUA 1UN2A 1F3AA 3CRUA 2R3XA 3EWLA 2GQKA 4KUNA 3HDCA 3IK9A 3APQA 2WCIA 1MDKA 3DRNA 3LSZA 1TOFA 11GSA 4I97A 1F2EA 3U5RE 1ZL9A 4ULXA 1WJKA 3M3MA 2H71A 4DSSA 1YZXA 1PMTA 2KUCA 3IE3A 4O32A 3F9UA 1TTZA 4ML6A 3CMIA 1G0TA 1SL1B 4I2UA 5IPGA 4XCSA 3HXSA 2IPAA 4E8HA 2K9FA 4MLYA 3H8QA 4IVFA 2FLSA 4I2TA 4IQ1A 2WDUA 3IDVA 3IAM2 4K9ZA 2F9SA 1J08A 2J23A 3C7MA 2I9HA 3C71A 1DBYA 2YOIA 2RUEA 1M2DA 3GNJA 4V2LA 2TRCP 2B7KA 3ISOA 4Q5RA 5ECRB 4X0XA 2LRCA 3QDNA 1IYIA 1GNEA 2LS5A 5CREA 1H75A 1BAYA 3EYTA 1TDIA 2WGRA 2YCDA 5D9XA 3ZFBA 1XIYA 3KTBA 4KE3A 2LUSA 2WULA 4LL4B 1XWKA 5EVOA 3HKRA 1SK1A 5IO0A 1Z5YE 3IK7A 5LCZA 1EV9A 3WGDA 5A4WA 4EE0A 3APOA 4PUFC 3LXTA 2B5YA 1J9BA 3UAPA 3VK9A 1JFUA 3N5OA 4ML1A 2CX4A 2GZZA 1K0BA 1TRWA 2VCXA 4O92A 4FH8A 5IMVA 3NZNA 2FNOA 3H93A 3J7Yb 4BWQA 5D9WA 1AQVA 6GSYA 1EZKA 4RQXA 1PD21 3F6DA 2AJQB 3TJBA 3M1GA 3KMNA 2HFDA 5ELGA 1BX9A 3QMXA 4IKHA 3RDWA 2X64A 4NWYA 2H0HA 1GTUA 4HU9A 4NAXA 1V9WA 1YQ1A 2YN1A 2OJLA 4PNGA 1BG5A 4MF6A 2GT6A 1FVKA 1B9YC 1A24A 2GSTA 1UVZA 4KDYA 3LYKA 3EMPA 3DVWA 2AYTA 1GTBA 1T4YA 3MSZA 5AN1A 3KEBA 1FG4A 4XRAA 4XIHA 3TB2A 3BCKA 18GSA 4LL1B 3IHQA 1FVJA 1V40A 3GL5A 2RLIA 2CT6A 1YF0A 2C3NA 2H72A 1LU4A 1JZDA 4YAPA 3ZLPA 2GVPA 1XVWA 5F05A 1EWXA 1EOGA 5ID2B 1FB0A 2DBCA 4WKWA 4Q5QA 1JLWA 2YJHA 1HNBA 5JWRB 2F51A 4F2IA 3WGEA 2WS2A 3UJ1A 1GUHA 1PGTA 3QCPA 3ZFLA 2V32A 4HU7A 2JSZA 3P2AA 1EOHA 2HRNA 2IFQA 4NHWA 1NHOA 1V57A 1GP1A 1GRXA 1G7EA 3ERFA 2KP2A 2E2MA 3EURA 3D22A 2GDRA 3EVIA 3W8JA 1O73A 1EP7A 2H75A 5DBQA 1WWJA 4JEDA 4N30A 2VL2C 1GULA 5L71A 2XPEA 3M0FA 2X99A 1HD2A 5KEJA 5AISA 4XS6A 3F63A 2DC5A 3O6TA 5CO3A 2H1DA 5B6MA 3ERWA 1E2YA 5J9BA 3KGKA 1KTEA 5HR1A 4AJ7A 2GGTA 5D8IA 4I8BA 4NXIA 4L8EA 2YP6A 3E9JB 4JZQA 1O8XA 2YNXA 3IOSA 3CXGA 5HR3A 1S3AA 14GSA 4WXTA 2VUPA 3UBLA 2DJ0A 4TXOB 5IMAA 2AB6A 3BBYA 