4O5RA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit c from e. coli
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule keywords AhpC component, subunit of alkylhydroperoxide reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5rA00
5IM9A 2K8VA 1TU8A 1PRXA 3CMIA 4GSSA 4Q5FA 1USBA 1VGLA 3ZLPA 4EUYA 3ERWA 1FHEA 3FR6A 4XIHA 1EOGA 4DSQA 1BX9A 4ECJA 2FA4A 3BCKA 3QOUA 4YH2A 4HU9A 2E0QA 2FHEA 2VUPA 3KGKA 1ON4A 2H72A 3O6TA 1OC9B 2K18A 2LRCA 3PR8A 3C1RA 3KH9A 5D8IA 3LEFA 1F2EA 2YWNA 1O81A 2IIYA 4RI6A 3EE2A 3WYWA 2H73A 2FCHA 5DJLA 3D4MA 1SK2A 4OCEA 4AGSA 3IHQA 4TR4A 1WE0A 5ECPB 2WZ9A 4WF4A 2IFQA 3RHBA 5H5SA 1K0MA 1J0FA 12GSA 1WWJA 1BEDA 2VD0A 2WGRA 1AQVA 2GSRA 2MMOA 2OE1A 2GSSA 2BMXA 3TRPA 4HEA2 1QFNA 1HNCA 3ISOA 3APOA 4NV2A 2MMAA 4I2TA 4EL1A 4ZL8A 3GL3A 2MBTA 1GSSA 2MZCA 5HFGA 1A24A 3CSIA 4PX1A 4KDYA 5D9XA 3TRQA 3CXGA 2R5GA 1XZOA 5IMZA 4TR0A 2O8VB 3TKQA 1I5GA 3P8WA 1R5AA 2WJUA 1ZYQB 2DJKA 10GSA 1XXUA 2FD3A 1A2JA 1ACVA 2I1UA 2YP6A 4ZXGA 4PQHA 2LJRA 1X5DA 2IL3A 1X0RA 4EDYA 4TRXA 1X9SB 4IKHA 1W89A 3BCIA 3TGZA 2YWIA 1BQ7A 2EIQA 5F06A 4XS6A 4MJCA 2N5FA 1WMJA 2YWOA 5A4WA 3DVXA 5DAKB 3DYRA 3F6FA 1ML6A 3L9SA 2PN8A 3HJPA 2IWTA 2JSYA 3ZVJD 3F3RA 1B4PA 2O85A 3WGEA 1SD9A 4WETA 1EWXA 3M9JA 5IOXA 2CVBA 3HA9A 2R4VA 2C80A 3ZZXA 2AYTA 4BWQA 4GLTA 2B7JA 5EY6A 3TB2A 3U6VA 2RIIA 2I9HA 1F3BA 4OWYA 4ZB6A 2KHPA 1GSDA 1XWBA 2AHEA 2M80A 3LYPA 3FZ4A 3HKRA 8GSSA 3KZQA 3AY8A 1XW9A 3TKRA 4P3YB 3Q74A 1OVNA 2XPDA 3EVIA 2C0GA 4CHSA 2DIYA 2YPMA 1UVZA 5LCZA 4RQRA 3CBUA 2HRNA 5ECKB 5HR0A 1F3AA 1TXXA 5J9CA 1QK8A 3GX8A 5D96A 4MJEA 1FVKA 2L57A 2LEGA 4XTSA 2JSZA 1JLWA 3LWAA 1SJ6A 1U88A 1K3YA 3L78A 2H6YA 3F8UA 1NM3A 2OE0A 1XOAA 1U3AA 2O89A 4LLRA 3KP8A 5CRWA 3QDNA 4PQ1A 2JZRA 4QL9A 5ID2B 2J9HA 4JEDA 2H1GA 4TXOB 3GKXA 3VURA 4MZWA 4XS4B 3N5OA 2CX3A 4XCSA 3IR4A 2CZ3A 4JBBA 4X43A 5GAPD 2OE3A 5DCHA 4MLYA 4KSOA 2V6KA 3TJJA 2PVOC 2GZPA 5J4UA 2RLIA 4ZIJA 4PQIA 3HDCA 2CV4A 