1XVWA

Crystal structure of ahpe from mycobacterium tuberculosis, a 1-cys peroxiredoxin
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
PRGSHMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Crystal Structure of AhpE from Mycobacterium tuberculosis, a 1-Cys Peroxiredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein Rv2238c/MT2298
total genus 47
structure length 157
sequence length 158
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xvwA00
4KH7A 1ZGNA 3FYGA 4E8EA 4MK3A 5G1LA 2MMZA 1AQWA 4V2MA 4TR1B 3LEFA 4LL1B 1EOGA 1JLWA 4GQFA 1YQ1A 5JCGA 2A2RA 3S9FA 1TRWA 1Z5YE 3I6AA 4HZ4A 3F3RA 4GLTA 2H6YA 3DD3A 4G9HA 4HUAA 5IMVA 5INYA 2X8HA 4X1UA 3ME8A 3LQ7A 4AGSA 1AXDA 2N5BA 2TRCP 4POLA 1VF2A 4BWSA 2H75A 3IXRA 4NHWA 3I9V2 2DIZA 1V98A 4ILFA 3FZ4A 3WGDA 5HR3A 4OFNA 1EGRA 2OACA 4MPFA 2LKUA 1ERVA 3M9JA 8GSSA 4K7NA 4TXOB 4GQCA 4ZILA 1SKSB 5C04A 2R3XA 5ECKB 3K8NA 1EOHA 2C80A 4IJ3A 1YF1A 5J4UA 5ENUA 4L5OA 1ZCPA 1FO5A 2IN3A 2GLRA 3RPPA 1WJKA 4HS1A 3J7Yb 2OE0A 4EDZA 2V6KA 2V1MA 4NXIA 2YPMA 4F0CA 1X9WB 1YEPA 5B6MA 1TW9A 18GSA 1T3BA 3UEMA 1BYEA 2DJ1A 4TKYA 4Q5QA 2H1BA 1A8LA 2G0FA 1W89A 2KLXA 4E8HA 1O73A 4ZB8A 5A4VA 3GRXA 4ZXGA 3TJBA 1TJDA 3F63A 1SYRA 4OO5A 1JZOA 4TR1A 2RM5A 2F9SA 12GSA 5H5SA 1A8YA 3JCML 5HR1A 2NVLA 1EGOA 4GXZA 1XOAA 5F07A 1NM3A 1F3BA 4WBJA 1AQXA 2CA8A 4RQXA 1ERUA 5D93A 5HFKA 3IK7A 4EF0A 2PU9C 2KHPA 1TDIA 4OWYA 3FZ5A 1V40A 1A24A 4KGIA 2CVDA 3LG6A 4TXOA 1EEMA 2H0IA 5A5KA 2PUKC 3APQA 3IK9A 1Y6EA 1Z7PA 3TCOA 4Q5RA 5A4WA 4AF2A 3P2AA 3HD5A 3ISOA 4MMMA 2DJJA 1SD8A 5J5NA 17GSA 3E0UA 3N5OA 1O8WA 1Z6MA 5H5RA 3HXSA 2OJLA 2JACA 3PINA 3TDGA 1SKWB 4DSQA 3KMNA 1FW1A 3DWVA 3IRAA 1M2DA 3DKSA 3D4TA 5ABRA 4KE3A 1V58A 2E0QA 4WF4A 4JR6A 3G7JA 1F6MC 3QD9A 4KCAA 4MZCA 2GTUA 4RI7A 1JLVA 1UC7A 2DC5A 3GKXA 4MJBA 4N0VA 4POMA 1EP8A 3EVIA 5DBQA 1TRSA 3FHKA 2HFDA 1K0DA 3L9VA 3ZITA 4YH2A 2H74A 4LMWA 3GH6A 1K0OA 2JL4A 2B5EA 2AB6A 3KMOA 4WXTA 6GSTA 1XBSA 2AYTA 3M3MA 4MABA 1O7UA 1M0UA 4L5LA 