4N0VA 3TJGA 5G5FA 2VD0A 3TUEA 1I5GA 3LXZA 4HUAA 4L0WA 1TK8B 4AF2A 3M9JA 1CQHA 1B8XA 3D21A 2PVOC 1WE0A 2YANA 4J2FA 1HNCA 4NV2A 1YKAA 2HRFA 2E7PA 2CZ3A 1TI1A 3H79A 2NVLA 4ID0A 4KDXA 4ZBBA 3TKQA 4RQRA 4KAEA 1K3OA 5CRWA 3QPMA 4PURA 1X9SB 3BJ5A 2R5GA 1QXHA 4HEA2 3Q19A 3GH6A 3TDGA 1K0AA 3TRXA 2LJKA 3TOTA 3DGQA 1QMVA 5J5NA 3KP9A 1A0FA 2FUG2 2FWEA 2LTKA 3HJOA 4OD7A 5DCGA 4HI7A 4DSRA 2DIYA 2MBTA 2VLUA 1TK0B 2KHPA 2AAWA 4GSNA 3LORA 4K7IA 4MABA 1XPVA 2O7KA 4OWYA 2JZRA 3PR8A 3RBTA 4LMWA 4WF5A 1OC3A 1NM3A 4PQ1A 1PN9A 3L4NA 4IJ3A 4LLRA 1VRSD 3I69A 2BJXA 1Y25A 1THXA 3GIXA 1GUKA 4KCAA 1OVNA 4GSSA 3HY2A 1XWBA 4OFMA 1SKSB 2FWGA 3MNGA 3EC3A 2WFCA 1YJ6A 3VWVA 3ZRDA 3G9BA 1V98A 4EDZA 3VURA 5AIVA 2IFQB 2P31A 5J9CA 2VOCA 1O81A 5FWGA 2HZEA 3KD0A 1SD9A 4PQHA 2VM1A 4KDUA 3UVHA 1AC1A 3FZ9A 3EU4A 1XVQA 3QAVA 2GZYA 1SD8A 3EE2A 4HS1A 4I5QA 2VLVA 4MJBA 4TVEA 3VI5A 1TRVA 1JZOA 2X8HA 2J9HA 3N9JA 1OC9A 3VFIA 1SENA 1XWAA 3LQ7A 4EXJA 4MDCA 1MTCA 2KP1A 2RM6A 5AGYA 1E6BA 3FEUA 3FHKA 5ABRA 2LJAA 1O7UA 3C1RA 3IV4A 4F0BA 2L4QA 1OAZA 3I43A 2RIIA 1PL2A 1GL8A 5DAKA 2C1YA 2CVBA 3UVTA 2V6OA 4WR4A 4OFTA 1Z9HA 2DJ3A 1QUWA 1U87A 3KZQA 4AJ8A 4NHZA 1YKCA 2GT5A 3IPZA 4XRDA 3GN3A 1BQ7A 5J4UA 5ENUA 2H1AA 3KP8A 1T3BA 9GSSA 2L5OA 3CSIA 10GSA 4WR5A 2C0DA 4KH7A 4BPYA 3DWVA 3TKSA 2AV4A 4XS4A 4V2MA 5HQPA 3GFKA 4IHUA 1X9MB 2IMEA 2P5RA 2I81A 3HZ8A 3KXOA 4NMUA 1MD3A 2H6YA 4ZL9A 3D4MA 1GLPA 4EVMA 1OE8A 1M2BA 2A2RA 1PL1A 2G0FA 4P3YB 8GSSA 2FA4A 4KA0A 3HVSA 2VCWA 2FWHA 2YWIA 2OKAA 1M7TA 3LFLA 1EGRA 4BVYA 3US3A 3KH9A 3W8SA 4MPGA 3TJJA 4BL7A 4BVXA 3EU3A 2PPTA 4OFNA 5DQYA 4POMA 5F8BA 4MJCA 4K2DA 2ZCTA 2M72A 2RM5A 4ECBA 4ACSA 4HJ2A 4L5LA 5EL8A 4J56E 2DMMA 3TJFA 3ZTLA 5ECMB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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