1A8Y | Genus

Total Genus 87

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	87
sequence length	345
structure length	338
Chain Sequence	GLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSIYVFKEDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKNKDSEHYKAFKEAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGYEFLEILKSVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEPSAEELEDWLEDVL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	CALSEQUESTRIN
publication title	Crystal structure of calsequestrin from rabbit skeletal muscle sarcoplasmic reticulum. pubmed doi rcsb
molecule tags	Calcium-binding protein
total genus	87
structure length	338
sequence length	345
ec nomenclature
pdb deposition date	1998-03-31

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1a8yA03
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1a8yA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1a8yA02

5JCUA 4EKZA 3GKXA 2GS3A 4HS1A 3G7YA 2H0HA 3G7IA 2GQMA 4F82A 4K7IA 4XS4A 2VCWA 4ZILA 1SK0A 4X0XA 1O6JA 3F4TA 5HFKA 4JU5A 1OC9A 1XWCA 4N0VA 4NV5A 2X8GA 4IGJA 2K8SA 4OO5A 1GSUA 3D0ZA 1NHYA 3KCMA 3KTBA 4JR4A 2ES7A 4QL9A 1MD3A 2QC7A 5KN1A 4L0UA 5AISA 3FEUA 1NHOA 2YN1A 8GSSA 2K9FA 3MSZA 3FR6A 4GTUA 3TRXA 3CRTA 3DRNA 4HI7A 4JR6A 4MA9A 2LJAA 1R7HA 2CAIA 4ZB8A 5CRHA 1SJ6A 1AQXA 5DJMA 1JZRA 4D73B 4KSOA 1SKRB 1BYEA 4MJEA 2E7PA 3GX0A 3ZYWA 2H73A 2QKEA 3A2VA 19GSA 3ME8A 2H72A 4KH7A 2KLXA 3FZ5A 3GA4A 2VCTA 3K8NA 2DJ3A 3FW2A 2CZ3A 3H4KA 2O85A 4K7NA 1UVZA 1HQOA 4ISDA 3IAM2 4YAPA 3TOUA 1FO5A 2TRCP 3GL3A 1O81A 1SD9A 1XOAA 4GSTA 1PKWA 1GUMA 4NHZA 4MPFA 3F0IA 1YKCA 4WF4A 5AGYA 3W8SA 1GP1A 2JZTA 1RK4A 4HZ4A 5IMAA 5KN2A 1JZWA 3AY8A 3DXBA 1Z5YE 5GSTA 3RPNA 2VLUA 1EEMA 3VWXA 4TXOB 1ST9A 4FYBA 2ZUPA 5IPGA 4NV2A 3GX8A 1GSQA 3HDCA 2FNOA 3UMAA 2IFQB 2CA8A 3N9JA 3GV1A 3KIJA 2L4CA 5ELGA 1OAZA 4KE3A 2DJJA 3GURA 1FB0A 4EC0A 2YNXA 1G0TA 2DIYA 4IVFA 2JZSA 2X64A 1QQ2A 4KCEA 4HU7A 1SKSB 5J4UA 4XHMA 2K8VA 2IJYA 2VCVA 1X5CA 1YJ6A 4IKHA 2I81A 1T1VA 2GQKA 2GLRA 3O76A 1MD4A 1UA5A 5ECSA 2L4QA 4PNFA 5C04A 2IMEA 1TK0B 4HU9A 4PUAA 