2ALBA

Nmr structure of the n-terminal domain a of the glycoprotein chaperone erp57
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
b'SDVLELTDDNFESRISDTGSAGLMLVEFFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of the N-terminal domain a of the glycoprotein chaperone ERp57
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
molecule tags Isomerase
total genus 28
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2005-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2albA00
3ZREA 2IPAA 2BMXA 2FNOA 1XZOA 2YZHA 10GSA 3UL3A 2JZSA 4MK3A 2IMEA 5CRDA 4J2FA 4ZBBA 1I9DA 2YANA 1VF4A 4MP4A 4D73A 2I9HA 5CYYA 3DIEA 1B9XC 5JWRB 3W8SA 2H75A 5B6MA 1DE1A 3US3A 1Z6NA 2CT6A 3F0IA 2AAWA 1OKDA 2F9SA 1XXUA 2YN1A 1EV9A 4I97A 3CSHA 1UN2A 4H86A 5ECHB 4KDXA 2F3MA 4MLYA 2C0GA 1YJ6A 1AC1A 1TW9A 2BJXA 2P5RA 4FH8A 1YDKA 3LGCA 3MSZA 4ECCA 3IRAA 2N5FA 3A2WA 4BPYA 2DJ1A 2DMMA 4L5LA 1EGOA 4XIHA 2DSAA 4DSSA 4EE0A 2L4CA 6GSXA 3IE3A 4IS0A 4V2MA 3HVSA 2VLUA 4FYCA 4F0BA 4MF7A 3V1WA 1IYIA 2A2SA 5J5NA 4ZIJA 2QKEA 2HZEB 4OO4A 5IPHA 2OA7A 2VIMA 1A24A 5DQYA 3CSJA 1M2BA 1K0CA 5DQSA 2CX3A 2VCZA 2GSRA 2O7KA 2FWFA 4EC0A 4LA1A 1Y25A 5CO3A 2X99A 3QOUA 1H4OA 2WULA 2CV4A 4G19A 2HXKA 5A4WA 1TRWA 5DDLA 2GT5A 3KZQA 2OE0A 3GIXA 4V2LA 4P3YB 3JCML 4XS1A 3DVWA 18GSA 3G9BA 2YJHA 5KN1A 3A3TA 1SKWB 1XOAA 4KDUA 4TR1B 4HU9A 2F51A 2MYGA 1AIUA 4EVMA 2C80A 3L9VA 22GSA 3BD2A 4EDYA 4Q5FA 3LJRA 1BYEA 4CHSA 4N0ZA 2J9HA 5B6NA 4EDZA 5IQYA 2FGXA 1Z3EA 5HFIA 1TRSA 2GQKA 3F4SA 6GSWA 3D4TA 3BCIA 5B8BA 4GWRA 4XS4B 5ELGA 5A5KA 4FYUA 4HQZA 1E6BA 2I4AA 4RI7A 4K9ZA 4TXOB 3CTFA 2PERA 4GXZA 2PN8A 1THXA 3BJ5A 4IHUA 4MF5A 4TR3A 4L0UA 2GZZA 4ZL7A 1SKRB 5IOXA 1G6YA 4ID0A 1O81A 4ZBDA 1Q4JA 4TVEA 5D9TA 3FK8A 3UAPA 3LYPA 2VCWA 2LTKA 1RK4A 2V2GA 1ABAA 3TRQA 4V1Ap 3O6TA 1V2AA 1G6WA 1RW1A 4BVYA 1SD8A 1XWKA 1SYXA 3VWWA 2PBJA 3KGKA 1YKCA 2KHPA 4X43A 1GNWA 2LJAA 3LORA 1J0FA 4ISDA 5KN0A 4ZB6A 3GNJA 4OD7A 2PU9C 2H6XA 3RAZA 3LXZA 4PUAA 3H79A 4E8EA 4DEJA 3TUEA 