1NW2A

The crystal structure of the mutant r82e of thioredoxin from alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
ATMTLTDANFQQAIQGDKPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGEPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
publication title An integrated structural and computational study of the thermostability of two thioredoxin mutants from Alicyclobacillus acidocaldarius
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nw2A00
1O6JA 3J7Yb 5B6NA 1WE0A 2GS3A 2NVLA 2GZPA 5KN2A 1XOBA 2VD1A 5CRWA 4ML6A 4MF7A 3VLNA 3EWLA 2DBCA 3ZITA 3IOSA 1G6WA 2AUVA 1X9WB 2B7JA 4MH2A 1BYEA 3ME7A 4N30A 5AISA 1EV9A 1TI1A 2CT6A 2VL3A 3ZLPA 2VLVA 3FRCA 2CVBA 4ZL9A 4GSNA 2V2GA 4CW9A 4LA1A 2L57A 2OE0A 1S3AA 3ZMLA 4MF5A 1HNCA 2CVKA 3NOFA 2GTUA 3P90A 3EU4A 1QGVA 5GZZB 1DE2A 3IHQA 2ZNMA 1GSEA 1Q4JA 2F8FA 3CXGA 5COHA 4K7NA 1X0RA 4KSOA 4ZILA 1M9BA 3WGEA 1VF4A 1G7EA 4GF0A 3EMPA 4XTSA 3TJFA 5AN1A 1F9MA 5CRDA 3TKSE 5ID2A 1SL2B 1OC9A 4V1Ag 3GKXA 3GSSA 5ECQB 4V1Ap 1YZXA 4JU5A 3APQA 4DEJA 1SK0A 1M99A 5ECKB 5JWQB 3ISOA 3I69A 2PERA 1MEKA 4TR4A 2QSIA 3UEMA 1IYHA 3PINA 3GHAA 3VWUA 5IOWA 2XPEA 3H79A 2VIMA 2DJ1A 3IV4A 2H6ZA 4NHZA 5AGYA 3QMXA 2VD0A 4JRRA 1O81A 1Z5YE 2FWEA 2A4VA 4LL1B 5J9BA 1ON4A 2H01A 2YJHA 3ERFA 1T00A 2HRFA 3QAGA 2LEGA 4L5LA 1X5EA 4ECCA 2IFQB 2FA8A 1EP8A 1Z7RA 4XS6A 1YKCA 2PPTA 2J23A 3ZRDA 4OFNA 2GSSA 5G2ZA 2MMNA 2NDOA 2H66A 3GTUA 5LD0A 3TRQA 1GL8A 4EE0A 4RI6A 1AIUA 3D5JA 1PN9A 2HNLA 4PUAA 5LNKe 1VF1A 5G5FA 4N10A 1OVNA 1O8XA 1SD8A 5G1LA 3R2QA 4GSTA 3L9VA 2C0DA 2NBSA 5LCZA 2PBJA 2LUSA 3MSZA 1RK4A 3F4TA 1U3AA 4O7HA 1ERVA 1MDIA 3F6FA 2LJRA 2LSTA 1DBYA 3RHBA 3VWXA 3RAZA 4KDYA 1AAZA 3TKSC 3HVSA 2XBIA 3GX0A 2EIRA 1VF2A 1EGRA 1T7PB 1K3LA 2WCIA 3GV1A 4KH7A 1J08A 5D93A 2X8GA 3C8EA 1BQ7A 3MNGA 2AJQB 4HDEA 1A23A 3I43A 2WULA 1V40A 2QKEA 1V57A 3VPQA 4EC0A 2GQLA 2TRCP 3KP9A 4TRXA 1QMVA 4ZB6A 1Z6MA 1KBNA 1VRSD 5H5SA 3F63A 3VFIA 3RDWA 4RQRA 3D21A 4EDYA 4PURA 3L9SA 4F9ZA 4BPYA 1X5DA 