3GA4A

Crystal structure of ost6l (photoreduced form)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
IDDILQLKDDTGVITVTADNYPLLSRGVPGYFNILYITMRGTNSNGMSCQLCHDFEKTYHAVADVIRSQAPQSLNLFFTVDVNEVPQLVKDLKLQNVPHLVVYPPAESNKQSQFEWKTSPFYQYSLVPENAENTLQFGDFLAKILNISITVPQAFN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Oxidoreductase activity of oligosaccharyltransferase subunits Ost3p and Ost6p defines site-specific glycosylation efficiency.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferas
total genus 39
structure length 156
sequence length 156
ec nomenclature ec 2.4.1.119: Transferred entry: 2.4.99.18.
pdb deposition date 2009-02-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ga4A00
3KH9A 1TRUA 3QAWA 3NIVA 4PURA 4HI7A 2VCWA 4IJ3A 4Q5RA 3GSTA 1JZWA 1MDIA 4KSMA 4MF6A 1MD4A 2CVKA 4N10A 3VPTA 4IN0A 3QR6A 2L5LA 2XBQA 1F3BA 3IR4A 4RI6A 4L5LA 1K0OA 5CRHA 1PSQA 4E8HA 4KDXA 2QGVA 4L8EA 2CT6A 2B5YA 2M72A 2VL2C 1GUMA 4YQUA 3ZRDA 1A2MA 4HEA2 6GSSA 1C72A 4GF0A 4WXTA 3M0FA 1ZMAA 4JRRA 3W8JA 3E0UA 2IPAA 4V2MA 3GSSA 2IMDA 3LXZA 1YY7A 4F82A 3HVXA 3HA9A 1F9MA 4D73A 1A0RP 3TDGA 2GSSA 5D8IA 2OADA 3IOSA 5ECPB 2OE3A 1X9SB 5D9TA 3QCPA 4ULXA 1W89A 5ECHB 1I5GA 3HD5A 3IRAA 3U5RE 2XBIA 4MA9A 3TKPA 3GURA 2PVQA 4TR1B 4ID0A 5DCHA 4F0BA 1GTBA 3E3EA 4ZBAA 3IHQA 2PU9C 3EINA 2YANA 1B8XA 4PQHA 3GTUA 3JCML 2H6ZA 4JU5A 5DDLA 2JZSA 3FRCA 3IBHA 3M8NA 3MWHA 5LCZA 4HU9A 1Q98A 2GDRA 1ZYQB 2H19A 3LSZA 3HZ4A 5ECRB 1Z5YE 1G7EA 1DSBA 4E8EA 1PGTA 1NSWA 4QL9A 4KH7A 8GSSA 2V2GA 2VAFA 1PKWA 4I2TA 5D9WA 4N0ZA 2H73A 2YWNA 2E0QA 1K0NA 1QUWA 2LRCA 2V1MA 1TK5B 3FYGA 3APQA 3KGKA 1F37A 2ZUPA 4YQVA 3TRXA 2F9SA 4OCEA 4IW9A 4EXJA 5CYYA 4LMVA 3EYTA 