4O5RA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit c from e. coli
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords AhpC component, subunit of alkylhydroperoxide reductase
publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 45
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5rA00
1M7TA 5F07A 2OE0A 3M0FA 1YY7A 2VL2C 4MZBA 2FA4A 5ECOB 2VD0A 4NAXA 1OE7A 3PR8A 1XIYA 2IPAA 1A0RP 2PPTA 2OBIA 5IO2A 1V40A 2DC5A 1B4PA 4WBRD 2C3NA 5GSTA 3DMLA 5ID2B 1PX7A 3GX0A 4WF4A 3HHVA 1R4WA 1TRWA 4HQZA 2JU5A 2DIZA 3IBHA 3TRQA 4KW6A 1HNAA 2H6ZA 3KXOA 2H66A 1XVQA 3KD0A 3GURA 2CV4A 4DVCA 2WCIA 1TK0B 4FH8A 4QL9A 1AQWA 3ZIJA 1XW9A 4K6XA 3IXRA 5F8BA 2CVBA 4X1UA 4EE0A 3VI5A 1YDKA 4LMWA 2B6MA 1TU7A 1BX9A 1W89A 3WGDA 2PN8A 1U88A 1LBKA 2F8AA 2FWHA 4JR4A 5ECKB 2P5RA 1O8XA 2PGTA 4I6XA 1MDKA 1ZMAA 4FYCA 1M9BA 2JZRA 2VLVA 1EOHA 3MSZA 3BCIA 1O85A 2LJAA 5EPFA 2R5GA 1THXA 2GGTA 5ABRA 1YKCA 1UA5A 4I5QA 1M2BA 4X43A 1HD2A 4NWYA 1X5CA 6GSSA 2K18A 4Q5NA 2XPDA 3F63A 3EC3A 1M99A 1TRSA 3ZVJD 3A3TA 2X8CA 3C1SA 5EL8A 2FNOA 3L4NA 4DSSB 3RHCA 2A2RA 3UBLA 2OA7A 2EC4A 12GSA 1Q98A 3FY7A 1GNWA 5COHA 2I4AA 4MPGA 1QUWA 5CP1A 3GKKA 4WR4A 4MH3A 5LNKe 2LEGA 2XC2A 2DJ1A 4PX1A 5CRDA 2VD1A 4MH2A 4ZL7A 3D21A 2AUVA 3EINA 4GSTA 1X5DA 1DE1A 4MLYA 1XWBA 4XS4B 1BEDA 5ECMB 2B5EA 3C1RA 3F4SA 4ZB8A 5ID2A 2WGRA 1V98A 2H19A 4L0WA 1ERWA 1N8JA 2RM6A 1SL0B 1UVZA 5G1LA 5IPGA 3TJJA 4D73A 3QAWA 2O85A 2EIOA 1EGOA 4IBPA 17GSA 3M3MA 3AY8A 4Q5FA 1ZYEA 2NVLA 2LKUA 3ZITA 3D6IA 4NMUA 1FB0A 1MTCA 2HZFA 5GAND 2HT9A 2L6DA 5FT3A 3US3A 3O3TA 4XS1A 1ZOFA 4K2DA 4KA0A 1ERVA 4EF0A 4OCFA 2E2MA 3KZQA 2KLXA 1AC1A 4CDOA 1ILOA 2LRTA 4KCEA 4MJEA 5H5SA 4YAPA 4AGSA 2GLRA 4HS1A 1MDIA 2WULA 2IMDA 2LQOA 3GKNA 1ACVA 4J57E 5E59A 2AAWA 3HD5A 3FZAA 4IVFA 1WJKA 4I2UA 3E0UA 1V9WA 3IE3A 2TRCP 3CBUA 1K0CA 1OE8A 3DEXA 2YANA 3KH9A 4CHSA 4WF5A 4EKZA 4MABA 1SK2A 2H0HA 4MDCA 5B6NA 2V32A 4MF6A 5HQPA 1A2LA 4TR1A 2H0IA 3TJBA 1X9SB 3UIWA 