5B8BA 5H5QA 4MPGA 5FHIA 2N5BA 1V98A 3CRUA 2OKAA 1DUGA 2AHEA 2KP1A 4XS4A 5INYA 3F0IA 1GUHA 1YF1A 1I5GA 2H76A 5ID2B 1OC9B 3GH9A 1CQHA 1F6MC 3CBUA 4KE3A 4BA7A 3HZ4A 2PVQA 1N8JA 2YN1A 2GLRA 2CAIA 5HR3A 4WKWA 3TUEA 3D6IA 1C72A 4FYUA 4I97A 5CRHA 3M1GA 3APSA 2ON5A 2VL2C 3EC3A 4MJBA 2AAWA 2O85A 2GSQA 3KH9A 3TJKA 4YAPA 1XFLA 2YOIA 3QDNA 1S3CA 2DMLA 1B9XC 1CQGA 1K0AA 4J57E 1PKZA 5KN3A 2AV4A 3GSTA 4IKHA 1TRVA 2B1KA 3M3MA 2HYXA 3GTUB 2WZ9A 1FHEA 1TK0B 1AUCA 1FO5A 1Z6NA 1EGOA 4IVFA 2QC7A 2HRNA 3LORA 1M9AA 2L4CA 4XRAA 3ZTLA 5ELGA 1GLQA 4FIWA 2YJ7A 1U88A 4N0ZA 1ST9A 3I9V2 2A2SA 4MP4A 3HJOA 3UARA 4KA0A 1TRWA 2KUCA 1J9BA 2JL4A 4G9HA 1T4YA 3KTBA 2VM2A 5JCWA 5ECOB 3WGDA 3LYKA 3LEFA 13GSA 3LGCA 4Q5RA 4ZB9A 2IMEA 2G0FA 2L6CA 2H1GA 4BWQA 4ZBBA 1TXXA 5B8AA 4KX4A 4XIHA 1NSWA 5ECMB 1GP1A 3TRPA 4NMUA 3PH9A 2E2MA 3FZ9A 4TW5A 4IELA 3F4RA 3VWWA 2KP2A 5ECSA 4TXOA 5D9TA 2MZCA 3JCML 19GSA 2C80A 4EKZA 4BL7A 2LQQA 4KCEA 4DSQA 4G2EA 3RHCA 5HR2A 1A0FA 3C71A 4WEYA 1F2EA 2C1YA 2CX4A 4D73A 1ILOA 2CA8A 5G1KA 2VCXA 1WMJA 1WWJA 3G7IA 4HQSA 4YH2A 2FWGA 4MJCA 3PGTA 2HSHA 4HU9A 1FOVA 2ZUPA 4RUVA 1OC3A 4KW6A 4XS4B 3HVXA 3I6AA 3L78A 3P2AA 2E2GA 4IGJA 4TN8A 1ACVA 2CV4A 1YEXA 1MDJA 2H8LA 3EE2A 2C3NA 3CTFA 5HQPA 2VCTA 4XRDA 3FZ4A 3TJJA 2L5OA 2H0HA 2WRTA 1OKDA 2R4VA 4QL9A 3FR9A 5DQYA 1WIKA 1AQXA 1OC8A 1JZDA 3UVHA 4JR6A 1YJ6A 4OFTA 1A0RP 2GDRA 3ED3A 3IC4A 1XVWA 3H8QA 4AJ7A 2OE3A 4PNGA 1SL0B 2R37A 5DJMA 6GSUA 2EC4A 1TTZA 2HSYA 4IQAA 3HY2A 3TB2A 1HQOA 3GURA 2FA4A 4GTUA 2VLTA 3FY7A 1PA3A 3DEXA 4OCFA 4PNFA 4ZL8A 2MMZA 3KD0A 4MPFA 4ID0A 3OR5A 1RQMA 4KGIA 5DQSA 4E8HA 1SL1B 2VCQA 4AF2A 2FNOA 3A3TA 3FEUA 1UC7A 1GSSA 4TR0A 3ZIVA 2AB6A 3FKFA 3KZQA 3KMNA 2GVPA 2F51A 2XPDA 4KDUA 2E0QA 1QXHA 4BVXA 3FK8A 3WYWA 3SWLA 3Q18A 1AC1A 1OAZA 2GSRA 1XOAA 5F8BA 4ACSA 2DJ2A 1ZCPA 4ILFA 1GSQA 2YP6A 4ZBAA 3DKSA 3BJ5A 1ZL9A 2IPAA 3FR3A 1XWAA 2B5XA 2KHPA 4X1UA 2FY6A 1MDKA 4Z7XA 1LBKA 5DBQA 1Y6EA 4DVCA 1H4OA 2LKUA 1LJRA 2EIOA 4XCSA 1F3BA 5C00A 1WOUA 2FUG2 