1XVWA

Crystal structure of ahpe from mycobacterium tuberculosis, a 1-cys peroxiredoxin
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
PRGSHMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Hypothetical protein Rv2238c/MT2298
publication title Crystal Structure of AhpE from Mycobacterium tuberculosis, a 1-Cys Peroxiredoxin
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 47
structure length 157
sequence length 158
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xvwA00
3KEBA 1H75A 1YDKA 3C8EA 3A2XA 2V6KA 1TI1A 5CRDA 5IO2A 1EOHA 4HQZA 1ST9A 2DIZA 2QSIA 1BX9A 2MBSA 3MAKA 3E9JB 3WYWA 2GT6A 3ZYWA 3PGTA 1HD2A 5DBQA 3TUEA 3TRXA 2CVDA 2IJYA 2LJKA 1XW9A 3CMIA 2P31A 1YKAA 5AIVA 1EV4A 1OC8A 4D73B 1TOFA 1QXHA 1E2YA 2DJ3A 4TOPA 1I5GA 2O87A 2ALBA 1DE1A 3HCZA 1Z7PA 3GA4A 1DE2A 2MMAA 1TP9A 2C8UA 2DMMA 2TRCP 2WZ9A 4IW9A 3D21A 2PBJA 3V1WA 1FOVA 3FR9A 3UJ1A 5CO3A 2M72A 2IN3A 2P5RA 1O85A 1GULA 3D6IA 4KSOA 2MBTA 1XVWA 3P7XA 2NVLA 3CTGA 5EL8A 2TIRA 3TKSE 3LSZA 2JZSA 3HVSA 2CZ2A 3QAWA 1GTAA 1TRSA 2OJLA 5A5KA 1OC9B 2H0HA 1JZWA 2FLSA 1O8WA 4IHUA 2YPMA 3GKNA 3IV4A 3ZLPA 4PURA 2WB9A 3HKRA 3GYKA 2L5LA 3EWLA 5IMDA 3FZ4A 2HZFA 2FY6A 1V58A 2CVKA 3ERWA 4GSTA 4GXZA 4TVEA 1G6WA 2H0IA 5IPHA 3LYKA 1O73A 4K0GA 5ECOB 5A4WA 1DSBA 2FHEA 2VCVA 4OMVA 2VL9A 1B9YC 3A2WA 1TK5B 1A0FA 3KMOA 1GLQA 3W8JA 5HQPA 2FWHA 2J9HA 2DIYA 2JU5A 1T3BA 1ERTA 3HVVA 2LQQA 5GAND 4L5OA 4FO5A 3I9V2 3U5RE 4MMMA 3QAVA 1TK8B 2B6MA 2GSQA 1GSUA 2EIOA 2HYXA 1TU7A 5DAKA 5B6MA 3L9SA 4IN0A 1M2BA 3TJFA 7GSSA 1GUKA 4AJ6A 2DSAA 3DVXA 3M3MA 3HA9A 3EMXA 2LRCA 3LFLA 2V6OA 3H8QA 2C3QA 3IAM2 5B8BA 1YF1A 1MDJA 1ZYEA 3BCKA 1FVKA 2I3YA 4ISDA 1T8EB 3RAZA 3A2VA 3UIWA 4WEYA 1K3YA 4JEDA 5H5QA 1RW1A 4AJ7A 3IK7A 5D9VA 1THXA 2V1MA 3NIVA 2H6YA 2F8FA 2H19A 3N5OA 1TKDB 1LJRA 3QR6A 3HJPA 2YWIA 3UAPA 1VRSD 2FUG2 3GKXA 5DQYA 3MDKA 2YCDA 2LSTA 2OE3A 2LUSA 2OBKA 1G7EA 4ID0A 3E3EA 1SD9A 2VD0A 4HI7A 1SL1B 3MWHA 4FH8A 1VF1A 5HR1A 3C1RA 1NM3A 4KDYA 1ACVA 3D22A 