1AIU | Genus

Total Genus 34

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	34
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVNDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Electron transport
source organism	Homo sapiens
publication title	Human thioredoxin homodimers: regulation by pH, role of aspartate 60, and crystal structure of the aspartate 60 --> asparagine mutant. pubmed doi rcsb
molecule keywords	THIOREDOXIN
total genus	34
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	1997-04-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1aiuA00

2R4VA 13GSA 2C1YA 4F82A 1A8YA 2LJAA 3HVVA 4WXTA 2LS5A 3L9VA 2FWGA 5ECIB 2OBIA 1Q4JA 1K0NA 3MSZA 1UA5A 5GAND 5KN1A 4I2UA 3EVIA 4AF2A 4I2TA 1QFNA 3F4TA 4PQHA 1AUCA 1AIUA 3KIJA 2H6YA 4KUNA 3H1NA 4HDEA 3GURA 2R2JA 5IOWA 1SD9A 5HQPA 4GQFA 2LRCA 3QAGA 3ME8A 2LQQA 3IV4A 3TGZA 3GH9A 2X99A 4MF5A 1GSDA 5KN3A 2MMOA 5IPHA 2XHFA 1ZYEA 2KP1A 3GA4A 5J9CA 1TK8B 3GX0A 1WPIA 2X64A 2PGTA 4MF7A 4EDZA 1WMJA 1A23A 2VUPA 3JCML 2B5EA 2B1LA 4EF0A 2P5RA 1TXXA 5IMZA 1ZMAA 1GLQA 3VPQA 4V1Ag 2MMNA 4YQVA 2RIIA 2F9SA 2YNXA 3D4MA 5D9VA 3QMXA 2PVOC 4LA1A 1MEKA 2RLIA 1EZKA 2LQOA 3KMNA 1F6MC 1F2EA 2G2QA 2L59A 1O8WA 5AISA 3IK9A 2QKEA 4K0GA 3UARA 5HFGA 4N30A 3A5WA 3M1GA 2N5FA 5IMVA 4KSMA 4GTUA 4KDXA 3BCIA 3F6DA 2IWTA 1NM3A 5ECOB 2MYGA 4ECBA 2VLUA 1F9MA 5DDLA 1SKRB 1TRWA 1M0UA 5IMDA 3IC4A 4KCEA 1Z6MA 2F3MA 4EC0A 4AJ8A 3ZVJD 1TTZA 3ZMKA 3ISOA 2JU5A 1YJ6A 3D22A 1AQWA 3H8QA 1ZOFA 1SK0A 1PL1A 1EGRA 2HRFA 4OD7A 4QL9A 5J5NA 5IQYA 3KP8A 2LUSA 2VD1A 4IKHA 2V32A 2GLRA 2PU9C 3APOA 3QFBC 2VCVA 4MPGA 4L8EA 1YF0A 2YWNA 1GUMA 3ZREA 2I1UA 5ECHB 3D5JA 6GSVA 3D21A 1FAAA 4POBA 2YOIA 1F3BA 1XWGA 3IHQA 2CAIA 3FY7A 3U5RE 2FUG2 3F3RA 3MAKA 4LL4B 3KD0A 5HR1A 5G30A 1AW9A 2YCDA 1WRYA 2AUVA 4K1FA 3WT2A 2LJKA 3J7Yk 1G7EA 4KA0A 4XHMA 1TDIA 3Q74A 1R4WA 1ZGNA 2E0QA 3UL3A 5F06A 1ERUA 2N5BA 4XTSA 2HZFA 2HNLA 4HU9A 2RM5A 5CP1A 1XWCA 3L0HA 4GRFA 2HSYA 1X5EA 1DSBA 2KUCA 4JU5A 4IBPA 5JWRB 4NHZA 2AB6A 