4N11A 1X9SB 4KDXA 2YCDA 4TR1A 1EEMA 4QL7A 3M0FA 4TXOB 5CAXA 2JZSA 5GSSA 1EP7A 3QCPA 3M8NA 3GKMA 4PXOA 3F3QA 3UMAA 4OO4A 2BJXA 1B4QA 2GZYA 1O7UA 4HI7A 3A2XA 1PSQA 11GSA 1TI3A 3W6GA 2IIYA 2KLXA 2L6DA 5D96A 3BCKA 2DJ0A 2H30A 5HFIA 2NTOA 2IN3A 4KAEA 4K0GA 1XPVA 2H19A 20GSA 1EOHA 1SYRA 2FCHA 3TJBA 2GZZA 3TOUA 5ECHB 2IMDA 2NPBA 1XBSA 1OE7A 5EY6A 2AYTA 4L0WA 1M0UA 3Q6OA 5EVOA 3EMXA 1QFNA 3VWVA 3DVXA 4IJIA 5JWRB 1K0BA 1B9YC 3M9JA 1XXUA 5DALA 4GCIA 4E8EA 5JCUA 2K6VA 3F3RA 2JADA 1EZKA 3GL5A 2M72A 4WR4A 9GSSA 4F0CA 2XBQA 1GUKA 2X99A 2HI7A 4POLA 3CSHA 2R3XA 4F82A 5DJLA 3SBCA 1DSBA 4MMMA 1N2AA 3ERGA 1URMA 4F2IA 2LRCA 5IPHA 3WT2A 1R26A 2PVOC 2C0FA 3G7YA 3GKKA 4G10A 3U5RE 4NHWA 3GH6A 1YF0A 3GMFA 1NW2A 3HKRA 3ZZXA 1JZRA 3TRXA 2DSAA 4IS0A 3GA4A 3FZAA 1TOFA 1GTBA 14GSA 3DMLA 3F9UA 1TDIA 1PKWA 5D9WA 2K8SA 5C04A 4KCAA 2VOCA 2B6MA 1AXDA 2H1AA 1ERWA 4X0XA 4ZL7A 2B5YA 2ALBA 5ECLB 4GSSA 4H86A 3KMOA 4MZBA 1YEPA 3FW2A 2YWOA 1KEBA 3GL3A 2ES7A 1M2BA 1SJ6A 2LRNA 1PX6A 2OA7A 4XHMA 2F9SA 5IPGA 3O6TA 5IMDA 2H73A 4ML1A 4I2UA 1BAYA 1UVZA 2GQKA 1O8WA 4CHSA 4PQHA 5B7CA 2I3YA 5D9VA 1OKTA 2VCVA 4POMA 2EIQA 2H6YA 4TR1B 1A2LA 1ZGNA 2JZTA 4GLTA 6GSYA 3ERWA 1GUMA 5IMVA 4GQCA 2FHEA 4MDCA 4EXJA 4F03A 2LNSA 2A2RA 3HA9A 4MLYA 5DAKA 5IM9A 3A2VA 2CVDA 1PL1A 3BD2A 16GSA 2VL9A 1EWXA 2CX3A 2OBIA 2H72A 2ON7A 5HR0A 4TR3A 4GWRA 3D0ZA 3ZREA 4BVYA 2VM1A 1FAAA 3MDKA 1FG4A 1T1VA 3DRNA 4O32A 2DJKA 2C3QA 3ZFLA 22GSA 3QD9A 3Q19A 3TKRA 3IR4A 1XIYA 1K0DA 3ZIJA 2MYGA 5FWGA 2X64A 2JSYA 2P5RA 1TRUA 5J9CA 3UL3A 2CQ9A 3KTLA 1OE8A 5CNWA 1T3BA 5HR1A 4IHUA 2R5GA 4I5QA 1XZOA 3LQ7A 1GSDA 2P31A 1R7HA 3L9UA 4ZXGA 4TOPA 3C1RA 4F0BA 1Z7PA 4OO5A 1PGTA 4K8MA 3WGXA 1XWCA 4G19A 3LJRA 8GSSA 4WR5A 2I81A 3VURA 1TRSA 4K9ZA 1OYJA 1GWCA 1M2DA 3ZL5A 3DXBA 1WRYA 5D9XA 4J2FA 4OCEA 2XC2A 2N5AA 4TXVA 3UVTA 4MCUA 4NV5A 2C3TA 1JFUA 4MZWA 4IJ3A 3Q74A 1WJKA 1YKAA 1H75A 2M46A 1BJXA 2R2JA 4JZQA 4ZB8A 4GRFA 3LG6A 3CMIA 3IRAA 2B5EA 6GSTA 3EU3A 1FB0A 4YAVA 1ZYEA 1ZYQB 6GSWA 