2L59A

Solution structures of oxidized and reduced thioredoxin c from m. tb
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
b'MTDSEKSATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPCKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVVPNLN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structures of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin C and models of intact thioredoxin system suggest new approaches to inhibitor and drug design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l59A00
3HJMA 2CQ9A 1GSSA 1SJ6A 3G9BA 1T3BA 1FOVA 4KW6A 2VAFA 3H8QA 1TK8B 4JR6A 1PD21 4TR3A 4MZWA 4ZIJA 1T7PB 4K1FA 3FR9A 5DALA 2IJYA 2EIRA 1SYXA 4CDOA 2GZPA 2AV4A 1AIUA 2JADA 1A23A 1YKAA 2IMDA 2WDUA 2GSRA 3IRAA 1GUKA 1GLQA 1MDKA 5HR0A 3HJOA 3VWVA 1JZRA 3D5JA 2XPDA 1THXA 2CT6A 2F8AA 3WT2A 2K8SA 2A4VA 4IS0A 5EL8A 3IPZA 1R26A 3P7XA 3TKRA 1ZGNA 5G1LA 5D96A 3CMIA 5D9XA 2VM2A 3TUEA 2M80A 1GLPA 1V40A 1TI3A 1GSDA 3E0UA 3TKPA 1O81A 4I97A 2N5AA 1ZZYA 1ACVA 1EWXA 3D0ZA 3RHBA 1NSWA 1XZOA 3HA9A 3FW2A 1XCCA 3ZTLA 4GQCA 1AQXA 1O8WA 3ZREA 1FG4A 1CQHA 4NAXA 3LYKA 1TW9A 3W6GA 4KDYA 1I9DA 2J23A 2RLIA 5DCHA 2XPEA 1ZYQB 1Z7RA 2DJ3A 2KP2A 4HI7A 2VL9A 1PSQA 4OCEA 4D73A 4QL7A 1SU9A 2MMAA 2DJKA 4DVCA 3D21A 1OKDA 5ECPB 3QFBC 1Q98A 1RQMA 2H70A 3FZ5A 1M9BA 5EPFA 4YAPA 4LL4B 1YJ6A 4EKZA 4GTUA 4ML6A 1MDJA 5HR2A 3HD5A 3F4RA 2X99A 1EGOA 3A5WA 1JZWA 2YP6A 3UBKA 4N30A 5JWRB 3HDCA 2DLXA 2DC5A 1SK2A 3OR5A 2R2JA 3M9JA 1MD4A 2PVQA 3E9JB 2HLSA 4NPBA 3BCIA 3DXBA 4X43A 5JCUA 3WGEA 3VWXA 1BAYA 2IL3A 3GKNA 2C0DA 2PGTA 1TU8A 1N2AA 1K0MA 4K8MA 1JZOA 4JR4A 3GFKA 4KDXA 3KH7A 4WR5A 5AISA 3IBHA 4F0CA 1YEXA 1GULA 4NWYA 1SKRB 4PNFA 4PNGA 2LQOA 2TIRA 2L59A 2KLXA 3TJFA 3IK9A 2OBIA 2RM6A 2H74A 3D22A 3V1WA 2R37A 2I81A 3LQ7A 2HZFA 4IP6A 4V2NA 4ECBA 3IR4A 3W8SA 2AUVA 2B1LA 2DMMA 3KJYA 2HSHA 18GSA 2I1UA 3DRNA 4GCIA 3QMXA 5F05A 5HR3A 2VO4A 3UAPA 1ST9A 4XS4B 2L5LA 5HFIA 3UEMA 2GVPA 2R6KA 1F3BA 4POMA 4MP4A 3EYTA 2WZ9A 1PL2A 2YWNA 