4RI6A 1B48A 3UMAA 3H93A 3C73A 3L9UA 2LNSA 3L78A 4IN0A 4ILFA 2CAIA 1SYRA 2D2ZA 4HZ2A 4JZQA 1HQOA 1YZXA 1SD9A 1QMVA 22GSA 5CRWA 2JSZA 3LYKA 3KP8A 3TKSC 4XS4A 2X99A 4KDYA 1YF1A 2OE1A 1FOVA 3WT1A 3FR9A 4HJMA 1EZKA 2V6OA 1J9BA 4WKWA 4HZ4A 3G7IA 4MJBA 5DVBA 3GL5A 1TDIA 3IAS2 3VWWA 5D9TA 1QFNA 4AJ8A 1OC8A 1GNEA 1JZWA 3HA9A 1TKDB 5C00A 3FR6A 4FIWA 1VGLA 5GAPD 2O89A 1F3BA 3ISOA 4L5OA 4N10A 3SBCA 4O5RA 4WR5A 5KN0A 2LV3A 3A2VA 2H70A 2LRCA 1GUKA 3APOA 1X9WB 4KE3A 4ULXA 4OO4A 1JLVA 3M1GA 1NHYA 4MJAA 1XPVA 5F05A 5DJMA 4AJ6A 4FYBA 5CAXA 3W8JA 3CTGA 5G31A 5ECRB 4HQSA 3L9VA 4F9ZA 4EXJA 2BJXA 4KDUA 5ELAA 1Z6MA 1XW6A 2H76A 4V1Ap 3FK8A 2HSHA 3IK7A 1TJDA 5A5KA 2FA8A 3KJYA 3RBTA 1FAAA 4ID0A 2O87A 5JWRB 2CX3A 4E8EA 5CREA 2C80A 2YWOA 4TR3A 4BPYA 4F03A 2A4VA 4YQVA 1U3AA 3QPMA 1ML6A 1WOUA 4OFTA 4BL7A 1K0OA 3KH7A 1PD21 1K0NA 4KCAA 3UJ1A 1A8LA 2IWTA 2YJ7A 4GSNA 4NHWA 4WBJA 1ZGNA 3I9V2 1TK8B 5CYYA 3GNJA 3RHBA 2HRNA 3V1WA 2IMIA 2I81A 2VUPA 2VL2A 3PINA 4POMA 3EE2A 3UOMA 4PNGA 3VI7A 1KEBA 2MYGA 4TN8A 13GSA 1HNBA 2ES7A 2HFDA 5GZZB 2G2QA 1YJ6A 1X9MB 3ZL5A 3DVXA 4O32A 3HDCA 3BD2A 3QMXA 3CSHA 2MMOA 4EDYA 4K7NA 2HLSA 2KP1A 3GTUA 3FYGA 2MBTA 3ERFA 4XS6A 5ECIB 1E2YA 5IO0A 3VLNA 3QCPA 3HZ4A 4N11A 4ZBBA 2ZUPA 2GDRA 1T7PB 2WB9A 4KNDA 1XWGA 4NV5A 3IRAA 1PX6A 3DD3A 3W6GA 1EGRA 1XW5A 2F9SA 2EIQA 4TW5A 1KNGA 4F2IA 1F9MA 1GTBA 5J4UA 5DCGA 3FW2A 4DEJA 1VF3A 3VWVA 3ZMLA 3GX8A 2LJKA 1OKDA 2YN1A 2L59A 1QQ2A 2FWEA 3P7XA 3GMFA 3ERGA 1LJRA 3ME8A 3TKPA 5H5RA 3HVXA 3TOUA 4D73B 4ZIJA 5AISA 5ECQB 1OC9A 4LMVA 2IMFA 2YZHA 2ALBA 2Z9SA 1PN9A 2HSYA 2WZ9A 5A4VA 3EU3A 2WDUA 3VPTA 5HFKA 1GSDA 3GSTA 5D96A 4EUYA 3UARA 2N5FA 5AIVA 4K0GA 3MAKA 2R2JA 2C0EA 4EO3A 1BJXA 1ERUA 5IMVA 4MK3A 1WRYA 2L57A 1VF1A 2OE3A 1A0FA 2MMAA 4POBA 3UEMA 4NPBA 5IMAA 3LG6A 3UBKA 4OD7A 2PWJA 1J08A 3GA4A 1TK5B 5E4WA 3NIVA 4I8BA 3DGQA 4ZXGA 10GSA 3UAPA 4POLA 1TRVA 1LU4A 4MJCA 1QK8A 2L4CA 1X0RA 3CXGA 5DCHA 3FZ9A 3TKSE 4IS0A 4L8EA 1XWKA 2I1UA 