3UEMA

Crystal structure of human pdi bb'a' domains
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
360
structure length
358
Chain Sequence
HHHSSGLEVLFQGPGSEFATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEMTKYKPESEELTAERITEFCHRFLEGKIKPHLMSQELPEDWDKQPVKVLVGKNFEDVAFDEKKNVFVEFYAPWCGHCKQLAPIWDKLGETYKDHENIVIAKMDSTANEVEAVKVHSFPTLKFFPASADRTVIDYNGERTLDGFKKFLESGGQDGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title Human protein-disulfide isomerase is a redox-regulated chaperone activated by oxidation of domain a'
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 103
structure length 358
sequence length 360
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2011-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uemA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uemA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uemA01
5ENUA 4XS6A 1GWCA 2HFDA 1AIUA 2DJKA 4E8EA 3GKXA 2H6ZA 1OC3A 2H8LA 5ECOB 3K8NA 4F9ZA 4CHSA 4MMMA 2IFQB 1ACVA 1VF1A 3VPQA 1T8EB 1I9DA 2C8UA 2I3YA 1GSEA 2N5AA 1WRYA 5F07A 4WXTA 2OE3A 4DSQA 2PWJA 3LORA 3M8NA 2H72A 4OWYA 3PINA 1DUGA 4HI7A 3RAZA 4EXJA 4POLA 2L59A 1JLWA 2OACA 2PMTA 4PX1A 4EO3A 1C72A 5E4WA 2R37A 1A23A 1XW5A 4CDOA 4YQMA 3I69A 4ACSA 3U5RE 2VCXA 5D8IA 4I2UA 3VURA 1V40A 3L9UA 2JZRA 1WIKA 1WWJA 5EL8A 3A3TA 1LJRA 3TJKA 4PNFA 3TJJA 5G5EA 4BA7A 5IMAA 4N11A 4TXOB 1YZXA 3KP8A 3TRQA 2WRTA 1M2AA 4J57E 5IMVA 4PQHA 4G2EA 1FHEA 2WCIA 2LNSA 3HVSA 4LMVA 1RW1A 1M9BA 3GUSA 2IIYA 5D9TA 4TR1A 3MDKA 1N8JA 2HT9A 2B7KA 2F51A 1BJXA 2B6MA 1E2YA 1O7UA 4IW9A 5KN0A 4ISDA 6GSXA 5FWGA 3PR8A 2FY6A 3UARA 1SKRB 2LJKA 1OC9A 1PMTA 1TRVA 2FWGA 2CQ9A 3EINA 2FWHA 4ECIA 3RDWA 4G10A 1IYHA 5JCGA 3N5OA 3VWUA 3PH9A 4YQUA 4TN8A 3LEFA 5IPGA 3UVTA 2HZEB 4EE0A 2J9HA 4N0VA 1TRWA 1WE0A 1JZRA 2RIIA 6GSWA 3HJPA 2H19A 4KA0A 4MPFA 1AQVA 3ZITA 1EP8A 4DSSA 3VWWA 4AJ8A 1SK2A 5G5FA 2WJUA 3CRTA 2GQLA 2VCQA 5D93A 3QDNA 3QOUA 4MP4A 4XS4A 1ZYQB 5ECLB 2F8AA 2TRCP 2F8FA 4TKYA 4MF5A 1A8LA 2I4AA 2HNLA 4Q5FA 1F3BA 2GQMA 4CW9A 2GT5A 1ZGNA 2VD0A 3WGDA 2CZ2A 4HQSA 