4KDYA 2KOKA 5EPFA 4ZILA 3D6IA 5B7CA 5IO2A 3ERFA 4PXOA 3FR3A 3J7Yb 19GSA 2L6DA 1EZKA 5F07A 4LLRA 3CBUA 4K1FA 3ZIJA 1GL8A 5D96A 5J9CA 3CRUA 1EOGA 2R5GA 3E3EA 1JZRA 1OVNA 4ECIA 3L4NA 4F03A 3GL5A 1Z7RA 3G7JA 1K0AA 4KUNA 1PL2A 2JL4A 3IK9A 2EIOA 5G30A 2RUEA 3U6VA 3GYKA 1BX9A 2PVOC 4PQHA 4JZQA 5F05A 2DBCA 1XBSA 5CP1A 3K8NA 2E2MA 4TW5A 2H73A 2L4QA 4ML6A 1PA3A 1O6JA 3M8NA 5AGYA 3EC3A 4MZCA 4X0XA 2YV9A 3HYPA 5LCZA 4OO5A 1A23A 3KD0A 5LD0A 3LSZA 4NWYA 2LJKA 4PNFA 3UVHA 2VM2A 2AV4A 3I69A 2VO4A 1PKWA 2AB6A 4G10A 4IN0A 2MMAA 2H70A 4HZ2A 4RI6A 2F8AA 5KN3A 1GTIA 4JRRA 2B7JA 4NPBA 2YZUA 4YQVA 6GSYA 1A8YA 16GSA 1YZXA 5ECKB 3FZAA 2IJYA 4KB3A 1M2AA 4HJMA 2YPMA 2B1LA 3C8EA 2LS5A 2RM5A 3EU4A 2AHEA 1U87A 3LWAA 3CTGA 4V1Ag 5D93A 5DVBA 4ML1A 4G9HA 4FO5A 1M9AA 2H6ZA 3TOUA 4JU5A 2H74A 3UBLA 1ERWA 1OE8A 3IXRA 1U3AA 2KLXA 1V9WA 3DEXA 2JU5A 2NDOA 4GLTA 1PRXA 2OADA 5E59A 3ZFLA 4ZB8A 3TCOA 3R2QA 2JZRA 1WWJA 3QAGA 1TDIA 1GWCA 4WR5A 3F4RA 4GSTA 3LFLA 1MTCA 3J7Yk 2G2QA 5DCHA 4O5RA 3F6FA 1N2AA 1ZYEA 2LRCA 4XS6A 2E0QA 3DRNA 1DSBA 5J4UA 1SD9A 4WKWA 3ED3A 3HZ4A 3C1SA 2MZCA 1TK8B 4CW9A 5J9BA 2ON7A 1GSYA 3OR5A 3KP9A 5DCGA 5IMDA 3W8JA 2OBIA 2CX4A 2YNXA 4MJEA 2O89A 4POKA 1ZL9A 2HZFA 1FW1A 4WETA 3NIVA 2DJJA 1XIYA 3WGXA 4LMWA 1XVWA 3MNGA 1TU7A 3HJMA 1CQHA 1ZOFA 2JACA 3QDNA 5HFGA 3TKRA 2WGRA 3UMAA 2EC4A 1M9BA 2PMTA 1YF1A 2FA8A 3IV4A 3APQA 5J3RA 12GSA 1OYJA 2I3YA 3HVVA 2NBSA 4WR4A 2FCHA 4MABA 1HNAA 3GHAA 5ECLB 3VLNA 1DE2A 1XWCA 1GUMA 3TJJA 2FUG2 2GDRA 2VUPA 5DALB 4NV5A 1XWAA 1VF2A 2RUFA 4ZL8A 3LEFA 4N11A 2L5LA 1GSSA 5ABRA 3VPTA 4GRFA 2XPDA 4HJ2A 2VCQA 2FHEA 3ZRDA 3IAS2 3P7XA 9GSSA 1K0NA 4G2EA 4HDEA 1E2YA 2WB9A 3ZMLA 3DKSA 5IMAA 4K8MA 3GTUA 3D22A 1QMVA 3QFBC 1T3BA 1SKSB 4NXIA 2DC5A 3QPMA 3ZYWA 2X8HA 2C1YA 2CAQA 4GSSA 1G0TA 2P31A 2XC2A 1F3BA 4GF0A 2K8SA 1SL2B 4ECBA 3QMXA 2RLIA 3KMNA 1OC3A 2DJ3A 2IMKA 4I2UA 1USBA 3APSA 4Q5QA 5EVOA 2GSTA 2R4VA 2R37A 4N30A 4MH2A 1WMJA 3MDKA 4POBA 2XBIA 1EP8A 3RDWA 3W6GA 2TRXA 1AQWA 3IPZA 1UVZA 3KH9A 