3O6TA 4V1Ag 4ZL8A 3DEXA 1E2YA 1WWJA 1AW9A 3EURA 2BTOT 2YWOA 2EIQA 2L6DA 3LJRA 4AJ8A 3GN3A 4PX1A 5J9BA 4AGSA 3P8WA 4TXVA 2GTUA 4P3YB 2I9HA 4N10A 1T00A 5H5SA 2OBKA 4BA7A 2LTKA 4AF2A 5J41A 2M72A 4BL7A 2HSYA 4TW5A 5JWQB 1DE1A 1XWCA 1A8LA 3C73A 1OVNA 2L57A 2VCXA 1WPIA 1TDIA 2YZHA 1JZDA 2H1AA 4BWSA 2JSZA 2V1MA 3HXSA 2P5QA 1Z5YE 3G7YA 3TJJA 3Q74A 1BX9A 5IMCA 3L9UA 2E0QA 4ECCA 2XBIA 1ZMAA 5GSTA 1XXUA 2IWTA 2FA8A 4KCEA 1UVZA 3W8JA 2K18A 1B48A 1JLWA 2H6XA 3ERWA 3ZIJA 2FNOA 4HUAA 5G5FA 1TTZA 2M46A 3M1GA 2JL4A 4RI7A 1M0UA 3CRTA 4MZBA 2O89A 5FWGA 3GRXA 2KP1A 2VLUA 3TRPA 3EC3A 1ERTA 2GLRA 2V41A 5E4WA 2H66A 3TOUA 1M2DA 1A0RP 3TOTA 2H8LA 1URMA 4KGIA 4OWYA 4MF7A 2DJ2A 3A2XA 4YQMA 2DSAA 3GSTA 1U3IA 2GSSA 3WD6A 1TRSA 3QAVA 4RI6A 4NV5A 1AC1A 1FW1A 1YKCA 4PQHA 3KMOA 5KN2A 5DCGA 5KN0A 4GXZA 2H1BA 3LSZA 3KTBA 4AJ6A 2FWGA 2TRCP 3F6FA 1XWBA 1EV4A 1K3LA 2C0GA 1A8YA 1TU7A 5ECIB 2NBSA 1Y25A 3ZIVA 4ZILA 1WIKA 1SK1A 1U3AA 1SKWB 3APQA 1V2AA 2V32A 5ECSA 4WF4A 3TRQA 5JCGA 4F2IA 2X8CA 1G0TA 5J9CA 1ML6A 3O3TA 3BCKA 2VOCA 1HD2A 1XW6A 2NPBA 1UN2A 1DE2A 1TP9A 2GS3A 4KA0A 4RQRA 2QKEA 4YQVA 3DVWA 17GSA 2LRNA 3GKKA 4EO3A 1MTCA 2LKUA 3C1SA 1ABAA 3EMPA 2F51A 1TKDB 2DJ0A 1FHEA 4HZ2A 4XS4A 1A2JA 3ZLPA 1W89A 1BYEA 1AUCA 1QFNA 4IHUA 1GP1A 5CAXA 4NMUA 2CVDA 4RQXA 1OE7A 1R4WA 3FRCA 1O7UA 1EEMA 4POBA 4KB3A 2VL3A 5COHA 2BJXA 1F37A 5CRHA 3EU3A 6GSSA 3ZRDA 1QXHA 1TI1A 2H0IA 3FKFA 5HFGA 3BBYA 4V2LA 3EWLA 3TJKA 1B9XC 1OE8A 4KAEA 3GKMA 3TRXA 2J9HA 5IQYA 4HJMA 1X5EA 3A2WA 4AJ7A 1NW2A 1FB0A 4BPYA 1V98A 4I8BA 3H79A 4ECJA 5DJMA 2OKAA 2OE0A 2OE3A 5ABRA 1XVWA 4ZL7A 1ERUA 3PH9A 1M7TA 4PUFC 2H19A 1J0FA 1SL2B 3ZL5A 5G2ZA 4IJ3A 5H5RA 1T8EB 1V57A 5IMDA 3LEFA 3DIEA 2DIZA 1XW5A 1H75A 2C0EA 3ISOA 4EE0A 4EXJA 5D9VA 4PXOA 3FY7A 3LFLA 3ERGA 5KN3A 2C3TA 4V1Ap 2HI7A 2WFCA 2VIMA 1G6WA 1M2BA 3N5OA 3DVXA 3U6VA 2JZRA 2ZCTA 2H75A 2YNXA 3GKXA 4LMVA 5AGYA 3HJPA 5DQSA 1K3OA 2C8UA 4XS6A 3VPQA 3CXGA 1A2MA 1GTAA 5H5QA 2XBQA 4MJAA 1HNCA 4G19A 5IMFA 3P90A 4XHMA 3KIJA 2LJAA 