1XVWA 4PNGA 4MH3A 5IIZA 1ABAA 2H6XA 1GULA 5DALB 3ZFBA 1ZZYA 4HS1A 3GKNA 1YEXA 4O7HA 5FHIA 3IK9A 3L78A 1HD2A 2JZTA 4PXOA 5IMDA 3LQ7A 1OKTA 2CVKA 1EP7A 3HY2A 4ZB6A 3LWAA 3UMAA 2VCTA 4E8HA 4ZL7A 1ON4A 5G1KA 2H1DA 4IJIA 6GSSA 2K18A 3IAM2 3KGKA 3IK7A 3M0FA 1R5PA 4O32A 4Q5QA 2PVQA 3M3MA 4GTUA 1PRXA 4LMWA 3BD2A 1QGVA 3GIXA 2YPMA 2V1MA 3GH6A 3G7YA 2P5RA 2VCWA 4KSOA 2H70A 4OFTA 1PGTA 4I97A 1A0RP 5IOXA 4D73A 3QAWA 3VWVA 2DJ0A 3LXTA 2OBKA 3TRXA 1SU9A 11GSA 3LYKA 1ERTA 4K2DA 2YJ7A 1AQWA 2LQOA 2IJYA 3QR6A 2PU9C 4NV5A 4TR0A 3E3EA 2P0GA 1B8XA 2LJRA 1DSBA 2DJ3A 1ST9A 1GUKA 1OC9B 4IKHA 2C80A 1URMA 3A2XA 2HE3A 2CAQA 3PGTA 1T00A 4JEDA 4ZL8A 4OFMA 1KTEA 5DAKA 1GSSA 2O8VB 4ZBDA 3GKMA 1O8WA 1YF1A 5J3RA 5DJMA 3ZTLA 1U6TA 2G2QA 3F63A 2MZCA 1MTCA 4F82A 1FAAA 3KD0A 3CBUA 2AJQB 4WEYA 3RHBA 3HVXA 1B4QA 1ERVA 4N10A 1XZOA 2CT6A 5DDLA 2VAFA 2YWOA 4LL1B 3NIVA 3DYRA 5C00A 2VUPA 5HR2A 1EV9A 5ABRA 3DMLA 1K0CA 2CAIA 3DIEA 1THXA 2LNTA 3ZLPA 1ZL9A 2O7KA 2K8VA 4F2IA 2HI7A 2EC4A 3TJBA 4RUVA 1BQ7A 2B1KA 4POBA 4K9ZA 3IR4A 3KEBA 4O92A 4AJ6A 5G2ZA 4I6XA 3CRUA 1EZKA 2OADA 1GL8A 4ID0A 1X5EA 4IQAA 4KH7A 1GSFA 1XWAA 5DBQA 2XPDA 2F9SA 5F0GA 1OE7A 2LTKA 1GTBA 2OE1A 5JCUA 1XOAA 1MD4A 1W4VA 4F0BA 4BVXA 1GUMA 2M72A 3CTFA 4MF6A 3E9JB 2VLTA 2WB9A 3IAS2 1TK0B 2AAWA 2YV9A 1U88A 3L9VA 1PD21 2GZYA 4JRRA 4K6XA 2C3NA 5ECPB 14GSA 3VLNA 6GSYA 1PQNA 2IMKA 3ZIJA 5B7CA 3HCZA 4V2MA 1V58A 2PVOC 4TOPA 4YQVA 2VO4A 1TOFA 3HXSA 3IDVA 3ME8A 3ZYWA 1BYEA 2YWMA 1BX9A 1B48A 18GSA 2A2SA 3C73A 3FZ9A 1PKZA 2IMIA 4ZL9A 2C3TA 2GZPA 2Z9SA 4PQ1A 3Q74A 2DMMA 1Q4JA 4QL7A 2DSAA 4NXIA 3GX0A 3M9JA 4X0XA 2HRFA 1ERWA 3EVIA 1GLQA 2R3XA 5G1LA 1VF3A 3GX8A 4HQZA 2FGXA 2YJHA 2QGVA 4RI7A 3LFLA 1VGLA 2C3QA 20GSA 3EMPA 3IE3A 3UIWA 5ELAA 2AV4A 2VL9A 5IO2A 3APOA 5DVBA 4NMUA 4J2FA 1G7EA 3KMNA 2OKAA 1GNWA 5JWQB 4IGJA 1G0TA 3M1GA 1YKCA 2LJAA 2MMOA 4ZIJA 3G7JA 2R6KA 3NZNA 4OFNA 5EY6A 2E0QA 3GRXA 3ERFA 3GN3A 13GSA 2R4VA 1O8XA 3MAKA 4EF0A 4OO5A 3D22A 4MF7A 1R5AA 3CXGA 2GGTA 1K3OA 1G7OA 1NSWA 4EDYA 4BWQA 4NPBA 3U6VA 2AHEA 3P8WA 1GH2A 1HYUA 2H1AA 3GL5A 2EIQA 