5IIZA 14GSA 2DIZA 4IP1A 1EWXA 1GTUA 4FYUA 4XS6A 3A2XA 4JBBA 1YKAA 5KN2A 3D4TA 2H01A 4KGIA 2XPEA 3APSA 5ABRA 1YEXA 1N2AA 3HYPA 3VLNA 3DYRA 2DJKA 3VURA 4IHUA 2H0HA 5HR0A 4YQMA 19GSA 4G10A 5CRGA 2X8GA 2L4CA 4LA1A 1XBSA 2O8VB 3RBTA 2DIYA 4TRXA 2YPMA 2MMOA 1O8WA 1K3LA 1U3AA 2JZTA 2ON7A 3BBYA 1SL1B 4MF7A 3K8NA 2RM6A 1Z9HA 1VF3A 2H0GA 1O85A 2IFQB 4WR5A 5JWRB 4K9ZA 4ECCA 2EIQA 1OC8A 5JCUA 5G5FA 2YV7A 4OFTA 4WBJA 2CZ2A 1BJXA 4OO5A 2B6MA 1XXUA 1M99A 4K7OA 1B4QA 2O7KA 2AYTA 2QSIA 4HZ2A 2F8FA 1TRWA 2RM5A 1TOFA 5IQYA 2L57A 4ML1A 2I3YA 2Z9SA 4O7HA 1RW1A 1V40A 4HJMA 3F0IA 2EIRA 1S3CA 5ECNB 1TI3A 4NWYA 4FO5A 1T3BA 4NPBA 4BWQA 1HNCA 3FR9A 7GSSA 3KXOA 2HI7A 2O85A 2GQMA 2P5RA 3VWXA 3W6GA 1Y25A 3KD0A 2YZHA 3FR3A 5DJLA 3QMXA 3NZNA 2A2SA 1GLQA 1EOGA 1J9BA 2P31A 1PL1A 1GSYA 3DKSA 4RUVA 1PL2A 2R3XA 1K3YA 2B3SA 4MH3A 5AIVA 3MSZA 3IK7A 1S3AA 2CAQA 1ERVA 4ZL7A 3CSHA 2CZ3A 4MDCA 3IC4A 3QFAC 3DEXA 4TXOB 4LL1B 2H8LA 5IPGA 1GSUA 4DSRA 2IMIA 3CRTA 2P0GA 1VF1A 4FYCA 2G2QA 2C8UA 4MZWA 2GSTA 5KEJA 4GQFA 4OD7A 4NMUA 3UJ1A 2H72A 3W8SA 2GZYA 2NVLA 1HYUA 3ZREA 1FO5A 3IV4A 2IWTA 3GMFA 3EMPA 1CQGA 1EV4A 5H5SA 2GSRA 3FZ9A 1PRXA 2LSTA 2VD1A 1B9XC 2AJQB 2FHEA 5J5NA 1H75A 5D96A 1M9BA 3CXGA 3TCOA 4K6XA 4EE0A 5J9BA 3Q18A 1AW9A 5CNWA 5B8BA 1J0FA 1AC1A 3L78A 6GSVA 3RDWA 1K3OA 1G6YA 1IYHA 1AUCA 4XS4B 4K0NA 2PN8A 4XHMA 1KNGA 5FHIA 1YF1A 4V2NA 3HVSA 1PX6A 3ME7A 5ECKB 3WGDA 2FA8A 1TRSA 1NHOA 5LNKe 2FWEA 2KLXA 2R6KA 3ED3A 2IIYA 2B5XA 5GSSA 5EY6A 3KZQA 1RQMA 4HJ2A 1U3IA 3VFIA 1ZZYA 2MMNA 2KP2A 5AIXA 22GSA 4ZB6A 1HNAA 3AY8A 3SBCA 5ELGA 3ZIJA 4MJCA 5DAKB 2V41A 5IM9A 4WR4A 1SK0A 1ZYEA 1JHBA 4P3YB 4Q5FA 4EUYA 3TB2A 1SK1A 2GGTA 2NTOA 2RIIA 3LXTA 2V6KA 2NBSA 4IP6A 