1BJXA

Human protein disulfide isomerase, nmr, 24 structures
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
AATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structure in solution of the b domain of protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 19
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 1998-06-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1bjxA00
2RUEA 2VL2C 4L8EA 5DALA 5E59A 2K18A 2J23A 1TRSA 1KBNA 5AIVA 2LJKA 5HR1A 4J56E 2EIQA 4EC0A 4XS4A 3TOTA 5IMCA 4WBJA 1N8JA 2LEGA 2CVDA 3PINA 5C04A 2HYXA 1LJRA 2OA7A 4MJCA 2YCDA 3WGEA 3FW2A 5ECKB 2R6KA 1GUKA 3BCIA 4WF5A 3GMFA 4BVXA 1LU4A 2VD1A 2PERA 3GUSA 1Z6NA 4POLA 2OADA 2N5AA 3WT2A 2B6MA 3Q18A 3DWVA 2DIYA 2MMZA 2X8CA 3BBYA 1F2EA 2WDUA 3KXOA 2GSQA 3R2QA 3FR3A 4CHSA 4LA1A 2WFCA 3FHKA 2FGXA 4LLRA 4OCEA 2B5EA 1AXDA 2KP1A 4HJMA 1TXXA 4IJ3A 4MZBA 5DCHA 2R3XA 2H76A 5EVOA 4K6XA 1A0RP 3HD5A 2LV3A 3APOA 3CRTA 3NOFA 1K0AA 1EZKA 1T4YA 2OE1A 2RLIA 4WETA 2H0IA 5KN3A 2WCIA 2WRTA 2XC2A 3CSJA 4PXOA 3GX8A 3FK8A 4MF5A 5D93A 4ZL7A 3IDVA 3IV4A 1VGLA 2K8VA 4PX1A 4QQ7A 1GSYA 3HKRA 2D2ZA 2L5LA 4TR3A 4HDEA 1EOGA 2OACA 2DLXA 3H93A 1V2AA 4D73A 3EU3A 1T7PB 1ILOA 3EYTA 1A8LA 1SK1A 3CXGA 4GTUA 5KN0A 1GTBA 2NTOA 4CDOA 1SYRA 5LCZA 1XWAA 1XW9A 5ELGA 3I69A 3ISOA 3M1GA 2VO4A 2GQKA 3ERFA 2YZUA 5ID2B 3TJKA 2AB6A 1SL1B 3UOMA 6GSSA 5CREA 5G1LA 3TKPA 4F2IA 1GUHA 3F0IA 2LNSA 1EP8A 1AQWA 3GTUA 4HQZA 4XIHA 3C73A 1XWGA 5CP1A 5ECHB 2O8VB 1T00A 4IGJA 3WGXA 4LL1B 3UEMA 1HYUA 2NDOA 2FA4A 1XWBA 5DAKB 4GSTA 2JU5A 1XWKA 3GNJA 3GL3A 4ACSA 3APQA 4OO4A 3QAVA 1ZGNA 1SL2B 4V2MA 3QFBC 4OFMA 3KMNA 4HOJA 1VRSD 2IFQA 4AJ6A 3FZ5A 2A2SA 4HS1A 2LJAA 1Y6EA 3RAZA 1FOVA 1R5PA 5IMDA 2O85A 1M2BA 5A4UA 2I3YA 1PRXA 3ZL5A 3TDGA 3CSIA 2YWOA 1O7UA 1BJXA 5ECNB 1OC9A 2DSAA 2LTKA 2V6OA 1I9DA 2KUCA 3FRCA 2LQOA 3D5JA 1KNGA 4K0GA 1CQGA 5IO0A 3QDNA 1B4PA 2LKUA 1WMJA 5D9XA 4MA9A 3UMAA 4G10A 2H1BA 1PKZA 3FZ4A 1FHEA 4JR4A 4MJAA 2HZEB 1QMVA 3P8WA 1ZYEA 2H70A 4POMA 3FYGA 