4QL7A 1A0FA 2H1DA 1SYXA 3IDVA 4G19A 2L6CA 1GULA 3H4KA 2FGXA 2VL9A 3KH7A 2F3MA 1JFUA 3UVHA 3TGZA 4N30A 3ZMKA 4ZBAA 1GSYA 4Q5NA 4PQHA 2LTKA 2FWFA 3LSZA 3SBCA 1PKWA 4LA1A 1B4QA 2B3SA 3FZAA 4MP4A 1K0CA 3E9JB 2GDRA 5KEJA 4KNDA 3RPNA 5B8AA 4ZB6A 1JHBA 1XW9A 2H1GA 4ACSA 4TOPA 2LNTA 1NHYA 4V1Ap 3QAWA 2VCXA 1URMA 2VL3A 1B8XA 3VFIA 1T4ZA 2B6MA 4IW9A 5IOWA 5ECSA 2R2JA 5ECLB 3RHBA 5FWGA 3FKFA 2OBIA 3FR9A 5GSTA 1F3AA 4PUAA 1Q4JA 5CYYA 3F8UA 2LV3A 1ON4A 1OE8A 3GKNA 3QDNA 3IHQA 3WYWA 3TJKA 1SK2A 1TP9A 2YWIA 2JZSA 3APSA 4ECBA 4EXJA 4XS6A 3M8NA 1T7PB 1Z6NA 3F4SA 1QK8A 1OYJA 1USBA 3CSHA 4GWRA 2VLTA 1A2MA 2PBJA 1SJIA 3A3TA 3EC3A 1CQHA 3NOFA 4I6XA 5AGYA 3GNJA 4KSOA 2NBSA 3ZRDA 2O89A 4FH8A 2M72A 2LSTA 1MDIA 1ZOFA 1X5CA 2P31A 2H1AA 2YOIA 3APOA 5CRDA 2GZPA 2H66A 2IMEA 3TKQA 3CMIA 3GA4A 2LEGA 1R7HA 5DJMA 4IKHA 2CX3A 2IMDA 4K0GA 5DALB 5ECQB 3IE3A 3MSZA 3HVVA 2K9FA 2P5QA 1AC1A 1K0MA 3ZVJD 5FHIA 4TRXA 3W6GA 5J3RA 2G2QA 4PX1A 1JZWA 2H76A 2PGTA 3DRNA 3QAVA 2TIRA 3TKRA 1E6BA 13GSA 3LYKA 3AY8A 3RHCA 1YKAA 4LMVA 4O32A 3NIVA 2C0EA 3HCZA 2HZFA 2L59A 2WRTA 4KW6A 3WT2A 1RW1A 3PR8A 3HJPA 3QAGA 2HI7A 1PKZA 5JCUA 3QCPA 3W8SA 1WRYA 3M0FA 1ML6A 1WE0A 3FR6A 1F9MA 1H4OA 3BOAA 1ZYQB 3ZYWA 2KOKA 3DVWA 1OVNA 1BJXA 3EU3A 4PGTA 4MH2A 1J9BA 4YQMA 3FK8A 4DSSB 2R6KA 5IO2A 1GSFA 1GLPA 1THXA 3F6FA 2HT9A 16GSA 3H8QA 4WR5A 1DUGA 2O85A 3IAM2 1A2LA 3KH9A 2YWMA 4K9ZA 3QFAC 2DJ2A 4IVFA 1B9XC 1M2AA 4AJ7A 3CRUA 3Q19A 5DCHA 4J56E 3LFLA 2PN8A 1S3AA 2C8UA 4WKWA 2A2SA 6GSVA 3O6TA 3C8EA 1OE7A 4IELA 5J9BA 1JZDA 5CRWA 5IM9A 4ZL7A 4EUYA 4N0ZA 5KN3A 1GSUA 3F9UA 4GRFA 2GSTA 5EL8A 3L4NA 5DALA 1G6WA 2GZYA 3LYPA 2OA7A 3G7YA 2JSYA 4P3YB 4QQ7A 5B8BA 1ABAA 1MD3A 2L5LA 2RM6A 3SWLA 1E2YA 2LQQA 2M46A 1H75A 2VD1A 7GSSA 4WEYA 3IR4A 2R4VA 5C00A 3TB2A 1LBKA 3D5JA 4K6XA 1Z9HA 3FR3A 2B5XA 3IA1A 1W4VA 2GQLA 3EMXA 1THOA 4YQVA 2FA4A 5G30A 3DEXA 3KD0A 2R37A 5ECNB 2BJXA 4V1Ag 4L0UA 1EP7A 1HNCA 2J23A 2C0FA 2CAIA 1TTZA 1WMJA 1WPIA 4EO3A 1B9YC 4LLRA 3TRQA 4IHUA 2AAWA 