4ZL9A 3TB2A 1PSQA 1E6BA 8GSSA 2N5BA 5HR3A 3OR5A 4K1FA 4ACSA 2VM2A 1DSBA 1SJZA 1G6YA 1TI3A 5J9CA 1C72A 1JLWA 3VWUA 4TR1B 2HZEA 2ON7A 3FKFA 2LTKA 5F0GA 1XOBA 3GN3A 4TKYA 5JWOB 2GS3A 1M0UA 4ZL8A 3L9SA 3EMPA 4FYUA 2C0FA 1PRXA 3APQA 3HVSA 4WXTA 1XFLA 3ZVJA 2VLUA 4ECJA 1EWXA 1SKRB 4NHZA 1X5EA 1CQHA 1THOA 4E8HA 4H86A 2GTUA 2M72A 2BTOT 2IMEA 3J7Yk 4QQ7A 1XOAA 2VL3A 4RUVA 1GULA 1NM3A 2B7JA 4TXOB 4O92A 4K8MA 4NXIA 5FHIA 1SJ6A 1K3YA 4YQMA 2K6VA 5KN2A 4ZB9A 3C7MA 2FHEA 4MA9A 3KCMA 2ON5A 1F37A 3HJPA 4BVYA 2OKAA 2F51A 4ZILA 3VK9A 2FWFA 1DBYA 3EMXA 1FW1A 1PMTA 2WFCA 3D4TA 1R5PA 3HCZA 3BJ5A 3VPQA 4MZCA 3EURA 1A2MA 2NBSA 1ST9A 2V2GA 4IKHA 5JWQB 1SL2B 2GSTA 3A2WA 3WGEA 4MPFA 4OO5A 4HUAA 1G7OA 4GXZA 5B8BA 1GP1A 1GTAA 4MZWA 2HYXA 2IJYA 4KDXA 2JSYA 2CX4A 3PGTA 4KH7A 4KSOA 1SENA 1GLPA 2XPEA 4PXOA 3TKSA 5ECHB 4CW9A 7GSSA 1K3LA 5DDLA 2RUFA 3ME7A 3D0ZA 4MMMA 1TW9A 1O8WA 1T8EB 1YEXA 2L4QA 1B8XA 2M46A 3J7Yb 3F4TA 1GSEA 2JZSA 3TDGA 4TR4A 4V2LA 5C04A 5ELGA 1PL1A 1GUMA 3TUEA 4LL4B 4V2MA 1GSSA 1QXHA 5G30A 2YV9A 4G10A 3ZFLA 3CYNA 5JCUA 3DVWA 2K8SA 1S3AA 5JCWA 1SKWB 3GL3A 2H72A 1AW9A 3LEFA 2MBSA 5CO3A 2IMKA 3HYPA 4ISDA 1GWCA 4RQRA 2IFQB 3IC4A 4ZB6A 1G7EA 3D4MA 3PH9A 1K0BA 2V6KA 4EC0A 4G9HA 1PL2A 1ERTA 1HYUA 3DXBA 2NPBA 3FR3A 5EY6A 1UN2A 3GTUB 3TCOA 4GCIA 4TXOA 1BG5A 1EV9A 3C71A 1VF2A 2VCXA 1GH2A 5G1KA 2L5LA 2H71A 2IN3A 1XBSA 5A4UA 1UC7A 1DE2A 3H8QA 5B8AA 4EVMA 1MD4A 1A23A 2DJ0A 4ML6A 2I3YA 1H4OA 3CSJA 4AF2A 2CZ3A 2L5OA 3WGXA 2QC7A 1XWAA 5IMDA 3UVTA 4V1Ag 2PUKC 4L5LA 4DSRA 3F3QA 5J5NA 5DAKB 2CZ2A 3HJMA 4HJ2A 2JZTA 2YV7A 2V41A 2YWMA 2VCQA 2C3TA 1R7HA 1KBNA 2RM5A 2VCTA 1PGTA 3GUSA 5IOXA 1H75A 3GIXA 4K9ZA 3P90A 1GRXA 5INYA 1VF4A 2EIRA 4HEA2 4KGIA 2H1GA 1M2DA 4Z7XA 2GZPA 3CRTA 1MDJA 5AN1A 2HE3A 1EEMA 1OC9B 4QL7A 2AB6A 1AUCA 4I2TA 1QGVA 5D8IA 3TGZA 2HI7A 3NZNA 3HVVA 2YJHA 5D9WA 4Q5RA 2YZUA 3KTBA 3I6AA 2GQMA 3ZFBA 3F6FA 2PVOC 4PQIA 3H79A 4G2EA 1GSQA 3VFIA 4HOJA 2AJQB 2HNLA 3WD6A 