5IM9A 1K0OA 3GKNA 2L59A 1Z7PA 2LSTA 1XPVA 5D9TA 2CVBA 1U3AA 3M9KA 4K9ZA 2P31A 4EVMA 2A4VA 3GYKA 5F05A 5B6NA 2YOIA 2HSYA 4DSQA 4TVEA 1U88A 2VIMA 3J7Yb 2Z9SA 3GRXA 4TR1A 2CZ3A 1QQ2A 5AIXA 4ILFA 2YANA 2I81A 4PQIA 2H1AA 22GSA 2EC4A 4L0WA 2N5BA 4KGIA 1T3BA 1X0RA 2JSYA 4V2LA 2JZTA 1B9YC 3HJOA 1MTCA 3HVXA 4HI7A 2K9FA 1R4WA 1HNBA 1U3IA 3LJRA 4PNFA 1C72A 1F3BA 3IK9A 3DRNA 1O73A 6GSUA 2F9SA 4OWYA 2NPBA 3IC4A 4KDUA 4I8BA 1TU7A 1XWCA 2YV9A 1GSEA 3D22A 4I6XA 3GN3A 3ERWA 4MPGA 1JZDA 5IMFA 1GSSA 1ST9A 4MK3A 3BJ5A 1PX7A 2C80A 1Z6MA 2JZRA 3O3TA 3GIXA 2DC5A 2B1LA 3FZAA 1HQOA 3EINA 1SKRB 3D4MA 5A4VA 3DXBA 2OKAA 2V32A 2GT5A 2ZUPA 1H4OA 3J7Yk 4PQ1A 4EO3A 4G9HA 2P5RA 4ZB8A 1GP1A 2GS3A 1X5CA 2FWHA 3DVXA 2H0GA 4HJ2A 1BAYA 1SKSB 1ZL9A 4XRDA 4IELA 1JZWA 1SK2A 1Z9HA 4MJBA 5CYYA 2H6YA 4L5OA 1BX9A 5ECSA 3PR8A 2KOKA 1HNCA 3ZITA 3UAPA 1TOFA 6GSVA 4L5LA 14GSA 4RQRA 2V2GA 3UJ1A 3UBLA 2LQQA 1DSBA 1J0FA 2F51A 2FLSA 3TGZA 2YWMA 3W8JA 6GSXA 4N30A 2CV4A 4O5RA 5IMVA 2CX3A 3DEXA 1G7OA 3M0FA 2CQ9A 2PU9C 2ES7A 2BTOT 20GSA 3ZMKA 2GQLA 3M9JA 2R37A 4ML1A 3L9SA 3QD9A 1O81A 5DBQA 2LUSA 4L0UA 4F9ZA 3TKSA 2OBIA 1Z3EA 4ID0A 3IOSA 2A2RA 4MPFA 2CA8A 3DIEA 3ME7A 2QGVA 1TTZA 1S3AA 4K7IA 1V40A 4BA7A 1GSDA 2LJRA 2IMEA 1SKWB 5GAND 3W8SA 1TU8A 3HA9A 4JBBA 3A5WA 4YQMA 1FAAA 3L9VA 4BVYA 1AQVA 1OYJA 1UA5A 1W4VA 5EPFA 4BWSA 1SJZA 3VWVA 3MSZA 4AJ8A 5HFIA 3UBKA 3HZ4A 5HFKA 4N0VA 4GF0A 1A0FA 1V58A 4RUVA 4IVFA 4XTSA 1LBKA 3IBHA 4ZL9A 2H75A 2JZSA 3DYRA 2NVLA 1M2AA 4XS1A 5CRGA 5FHIA 2IMKA 2VM1A 16GSA 1Q98A 1XVQA 2VLUA 3PGTA 3KEBA 3TRPA 3S9FA 4IBPA 2YN1A 2MYGA 1ERWA 3GH6A 3VWUA 5ECRB 3GHAA 2M80A 3M3MA 4WR4A 12GSA 1SD9A 2IWTA 4X1UA 4NPBA 1ZMAA 1K3YA 2DIZA 5IMAA 2PVOC 1YF0A 2GQMA 2VD0A 3UVTA 5KN2A 1MDJA 2OBKA 3HZ8A 2VUPA 2DJKA 1EV9A 4FYBA 2R5GA 2JADA 4GWRA 5G30A 2IIYA 1G6WA 4HU9A 1YKCA 2RIIA 3G7JA 1YF1A 1OKDA 4JR6A 2FWEA 5DJMA 1UC7A 1JZRA 4GQFA 1F9MA 4TXOB 2E2MA 2GZZA 1ZCPA 3QFAC 4EKZA 1THXA 3DGQA 3VPTA 3LG6A 2JSZA 1O85A 3SBCA 5ID2A 2QKEA 1BQ7A 3C71A 