2ALBA

Nmr structure of the n-terminal domain a of the glycoprotein chaperone erp57
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
SDVLELTDDNFESRISDTGSAGLMLVEFFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of the N-terminal domain a of the glycoprotein chaperone ERp57
rcsb
molecule tags Isomerase
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
total genus 28
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2005-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2albA00
2YOIA 4HUAA 3KH9A 4PNFA 4NHWA 1M2DA 1TP9A 2E2GA 3C71A 5F06A 5G31A 1O85A 1R26A 3GV1A 4X0XA 2P0GA 4XS6A 3CSIA 1OC9B 1V40A 4IW9A 1SKSB 4POKA 2WULA 1SKWB 1PGTA 4KDUA 1A24A 4TXOB 1EV4A 1GTBA 2I4AA 5CP1A 3UL3A 1WIKA 2K6VA 1O81A 4HOJA 4MDCA 2HZEB 3GSSA 1HNCA 3D4TA 1K0AA 1YEXA 1TRUA 4Q5RA 4MH3A 2FGXA 5IMDA 2N5AA 1Z3EA 3EU3A 2R37A 4G10A 3GKMA 4J2FA 11GSA 4I2TA 3L0HA 3HJMA 3HYPA 3US3A 3QFBC 4RQXA 1SD9A 2B5YA 2EC4A 1SJIA 1TOFA 4AGSA 3F8UA 1F9MA 3CSHA 2C80A 3JCML 3GIXA 4V1Ap 2PVQA 3P8WA 1PA3A 2IMKA 2JSZA 2F3MA 5IM9A 3VFIA 4WKWA 3E0UA 3HZ8A 1JZWA 1URMA 1EV9A 1PX7A 1YZXA 5JCGA 2GS3A 2EIQA 1BQ7A 5IMZA 2H1AA 3F4TA 5FHIA 2IMFA 1VF3A 4OD7A 1PKZA 3TOUA 1R7HA 5ENUA 1NM3A 2XC2A 3APQA 1XVWA 2GT5A 2HRNA 3VPQA 3F9UA 4LL1B 1NHYA 5B7CA 2H1DA 4EO3A 1W4VA 4WETA 4EF0A 1N8JA 4I2UA 5J41A 4X43A 3UJ1A 4MF5A 3FKFA 2V2GA 1JHBA 2WB9A 2JL4A 1EP7A 3Q6OA 3LXZA 4FH8A 3HHVA 1DE1A 3GURA 3HXSA 3LGCA 3CSJA 4N10A 1O8XA 3GRXA 1GSDA 5CREA 1Z6NA 1NSWA 4MZBA 1V98A 2YZUA 3APSA 4MJEA 4IJIA 5IMFA 1B4PA 2H01A 2YCDA 4QL9A 1R5PA 2R5GA 4HU7A 3TRXA 2L5LA 5IOWA 4CDOA 3ISOA 2P31A 3HZ4A 1C72A 3QFAC 2VCZA 2RUEA 2O89A 3HJPA 4GSTA 4KNDA 4FO5A 4PXOA 1WPIA 4OMVA 2NTOA 1K0BA 3TB2A 1AQVA 4EDYA 4J57E 1SK1A 4TVEA 2VIMA 3W6GA 5ECQB 4V2NA 5F07A 4K7NA 9GSSA 2GZZA 4QQ7A 5GSTA 4F82A 5G30A 4F9ZA 4MPGA 4D73A 5ECMB 4ILFA 1BG5A 1M7TA 1AIUA 2OACA 4L0WA 4GRFA 1OE7A 3IRAA 1PSQA 4EE0A 2DJ2A 3FZAA 3L9VA 4LMWA 3TRQA 1Z7PA 5E4WA 4POLA 1KBNA 2M80A 1MDJA 3VPTA 3ME8A 2RM6A 2JZTA 