1FB0A 4GSSA 4ZB9A 5IMCA 1R4WA 3Q19A 5AN1A 1FOVA 3VI7A 2XHFA 3DD3A 1ML6A 2L6DA 2PUKC 2C0FA 3C7MA 1F3AA 1XIYA 1F2EA 5JWRB 4POMA 2H01A 1XWGA 2IL3A 1M2BA 1X9SB 4FYBA 1PL1A 4RQRA 3FEUA 1X5CA 19GSA 3TCOA 4Z7XA 2K9FA 3GYKA 1X0RA 4AF2A 2X64A 5AIVA 3FW2A 10GSA 2YV7A 4IELA 2GSTA 1R7HA 3IRAA 2C0EA 4L0UA 2NTOA 3NOFA 3C8EA 4I5QA 1O85A 5LD0A 1EOGA 3GURA 1EEJA 4MJAA 3KCMA 4N30A 4TW5A 2HLSA 3D4TA 2B5EA 5G30A 2HSHA 4HZ2A 1T4YA 2H74A 2KP2A 2VM2A 2L57A 4TR3A 5J4UA 1YEPA 1SL1B 3GH9A 2VLUA 2YWNA 4I2TA 1SL2B 1TRSA 1A2JA 3OR5A 2IMEA 2OE0A 1A8YA 1Z7PA 3F4RA 2A2RA 2JSZA 3KH7A 2LEGA 4ZXGA 6GSUA 3J7Yb 1BG5A 2R2JA 4DSRA 2YWIA 4QQ7A 5GSSA 2KLXA 3ZL5A 3HVVA 3F8UA 3F3QA 3C1SA 1J9BA 2H73A 1WJKA 1PL2A 1SKWB 2XPEA 3CTGA 3F6DA 5D73A 1AXDA 2IMDA 5CRGA 5CP1A 1SYXA 2CX3A 5C04A 1T4ZA 3DKSA 1YQ1A 3FR3A 1GTUA 1K0DA 2YZHA 3WGXA 4NWYA 2XBQA 3GA4A 3FK8A 3TKSC 3LSZA 3FY7A 4J56E 3HHVA 4HU9A 4XS1A 1S3AA 1F9MA 1HQOA 3APQA 1XPVA 5A4WA 4MLYA 3UVHA 1Y25A 2V2GA 1VF4A 5HFIA 2MBTA 3TJFA 3MNGA 3EURA 3H93A 1VF2A 4IVFA 4RQXA 4BL7A 4YAVA 1DBYA 2G0FA 4V2LA 3WT1A 3I6AA 5H5RA 1X9WB 2PGTA 4KW6A 5B8BA 4MH2A 5D96A 2FA4A 3ZVJD 5KN1A 4KNDA 4G19A 3DVWA 4PQIA 2DBCA 4V1Ag 2DIYA 2RLIA 2L4QA 3IOSA 4ZBBA 1LU4A 4JBBA 3QCPA 4PUFC 4MZWA 1V2AA 2KP1A 5D9XA 2CVDA 2X8GA 1HNBA 3D6IA 6GSTA 2A4VA 4V1Ap 4EDZA 1RQMA 3A2WA 2FHEA 4L0WA 3L9SA 2M80A 1EOHA 3QD9A 4GSTA 1NW2A 1EWXA 2VL3A 3VPTA 3BBYA 5HR3A 1GSUA 2X8HA 5HFKA 3TKPA 4GXZA 3F4SA 2RUFA 3HD5A 3VI5A 4MJCA 1SENA 4JU5A 2YZUA 2E7PA 2MYGA 4I8BA 2P31A 1FVJA 3GSSA 4TR1B 4HOJA 3CMIA 2QC7A 3C71A 1XWBA 1SL0B 3QAVA 5ECMB 1YY7A 2BTOT 2C1YA 4L8EA 4ECCA 2H71A 3W8SA 4OCEA 3GTUA 1UVZA 3EMXA 4BVYA 1MDIA 2AB6A 5COHA 5H5QA 3ISOA 5AIXA 3O6TA 1ZCPA 3GSTA 2K6VA 2HXKA 3F4TA 5GSTA 4KGIA 2AUVA 1PSQA 1UA5A 1QK8A 5KEJA 3BCIA 3A2VA 2CVBA 2XBIA 2GSSA 2H0GA 3VK9A 3C1RA 5CYYA 2GSRA 5ID2A 2DC5A 3P90A 4DSSB 5J5NA 2VL2C 1M2DA 3GKKA 2NVLA 3ZMLA 2N5FA 5CNWA 5LNKe 5IQYA 4XRAA 1Y6EA 3LG6A 3WYWA 1X5DA 2VCVA 4WKWA 4XS4B 2EIOA 4XHMA 5IO0A 3I9V2 2L6CA 1XOBA 2NPBA 4ML6A 3WT2A 2N5BA 2HZFA 2NBSA 2HRNA 1M9AA 4EC0A 1F37A 1ZOFA 