2OACA 4WF5A 2HI7A 2GS3A 3A2XA 3HJOA 1JLVA 4I6XA 3VI7A 1VGLA 1F9MA 4J57E 4HI7A 4PQ1A 1TXXA 3H93A 4TOPA 5ID2B 4IP1A 1GH2A 3F6DA 1I5GA 1ZMAA 3VPQA 5IO0A 2Z9SA 1AQXA 3M9JA 1K0OA 1HNBA 2FWEA 3GKXA 1JZWA 1WE0A 1LJRA 3HHVA 5H5SA 1FB6A 3BBYA 5CRHA 5J41A 1ST9A 3F8UA 3RHCA 3C7MA 2GGTA 3PH9A 4KAEA 2B6MA 3RPNA 3GURA 1GUKA 4K0GA 5G1LA 4FYBA 4IJIA 3L0HA 20GSA 1M2DA 1NHYA 4HUAA 5DAKA 1TJDA 1K0BA 3TKSE 3HA9A 1Z5YE 4HU7A 3FYGA 3M1GA 3GX0A 2X8GA 1AW9A 1V57A 4BWQA 3H8QA 2V6OA 3GH9A 4KE3A 2KUCA 1GUHA 4IQAA 2CVBA 5EL8A 4I8BA 5EY6A 1QGVA 1UA5A 4ZL9A 4LL1B 3KMOA 3SWLA 2GQLA 2P0GA 4JEDA 5IPGA 2B5YA 4CDOA 3C73A 3L9UA 4AJ7A 3P90A 1F37A 3IA1A 1GSQA 4NHZA 2GTUA 1FOVA 1OC9A 3ZMKA 4LL4B 2K18A 1T4ZA 2O87A 1MEKA 5ECMB 2H72A 1EV4A 1FO5A 4AJ6A 1F3AA 1YEXA 2C4JA 2AUVA 2ZNMA 4MMMA 2P5QA 5HQPA 3ZZXA 4MH3A 2OJLA 3TKPA 4D73B 3MWHA 4MJBA 4KA0A 4YQUA 5IIZA 3EINA 1LBKA 1DBYA 3ZL5A 2YWIA 3G7YA 5F0GA 5ECQB 1KBNA 1PX6A 2LNSA 2B5EA 1ZCPA 4TR0A 2JZTA 2IIYA 4KH7A 2C8UA 2H1GA 1NSWA 2LSTA 2JSZA 1T1VA 2FA4A 4OMVA 3D5JA 3UARA 1Z6MA 1TRVA 2YWMA 2LQQA 3BOAA 3GKKA 4Q5RA 2LQOA 3CXGA 4DSSB 3U5RE 1XW5A 4ZXGA 2IFQA 5ECSA 3BCKA 3EWLA 2VCVA 4N0VA 4IJ3A 5ECOB 5JCGA 1XWBA 3TDGA 1HYUA 2PWJA 1THOA 1URMA 3EU3A 3FZ5A 5DBQA 2VCXA 3O3TA 3WD6A 1JFUA 4ECJA 2VD1A 2V32A 4KCEA 5GZZB 4I2TA 2PUKC 2IWTA 4I5QA 5HR0A 3N5OA 2CAIA 2RIIA 1MDJA 3IR4A 1B9YC 2H8LA 1BEDA 2ZCTA 1YEPA 3DXBA 3PINA 5E4WA 2LV3A 3FEUA 4RUVA 3MAKA 3Q6OA 2HRFA 7GSSA 4DVCA 2DJ0A 1XOBA 3VI5A 1BG5A 1ZZYA 1X9MB 4XCSA 1F6MC 1XWGA 1KEBA 4MJAA 4TXVA 5JWQB 4PX1A 2XHFA 3GL3A 6GSTA 1X9SB 1MD4A 2LJRA 2IL3A 1O7UA 4NAXA 4WF4A 2PVQA 1EP7A 3QAVA 4IGJA 2A4VA 5G5FA 2JADA 3TJKA 2TRCP 4JBBA 2YOIA 2KP1A 3IHQA 4O7HA 4X1UA 2RM6A 3ZFBA 1MDKA 3GV1A 2D2ZA 3WT2A 1T4YA 2H19A 3UBKA 2L59A 1GTUA 2R6KA 4F82A 8GSSA 3LQ7A 4GSNA 1WP0A 1BJXA 1QQ2A 5KN2A 3Q74A 2ON5A 2FY6A 2WJUA 4WEYA 5IMZA 2E7PA 1B8XA 1LU4A 2MBTA 1GLPA 5JCWA 5A4UA 3DVXA 2LNTA 2K9FA 1WIKA 3HJPA 1TI3A 3F4TA 1SK0A 4MPFA 1O73A 2LUSA 4KCAA 4PQIA 4Q5NA 4V2NA 1A2MA 