5J4UA 4PURA 4DSRA 2YN1A 2VD0A 2I3YA 3CRUA 4DEJA 2FUG2 3ED3A 1JHBA 4KDUA 1B4PA 4ZBDA 2FWHA 5B6MA 3QD9A 1BG5A 1IYIA 1YY7A 4MMMA 5FHIA 1U6TA 3HKRA 3GURA 4J2FA 3JCML 1PA3A 4Q5FA 3VWWA 2GT5A 1EGRA 2ZNMA 5ELAA 5IPGA 3ZZXA 1GNWA 2N5FA 2X8GA 2CAQA 2L4QA 3IAS2 4K0GA 3IOSA 3BJ5A 1NM3A 3IC4A 1DUGA 3LORA 1K0CA 4I5QA 12GSA 4F9ZA 2HXKA 3GMFA 2LRTA 1X5CA 3HVSA 3HCZA 3NIVA 3GX8A 4QL9A 3ZFBA 4HU9A 1K0NA 1XBSA 1ZCPA 2R4VA 4K0NA 1T1VA 4K7OA 2GQKA 1EOGA 2CV4A 4ZL9A 4L0UA 2PVOC 2GZZA 2YJHA 4WBRD 3UBLA 4E8EA 5F0GA 4IGJA 2IMIA 1PKWA 1YF0A 5F07A 3QCPA 4XTSA 1U88A 4ZBBA 1YF1A 4FH8A 1T4YA 4L8EA 4TN8A 4TXOB 3GTUB 2HRFA 4MABA 4WR4A 5G1KA 1LBKA 2H6YA 3VPTA 3KP8A 1X0RA 2B5YA 2CZ2A 4BVXA 1R5PA 3NZNA 3QPMA 2DMLA 2K9FA 4F03A 5D93A 1EOHA 4O92A 3KXOA 4FIWA 1OYJA 1SENA 3MNGA 2VLTA 1SYRA 1I5GA 3AY8A 3QR6A 1MDIA 3TKSE 1X9WB 3RAZA 5B7CA 3J7Yk 1KNGA 2B6MA 2VL2C 3CTFA 4Q5RA 2XC2A 2ES7A 2KUCA 3R2QA 2H6ZA 4GQFA 3D4MA 3GX0A 3L78A 4PGTA 4TR4A 1FVJA 3RHCA 1K0BA 2OA7A 4LMWA 4EDZA 3UJ1A 4MH2A 4TKYA 5G30A 3GA4A 1GUMA 3VK9A 3SBCA 3M8NA 4XRAA 3QOUA 3F8UA 2X8HA 4BVYA 1SD8A 1VF4A 4MZCA 3DD3A 3P2AA 2F3MA 2B7KA 1A24A 3DMLA 5CRGA 1G6YA 4IP1A 3L9SA 3UARA 1ZYEA 4O5RA 2MBSA 2LEGA 5CNWA 3GIXA 2K6VA 4FYCA 3F3QA 4TRXA 5ECLB 4ZB9A 5HQPA 2PU9C 4ML1A 4N0ZA 2H73A 1LJRA 2CAIA 4L5LA 1S3CA 1BEDA 3L4NA 2H71A 1Z9HA 3HY2A 3QDNA 1WRYA 2NDOA 1HNAA 5C04A 1N8JA 2YCDA 1GTIA 2NTOA 4DSSA 5G5EA 4XCSA 2ON5A 2N5BA 1HYUA 3D6IA 5LNKe 3TJBA 2CVKA 3CYNA 5A4VA 3C7MA 6GSWA 4E8HA 2AAWA 2IN3A 4FYUA 5IIZA 1QK8A 2FY6A 2D2ZA 1OAZA 5ECKB 5DDLA 2GQMA 1KTEA 3US3A 2MZCA 9GSSA 10GSA 4K7IA 2JZSA 2FHEA 2OJLA 3TGZA 5ELGA 13GSA 1GRXA 3UMAA 3CBUA 1EV9A 5CYYA 1F9MA 4POLA 2L6CA 2I4AA 4BWQA 2VM1A 4FYBA 4XRDA 2VUPA 3M9KA 2VLVA 4TR1B 3RBTA 4HQZA 3VURA 4KSMA 1WJKA 2GZYA 5IM9A 1S3DA 2LUSA 2DBCA 2PUKC 3VWUA 3TCOA 1LU4A 2GT6A 2FGXA 3UOMA 1PX6A 3LYPA 1X9MB 1ON4A 1K0AA 4HZ4A 5ECRB 1O73A 4TXOA 3GTUA 3LXZA 1XFLA 2LNSA 5DJLA 2YANA 1WMJA 3GL3A 2V6OA 4J57E 4EC0A 4L5OA 4H86A 5ECQB 2F9SA 5B8BA 2VCVA 3HZ8A 