2GSRA 4HZ2A 3KXOA 2C0DA 3LJRA 3FKFA 1UC7A 4LL4B 1YY7A 1M2AA 3KP9A 3VFIA 3IHQA 1X9SB 3O6TA 1K3OA 3TKPA 4PX1A 3NZNA 2IFQA 2XBIA 2OADA 3TKSA 1B4PA 4I2TA 3CSIA 4EO3A 1F37A 1HYUA 4MF7A 4H86A 3C73A 17GSA 1NHOA 3DVWA 3HY2A 3ZZXA 4DEJA 4MLYA 2H74A 1OKTA 3L78A 2I4AA 2OACA 3CTFA 3F8UA 2JADA 3BJ5A 1GSYA 3S9FA 2BMXA 1T4ZA 2WRTA 1FO5A 5DJLA 3DKSA 1J9BA 5GSSA 2EC4A 5KN1A 1DUGA 4F03A 3DD3A 4IJ3A 4KCEA 4F2IA 1O8XA 1V40A 1IYIA 3QPMA 3RDWA 2VCTA 4JE1A 2RLIA 4JZQA 4KDXA 3R2QA 4ECJA 2CZ3A 5IMVA 3HYPA 3LGCA 4NHWA 4K0NA 2VL3A 4HOJA 1SKSB 2JACA 1B8XA 1GSDA 2PVOC 1E6BA 1AC1A 3QAGA 2L4CA 4OFTA 4N0ZA 3IR4A 4PGTA 2F9SA 1Z6MA 4EUYA 3LYPA 3LG6A 5ECNB 4ZL9A 5D93A 2BTOT 4KSMA 4WF4A 2NDOA 2AAWA 3US3A 4XTSA 1PD21 1WMJA 6GSTA 1XWCA 4HU9A 2HRNA 4IJIA 3UBLA 3EE2A 4MPGA 4ACSA 2GQMA 1S3CA 2R6KA 2HZEA 4BL7A 3LWAA 4KCAA 2H71A 3IK9A 5G1LA 5CREA 4MF5A 1QMVA 3KJYA 1PX7A 2ZNMA 2OA7A 2I1UA 3VURA 3GTUA 2GT5A 1F9MA 1K0OA 1IYHA 2H72A 3UVTA 3ZIVA 2DJKA 3K8NA 2WCIA 1B48A 1Y25A 5DJMA 3ED3A 5HR0A 3M0FA 5A4VA 1GSFA 3H1NA 4GLTA 1KEBA 2B1KA 11GSA 4EDZA 3GL5A 2C3TA 2A2SA 2LRNA 5D8IA 2AV4A 1HNBA 2VCZA 2VD1A 3G7IA 3TJJA 2CV4A 5ENUA 4LA1A 3GN3A 4JRRA 1U3IA 1H4OA 4IP6A 4MZWA 4MA9A 2E2MA 4IQ1A 5COHA 1PL2A 3ME7A 1GP1A 5G1KA 3TDGA 2VAFA 3QFAC 5IMCA 1WE0A 1B4QA 5CRGA 4TR3A 3KTLA 3ZITA 3Q6OA 1MD4A 2WJUA 1SKWB 4ECIA 3WGEA 1XXUA 2IL3A 4TN8A 4CDOA 1J0FA 4NWYA 5E4WA 1VF2A 3F63A 1K0BA 1GUMA 4TR4A 2B1LA 2X64A 3I43A 1KNGA 1AAZA 3GKMA 3WD6A 19GSA 2DJ0A 6GSWA 1QK8A 3Q74A 5IMAA 1GSEA 3VI7A 2H8LA 4D73A 2P0GA 1GRXA 18GSA 2C0GA 3D4MA 1JLVA 3G7YA 1YJ6A 4TR1B 3DRNA 3G9BA 3FYGA 3EMPA 1A0RP 4WETA 3TKRA 1X5DA 4IBPA 4ZILA 5IM9A 3KTBA 2PU9C 4HJ2A 1M9AA 2XBQA 4KB3A 1EGRA 3HZ8A 4K8MA 1FAAA 3GSTA 3VPTA 1TI3A 2H66A 1Z3EA 2YV9A 4MCUA 1A2JA 4FYUA 4MZCA 3WT1A 3O3TA 5G5FA 3LORA 3GH6A 4TXOB 2H6ZA 4TKYA 4XRAA 4BA7A 3KM6A 1FW1A 3HJMA 1XZOA 1OC9A 1T00A 4I97A 3FHKA 4OO4A 2M46A 2C0FA 2ZCTA 2V32A 4ZL8A 1TRVA 4JBBA 2YANA 3VWWA 4LMWA 3A5WA 1WWJA 4BVYA 4O7HA 1FB6A 1T7PB 3SWLA 1SYXA 