1KEBA 5CAXA 3DRNA 3QAWA 2PUKC 4TR1B 4Z7XA 3C1SA 3M1GA 5DDLA 1HQOA 3I43A 5DJMA 3ZMLA 3UVHA 4HZ4A 1XFLA 5CRGA 1SJZA 1XBSA 3EU4A 4MH3A 4DVCA 1GSYA 2H30A 2C0EA 4ACSA 20GSA 4QQ7A 2C0FA 1Z7RA 5CRHA 1OE8A 5A5KA 4MDCA 5G31A 2N5AA 2WDUA 3TOUA 4WKWA 1ZMAA 3UBLA 2RUEA 4EKZA 2NPBA 4MP4A 4E8HA 2J23A 5EL8A 4I97A 2HRFA 2LTKA 3EYTA 1N8JA 1XW5A 1T1VA 2YOIA 4G9HA 2VL2A 4AJ8A 4K2DA 2KP2A 3HZ8A 4HI7A 2VM1A 1TJDA 6GSYA 1THOA 2VO4A 4L5OA 5JCWA 1T8EB 1WRYA 2KUCA 1PQNA 4HS1A 5ELGA 4IS0A 4KCEA 1GH2A 1BAYA 3GIXA 1LJRA 2D2ZA 5JWOB 5G5EA 3Q18A 22GSA 1M9BA 3TJBA 1OYJA 2M46A 4MF6A 4OFNA 4NMUA 5CREA 3TCOA 2X99A 2O7KA 2HNLA 1HD2A 5DCGA 1YF0A 1SJIA 13GSA 3FZ9A 5D9VA 17GSA 2K6VA 3HY2A 4DSSA 2DBCA 5HFIA 1GSFA 4TKYA 5IO2A 3QMXA 3FK8A 2LRNA 3O3TA 2GQKA 1KBNA 1DE1A 4HDEA 3SBCA 1R5PA 5ECMB 4K0GA 4MCUA 3GN3A 4PGTA 4LMWA 2JACA 2CT6A 3W8JA 1JZWA 2F9SA 2V1MA 4OMVA 1XW6A 3RPPA 3IK7A 3L9VA 4NWYA 3MAKA 2V2GA 2CVKA 1SYXA 4MPFA 1ERUA 2PU9C 3UEMA 2MMNA 2REMA 3ZTLA 4DSRA 4EDZA 1PGTA 3LXTA 1XCCA 1ZZYA 5EVOA 1H75A 1NHOA 5ECLB 1OC8A 1Q98A 4TW5A 3LSZA 3P2AA 1BG5A 4KA0A 3FEUA 1QMVA 1K3OA 4K7IA 4KDUA 4YAPA 1B8XA 1JZOA 2L4CA 4X0XA 3JCML 2B6MA 3FR9A 2DJ1A 5DQYA 5F8BA 2WB9A 1Z3EA 2H71A 1K0NA 5D93A 2HSYA 2JU5A 3KEBA 2QSIA 4GQFA 1V98A 4MK3A 3NZNA 2E2MA 4D73A 2YZUA 1G0TA 4WBJA 2GQMA 2X64A 2GGTA 4MH2A 2DJ0A 4JZQA 4J56E 2C3QA 1EZKA 4HQZA 2FWHA 1M99A 3ZL5A 4Q5RA 4POMA 2IMKA 1EV4A 2A4VA 2BTOT 3EMPA 2AB6A 2GSQA 3D4TA 3WT1A 2LV3A 1YJ6A 5CNWA 2L59A 1TW9A 4F0CA 1OAZA 1YEXA 3Q19A 4I2UA 3CRTA 5CP1A 1XWCA 4KB3A 2YJ7A 2MMZA 2OJLA 3HVSA 3H8QA 3C73A 4MJBA 4G2EA 2VL3A 1GTBA 1TDIA 2LQQA 3FRCA 2VCQA 1ZYEA 3F4SA 3K8NA 1A0FA 3CSJA 1GSEA 1YY7A 3VI7A 3D22A 3VPTA 6GSTA 2FWFA 2NBSA 2HZEB 1AIUA 3G7IA 2R3XA 5J5NA 1GUMA 5IOWA 4KNDA 4MF5A 2LSTA 2ON5A 4GSNA 2RUFA 3TJGA 3TOTA 3GKNA 3H79A 5IQYA 2TRCP 3GTUA 4NAXA 4JR4A 4I5QA 2WULA 3W6GA 4HOJA 4JRRA 1SL0B 3IOSA 5HR1A 3F4RA 3EINA 1G6YA 3E9JB 1M2DA 4KCAA 1Z9HA 1ERTA 2BJXA 1X9MB 