3E9JB 2X8GA 5KEJA 2FY6A 1TI1A 3QFBC 3W8SA 3F8UA 2HXKA 1WPIA 1HNCA 1WMJA 3TJKA 1YEPA 4PQ1A 1GSYA 1EEJA 4KUNA 2H6XA 2KP2A 6GSVA 3E3EA 4OWYA 3KP9A 2IFQA 1NHOA 4TOPA 2DJJA 2CVDA 1A24A 5ECPB 1KTEA 2GT6A 2O8VB 5J41A 3SWLA 3F9UA 2V1MA 4RQXA 2XBQA 3ZREA 3TRPA 3D22A 5IQYA 3HY2A 4TVEA 1T3BA 3DIEA 4GLTA 3LXZA 3Q6OA 3IPZA 3LYPA 1K0AA 5L71A 2DMLA 3LORA 1Z7PA 3TKRA 4K7OA 4TR0A 2R4VA 4LLRA 1SKSB 2HZEB 3APSA 1OVNA 4X0XA 5ECLB 3H1NA 4ECBA 1Z9HA 2ZNMA 1T00A 3C8EA 1I5GA 1B9YC 2C8UA 3N5OA 4HDEA 3VWXA 1JFUA 1USBA 1YKAA 5DAKA 4K7IA 1R26A 5DBQA 1BYEA 1OC3A 3F6DA 4BWSA 1GSFA 1AAZA 1AQVA 2N5AA 2OACA 1PA3A 6GSXA 2C1YA 1O7UA 1OYJA 1K0MA 3LWAA 6GSTA 4XRDA 3ZMKA 1GSUA 2H1DA 2GSRA 11GSA 4J56E 3LQ7A 4K0NA 5HFGA 2MMNA 2M80A 1XVWA 3FHKA 4L0UA 1XCCA 4MF5A 2H1BA 2PMTA 3CRUA 4IHUA 3GKMA 5F06A 2PU9C 3KEBA 4AJ7A 3LGCA 2VCZA 1M2AA 3UVHA 2X8HA 3IK9A 4PNFA 3IHQA 2H75A 1MEKA 2KHPA 4IJ3A 2YWNA 4LA1A 2LNTA 2E7PA 1K0DA 1TU8A 1PKZA 1Z7RA 1YQ1A 3ZIVA 3ZYWA 2JADA 5J9BA 1FO5A 1OAZA 1BAYA 4IJIA 2OADA 2XHFA 2LS5A 5H5QA 2C0GA 4P3YB 2LRNA 4OFNA 5G2ZA 4JR6A 2GQLA 2LSTA 1G0TA 3RPPA 1J0FA 6GSYA 2KUCA 3JCML 3H4KA 1RQMA 5ECSA 1O73A 2C0DA 2GQKA 3KTLA 4GF0A 4MF7A 3K8NA 3UL3A 3GKXA 2MMZA 5IPHA 3GYKA 4XRAA 1SD8A 3RDWA 2VCWA 3D5JA 4JU5A 2E2GA 5B7CA 4GWRA 4IGJA 3FEUA 2B5XA 1GTIA 1FVJA 2QKEA 3IA1A 2IIYA 2GZZA 1Z5YE 4XCSA 3G7JA 2O7KA 1FG4A 1WP0A 4PGTA 5LCZA 4JBBA 4ECIA 4V2NA 1GLQA 2I9HA 3TKQA 2K9FA 3KIJA 4JEDA 5IMFA 2JL4A 3LJRA 1ZCPA 2VAFA 3DYRA 3G7YA 3HZ8A 5DALA 3VURA 18GSA 3M8NA 3S9FA 4OCEA 2CT6A 3CSIA 3WT2A 5DQSA 2PVQA 5CRHA 4IP6A 2RIIA 4MP4A 4WETA 3HXSA 2LQQA 3F3RA 1XWCA 1WWJA 4IQAA 5DQYA 2FD3A 3ZLPA 4XTSA 4OFMA 1G6WA 2KOKA 1AQXA 1IYIA 1GTUA 3R2QA 2R3XA 1B4QA 4TXVA 1SK0A 4IW9A 4GQCA 5IMCA 5IOWA 4LL1B 1M9AA 3IDVA 3IAM2 2AV4A 1YF0A 3Q18A 5G5EA 1JZDA 2CA8A 4WEYA 1OKTA 5EVOA 3F4RA 3RPNA 2K8VA 2H73A 4HI7A 2YNXA 1URMA 1TP9A 2FWGA 1ON4A 3QOUA 4G19A 2H74A 4FO5A 3A5WA 20GSA 1T1VA 2FGXA 3TOTA 4NV2A 5D9VA 2B1LA 2DJKA 