5B8AA

Crystal structure of oxidized chimeric ecahpc1-186-yfskhn
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C,Peroxiredoxin-2
publication title Transition steps in peroxide reduction and a molecular switch for peroxide robustness of prokaryotic peroxiredoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 47
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b8aA00
4GLTA 3A3TA 4L0UA 5D9TA 4ID0A 1QGVA 3NOFA 4FO5A 3TKRA 1XXUA 2XBQA 2GQKA 2E2MA 1OAZA 4XS6A 1GUHA 3V1WA 2RIIA 1SYXA 2NVLA 2AHEA 2ALBA 2L57A 1RW1A 4RI7A 3QCPA 3ERGA 1LBKA 3HVVA 1QFNA 1QQ2A 4EO3A 1Y25A 4N11A 1O81A 2DJ0A 3TRQA 1OVNA 1XVWA 4WKWA 5DCGA 3IK9A 2V2GA 3MWHA 1R4WA 1BAYA 3IHQA 2PUKC 3C1SA 3VLNA 2CZ3A 3ZTLA 1QK8A 3LSZA 2WCIA 4PQ1A 5J9BA 2P0GA 2CVBA 4JR6A 1WWJA 5G5EA 1SKRB 2FCHA 1EV4A 4F03A 5G5FA 1SJ6A 2FD3A 4KDUA 3UEMA 3ZLPA 2B6MA 3H8QA 1XW6A 4KUNA 4GSTA 1Q4JA 2M80A 4GTUA 1X5EA 1TK5B 2YP6A 5A5KA 4V1Ag 2L4CA 3HZ4A 2IJYA 4DSRA 2E7PA 3WD6A 2EC4A 4HOJA 1EZKA 1XW9A 3ZYWA 2K8SA 4PQHA 3KM6A 4K7IA 5JCUA 4ML1A 4MMMA 4ZBAA 4MZWA 4BWSA 3VPTA 2X64A 2V32A 1A8YA 2J23A 3EMXA 1EGRA 4H86A 2DIZA 1ERVA 3F9UA 4N30A 3TJGA 2H1GA 2QC7A 1XIYA 2OE1A 2GT5A 16GSA 4ZB8A 2DJJA 3QPMA 3RHCA 3EE2A 3C73A 4G19A 4HQZA 1GTIA 4AF2A 1USBA 3GMFA 1VGLA 3U5RE 1GSEA 5ENUA 3BJ5A 2H70A 2HI7A 3UMAA 2JZTA 1O85A 3F0IA 1ZYEA 1OKTA 1A2MA 3QFAC 2YNXA 4WEYA 5DAKB 1A2JA 5JCGA 4KB3A 5DALB 2LUSA 4I2UA 2I3YA 4O32A 3HVSA 4L8EA 4IP6A 5B7CA 3DIEA 3KJYA 3W8SA 3D21A 4N0ZA 2VL9A 3H93A 1M2DA 1VF1A 2IL3A 2NDOA 4KNDA 3APOA 5H5SA 1EP7A 1X5CA 1OE8A 2IWTA 2B1KA 4ZBBA 5D96A 3ERWA 3GH6A 3KTLA 5IMDA 1CQHA 2VD0A 3GSTA 3HJOA 2VM2A 2ZUPA 3LWAA 5E59A 3GL5A 3P7XA 4V1Ap 5DCHA 4I6XA 4FH8A 2X99A 4QQ7A 4TR4A 5HFKA 1QMVA 2DJKA 1U3IA 3LJRA 1OE7A 2GLRA 4D73A 4YAVA 14GSA 4GCIA 5G2ZA 5F8BA 10GSA 2O7KA 2R3XA 4MJCA 4OWYA 3ZIJA 2TRCP 1ZYQB 1EV9A 3EVIA 3KMOA 4IELA 4V2MA 3EMPA 3MSZA 4EE0A 3HDCA 5HQPA 3A2VA 3WGDA 5DJLA 3TB2A 1MD4A 1UN2A 4EVMA 1GUKA 1GNEA 2A2SA 4JEDA 