5JCWA 2PVOC 3LQ7A 1OC8A 3RAZA 1AW9A 1TDIA 2TIRA 5ELAA 1ZMAA 3FY7A 4GRFA 2HLSA 3I6AA 9GSSA 2P5QA 1QGVA 2B6MA 3DYRA 1Z3EA 4WF5A 2P0GA 2JU5A 4WR5A 1VRSD 1SENA 3LFLA 1THOA 3HHVA 1M2AA 4J2FA 1NSWA 4ECCA 5H5RA 3EU4A 4WBJA 4E8HA 1HD2A 3QAWA 5CNWA 3UBKA 1N8JA 1XCCA 1WE0A 5ECKB 2LQQA 4RUVA 3TDGA 3NOFA 2L6CA 2RM5A 1SKWB 3TB2A 2JL4A 2VD0A 1XPVA 3PINA 3VWUA 2FLSA 3GRXA 4GCIA 2DJ0A 3KJYA 2WZ9A 4V2LA 1TP9A 5B8AA 2I1UA 4MLYA 4AJ8A 2H1AA 2PU9C 2VAFA 1GSFA 1EP8A 4ILFA 2GGTA 1E2YA 4ZBDA 1HNCA 5FWGA 4EDYA 3PH9A 5D96A 1K0MA 2GT6A 2ZNMA 4F2IA 1VGLA 2V32A 5F8BA 3TJJA 4WBRD 3TUEA 3HJMA 1B48A 1ON4A 1XIYA 1LBKA 4OCFA 4NXIA 2L6DA 1PL2A 1JZDA 1HNAA 3HKRA 5ENUA 2VCZA 4L0WA 2GSQA 1MEKA 4XCSA 5DAKA 4EE0A 1YY7A 2IIYA 3LXTA 1XW9A 2OA7A 4OFTA 1FHEA 1GLQA 4O32A 5H5SA 3LG6A 5KN0A 2V2GA 3QAVA 5E59A 5IMCA 4IP1A 1YQ1A 4GSSA 2FCHA 4POBA 4RI6A 3H8QA 2BJXA 1KBNA 3TRPA 3BOAA 1PX7A 1U6TA 5FHIA 2MMZA 2AHEA 3KEBA 2PGTA 1GULA 1W4VA 2YZHA 2VOCA 3ZIVA 4HZ2A 2IMIA 2BTOT 4ULXA 1TW9A 3MNGA 1SU9A 3UIWA 4J57E 3M1GA 1PA3A 3HJOA 2O89A 2IMDA 4ID0A 7GSSA 1EV4A 3G7JA 5ECNB 4IP6A 2C0DA 2GZZA 3TJBA 3IA1A 2DBCA 2MBSA 3KM6A 3IV4A 1SL0B 1K0CA 4ZB9A 1J08A 2RUFA 5L71A 4GQCA 3RHBA 1ML6A 3L4NA 5JWQB 1ZZYA 2V6KA 1K3LA 1TXXA 3W6GA 2YWIA 1PD21 4OFMA 2H01A 3LYPA 4XRDA 4ZXGA 3P90A 3L78A 2FY6A 1AQWA 3U5RE 3M3MA 3VURA 3D5JA 4POLA 2LRTA 2PUKC 4YQMA 3R2QA 2KHPA 3QCPA 1PQNA 3GIXA 4MABA 3CTFA 4PX1A 1AUCA 3GKMA 3IDVA 4Q5QA 3UAPA 1AQVA 4GXZA 4TOPA 1F6MC 3EWLA 3PGTA 2OKAA 4ACSA 5D8IA 2GSSA 2EC4A 1NM3A 1J0FA 4RQXA 3W8JA 3FYGA 3F3QA 1EWXA 4JE1A 2HI7A 4L8EA 4DSSB 2H6XA 2OE3A 1USBA 2GSRA 4LMVA 2HSYA 1EGOA 5ECOB 4EO3A 3D4MA 1MDIA 2AB6A 4G10A 1MTCA 3H1NA 4F03A 1Z7PA 2HYXA 3VPTA 1Y6EA 3EU3A 4HDEA 4LLRA 4AF2A 4BWSA 2CX4A 3IPZA 1N2AA 3DVWA 5A4WA 1O85A 5ABRA 2KP1A 5AIVA 1DE2A 4I2TA 1V57A 4ZBAA 5ID2A 2HZEB 3GTUB 2YZUA 3UVHA 3ED3A 1B4PA 3TOTA 5G5EA 2B5EA 5LNKe 2OADA 4ZL7A 2XBQA 4G2EA 4GSNA 4L5LA 3PR8A 1AIUA 2GDRA 2F51A 2OACA 1PX6A 1ABAA 3ZIJA 1PL1A 1A23A 2DJKA 5B6MA 3GH9A 1GNEA 6GSUA 1VF1A 1A2LA 3DMLA 4EDZA 3GSTA 1XW6A 3D22A 4TR1A 3S9FA 1AXDA 4IJ3A 4ECBA 16GSA 1H75A 2LNSA 