2PVOC

Crystal srtucture of the ternary complex between thioredoxin f, ferredoxin, and ferredoxin: thioredoxin reductase
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
EAIVGKVTEVNKDTFWPIVKAAGDKPVVLDMFTQWCGPSKAMAPKYEKLAEEYLDVIFLKLDCNQENKTLAKELGIRVVPTFKILKENSVVGEVTGAKYDKLLEAIQAARS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic chain
publication title Structural snapshots along the reaction pathway of ferredoxin-thioredoxin reductase.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Electron transport
total genus 29
structure length 111
sequence length 111
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pvoC00
4IJ3A 1I5GA 1X9SB 1EP7A 2DJ2A 1TW9A 4NV5A 4K2DA 4OCFA 3FR9A 4GF0A 3AY8A 2YWIA 3TKPA 1AQWA 2DSAA 2YJHA 5ELGA 4N11A 5LNKe 2R37A 1BX9A 4ECCA 2IN3A 2KOKA 2FD3A 2YZHA 1FHEA 3GKXA 4F0CA 2ZCTA 2DJ0A 1T1VA 1UVZA 2GT5A 3DMLA 2QSIA 3WYWA 4IKHA 4K9ZA 1PQNA 1AQXA 3HJMA 2H6XA 1ZOFA 2DJKA 2XC2A 3KEBA 3ME7A 5CNWA 1F2EA 1ZYQB 5B8BA 3C1RA 2H71A 3Q6OA 4MLYA 2IMFA 1AC1A 2G2QA 4IJIA 2AHEA 1SJIA 2LTKA 2CQ9A 4NHWA 2CZ3A 3GFKA 3F3QA 3ZZXA 1Z7PA 4IQ1A 1J0FA 2VCZA 2O85A 1XZOA 1PL2A 2WJUA 4MA9A 4N0VA 2BTOT 2M46A 1LU4A 4WR5A 1M99A 2IJYA 2GS3A 3VURA 2NVLA 3KP9A 3ZMLA 3UVTA 1EP8A 2LV3A 3OR5A 4EUYA 5AGYA 3QCPA 1GSUA 3GNJA 1SKWB 3IRAA 5F05A 2F8FA 5CAXA 4DSSB 1MD3A 3FZAA 3CRUA 2JSYA 2B7KA 1O6JA 4Q5NA 1XWBA 2OA7A 1H4OA 3D5JA 2KP1A 6GSUA 1YKCA 3EURA 1GUMA 5G1KA 2DBCA 2H1AA 3GHAA 3UVHA 3I69A 3FR6A 1SYXA 4L5LA 3QAWA 4PUAA 5KN1A 4CW9A 2K6VA 3H93A 4NHZA 3KMOA 1O73A 1EZKA 4MMMA 3ZRDA 4AJ8A 3L9VA 4EL1A 4XS4A 5ID2A 1AIUA 4FYBA 2IL3A 1UN2A 1YDKA 2QKEA 4XRAA 2AYTA 3RDWA 4GLTA 4HZ4A 1K3YA 5EL8A 3TCOA 2GTUA 4XS1A 5HR0A 1BEDA 2DMMA 1VF3A 4HQZA 1CQHA 3I6AA 3KXOA 4N0ZA 1OAZA 2OACA 3EU4A 3D4TA 3A2XA 3US3A 5F0GA 3IOSA 4YH2A 3W8SA 2YV7A 1S3AA 4NAXA 2LRCA 3HJPA 1JHBA 4TKYA 1B9XC 2M72A 2PN8A 2C3QA 1WIKA 2B7JA 4NMUA 5GAPD 3GH9A 2FA4A 2L59A 3GIXA 1EOHA 2LNTA 2HSHA 3FY7A 5G2ZA 2VIMA 4OO4A 1K0OA 4TVEA 1M0UA 4PGTA 4KGIA 2H70A 3GKKA 4GQFA 