8GSSA 3UBKA 6GSYA 2IN3A 3FZ9A 2H1BA 4MDCA 3OR5A 1NW2A 3TJBA 1GSSA 1I9DA 4AJ8A 5J9CA 3IC4A 3VWWA 1XWGA 3A2WA 1EGOA 4P3YB 2NTOA 2RUEA 3VI5A 1B4QA 4IN0A 4HJ2A 1URMA 3PGTA 3C7MA 1A24A 5CRDA 3TOTA 3VURA 1F3BA 2H6YA 3AY8A 2LV3A 1YZXA 2HT9A 1MEKA 20GSA 1PMTA 3L9VA 5KEJA 2HLSA 2IIYA 3HYPA 2GGTA 4OO4A 1AXDA 1MDJA 4QL7A 2DLXA 1XCCA 3GKKA 4ECCA 2H73A 3EINA 1BG5A 2C1YA 2PU9C 3Q19A 1TKDB 4ZXGA 4MF5A 3TOUA 1PL1A 1OC3A 1X5DA 1AQVA 4RQRA 3GN3A 5FWGA 2WS2A 18GSA 2JACA 2VCWA 4XS4B 5HR3A 4ZL7A 3FZAA 1OYJA 1A2LA 2VO4A 1V9WA 2V1MA 5HFIA 3BOAA 2VIMA 1MD3A 5JWRB 1HYUA 1O6JA 1G7EA 1SK2A 2V41A 2YJ7A 3D0ZA 1XW5A 1GTAA 3TRPA 4KSOA 1J0FA 3RBTA 2LRTA 1SL0B 2MBSA 1WE0A 5AIVA 1R26A 2GZPA 5HFGA 1M0UA 1THOA 2CA8A 2JZSA 5DDLA 4HU9A 3FY7A 4ZL8A 4BL7A 1YY7A 2VLUA 1Z7RA 4IBPA 5IPHA 4XTSA 1TOFA 1PRXA 3FKFA 4GSSA 2GT6A 4PUFC 4GQFA 2LJAA 4X0XA 5A4UA 1U3AA 4DEJA 2L6CA 4LMWA 6GSTA 5IPGA 5ELAA 2HRFA 3UVTA 4ILFA 3Q18A 4I97A 5G30A 2L5OA 4HEA2 5KN3A 2B5EA 1PX6A 3G9BA 1CQGA 3APQA 4BWQA 4ZB6A 4QL9A 1UVZA 3ZRDA 5CNWA 4ZL9A 2JSZA 1DE1A 2GSRA 1SENA 3UVHA 2XC2A 9GSSA 1GNWA 2DMLA 1PA3A 2H6ZA 2F3MA 2LKUA 3DEXA 1ZL9A 4HZ2A 5ECLB 2R6KA 4JRRA 2VCZA 2F8FA 2H19A 5H5QA 1GLQA 4G9HA 5A4VA 5JCWA 3UL3A 3TDGA 5CAXA 5FHIA 2O87A 3I6AA 2CZ2A 1TK0B 3KTBA 3VWVA 3QD9A 2B1LA 4NXIA 3DVXA 2LEGA 1UA5A 2PBJA 3KMNA 3GNJA 2YV7A 3KH9A 2YWMA 2IMFA 4NV5A 2QKEA 4TXOA 5INYA 6GSSA 4KCAA 4ZILA 3D5JA 3F8UA 4XS1A 5DBQA 1BX9A 1GSFA 2VL2A 4LL4B 2JZRA 2REMA 5ID2A 3H4KA 2C3NA 1MDIA 1PGTA 4EC0A 2R2JA 3ZMKA 3FEUA 4HDEA 1O8XA 3TJFA 12GSA 3UIWA 1OC9A 3HD5A 2FUG2 3CSJA 4MPGA 5C04A 1GRXA 1F3AA 1KNGA 1K3OA 2YOIA 2LRCA 4I5QA 4KAEA 5EL8A 4OMVA 5AN1A 3A2XA 3KCMA 3EYTA 5AISA 4WXTA 3GURA 5IOXA 2B3SA 1JFUA 5DJMA 3PH9A 5LD0A 1GSDA 3QDNA 2RUFA 5D9VA 2HZEB 1XFLA 3CMIA 3TKQA 2HZEA 3L4NA 5G1KA 4KCEA 1KTEA 1I5GA 3EURA 4XCSA 2LRNA 4ECJA 4MF6A 4OFTA 3TGZA 4WR5A 1TTZA 2CX4A 1FB0A 1HNAA 3GA4A 3HY2A 1TXXA 1NM3A 1AW9A 3CSIA 4HUAA 2MBTA 3GX8A 2YWIA 2JADA 1Z6NA 4CDOA 2LJRA 