4OFTA 6GSSA 3F3RA 2GQMA 1TI1A 1B4QA 1U3IA 3UJ1A 4KX4A 3TKSA 2JSYA 2R2JA 1SK2A 5HR2A 3GSSA 5LNKe 3GMFA 4BL7A 4MDCA 1FVJA 2OE3A 2GSQA 3KJYA 4YQMA 1B48A 4KSMA 3E0UA 3F63A 4WXTA 2IMIA 4XHMA 5INYA 2NVLA 2N5BA 2DMLA 2E2GA 1S3AA 11GSA 2HZEA 2WDUA 3ME7A 4LMVA 2FWGA 1H75A 1QUWA 1S3DA 3EE2A 3I43A 3KXOA 5ENUA 4HZ4A 3IBHA 4MZBA 4HEA2 1IYHA 2H1AA 2R3XA 1AAZA 2AJQB 3A5WA 1A0FA 3KH7A 1YY7A 4AF2A 1SENA 5GSSA 4POLA 1XW6A 4IW9A 4MF6A 5ECPB 1ILOA 2V6KA 1NM3A 2MMZA 4OFNA 3ERGA 3GKMA 2OKAA 4JE1A 5CAXA 2C3NA 2GVPA 1Q98A 3F3QA 1TK0B 1V40A 4DSRA 1YQ1A 5AIVA 1MD3A 1GP1A 1KTEA 3PGTA 5IMCA 1FAAA 1FB0A 1V98A 5JWOB 2HRNA 1MDIA 1JZOA 4TR1A 3KM6A 4TRXA 3ZVJA 3S9FA 1M0UA 3VK9A 3GKNA 4EUYA 3M9KA 4IVFA 1X0RA 1PD21 2CA8A 2X8CA 3ZTLA 4ULXA 3UVTA 5G31A 3PR8A 4PUFC 4IKHA 1NHOA 1FVKA 2HYXA 2MMNA 3VURA 3DD3A 3QCPA 1W4VA 3M3MA 4EL1A 3CMIA 5C04A 1K3OA 1ON4A 2M46A 4TXOA 3TOTA 3GRXA 3EYTA 1PKZA 2CVDA 2H0GA 1SL1B 2GZYA 3QFAC 1WPIA 4XTSA 1EEJA 1EWXA 4TR4A 4K0NA 5DJMA 4F2IA 2DJKA 1YF0A 1U88A 2AYTA 3WYWA 3IDVA 2I81A 4QL9A 4QL7A 3QD9A 1A8LA 4BWSA 2MMOA 4OCFA 4FIWA 2XBQA 1TKDB 3L9SA 1SJ6A 2L6CA 3KEBA 4K7NA 3WT1A 2X64A 3DWVA 3C71A 3UOMA 2HNLA 3FRCA 5FT3A 1ZYQB 5IMVA 3H4KA 1R5PA 2VL2A 3IAM2 2HT9A 3HD5A 4L5OA 2HLSA 5A4VA 1VRSD 3HZ8A 2YV7A 1XCCA 4EF0A 4GCIA 3I6AA 3D0ZA 3FR6A 4MPGA 3ME8A 2H1DA 2A2RA 1PQNA 2MBSA 2H0HA 4NV2A 2C3TA 2CVKA 2V41A 2B1KA 4BA7A 1WOUA 1GSEA 2QSIA 1Y6EA 1NW2A 3O76A 4WBJA 1QXHA 5G5EA 1U6TA 1RQMA 4PGTA 1QFNA 2WCIA 2CZ2A 4O32A 5GSTA 1Z9HA 1VF1A 2LEGA 5F06A 2VLTA 2VLVA 3TRPA 6GSVA 2IN3A 1PN9A 1X5DA 3DGQA 1EOHA 4NHWA 3GUSA 1C72A 3EMXA 4MZWA 2VOCA 1GTAA 3TKSC 3EURA 1J08A 2B5XA 17GSA 4E8HA 2VL9A 4IBPA 1N8JA 2C0EA 1M99A 1PMTA 1TP9A 5ECNB 4TKYA 3ZITA 1KNGA 1WRYA 2DIZA 3VWXA 3FHKA 1G7EA 1CQGA 4N10A 1ACVA 4GQCA 2C0FA 2FLSA 1R4WA 3WGDA 1PX7A 4IQ1A 5HR1A 2GT6A 1JZDA 2YJ7A 2LRTA 1OAZA 4XRDA 2YWOA 3KTLA 1ERUA 1ERTA 4EXJA 2M80A 2PGTA 3P8WA 5D9VA 1Z7PA 3FZ9A 3GTUB 3HKRA 1XPVA 1GLQA 3TJFA 3APOA 2IMDA 3FR9A 1WJKA 1T7PB 2GSSA 