3GA4A

Crystal structure of ost6l (photoreduced form)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
b'IDDILQLKDDTGVITVTADNYPLLSRGVPGYFNILYITMRGTNSNGMSCQLCHDFEKTYHAVADVIRSQAPQSLNLFFTVDVNEVPQLVKDLKLQNVPHLVVYPPAESNKQSQFEWKTSPFYQYSLVPENAENTLQFGDFLAKILNISITVPQAFN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Oxidoreductase activity of oligosaccharyltransferase subunits Ost3p and Ost6p defines site-specific glycosylation efficiency.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferas
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 156
sequence length 156
ec nomenclature ec 2.4.1.119: Transferred entry: 2.4.99.18.
pdb deposition date 2009-02-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ga4A00
4ECIA 14GSA 4MH3A 3CSHA 3HJMA 1K0BA 4I2UA 6GSVA 1HNBA 4KX4A 1HQOA 1HYUA 6GSUA 4KDXA 5A4WA 5IPGA 2I4AA 1T00A 2NDOA 3CTFA 1AIUA 2H1DA 3UL3A 1Q98A 4PNGA 2O7KA 3U6VA 4F9ZA 5GSSA 1BYEA 1PA3A 4PNFA 5ECQB 5D73A 4DVCA 3M3MA 3GL3A 2C80A 3CSIA 3PINA 3UIWA 3SWLA 1O8XA 3CBUA 1BQ7A 5C00A 4OO5A 5HR3A 3HYPA 5AIVA 5KN1A 3HHVA 1UC7A 3IBHA 4IELA 3KTLA 2JU5A 2GZYA 1A8LA 2VO4A 3TJFA 1X9MB 2F51A 1YF1A 3VURA 1TKDB 2MBSA 3ERFA 2CAQA 1OKTA 3EU4A 2FHEA 4ACSA 4K1FA 1TI1A 3VK9A 1EZKA 3F4RA 1SU9A 4HZ4A 1T8EB 1H4OA 4EKZA 3ZITA 3VWUA 3GKMA 3GN3A 2DJ1A 5J3RA 4E8HA 1K0OA 3ZVJA 1GSUA 1WOUA 2L6DA 2H1AA 5J41A 1OKDA 2LEGA 4O32A 1O6JA 2MBTA 3F0IA 4MH2A 3TGZA 5ECRB 3H93A 3VLNA 1TJDA 1FB0A 4XHMA 4K7NA 1MDIA 5B6MA 3BBYA 4AJ7A 2VM2A 4K8MA 3GH9A 3H79A 4IBPA 4PQIA 5D93A 1QK8A 2FWGA 1ERWA 2OA7A 2PU9C 3QFAC 3ZRDA 3KEBA 12GSA 3O76A 5G1LA 3R2QA 3ZREA 3M0FA 17GSA 5GAPD 3V1WA 1QFNA 2YN1A 1O7UA 2VM1A 4MA9A 3WGDA 3PGTA 3GFKA 2F8AA 2NTOA 3F8UA 5D9VA 1TW9A 1TOFA 4BVYA 2HT9A 2GSTA 5IMVA 4ZBBA 2H74A 2E2MA 2H6YA 4EF0A 2LTKA 3QCPA 5COHA 19GSA 4MABA 2A2SA 2K18A 3GKXA 2GZZA 2HI7A 2LJRA 3L9UA 5CP1A 2H8LA 5J4UA 3EVIA 1DSBA 2C0DA 2V1MA 2HE3A 1YY7A 2V6KA 3I69A 2V41A 1T3BA 4POMA 5DCHA 2H66A 3DKSA 1TK5B 5EY6A 4MJCA 2LNSA 3APQA 1SL2B 3DWVA 1OC9B 2JL4A 4LL1B 2NBSA 1J9BA 1MD4A 