2L4CA 2VCWA 2YOIA 5D9WA 3PGTA 3G7JA 4KX4A 3RDWA 1W4VA 3GV1A 8GSSA 1GSEA 2R3XA 4GWRA 4XIHA 4QQ7A 3KP9A 2GSTA 16GSA 2H01A 2L5OA 3HHVA 4YAVA 1SL1B 3LGCA 1TOFA 4IKHA 4HDEA 2FD3A 3A2VA 3NOFA 5J5NA 1Z3EA 1GTUA 3ZFLA 2HRNA 3F9UA 5GAPD 5D8IA 2H30A 5HR1A 4RUVA 3FHKA 4G10A 1OC8A 4Q5QA 2DJJA 2OACA 2CZ3A 1AQVA 3VI5A 5ECHB 1GSQA 4MH3A 2TRXA 2RUFA 4OCFA 4WXTA 3ZYWA 2H72A 2IMFA 3TKSC 2OE1A 1AXDA 1QGVA 1ZL9A 3I69A 5GZZB 3TKQA 2K8VA 3EU4A 1M99A 2XHFA 1ERVA 3SWLA 4WBJA 2LRCA 3KZQA 1R7HA 4JRRA 1GUHA 5A4UA 2LV3A 4JU5A 5ID2B 5AN1A 3F63A 4X1UA 2R5GA 4MPGA 2WGRA 1XPVA 4OO5A 1F2EA 3G7IA 1GSUA 3KGKA 2A2SA 5F06A 1GSYA 4FO5A 4WETA 4EF0A 2IPAA 4IQ1A 4WEYA 3IK7A 2FWEA 1YQ1A 1K0OA 4OFMA 4NHWA 1O6JA 2VL2A 4TR0A 4IVFA 3U5RE 3MDKA 4ZBAA 3C71A 5GSSA 3WT1A 1V58A 4IW9A 3UVTA 3A3TA 3IA1A 1YEPA 4KH7A 1SJIA 1KBNA 3D4TA 2JU5A 3I6AA 2G0FA 3KM6A 3IXRA 4G9HA 1GNEA 1XW9A 1GL8A 1A2LA 4GLTA 4LA1A 1T4ZA 1BJXA 2JZTA 4JZQA 3F4SA 4DSSB 1VRSD 4K6XA 4MJCA 4ULXA 2V6KA 3TJGA 4IELA 4MF5A 3FK8A 4F0BA 2JSYA 1NHYA 4HOJA 2CA8A 3EINA 2WB9A 2GGTA 1SL0B 3BD2A 1Z7PA 3KH9A 1SJZA 3GL5A 1F3AA 2HE3A 3PR8A 4POKA 4I6XA 4OO4A 1GH2A 4JE1A 2WCIA 3ME7A 2REMA 3F4TA 2AYTA 1PRXA 3VLNA 4MPFA 1MD3A 3CTGA 4TR1A 4CHSA 5IMZA 4JEDA 4MDCA 2HZEA 2KHPA 3O76A 3CSHA 3IV4A 4MCUA 3UL3A 4WF5A 1WOUA 5AIXA 2H76A 5JCWA 1MEKA 2H0GA 2PPTA 1GSFA 1SK0A 1AAZA 3DWVA 2LJKA 3FZ9A 3ZVJD 1FB6A 1V9WA 4ID0A 1B8XA 1QQ2A 4KCAA 4ZB8A 1TRUA 2JACA 3DKSA 1TK5B 1C72A 2AJQB 4NHZA 1OC9B 4L0WA 2H0HA 2HNLA 2QSIA 3DGQA 3Q6OA 4V2MA 3FR3A 2B3SA 1FO5A 1PKZA 5CO3A 3HVVA 1Z6NA 4ZXGA 1X9SB 2EC4A 2VCTA 1K0DA 1O8XA 3VFIA 2PN8A 2FWFA 2Z9SA 2WJUA 1WP0A 2PBJA 5CP1A 2RUEA 1NHOA 3RPPA 2B5XA 2PMTA 5KN1A 5ENUA 2AB6A 1U87A 2MMZA 2FLSA 2IFQB 4HQSA 1E6BA 1PMTA 3FZ4A 4PUAA 4PQIA 6GSXA 2ON7A 2FCHA 2C80A 1XWGA 5E59A 3MAKA 2YJ7A 4KSOA 11GSA 4F82A 4NV2A 2YWMA 2GQLA 3M0FA 2DIYA 4IBPA 1TK0B 3FZAA 3K8NA 3APOA 1PX7A 5DAKB 2WRTA 3J7Yb 4YH2A 4O7HA 2YZUA 1OC3A 1ILOA 1WE0A 3ME8A 1RW1A 4OMVA 5ECNB 1GWCA 19GSA 2DJ1A 4KUNA 4J56E 3Q18A 