3U5RE 4EKZA 1RK4A 2ALBA 3IXRA 4DSSB 3APOA 1ZL9A 5ID2B 4JU5A 5HFIA 4NXIA 2CA8A 4GQFA 5DAKB 3CYNA 5D9WA 4QL7A 4PGTA 4K1FA 3NZNA 1DE2A 1AAZA 2CT6A 2VD1A 1WRYA 2MZCA 4ZB6A 3G7IA 4ECCA 3BD2A 2DIZA 1XBSA 1F2EA 1G7EA 2NPBA 2PMTA 4KCEA 1YEPA 5D9XA 2YZHA 4BWQA 3ZMKA 4F2IA 5IMAA 3WYWA 3QAGA 6GSYA 4L5OA 4MA9A 3QAWA 5GSSA 2OA7A 2XPDA 2GQLA 4K6XA 2H72A 3TJJA 3ZVJD 5FT3A 5IPHA 2MBSA 2H71A 2AV4A 2H1BA 5L71A 2PUKC 2DBCA 4WF5A 2C1YA 3RPPA 3TOTA 6GSVA 5A5KA 4ACSA 1ERUA 1QMVA 3LEFA 2DJKA 2MMNA 2YJ7A 3TJKA 3Q74A 2K8VA 2CVBA 2RM5A 1K0CA 5ECNB 3DKSA 4AJ6A 4GSSA 3WGEA 2R4VA 1YKCA 3TKQA 2YN1A 2DJ0A 4IELA 4I6XA 1O8WA 4MJCA 4G2EA 3KGKA 4Q5NA 3EMXA 2K18A 2VD0A 1QFNA 4ECBA 1XIYA 4JEDA 5CRDA 2LUSA 1J0FA 5AISA 2JZSA 2ZCTA 5IO2A 4TR1A 5B6MA 3QR6A 4K2DA 3UBLA 4K0GA 1H75A 5JWRB 2FUG2 1T1VA 2IMIA 2F9SA 4IP1A 2R6KA 4TKYA 4Q5QA 1QUWA 4K0NA 3M0FA 3QPMA 4ID0A 5KN3A 2WCIA 2YWIA 3QCPA 1XFLA 5LD0A 5G5EA 1SD8A 2F51A 2KUCA 2L57A 2DSAA 1PL2A 1R5AA 2H6ZA 1AQXA 4IQ1A 3FR9A 6GSWA 1T4YA 1ZGNA 3HA9A 4K7IA 2X8HA 3S9FA 1TRSA 1BJXA 1QXHA 1YKAA 4L0UA 5GAND 4XS1A 1XZOA 3G7JA 1GNWA 1OE8A 3DRNA 3H1NA 2LQOA 4KW6A 2AAWA 3F3RA 4OFNA 1GSQA 4V2LA 1VF1A 1X0RA 2C0DA 1A8YA 3GH9A 5HR0A 1GLQA 2LS5A 2LRNA 2J23A 3IV4A 3IBHA 1GNEA 1ZZYA 1EWXA 3FR6A 3TGZA 3IR4A 1Z9HA 3IK7A 3L9UA 5CNWA 4EC0A 2LSTA 2JU5A 5EL8A 3ERGA 2VLUA 1OC9A 1GSUA 4MF6A 2KLXA 3QDNA 4WBJA 5D8IA 5COHA 3H93A 3DGQA 3MDKA 4IVFA 3RPNA 4TXOA 3ED3A 1F3AA 1GTUA 1TU7A 1K3LA 1EOGA 3Q19A 2TRCP 4YQUA 17GSA 1DBYA 3HKRA 5JWQB 2RLIA 1WOUA 5CRHA 1T00A 1LJRA 1JZRA 4O92A 4ULXA 5ECHB 2HZEA 3L78A 1S3CA 1B8XA 1XW5A 5D9VA 3RDWA 4ZL7A 5DVBA 1OKTA 4ECIA 3P2AA 2B1KA 4OCFA 3TKRA 2LRCA 2VCVA 4FIWA 2LNTA 4PQ1A 4DEJA 1GL8A 1I9DA 1PL1A 1V58A 4ZILA 2B5XA 2GSTA 5ECPB 3MWHA 3DVWA 5B8AA 3TJFA 6GSUA 1Z6MA 1GH2A 4CHSA 1JZOA 4TOPA 4RUVA 3L9SA 2AJQB 3BJ5A 1PKWA 3IE3A 1UVZA 2V32A 5GZZB 4POBA 3ZRDA 3GYKA 4CW9A 4N0ZA 3LYPA 1AC1A 4JZQA 1MDKA 3KM6A 2JACA 1U88A 3U6VA 3LG6A 1XW6A 5IMVA 3R2QA 1GUKA 2GZYA 2JSYA 1KEBA 1ZYQB 2E7PA 