5H5QA 1K0BA 1PMTA 2A2SA 2O87A 3ME8A 2HE3A 2C8UA 2HI7A 1AAZA 3HJMA 2JZSA 2H0IA 1JFUA 2H6XA 2CA8A 3ZITA 1O6JA 3GX0A 4GTUA 1ZGNA 3H4KA 4ISDA 3DXBA 1PD21 4O5RA 5G1LA 3VWUA 4FO5A 2V41A 4FH8A 3WGDA 4ZBAA 1YF1A 3MDKA 2VCVA 2P31A 4GQCA 3UIWA 5KN3A 1GSUA 3GFKA 1HNBA 4IW9A 1EOHA 3VFIA 4IBPA 1KTEA 2B5YA 3ME7A 1EP8A 1S3AA 2VLVA 1X9WB 2H74A 3GH9A 2IFQB 1TU7A 2YN1A 3GKMA 2MBSA 4WXTA 1TRVA 3GV1A 1V58A 5AIVA 1SK1A 2YWMA 3RBTA 2ZNMA 1A2LA 3HVVA 4J57E 1PKWA 2PPTA 4YQVA 3TDGA 1Q4JA 1PL2A 2IMEA 2V6OA 1H4OA 5IPHA 4KDXA 2VOCA 5INYA 2LJKA 2EIRA 7GSSA 3ZREA 1XWKA 1CQHA 4HZ2A 3GSSA 1A8LA 1TI1A 5ELAA 3HYPA 1LBKA 3EURA 3LFLA 1KNGA 2TRXA 4G10A 3UOMA 4BWSA 1FVJA 1MTCA 1OE7A 4IJIA 1ILOA 2H66A 3M3MA 1MDKA 2GS3A 1QQ2A 2DIZA 4NXIA 2GDRA 3BOAA 2LNTA 4CDOA 4WEYA 4IQ1A 5GAND 5D9TA 5CO3A 3WD6A 1OKTA 1TK0B 3U5RE 4H86A 2DJ2A 3DMLA 3ZIJA 5IO0A 3VWWA 3ZFLA 1DBYA 3F9UA 2CZ2A 4MABA 3P90A 3EC3A 3TJKA 3ZYWA 2LRTA 3KTLA 2H0GA 5GSSA 2WS2A 1TTZA 1TRSA 4L0UA 3F3QA 1TK8B 1SK0A 3ZIVA 2H6ZA 2VLTA 1GL8A 1G7EA 4N30A 1GRXA 4OCFA 3GUSA 4KH7A 4HQSA 2VL9A 1GTAA 5G2ZA 3GA4A 3TKSC 3M0FA 2LQOA 1VF4A 5B6MA 3GL5A 3MSZA 1TOFA 4ECCA 1QXHA 3D6IA 3FZ5A 4KSMA 1SKSB 5ECOB 2I81A 3QPMA 2F51A 6GSXA 1YDKA 3I6AA 3WGXA 2C3NA 1B9XC 4K9ZA 18GSA 1Z6NA 3FKFA 1GLQA 2H76A 1TRUA 4IQAA 5AN1A 5DALA 1SL2B 4YAVA 1SYRA 3ZVJA 2P5QA 3M8NA 2FY6A 3NOFA 2B7KA 1JZDA 1B4QA 1EGRA 1N2AA 4MJAA 1M0UA 4YQMA 1FB0A 1WIKA 1S3CA 4F2IA 2GSTA 2HFDA 1GWCA 1TKDB 3QFAC 1FW1A 4GRFA 1JHBA 1PN9A 2IMDA 1J08A 4BL7A 1G7OA 4ILFA 3GKKA 2KP1A 1ERVA 4TR3A 2L5LA 3IAM2 1AUCA 5ECHB 1DSBA 2B1LA 4ZL7A 2ON7A 4ZB8A 4XRAA 4F82A 4FYUA 3HXSA 3A5WA 1RW1A 2PERA 4V2NA 4ECIA 2R37A 4GF0A 3L9UA 4OFMA 2HYXA 2DMLA 2PGTA 4IHUA 1V9WA 3I69A 1XOBA 3ZMKA 2TIRA 4GSTA 2B3SA 3IAS2 5JWQB 6GSSA 1Y6EA 3WT2A 1TK5B 5GSTA 1J9BA 1A8YA 2LKUA 5ABRA 4FIWA 1JLVA 2AAWA 2LS5A 1GTIA 4OFTA 1X5EA 2H70A 2PMTA 4NHWA 2X8HA 1ERWA 4IVFA 5B7CA 2YNXA 5IMCA 5F07A 3W8SA 3HJOA 3TUEA 5AIXA 1URMA 