3VWVA

Crystal structure of n-terminally truncated peroxiredoxin 4 from m. musculus
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
HHSSGLVPRGSHMPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFKSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLNHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGVLRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Synergistic cooperation of PDI family members in peroxiredoxin 4-driven oxidative protein folding
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 54
structure length 182
sequence length 182
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3vwvA00
4O5RA 1VF3A 1TW9A 5DBQA 2MZCA 3CSHA 3IV4A 2VAFA 3S9FA 2GZYA 4PQ1A 2R3XA 4HZ4A 1EV4A 1GH2A 3IXRA 3M0FA 1NSWA 4K7IA 4NXIA 1A23A 3Q74A 3HZ8A 1VGLA 5H5SA 5LCZA 4NHWA 1T1VA 2HZFA 1A2MA 2K8SA 4YAPA 1KTEA 3F9UA 3EC3A 1K0AA 4EL1A 1SK0A 1YY7A 1FW1A 2H6ZA 5IPHA 2DJ2A 3HCZA 6GSUA 4EVMA 3SWLA 5ECNB 4ID0A 3FEUA 2QKEA 1BJXA 4V2NA 1E2YA 4X1UA 3APQA 1T4YA 2H66A 1GP1A 4WBRD 2HSHA 3G7JA 3KMNA 4ECIA 2JU5A 2FA4A 1JZRA 4PGTA 1SD8A 2OE3A 1OAZA 1MDKA 3DXBA 2XHFA 2TIRA 1ERWA 3N9JA 2HI7A 1EEMA 4ECBA 2IJYA 4XIHA 2VO4A 2GQMA 4CW9A 5IQYA 5IOWA 2VM2A 3TKRA 3VPTA 1TRVA 2F9SA 1PX6A 4PXOA 1OE8A 3IA1A 3KH7A 3UBKA 2XPEA 1BG5A 3GH6A 4I8BA 4XCSA 3J7Yk 1YQ1A 3LG6A 3HYPA 4ZILA 1TTZA 4Z7XA 4I2UA 3BBYA 12GSA 2CT6A 3F6FA 1GSQA 4F82A 4KSMA 5J3RA 3C7MA 2C0GA 3MAKA 2HNLA 3IOSA 1PX7A 5B6NA 3L4NA 5CRDA 5DQSA 3KTLA 2E0QA 1F6MC 4EXJA 1K0NA 2HSYA 3P90A 5IIZA 2OJLA 5IO0A 1UA5A 4ZBDA 4TW5A 5ECHB 3TJJA 3ZL5A 1XBSA 5HQPA 1TRSA 1ILOA 2PBJA 1JHBA 3IR4A 18GSA 3TRQA 3KMOA 1HQOA 3QFAC 2WDUA 4GWRA 2WULA 1U3IA 2MYGA 2B1KA 1Z5YE 1Z6MA 2IMKA 4IS0A 5HFIA 4KAEA 4HS1A 1A8LA 3ZLPA 5D9TA 1MDJA 4ZB6A 1Z6NA 3PH9A 4N11A 3WGDA 4PUFC 4IELA 3IHQA 2V6OA 3QCPA 4CDOA 5G31A 4F0CA 5CRHA 3I9V2 5IPGA 2VCWA 2F8AA 1LJRA 3RHBA 2TRCP 3U5RE 4G2EA 3P8WA 2IFQA 1GTAA 1LBKA 2YPMA 3O3TA 4IW9A 3NIVA 3TKSC 1VF2A 4V2LA 5INYA 2YWOA 3ISOA 3QFBC 4Q5QA 3QPMA 4ZIJA 2D2ZA 2JL4A 4PNGA 