2BJXA 5G1KA 3M1GA 3RPNA 3GL5A 4BA7A 1SU9A 3N5OA 5ECQB 1FAAA 3LWAA 2HRNA 1AQXA 1H4OA 1SENA 2OKAA 2N5AA 1Z6NA 3GNJA 4EF0A 3PR8A 1TKDB 4JE1A 1UA5A 2F3MA 1X5CA 2DJ1A 5ECMB 2GT5A 1E6BA 3ZVJD 2A2RA 3EVIA 3ZZXA 3UBLA 2B1LA 4IBPA 4V2LA 1T4ZA 1K0BA 2I4AA 2K8VA 1R5PA 1SD9A 1FB0A 4GRFA 3MAKA 5HR2A 5GAND 1GTAA 2AUVA 2KOKA 2PWJA 2N5BA 4I2UA 4EVMA 3FY7A 5EL8A 4WETA 1EEMA 2O87A 4POKA 2IFQA 4J2FA 2XC2A 3GL3A 1R4WA 1O7UA 4GWRA 2IL3A 1CQHA 5DVBA 5IMDA 4JR4A 3VWVA 1ZCPA 3LGCA 2FWHA 2OACA 3WYWA 1GP1A 2KUCA 4MJEA 4Q5QA 4MP4A 1HNBA 13GSA 2FCHA 4I5QA 3SWLA 1R7HA 5IOXA 3KP8A 1V98A 4K2DA 3WGEA 2I81A 2LJRA 3UOMA 4QL7A 1TW9A 4FYBA 1TU8A 3VWWA 2DLXA 6GSWA 4BPYA 1N8JA 4XRAA 5F07A 1Y6EA 1EP8A 1T00A 2OBIA 3HY2A 4OFNA 1O8XA 4WF5A 1A24A 5ECSA 1TXXA 2DC5A 3HVVA 2MBSA 1UC7A 3CSJA 4JR6A 4OFMA 1JZOA 4IQAA 1M9AA 1SK2A 18GSA 2C4JA 2GTUA 4LMWA 2NPBA 3VK9A 5DBQA 2LQOA 3ZIVA 2K9FA 3G7YA 1GSDA 3LFLA 1PA3A 4TW5A 3IPZA 1PD21 16GSA 3GX0A 1GULA 1K0DA 2TIRA 4DSSB 3EU4A 2HZEB 3TKSE 1OC9B 4RQXA 4TXOA 3TKRA 2X99A 3IDVA 2CV4A 4KA0A 2F51A 4HOJA 2H1AA 1THXA 3P8WA 3GH9A 4TR4A 3TRQA 1F3AA 2H75A 3VWUA 1X9WB 1JZDA 1JZRA 3F4TA 2YOIA 4IS0A 1WWJA 1GL8A 1SJIA 3LYPA 3Q74A 1ERUA 2GZZA 3C73A 3IAM2 6GSYA 3F63A 4WEYA 5DCGA 2E2MA 2KHPA 4NV2A 2GQKA 3S9FA 1SL2B 1G0TA 2D2ZA 4NHZA 4ISDA 3L0HA 3QPMA 4EDZA 3D21A 2IMFA 3HDCA 4MF5A 1TRVA 4G9HA 2HSHA 2VLVA 3CRUA 5COHA 3CTGA 2JSYA 5KN3A 3ZYWA 2HZFA 4XS4A 2CVDA 3F3QA 1T8EB 3UEMA 3DIEA 1ON4A 4MJAA 2FY6A 5DALA 1BEDA 3QDNA 4XCSA 3HJPA 3A2VA 2LQQA 3M9KA 1U88A 1Z7PA 3PH9A 5CAXA 2VUPA 3TOUA 3Q6OA 2DBCA 5ECIB 4IJIA 1IYIA 4MJBA 2E7PA 1ML6A 2FUG2 2YZUA 3LG6A 2WB9A 3ZMLA 5A4UA 1ABAA 5DAKA 5IMZA 5JWOB 5CRWA 1USBA 5E59A 2HYXA 1GSEA 2H70A 