2F9SA 4XS4A 2XC2A 1X5CA 3M9KA 2L57A 3TRPA 3U5RE 4CHSA 4TKYA 4RQXA 1R5PA 4TXOB 3FY7A 1PGTA 1M9BA 3TKSE 3HZ8A 4ZBAA 4YAPA 3TKSC 2WS2A 3GA4A 5GAND 5HFIA 1EGRA 4LL4B 2X8GA 1GLQA 1TK0B 5J9CA 4JR6A 2IMEA 2CVKA 2G0FA 2KUCA 2GZPA 3GIXA 2QKEA 2AUVA 4CW9A 1B9YC 4OO4A 3Q18A 4POKA 2VAFA 2DMLA 1ZMAA 2L5LA 5KN0A 1ZCPA 3LYPA 3ZLPA 3PR8A 3APSA 3QR6A 4NHWA 4HI7A 2F3MA 4ZIJA 2O8VB 1OAZA 5EVOA 2C3QA 1FVJA 2LS5A 4BPYA 3CXGA 2M72A 4L0UA 4QQ7A 2J23A 5ABRA 2TIRA 5ECOB 1BJXA 4HDEA 4EC0A 3IHQA 3DXBA 4FYCA 4K9ZA 1PQNA 3H1NA 5DAKB 1OC8A 2D2ZA 3D4TA 3UOMA 1G0TA 4ECCA 3KP9A 4FIWA 4KW6A 4GSSA 3LG6A 4X1UA 5H5SA 3ERGA 4K7OA 5DQSA 1GSEA 2MMAA 3IOSA 4BWSA 5DJMA 3P7XA 2LJAA 1SKWB 2CVBA 1M9AA 5CRDA 4Q5QA 5HFKA 4GCIA 3F6DA 2YJ7A 3BD2A 1MDJA 2MMZA 4NXIA 4V1Ag 3GNJA 5G1KA 3D22A 5AISA 1IYIA 1TRVA 3KTBA 1VF1A 2H6XA 11GSA 2K9FA 1ABAA 3TDGA 4GTUA 1M2DA 1FAAA 2GT6A 3ZZXA 1TRUA 2K6VA 3M1GA 4H86A 1A24A 3M8NA 4TR1A 2DIYA 4MZWA 2HRFA 3N9JA 3IK7A 5CRWA 1V98A 2R3XA 2GGTA 4IJ3A 5H5RA 3VWXA 5D9TA 4TOPA 3FZ9A 2B7KA 4MMMA 1EV4A 1EGOA 3NOFA 5G31A 5DBQA 3LWAA 4V2NA 1HD2A 2AYTA 1F3AA 3GYKA 4AF2A 4JEDA 4OMVA 2V2GA 3APOA 3E9JB 2FLSA 1S3CA 3E3EA 1O73A 5INYA 4WR4A 1V9WA 2FCHA 1KBNA 3ME7A 4OFTA 2AHEA 1VRSD 1X5EA 4MF6A 4MK3A 5ECIB 2GTUA 4I97A 4L0WA 5JWQB 3FR6A 2H01A 3HJOA 1M99A 4IVFA 1RK4A 1AC1A 1V40A 4EUYA 3IK9A 3TJBA 1SJZA 1Y6EA 4HQZA 4N10A 2ES7A 5A4UA 4GSTA 4GQFA 3GTUA 2OBKA 4WBJA 3FEUA 4JZQA 3N5OA 2MZCA 2X64A 3TKPA 2OACA 4D73B 1T7PB 3TJGA 1CQGA 5KN3A 1WMJA 2TRCP 4AJ6A 3GHAA 4LMWA 2GQKA 4ZB8A 4ECBA 1QGVA 1BG5A 4Q5RA 1G6YA 3TCOA 1JLVA 1F2EA 5EL8A 2PGTA 3FZAA 1TRWA 1F9MA 2M80A 4OCEA 5B8BA 2H6ZA 4KSMA 2GQMA 2K8SA 3LXTA 2YWOA 3D5JA 4I8BA 4IJIA 1GTBA 2KLXA 4TRXA 2PERA 4IQAA 2PBJA 4V2LA 1H75A 1GP1A 1TK8B 4EE0A 4YAVA 1GLPA 3QOUA 6GSYA 4IP1A 2TRXA 4JBBA 2C3NA 1NM3A 2LJKA 2J9HA 5DJLA 4Z7XA 2JACA 1E6BA 2FWFA 4TW5A 4L5OA 1ZGNA 3MDKA 2P5RA 2RM6A 4JU5A 4XS6A 3ZL5A 4I5QA 2H70A 4ECJA 2Z9SA 1GTAA 3UVTA 3J7Yk 2HXKA 4DSQA 2PMTA 3UVHA 1XOBA 3PH9A 1K3YA 4ILFA 1U3IA 5AN1A 1XOAA 1TTZA 3TUEA 2GVPA 3C73A 10GSA 