3DEXA 2BJXA 3M9JA 5JWRB 3KCMA 2G0FA 1FVKA 1XWGA 4MJCA 4RI7A 1RK4A 2GVPA 4ZL8A 5HFGA 1EWXA 1TJDA 3GX8A 4ECJA 2C3NA 3Q74A 5J9CA 14GSA 4HZ2A 2M80A 4I97A 4PQIA 3UOMA 1SK2A 1KTEA 4O32A 2H76A 2LSTA 1QK8A 3G9BA 1A0FA 1Z7RA 1EEMA 3D6IA 3CBUA 1J08A 2GT6A 3N5OA 5IMVA 4F9ZA 2LNSA 1Y6EA 2GSQA 2F3MA 3QD9A 2B6MA 2PU9C 4POLA 2YV9A 1R4WA 3M9KA 1SK1A 1X0RA 3DXBA 4PNGA 4RQXA 4AGSA 2FWHA 4I2TA 1CQGA 3VWVA 4AJ6A 1GWCA 3D4MA 3DWVA 1VF2A 2RUFA 3IXRA 4K7IA 5G5EA 3HXSA 1HYUA 2RUEA 3CSHA 2GZPA 3BCIA 3H8QA 4K6XA 4ILFA 5J5NA 4V1Ag 5KN2A 1ST9A 2H19A 3VI5A 5ECPB 1BAYA 2YCDA 3HJOA 3TJGA 2A4VA 2V6KA 1T8EB 4EVMA 3P90A 1A8YA 4IP6A 1GSYA 1FOVA 1A23A 3CXGA 1Z3EA 3GX0A 1GRXA 1V57A 3LXZA 2V32A 4POMA 1XBSA 4POKA 4TR0A 4DSSA 1THXA 3KMNA 4AF2A 3UARA 1ERWA 3ZFLA 3SBCA 5AISA 2X99A 1TI1A 4TW5A 1GSSA 3IE3A 1FW1A 1NW2A 3EWLA 3HDCA 1PSQA 5H5RA 2REMA 1HNAA 3DD3A 3F4RA 2E2GA 2YP6A 1EV9A 1SJZA 4MDCA 2AV4A 3DGQA 2YWMA 3I43A 1K0MA 5G31A 3HZ4A 1T4YA 1Z5YE 1ZGNA 19GSA 4ML1A 2B3SA 2WGRA 2L57A 4HQSA 2H6YA 12GSA 1GLPA 4FO5A 3A5WA 2C80A 1VF1A 5D9WA 5EPFA 3KP8A 1YZXA 2RIIA 1XW5A 1UA5A 1PKZA 2K9FA 2EC4A 1JZDA 4GCIA 1U87A 1S3DA 1WJKA 3RPNA 2XBQA 5IOXA 2CAIA 1MDKA 2L6DA 3E0UA 2H8LA 2F9SA 3GSTA 2YANA 3EE2A 4J2FA 2YZUA 2CVDA 1OKDA 1G6YA 2H0HA 1V9WA 5DQYA 2PPTA 3CTFA 3MSZA 2GGTA 2XBIA 5IQYA 2VAFA 1OC3A 3KM6A 1J9BA 1DE2A 2N5BA 4RQRA 4MF6A 5C00A 2MMOA 4KAEA 4K0GA 3QPMA 1HQOA 4F2IA 1QUWA 4K7OA 1DE1A 2MYGA 1GTAA 2IMIA 1GLQA 3MNGA 1K3LA 2VD1A 5JCGA 3FW2A 4V2LA 3KGKA 1ZL9A 2LUSA 3F6FA 4ZB6A 1FO5A 5AIVA 1EOGA 2P5RA 3HKRA 2B5YA 2R3XA 3NOFA 3QMXA 1WP0A 3TKRA 3C8EA 3F0IA 2V2GA 1NSWA 5DALA 1XOBA 1OC9B 3VI7A 1K0BA 1G7EA 1V40A 4J56E 5DBQA 2VL2A 1ON4A 2C1YA 2DJ1A 1TDIA 1N2AA 2PMTA 4PQHA 1TI3A 1WWJA 2WRTA 1K0DA 2FNOA 1O8XA 3QAVA 4LMWA 1XWAA 2YWOA 1TK0B 2C0DA 2NDOA 1GH2A 2JU5A 2IMDA 3HVVA 2H72A 3IV4A 1USBA 3JCML 4FH8A 1HD2A 1R5AA 5D9XA 4RUVA 1EGOA 3GL5A 1K0NA 1ERUA 2P5QA 3UMAA 3TDGA 5G1LA 4XRDA 4EE0A 2VM1A 1C72A 4X43A 5A4UA 2GSRA 2PWJA 6GSXA 5J4UA 2B5XA 3ZTLA 2L5OA 1M2BA 2JZRA 3GRXA 4KSMA 