2YN1A 5B6MA 1YJ6A 3PGTA 2J9HA 1GRXA 1XOBA 3WD6A 2LV3A 3H4KA 2M80A 2C0DA 2AHEA 2TRXA 3ZFLA 4ZBDA 4EO3A 5F0GA 2VD0A 4PNFA 2DJ2A 3US3A 3UBKA 3GN3A 2FNOA 3EWLA 2WCIA 4BL7A 1SYRA 3TRPA 3HXSA 3EU3A 1MD3A 3TKQA 1ZGNA 3FK8A 1WP0A 3LEFA 1BYEA 1TJDA 3GIXA 5IOWA 4ECIA 3J7Yb 1HQOA 4MH2A 3BCKA 4OO4A 4RI7A 4JEDA 4AGSA 1EP7A 3UVTA 3LYKA 4GCIA 3GKKA 2K6VA 2VL9A 3CMIA 4K1FA 3UL3A 2XPDA 3IK9A 3L4NA 1AQVA 2EC4A 1A0FA 1DBYA 2DMLA 2VCXA 1OKDA 3U6VA 1ST9A 3TKSA 2OE1A 3I69A 4MMMA 1V2AA 3M3MA 2CX4A 1WJKA 2FGXA 4GLTA 4X0XA 2R4VA 4ZL9A 1EZKA 2PBJA 3DMLA 1FOVA 2A4VA 1SL0B 5JCWA 10GSA 1O6JA 4N11A 3GUSA 4KCAA 3DWVA 1THOA 2ZCTA 4KDYA 2L59A 2H1GA 4PGTA 5B7CA 5G31A 2FA4A 2CVBA 2RUFA 5INYA 2V32A 5HFIA 1WPIA 2B1KA 4PUFC 2MZCA 2C0EA 4Z7XA 3UIWA 1XW6A 3GYKA 1AIUA 1QFNA 3ERFA 1X9MB 1G7OA 4O32A 2QKEA 3I43A 3VI5A 4JZQA 1TP9A 1URMA 4MK3A 3I6AA 2VM1A 3DVXA 3KCMA 1TI1A 3KH7A 2VM2A 2R37A 5B8AA 3BD2A 3IAS2 3CSIA 4CHSA 5DQYA 3KTLA 2K18A 5A4WA 20GSA 5ID2B 2GQLA 2H0IA 4X43A 4K7IA 3C7MA 2M46A 2YWIA 5ECOB 2H74A 5F06A 4POBA 1LJRA 4TR1A 2FLSA 5KN0A 4YH2A 3EE2A 5GZZB 3V1WA 5ECLB 2AV4A 4WBRD 3FEUA 2FWFA 1MDKA 4BVYA 4HQSA 4XS1A 2NDOA 1OE8A 5G1LA 3HJOA 2I9HA 1VF2A 2WJUA 3F8UA 2YWOA 3FW2A 4G2EA 3P2AA 1XVWA 2AAWA 4DVCA 4NXIA 5AISA 1A2JA 3ISOA 1OYJA 1GSQA 2TRCP 4F9ZA 2V6OA 1XFLA 2LNSA 3C1RA 5CRDA 5EVOA 4ZB8A 2H71A 4TR3A 4CDOA 2HSYA 5CO3A 2VL2A 5G2ZA 2OBKA 3TJJA 4OWYA 2VCVA 4J56E 2EIOA 5FWGA 5IPHA 1KTEA 5HR1A 1Z6MA 4XIHA 2OA7A 4ECJA 2H6XA 1XWCA 4MCUA 1A23A 5L71A 3C71A 3ZL5A 3D22A 2JL4A 1W4VA 1V9WA 1I9DA 5IMCA 4TR0A 4ECBA 2FD3A 2GLRA 2HRFA 3FKFA 1J08A 1GSFA 4XTSA 4F03A 1YEPA 3D5JA 3TJFA 4TXVA 3ZFBA 4V1Ap 1PKZA 4OMVA 3KM6A 5KN1A 1K0MA 1ZOFA 2K8SA 1KBNA 3F9UA 3HZ8A 