4KNDA 4XCSA 1WE0A 2OADA 1X5DA 4HOJA 2DMMA 1YEXA 2E7PA 5A4VA 5IOWA 1XVQA 2KHPA 4RQRA 5D96A 1YDKA 1ON4A 2CV4A 1JZDA 1BEDA 4CDOA 1VF3A 1GSSA 2EIQA 2JSYA 4XRDA 2CX3A 3KMOA 2V32A 1AXDA 2H19A 3C1RA 4KDUA 3Q6OA 2B5XA 2VCVA 4ZL9A 2FA8A 5ECHB 2KP2A 1Y25A 3GX0A 2H1BA 4WEYA 2YP6A 1OE8A 1XVWA 1FG4A 1XWBA 2VUPA 3C7MA 5CO3A 4MZCA 1V2AA 5B6NA 2HFDA 2M46A 3KD0A 1W89A 3TRQA 3ISOA 2H30A 4IP6A 3KZQA 1DE2A 3QAVA 2EIOA 3LFLA 5E59A 3TKSA 1U3AA 4ZXGA 4G9HA 2C0EA 1SENA 1QXHA 2CAIA 3IE3A 5A5KA 4F0BA 1Z6NA 1OE7A 5DDLA 3LSZA 1O85A 3FZ5A 1K0AA 2K8VA 2KOKA 4FYUA 4GXZA 2LUSA 2RUEA 1GNWA 2CZ3A 1B4PA 5CYYA 2REMA 2X8CA 1YF0A 1ZYQB 3HDCA 3J7Yb 1GTIA 3A2WA 4BWQA 1O81A 4EVMA 3GX8A 3FKFA 2VD1A 3P2AA 2YZUA 4AGSA 2CZ2A 3ZMLA 1R5AA 5JCUA 3I43A 5JWOB 2RM5A 2VL2C 5ELGA 3RDWA 3WYWA 2O87A 5ECMB 4ZL7A 3LXZA 3G7YA 5LNKe 3FHKA 1SYXA 1HNCA 2IPAA 3D0ZA 1MTCA 1ERUA 4F0CA 1XW6A 1PD21 5ECKB 2LNTA 3QAGA 3G7IA 1MDKA 1EP8A 4NPBA 1PMTA 4XS4B 2R5GA 4LA1A 5CNWA 2JADA 20GSA 2O85A 2GS3A 1EOGA 1B9XC 4L5LA 2HZEA 3FR9A 1X9WB 4KCAA 4MJAA 1EV9A 4J57E 2MYGA 2IN3A 2HSYA 3GKKA 4TN8A 1JHBA 2PUKC 1V58A 2ON7A 3F4TA 3EWLA 4FYBA 4KH7A 3M9JA 4MF5A 3F3RA 4DSRA 1XWCA 4MZBA 1GSYA 1GL8A 5F05A 3C8EA 4DSSA 2H76A 1Z9HA 5IQYA 1SL0B 3TOTA 3F6FA 5B7CA 1AQVA 4LLRA 2FUG2 5J5NA 1JZRA 4KAEA 1SJIA 2BMXA 1PL2A 1OC3A 4QL9A 2KP1A 4IN0A 1U6TA 2DC5A 2C3TA 4XS1A 3L9SA 1Z7RA 2FWEA 1EEJA 2ZCTA 1TU8A 1XWGA 3ZYWA 3ED3A 2P31A 2YWMA 3LJRA 9GSSA 3L4NA 1PN9A 5CREA 1Z3EA 2VLTA 3GSTA 2CVDA 2C0FA 3RHCA 1XIYA 3VWVA 5IPHA 5AGYA 2RLIA 1F37A 5KEJA 4ZBDA 4WXTA 3CYNA 2LQQA 3AY8A 1ERTA 2VL3A 4P3YB 4TXVA 2L59A 4EDZA 5IOXA 5IMDA 4PXOA 3GUSA 3L9VA 2V6OA 1MEKA 2C8UA 1GH2A 2LRTA 2QSIA 3UJ1A 1BX9A 13GSA 2R2JA 4N11A 3D6IA 3A5WA 1U87A 2JZRA 3DYRA 4NV5A 5GSTA 1CQHA 4FO5A 2B5YA 5L71A 4YQVA 1VF4A 2GQLA 4NV2A 2IWTA 1N2AA 3RPPA 4N30A 1SYRA 2LRNA 1ML6A 3NIVA 2E2GA 3QMXA 2OBIA 3DGQA 4Q5FA 2OJLA 5F07A 3DVWA 4MJEA 2MMOA 3ME8A 3UAPA 3TJJA 2F8FA 5ID2A 4KB3A 2LRCA 1NHOA 1GUKA 2N5BA 2WB9A 2OE1A 3F9UA 2MMNA 3IR4A 3IAS2 1YQ1A 5G5FA 3ZTLA 1TRSA 4V1Ap 1SD9A 