5DQSA 1W4VA 1Y25A 2RM5A 2XBIA 1O8XA 1V40A 4V1Ap 3VPQA 3DWVA 1GP1A 4X1UA 3IA1A 1NW2A 2R6KA 2VD1A 1T00A 5ECRB 3US3A 2NVLA 2GZZA 1XIYA 1BYEA 3QD9A 4PUFC 5HQPA 4ZBBA 4I6XA 3KXOA 1VF2A 3A2XA 2GLRA 1XVQA 5IMAA 3DEXA 4IJ3A 3IDVA 2G2QA 3A2VA 3KCMA 4PXOA 2XPEA 4N11A 2GTUA 1RK4A 1K0DA 5E59A 4L0WA 4JE1A 1AC1A 1F9MA 3UARA 4DSSB 2VAFA 4PNFA 4Q5NA 1OC9A 3FW2A 2PBJA 1K0OA 5G5FA 1K0AA 2YANA 5G1KA 3H1NA 1WOUA 1EGOA 2OBKA 1AW9A 3PINA 16GSA 3HHVA 5COHA 4K8MA 3HZ4A 5G30A 1LU4A 4JU5A 1NSWA 3IRAA 1K0CA 4AF2A 4POBA 2L5OA 3CRUA 4BA7A 3UAPA 2NDOA 1YKAA 2F8AA 3KJYA 2IMIA 1ZOFA 9GSSA 4LL4B 1PA3A 4F0BA 3TJFA 1QUWA 5FHIA 4EXJA 3KMOA 2VLUA 1MEKA 3RHCA 5IPGA 3Q6OA 1FAAA 2AV4A 3GSTA 5H5RA 5J9BA 5IMVA 2KLXA 4TOPA 5FT3A 2OBIA 3J7Yk 1GTUA 4L5LA 1MD4A 1RQMA 4RQXA 4D73B 4WBRD 1E2YA 1FO5A 2GT6A 2P0GA 4O32A 2GZYA 2DJ3A 1GSQA 2FGXA 1F6MC 1O73A 2LJAA 1FG4A 2XC2A 3HVXA 5F05A 1NHYA 5LD0A 3FYGA 2YZHA 2P5RA 3J7Yb 3LG6A 4BVXA 5JWRB 2H8LA 3GH6A 3DD3A 5ECNB 2DLXA 2JZTA 1Z7PA 1M2AA 3GRXA 3VWVA 2DJJA 5C00A 2DMMA 1SL1B 1MDIA 1WJKA 2QC7A 2X8GA 1R7HA 3IK9A 4ZILA 2ALBA 5IIZA 3UMAA 1YZXA 4TVEA 2E7PA 1EEMA 5DAKA 6GSWA 2F8FA 3IE3A 1A23A 2FLSA 2IMFA 3KIJA 4V2LA 2ES7A 5D9WA 4AJ6A 1PX6A 1UA5A 2X8CA 4KGIA 5KN0A 4NPBA 1GUKA 3RDWA 4IP1A 2GVPA 2L4QA 1AXDA 2H01A 4K7NA 1GNWA 4HJ2A 3FHKA 4KW6A 3S9FA 2VM2A 3GTUB 4BVYA 4MMMA 2C0DA 2L6DA 3APSA 1R26A 1AQXA 3SWLA 3GYKA 1DE2A 5IMDA 4HU7A 2QKEA 3PGTA 3KTBA 5C04A 4TN8A 4V2MA 3UVTA 4GWRA 3BBYA 2K8SA 4BPYA 3MNGA 3QCPA 3TKSE 3IBHA 4ECBA 3IXRA 3DIEA 5B8AA 2YCDA 2B5XA 1ABAA 5L71A 3UBKA 3CSHA 3A3TA 5DVBA 2M72A 2B5EA 3LJRA 1GNEA 3ED3A 4MZBA 4NHZA 2DC5A 3RAZA 1V2AA 4EE0A 2XHFA 2K9FA 2KOKA 4MZCA 5JCUA 2OKAA 3N9JA 4IELA 2H1AA 1WPIA 2C3TA 3DKSA 2AJQB 5CRDA 4ZL9A 4FYCA 1U3IA 3TRXA 3FR3A 1MD3A 1QGVA 1GLPA 1U6TA 4CW9A 3LXZA 4L8EA 2WCIA 1XWGA 1SD8A 5ID2A 3QAGA 4TXOA 4LL1B 3A2WA 1EEJA 5KEJA 5DBQA 4XS4A 4HJMA 4E8EA 5F0GA 3KH7A 4MF7A 4JR6A 2HLSA 5J41A 1SENA 5CYYA 3UL3A 2CAIA 