5AIXA 4F9ZA 2H01A 3KIJA 5ECIB 1SK1A 1R7HA 1SYRA 4ZBAA 2HFDA 2BTOT 1TTZA 3GX8A 3UEMA 2H1BA 1BQ7A 3FKFA 3GFKA 4HOJA 2ALBA 2DLXA 1X5CA 4ZB9A 5H5RA 2C0DA 3N9JA 4YAVA 5AN1A 2WRTA 4KNDA 2OE1A 4EO3A 1PGTA 4Z7XA 1AQVA 3GA4A 2REMA 1ML6A 5CREA 5IM9A 4HS1A 1UC7A 3TKQA 5FHIA 1FHEA 1K0DA 3ZLPA 1S3CA 4POMA 1TOFA 1QK8A 1FG4A 4JR6A 5D8IA 5D9WA 1GSDA 4J56E 3ZIVA 3FW2A 4AGSA 5GAND 3LYKA 5KEJA 2VAFA 3GH6A 3H1NA 1OC8A 2PPTA 3GN3A 2WZ9A 4MCUA 1OE7A 4OFMA 1X5EA 1T00A 3QR6A 3KCMA 3CSIA 1SJZA 2I1UA 3FY7A 1O85A 4K2DA 2GZPA 3DMLA 3VWVA 4K7IA 3EVIA 5DAKB 1W89A 1HNCA 2L5OA 3F9UA 4OWYA 5H5QA 1X9WB 2QC7A 5JCUA 3IC4A 3ZVJD 1AXDA 1SL0B 1K3YA 3A2VA 4IP6A 2G0FA 4TN8A 1K0MA 5C00A 3WGEA 1GRXA 4EKZA 2H71A 4RQRA 2KP2A 5FWGA 2LKUA 2VCTA 2VL2C 3C1RA 3HCZA 3VWUA 5CRWA 5ELAA 4K6XA 5D73A 5IMFA 2ES7A 5F8BA 4AJ8A 1TU8A 5CNWA 2H76A 1ZGNA 1GSFA 2CZ3A 4PNGA 2B7KA 4BVXA 3CYNA 4GQFA 3LXTA 1OC9B 5DALA 2L57A 1BAYA 4NMUA 1SU9A 5ECRB 3ISOA 3RBTA 3HDCA 13GSA 4IELA 5D9XA 3E9JB 3IOSA 1R26A 3Q18A 4F0CA 4L0WA 3TB2A 3IK7A 1G7OA 4WBRD 3UIWA 5G1KA 1GTBA 3KP8A 5L71A 3P2AA 4YAPA 1OKTA 4PURA 2YP6A 4ACSA 1TK5B 3EMPA 3TRXA 1EGRA 2FWHA 2YCDA 4QQ7A 4RQXA 14GSA 1GSUA 1PL1A 2XPEA 3ERWA 3VFIA 1JLWA 2V1MA 3AY8A 2DIYA 3DYRA 5HR3A 1TRUA 1F2EA 3HVXA 4OCEA 2ZUPA 2H6YA 4ILFA 2IMFA 2NPBA 3I9V2 2K6VA 2HE3A 2WFCA 3TJBA 3TJGA 2VL3A 1A2JA 2CQ9A 3G7IA 1VF3A 2M72A 2NTOA 2IFQB 1ERVA 4JR4A 3KTBA 1XVQA 5HFKA 2HSHA 4K7OA 3TGZA 1O8XA 3NOFA 2QGVA 2HSYA 5GAPD 2TIRA 3Q19A 2B3SA 6GSUA 5ID2A 2YWNA 2EIRA 1HQOA 4GTUA 2O85A 1A2LA 3CRTA 1GULA 2LRNA 1M7TA 1T8EB 3D21A 3SBCA 5DJLA 4MA9A 2J23A 2VM1A 5B8AA 4HQSA 4L8EA 1V58A 1K3LA 3RHBA 2N5AA 2OBKA 3D4MA 4KW6A 1PSQA 1O8WA 2EIQA 1J9BA 2F8FA 5COHA 5CRGA 1YKAA 4O92A 1JHBA 1AUCA 1XFLA 4DSQA 3NZNA 3RPPA 1EEMA 2C3QA 3LG6A 4MJCA 2H0IA 1A0RP 4KGIA 3FZ4A 2H30A 3HY2A 4YH2A 1GNEA 2FD3A 5G2ZA 2GLRA 4KSOA 2WS2A 2K8VA 1R5AA 2H66A 3HXSA 4XRAA 3M0FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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