1EWXA 13GSA 3EYTA 3W6GA 3EU3A 5D96A 4YQUA 1W89A 3D6IA 2LJAA 6GSSA 1B9XC 6GSVA 2OKAA 1M2DA 5KN0A 3KM6A 4FYCA 2RM5A 1AIUA 3PGTA 4NAXA 4HUAA 4TR4A 2F51A 3FZAA 1PMTA 1QMVA 1ERUA 4GQCA 3HD5A 3GIXA 2ES7A 2HXKA 4I2TA 4XS4A 5G5FA 1B8XA 3F3QA 3G9BA 3TUEA 2B7JA 4L0UA 3TJKA 1EV9A 3L0HA 1GTUA 2CVBA 3C73A 1ZYEA 5DDLA 1XXUA 3KH9A 2I4AA 5D9XA 1Y6EA 2WGRA 4MABA 2R37A 5A4VA 5B6MA 4MJCA 2HE3A 1QXHA 3UBLA 4BA7A 4PQIA 3QR6A 5EY6A 4JBBA 2VL2C 3TKSE 3FYGA 1ERVA 3DIEA 2H0IA 3BJ5A 2DIZA 2RUFA 5DJMA 3EMPA 3F63A 5DVBA 3C1SA 2DSAA 4MZWA 5ECIB 5EPFA 2I81A 2LJRA 4K2DA 3F3RA 4POKA 4ZB9A 4DSRA 4O92A 4TVEA 16GSA 1GLPA 1RW1A 3ERGA 5ENUA 3E0UA 2OE0A 1FVKA 3M9JA 3H93A 3DD3A 4EDZA 1NW2A 2WCIA 4IP6A 2PWJA 3G7IA 4PURA 1TK5B 5DQYA 3TDGA 3UJ1A 3GA4A 2O85A 4RQRA 1EOGA 2C4JA 3VWXA 1ZL9A 2LQQA 3QDNA 2ON7A 4WXTA 1E6BA 3EVIA 4MDCA 3P7XA 2PVQA 5G1KA 1WE0A 2IMIA 2F3MA 2JSZA 1XWAA 1V58A 2VLVA 3CBUA 3KJYA 3UAPA 2A2SA 5JWOB 2MBTA 2FGXA 3BOAA 3LGCA 3VURA 3ZRDA 4WBJA 1U6TA 2GDRA 1VRSD 1GSFA 1OKTA 4IHUA 4K8MA 3HXSA 1FO5A 1XFLA 2FWGA 1JLVA 1TRWA 3IPZA 2DBCA 2GGTA 3CRTA 2XPDA 4NWYA 5ECMB 4AJ6A 2P5QA 1X9MB 3LSZA 2QGVA 3F4RA 2R4VA 3I43A 2LKUA 3IDVA 1TRUA 1A8YA 5GAPD 3TKSA 1UN2A 5HFKA 2LRCA 2EIQA 1PA3A 1Z3EA 4HJMA 4IVFA 2K9FA 2YWIA 3CTGA 4OCEA 2C8UA 2LUSA 2O87A 4OFMA 1KNGA 1MEKA 5CAXA 4MJEA 2L4QA 2DJJA 4LMWA 3C1RA 2WJUA 2VD1A 3ZZXA 3N5OA 3TB2A 3U6VA 2N5BA 5KN2A 3WD6A 3EE2A 2FCHA 3GUSA 1XCCA 1GSUA 1SYXA 1J08A 2MMAA 1EOHA 1O85A 3PR8A 1AQXA 5J41A 3IK7A 3HKRA 4JR4A 1BEDA 5AIXA 4BL7A 5DAKA 2H1GA 2VCZA 4GSNA 2RUEA 5DCHA 2YOIA 5F06A 1R26A 3GL5A 5ECQB 2CZ3A 1DSBA 3ME7A 1I5GA 2LNTA 4WEYA 2F8FA 1PD21 3VWUA 4DSQA 4G10A 3HHVA 4QQ7A 2FWEA 2VL2A 4MF5A 5COHA 1GSDA 1FHEA 1BX9A 4MZBA 3RPPA 1TU7A 4YAVA 2C1YA 4RQXA 3GTUB 1EEJA 3FR9A 1JLWA 1CQHA 3IBHA 3BCIA 4HQSA 4EUYA 2CA8A 1EP7A 3HVSA 2HYXA 1VF1A 1JZWA 1G7EA 3GSSA 4RI7A 3ME8A 2H73A 2I1UA 2YWNA 4KSOA 1J9BA 1SKSB 3QAVA 4EDYA 4TKYA 1JZDA 1NHOA 5ELAA 3A2XA 1GRXA 1YZXA 4GXZA 1BQ7A 1XVQA 3GNJA 1K0BA 2YANA 3NZNA 3WGXA 2H0GA 2AV4A 3VI7A 