5EPFA 4PUAA 4Q5QA 4AJ7A 3KJYA 4KX4A 5IPGA 3UEMA 3L4NA 2FCHA 4RQXA 2GGTA 1SKSB 2GS3A 2B3SA 3O6TA 5ID2A 1N8JA 1JZWA 2IFQA 5ELGA 2J9HA 2VO4A 4EKZA 3M8NA 5ECSA 3TRPA 1GTUA 2YJ7A 1X9WB 3Q19A 4O5RA 2H1GA 1K0OA 3WD6A 3FK8A 5A4UA 5ECPB 1OC8A 1O8XA 2P31A 4YAPA 4X43A 2OE3A 1YQ1A 3ME7A 2OE0A 1TK5B 4GQCA 2X8CA 3FZAA 2LSTA 2BMXA 2WRTA 3P8WA 3UIWA 3EU4A 1M2DA 1I5GA 2V6OA 1NW2A 2YZUA 1AXDA 5HR2A 2GQMA 4RQRA 1OC9B 2IMFA 2H70A 2IIYA 2C3QA 2QGVA 1BG5A 3DD3A 20GSA 4ILFA 4KGIA 2E2MA 2C0EA 5INYA 2FHEA 5JCGA 2YV7A 5AIVA 2DBCA 4LLRA 2WS2A 1FOVA 5COHA 3GL3A 4D73B 2A4VA 1VF1A 4K9ZA 2I3YA 1DE1A 2CV4A 1JZOA 3GNJA 2FD3A 1USBA 4JRRA 3FZ4A 1OKDA 3CSIA 4POMA 3GTUB 3FR6A 1FHEA 2DMMA 4GLTA 2XBQA 3QPMA 1M7TA 3KZQA 4I6XA 4KAEA 4L5OA 6GSSA 3QFAC 1X5CA 4ISDA 3U6VA 1K0DA 3EE2A 4EO3A 3HHVA 1TK0B 3HVXA 3GSTA 1ZYQB 5GSSA 5CREA 3G7JA 3QD9A 2C0GA 4QL7A 3GKXA 2MMAA 1KBNA 3QDNA 1ML6A 2M80A 1GL8A 4MJCA 2YWMA 2L6CA 1O81A 2XC2A 3RPPA 2R37A 1T00A 2F8FA 4BWSA 1WIKA 5A4WA 1VF4A 1K3YA 5G1KA 2LEGA 2IMIA 4EUYA 2H66A 10GSA 1S3AA 1XW5A 2H73A 4BA7A 3I6AA 5GAPD 3E0UA 2NTOA 4NV5A 3KXOA 2IN3A 1Z9HA 1GWCA 2IMDA 4PNFA 4LMVA 3VFIA 3LYPA 1XBSA 2CVDA 4MPFA 3WYWA 3L78A 4NMUA 4F0CA 3N5OA 4FYBA 3CRTA 1XIYA 4X1UA 2N5AA 5ECNB 3M0FA 3M9JA 4IELA 4PURA 2TIRA 2GDRA 4P3YB 3UAPA 2RUEA 1BAYA 3ERWA 2PN8A 1U3IA 2I9HA 4DSSA 1XOAA 1GTAA 5IMCA 3PGTA 4OCFA 2WCIA 5IO0A 2B5XA 2PBJA 3R2QA 4JR4A 4XS4B 5IMFA 2CVKA 3PR8A 2H0HA 3VPTA 1ABAA 3KCMA 1MTCA 3FEUA 5F07A 3RBTA 1B4PA 4K7OA 1R5PA 2TRCP 4ZXGA 2C8UA 1A2MA 1EWXA 1RQMA 5D8IA 5G2ZA 4CW9A 3GL5A 1EEMA 1JZDA 3Q6OA 3WT1A 1SL2B 1MDKA 2FWHA 3PH9A 2JSZA 1V9WA 2K6VA 3GX8A 4ZL7A 3RAZA 4E8HA 1W4VA 1Z6NA 5C00A 3HVSA 2BTOT 1FB6A 1PA3A 3TJJA 2H74A 2DIYA 2D2ZA 3N9JA 2PERA 2WB9A 4KDUA 5E4WA 6GSXA 1PKWA 2VOCA 1GNEA 4NAXA 3ZLPA 3ZL5A 2DJ3A 4L0UA 1G6YA 1TRVA 2AJQB 3ERGA 5CRDA 4IVFA 3C1SA 3UOMA 5D93A 3TRXA 1GSUA 2VCQA 3AY8A 1DE2A 2ES7A 4JBBA 4TXOB 1QUWA 5KN0A 1FG4A 3I69A 4WR5A 4CDOA 1YKAA 9GSSA 3HYPA 3HA9A 3KTLA 2YWOA 3GKNA 4PGTA 2H0IA 5DJLA 4RI7A 