4ZBBA 3ERGA 1E2YA 2R5GA 4PX1A 2L5OA 4KE3A 5IMAA 3GHAA 2RLIA 4ACSA 3O76A 2YJHA 5DQSA 1TDIA 3J7Yk 2PGTA 1WIKA 1SKRB 1B9YC 4GSSA 4ZIJA 3A5WA 1FVJA 1TU7A 2LS5A 3H79A 1WE0A 17GSA 5B6NA 2MYGA 2IJYA 1JFUA 3ME8A 1SJZA 1SJ6A 3VI7A 2REMA 2VLTA 4KCEA 4EC0A 1PN9A 5J9CA 1DUGA 1GNWA 1ACVA 1EGOA 1XPVA 4EKZA 1KEBA 1BX9A 2YWMA 3LORA 2PUKC 3I9V2 1VRSD 4F2IA 1BQ7A 3FHKA 2F8AA 5J41A 4DEJA 4PXOA 6GSXA 5D73A 2WULA 5ELAA 1Z3EA 2JADA 4AJ8A 3EURA 1YQ1A 4CW9A 3OR5A 1GWCA 2VIMA 1VGLA 4V1Ag 5HFKA 5G30A 2H30A 2ALBA 1GH2A 3F6DA 5D9VA 3F4RA 2LKUA 3UAPA 1TTZA 4TN8A 1YDKA 1T1VA 2L4QA 3HKRA 4G19A 2HT9A 2YNXA 1ZL9A 3M9JA 5IO2A 1XVQA 3FR6A 2YCDA 1ILOA 2JACA 2ZNMA 2HNLA 4KX4A 2GSQA 4J57E 4KDUA 1QQ2A 1X5DA 2C3QA 1EV9A 3DVWA 1AXDA 3FZ5A 3UARA 2VLUA 2CA8A 1TK8B 3TGZA 2X8CA 2HLSA 2HXKA 2KP1A 4NAXA 1YZXA 4MZCA 4ZILA 4QQ7A 4BVXA 3H93A 3EMXA 1SYXA 3P7XA 5E4WA 4K8MA 1S3DA 4GTUA 3LQ7A 5ID2A 4FH8A 4TVEA 4O5RA 3QOUA 1DE2A 3CYNA 3KEBA 1PX7A 1FVKA 4WF4A 2DJJA 2LNTA 4AJ7A 1PMTA 2B7JA 6GSTA 2H66A 3QAVA 2ON5A 4NHWA 4X1UA 4PQIA 2VOCA 3MNGA 5C04A 3D6IA 5EPFA 3KTBA 1QXHA 5HQPA 1QGVA 2G0FA 1EEJA 3GH6A 4HQZA 5F05A 1DE1A 1WOUA 1T4YA 4IVFA 4N0VA 2H76A 5JWQB 1MEKA 9GSSA 5F8BA 3KP9A 3RHCA 4PQ1A 2IMKA 5C00A 1AQWA 2PMTA 1B4PA 3C1SA 3HJMA 3GA4A 1R26A 4N30A 1XOAA 4HZ4A 1FW1A 3NOFA 2XHFA 3IE3A 2I1UA 3DRNA 3A3TA 4HU7A 6GSUA 2C3TA 4BWSA 2CAIA 3O6TA 3RAZA 4TOPA 2HFDA 1XWAA 2YJ7A 2C80A 1SD8A 3BCIA 5J4UA 1EOHA 2X8HA 4IKHA 3TUEA 3E9JB 4IQ1A 2C1YA 1A2LA 3EC3A 4MABA 3GKNA 4ZL8A 4HUAA 1OVNA 3HCZA 2N5FA 2C0FA 3FZ4A 4F0CA 1YF0A 5G5EA 1M2BA 3VPQA 2VL3A 3LJRA 2L6DA 3GX8A 5IMVA 5D9XA 3L9VA 1OE7A 2ES7A 4HS1A 5H5QA 1F6MC 3GFKA 11GSA 4ZXGA 4H86A 1FG4A 3N9JA 4RQRA 1EGRA 4MLYA 2YP6A 