3KGKA 2E2GA 2YWNA 1K0CA 1M2DA 1QUWA 2C0DA 1A8YA 2BJXA 2MMNA 3F4RA 4OFTA 5L71A 4ULXA 2R4VA 3LGCA 3HVSA 2FNOA 4GSSA 3QAWA 3RDWA 4RI6A 1M0UA 1MEKA 5D96A 5ECPB 3DD3A 2GLRA 3G9BA 4NAXA 3TKSC 1TK8B 1N2AA 5DAKA 4EE0A 4LL4B 1OE7A 4PUFC 2CZ2A 1YQ1A 2XPDA 1V57A 3E0UA 1Z7RA 3U6VA 5DDLA 2PN8A 4ZB6A 3VPQA 2LS5A 1XW5A 5H5QA 3VI5A 3P90A 1SU9A 3EMPA 4OCFA 1NM3A 3BD2A 4TKYA 3KJYA 3GL5A 2YP6A 3FR6A 4EDZA 1XFLA 4WBRD 2XBIA 5ELAA 1Q4JA 3ZZXA 5AN1A 2IJYA 3QCPA 3VFIA 3FKFA 3IA1A 4ISDA 3N5OA 2MBTA 1TDIA 3FR9A 3KM6A 2OJLA 4PUAA 1OVNA 1W89A 1K0NA 1GUMA 2LNTA 1MD4A 2C3NA 3ZIJA 3RPPA 1A23A 1EEMA 4ECBA 1JZOA 5JCUA 2REMA 5IMZA 4MF7A 6GSWA 3EURA 2NBSA 2LRCA 1FVKA 5ECMB 1RK4A 3GURA 4WXTA 4ZL8A 3ZYWA 2HZEA 1DBYA 4NV5A 4WEYA 3W6GA 1GH2A 2HFDA 2IN3A 4MCUA 1XW6A 1URMA 1DE1A 1PKWA 3HXSA 3GTUB 4K2DA 3Q19A 5HR0A 3L4NA 5DVBA 2XHFA 2H8LA 4Q5RA 3QMXA 4K7OA 4WR5A 4BWQA 4KUNA 4ECJA 6GSTA 2V1MA 3ZVJA 2LRNA 1DE2A 1GTAA 2VM2A 2GGTA 2H01A 3H8QA 2VLTA 3IHQA 2YZHA 2M46A 1KEBA 1GLQA 2HXKA 3HYPA 4WKWA 2FWFA 3KP8A 1NHOA 4X0XA 3H79A 4DSSB 5HQPA 1TI3A 3C1SA 3KTBA 2IFQB 3WT1A 9GSSA 1GL8A 4TN8A 4ZILA 1F6MC 1XVWA 5G2ZA 1HNAA 5J3RA 4QL9A 2H30A 3GH9A 1PSQA 3HJMA 4KCAA 3AY8A 3D4TA 4N11A 2B5XA 1CQHA 3IAM2 5A5KA 1A2LA 3ZVJD 5G31A 2YPMA 3EVIA 3ERGA 3MNGA 1PQNA 3RHBA 10GSA 2EIOA 2GZYA 1UVZA 5JCGA 4YAVA 3A2XA 3LXTA 2FA8A 2XBQA 3ZFLA 1YY7A 1YEPA 4PNGA 5ENUA 2VCXA 3KCMA 2J9HA 3GKKA 4KW6A 1TJDA 2HLSA 3H4KA 4AGSA 1PMTA 3F3RA 2DMLA 3LXZA 4FIWA 1EOHA 3NZNA 3GKMA 1Z5YE 1MD3A 3NIVA 3CRUA 1FW1A 1GSUA 2GVPA 3IRAA 5LD0A 5F07A 4JEDA 1X5EA 5EL8A 2L4CA 1WRYA 1SENA 2GZPA 5HFGA 1ZZYA 3VI7A 1PX6A 4IW9A 3HDCA 4KSOA 1ACVA 1MDIA 4YAPA 2H74A 3EU4A 3KD0A 1ML6A 2XPEA 5F0GA 2X64A 1RW1A 2GT6A 2B7KA 4TR1B 17GSA 2GSRA 3LWAA 2DJ3A 3F63A 3UIWA 3F4SA 4ZIJA 1JHBA 1AUCA 7GSSA 5J9BA 2PGTA 4K8MA 4NWYA 2L6DA 3VK9A 1TK5B 3G7IA 3QR6A 3ZMLA 4IN0A 3G7YA 4WF4A 1BYEA 3F9UA 2HRFA 5INYA 2FWGA 4JRRA 1I5GA 3N9JA 4EUYA 2ZNMA 4JE1A 1TP9A 4MZCA 5IPGA 1GNEA 3OR5A 2E7PA 1FB0A 3KH7A 4IJIA 