1B9YC 1O7UA 3HZ4A 5CYYA 5D96A 2YWIA 4L0WA 1WWJA 4FYUA 1S3CA 1KTEA 1SJ6A 3S9FA 4HUAA 1GUHA 1UVZA 4X0XA 4AGSA 3CTFA 4FIWA 4MH3A 4MABA 2PWJA 4QQ7A 4MZBA 3M9KA 3C7MA 5DJMA 2JZTA 3DMLA 3RHBA 2H0GA 2KLXA 2EIOA 1R26A 3TJBA 2H72A 3LYKA 2C4JA 1YDKA 1N2AA 4N0VA 5DCHA 1B4QA 1V2AA 2YP6A 2K8SA 5F05A 1DBYA 5CRHA 2OADA 5FWGA 3H93A 1PQNA 5DALB 4FO5A 1EOGA 1K3LA 3A2VA 3LEFA 4ZB9A 1T7PB 1SJIA 3TKSC 4N11A 16GSA 2ZUPA 5IOXA 1EP7A 3FYGA 1K0BA 2V41A 4NV2A 3QOUA 3D0ZA 2DJKA 3KMOA 2IMEA 1NHOA 2OJLA 2VCXA 4GWRA 2OACA 5IO2A 3VWVA 5ECMB 1Z7PA 4IGJA 5EVOA 3KGKA 2ZNMA 3F0IA 4H86A 4WKWA 3ZYWA 4JR6A 5EY6A 2KP2A 1JZRA 1TW9A 2L6DA 5D9TA 4IP1A 3ZIJA 4ID0A 1U6TA 1YZXA 4EVMA 5ENUA 3GKMA 1V58A 4TRXA 1T8EB 3TOTA 4O92A 1KNGA 1XFLA 1HNCA 2XBIA 3FR3A 4IN0A 4GF0A 3DVXA 3DGQA 3IA1A 4MA9A 1X0RA 2O85A 18GSA 2CQ9A 3TKRA 1WOUA 5J3RA 4ZILA 5F8BA 3VURA 5J41A 3UMAA 2B5YA 3NZNA 1J08A 1XW9A 4HS1A 3TCOA 5ABRA 3A2WA 1GSQA 4IJ3A 2IJYA 4K8MA 5JCWA 1HD2A 5IM9A 3QAVA 1A2JA 3ZMLA 4GSNA 1TRSA 3TKSE 1PKZA 3GIXA 3APSA 4F0BA 4TKYA 4J57E 2VM2A 1QMVA 2C0DA 3WGDA 2JZRA 2YN1A 4HZ2A 1XCCA 5HR0A 3GKKA 2FNOA 1WP0A 2FA4A 3CMIA 1HNAA 4BVXA 2X8HA 4XRDA 5HFIA 2VL9A 4LL1B 3IE3A 2BJXA 3QAWA 3K8NA 5IMAA 2A2RA 4BVYA 5ECKB 4KW6A 4ZB8A 3ZZXA 1QXHA 4IP6A 2YZHA 3H79A 3HJPA 4DVCA 4ML1A 1LJRA 2AV4A 2CT6A 2MBTA 1OC9A 5JCUA 3C71A 4Q5RA 2M72A 2H1BA 4MLYA 1H4OA 4I5QA 3QCPA 2YPMA 3W8JA 5G31A 1Z3EA 1SL0B 4KDYA 3US3A 1SKWB 3EMXA 4D73A 5DAKB 3SBCA 2HXKA 2H1DA 2C0FA 1FVJA 3O76A 2FGXA 5D73A 1ZCPA 1ZZYA 1V98A 1SD8A 4WEYA 3GTUA 4I8BA 2HSHA 3FZ9A 1TI3A 2EIQA 3G7YA 4OFMA 4ZIJA 2L4QA 3EU3A 1ERTA 3J7Yb 2ZCTA 2GSSA 1ON4A 3EINA 2VIMA 4NHWA 1FB0A 3VWXA 1TU7A 2XPEA 4TN8A 3KH9A 1NHYA 1UC7A 1HNBA 1V57A 3CYNA 2RM6A 4TR1B 5DCGA 2C80A 22GSA 2KHPA 3G9BA 2IL3A 3ERFA 5H5SA 5CAXA 2Z9SA 1YEPA 3WGEA 1SK2A 6GSWA 3CTGA 3LXTA 1TOFA 4KNDA 4TXVA 2F8AA 2C3NA 2A2SA 3NOFA 4WF5A 2FWFA 4V1Ap 1MD3A 4TR3A 2E7PA 1BX9A 4J2FA 4G19A 1TRUA 2ALBA 2X8GA 1FO5A 4MH2A 4PXOA 3VI7A 1JHBA 1OVNA 3TJKA 4F03A 2TRXA 1QQ2A 4IHUA 5B6NA 1PD21 