5CREA 1FB6A 2LUSA 2BMXA 3A2WA 2E2GA 1Z7RA 1M0UA 4D73B 3WT1A 1XW9A 3KMOA 1QK8A 1VF4A 2LTKA 2VCQA 4DSQA 5A4VA 3FZAA 3PINA 3GV1A 1WMJA 2VCZA 2BTOT 2GS3A 5CP1A 2H1DA 3QAGA 2CX3A 1MTCA 2GVPA 4PUAA 3P90A 3F3RA 4LL4B 4KW6A 2WGRA 4YAVA 1PQNA 2HE3A 4IELA 4OCFA 1U6TA 3WT2A 3KJYA 4NV5A 3GKMA 5GSTA 1LU4A 1F2EA 4KSOA 1G6WA 1MDJA 3ZVJA 3BOAA 3QFBC 1K0CA 4KAEA 3GTUB 4WKWA 1UVZA 4TKYA 3TJBA 4FIWA 4MZBA 3C8EA 1BG5A 1XWBA 2GT6A 3UMAA 1OKTA 4Q5NA 4AF2A 1R5AA 2VO4A 3CBUA 4KB3A 5ENUA 1RK4A 2R2JA 1O81A 2LEGA 3BJ5A 5FT3A 3G7IA 2IN3A 3KIJA 1WRYA 4POLA 1JLVA 4EL1A 3MDKA 3O3TA 4K0GA 1M7TA 4YAPA 4L5OA 4KUNA 1GTIA 1M2DA 1V57A 2B7KA 2DJ3A 2LJKA 2QC7A 4DSSA 1K0AA 1GSSA 2HZEA 5DJMA 1LBKA 1OC9A 2YV9A 2WZ9A 5GAPD 1ERTA 1HD2A 3H8QA 1B48A 1SKWB 5JCGA 1XIYA 1GNEA 4KNDA 3WGXA 5A5KA 4L0UA 4ILFA 2IMEA 1XWGA 2MMAA 3UVHA 1XCCA 1A8LA 3QD9A 4GXZA 2DSAA 5AN1A 5IO0A 3APOA 1SKSB 1NHYA 1ERWA 5DALB 1GLPA 2L6CA 1GUKA 1YKCA 2C0GA 3TKSC 3RPPA 1QMVA 2LRTA 3RHBA 2J23A 4IGJA 1XW5A 3GRXA 3ZTLA 4O92A 3KMNA 1BAYA 2WS2A 2MBTA 3G7JA 3TJKA 1GUHA 2DJ0A 2LJAA 1X0RA 2CQ9A 1M2AA 2LRNA 2H1BA 4AJ6A 1XWKA 2WFCA 4K7NA 2PPTA 1A8YA 4GSTA 5LD0A 2GZPA 1U87A 2C3NA 2FWGA 5J3RA 4L0WA 3R2QA 3L9SA 5HR3A 2WRTA 3TJGA 3F6FA 3ZITA 3IA1A 3D0ZA 2AB6A 1OAZA 3F4SA 4PNGA 3G9BA 2OE0A 4LLRA 5H5RA 4ZB9A 2OJLA 4I97A 3Q19A 1XZOA 3CTFA 1NM3A 3ZMKA 5AGYA 4I8BA 1Q4JA 1O73A 3ERWA 12GSA 2B5EA 4HDEA 1TK0B 3DD3A 4ML6A 4XRDA 2H6YA 1JLWA 2DMMA 5IMFA 1T7PB 2JU5A 3DXBA 2X64A 3D4MA 4I6XA 3HHVA 2JZRA 4MPFA 1NW2A 2RUEA 4POMA 3L9UA 2PVOC 1X5EA 2JSZA 5D93A 5HFGA 3GKXA 4GQCA 4EDYA 1AAZA 4MPGA 1OC3A 2PERA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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