4GCIA 3WGDA 1IYIA 1UN2A 1WP0A 2WS2A 4FO5A 4YH2A 4O7HA 3DMLA 1AAZA 3A2VA 2QSIA 5DJLA 3P2AA 3VWXA 4IP6A 3L9UA 3HCZA 3E3EA 4H86A 2TIRA 1O8XA 4GRFA 4N10A 5CNWA 5GSSA 5H5RA 5J5NA 5DQYA 4TRXA 2G2QA 1HD2A 4MH2A 4TXVA 2CAQA 2R2JA 4ECIA 4IQ1A 3C7MA 3CTFA 2VCVA 1VF2A 4K1FA 1PL2A 2HE3A 3JCML 4JU5A 4IHUA 4IP1A 5CO3A 4YQUA 3KH9A 3KZQA 4MDCA 5HR3A 2H6ZA 3F6FA 3LSZA 4TW5A 4TR4A 5DQSA 4ECCA 4V1Ag 1XCCA 2DJ0A 2F3MA 2VCQA 4QL7A 3EMXA 4Q5FA 2DMMA 3QOUA 4DEJA 4Q5NA 3TUEA 3RHCA 3U5RE 1ON4A 2GSSA 2HNLA 3MWHA 3IE3A 3K8NA 4MZWA 4EXJA 5IPHA 18GSA 4TR0A 1ERUA 1ZYQB 4PQHA 1NW2A 5CAXA 4YQVA 2O89A 1B48A 3VLNA 2C1YA 1F37A 5H5SA 1X9WB 2FUG2 5ECLB 2ON7A 3QPMA 2C3TA 2F8FA 4KDXA 1FO5A 2L6CA 3A3TA 5CRDA 2N5FA 4F0CA 1G0TA 3GA4A 5LNKe 2C0GA 5DCGA 2AJQB 3TJGA 5J9CA 5EY6A 3D0ZA 1AIUA 3TRXA 4TXOA 1FVJA 5E4WA 4ZBBA 4I2TA 3SWLA 2PWJA 3O6TA 5IOWA 1KTEA 1FB6A 4KSMA 1QK8A 2O7KA 3PH9A 4JZQA 2X8GA 3GFKA 4HEA2 4KDYA 5DALB 5JWRB 3HHVA 3V1WA 2VLVA 1WOUA 4ZB9A 11GSA 1QGVA 3QAGA 4KA0A 3ZIVA 5F06A 5GAPD 4XS4B 1GULA 5J41A 2LRTA 4GQCA 3TCOA 5FT3A 1SYXA 2GDRA 3TKRA 2B7JA 4F03A 1YJ6A 1YDKA 5ECIB 3P7XA 2H71A 3FEUA 1G6YA 3CSHA 1RQMA 3GSSA 4POBA 3WYWA 1AW9A 1NSWA 2ALBA 4I2UA 2RM6A 2AYTA 2C0FA 2KLXA 1K0BA 1TRWA 2FHEA 4HZ2A 2L5OA 1AQXA 2M72A 4GSNA 3LQ7A 1B9XC 3D21A 2HI7A 2OE3A 2KHPA 2V6KA 3E9JB 2MMOA 2TRXA 4GXZA 5D8IA 4ZBDA 5B7CA 1ERVA 4PGTA 4KE3A 4EF0A 4XCSA 1JLVA 1YEXA 4FH8A 3I6AA 2VCZA 1Y25A 2WZ9A 1T4ZA 8GSSA 1J08A 3Q6OA 5AGYA 1J9BA 1YZXA 2L57A 3ZTLA 1XIYA 1PA3A 1GSFA 3GV1A 5B6MA 4PURA 1GNWA 3I43A 4E8HA 1MDKA 1S3CA 3EWLA 4OMVA 3DVWA 1E2YA 3F6DA 3LORA 1GLPA 3C8EA 4I5QA 4K0NA 3IAS2 1EEJA 5ABRA 2B1KA 4D73B 4LMWA 1JFUA 4AJ7A 2L4QA 5CRWA 4MMMA 3RPNA 1OAZA 5F8BA 1PN9A 4HZ4A 4Z7XA 1EV4A 2CVKA 1XBSA 1V9WA 1WJKA 2C8UA 2P5QA 3HVVA 5B8BA 5IIZA 2H6XA 1OKTA 5IO2A 4DSSA 5G5EA 3MAKA 4NMUA 2AHEA 1A2MA 3F3QA 3WD6A 3VWWA 4KX4A 3H1NA 5IQYA 1K3LA 4IS0A 2GSTA 3BOAA 3CBUA 3KP9A 2YJ7A 1SJ6A 1PD21 5ECOB 3F8UA 4GLTA 1WE0A 2YWIA 2H73A 4IQAA 2H1GA 5JWQB 2ZCTA 