3EYTA 1X9SB 2H72A 4WETA 5ECNB 4TR1B 2H1GA 4MPGA 2L6CA 6GSSA 18GSA 2B5EA 2VCXA 4O92A 5JCGA 1Q4JA 2I3YA 3KCMA 1YJ6A 2VCWA 2E0QA 4KA0A 2B7JA 4F03A 1DUGA 5JWRB 3IDVA 1Z5YE 3TKQA 2N5AA 3LQ7A 3KGKA 3US3A 4WF5A 2JSZA 1XBSA 2IFQA 3TKRA 5G5EA 2DSAA 3GH6A 3FW2A 1FHEA 3IA1A 1HNAA 5C04A 2OE0A 3Q74A 2HNLA 5CAXA 4IQ1A 5H5QA 2X8HA 3MNGA 3D21A 5DALA 3UARA 3P90A 4PUFC 2X99A 3DMLA 1FO5A 2B3SA 4NMUA 3GTUB 1GUHA 4KGIA 1TI3A 4NWYA 4MCUA 3LGCA 1USBA 4OFMA 3E0UA 4YH2A 1MD3A 4GQCA 4ZL8A 1WPIA 4O5RA 1IYHA 3HXSA 3QFBC 1J0FA 4K7IA 1K0MA 3F4SA 2AB6A 6GSTA 2H73A 2BTOT 3FYGA 3EE2A 5D8IA 3CMIA 1OYJA 3MSZA 2I1UA 3BOAA 3GRXA 3DIEA 1UVZA 2AJQB 2VIMA 2VLVA 3KIJA 3UEMA 4K2DA 1XW5A 2HYXA 1ZL9A 2WRTA 1ACVA 4Q5NA 3VPTA 4KCEA 1M7TA 1NSWA 2HZFA 4K0GA 1EWXA 2G2QA 2VLUA 3BJ5A 5LCZA 2PPTA 1SJ6A 3FK8A 5DVBA 1GSDA 1T4YA 3D4MA 2DJKA 2IMIA 1LU4A 4HUAA 4KE3A 4PQ1A 2H75A 1AQWA 3UBLA 3CTGA 4WF4A 3WD6A 3FRCA 3OR5A 3HZ4A 3WGEA 1TU7A 1PL1A 3KM6A 4MLYA 4IKHA 4PX1A 3WT1A 1KEBA 3ZIVA 1TXXA 2ALBA 1YKCA 2IIYA 1TDIA 2DLXA 1W4VA 4GRFA 4IW9A 3IC4A 2RIIA 8GSSA 1I9DA 1XZOA 4HQSA 1ERVA 1AUCA 4F2IA 2IMKA 2VL2A 3CRUA 1LJRA 2A2RA 3DD3A 4HEA2 4NHZA 1A2LA 1K0DA 2H71A 2B1LA 3LYKA 5ENUA 4AJ8A 4G10A 4HU9A 1M2AA 3W8JA 5B8AA 5GZZB 3GL5A 1WWJA 3HA9A 4PUAA 4G19A 1NW2A 4MP4A 4RUVA 2DJ3A 2B6MA 4J56E 2DIZA 1SD8A 3ZVJD 3F63A 2VD0A 1A2JA 4O7HA 4POLA 5D9XA 3O6TA 4YQMA 5FWGA 3RBTA 5KN2A 1FB6A 1WJKA 2YV9A 3HVSA 1YZXA 2VCTA 3IAM2 4BL7A 1A23A 3F3QA 2NPBA 1I5GA 2CT6A 3HD5A 3DVXA 3JCML 2R6KA 3GV1A 1E2YA 5LD0A 1PSQA 4K0NA 1JFUA 3HCZA 1U88A 2VCZA 4V2MA 2CX4A 3QPMA 1KTEA 3UBKA 1WP0A 2ON5A 4I2TA 4X43A 4NAXA 2XBIA 1B8XA 1SL1B 1B4QA 1B48A 4QL7A 3MWHA 3IXRA 1R7HA 2AV4A 2HSHA 1SKSB 1XXUA 1VGLA 2IMDA 3DRNA 1A8YA 3HKRA 4F82A 2XPEA 4DEJA 4E8EA 4MJBA 4HJ2A 4HU7A 4EL1A 4N0ZA 2L4QA 2WCIA 1QUWA 5IM9A 5F8BA 1GSFA 4PQHA 4RI6A 1Z6MA 3WGXA 4LMVA 5J9BA 3FZ4A 1DBYA 3TB2A 1AAZA 5JCWA 4GF0A 1M2BA 2IL3A 3ZIJA 1PKZA 1YKAA 3GSSA 4OCFA 4IGJA 4N0VA 1K3OA 2N5FA 5IIZA 2YANA 1ZYEA 4J2FA 3BCKA 1G7OA 2HZEB 4XRAA 1N8JA 1XW9A 4JR4A 4L8EA 2C4JA 3VI5A 