2OE1A 3C7MA 3ZL5A 2H0IA 1MDKA 4LL1B 1GRXA 3LYKA 4LL4B 5LCZA 4V2NA 4MJCA 1ERWA 1GUHA 3O3TA 3FZ4A 2FA8A 1YKAA 17GSA 2JADA 2YV7A 3FZ9A 5H5QA 1RQMA 4KX4A 4GF0A 2FWGA 2B1LA 1YEPA 3TJKA 2FWEA 4MDCA 3TKQA 4NAXA 1JZOA 5FT3A 3HXSA 2OBKA 4OWYA 2ON5A 3ZMLA 2WGRA 1AC1A 3CMIA 1M7TA 3FRCA 2H74A 1T00A 4PNGA 1GTIA 1C72A 3TKPA 3CSIA 2H76A 1K3YA 3TKSA 1Y25A 3ZLPA 3GHAA 3HD5A 2YWNA 5IPHA 3TJGA 2AYTA 1G6WA 3N5OA 4TR3A 2H0GA 3DIEA 4FYUA 4BVYA 5F05A 5ECIB 2YJ7A 5ECHB 3VWWA 3WD6A 1Z9HA 4YQVA 4O92A 1XWAA 6GSVA 4O7HA 4AJ6A 3KTLA 3UOMA 3FKFA 3ME7A 3CTGA 3TKSC 2C4JA 3KXOA 4JBBA 2R3XA 1R5AA 1JHBA 5C00A 1QUWA 2C0GA 4KUNA 2M46A 3F6DA 2WJUA 2YOIA 1KEBA 1YDKA 2VD1A 1XW5A 5HFGA 5HFIA 2GZPA 4KGIA 2A2SA 3GFKA 1OC3A 4I97A 1TTZA 1PGTA 2IL3A 1G7OA 4I6XA 3Q74A 4LMWA 5DCHA 4G9HA 1QK8A 3A2WA 3IOSA 1WIKA 4OCEA 5D9VA 1JLWA 2H8LA 4XS1A 1F2EA 5COHA 4BL7A 3F3RA 1BAYA 5CAXA 4TXVA 1EOHA 3IBHA 4X1UA 2IWTA 3CRUA 4IS0A 5J9CA 3M0FA 5DALB 1A24A 5ECQB 3BD2A 1M0UA 2HXKA 3RBTA 2HZEA 2I4AA 2OJLA 2IMKA 3US3A 3GTUA 12GSA 1M9BA 2H1BA 3F8UA 1X5EA 2N5FA 6GSSA 2H30A 2LRCA 2PPTA 2IN3A 2H75A 4F0BA 1A0FA 1V40A 4MZBA 3IAS2 3CXGA 2FGXA 2QSIA 2XBIA 4TR4A 3C71A 4MPGA 3KH7A 4FH8A 3EVIA 1K3OA 5LD0A 1KNGA 2XHFA 2B5YA 2DMMA 2R5GA 2G0FA 3KMNA 3QPMA 6GSXA 2NPBA 2V1MA 5D9XA 6GSTA 1A2JA 3ISOA 2MZCA 1TRWA 3A3TA 1V58A 3ERFA 3EE2A 2H6YA 1T8EB 1R4WA 5CRGA 5DBQA 2AV4A 4J56E 1V9WA 3ZFBA 2VL9A 3UVTA 3J7Yk 3FZAA 2LUSA 2ZCTA 4CW9A 4NPBA 1WOUA 3QAGA 5EVOA 1ZYQB 5ECPB 1PSQA 4HOJA 4D73A 3HVVA 4F0CA 3FR9A 4K8MA 1S3AA 2CZ2A 3L9SA 4KDXA 1O8XA 4XTSA 4MZCA 3RHCA 2C80A 3Q18A 4PQ1A 1YZXA 4MH2A 1SJIA 4YH2A 2X8CA 3WT2A 4KDYA 3M8NA 2FHEA 5D93A 2YP6A 4XRAA 10GSA 4XS4B 1SL1B 3D6IA 4KB3A 3IK7A 5EL8A 4POMA 4DEJA 3UEMA 4MF6A 4F9ZA 1DBYA 1TRUA 1XXUA 3WGXA 1OC9B 2K6VA 2GSTA 3I9V2 4CDOA 2YJHA 2WRTA 4Z7XA 5IMZA 2B7KA 1X9MB 3VPQA 3P2AA 5DJLA 3GNJA 4TXOA 3TKSE 4ML1A 1V98A 2L5OA 4Q5FA 4Q5NA 3TKRA 1FG4A 4WEYA 1OE7A 2R6KA 2IFQA 3HZ4A 4KDUA 3UBLA 4DSRA 2WB9A 5J9BA 1V2AA 4KCAA 4K6XA 2LRNA 2LNTA 3P7XA 4ML6A 1A8LA 4K0GA 4FO5A 2EIRA 1GTBA 2F8AA 3LJRA 5GAPD 2LSTA 3HY2A 1XBSA 3QR6A 4N30A 1O7UA 1U3IA 3NIVA 