1XFLA 2JU5A 2K8SA 3UBKA 1GSDA 1V57A 2L5OA 1FG4A 4KAEA 1G6YA 1T3BA 1SKSB 4GLTA 1M0UA 1PA3A 5GAPD 5J9BA 3D0ZA 5ECRB 4IP1A 5CREA 3ZVJA 2AYTA 1A0FA 1A2LA 3GMFA 2LRNA 4TR4A 1FB6A 2VOCA 4MZCA 5DQSA 5IMFA 1QUWA 1JLVA 1Z7RA 1O81A 1Z9HA 4KSMA 5J41A 2CV4A 2YOIA 3ED3A 2L5LA 5JCWA 2WGRA 1TI1A 5FT3A 2FD3A 2DJ1A 1GUHA 3HZ8A 1EGOA 2MMZA 3RPPA 1JZWA 1ZYEA 3KIJA 1TP9A 4TXOA 4XTSA 2HSYA 4GF0A 2LKUA 4TRXA 2DJJA 2FCHA 2H1BA 1ILOA 2JADA 4FYUA 1AUCA 2P5QA 2ES7A 3O76A 4F0CA 2GVPA 2ON5A 1O73A 2H0IA 4D73B 4OO4A 1TU7A 1XBSA 3ZMKA 5CAXA 4F03A 4X43A 4XCSA 2O89A 3J7Yk 4KUNA 4K7IA 3TKSA 1XW6A 4KCEA 1QQ2A 4FH8A 1G6WA 2GQKA 2CA8A 3DGQA 5DAKB 4MABA 3ZZXA 1MD3A 1OVNA 2B5YA 2JL4A 2BJXA 1QXHA 1A2MA 1WOUA 3W8JA 4OMVA 2QSIA 1XCCA 4FYCA 5KN2A 3P2AA 1V9WA 5DCGA 1MDJA 2GT6A 3ME7A 4MJEA 2V32A 4GRFA 7GSSA 2VM1A 5A4UA 1Q98A 3TB2A 4WF4A 1OC8A 4EUYA 1JZOA 5IMZA 3FHKA 3HJOA 1A24A 5B8AA 4BWSA 2LS5A 3AY8A 1GRXA 3QPMA 1Z5YE 4NHZA 5EPFA 5CO3A 3IBHA 3EWLA 4MZBA 3APSA 8GSSA 3US3A 1KNGA 4HJMA 2LUSA 4RI6A 4OD7A 3WGEA 3KTLA 4K0NA 5DALA 3TKSE 3N9JA 3F0IA 1PKWA 4MPGA 4NAXA 3D21A 4PUAA 4HU7A 4IBPA 4BPYA 2FLSA 3GL3A 3FKFA 2H6YA 5EVOA 3EYTA 4ECJA 1S3CA 3HZ4A 2DJ2A 2FWEA 5F06A 3WD6A 1GSQA 1K0NA 3LYPA 2DMLA 1AAZA 5ECSA 4ULXA 5ECKB 5ECIB 2IMFA 3DRNA 3UBLA 4O5RA 1K0BA 1K3LA 2GLRA 3UJ1A 5CRDA 1M99A 3HDCA 1K0AA 1FO5A 1EEMA 2HYXA 2TIRA 4MDCA 1N2AA 3TUEA 2LRTA 5J9CA 1E6BA 3UAPA 5B6NA 3IC4A 1EGRA 3ERGA 4GQFA 2FWFA 5JWOB 1HNAA 2OA7A 1S3DA 4WBRD 1B9YC 2VL2A 4Q5RA 1TK8B 1XVQA 1O6JA 2FUG2 5DJLA 3M9KA 2GTUA 1TI3A 1TDIA 1OE8A 2I9HA 4IJ3A 2MMNA 2YNXA 1I5GA 3RPNA 3D5JA 1Z3EA 3EC3A 1UN2A 2I81A 1DE2A 1LBKA 2RUEA 2GZZA 4GWRA 3H79A 2E2MA 3FZ5A 4MCUA 2WDUA 2LQQA 3O3TA 3TOUA 1GTIA 5LCZA 5GZZB 2YCDA 4DEJA 2R5GA 2O87A 1SD8A 4V2NA 22GSA 2V41A 3EU3A 4OCFA 2E2GA 3GV1A 4K7NA 2GDRA 1H4OA 5B6MA 2IWTA 3TKQA 4HZ4A 1J08A 4ZILA 4H86A 5L71A 3VWXA 1AC1A 2B5XA 4JE1A 3BOAA 5A5KA 2RM5A 4KX4A 2CZ3A 4MJBA 3UEMA 1K3YA 1T7PB 3L4NA 4HJ2A 2H0HA 3GNJA 4JR6A 2H1GA 5HR0A 4KE3A 3R2QA 1PX7A 2KUCA 2YN1A 1QFNA 2H66A 3FYGA 3IPZA 3ZRDA 3D4MA 3JCML 4XIHA 1OKDA 2RM6A 