2CVBA 4HU7A 2QGVA 3Q18A 5GSTA 4K6XA 1PX6A 3MNGA 4XS1A 3TJGA 1PSQA 1LU4A 2L5OA 4EL1A 3D5JA 5ECKB 3GFKA 3N9JA 1PGTA 1XIYA 4GF0A 1SJZA 5KN2A 1F2EA 1XWBA 4IS0A 1YEPA 4LLRA 5JWRB 4ZBBA 4WXTA 5DDLA 3CRUA 4YAPA 5D9XA 4NAXA 2H76A 1O81A 3LXZA 4V2MA 2H1BA 1PKZA 5G5EA 2YWOA 4EC0A 5IMZA 1GTUA 4IKHA 1TXXA 2IWTA 2DJ2A 6GSSA 1A23A 5CNWA 4AF2A 3IXRA 4XHMA 4K9ZA 5F06A 3APSA 2GVPA 3PR8A 3HHVA 4IP1A 2M80A 5JCWA 2HI7A 2O8VB 3D4TA 4EDYA 2JZTA 1OAZA 4G10A 3L4NA 3GUSA 3F9UA 1A2MA 5G31A 2LS5A 3IC4A 2WGRA 1B9XC 2KLXA 3DMLA 5HR3A 3D0ZA 2HT9A 3KZQA 5KN3A 3LXTA 4WKWA 1V57A 4WR4A 2LV3A 2REMA 2F8AA 4MK3A 3G7JA 1PQNA 1U87A 2MMNA 3IA1A 1A8LA 1AQVA 5CP1A 2OKAA 1U3AA 5ECSA 1SENA 4PNFA 2GQKA 4CW9A 2H01A 5B6NA 4N0VA 2OE0A 1GSQA 1EEMA 2I81A 4AJ8A 3CSHA 2LJRA 2GZZA 1AIUA 2VM2A 2GLRA 4KAEA 4ZB6A 3F3RA 2PPTA 1TRUA 3RPPA 3GL3A 2VUPA 3F3QA 2H75A 2H1GA 1GNEA 1ZL9A 1GNWA 1OYJA 3CSJA 2KP1A 2R37A 2X8HA 4DSSB 4FYBA 3MSZA 2H1AA 2GSTA 5F8BA 4X1UA 1FG4A 1TTZA 4AGSA 3SBCA 3FZ5A 2MZCA 5JCGA 2ON5A 2R5GA 3ZREA 4ZXGA 3VWUA 2H6XA 3DGQA 2MMZA 5KEJA 1EZKA 3EC3A 3EU4A 1GTIA 1MTCA 4XS4B 3I6AA 2EIQA 1W4VA 1T4YA 1MD3A 2RM6A 4MF6A 4OO5A 4XCSA 5ECIB 3W6GA 4OFNA 4POKA 3F4TA 1NW2A 4RUVA 4YQMA 1DBYA 1WIKA 3KMNA 2HE3A 2K9FA 1U88A 1G6YA 2CQ9A 3AY8A 4G2EA 2YWNA 1Q98A 2GZPA 1EEJA 1O6JA 2F3MA 1SK2A 5DQSA 4ZL7A 1KTEA 2LTKA 3F6FA 2WDUA 4Q5RA 2H1DA 3VWVA 5DALB 4ZBDA 1SD8A 1CQGA 1AW9A 22GSA 3VPQA 4EKZA 2VIMA 1S3AA 2VL2C 4HQSA 3QMXA 3FY7A 4EF0A 4IELA 13GSA 5J5NA 2P5QA 4NPBA 4OCFA 1VGLA 1GTBA 4E8EA 3PH9A 4OWYA 2YNXA 5B7CA 1ZGNA 1EV9A 2IMKA 3UOMA 3ERGA 2BJXA 2J23A 4KE3A 2VM1A 1RK4A 3TKQA 1PMTA 3O76A 3HJOA 1ILOA 2WULA 5JWOB 2G2QA 3L0HA 3BBYA 2KUCA 1T1VA 2E0QA 1MDKA 3QD9A 1AQXA 1VF3A 4PNGA 3ZL5A 2HNLA 1EP7A 2H30A 1M9BA 4QQ7A 6GSUA 4MJEA 3P2AA 9GSSA 4P3YB 3C71A 1R7HA 1N8JA 4Z7XA 4L0UA 2AB6A 3KCMA 2C3NA 5LCZA 4HEA2 4L5LA 1KBNA 4POMA 4BWSA 5ID2B 4K7IA 4WF5A 3U6VA 4NV2A 5C04A 2HSHA 5FT3A 2FNOA 5H5SA 2HLSA 4ZBAA 1EOGA 12GSA 3OR5A 1X9MB 4GCIA 5LD0A 3P90A 1WOUA 2I9HA 