4ECJA 1LU4A 3APOA 2FWHA 2L57A 1GTAA 1YF0A 3ZRDA 2YANA 2FWFA 5IMVA 1ERVA 4K0NA 2DJ2A 2VLVA 5G30A 4I5QA 1K0BA 3IC4A 4V1Ag 1Z6NA 3TJFA 1XFLA 2EIOA 2RM6A 5G5FA 5KEJA 1G6YA 4V2MA 3TCOA 1FOVA 3KH9A 5EY6A 1TI3A 5DALA 5CO3A 1B8XA 4IQAA 4BPYA 4ZL9A 4MH3A 4L5OA 2PWJA 4XIHA 2WS2A 4XS6A 4MK3A 4PQIA 4NHWA 2HFDA 3NZNA 4HJMA 4YAVA 4X43A 4K1FA 3M9JA 1FW1A 2WULA 13GSA 3ZREA 1F3BA 3WT1A 4WKWA 1PN9A 3QMXA 4GWRA 1S3DA 2OBIA 2DIZA 2P31A 4EL1A 1XOBA 4GQFA 1GSDA 1NW2A 1TRSA 11GSA 1WRYA 2O8VB 1VF4A 1M99A 1GSEA 4I8BA 1ERUA 5G1LA 1TU7A 2CT6A 3D21A 1TOFA 4ZL8A 1T7PB 4BWQA 5IQYA 1XWGA 2XC2A 3VWVA 2J9HA 3FR3A 5CYYA 1GLPA 4PURA 4HUAA 14GSA 2YWOA 2NVLA 5CP1A 3LGCA 2MMNA 3EMXA 4KA0A 1S3CA 2C0FA 2F8FA 2H66A 1ACVA 5ECLB 2REMA 3BBYA 3WGEA 2C3NA 3L9UA 5JCGA 3KP9A 1SL2B 3A5WA 1GL8A 2N5AA 2FD3A 1IYHA 5JWOB 3DEXA 4HEA2 4EF0A 1XVWA 2MMAA 2YV9A 1CQHA 3ZTLA 4OD7A 2LV3A 4MJBA 3LEFA 1XWKA 2LEGA 2WCIA 5J41A 5IMFA 2I3YA 3HYPA 3QDNA 4H86A 4MF7A 4TW5A 1M2DA 4AGSA 4RQRA 3VK9A 4TVEA 4I2UA 1GH2A 3KP8A 1GSSA 2NDOA 3C8EA 2GZYA 3RDWA 4K9ZA 3F9UA 2XPDA 1FAAA 1TRVA 4N11A 4TR0A 2C1YA 3WGDA 4BA7A 4OO4A 1EGRA 3EC3A 3EURA 4KSMA 1I9DA 2PBJA 1ZGNA 3G9BA 3P8WA 1GNWA 1X9SB 1SYRA 4HQSA 5KN3A 1O8WA 3MDKA 1SJZA 3C73A 2DJ1A 1K0DA 3IRAA 4IN0A 4IJIA 1TJDA 2P5RA 2F3MA 2Z9SA 22GSA 2AJQB 1LJRA 1F9MA 2L5LA 1EOGA 2E0QA 2VUPA 1SK2A 2LJKA 3U6VA 1TKDB 5HR2A 2E2MA 4AJ7A 4V1Ap 5IM9A 1OKDA 5HR0A 3QFAC 3HCZA 3LSZA 3C1RA 5DAKB 2MMOA 1EV9A 3KZQA 2OE0A 3ZVJA 1OE8A 3I69A 3L0HA 2CVKA 1E6BA 2F9SA 3L9VA 3GKKA 1U87A 2N5BA 2VIMA 3H93A 1SK1A 4N10A 4K7OA 2GT5A 3MWHA 1ZYEA 2RUEA 4HJ2A 3E3EA 1JFUA 2A4VA 4MZWA 5A4UA 5ECMB 2EIQA 3IE3A 2VLTA 5DDLA 2M80A 3GL5A 2V41A 4DSQA 3I43A 3CSHA 5CREA 1BG5A 2H1GA 4IBPA 2YPMA 6GSWA 2HSHA 1TK5B 2JACA 1B9XC 3V1WA 1WWJA 3FHKA 4E8EA 2QGVA 1QMVA 1F37A 2FUG2 3ZITA 1RW1A 5DCGA 4DSSA 3TRQA 2HE3A 2LS5A 2VCQA 4ZIJA 5GZZB 1DE1A 3ZFLA 3UARA 3LWAA 2C3TA 4ECIA 1PKZA 3KGKA 2O87A 3UJ1A 1ZCPA 5A5KA 3DD3A 3HVXA 1JLVA 3UL3A 3F4RA 18GSA 1Q98A 2MBTA 1XZOA 2R37A 3E0UA 2DSAA 3VLNA 5G31A 2JSZA 2E2GA 2C8UA 2TRXA 3APQA 1WPIA 3QOUA 1KTEA 4MCUA 2WDUA 3HA9A 3HJPA 4O5RA 