1OAZA 3HJOA 1EOHA 3EC3A 4PQ1A 1GSEA 4NWYA 4HZ4A 4F9ZA 1PMTA 2LKUA 4TW5A 3W8SA 2ON5A 2PUKC 4OFTA 1K0AA 4K7NA 2H76A 4XS4A 3MWHA 2VL2C 5LD0A 4OWYA 3ZFLA 1XPVA 4V2LA 3BJ5A 14GSA 3ZFBA 2FY6A 2HRNA 4MP4A 2CX3A 5ECLB 5B8BA 1JLVA 1GNWA 3IBHA 2LNTA 3W6GA 1THOA 4JEDA 1THXA 1ERVA 3TOUA 5IIZA 1B8XA 2FLSA 3TKQA 2MMZA 2WZ9A 5GZZB 4POLA 1GSFA 3GHAA 2R3XA 2VCZA 5EL8A 2GSRA 4HQZA 1RW1A 1XVQA 4GSTA 3WGXA 5LNKe 4MJEA 4YH2A 1J9BA 1Y25A 2LV3A 5KN2A 1A0FA 3BD2A 4E8EA 2JADA 3C1RA 3TB2A 3DEXA 4KCAA 3FW2A 2MZCA 3D6IA 1M2BA 3GYKA 3DXBA 2WULA 1OYJA 3HD5A 2EC4A 3GH6A 4IQ1A 5C04A 3UJ1A 2HZEB 3P90A 2IPAA 4TXOA 2HFDA 3D4TA 6GSUA 5JWOB 4I97A 3RDWA 1TU8A 3GFKA 4K2DA 2L5OA 1UN2A 4MDCA 1A24A 2YV9A 4ML6A 2F51A 3RHCA 4IJIA 4ZBAA 4HQSA 5CRGA 3FKFA 2H6XA 4IQAA 1JFUA 3DRNA 5J4UA 3DWVA 3CSJA 2K9FA 4IW9A 1ST9A 4WBRD 4MCUA 1OE8A 4BPYA 1A8LA 4EL1A 4ULXA 1S3DA 2FWEA 3F4SA 4WETA 1M99A 5F0GA 5DALA 5J9BA 4MK3A 2NDOA 2VLVA 2FA8A 2H8LA 4K6XA 3L9SA 3V1WA 3FZ5A 2WJUA 4DEJA 2G0FA 1K0MA 3QR6A 1AQVA 4CHSA 4TVEA 2VL3A 3VWUA 3G7IA 2HYXA 2OE1A 3M3MA 4ECIA 2PPTA 3HKRA 2LNSA 2DMLA 1SYRA 4KB3A 1R7HA 2GZYA 4L5LA 6GSTA 8GSSA 1I9DA 1Z5YE 1M9AA 5CNWA 1K3OA 5CO3A 2HE3A 2QC7A 2LJRA 3A2XA 1R5AA 3BCKA 1XZOA 5G1LA 2EIRA 1GTIA 3DVWA 3RPNA 1O73A 4PX1A 2L57A 5AIXA 3VK9A 5JWQB 3A3TA 2MBSA 3F9UA 1EEJA 2JZSA 3CBUA 4XCSA 4WBJA 2O89A 4Z7XA 17GSA 2GQKA 2HLSA 3LG6A 3DIEA 4F2IA 7GSSA 1G6WA 4Q5FA 5GSTA 5HR3A 3TJFA 3GN3A 1Q98A 2DJ2A 2DSAA 1FVKA 4K0NA 2ON7A 4Q5NA 1X9SB 4BWQA 12GSA 3ZITA 4V2MA 1H75A 1PL2A 1Y6EA 1XVWA 5LCZA 1XWBA 1VRSD 2IMKA 1E6BA 4JE1A 5DBQA 5D9XA 5A5KA 1GH2A 5B6MA 1ZL9A 1QK8A 3C8EA 3E9JB 1O85A 1GUKA 1SK1A 1U3AA 4XRAA 4HU7A 4OCEA 3UVTA 3E3EA 2AAWA 3F63A 1TJDA 2GT5A 3VI5A 2LRTA 1MDIA 4ECCA 2XPDA 4ZL8A 1F3AA 3L9UA 1PGTA 1O6JA 3GMFA 1AAZA 2H30A 5D9WA 3TRQA 4XS1A 1FW1A 5DQYA 3HDCA 2NPBA 1QGVA 1G0TA 4XS6A 2V6KA 4WR4A 1T4ZA 1SU9A 2VCWA 2JSYA 3IRAA 5B8AA 2CVBA 2C3TA 1HYUA 2GT6A 2V1MA 3KP9A 2O7KA 4TR0A 5FHIA 5DVBA 4BL7A 1YY7A 2DJ1A 3KM6A 3IPZA 1A2LA 1V40A 3GSSA 3UVHA 5KEJA 