1FAAA 1RK4A 4F2IA 3F0IA 2LRTA 3CYNA 8GSSA 1S3DA 2H1DA 2VIMA 2EIOA 1G6YA 2A4VA 1PL1A 5AN1A 4I5QA 5L71A 2AUVA 2YZHA 4IGJA 1YDKA 6GSTA 2AHEA 2CAIA 4FH8A 3GFKA 4JRRA 2AB6A 1TDIA 2PGTA 4X43A 1FG4A 5ECOB 2JSYA 3APSA 3HVXA 3L9UA 2OBIA 2LJKA 1JZOA 3TRXA 3P2AA 5G5EA 1QQ2A 1T00A 2TRXA 5DALA 1U3AA 2G2QA 4LA1A 4HJ2A 4G19A 3AY8A 4KH7A 3Q18A 2CV4A 3E3EA 1QUWA 4J57E 2DC5A 4N10A 4GLTA 3UL3A 4RI6A 3LORA 3D0ZA 4IQAA 1EP8A 3APOA 4MJBA 1MD3A 3GX0A 4HOJA 1OE7A 4OWYA 4FYUA 1TKDB 3ZVJD 5DCGA 3F8UA 2I9HA 2JADA 3DVWA 2LNSA 4POLA 1ST9A 4JZQA 2MBSA 4XS6A 3LYKA 1AQWA 2REMA 1XOAA 2H19A 5DAKB 4KDUA 2R2JA 4ZB8A 1MTCA 2J23A 2P31A 3GH9A 4NV2A 2WS2A 4XTSA 5ID2A 2C0FA 5JCWA 1F9MA 5CREA 1PGTA 3A2VA 5KN3A 3KCMA 3WYWA 3Q19A 4IJ3A 2RLIA 5ECPB 5ECRB 2PERA 2VM1A 3ZITA 4JEDA 1QGVA 3GHAA 5D93A 2V1MA 4OD7A 1OVNA 1YJ6A 2IWTA 1GL8A 2FWHA 1XW6A 4ZBBA 1XIYA 1IYHA 1GUKA 2M80A 3CSIA 4PQHA 1MD4A 5JCUA 4GF0A 5HR3A 3LXZA 3O76A 4LLRA 2L5LA 5AIVA 4LL4B 2O89A 1SJIA 2NBSA 2B5EA 1YEXA 2QC7A 4MF7A 4OFTA 1TK0B 3A3TA 1K0MA 2H6XA 5E59A 4K7NA 4MJAA 3FR6A 1O81A 2ALBA 5KEJA 2GTUA 2HT9A 1T4ZA 2CX3A 2X8GA 3G7YA 4K0NA 5LNKe 2VCVA 4PNFA 1X5CA 2JACA 1V9WA 5F0GA 2O7KA 3FHKA 1G7OA 5G2ZA 2KUCA 1ZCPA 4I97A 3VLNA 4XRAA 1SJZA 4GQFA 2FA8A 2HZEA 2FHEA 4ZL7A 1ACVA 1XWBA 5FWGA 2MMNA 3EURA 3UMAA 2E7PA 3IRAA 3O6TA 1XZOA 1BAYA 2LQOA 4GCIA 2VLUA 1AXDA 4HDEA 2ON5A 5CRWA 1HNBA 1PQNA 7GSSA 4DSSB 5GAND 2B5YA 1M99A 1YKCA 2BTOT 2PVOC 2H30A 4MP4A 5DALB 3KTBA 1V57A 4Q5NA 1H75A 1TI3A 3MSZA 1XOBA 4YQMA 2X8CA 1XWCA 4CHSA 2P0GA 4BVXA 1WJKA 4MF6A 1SU9A 10GSA 5A4WA 2YV7A 3DMLA 2PU9C 3GTUA 1PKZA 4TR1B 4N0VA 5IMZA 3IC4A 4JR6A 1A24A 1FB6A 4BWQA 2PN8A 2AYTA 2LRNA 3ZVJA 3HJPA 1YF1A 2VL3A 1GSSA 1H4OA 5KN1A 1ZGNA 2V41A 4HZ2A 3FW2A 1S3AA 5J9CA 2NPBA 3TGZA 1T7PB 1K3LA 1X9WB 2P5RA 4ML1A 4NMUA 4GSTA 3DWVA 1GULA 2FNOA 2DJ3A 2I3YA 4DVCA 4GTUA 1A2JA 1K0DA 1M2AA 3CMIA 4KUNA 3EWLA 1B4PA 4BPYA 5ID2B 2H8LA 4G9HA 2KP2A 2GSTA 3CSJA 5J4UA 5JWRB 4KGIA 5C00A 1SK1A 11GSA 3F4SA 2GSSA 5G30A 2H74A 2DJ0A 1WRYA 1O8WA 6GSWA 5CYYA 4QL7A 