1GLPA 1E2YA 2X99A 3VK9A 1HYUA 2MBTA 3DMLA 2H73A 1TTZA 1EGOA 2F8FA 2X8GA 3C7MA 2DMMA 4X1UA 1JZDA 2VL2C 5D96A 2V1MA 3LFLA 4I5QA 2R2JA 1ST9A 2H30A 2OBKA 1THXA 3C8EA 2QKEA 3EMPA 5DDLA 3VWUA 2YV7A 2DJ3A 4N0VA 5ELAA 1B9XC 3EURA 3KP8A 4KH7A 3C1RA 4MABA 3GKXA 3UVHA 3TKPA 5ECRB 4AJ8A 3GKNA 5DCHA 2GSQA 1ML6A 3W8JA 1VF2A 1SL2B 5D73A 4MPFA 4O7HA 1F3BA 2LEGA 4PURA 3WT1A 2CV4A 2I81A 2O7KA 5HR2A 1FO5A 3BOAA 4JR6A 2HSHA 3HCZA 3M9JA 1GTIA 4K9ZA 3O6TA 3IOSA 3UIWA 1MTCA 1USBA 4NWYA 1T8EB 2K8SA 1BX9A 3TDGA 1GRXA 4NAXA 5DQYA 3QOUA 1V9WA 4TR4A 2H19A 2X8CA 3FK8A 1KTEA 1K0MA 3QMXA 1K0OA 2XPEA 4DVCA 1M0UA 4BPYA 3KMOA 3EINA 1X9SB 1YQ1A 4F03A 1E6BA 2RIIA 4O5RA 20GSA 2N5FA 3DIEA 2V6KA 3EWLA 3C1SA 1OYJA 3TUEA 2WDUA 1XWKA 4POMA 2RUFA 4IBPA 3MSZA 4MJBA 5J9CA 4V1Ag 5LCZA 4XCSA 2H74A 4PUAA 3GN3A 3ZITA 2LJKA 1U6TA 1X5EA 5KN2A 3GX8A 4GSNA 1MDIA 3ZLPA 1UN2A 4DSSA 1TRWA 5ID2A 8GSSA 2M46A 2V6OA 3D5JA 1ZCPA 3FW2A 5DJLA 3UBKA 1B48A 1GP1A 5DAKA 4BL7A 2PBJA 3K8NA 5GAPD 4MCUA 2WFCA 1VGLA 3GTUB 1AXDA 5DBQA 1K3YA 2VCQA 3GHAA 5J4UA 2D2ZA 2YWMA 4BA7A 1AQWA 1GWCA 2AUVA 4EDZA 7GSSA 1VF4A 2PN8A 4WBRD 3I6AA 2FLSA 3DXBA 2CX4A 3M9KA 1TRVA 1YF1A 1T7PB 1TU8A 3LYKA 1YF0A 1JFUA 2TIRA 3NOFA 4Z7XA 3W8SA 2VOCA 4FYBA 1TK5B 1PD21 2HNLA 3EVIA 4XS4B 4GXZA 2H75A 1G6WA 3FYGA 5JCWA 4JBBA 1J08A 4KSMA 1TI3A 1ON4A 6GSTA 1X5CA 4ZB8A 1XWCA 1LU4A 4NV5A 2EIOA 2YV9A 2OJLA 2G2QA 4AJ7A 2KP2A 2BTOT 2HXKA 3WGXA 5HFGA 3I9V2 4OFTA 4ZIJA 3L4NA 4GQCA 1A23A 4HQSA 3SBCA 3LSZA 3DEXA 2HE3A 2LKUA 2YPMA 2VM1A 3IHQA 3VI5A 1M9BA 2L6DA 1SYXA 3F4SA 1N2AA 4NHZA 6GSXA 2H0IA 5H5SA 1Y25A 3LJRA 4MMMA 2I3YA 3Q18A 2GQKA 4RI7A 2IFQB 1M99A 3I43A 3A2XA 4DSRA 1KNGA 2GVPA 1GTAA 3KZQA 3KD0A 4BWSA 4MZWA 1F37A 3CXGA 2GT6A 5ECSA 2J9HA 4FYUA 4WR4A 3BCKA 4GLTA 1MD3A 4J56E 3RHBA 2ZUPA 19GSA 4ZBAA 3IA1A 4JRRA 4YAPA 2XBQA 3LORA 2FHEA 1K0NA 4IJ3A 3DWVA 2OE0A 1BAYA 1A2LA 5DJMA 1O73A 1YY7A 6GSSA 3G7YA 3F0IA 2B6MA 4XHMA 2VM2A 3ZTLA 3GL5A 1FG4A 4JR4A 2DJ1A 3AY8A 1A0RP 4P3YB 3IAM2 1ERTA 4NPBA 