1SL1B 4IP1A 4OMVA 3GKNA 3LFLA 2WDUA 1B48A 4PURA 4JBBA 1SYRA 3TRPA 4JR6A 3L9SA 3TKSA 5KEJA 3FR3A 2YNXA 1V2AA 5CREA 4JU5A 3VPQA 3LORA 1NHYA 3SWLA 5CP1A 5G30A 1OE8A 2MMNA 2V1MA 3ZITA 3VLNA 2B5EA 4OD7A 3IR4A 1K3OA 1YEXA 3L0HA 3L4NA 1HNCA 4IN0A 4YQVA 5HQPA 2FY6A 2FWEA 1JLVA 2A2SA 2DIYA 2N5FA 4IHUA 4WBJA 1T4ZA 2XHFA 4Q5QA 1GL8A 5GSSA 3GMFA 2HXKA 2RM5A 3WGDA 3NZNA 1KEBA 2FLSA 4LL4B 2FWGA 1AW9A 5ABRA 3G7JA 3RPPA 4P3YB 4BPYA 2CVKA 4KUNA 4I6XA 4XCSA 2E0QA 4TR4A 5HFKA 2LJKA 3V1WA 3FZ9A 1BQ7A 2H30A 2YJ7A 3F6DA 1FB0A 2YOIA 2X8HA 1MDIA 3KH9A 4IELA 2ZNMA 4KDXA 2IPAA 4MH3A 2IIYA 1HNBA 5J41A 5B8AA 2RLIA 2H75A 3IPZA 1T00A 5JWQB 4ZIJA 2WFCA 2H0IA 3HY2A 1M7TA 4D73B 3WD6A 4IS0A 2EIOA 3TJJA 3HVXA 4HS1A 2VD0A 3VWWA 2OE0A 1TRUA 3VK9A 2CZ2A 1OYJA 2I81A 4ZBAA 1XWKA 4EO3A 4MZBA 3FYGA 1FB6A 2FWFA 2J9HA 5ECQB 2WS2A 1PX6A 4GSSA 3C7MA 3UL3A 3DYRA 1SK0A 1B8XA 1WOUA 2Z9SA 5ECOB 1U3IA 11GSA 2VLVA 5IMZA 3GTUB 2ON5A 1XWCA 4O5RA 4E8EA 2VM2A 4BA7A 4KX4A 3CSIA 4KDYA 1A2MA 2AUVA 2H0GA 3GL3A 5AIXA 3GH6A 2KLXA 1QGVA 4Z7XA 4CDOA 1QFNA 3LSZA 1N8JA 4K8MA 4KSOA 4JE1A 3BJ5A 1MEKA 1IYHA 4RI6A 5G5FA 4TXOB 1ERVA 3DKSA 3TRXA 3TB2A 3QFAC 4MJAA 1TK8B 2F8AA 1UC7A 1OC9A 5B6NA 1PRXA 4TR1B 3WT2A 3ME8A 4QQ7A 2VL2C 3N9JA 5FWGA 1OVNA 2WB9A 2HRNA 2BMXA 2GDRA 2VCWA 4PXOA 5DALB 1PMTA 3PINA 2C4JA 3KH7A 4ZB8A 2IFQB 1DSBA 3F9UA 5F8BA 4DSQA 1XCCA 3MDKA 4HEA2 1X5DA 2VOCA 5GSTA 2EIQA 1F3BA 2GQKA 4EF0A 1JZRA 4YAPA 1YY7A 1GNWA 3D21A 1GTBA 1K0AA 5ECHB 2OKAA 4ZBBA 2N5AA 4KE3A 3E3EA 4ZBDA 2EIRA 5ECMB 4MK3A 1GSEA 5IIZA 4QL7A 5LD0A 2HLSA 3TUEA 4HOJA 5L71A 2E2MA 1SD8A 3CTGA 1E2YA 4FYUA 2VL3A 2ZUPA 2FA8A 3TKSC 1PGTA 5INYA 4J57E 4NWYA 1JFUA 1MD4A 4WETA 3KZQA 1TRWA 3IC4A 1JZWA 4ID0A 2F51A 1KNGA 20GSA 2O87A 2K8SA 1O81A 2DJJA 1T7PB 2MMZA 3IDVA 4G19A 2MBTA 1E6BA 2IWTA 4XIHA 1Z9HA 3CSJA 3IHQA 3QAGA 5DVBA 2VCTA 2L6CA 5GZZB 1M9BA 3I9V2 1XW6A 4K7NA 4MABA 2H66A 2LQOA 2H1GA 2V41A 1TP9A 2B1KA 3QDNA 1R7HA 3WGXA 4JRRA 2O89A 2OBKA 2X8GA 1TRSA 5IO0A 3LYPA 1VGLA 1K0CA 4OCEA 4AJ7A 1GTUA 3IAM2 2FCHA 