1AQWA 3GRXA 3TDGA 2H0GA 1TJDA 3F4SA 3P8WA 1ZMAA 3CSJA 2P0GA 3APOA 3KJYA 1SK2A 2WFCA 1XW6A 3KCMA 1X5CA 5G5EA 1K0CA 3RPNA 2C8UA 4OFMA 3IPZA 2JSZA 3KP8A 2HZFA 3G9BA 5ELAA 3C73A 4NXIA 3IAM2 1XW5A 5CYYA 2GT5A 4K6XA 2V6KA 5JCGA 5ECNB 3HHVA 3W8JA 2O87A 2DLXA 3LYPA 4JE1A 1JLVA 2H0IA 4EF0A 4HJ2A 2GQMA 4JEDA 3UIWA 4K2DA 3N5OA 2C0EA 2D2ZA 3LXTA 5DVBA 2MMOA 1M7TA 3ZVJA 1PX7A 4N0VA 4DSSA 2H1DA 5IMCA 4XS1A 3GIXA 3CYNA 4WBRD 3AY8A 2RIIA 3J7Yk 2P5QA 2VL2A 1J0FA 3HJPA 2LTKA 5F06A 1SJZA 1ZZYA 1RW1A 2X8CA 1A8YA 1R5PA 3BBYA 1B48A 5J4UA 2DJ3A 4MF6A 2LNTA 4ULXA 4POKA 4MJEA 2YWMA 1YQ1A 4Q5FA 1LU4A 3UBKA 2GT6A 1NHYA 2VAFA 1DE1A 12GSA 5EL8A 2WJUA 1S3DA 2OE1A 2QGVA 4RQXA 2FWHA 5ABRA 4X43A 2VCZA 4POBA 5A4VA 4L8EA 2IMFA 2IMIA 5DCHA 1XVQA 3MWHA 4WETA 5CRGA 4K7OA 3H93A 3IK9A 1TP9A 1ABAA 2B7KA 3ZVJD 4MH3A 3QFBC 1BEDA 1AQVA 5J3RA 2L4QA 3HXSA 2OBKA 2PGTA 2O7KA 1SJIA 3TOTA 3GX8A 5IO0A 1Z3EA 1FW1A 2K8VA 1A24A 3GN3A 4V2LA 3UOMA 4IW9A 3TKQA 3ZFBA 5B6MA 3DD3A 5ECRB 2LJKA 5CP1A 5KN0A 3DWVA 3IXRA 1USBA 3VK9A 5DCGA 1GNEA 4HS1A 3CTGA 3D22A 2GGTA 5DDLA 2CZ3A 3W8SA 2DC5A 3IDVA 1K3OA 3UAPA 4YQVA 3LXZA 2ZCTA 1WPIA 3HVVA 2HLSA 4GQFA 1PQNA 4D73B 4IP1A 2PN8A 5CREA 2HT9A 1KNGA 4KUNA 4AGSA 4FH8A 1V2AA 1U87A 3RBTA 1K3YA 2J9HA 5AIVA 2JU5A 2WGRA 1ML6A 4K7IA 1ERUA 2HXKA 5A4WA 3QPMA 4J56E 2YZUA 3FHKA 5IMFA 2VCWA 2DMMA 1R4WA 1GSUA 1EOGA 4PGTA 1IYIA 5J41A 2BMXA 2I1UA 5D8IA 5IIZA 5L71A 1M2AA 4DSSB 3FZ5A 3GKNA 2YWIA 4Q5NA 1GTUA 1PRXA 4V2MA 4LLRA 3FYGA 1MTCA 4YQUA 1SU9A 1TK8B 4RI7A 3PR8A 4I8BA 4ECJA 3DYRA 1EV4A 1JLWA 3FR6A 2BTOT 5HFKA 1X9MB 1XWKA 2F8AA 1TU7A 3KH7A 1TKDB 1A2MA 3KXOA 2L59A 2RUEA 4HOJA 3HCZA 4PQ1A 3BOAA 1PL2A 2LJAA 3DVWA 4HQZA 5GSTA 4KNDA 2YWNA 3NIVA 2VLUA 4K1FA 4EDZA 1ERTA 5EPFA 6GSXA 3QFAC 5FT3A 1JHBA 1GRXA 3H1NA 1B8XA 1PD21 4IBPA 2WB9A 2VO4A 4I6XA 3C1SA 1G6YA 1UN2A 1QK8A 4KB3A 4HZ2A 1GNWA 2C0GA 2RUFA 3QAVA 4IP6A 2JZRA 4L0UA 3CSIA 1BG5A 3D4MA 3GNJA 1NHOA 3IK7A 2B3SA 3F6DA 3L0HA 1T8EB 4OWYA 2DIYA 4FYBA 3KEBA 5F07A 