1USBA 3IE3A 1M0UA 4RQXA 5HFKA 3GMFA 1BG5A 3EINA 3GSSA 5DVBA 2GTUA 3W8SA 2AYTA 1ML6A 2YOIA 4BPYA 4POBA 1ZZYA 3LQ7A 4NHZA 3VWXA 3EU3A 3CXGA 4ZIJA 5DCGA 1S3DA 1UN2A 2RM5A 3VI5A 6GSVA 4POLA 3LEFA 4ML1A 3GKKA 3I69A 1YEXA 2DMLA 2PN8A 4IVFA 2FCHA 3ZMKA 14GSA 1R4WA 2L59A 2YV7A 4YQVA 3FW2A 3GX8A 3BD2A 3UVHA 5C00A 10GSA 1ERVA 4LMVA 3H93A 2CT6A 1M2DA 4TR1A 5AN1A 4KUNA 1QQ2A 2VLTA 3F4SA 4ML6A 4JU5A 1XVQA 2B5EA 2D2ZA 3HXSA 1FB0A 3KP8A 3GV1A 4F9ZA 4DVCA 4GTUA 5B8AA 5D96A 1K0AA 3UL3A 4GSSA 5ECMB 4L8EA 4HDEA 4GQFA 5J4UA 2R2JA 4OCEA 2K18A 1M7TA 4ECCA 2GDRA 5IQYA 2MYGA 4ZB8A 2RUEA 4WBRD 3FR6A 4O5RA 3TCOA 4GRFA 4MH3A 4Q5QA 4TXOA 4CHSA 3H79A 4TRXA 5ECPB 2H0GA 1TRWA 2IMFA 1JZDA 5GZZB 5J9CA 3BCIA 2C0EA 4NV5A 1K0DA 3TJBA 4MPFA 4TXVA 2VL2A 1WJKA 5F05A 1K3LA 3ZIJA 5ECLB 4KH7A 1TW9A 2LNTA 4RI7A 5INYA 2K8VA 2L4QA 3IPZA 3F0IA 5ELAA 2IPAA 1K0CA 2QKEA 1GSSA 1URMA 1YZXA 1PL1A 5AIXA 4Q5NA 4X0XA 4MJBA 1XW5A 5HR2A 2C4JA 1TU8A 1X5CA 4PUAA 1A2LA 5ELGA 1OVNA 4O32A 2F51A 5JCUA 2KP2A 2ON7A 3M1GA 2XHFA 2X8CA 3C1SA 2NPBA 3L9UA 3EURA 4KNDA 2VO4A 2O85A 3FK8A 5G2ZA 1SJIA 1I9DA 1EWXA 3KH9A 2RUFA 1N2AA 2CX4A 3APQA 4V2NA 1PN9A 4G9HA 3TKSC 3DXBA 4Q5FA 4F82A 1AXDA 3EVIA 2N5BA 1PRXA 4F0CA 1G7OA 2N5FA 4K1FA 3HD5A 3APOA 5AISA 1XWAA 1V2AA 4ULXA 5IIZA 3J7Yk 4YAVA 4DSQA 2B7JA 4MJAA 5IOXA 2R4VA 1TJDA 1PKWA 2JL4A 2YJ7A 3TRPA 1ZOFA 1X0RA 4DSRA 1ERUA 3IDVA 1GH2A 2HXKA 1SL2B 4MZBA 1XCCA 3RHCA 5CYYA 1GL8A 2OE1A 2V41A 4N10A 3ZVJD 5FHIA 4HJMA 1R5AA 4YH2A 3KH7A 4J56E 4RQRA 1ABAA 4G19A 1Q4JA 2JZRA 4MDCA 4TW5A 1XPVA 1SL0B 2CA8A 3M9JA 4GQCA 2VCXA 2L57A 4FYCA 3NOFA 2H70A 5IPGA 3ZVJA 2GQLA 2PGTA 2VLVA 1EP8A 2FA8A 2FA4A 3WGXA 4IGJA 1XBSA 4OFMA 1WPIA 3F4RA 3GURA 2IMEA 2PUKC 1ZYQB 5D9TA 2GZYA 1SU9A 2A2RA 4NXIA 3E0UA 1LBKA 4QL7A 2YZUA 1TK0B 3RBTA 1K0NA 1VF4A 4DSSA 3IAS2 2FD3A 3QDNA 4EXJA 4MP4A 3GIXA 1U6TA 5JWQB 1XOBA 1F3AA 2RIIA 2B5XA 5J41A 2FGXA 2HRFA 2KHPA 3QOUA 4KW6A 4GSNA 3FZAA 5EPFA 3HVXA 1V98A 3ISOA 2XC2A 5J3RA 3P8WA 5F0GA 4L0WA 2O7KA 4XS4A 3M8NA 