2HZFA 4OO4A 1XVWA 5ECSA 1O8WA 2A2RA 1AQWA 2FNOA 3GURA 3HCZA 2CQ9A 1PL1A 4LA1A 5ECQB 1FB6A 4KX4A 3NIVA 2IPAA 5ENUA 4EO3A 2VCTA 4TR1A 3QR6A 4PURA 4EF0A 3BD2A 4O92A 4GXZA 1A2MA 1IYHA 2N5BA 4PNGA 1PSQA 2FUG2 6GSVA 4IGJA 1G6WA 5J3RA 2H19A 3MWHA 4OO5A 3APQA 2Z9SA 3VI5A 2ZUPA 3IV4A 3EMXA 3CTFA 2R2JA 4N0VA 4O7HA 5AISA 1U87A 3EU3A 4IN0A 4N10A 4QL7A 2CX4A 4WF5A 1M9AA 3DVWA 2C4JA 2EIOA 4KAEA 1VRSD 2WRTA 2GQLA 3C7MA 1Z6MA 3H93A 3P7XA 3GNJA 2CAQA 1TP9A 2NTOA 2VL2C 1CQGA 5A4UA 5HR2A 1ST9A 1TI3A 1M2BA 2XBQA 4AJ7A 2HT9A 2V32A 4F03A 1DUGA 1OC3A 3O76A 1MDJA 3QFBC 2HSHA 3LGCA 3D5JA 5JCGA 5EPFA 1V57A 3OR5A 3CTGA 4I8BA 3TKPA 1M7TA 3C8EA 3GHAA 1XWAA 2AUVA 4RI7A 1EP7A 3QAVA 1UC7A 1YEPA 2VCWA 4K6XA 2H1DA 4J2FA 3E0UA 2RM6A 3TKSA 4ML1A 4ML6A 3FZAA 11GSA 2DSAA 3EWLA 4XS1A 4OD7A 1EV9A 1OKDA 3PH9A 2H75A 2L6CA 3D21A 1VF3A 1A0RP 6GSUA 4EVMA 3G7YA 3KMNA 1WP0A 2VCXA 2GT5A 3FY7A 3IPZA 1FOVA 2OA7A 4RUVA 3F6DA 4K0NA 3R2QA 2B1KA 2WFCA 1GULA 1PX7A 4EC0A 1JZRA 1TRWA 3VK9A 4POLA 5DALB 4WR4A 2MYGA 2VIMA 1SKRB 2PVQA 2C1YA 3KM6A 4POKA 4K1FA 2E2GA 3I9V2 1YKCA 2ZCTA 1B9YC 4MPGA 2I3YA 3VWXA 2F3MA 3F0IA 1HYUA 5KN2A 3BJ5A 3F63A 4F9ZA 5E4WA 4G19A 5FWGA 2YV9A 2VCZA 2YJHA 5B8BA 3E3EA 5AGYA 3M9KA 2QGVA 1B48A 4MA9A 4XRDA 1ZL9A 2CVDA 1T7PB 5GZZB 4KUNA 4FYBA 4N0ZA 2OADA 3HD5A 2OACA 2H0HA 5D73A 1IYIA 1ZCPA 2YV7A 5B6NA 1SKWB 3LQ7A 14GSA 3ZRDA 4HUAA 3L4NA 1PKZA 1O85A 3LYKA 4DEJA 4PUAA 2EC4A 2FA8A 2PWJA 2H1BA 4NV5A 2I4AA 5LNKe 1VF1A 3GMFA 3V1WA 1I9DA 4IP6A 2IN3A 1E6BA 1Z5YE 3G9BA 3UJ1A 1SU9A 3G7JA 4ZBDA 1S3DA 2FWGA 3VLNA 3L0HA 3CYNA 1T4YA 1X5CA 4K7OA 3D0ZA 5HFKA 5A4VA 3IC4A 5ECIB 3ZFBA 4XHMA 5IMFA 2JL4A 1K3LA 4YQUA 19GSA 3C71A 1YQ1A 1F37A 4WR5A 4LMVA 1XPVA 3KP9A 2FWEA 4ID0A 5KN1A 3DGQA 2HZEA 2HXKA 1O7UA 3LORA 2G0FA 1T4ZA 3ERGA 3RPNA 4Q5QA 5HR3A 4GCIA 4ZB9A 1UN2A 2LNSA 1C72A 2IJYA 2JADA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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