2IJYA 2VLVA 5GSSA 4ECJA 4DSSA 5GAND 4XTSA 2H70A 3ME7A 2IMKA 3CTGA 22GSA 3U6VA 4FYBA 2X8CA 5A4UA 1XWCA 4WR4A 2IMIA 1G7EA 3VURA 4TN8A 5AIXA 4OCFA 4PQIA 3ERGA 2LJKA 4IP6A 5DCGA 2ZUPA 1GSEA 3G7IA 3QFBC 1MD4A 3LXZA 5COHA 3MNGA 2C3NA 3GUSA 4MJAA 1SK0A 2HE3A 4MPGA 5ID2B 1QMVA 5J9CA 1T8EB 3C73A 1ZL9A 3Q74A 1GL8A 3A2XA 1TXXA 5IMFA 1SL1B 3CSIA 4NWYA 3M1GA 2P0GA 1FVKA 4QL9A 3TJGA 4OCEA 4K0NA 3UAPA 4XS4B 2RUEA 3TKSE 1TRUA 1ZYEA 3D21A 4K1FA 5EVOA 1PMTA 3KTBA 2FWHA 4YAVA 4TXVA 5G5EA 5ECHB 2IPAA 2YWOA 5KN2A 3RDWA 4JU5A 2IFQB 3Q6OA 1V2AA 4GSTA 1PD21 1HNAA 3F3QA 1KEBA 3ZTLA 3IBHA 5L71A 1DE2A 4AJ8A 1OC8A 4ZL9A 1Z7RA 4AJ6A 5IQYA 3O3TA 2VD0A 3WGXA 1ZMAA 2GT5A 4MZBA 2YCDA 1GLQA 1A2JA 2DMMA 3GV1A 2ON5A 1XPVA 1MDJA 5ECMB 2H6XA 2BTOT 2H01A 2A4VA 4BWQA 2H73A 5ECPB 4DVCA 2DIYA 1R4WA 4KB3A 1YY7A 3QMXA 4JE1A 2WB9A 5G2ZA 2C3QA 1TRVA 4ZIJA 4HU9A 2JZTA 2YANA 4TR4A 4IQ1A 4N10A 3VWXA 1FB0A 1EZKA 2V2GA 4WBRD 4NV5A 2NTOA 1U88A 3IV4A 1GNWA 1GSSA 1XW6A 1GRXA 4MJEA 4JR4A 5IMCA 1VF3A 3TRPA 1RK4A 3HVXA 2TRXA 5CO3A 2PVQA 3NZNA 2JADA 1O6JA 1PN9A 4J57E 3VLNA 3TRXA 5ID2A 4Z7XA 1WOUA 4XHMA 2QKEA 5CAXA 2FWGA 2C0GA 4F82A 2F51A 3RBTA 2QSIA 1GSDA 1TK0B 1XWAA 2WDUA 2HRNA 4IN0A 2K18A 2C1YA 3FW2A 1F2EA 4IBPA 5HQPA 3KXOA 6GSUA 4XS4A 2I4AA 5LNKe 4MCUA 3F0IA 1PL1A 1X5EA 2HRFA 2CX4A 1A0RP 1VF1A 2H72A 1SD9A 2FUG2 2IFQA 4FIWA 2M80A 4ML1A 3TKSA 4NV2A 3UL3A 5J41A 1X5DA 2GSSA 1RQMA 3TJFA 1CQGA 2DSAA 2H0HA 1NHOA 5IOXA 3GYKA 2XPDA 2GQMA 3L78A 1GUKA 2DBCA 3FRCA 1DE1A 1FG4A 4MF7A 1TOFA 5IO0A 4EKZA 1YKCA 2GQKA 2E7PA 4PUFC 4IJIA 3CSJA 4L0WA 2I3YA 3TKSC 2VM1A 3EMPA 3GKKA 4N11A 2MZCA 3A2WA 2YN1A 1PL2A 2JSZA 5DDLA 1XXUA 5F8BA 3E3EA 3QPMA 4MF5A 3LWAA 5G31A 2C4JA 1BQ7A 2XHFA 1FB6A 2I1UA 3W8JA 1GP1A 2V6OA 3VI5A 1SJZA 1MTCA 1A23A 2H30A 3BJ5A 1N8JA 3BCIA 2FHEA 5ECRB 4GCIA 2L5OA 2HNLA 5DJLA 2PERA 3IAS2 2EIRA 4CW9A 3D4MA 3ZFLA 3UOMA 2VAFA 2KP1A 1NW2A 4V2NA 1Z3EA 1U3AA 2IMFA 3DMLA 5E4WA 3J7Yk 5LD0A 2O8VB 3DGQA 1X9SB 1T4YA 3CBUA 1UN2A 2NDOA 2O7KA 1GTAA 