2EIRA 4GWRA 2VLUA 2LKUA 4KDUA 5HFGA 4RI6A 5G30A 1O7UA 3TOUA 1F3BA 2O89A 2LNSA 1BYEA 2R3XA 3PINA 5F07A 5AGYA 2Z9SA 5CRHA 1GWCA 5HFIA 3VK9A 2DBCA 4PQ1A 20GSA 2TRXA 2XPEA 5IO0A 4E8HA 4PQHA 5DALA 1ON4A 2FWGA 5D9WA 1OE8A 2PERA 3KIJA 1WP0A 4EE0A 1GUHA 2E7PA 3DWVA 5DAKB 2WS2A 3ZFBA 2L6DA 1Z6NA 1AUCA 5J9BA 2N5AA 1QGVA 2YJHA 1JLWA 3FR3A 1MDIA 2GSSA 4F0BA 1EGOA 1HNAA 3ZFLA 1OKDA 2L6CA 4PQIA 3GRXA 2OBIA 2AUVA 2IMDA 2B3SA 4ZB9A 2K6VA 1YQ1A 2MMOA 2WFCA 4WR5A 1OC3A 3UEMA 3BOAA 1SK1A 3CBUA 4N11A 2KOKA 2XPDA 5LNKe 3DYRA 5ECRB 3TRQA 2B7KA 5CRWA 1XOAA 1PA3A 4V2LA 5FWGA 1RQMA 5ECHB 1Z7RA 4QL9A 5EY6A 3F6DA 2LEGA 1BEDA 5CAXA 4ILFA 3UARA 3IBHA 2YN1A 2YP6A 3ZRDA 1TDIA 1UVZA 2B5YA 4EVMA 4I8BA 5EVOA 2DJ1A 3TJKA 2HSYA 1XWGA 2CX3A 5E59A 3WGDA 3KGKA 2C80A 1QFNA 5ID2A 4MJCA 4OD7A 1UA5A 2IFQB 4PXOA 1JZOA 5KN0A 2A4VA 1X5EA 2GS3A 2PMTA 3GHAA 2QC7A 4PUFC 4XRDA 2NBSA 2ZUPA 1HNCA 16GSA 2PWJA 2LJAA 3CYNA 1G0TA 3FZ9A 1JHBA 4V1Ap 2FWEA 2DJJA 2YWMA 1Y6EA 3L9VA 2NTOA 2DC5A 4O92A 3VLNA 3UBKA 1Z5YE 1JFUA 1ZCPA 5D73A 3IRAA 1SK0A 1THOA 4MH2A 2LRTA 4XS6A 3M9KA 3QFBC 3C7MA 2PVQA 4BVXA 3GH9A 3RHBA 1YKCA 4HZ4A 3HZ4A 3IOSA 2VCWA 2FWFA 2VCQA 2CAQA 5L71A 1V9WA 1XWKA 1GLPA 5ABRA 3TOTA 5DCHA 4K7NA 3ZMLA 2C1YA 3JCML 4HUAA 3WT2A 4BWQA 1YF0A 4ECBA 4KX4A 2AJQB 1M99A 6GSYA 2VOCA 1A8YA 2G0FA 8GSSA 3QCPA 4XIHA 1A24A 4I5QA 3Q19A 3HDCA 3ERFA 4JR6A 4JR4A 4LL1B 4V1Ag 4KGIA 2JSYA 2JSZA 4K2DA 1SJ6A 3FEUA 2IIYA 1ZMAA 3CRTA 5IMFA 2E2GA 1NSWA 5A4UA 1SYRA 1BJXA 1AQWA 3DEXA 5IOWA 1CQHA 3J7Yb 2HZEB 3TB2A 2GGTA 4I6XA 4HS1A 2X99A 3UMAA 2X8GA 2ES7A 1C72A 4N30A 3RPNA 4I2UA 4FIWA 4IQAA 4WBJA 1Z9HA 3GTUB 3KD0A 3ZTLA 4K7OA 1X9WB 2H73A 3GNJA 2HFDA 4X43A 1J08A 1SKRB 1R26A 1FVJA 1MEKA 3GX0A 2DLXA 4TR0A 5ECQB 1XW6A 1ERWA 3FRCA 1XFLA 6GSXA 2LQOA 1QUWA 3A3TA 3EYTA 1FHEA 2K8SA 2V2GA 4NMUA 3TGZA 3H4KA 1JZRA 1K0MA 1WRYA 1HQOA 2YZHA 2IMIA 1W89A 3ME8A 1R5PA 1NHYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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