3KTLA 1O6JA 4ZBAA 3CMIA 1TK0B 3IXRA 19GSA 2C0EA 1M9BA 1VF1A 4NV2A 2VCWA 2FCHA 2HT9A 3IR4A 4ZXGA 4EL1A 3UL3A 2RUFA 2BMXA 5FWGA 2DJJA 3ZFBA 4HUAA 4Q5QA 3UARA 1EGOA 1OC3A 1EP7A 3CTGA 4XHMA 2B5YA 5KN1A 3TKQA 5GSTA 4XRAA 3TKSE 4OD7A 2IMIA 5KEJA 2I9HA 1X9MB 1R5AA 5GZZB 1TI1A 3DKSA 1O8WA 1GRXA 2PMTA 1OC9B 1FG4A 1F3AA 2H72A 4EDYA 3TRQA 4HU7A 4POKA 4X43A 4AF2A 2C3QA 1USBA 3L0HA 4V2NA 2IL3A 1TKDB 4DSRA 3ZREA 5CRHA 2PVQA 2DBCA 1WWJA 2C4JA 4MH3A 2CAIA 1XOBA 3EC3A 2K6VA 4MJEA 1V98A 2K8SA 4ML6A 1K0DA 2CT6A 1X9SB 2YJHA 4RI7A 4IKHA 2VL2A 1TW9A 3Q74A 2WJUA 2EIRA 2VAFA 5G5FA 3ED3A 4OFNA 1EWXA 4BPYA 1M99A 2ON5A 2F8AA 1PL1A 2MBSA 3TJFA 4NHWA 1JLWA 1K0MA 4MF6A 3TB2A 2HSHA 4KH7A 4RQXA 2E0QA 3KMOA 1K3OA 3HJPA 6GSYA 4J2FA 1THOA 4K7NA 4MP4A 4XS6A 3EE2A 1GTIA 4FYUA 3TJJA 4KNDA 1ZOFA 3TJBA 4O92A 2PUKC 4LMVA 5IOXA 1T1VA 2QC7A 2JACA 3F4TA 3TOUA 1B8XA 4OO5A 3C1RA 5COHA 4CW9A 1OE8A 2MMAA 2AV4A 3APSA 1SD8A 3LFLA 2VCTA 3A2WA 4J57E 1SL0B 5HR2A 2PBJA 5JCWA 1QXHA 1QFNA 3IK7A 3L78A 1GTUA 4G19A 1XOAA 3US3A 4E8EA 2V41A 1X5DA 2OE0A 1EGRA 4DVCA 2DJ1A 4NHZA 3ME8A 2H66A 5G1KA 2VL3A 1PGTA 1R7HA 1GSQA 2TRCP 2WULA 4TOPA 3GX0A 3LYKA 2FY6A 5D73A 3RBTA 4G2EA 2I4AA 3CYNA 4F82A 2JL4A 2RM5A 2FD3A 1S3DA 4P3YB 4FYCA 2O87A 2PPTA 2IMDA 4I97A 5JWOB 2H1DA 4MLYA 1A24A 2G0FA 1TRVA 1U6TA 1NHYA 2X8HA 3I9V2 3D6IA 2HRNA 2P0GA 3ZRDA 1M7TA 1XXUA 1ABAA 5C00A 3KIJA 4HQSA 3GSTA 2IMFA 2IPAA 5J4UA 3M8NA 1TRUA 5B8AA 2H0HA 1VF4A 1BG5A 5AISA 4O32A 2DJ2A 5A4WA 3LEFA 3BCKA 2I1UA 3VURA 4NXIA 3HY2A 1U87A 2KP2A 2HZFA 4KAEA 2X99A 1DUGA 1XZOA 3ZLPA 3IPZA 2AAWA 2GTUA 4N0ZA 1T8EB 3LYPA 1AC1A 3FY7A 1R26A 3O76A 2H19A 2WB9A 1ERTA 5ECQB 3GKXA 4BL7A 1SK0A 2YNXA 1IYHA 13GSA 4KB3A 3FZ9A 1OC8A 3MDKA 1E6BA 1A2JA 3UVHA 1VF3A 1WIKA 2VL9A 2MZCA 1BEDA 2AUVA 4V1Ap 1M9AA 5D9WA 1G7EA 1SJIA 1WPIA 1H75A 2WGRA 4MABA 5D9VA 2YV7A 2VOCA 1YKAA 4F0BA 1GWCA 4KCEA 1B4QA 2B3SA 2CX4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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