4EVMA 1I5GA 5AIXA 3GUSA 3PGTA 2HLSA 2PU9C 1TK0B 4ISDA 5AN1A 1M2AA 4HS1A 3D21A 4DSQA 2HYXA 3HY2A 1UC7A 1TKDB 2FWHA 3HJOA 3ZVJA 2HI7A 1U87A 1CQGA 1M9AA 2VCXA 3GX0A 5J9BA 2K9FA 4YQMA 5CAXA 5EVOA 3QD9A 2P5RA 4N30A 3H79A 2FWFA 2ON5A 3VI7A 2AYTA 2MYGA 1TW9A 1HD2A 2LTKA 1SJZA 4RI6A 5F8BA 3ZIVA 4XTSA 3A5WA 4PQIA 1PX6A 5HR3A 1GSFA 5LNKe 1R4WA 3UMAA 4F0BA 2X64A 2DJJA 4PX1A 1WP0A 1T3BA 1SJ6A 2DMLA 3MNGA 3EE2A 5C04A 1HNAA 1GSEA 3UAPA 3LWAA 1FB0A 2LQQA 4EUYA 4HJMA 2CAQA 1JLWA 2A4VA 2FCHA 1U3IA 2LRTA 1WMJA 1MD4A 3GNJA 3DVXA 3RAZA 3MAKA 2B5EA 3HVXA 2V41A 1K3OA 2YJHA 4KA0A 2C0GA 4V2MA 3IC4A 5D9TA 4TRXA 1TXXA 1YDKA 1V57A 2PPTA 2GZPA 1PMTA 1O6JA 2H70A 4MLYA 2VUPA 1H4OA 5CRWA 2DC5A 3ZIJA 2GDRA 1SYRA 2BMXA 1G6YA 4L8EA 4LLRA 4G19A 3ZREA 3J7Yb 1Y6EA 1FVJA 4HZ4A 5F05A 5FWGA 2IMDA 3M3MA 4WXTA 3M8NA 2F8AA 1SKRB 3FZ5A 2G0FA 3V1WA 2C0FA 4IHUA 2PWJA 3BBYA 4XIHA 2NBSA 2CX3A 1QGVA 2E2MA 1A2JA 1VRSD 2VL9A 1LBKA 3A2WA 4XRAA 1PQNA 4MF7A 2VLTA 4OO4A 1X9MB 4NMUA 3ME7A 3ERFA 5A4VA 5DALB 5IMCA 1QQ2A 5CRGA 2I1UA 1Q98A 2C8UA 3FHKA 4ML6A 4MZCA 5F0GA 4HQZA 3GA4A 4OCEA 3O76A 1RW1A 2CVKA 1XOAA 10GSA 5ECKB 4E8HA 2B7KA 3RHCA 4EXJA 4IQAA 3TCOA 5ECLB 3D6IA 3FZ9A 2O87A 1DUGA 4GTUA 4N11A 4YH2A 4TN8A 4JE1A 3TKSC 1J9BA 1EP8A 1EEJA 4I97A 1OC3A 2ON7A 4PNGA 3IAS2 1JLVA 2M72A 2C0EA 3KCMA 2FD3A 4KE3A 2QC7A 2E0QA 2VL2A 4AF2A 3PR8A 4KUNA 3WT2A 2MMOA 1ZMAA 4GWRA 1K0DA 3TKSA 2HT9A 5C00A 4GF0A 1HQOA 2XBIA 5JCUA 3ZZXA 1NHOA 4BVYA 5H5RA 4KDXA 1B9YC 3FY7A 2O8VB 1G7OA 4MP4A 2L4CA 4PQHA 3UOMA 2KP1A 2LNSA 4BVXA 2ES7A 2H6XA 2EIRA 1MEKA 3GTUA 3DD3A 1A8LA 1ZOFA 4HEA2 4PUFC 22GSA 2H1GA 2C3NA 4OWYA 1WE0A 3D4MA 2ZNMA 5G1KA 1XVQA 1FHEA 1THOA 2REMA 1TJDA 1WJKA 2H66A 3G9BA 1FOVA 3VURA 1GSSA 3OR5A 2I9HA 2GLRA 4HZ2A 1OVNA 1SL0B 1ILOA 4XS4A 2IJYA 1GUHA 2B7JA 3ZFLA 1GULA 2B3SA 18GSA 3F63A 2CZ3A 1Q4JA 4E8EA 2XHFA 4H86A 4G9HA 2H6YA 5E59A 1Z7RA 4ZL9A 3FEUA 1EOHA 1XWGA 3GL3A 5IPGA 3ZMLA 3ERWA 1ERWA 4KGIA 4I8BA 4LL4B 2L5OA 2LJRA 1QK8A 3IK9A 2FA8A 2H0HA 2C3QA 1XPVA 