5ECIB 2DJJA 2H1BA 3TKPA 1QUWA 3C7MA 3HD5A 2N5FA 2XHFA 2FD3A 4QQ7A 2V41A 4FO5A 1GTIA 2H70A 4WF5A 2V6OA 1HD2A 2DIZA 4EO3A 4GXZA 5HFGA 5J5NA 3MAKA 4OMVA 1U6TA 1T4ZA 4OD7A 3VPTA 5E59A 3VI7A 1TK5B 1XWGA 1TU8A 3KM6A 1B4PA 3K8NA 2RM6A 2HZEA 3WT1A 3P7XA 5JWOB 1E6BA 1PMTA 5D73A 2MBSA 1MD4A 1ZOFA 1MD3A 4MA9A 1GULA 2H6XA 4WXTA 3GUSA 2KOKA 3IE3A 4HUAA 17GSA 1EEJA 1VGLA 4LMWA 1R5AA 3UJ1A 2YANA 1GTAA 3D4TA 4DSRA 2H75A 1U3IA 3TJGA 3QR6A 2YPMA 3IA1A 4MK3A 1SKSB 2LS5A 5DALB 2TIRA 3A5WA 1KTEA 1XWBA 1FVJA 4PQIA 1THXA 4ECIA 2OJLA 1XW9A 3O76A 1O85A 4L5OA 4NV2A 3LWAA 4PX1A 3US3A 4NAXA 1TW9A 5H5RA 4O92A 2WDUA 4ECBA 4EL1A 1JZOA 3S9FA 2PMTA 3L4NA 3O3TA 2YV7A 3LFLA 4TVEA 4EUYA 2PU9C 5ENUA 1BX9A 1NM3A 2Z9SA 2OACA 1SYXA 5G31A 1JZWA 3HDCA 1W4VA 1GSFA 1GSYA 4BWSA 3EINA 3QAWA 1FVKA 3KIJA 3HYPA 5IMZA 1THOA 2I4AA 3TCOA 1W89A 3TKSA 4TKYA 3QOUA 2YV9A 1F37A 4ISDA 5KN1A 4FYCA 1O73A 1A8LA 4LL4B 1A2JA 3V1WA 5G30A 2H74A 2CZ2A 2R6KA 3HJMA 3E0UA 2IMKA 4CDOA 5IMAA 1YDKA 4HJMA 3EURA 2FGXA 4EVMA 2V1MA 5F05A 4AJ6A 3BCIA 2K18A 2B1LA 3IBHA 2YZHA 5F0GA 5A5KA 10GSA 1V9WA 1HYUA 2X8HA 4MJAA 1YY7A 3VI5A 3IAS2 4V2NA 2O8VB 3GYKA 4IQ1A 2HZEB 3F8UA 3EVIA 18GSA 1SKWB 3GFKA 2VUPA 5DAKB 1HNAA 4WF4A 1SD9A 2L5LA 3ZYWA 1WP0A 1AW9A 4HEA2 4AJ8A 5ECPB 3CRTA 1QQ2A 2LRTA 2LQOA 2O89A 4YQMA 3EYTA 3A2WA 5IOXA 1GH2A 2CAQA 2K9FA 2YNXA 4HU7A 4MABA 2LV3A 5A4UA 2HE3A 2F3MA 4P3YB 1I9DA 3DGQA 2I9HA 2IJYA 1K0NA 3E9JB 1V58A 2MBTA 4I2TA 4ZIJA 2H71A 2TRXA 4PUFC 3DIEA 1SKRB 4K0NA 4JBBA 1K0OA 4O5RA 1K0MA 2C4JA 1E2YA 1G0TA 5KEJA 1G7OA 1SENA 4NWYA 2FWFA 4LMVA 5E4WA 5IO2A 4Q5QA 2RM5A 3ZMKA 2FLSA 6GSVA 4MZCA 1F3AA 1Z9HA 7GSSA 1FB6A 2MMAA 2IFQA 2PUKC 2V32A 2G2QA 1Q98A 5GAND 3U6VA 2M80A 3ME8A 1GLPA 3LSZA 3NZNA 3TGZA 2IL3A 4NPBA 6GSSA 1UA5A 5GAPD 5IQYA 2E7PA 2RLIA 1Y25A 3WD6A 3HZ8A 4WBJA 2PWJA 3UBLA 1HNBA 3KGKA 2JACA 2REMA 4JR4A 3RPPA 5CO3A 4IN0A 4KSMA 4HZ4A 3H4KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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