3VPTA 3BOAA 3WT1A 1GUKA 1F6MC 5JCWA 4EDYA 3C71A 1TTZA 6GSWA 2QGVA 3A3TA 5CO3A 1X9MB 4KB3A 4MH2A 4MZWA 2R2JA 1TK5B 4D73A 2DC5A 2JSZA 1GUHA 1O8WA 1JZOA 1YQ1A 4JZQA 4BWSA 4XTSA 1QQ2A 2X8CA 4BVYA 2H01A 22GSA 3U6VA 1R5PA 1BJXA 6GSVA 3HVSA 6GSSA 1F3AA 3FHKA 4XHMA 4KCEA 2TRCP 4WXTA 5A4WA 3TGZA 3M0FA 4NXIA 4BL7A 1PL1A 5JCUA 5A4VA 3ERGA 1Z6MA 3GTUA 1X5EA 3LG6A 4DVCA 2HYXA 1WMJA 3KTBA 5HFIA 4TXVA 1ACVA 17GSA 1O7UA 2GSTA 3H1NA 1F9MA 1KBNA 2MZCA 1XIYA 2HT9A 5J9BA 1R26A 2C0GA 1EEJA 2GQLA 2CX4A 3HCZA 4TXOA 3HD5A 1GTIA 1A2JA 1GSFA 4MP4A 2CX3A 3LEFA 1RW1A 4KDUA 4KNDA 1ZZYA 1IYIA 3UAPA 1FVJA 4TR1A 5DJMA 3IA1A 3LJRA 1W89A 3VWUA 2PBJA 3IAS2 5HR3A 3HHVA 5DDLA 3IBHA 2NTOA 2XPEA 2YPMA 4WKWA 1A8LA 2H6ZA 2IFQA 1YJ6A 2L4QA 2CA8A 2JADA 3IK9A 3KD0A 4IQAA 1X9WB 3APOA 1SENA 3Q18A 3WGEA 6GSYA 4GSTA 4I5QA 1AXDA 3FEUA 4MJBA 5ECIB 2V6OA 3LWAA 1DBYA 4H86A 4LA1A 2J23A 3C1SA 4HU7A 5ELAA 1SD9A 1ZCPA 1PN9A 1XOAA 1U88A 4ISDA 2H1BA 1PA3A 5E59A 3BBYA 3LGCA 5COHA 3S9FA 1AAZA 2CAQA 3GUSA 3LQ7A 13GSA 4WF4A 2KHPA 2AJQB 1QXHA 4IBPA 3CRTA 4ECIA 4GRFA 1OC8A 5KN0A 2D2ZA 2WZ9A 1ILOA 4ACSA 2CV4A 4L0UA 2PVQA 4G2EA 3HYPA 5ECKB 3ED3A 5A5KA 2I1UA 3CYNA 2LS5A 2NPBA 3HA9A 4WEYA 2ALBA 1LBKA 4TOPA 4X1UA 3K8NA 3ZIVA 4OFTA 1YF1A 4V1Ap 3ZVJD 5CRWA 4KW6A 3ERWA 2VL9A 4O7HA 5D8IA 4O92A 3MAKA 4KH7A 5DCHA 5IM9A 1LJRA 4OFMA 2R4VA 1RQMA 3M1GA 2ES7A 1XVWA 4PNFA 3ZFBA 3E9JB 2OJLA 2DIZA 3IK7A 3PR8A 1XFLA 3GURA 1Q98A 2VLTA 1V58A 4IVFA 2GZYA 4HI7A 4GSNA 5IMDA 2LRNA 3FK8A 1O85A 5IMAA 2VCVA 1NM3A 1A2LA 2HZEB 4HJ2A 4PQ1A 3ISOA 4N10A 3EYTA 1GP1A 4ZXGA 1SKRB 3G7YA 1AUCA 2VUPA 3ZVJA 2GQMA 4ZB9A 3NIVA 2C0FA 1TKDB 5E4WA 3QFBC 5JWOB 2VO4A 4MF7A 3GN3A 3DIEA 1BYEA 2PUKC 4MF5A 4BWQA 1G7OA 1U6TA 4DEJA 4DSRA 3TJKA 5D96A 5ECRB 4HJMA 3TJBA 3CMIA 1TU7A 5IMCA 3GV1A 3UJ1A 3VFIA 4HU9A 4ULXA 1WRYA 3PH9A 1Q4JA 1URMA 4WR4A 2LQQA 4Q5FA 4E8HA 4KCAA 2P0GA 1FG4A 1X5CA 2KUCA 3BCKA 4I8BA 5CRGA 2FGXA 3D0ZA 2LJRA 2OBIA 2R6KA 3UBKA 2VCQA 4V2NA 3RHCA 5IMFA 3ZMKA 4NPBA 1H75A 2A2RA 2O7KA 4F82A 5D9TA 1OKTA 5DAKB 2X64A 