4IKHA 2PERA 4KB3A 2GSRA 2AHEA 1W89A 3UEMA 3KH7A 1M2BA 2FA4A 3HVVA 3PH9A 1EZKA 1SENA 1IYHA 4HI7A 5ECIB 2IFQA 1U3AA 3EC3A 3SWLA 5AIVA 2WGRA 3NIVA 4MH2A 1SK0A 2PGTA 1B4QA 2L6CA 1X9WB 3H8QA 2FNOA 2MMAA 4GCIA 2LJAA 2VLVA 3UVTA 2OADA 1RQMA 1O7UA 1OKDA 4ZL8A 3J7Yk 4OFMA 3D22A 2OKAA 4ECJA 4IN0A 3TJGA 3UARA 2IPAA 3TJBA 2YWNA 2NVLA 1Z5YE 5G5FA 2Z9SA 3KTLA 4IGJA 5J3RA 2PVOC 2OE1A 3F4RA 3P90A 1XXUA 2O85A 1SL1B 3ZL5A 2VL3A 1OAZA 2TRXA 4RQRA 1XWAA 2MMZA 3P7XA 2VCWA 3CBUA 1PRXA 3WGDA 3QAVA 4ZB9A 5IQYA 4XRDA 4NV2A 5ABRA 4L5LA 3BCIA 1XWBA 2H76A 2GSSA 2AB6A 1A0FA 2GQMA 4WF4A 4ZBBA 1ERVA 4LMVA 2HSYA 1BYEA 2FY6A 4HU9A 3VWXA 1FVKA 5EPFA 3LQ7A 3ZFBA 2CZ2A 2NDOA 4F0CA 4MJAA 4D73B 4KSOA 3PINA 3LXTA 16GSA 3GSTA 3M1GA 1ZYEA 4OO5A 5IO0A 1S3DA 1G0TA 2KHPA 2A2RA 4EL1A 5G2ZA 2QSIA 1WWJA 1GUMA 2H0GA 3O3TA 4K7OA 3KMNA 5KN1A 3VLNA 1SU9A 3KIJA 2L59A 3H4KA 4FYCA 12GSA 4KCAA 4TR3A 3F3QA 3IDVA 1TDIA 4MK3A 3KXOA 2QGVA 2L4QA 3N5OA 5A4WA 2KOKA 2C4JA 3ZYWA 3CMIA 5DQSA 2WJUA 1YJ6A 4Q5FA 2C3TA 3C73A 5HQPA 2HFDA 1FAAA 3CTGA 3FZ4A 3KP9A 3F6FA 5JWOB 5B6NA 2YANA 3RBTA 5D93A 1ABAA 2OE3A 1FB6A 1PN9A 4ML1A 5IOXA 1DSBA 3EYTA 2WZ9A 4YQVA 1GSYA 5EY6A 4ZBDA 3CRTA 2VAFA 3CTFA 2OBIA 1IYIA 1OC8A 1TK8B 4YAVA 5HFKA 2IMEA 5H5QA 2H8LA 4HDEA 1HNBA 3HD5A 1TI1A 2B1LA 1F6MC 3GH6A 4WEYA 3EU4A 2YNXA 1EGRA 3D0ZA 2IWTA 3GFKA 2BJXA 2IIYA 5KN0A 2FWEA 4HJ2A 5G1LA 1S3AA 1BEDA 3KTBA 5DALA 1SK2A 3TRPA 3KJYA 2JZRA 1FW1A 3N9JA 4WR5A 3F6DA 4O32A 2HRFA 1V2AA 3VWWA 1AUCA 1XOBA 4TR1B 1CQHA 3GKKA 2IN3A 2DIYA 1UA5A 5ECOB 1AW9A 2GGTA 2WS2A 2HZFA 2N5BA 1EEMA 2DLXA 3DYRA 2WRTA 5IIZA 3FRCA 1X5DA 5HR1A 3KEBA 1XW9A 1ACVA 4KX4A 5CYYA 2YWOA 4KDYA 4IS0A 2CVDA 4TR0A 3GMFA 3A3TA 1T4ZA 3HDCA 5KEJA 5B8BA 1A2MA 13GSA 5DCGA 2IL3A 5AGYA 5INYA 2P5QA 3A2VA 3FR3A 4K8MA 2JADA 2VCTA 3CRUA 2YP6A 4TW5A 5J5NA 4ZXGA 3VWVA 3I69A 14GSA 2GTUA 4KAEA 5ELGA 5CO3A 3E3EA 2FWGA 4IP6A 2LV3A 1NW2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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