5H5QA 2H71A 3QAGA 1XWKA 4AJ7A 4NHZA 4HI7A 5JWQB 3UVTA 4LMVA 2ZNMA 4PX1A 5IMAA 1OC3A 2NTOA 1R5PA 4ECJA 5F8BA 5AISA 1ZZYA 3TJFA 3GKNA 3RDWA 4TN8A 1G6WA 4K6XA 1GUMA 1M9BA 4I6XA 3WT2A 4KA0A 5EVOA 3KD0A 3NOFA 2B3SA 4KNDA 1M0UA 1SD9A 5G1LA 2RM6A 2G0FA 3WT1A 4EE0A 3GRXA 2JZRA 4MH3A 1YKAA 4ZXGA 2HRFA 4OMVA 3KEBA 4IJIA 1TJDA 5A4UA 4YQVA 2LS5A 4POBA 2KOKA 1AC1A 1EGRA 3IK9A 4KB3A 1ZYQB 20GSA 1SL2B 3IE3A 2JZTA 5HR0A 3GKKA 1N2AA 4BVYA 2GLRA 3R2QA 4EF0A 2M46A 4O32A 5ECLB 2XBIA 3HDCA 1B48A 1B4QA 2LV3A 2OA7A 2X99A 3UVHA 1XW9A 2VL9A 3ED3A 1QFNA 4ML6A 5DJLA 4GSSA 1V98A 2HZEB 2C80A 4ULXA 3FKFA 4MH2A 2CQ9A 3GKXA 4POMA 1T3BA 3C8EA 3GX8A 3VI5A 4F0BA 4EKZA 4IKHA 3GYKA 3GN3A 1S3CA 2VUPA 1ZMAA 3DYRA 1R4WA 2OBKA 1TOFA 3ZFBA 3DGQA 4V2MA 2LSTA 1IYIA 4MMMA 3FR3A 4OO4A 2YJHA 4E8EA 1V40A 3D21A 2QSIA 3CTFA 1OC9B 1PN9A 1CQGA 4AF2A 3ZMLA 1O6JA 2L6CA 3Q6OA 1GWCA 4NPBA 5ECKB 3D5JA 4TOPA 3GV1A 4OFNA 4ACSA 2X64A 1SK2A 4WKWA 3PINA 2H0HA 2AAWA 4MK3A 3A2WA 9GSSA 1PRXA 3KGKA 3J7Yb 1F2EA 2FY6A 6GSYA 4Q5RA 4YH2A 2O8VB 1ZOFA 1O73A 3ERFA 2CZ2A 1UC7A 3MDKA 2IIYA 6GSXA 1EZKA 1YEPA 3L78A 5GSTA 4MLYA 4KDYA 1WPIA 1U87A 1X0RA 2L6DA 1FOVA 1SENA 4F9ZA 4ZL9A 3BD2A 2MMZA 22GSA 2DIYA 3TJBA 3KXOA 1WWJA 3SBCA 1SJ6A 1X5EA 2HLSA 1I9DA 3F4TA 5B7CA 4WF5A 4F03A 4MA9A 4HU7A 5GZZB 1WP0A 1G0TA 1KEBA 4XHMA 3ZYWA 5GSSA 3DVXA 4N30A 4N0ZA 2GSQA 3LFLA 1R5AA 1AAZA 5IO2A 2RIIA 1TK8B 1C72A 3D4MA 2V6KA 3DKSA 4DSSA 1N8JA 1PL2A 2L57A 4K7OA 1DE1A 3C71A 2DMMA 3WGEA 2J9HA 1HNAA 4TRXA 5IOXA 1K3YA 1GTBA 3D4TA 3ZIVA 4TXOA 2YP6A 1GUHA 2IN3A 2C0EA 1A0RP 4KCAA 1Q98A 4ILFA 4E8HA 4O7HA 4TR1A 2GT5A 5J9BA 1URMA 3H8QA 4EC0A 5F07A 3TKPA 4EO3A 2VD0A 1U88A 2KP1A 2DLXA 1FVJA 2GT6A 3EINA 2M72A 2OACA 1SKWB 4IN0A 4TR0A 2LEGA 1VF4A 2CAQA 4L5LA 1HNCA 2E2MA 2E2GA 3GSTA 2ZUPA 1HD2A 1GLQA 1USBA 3QAWA 3F6DA 1Z7PA 1MDIA 2B6MA 2GQLA 5J5NA 1TXXA 1F3AA 2V32A 4HU9A 2MMOA 4GRFA 2FUG2 2H01A 3TKQA 2GVPA 2K18A 1F37A 2WFCA 5JCGA 2HFDA 3HY2A 5FT3A 4L0WA 5B8AA 4AJ8A 5IMDA 4V1Ag 2C3QA 1OKDA 5HR1A 1XWGA 1SKRB 5CP1A 4FYBA 