2RM6A 5AN1A 1S3CA 5DJLA 4MCUA 2OE1A 3FKFA 1ZYEA 5D93A 2NBSA 2H73A 3DVWA 2PERA 3UEMA 4YAVA 1VRSD 1QMVA 3F4SA 5FHIA 4G10A 2E7PA 4ZL7A 3ZL5A 10GSA 2L5LA 2K18A 6GSTA 3EMXA 3M3MA 5F07A 2DMLA 4OO5A 1V98A 1PD21 1PX7A 4EC0A 5F06A 5ECSA 2JL4A 3GYKA 2CVBA 3RHBA 1NHOA 3GKMA 2TIRA 2CT6A 5HR1A 5DQSA 4HDEA 3PGTA 4F03A 1B4PA 2HRFA 2AAWA 3APQA 2HFDA 2DLXA 4ECBA 4TR3A 3P7XA 3FZ5A 5HR2A 4LL1B 4QL9A 4LMVA 1SU9A 3EINA 5EVOA 1SKSB 7GSSA 3UIWA 5H5QA 2C3TA 3TKSE 3ZYWA 5ECNB 2JZSA 3TKQA 4BVXA 3UBLA 2MMAA 4JEDA 4CHSA 3APSA 3ERFA 5B6MA 1B4QA 1TRVA 3J7Yk 2PVOC 4MJEA 4K0NA 3A2WA 5H5SA 1XVQA 2IMEA 1SL0B 2XPDA 5IPGA 3F63A 4Q5RA 3P2AA 18GSA 1FAAA 2H1DA 1EGRA 1YEPA 3TRQA 2LEGA 4WBRD 3U5RE 3LXTA 2JZTA 1G0TA 1XXUA 3W6GA 1SL2B 4TN8A 2WULA 1ERTA 4PUFC 2VLUA 1DUGA 1A24A 2WCIA 5LCZA 2HSYA 3BD2A 2O8VB 2L4CA 5DCGA 4L0WA 4MPGA 3R2QA 2OE3A 2I9HA 3L9UA 3GSSA 3HZ8A 2HI7A 5J3RA 2YN1A 1WE0A 1G6WA 3VWXA 4EXJA 4EDZA 5FT3A 3QOUA 5ECLB 1SJ6A 3F4TA 1M2AA 1GULA 4FIWA 3TOTA 1AQVA 4IW9A 2LJAA 4PX1A 2HZEA 1M2DA 4GWRA 3C73A 4G9HA 4IGJA 5ENUA 3EMPA 4N30A 1ZMAA 3F3RA 4OWYA 5B7CA 5D73A 1I9DA 1F37A 4GTUA 5GAND 3G7IA 3KIJA 2C8UA 4JR4A 5IOWA 4L5OA 3ZIJA 8GSSA 4GXZA 3TJFA 4YQUA 4MZCA 4XS6A 1YKAA 1THOA 2OADA 3J7Yb 3LYKA 2B1LA 2TRXA 1YF0A 2DJ3A 3KTLA 4TRXA 1WPIA 1JLWA 4EKZA 3O6TA 1GSQA 1B9YC 4GQCA 2P31A 3RAZA 2I3YA 5D9VA 2QC7A 2LRTA 1MDJA 1BG5A 1XPVA 1ML6A 4XS4B 2FHEA 5ID2B 2JACA 3TOUA 2IMKA 1T3BA 5DAKA 1A0RP 4ZILA 3MWHA 3O76A 3EVIA 1M9AA 4MPFA 4LLRA 2HE3A 1OE7A 3L78A 4WF5A 3DRNA 4KA0A 1EV4A 4POBA 3KJYA 3A2VA 3H79A 3QR6A 3FZ4A 3H4KA 1TOFA 4YQMA 5IPHA 4X0XA 2C0EA 2R5GA 3FRCA 2GSSA 1PKWA 4V2MA 3D22A 2I4AA 5EY6A 5C04A 5CRDA 3ZLPA 2HZFA 1MTCA 3RBTA 1U3AA 2VCXA 1GSDA 3P8WA 4F0BA 3EU3A 3O3TA 2FUG2 4L8EA 2AB6A 2YWNA 4OFNA 5KN3A 2H74A 3Q19A 1ABAA 4I2UA 2ON7A 5IO2A 3W8JA 2HNLA 1XW9A 1TU8A 2MBSA 3F8UA 16GSA 9GSSA 2GZZA 1W4VA 1Z6NA 1Y25A 4ZL9A 2K8VA 4NV2A 1TXXA 3GA4A 3M8NA 2KP2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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