3LXTA 2VCQA 1EEJA 3QFAC 2QGVA 4X0XA 2C3NA 5ID2A 3CSJA 2MBTA 4GSTA 2CX3A 3KTLA 2AHEA 3EVIA 5CRWA 2OADA 2V2GA 4MJBA 5AIVA 1QMVA 3ZMLA 4IN0A 3APSA 1PGTA 3KMNA 4HS1A 1XOBA 3F3RA 5B6NA 1TRVA 5LD0A 4MA9A 2EIOA 2X64A 3WYWA 5IMAA 3MSZA 1XVQA 4YQUA 2O7KA 4G2EA 1PL1A 5L71A 1F6MC 2O8VB 2QC7A 4JBBA 2GSQA 3MWHA 1QUWA 3F6DA 5IO2A 2LQQA 2CVBA 1GTBA 2G2QA 1YDKA 3GH9A 1J9BA 4TOPA 2E2MA 3BOAA 2B5EA 1VF3A 2B1KA 4EL1A 2HYXA 1XWKA 2PWJA 4LLRA 4O32A 4EVMA 5DALB 3N9JA 4Z7XA 4N0VA 4LL1B 1G7OA 2MMOA 3QAWA 1K3YA 4EUYA 5D9TA 1JFUA 2KOKA 1TJDA 2H1DA 3H1NA 6GSVA 3ZVJA 5A4WA 1XWAA 2CX4A 3TKSA 3LWAA 3HZ4A 2B7JA 3TB2A 3M3MA 2IMEA 5KEJA 4N11A 5G31A 2RM5A 2O85A 2C0FA 1USBA 4Q5NA 4ILFA 3GSSA 3DYRA 4TVEA 3KD0A 4KNDA 4IJIA 1CQGA 4GRFA 5DQYA 5A5KA 1AQWA 3C8EA 2VD1A 3FEUA 1ZOFA 2ALBA 3H93A 4OFNA 4HU7A 1HNBA 1X5DA 1PQNA 1EP7A 1S3AA 4GF0A 3GHAA 2LJRA 1KEBA 1VF1A 4MK3A 1DSBA 3VI7A 4I2TA 3UIWA 1IYHA 1HQOA 4HJ2A 3WGXA 2HFDA 3ZITA 3IE3A 4GSNA 2MMNA 1RK4A 4HEA2 2VCZA 3H4KA 3I9V2 1JLVA 1R5AA 1PN9A 3EMXA 3L9VA 3GYKA 5IMVA 5IOXA 6GSYA 5HFKA 1FVKA 2NVLA 2P31A 2HZEB 1Q4JA 3TDGA 5LCZA 1UA5A 4D73B 1OC9A 4I2UA 2P5RA 3L0HA 4ZB6A 5B8AA 3IDVA 5FT3A 20GSA 4DSQA 5DVBA 2BMXA 1B9YC 2LS5A 3HYPA 3C1RA 3KEBA 1O85A 2YWIA 5EY6A 2C4JA 5CRDA 3UVHA 2P0GA 1H4OA 2MYGA 3IAM2 1SD9A 1Z6MA 2WULA 14GSA 3E3EA 3HVXA 1DBYA 2IFQA 3GNJA 3CSIA 2F8FA 1J08A 2A2RA 4ACSA 2PERA 1A0FA 2GDRA 1TXXA 5ECOB 3PINA 5INYA 1EZKA 2LNTA 1XIYA 4IQAA 2IMKA 2RIIA 3RPNA 1M2AA 2H1GA 2YPMA 2E2GA 4ECIA 3ERFA 1B4QA 1SKSB 4ISDA 3KCMA 2C3QA 5DAKA 1XOAA 3WGDA 3S9FA 5CREA 4K7NA 3ZMKA 1M9AA 4EDYA 1THOA 4K9ZA 5EVOA 1ERWA 3FR6A 4MLYA 5J3RA 2IIYA 4CW9A 4K2DA 3GUSA 1UC7A 1YZXA 4OD7A 2FA4A 3EE2A 2LSTA 5F8BA 4MJEA 1Y6EA 5IOWA 4MF6A 5DBQA 1VGLA 5ECMB 3F0IA 5JWOB 4WKWA 5D73A 2ZUPA 3FYGA 2C1YA 6GSUA 4NXIA 4PQ1A 1EP8A 1OKTA 22GSA 3LG6A 4XS1A 5GAND 1VF2A 7GSSA 4KE3A 2WS2A 1FAAA 3Q19A 3I43A 3IHQA 6GSTA 4GSSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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