2GSTA 1JZOA 2DIYA 2OACA 1JHBA 3KH7A 5ABRA 3ZVJD 2CX3A 3F3RA 2H66A 22GSA 3IDVA 2K18A 3E3EA 3GRXA 3J7Yk 2KUCA 2TIRA 4IS0A 3HJMA 1HQOA 5F07A 3DXBA 2I4AA 4L5OA 4GWRA 1JZWA 5D9WA 2LQQA 2FA4A 1FHEA 3F63A 3BD2A 1TRWA 3WT1A 3L9SA 2L4QA 2YZHA 3CXGA 2PPTA 1JLVA 4JU5A 4EL1A 2IMEA 2FLSA 1JLWA 1FG4A 1SL1B 1FAAA 4MJEA 1SD9A 2C80A 1DBYA 4FYCA 4K0GA 1WIKA 4HQSA 3EU4A 2RLIA 3EU3A 3ZREA 1K0NA 5B6MA 19GSA 5J3RA 4KSMA 4AJ7A 1ZGNA 1NHYA 4TR3A 2QSIA 5H5RA 5F06A 3DD3A 3P90A 5COHA 3TKSC 5DAKA 3ZZXA 5B8AA 2H74A 2DC5A 5DALA 1TP9A 4TN8A 2WULA 1M2AA 1GSYA 1GSUA 4TXVA 3UOMA 1ST9A 2IFQB 3GX0A 3M3MA 2ZNMA 4K0NA 2AYTA 2F9SA 1WP0A 3FR6A 1HD2A 3CYNA 3ERFA 3IK7A 4IP1A 5C00A 1SJZA 2LQOA 2PN8A 5B8BA 4ZIJA 1TW9A 4WETA 1V2AA 1TJDA 5EVOA 2MZCA 4K9ZA 6GSXA 1Z3EA 1LU4A 6GSVA 2C0GA 2H01A 2OKAA 4YQMA 1J9BA 3RAZA 1NHOA 3SWLA 2OA7A 5IMVA 4OCEA 1NSWA 1T1VA 4AGSA 2H0GA 4RQXA 1E6BA 1ERTA 2KOKA 2O89A 2K9FA 1S3DA 5JWQB 1FOVA 1K0CA 2C3QA 2G2QA 2AB6A 5ECQB 2LJKA 3O6TA 1JZDA 1PD21 2H0IA 1EP8A 3HKRA 1BQ7A 3ME7A 5D93A 3LG6A 3TKSE 1M99A 3QAVA 2CV4A 1XZOA 2VCTA 2KP2A 4N10A 1GLPA 1HNBA 2GZZA 2HFDA 3VK9A 5ECSA 4O92A 1Z7PA 3LXTA 4TVEA 3RHBA 1EOGA 2VLVA 3FZ4A 5DQSA 3KXOA 2GQLA 2PGTA 1V98A 2WGRA 1T4ZA 1PKWA 3C1RA 2AV4A 2Z9SA 1XOBA 2F51A 4HS1A 1K0DA 1DE2A 1GL8A 3QOUA 2VOCA 4DSSB 2GDRA 2VCXA 1OC8A 4NAXA 3D6IA 3GHAA 1YF1A 2OADA 3D22A 4F9ZA 3TKPA 5A4WA 2YJHA 3Q6OA 2KHPA 3ZFLA 2D2ZA 4Q5FA 1PX7A 2VAFA 3FHKA 2PMTA 2OJLA 5F0GA 3UAPA 2GVPA 2YN1A 1GTUA 4RUVA 4XRDA 1V40A 4K7OA 2FY6A 2YWNA 1R5AA 4XS4A 1Z5YE 5IQYA 3DRNA 3W6GA 4ECBA 1TRVA 1R7HA 4IW9A 1GULA 1Q98A 3I9V2 1IYHA 1W89A 4KGIA 4MP4A 2WDUA 2EIOA 2R5GA 3HXSA 3PINA 3DYRA 3M8NA 2HSHA 3GFKA 1ZOFA 4K6XA 4IJ3A 5KN2A 1K3LA 4V2NA 4MLYA 2B7KA 1K0AA 1T00A 2PVOC 3HZ8A 2I81A 1O7UA 5G31A 2PVQA 5JWOB 3PR8A 4PX1A 4IGJA 3IAS2 1ZZYA 3HA9A 3H79A 4TR1B 3GIXA 1FVKA 4HU7A 1MDKA 2H30A 2ON5A 4BVXA 1FO5A 4XRAA 2O85A 3SBCA 2X8HA 1K0MA 3HHVA 1K0OA 2YCDA 4IQAA 4Q5RA 5DVBA 4FYBA 2C8UA 4PNFA 3LORA 1O73A 