5E59A 2CX4A 3GFKA 4PGTA 2PBJA 1GLPA 1U87A 3I43A 4N0ZA 2WZ9A 1ZMAA 3G9BA 3IV4A 2OJLA 3E0UA 1TW9A 1YDKA 5F8BA 3LGCA 1XXUA 4NHWA 3HYPA 2IN3A 1KBNA 1EV4A 4K7OA 5GAND 4G9HA 3G7IA 2JSYA 1GNEA 4TXVA 3EE2A 4HDEA 3TDGA 1WPIA 2J23A 1PX6A 1K0OA 1YF0A 1XW9A 1JHBA 1AQXA 2MMAA 1DE1A 3DXBA 4ILFA 2JZSA 3KTBA 4NV2A 2LSTA 2ZNMA 1TK5B 1SJIA 2L4CA 2H75A 3IXRA 4YAPA 3QMXA 2ZUPA 1NHYA 3EU4A 3QFAC 5HQPA 2F3MA 2B1LA 2GSQA 1KEBA 1TRUA 4ZB8A 5F05A 4K0GA 2DIZA 2IPAA 3TGZA 2OBIA 3FZAA 3L0HA 2QKEA 5KN3A 1J0FA 2H76A 5D9VA 1WMJA 4QL9A 4WETA 3A5WA 3KZQA 3DVXA 2C0GA 17GSA 4KDYA 4JZQA 16GSA 5HFGA 4PURA 1SK1A 4IHUA 3TOTA 2B3SA 2PERA 2JACA 2KHPA 1W89A 4JR4A 4IS0A 4FIWA 2TRXA 3P7XA 3S9FA 3H1NA 3KXOA 5IPHA 4LLRA 1VRSD 2O85A 1TTZA 3HA9A 1GSYA 2XC2A 3HJMA 3ZREA 2PPTA 1MDKA 3CSJA 9GSSA 5ECNB 4LA1A 3FRCA 5DQYA 3ERWA 4P3YB 1PN9A 3F3RA 4HEA2 5DCHA 5IOWA 1V98A 3KH9A 3MSZA 2PN8A 3IHQA 4MA9A 2C0DA 3CSHA 3VFIA 1SYRA 4IP6A 2REMA 2IFQA 2FNOA 3LJRA 4K1FA 4WR4A 4GCIA 5H5SA 5AISA 2YANA 3V1WA 1Z6NA 2WS2A 5IM9A 4GSNA 1WP0A 4ECBA 1NHOA 3RHCA 5ECQB 3ZIVA 4YH2A 2C4JA 2M46A 3QFBC 5A4VA 1AW9A 2BMXA 3TJGA 1BEDA 3CSIA 3Q6OA 1CQGA 3HKRA 4KB3A 1GTAA 2B7JA 5HR1A 3SWLA 2V6KA 3DWVA 1RK4A 2WULA 3W6GA 5AGYA 4XRDA 1X9MB 5ELGA 3ZFLA 4HUAA 1XWKA 4IQ1A 3KM6A 2DLXA 1U3AA 1NM3A 4EKZA 1TJDA 3IA1A 4IN0A 4Q5NA 1FVKA 4LL4B 2H30A 4ZBAA 2I1UA 12GSA 4WR5A 2VIMA 3GHAA 1TU8A 1SK0A 3H8QA 2GS3A 1MEKA 1JFUA 1TKDB 2ALBA 2LV3A 2X99A 3F9UA 3Q18A 3LXZA 5CRHA 1K0MA 1B4PA 3BJ5A 1YJ6A 1CQHA 2EIRA 1B9XC 3KMOA 1THOA 4GQCA 4FO5A 1U3IA 5CRWA 3GTUB 3CYNA 1ERUA 4L5LA 1Z6MA 4DVCA 2V6OA 1H75A 4EVMA 3MWHA 4WBJA 4ML1A 4KCAA 2VCZA 4X1UA 4AJ7A 4WF5A 5D9WA 3DEXA 1UC7A 4L5OA 3FZ4A 2KOKA 2HZEA 1F6MC 2VLVA 1TXXA 2X8CA 4KDUA 3KJYA 3KP9A 3F6FA 3UOMA 1M7TA 2D2ZA 2LRCA 1SJ6A 6GSVA 3TRPA 4TVEA 4POKA 3FR6A 5ECHB 1JZDA 4EL1A 1QMVA 2WFCA 5ID2B 2FA8A 3H4KA 1FW1A 1BAYA 1OYJA 2YP6A 5INYA 1SJZA 3QAGA 1IYIA 3FR9A 5G31A 2ZCTA 1HNCA 1XWCA 3BCKA 1USBA 2ON7A 3UL3A 1OAZA 2VD1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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