1WJKA 2PERA 2VO4A 2H70A 1PRXA 2B3SA 2IPAA 2DMLA 2IMFA 2XPEA 1J9BA 1GWCA 1GUKA 5DQSA 2LJRA 5EPFA 1R26A 1U88A 1EZKA 2D2ZA 1K0OA 4PUFC 3TGZA 3LORA 1FVJA 3BJ5A 1T4ZA 3VFIA 4MF5A 3RPPA 3BCIA 2HNLA 4IW9A 1OYJA 2PN8A 4FIWA 5IO0A 2VL2A 3HZ8A 1Q4JA 4JEDA 2KOKA 1FB6A 4ZBBA 1FVKA 2H71A 4QQ7A 5CRDA 2YCDA 1A8YA 5AN1A 4KW6A 1MDJA 2CQ9A 2B7JA 2G2QA 2HZFA 3KD0A 4EVMA 3GN3A 4N0ZA 4WETA 3GMFA 3VI7A 1QFNA 1M9AA 1ERTA 4EXJA 1OVNA 1VF3A 3MAKA 3J7Yb 2GTUA 4KNDA 1T3BA 1XWBA 2R2JA 4G19A 2CVDA 1THXA 3SWLA 2I9HA 4GLTA 4P3YB 3IK9A 5HR3A 1XVQA 5ID2B 2VL2C 1O73A 1Z7RA 2NTOA 5J5NA 5D73A 1X0RA 1K0NA 3CYNA 2X99A 1B9YC 2X8HA 2LTKA 4BVXA 3O6TA 2DC5A 1Z6MA 3GH6A 2M72A 3HVSA 4KAEA 1SYXA 2CAQA 4FYCA 2PVQA 3E9JB 2FA4A 2HRNA 5D9WA 1H4OA 3DWVA 5CRWA 5HQPA 1DSBA 4TR1B 5AIXA 1K0AA 3LXZA 5INYA 3C1SA 4YQUA 5IIZA 5G1KA 1URMA 2JSYA 3M9KA 5J3RA 2J23A 3IR4A 3GYKA 3D4TA 1UN2A 2CV4A 1X9WB 1CQGA 1G7EA 3ERGA 3KMOA 1EP7A 2C3QA 2CX3A 2HT9A 2VM2A 4CHSA 3APSA 4JRRA 1X5DA 2GVPA 3BCKA 2A2RA 1IYIA 3H79A 1A2MA 3Q6OA 2GQLA 4WXTA 1TK8B 5D9TA 1GTUA 2B5XA 3SBCA 20GSA 2WFCA 4MJAA 3IXRA 5IMDA 1WP0A 3QD9A 4DVCA 1M2BA 3F4SA 1BX9A 5B7CA 2ALBA 5IOXA 4NMUA 4POKA 4PXOA 2KP2A 1ZOFA 3GUSA 1OKTA 4HQZA 2V6OA 3CSJA 4IHUA 2LKUA 1SD8A 4JZQA 1YF1A 1DUGA 3Q19A 4MP4A 3DGQA 3OR5A 3ZVJD 5IOWA 3F6FA 4Q5RA 3DKSA 2LQOA 4NWYA 3A2XA 3EINA 3WYWA 5ECRB 3CBUA 4IQ1A 2H1DA 1WMJA 1T4YA 2VM1A 1BEDA 1F3AA 6GSYA 5JWRB 5E4WA 4K2DA 4OMVA 5A4VA 4ZB6A 3GKNA 5F06A 5F0GA 2K18A 2L59A 2KUCA 4LA1A 1ZL9A 5HR1A 2AUVA 4IELA 1W89A 2NBSA 4OFNA 1A0RP 5G2ZA 2JZRA 3FK8A 1HYUA 2H19A 1HNBA 2HRFA 2R4VA 2VL3A 3EYTA 5B8BA 3IHQA 5GSSA 4RI7A 4TRXA 3VI5A 2C0EA 3DVXA 2YWMA 2BMXA 2RIIA 1PMTA 2ON7A 5IO2A 4TN8A 5DVBA 4WR4A 1BQ7A 1R5PA 4PQHA 5F07A 3EMPA 1TI1A 3ZZXA 1UC7A 2H6ZA 5DQYA 4TKYA 3QFBC 1TU8A 4EUYA 5B6NA 1GSYA 2MYGA 3JCML 2DLXA 1QXHA 3ERWA 2AAWA 2RLIA 1ILOA 5GAND 3F63A 1AAZA 2B1KA 4PGTA 4QL7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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1A8YA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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