4BA7A 2GSSA 5GSTA 1PQNA 2DJ3A 3W8JA 3F6FA 2OBIA 2C3TA 3WGXA 2H8LA 4JE1A 1GWCA 2IMKA 5HR1A 4J56E 4KA0A 3D4MA 3L78A 3FW2A 4WF4A 2FHEA 2N5BA 3EWLA 3ME8A 4OD7A 3U6VA 2RM5A 2LTKA 3CRUA 2L6DA 2X8CA 3F4RA 4MZBA 3CSHA 4LMVA 1F6MC 5D8IA 4L0WA 4EXJA 5GAND 2PERA 2C0DA 1OKDA 1SKSB 3KD0A 3F4TA 3IOSA 3GTUB 4GRFA 4DVCA 3ED3A 3LGCA 2H1DA 3G7JA 3GUSA 1A0FA 2FWFA 1TRUA 1AUCA 1VF2A 4YH2A 1YQ1A 1ABAA 3ISOA 3D4TA 4TKYA 3QFBC 2C0EA 5DQYA 4MJAA 1G6WA 2QGVA 3RPNA 2WZ9A 2H1AA 2CAQA 4WF5A 4K8MA 5ELGA 3BBYA 3FZ5A 2HE3A 2H6XA 1G0TA 2WB9A 5CYYA 3UBLA 5IO0A 4PQIA 3TCOA 3ZL5A 1PSQA 2OE0A 4E8HA 1F9MA 3APSA 1E2YA 1AQWA 1BYEA 5B6NA 1YKCA 4YQVA 1G6YA 5LNKe 4PGTA 2VLTA 3QAGA 17GSA 4CHSA 5ECMB 1J08A 3L9UA 1EEJA 4BPYA 2FNOA 3QMXA 3KP9A 3I43A 5ECPB 3IR4A 4F0BA 2E2GA 2VM1A 3Q74A 3NZNA 4MCUA 5IMFA 4X43A 3IAM2 4ULXA 2B7JA 1SKWB 4IJIA 2ZCTA 4YAPA 4POBA 5EY6A 1SK0A 2H76A 4L5LA 2N5FA 5AGYA 1U88A 1YKAA 3J7Yb 1O8WA 5KN0A 5L71A 2X8GA 3FYGA 4ACSA 3DMLA 5IMZA 4KDXA 4TRXA 1ML6A 2FWEA 4MH2A 4MF7A 4FYUA 4BVYA 1GSQA 3M1GA 3WYWA 3WT2A 4MJBA 3S9FA 5D73A 2JL4A 2RM6A 1WMJA 5FT3A 2R4VA 5CRHA 4ISDA 3KP8A 1PN9A 1X9SB 4ZBDA 1Y6EA 1Z9HA 4MK3A 3LYKA 3N5OA 3M9KA 4OCFA 1TRSA 4PURA 4FIWA 5IIZA 3BCKA 2R37A 1AC1A 1DUGA 2L59A 1YDKA 5ECHB 2H72A 1A0RP 3VI7A 11GSA 2HSYA 3EC3A 1C72A 2A2RA 1G7OA 1H75A 2ES7A 4NWYA 3GYKA 6GSWA 3IA1A 4LA1A 2VCVA 3GV1A 1XWAA 2BMXA 2CAIA 3WGEA 4OO5A 2GSQA 4JBBA 3IRAA 3LYPA 5EPFA 1XWKA 2K6VA 4MH3A 4KE3A 2YZUA 4ML6A 2LSTA 1K0BA 2VUPA 3GH9A 3NIVA 4HZ4A 3M9JA 4GQCA 1VF4A 2OBKA 2C4JA 3TJJA 4CW9A 1WOUA 1YEXA 3F3QA 2MMNA 3IE3A 4KW6A 3M0FA 4EDYA 1X9WB 2GZYA 3KIJA 1BEDA 2HRNA 5D9XA 1TDIA 3IV4A 5CREA 3VWUA 2GS3A 2TRXA 2N5AA 1AIUA 3CTFA 3RDWA 2MYGA 1B9XC 5J41A 2I1UA 3GKNA 1V58A 1V57A 1VF3A 1FB6A 2AUVA 4EKZA 2JU5A 1LJRA 1M9BA 2HZFA 3TJKA 2IMIA 2EIQA 1XVQA 1GP1A 3VFIA 2HNLA 4TW5A 3G7IA 2IFQA 4KH7A 1B8XA 1PL2A 2O8VB 4EUYA 1B9YC 1XOAA 4I2TA 3ZIVA 5GAPD 2EIRA 5IOWA 3UJ1A 4AJ6A 1R5PA 2L5LA 2P31A 1XWBA 2XHFA 4KDYA 2B5XA 