5CO3A 1THXA 1GSYA 1RQMA 2B1LA 2H6YA 4MCUA 2GSRA 2LTKA 5D73A 2EIRA 5FHIA 2ZCTA 5EL8A 4LL1B 2HRNA 4XS1A 3VK9A 1WIKA 3KZQA 1DE2A 3ZIJA 3GMFA 4J2FA 3MNGA 1WMJA 1GSEA 1JFUA 1UVZA 2FD3A 1ML6A 2NVLA 4V1Ap 3LYPA 3MWHA 2CVDA 3EMXA 1PSQA 1LU4A 4PUAA 5IMVA 2C3NA 5CRGA 1FB0A 2YJ7A 2YN1A 3E9JB 2VOCA 3HVVA 2PPTA 1XVWA 2B5XA 5CNWA 1M2BA 2IMEA 2GZPA 4K1FA 3GL3A 1X5DA 5IMCA 3ZMKA 1EGOA 2VCQA 1GTIA 1OC8A 4Q5FA 3ZREA 5H5RA 2GS3A 3VWWA 4OO5A 3TJGA 3IAM2 5ECSA 3GKMA 5HFGA 1J0FA 3W8JA 3M9KA 1Y25A 3HZ4A 2BJXA 3QMXA 5E4WA 3L9SA 2YWMA 3M1GA 5C04A 1F3BA 1NHYA 1AW9A 1TU8A 2IL3A 2KHPA 4ZBAA 3H4KA 2EC4A 2YNXA 4KDXA 3H79A 2CVKA 4FIWA 1A2LA 1HYUA 1Z9HA 2OADA 1NM3A 4TXOB 1GNWA 2WZ9A 4D73A 2H72A 2XC2A 3LWAA 1OC9A 4MPFA 1BYEA 1OYJA 3LXTA 1K0OA 2VCTA 4MZCA 1M7TA 4RUVA 3HJOA 1R7HA 2R5GA 5D9WA 3FZ9A 4H86A 3LEFA 3FZ5A 2WRTA 1W4VA 4TR3A 3IAS2 1Q4JA 4DEJA 1SL0B 1TI1A 4WF4A 4WR5A 1ERTA 4P3YB 4HEA2 2JZSA 1SL1B 4KCEA 4KX4A 3VFIA 2R6KA 2NDOA 3CXGA 2IMFA 4JE1A 3UIWA 2X8HA 5LD0A 2A2RA 2H76A 2H1BA 3DEXA 2N5FA 3CRUA 3UOMA 4ISDA 1KBNA 4KE3A 3FK8A 2GQKA 2VLTA 4L8EA 4KW6A 5F05A 3RAZA 1O8XA 1THOA 4FO5A 4ZL8A 3DRNA 5D9VA 3ERWA 1DBYA 1V2AA 3HJMA 3BCKA 4AGSA 5ABRA 5D8IA 2OE1A 3ZTLA 1ON4A 2L59A 2Z9SA 4JU5A 3KP8A 17GSA 2IPAA 2DJKA 5HR2A 3UARA 1AUCA 3GURA 2CX4A 3L9VA 14GSA 3A5WA 3VPQA 4K0GA 4MPGA 3TCOA 2XBQA 2IMDA 4IP1A 2KLXA 4TXVA 3ZFLA 2YZUA 5B8BA 3RBTA 3D22A 2FLSA 3M3MA 4OCFA 3TOTA 1WOUA 4WR4A 2H70A 3FZ4A 3FY7A 4QL9A 1Z7RA 3V1WA 3QD9A 3LQ7A 3VWVA 3W8SA 1K3OA 2IFQB 3I6AA 5AGYA 1SYRA 2AJQB 1T8EB 3K8NA 4ECCA 3LJRA 5A5KA 2BMXA 1X9SB 4J56E 4X0XA 2DMLA 2N5AA 1TP9A 2C3TA 3H1NA 2PMTA 1QK8A 1XW5A 4XRDA 2B7KA 5IMFA 3JCML 4WETA 1GNEA 2L5OA 3HA9A 1XPVA 3FRCA 2C0DA 1M9AA 1PKWA 2FWFA 4IBPA 5IM9A 2V2GA 2WB9A 4IQ1A 3RHCA 4K9ZA 2GZZA 3US3A 2PUKC 3I69A 3KP9A 1B9YC 1K0CA 3M8NA 2K6VA 4XS4B 3TOUA 2VCXA 4NV5A 3RPNA 2YCDA 4HQZA 3QOUA 19GSA 2H1AA 2H75A 4L5OA 3TRPA 3UEMA 2L4CA 3KIJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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