1WE0A 2I4AA 3Q18A 5ELAA 1YF1A 2GTUA 2WFCA 1U88A 4OMVA 1CQGA 1W89A 3LXZA 4JZQA 1E2YA 3KH7A 4MZWA 2H75A 1XWAA 3F8UA 2H1AA 5AGYA 3DKSA 1AC1A 4ACSA 3LSZA 1EP8A 3VWWA 5B7CA 1MDJA 5DAKA 5G5FA 1DUGA 2DJJA 2H6ZA 2K18A 1M9BA 2L4CA 3ED3A 4IS0A 5A4VA 1CQHA 1PX7A 1GLPA 3BOAA 3ZTLA 4PQIA 3APQA 2JL4A 4AJ6A 3BBYA 1EV9A 3I43A 4EE0A 3LFLA 1URMA 3ZRDA 2DJ0A 1B48A 2R5GA 3HZ8A 2R6KA 2E2GA 2DLXA 3MNGA 3TJGA 4HOJA 2RUFA 4J56E 1IYHA 1ACVA 4FYCA 1BJXA 1B9XC 2L5LA 3O3TA 1WJKA 4OO5A 4HJ2A 4ZB6A 4ZBDA 3NIVA 3IOSA 1EGOA 5ID2B 1LU4A 4TR1A 5ECQB 2AHEA 1C72A 2IFQB 4DSQA 4MF6A 1T1VA 4LMWA 4NXIA 3LORA 1BEDA 1M2AA 4MMMA 1U87A 3ZIVA 2H19A 1IYIA 1T3BA 4G2EA 3KTBA 5H5RA 2I81A 1HQOA 1X9MB 4YQUA 4N10A 4GXZA 2DIZA 1VF2A 3OR5A 2GZZA 4XIHA 1BQ7A 3UBLA 3GV1A 2GVPA 2CAQA 2K8VA 2VL2A 3IK7A 2V2GA 2VLTA 3GUSA 4FH8A 2M46A 1K0CA 1TI1A 4O7HA 4OO4A 3ZVJA 2O8VB 1X5DA 2HT9A 4KH7A 4EDYA 3P2AA 2OKAA 3P7XA 2JACA 2HI7A 1PRXA 4ZBBA 3KEBA 1PN9A 2LTKA 5AN1A 2PMTA 1GRXA 1GP1A 2H01A 1GSSA 4OFNA 5FT3A 3I9V2 3EURA 1NSWA 2KOKA 3FHKA 1TP9A 3EMPA 4KSOA 2GQLA 19GSA 2YJHA 2VM1A 2GSQA 4MJAA 3EWLA 2VAFA 3EYTA 4K7IA 5H5QA 1ERWA 1T4YA 1XXUA 4GCIA 3FRCA 2P5QA 2WDUA 4V2NA 2REMA 4RUVA 3HCZA 4DSRA 4EXJA 3SWLA 2VCTA 3IDVA 3LQ7A 4ZL9A 2B7KA 2WGRA 4O32A 2NBSA 5ECRB 1RK4A 4HI7A 1KEBA 5L71A 4YQMA 3LGCA 1Z7RA 3IAM2 3C73A 3F4RA 1MD4A 1GTBA 1PX6A 2GZPA 2DC5A 4RI6A 1OE7A 4TR4A 4HEA2 3GRXA 3LJRA 3HY2A 1SJZA 1JLWA 1PSQA 3CXGA 1VF3A 1SYXA 2H71A 5DQSA 5G5EA 1G7OA 5HFKA 1GSYA 1F37A 3TUEA 4PNGA 2HZEA 11GSA 3F6FA 2B7JA 3MDKA 3DYRA 3IR4A 4ECJA 1SL1B 2B1KA 4WF4A 1VGLA 1EV4A 2NVLA 1XOBA 2B6MA 1YKCA 3CSHA 3UBKA 2QSIA 4N0ZA 4G10A 3TDGA 2LRNA 1XW6A 1TKDB 1AQXA 5E59A 2J23A 4POKA 4G9HA 1J0FA 3TKPA 3H4KA 4MZCA 2YANA 2O87A 4DSSB 3IXRA 2OBKA 2CZ2A 2VD0A 3IAS2 1BYEA 2CA8A 3HXSA 2CZ3A 2P0GA 6GSYA 4NPBA 4YAVA 1OC3A 2AYTA 1GULA 4MJBA 2GSTA 4GSSA 1ILOA 4HJMA 3LWAA 4PUFC 1LBKA 1SENA 1XWKA 4KE3A 1A0RP 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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