4X0XA 3KTLA 4OMVA 5IMDA 3G9BA 4ZB9A 1B4PA 1J0FA 5GZZB 2VCWA 1EEJA 5CRGA 4EDYA 3KIJA 4TR3A 4I2UA 3H1NA 3IC4A 3Q18A 3CTFA 1QFNA 2PVOC 5HR2A 1AUCA 2JZRA 1GH2A 2E2GA 2H71A 2FA8A 5D96A 3TOUA 1M99A 2N5AA 3EE2A 2FY6A 4ZL8A 1UVZA 4EVMA 4MLYA 3VWWA 2KP2A 1YF0A 3UIWA 2JU5A 3GH9A 3PGTA 2ZCTA 4D73B 1M9AA 3H79A 3VK9A 4BPYA 5DAKB 3IOSA 2WZ9A 4I2TA 3GFKA 2CQ9A 3F4RA 5IPGA 1XVWA 1GSQA 2F8FA 3TJJA 2HXKA 1G7OA 3HA9A 3C71A 5DQSA 3ZZXA 1ST9A 1C72A 3IPZA 11GSA 3EU4A 1XCCA 3EINA 2HZEB 3A2VA 4HEA2 2VCVA 4HOJA 2EIQA 3EYTA 5KN1A 3I69A 1R5PA 5IPHA 2CZ3A 2FNOA 3QOUA 2LRTA 4I8BA 1KNGA 1VRSD 3KEBA 1XWKA 2NPBA 3GSTA 5JWOB 4WF5A 4TW5A 3ZVJA 3KCMA 2X99A 2GZZA 3TKPA 2WS2A 2H0GA 4NHZA 3HY2A 4KDYA 1OAZA 4K2DA 1M7TA 2DJ3A 4K7IA 2LJAA 3D0ZA 1DBYA 6GSXA 4LL4B 4K8MA 5ECOB 3HZ4A 2YWNA 4YQUA 2OADA 3DXBA 20GSA 2XC2A 3ZMLA 1F37A 5HR0A 4MF6A 4OFTA 2AV4A 1G6YA 5ECIB 4PXOA 1SJ6A 3P7XA 4BVXA 3FZ9A 4NPBA 1X9MB 2VM2A 4EL1A 4FYCA 2L4CA 1TI1A 3P8WA 4TVEA 1VGLA 1HD2A 1WP0A 2CT6A 4IQAA 6GSSA 2OBKA 5D9WA 5H5QA 2AUVA 4D73A 4KUNA 1GWCA 1AIUA 5DAKA 3UMAA 3LGCA 2GS3A 4RUVA 2CV4A 6GSWA 4HJ2A 3FEUA 4KX4A 5GAPD 1TU7A 5AIVA 1TI3A 2WGRA 5F0GA 2LS5A 2AHEA 2VCZA 2HZEA 1QUWA 3GL3A 2IL3A 4GF0A 1AQVA 3KGKA 4O5RA 1FAAA 2XBIA 3US3A 2FLSA 2VCTA 1K0NA 4MZWA 1UA5A 3DVXA 5D9XA 1YZXA 4JZQA 2LJRA 2X8GA 3HJMA 4H86A 1QGVA 3GX0A 4IS0A 2YJ7A 2IWTA 1V9WA 3V1WA 1FOVA 3HHVA 4HQSA 5D9TA 1HQOA 1KBNA 4GSSA 5B6NA 2EC4A 4BL7A 1TKDB 1K0AA 2CAQA 2DJKA 2VIMA 4DSRA 1TK8B 4F9ZA 9GSSA 3ZIVA 4POBA 3HDCA 2MBTA 2MMOA 2MMNA 3CYNA 4K7OA 1PQNA 3TUEA 2IIYA 3FY7A 2L57A 5F06A 2H6ZA 2AJQB 1I5GA 3D22A 4YAPA 2CVBA 2B1KA 5DQYA 5G1KA 14GSA 3F4TA 2L4QA 2I9HA 3MAKA 4JEDA 1XW5A 4OD7A 5CNWA 2ES7A 4Q5FA 2H8LA 3GKMA 5IMAA 3GX8A 5FT3A 2GSRA 4IP1A 2R5GA 2RUFA 2K8VA 3HJOA 3ERFA 1K3YA 19GSA 4DEJA 4BVYA 2K6VA 1XWGA 3KJYA 3EWLA 2GSQA 3C7MA 3PH9A 3QR6A 2CVKA 4I5QA 5JWQB 3RAZA 4MH3A 3KZQA 4MA9A 4ULXA 5B7CA 1U87A 6GSYA 3ED3A 3A5WA 1K3OA 4FO5A 1M2BA 4HU7A 2VUPA 4F03A 5ELAA 1AAZA 3VPQA 3BD2A 5HFGA 