1PX7A 5ECSA 1OVNA 1JZOA 1XWAA 2LKUA 1LBKA 3I6AA 5IMCA 2GT5A 2CA8A 1M0UA 1A0FA 1KNGA 2VOCA 3L0HA 4ZB9A 3KJYA 1Z7PA 3LEFA 2P0GA 4DSSB 2JZTA 5HR0A 1FW1A 2O89A 5FHIA 2GDRA 3GMFA 4RI7A 1WIKA 2I9HA 2WJUA 1S3AA 2YWIA 3A2XA 2WGRA 3QD9A 2EIRA 4ID0A 3EURA 2JZSA 1JLWA 2H0HA 5ELAA 1OC9A 1G6WA 2YJHA 1K0CA 5IO0A 2YOIA 2XHFA 5HFGA 3HVVA 4HJMA 2PWJA 4GWRA 2R37A 3WT2A 3QDNA 5E4WA 2LQOA 4XIHA 3NZNA 2PVQA 5F06A 3Q19A 4TXOA 3ZFBA 4K6XA 2QGVA 5F0GA 5ECLB 22GSA 3EC3A 1AW9A 1J08A 1GUMA 1SK2A 1TP9A 5DCGA 1F6MC 5DQYA 3KXOA 2HRNA 1SK1A 3IV4A 1O8WA 4JRRA 1THOA 3EU3A 5CRHA 3GURA 2AAWA 1GNEA 2GSRA 4ML1A 5HQPA 3EMXA 1SKRB 2HLSA 3L78A 5IMAA 16GSA 1EEMA 3C1SA 3P8WA 1T1VA 4OWYA 2GLRA 5ID2B 3DEXA 3HJPA 5IMFA 2LSTA 5IMZA 5IO2A 3K8NA 2YV7A 7GSSA 4MF7A 2YZHA 5G30A 4GSNA 2IJYA 1GWCA 4IS0A 4ISDA 2DJ2A 1EOHA 2H0GA 3SBCA 3ZMKA 2QC7A 4FH8A 3ERWA 3S9FA 1XCCA 3RPNA 1ZOFA 3KP8A 1UN2A 1XPVA 1GSQA 2WZ9A 5DAKA 4ML6A 1GRXA 4TR3A 4ZILA 3VPQA 4BVXA 2OE3A 3HY2A 1NHYA 2PN8A 1ILOA 1A2MA 2WDUA 1K0NA 2YCDA 4IHUA 4YQUA 1C72A 1X0RA 4WKWA 1G7EA 4I6XA 1GULA 2IFQB 4TR0A 1T4ZA 2L4CA 5D9WA 1PKWA 1UA5A 2YPMA 3RHBA 2PVOC 4TVEA 1K3LA 2YNXA 2WFCA 3H8QA 4EXJA 1FVKA 1RW1A 4KUNA 1URMA 2ZNMA 3LORA 3W6GA 4HS1A 4EDYA 3I9V2 3HVXA 3FR3A 3KH9A 5FT3A 3VI7A 5DALB 1SK0A 2DJJA 4X0XA 2EC4A 4POBA 2NVLA 1FOVA 2I81A 4KSOA 1PRXA 2VCQA 5HR2A 4BA7A 1ZZYA 3VFIA 4OFNA 4PGTA 5CRGA 1PX6A 6GSXA 2DBCA 3C71A 2FA4A 2WULA 4WBRD 4ZB6A 3BCIA 3O3TA 3EMPA 3G7JA 3UMAA 2R4VA 4EO3A 1THXA 3IRAA 4OD7A 3W8SA 3CSJA 5G2ZA 1BAYA 2H0IA 2XBQA 3EINA 3KH7A 5HR1A 4ULXA 3IPZA 2P5QA 1JZWA 3A3TA 1VF2A 4KDYA 2LV3A 3TJKA 1R26A 1XFLA 3KMNA 3GKNA 3QAWA 4MPFA 3CRTA 2FWHA 4HZ2A 2IMFA 1QQ2A 4MDCA 4G2EA 5ECPB 2A4VA 2FGXA 5AIXA 1V57A 1QMVA 4XTSA 1DE1A 1F3BA 2B1KA 5EPFA 1R4WA 4JE1A 1EP7A 2RUFA 1A0RP 2GSSA 3MAKA 4WR5A 2ZUPA 2BJXA 4D73A 2XPDA 1XWKA 3VWWA 2VL9A 4GLTA 3TRXA 2L5OA 1GTUA 3ZFLA 3H4KA 2FNOA 4TR4A 2DJ0A 6GSWA 1RQMA 2CQ9A 4PURA 3G9BA 2OKAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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