5ECNB 2MMAA 4JR4A 2LNTA 2H0HA 2KLXA 2FA8A 1F37A 3C8EA 3CBUA 4LLRA 2G0FA 2WJUA 2P5RA 2DSAA 3TKSA 1ZMAA 4WBRD 1WJKA 4DSQA 4E8EA 1S3AA 3FK8A 1EEMA 5ECIB 4NHZA 5IMCA 2FWHA 3MDKA 1JZRA 4GF0A 3IXRA 4POMA 2YANA 1TI1A 2F8AA 2HXKA 7GSSA 5GSSA 1XWCA 3VWXA 2ON7A 1X9MB 4D73B 4K2DA 1SL2B 3KGKA 1K3YA 1TU8A 2YPMA 1YJ6A 1FW1A 3DKSA 1IYIA 2DJ1A 4LL1B 5AIXA 1X0RA 2V6OA 4Q5QA 4J2FA 2LS5A 2M46A 4XIHA 2CT6A 3US3A 2C0FA 3TUEA 4G10A 2BTOT 1QUWA 2DJ2A 2FGXA 4IQ1A 1B4PA 3MAKA 3IBHA 1KBNA 3G7YA 1TK8B 4NHWA 4F82A 3C71A 4Z7XA 1GH2A 1QXHA 3GSSA 3HVXA 1TU7A 3O3TA 3CTGA 1M7TA 4POLA 2H71A 1F2EA 1U87A 3BCIA 1XPVA 2B5YA 1HNCA 1THXA 1ZCPA 4Q5NA 3L0HA 4RI6A 2XPEA 2CVKA 2GTUA 3LEFA 1S3CA 3E0UA 1DSBA 3HCZA 1SJIA 3I69A 3O76A 1M2BA 4DSSA 2K8VA 3RPPA 1BJXA 4TOPA 3FR3A 3GL3A 5CO3A 2A4VA 2AJQB 3LQ7A 4MPFA 4O7HA 2H75A 2XPDA 1ON4A 2FWGA 1GUMA 4K1FA 2NBSA 3UARA 5ECRB 3ZVJA 1SU9A 1N2AA 5KN1A 1A23A 2IMDA 4X1UA 2OE3A 3QR6A 2P5QA 3E9JB 13GSA 5CRWA 1EOHA 1EWXA 4MABA 3R2QA 3ZMLA 4POKA 3VPQA 4WBJA 2HYXA 1Z6MA 5F05A 1SD8A 4TR0A 2LNSA 1ERUA 3F4SA 2DBCA 5G1LA 3ZITA 4ECIA 2VD1A 1RK4A 4I8BA 1SK1A 4G2EA 3N9JA 1PKZA 1AQXA 3LXZA 2CQ9A 5IM9A 1KEBA 5LCZA 3P2AA 3A5WA 4YQUA 5GZZB 2JSYA 3JCML 2M72A 4NPBA 4TR1A 2I9HA 4PNGA 4PXOA 5CRGA 5HR0A 1YEPA 4NV2A 2WFCA 1T8EB 1N8JA 4IHUA 2YV9A 4MA9A 2YWOA 4XHMA 1B48A 4O5RA 1WPIA 4EDZA 2WRTA 1T4YA 3IPZA 3FRCA 3GKMA 1VRSD 4GXZA 2MMOA 5HR2A 3CRTA 4KX4A 2DMMA 1UC7A 4PUAA 6GSUA 1ACVA 2V6KA 4F2IA 4JZQA 4EF0A 4OFNA 2J9HA 5ECKB 3ZFBA 1MTCA 5ECOB 3FR9A 2VCQA 2VL2C 4WR4A 3KZQA 1M9AA 4MZCA 2PWJA 1AAZA 2CVDA 1FVJA 5IO2A 2GQMA 3MNGA 3P8WA 1TI3A 5IMAA 1A8LA 4ZB9A 5J5NA 4IKHA 3DGQA 3GTUA 4HJMA 1GTBA 1H4OA 1ILOA 5J4UA 3KEBA 2VL3A 4HI7A 4J57E 2BJXA 1YF0A 3DWVA 1T3BA 3HJPA 3DVWA 1RQMA 1SYRA 1XBSA 2IPAA 4TXOB 3TRXA 4V2LA 4GSNA 3LFLA 5E4WA 4F0CA 2MMZA 1W4VA 5CP1A 3QAWA 4N0VA 4IVFA 1WRYA 2XBIA 5ID2B 4K7NA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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