2A2SA 3NOFA 3GHAA 1GL8A 1I9DA 1ABAA 3KMNA 3QD9A 1CQGA 2MZCA 3I69A 2F8FA 5J3RA 3GFKA 4ECCA 4GQFA 3TJGA 2DJ3A 2WJUA 4BVXA 2C3QA 3QFAC 3DRNA 1PKWA 4MCUA 3U5RE 2HRFA 2OBKA 3Q74A 2YPMA 1TRUA 3QAVA 1EP8A 2AHEA 2J23A 3GRXA 3MNGA 5DJLA 6GSUA 2XBIA 3KGKA 1R5AA 2DSAA 5ECNB 4TRXA 1SYXA 4JE1A 1O6JA 2P31A 3DWVA 3HKRA 3ERWA 1VRSD 4GTUA 5AGYA 2PERA 1WE0A 2REMA 2H30A 3CMIA 3QAGA 4DSSA 3ZTLA 3O76A 1Z3EA 2VLTA 3A2XA 2FCHA 3M9JA 3WYWA 1DUGA 2RLIA 4IP1A 1BQ7A 4N0ZA 4KB3A 2P0GA 3FZ4A 3FZ5A 2GSQA 3IOSA 5G5FA 1XXUA 2YOIA 4N30A 5FWGA 1T4ZA 2CQ9A 2H6YA 3LFLA 1EOGA 2AYTA 2RUEA 3EVIA 19GSA 2WS2A 4KAEA 2VIMA 1FHEA 3KM6A 1EV4A 3RAZA 4Q5QA 2E0QA 4OMVA 3IV4A 5KN3A 5HR2A 5IIZA 2B5YA 4ML1A 1O81A 1F3AA 4ZBDA 1SJIA 3P2AA 2TIRA 1JHBA 3TJFA 1XZOA 4GRFA 3O6TA 1N2AA 1Y25A 4IELA 1A2JA 3N9JA 1ZZYA 3TRXA 1AIUA 3ED3A 3ZRDA 3FRCA 3P8WA 2J9HA 3Q19A 1TOFA 2X64A 2L6CA 3G9BA 3LSZA 1TXXA 5GSSA 1RK4A 3HJOA 4F0BA 2B3SA 1S3DA 4PUFC 2VCVA 1Y6EA 2ZCTA 4PURA 3MDKA 1U3IA 2DBCA 1FVKA 2P5QA 2R37A 1EP7A 3BOAA 3MWHA 4BWQA 3ZZXA 3BBYA 3QDNA 1Q4JA 1F6MC 6GSWA 4YQUA 1IYHA 1JZOA 2YCDA 4J2FA 5AIXA 4IQ1A 3GH9A 1U87A 1SU9A 5D93A 3GSSA 5LD0A 4F0CA 3U6VA 5CRGA 1NSWA 5HR0A 4ZBAA 2GZYA 4I97A 4PQHA 2QGVA 4YAVA 1Z6NA 5JCGA 3KMOA 5ENUA 1A8YA 2GVPA 2R6KA 4HU7A 4DSQA 9GSSA 5KN1A 2YWIA 5D9XA 1V2AA 4EL1A 5HFIA 2B7KA 1TTZA 16GSA 3GV1A 2H01A 1AXDA 4YH2A 14GSA 2NDOA 2NTOA 2BMXA 1U6TA 2VO4A 5IM9A 3QR6A 2YP6A 3EYTA 3L0HA 1K3OA 1GUHA 5B6MA 2LJRA 2H1AA 3F0IA 2PBJA 2WRTA 1MD3A 1ZL9A 1T4YA 2OJLA 1JZRA 2VM1A 3GH6A 4POKA 5IMZA 2DIYA 2H0GA 5A4WA 1SL1B 2G0FA 1RW1A 3I43A 3M9KA 3CTFA 5D73A 2C4JA 2GSSA 2VL9A 4XIHA 2FUG2 2DMMA 2TRXA 1PQNA 3EWLA 4F82A 5HR1A 4N0VA 3IR4A 4HU9A 1F2EA 2QSIA 2F3MA 1ZYQB 2H8LA 4KX4A 2CAQA 1WIKA 2VOCA 2DJ2A 4XHMA 1NW2A 2JACA 3EU4A 2LUSA 1FB6A 3BCKA 1W4VA 4JRRA 2CVKA 4GSSA 2IL3A 1SK1A 4RI7A 1B9XC 2DLXA 1V57A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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