1BAYA 2P5RA 3P90A 5CP1A 3KP8A 1SL0B 1XIYA 1Q98A 1TU8A 2HSHA 2B1LA 2YJHA 1N2AA 3HVSA 5KN0A 2WULA 1IYHA 2V41A 3UVTA 1TK5B 2V32A 2VO4A 2F8AA 1DSBA 2MBSA 1T00A 3C1SA 4PURA 1GUHA 1GNEA 2QGVA 1SL2B 3WGEA 4JRRA 2MMAA 2OE1A 1PA3A 2C3TA 2CZ2A 4KSMA 2PMTA 4I97A 4PQ1A 1BEDA 2YP6A 4MJCA 4XRDA 5CRHA 3O76A 4ZBBA 1PX6A 1PSQA 1S3DA 2VL2A 4EC0A 2YNXA 2O87A 2RIIA 3BCKA 4ID0A 2LRNA 2PPTA 4KAEA 2KUCA 1PX7A 4HZ2A 4X43A 1XWBA 1GTIA 3D6IA 2BMXA 1SK1A 4PNFA 2HSYA 2ON7A 5F05A 4G2EA 4G10A 2I81A 4CHSA 3HYPA 3UARA 4POKA 2PWJA 3VPTA 2FD3A 3DIEA 1IYIA 1V57A 1SU9A 3BBYA 2HYXA 2VL2C 2WCIA 4HJMA 3HKRA 5EPFA 4NAXA 4HDEA 1R5AA 1K3LA 4L8EA 2GVPA 2C0DA 1OC9B 1WIKA 1FHEA 1K0BA 2GGTA 1YJ6A 2REMA 1O85A 1EV4A 1U3IA 2YZUA 2MYGA 4GSNA 3LORA 3CRTA 4OFMA 10GSA 2Z9SA 1GTUA 4TR0A 1B48A 2DJ0A 3KM6A 3LXTA 3I43A 4NMUA 1PGTA 3CXGA 3GHAA 1FVJA 1LJRA 2D2ZA 1R26A 1GUMA 1EWXA 2WJUA 1M9BA 1X0RA 5EY6A 5D73A 3VWVA 4O92A 1ACVA 4RI6A 4GTUA 2OE3A 4XCSA 2RLIA 2L6DA 1WWJA 3GURA 3ZFBA 4BA7A 1HNBA 5DVBA 3EURA 3GMFA 1QXHA 1XOBA 1O8XA 4RQRA 2B7JA 3OR5A 1BX9A 2YV9A 2XBQA 2K8SA 4HI7A 3GIXA 3GTUB 2EIOA 2XPEA 2H19A 2HLSA 4IGJA 3VWUA 1ERTA 2FCHA 1KTEA 4ECIA 1T1VA 1U6TA 2FWEA 2DLXA 3UJ1A 1J08A 1HYUA 5IMZA 3UBKA 4KDUA 2VLUA 2YV7A 3MDKA 1MDKA 3C1RA 3ZREA 2X64A 4F0BA 1OC3A 1MEKA 5IIZA 4ZBDA 2B5YA 5CREA 3N9JA 5E59A 2LQOA 4O7HA 2N5FA 5D9VA 3MWHA 1OC9A 1JZRA 3L0HA 2WFCA 4KCEA 3TOTA 3U5RE 4FYUA 1S3CA 5ELGA 3L9UA 4KA0A 5AN1A 3WD6A 1BG5A 1NSWA 1OKTA 1XZOA 5AISA 1OKDA 2VCQA 1LU4A 2GT6A 4XIHA 4KDXA 4ML6A 3L9SA 4XRAA 3GN3A 3GL5A 5LCZA 5HFIA 1ZZYA 1AW9A 1PRXA 1YEXA 4XS1A 2YZHA 4F2IA 2DMLA 2OKAA 3GSSA 4J2FA 1GTBA 2VOCA 2LNSA 1Y25A 3LJRA 5JWRB 3VI7A 4EE0A 2ALBA 3H93A 3GTUA 4CDOA 3DYRA 2LUSA 1XFLA 1G0TA 5G5FA 3UBLA 2J9HA 1EV9A 3R2QA 4WETA 4PNGA 4ISDA 4V2LA 2B7KA 1XVQA 2ZNMA 1O81A 1VF4A 3ZL5A 1SKRB 1QQ2A 4MDCA 1SENA 3M9KA 3ZIJA 5JCWA 3ERWA 1YDKA 1ERWA 2QC7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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