4O5RA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit c from e. coli
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords AhpC component, subunit of alkylhydroperoxide reductase
publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5rA00
3A2VA 5CYYA 5DCHA 3HHVA 3GNJA 3ZLPA 4MZWA 3IV4A 5ECKB 4G2EA 1THOA 2OACA 6GSWA 2H66A 4YAVA 1U87A 2JADA 1BAYA 4G10A 1R7HA 4GSTA 2C0DA 1Z9HA 4EE0A 4MJBA 3UBKA 1JHBA 2L6CA 1OVNA 3ERFA 2PU9C 6GSSA 4IBPA 4BL7A 3EMXA 4GWRA 5B8AA 4WEYA 2L59A 3Q19A 1YJ6A 2LRTA 2JZSA 4IW9A 1AQVA 1V58A 3NOFA 4GSNA 3LXTA 2IPAA 4OFTA 5CREA 3LYKA 4TXOA 5H5SA 5ECRB 3Q6OA 4RI6A 3GTUB 2L6DA 1W89A 4XIHA 1QFNA 4EL1A 3GFKA 5HFGA 2H30A 4KGIA 2AAWA 2H0HA 3FR3A 3G7JA 2O85A 4O32A 3WGXA 2CAIA 1Z7PA 1ML6A 2VD1A 1UN2A 5J9CA 2G2QA 5ECNB 4X43A 2B5YA 4DSQA 1VRSD 5HR1A 5B6MA 4BWSA 3QFBC 6GSYA 4KB3A 5CRDA 1UA5A 1TI1A 1GTAA 1H75A 1DBYA 2LUSA 4HZ2A 4Q5QA 3W8SA 1GWCA 4ML1A 1EGOA 1ZGNA 4NHWA 2AHEA 1T7PB 4TN8A 5DAKA 4G19A 2PVQA 1K3LA 4PNFA 2NTOA 2MYGA 3IK9A 2LNSA 5AISA 1AC1A 2L5OA 4XTSA 3SWLA 5E4WA 4DSSB 3VWXA 4NV2A 1F9MA 1EZKA 1FHEA 4ZL7A 1A8YA 2YJ7A 3GKKA 2PBJA 2M72A 2VCQA 2J23A 2V6OA 3P90A 1PX7A 4K1FA 1B9XC 2JL4A 3CTGA 5JCUA 2AJQB 2OBIA 4RI7A 4EO3A 2QKEA 3WT2A 1K0NA 3WGDA 3Q74A 1NHOA 4ZB9A 2B6MA 2OADA 5IMFA 1Q98A 1BYEA 4ECJA 2GQKA 1K3OA 3IOSA 5KEJA 5B8BA 4KCEA 5G1LA 2O7KA 3I69A 3DIEA 4LL1B 2DLXA 5CNWA 2RM6A 1YF1A 1CQHA 3TKSA 3HXSA 1WMJA 4NMUA 2YZUA 1HNCA 3C71A 3QR6A 5D9XA 3FHKA 5CRHA 1MDJA 3EC3A 3GTUA 1X0RA 1EOHA 2FWHA 6GSUA 2I1UA 3LEFA 2KOKA 4BPYA 1SK1A 3TCOA 4H86A 1QGVA 2ON5A 2JSYA 4K0NA 4XS6A 4MJCA 1ZOFA 5AN1A 2PVOC 2PERA 18GSA 3EINA 3FR9A 3L9UA 4NV5A 5C04A 1OAZA 3F4RA 2LJAA 1XW5A 3CMIA 1TRUA 2H74A 4GSSA 4L8EA 3DMLA 2XPDA 4KDXA 1M99A 1VGLA 4OCFA 1JZWA 3P8WA 4MF5A 3KEBA 3IE3A 2DMMA 3EVIA 2M46A 3KTBA 3C8EA 5IPGA 4ZB8A 5HR0A 4K0GA 5D9WA 5D96A 1X5EA 4L0UA 1WWJA 3TKPA 2NVLA 1XOAA 4I5QA 1TRVA 2HZFA 3ZYWA 2LQOA 4DSSA 1SJ6A 4WR4A 3D4MA 4AGSA 3FZ5A 3CSIA 4GCIA 4HUAA 2ON7A 3C7MA 3UMAA 2YOIA 3V1WA 2WRTA 4V1Ap 2V6KA 5D8IA 3FW2A 2RIIA 5ECIB 1F3AA 1XVWA 3HVVA 1LJRA 2GZYA 1GTUA 2EIQA 2GSQA 2J9HA 4WF5A 4F9ZA 4KSOA 2AV4A 3HD5A 1R5PA 2VCVA 1ERWA 2DMLA 3TKSC 4TKYA 4KNDA 1M9BA 1XIYA 3UVTA 4JE1A 4L0WA 1Z7RA 2QGVA 1O8XA 1PL2A 4ZL9A 4ZB6A 2VLUA 4FH8A 1FG4A 4MP4A 3TJBA 4N10A 1XFLA 5AGYA 4EXJA 2N5FA 3G7IA 2FA8A 3IC4A 2HT9A 3VPTA 3HZ4A 2QSIA 1GSQA 1X9MB 2CV4A 4ML6A 3DKSA 4EF0A 3H93A 3VURA 3U6VA 3RPPA 4IJIA 4TR3A 1GTBA 2X8CA 3HKRA 5DJLA 3KD0A 3GKNA 1ZYEA 5ECHB 3IHQA 1K0BA 3BBYA 2IMFA 3TOTA 5CP1A 4WR5A 2ALBA 3HDCA 5J4UA 1HQOA 3KP9A 1T8EB 2BJXA 2VL3A 4XS4B 3O6TA 5ELGA 3BCIA 2X99A 2WGRA 2C0FA 4WF4A 5EVOA 2JACA 3O3TA 4O7HA 5CO3A 4PQ1A 1B8XA 1SU9A 2CT6A 1QUWA 2WJUA 4P3YB 3UARA 4NWYA 1OE7A 1LU4A 2K6VA 2MMNA 3BJ5A 4ECCA 1EP7A 2WDUA 2I9HA 3UAPA 3L9SA 4QQ7A 4FIWA 3VLNA 2YWMA 4MPFA 2AYTA 1A2MA 1K0OA 4IQAA 3D4TA 3ERGA 4HS1A 5IO0A 3R2QA 1URMA 5LCZA 4GLTA 1MD4A 2C0EA 3ZREA 3FK8A 1NM3A 2FUG2 8GSSA 2TIRA 1BEDA 2X64A 4POLA 5F07A 2FWFA 2CQ9A 1DE2A 3GUSA 3MNGA 1T1VA 5D9TA 1AIUA 3EU3A 3W8JA 2WB9A 2KHPA 3GA4A 1WE0A 4BVYA 1A0FA 4V2LA 3E3EA 4KE3A 1YEXA 4IJ3A 3DYRA 1XWAA 3WYWA 1U3AA 4JU5A 1MDKA 5GZZB 5IMVA 2H6XA 1A23A 3KH9A 2IMDA 5ECLB 5GAPD 2C4JA 2X8GA 1KEBA 4HQZA 4XCSA 3GRXA 3DVXA 4F0CA 5IQYA 2LEGA 2YZHA 1M2AA 2H19A 4F03A 4J57E 4YQUA 2CAQA 1X9SB 2WFCA 1EP8A 4FYBA 2WULA 3CRTA 1YKAA 3HCZA 2JZRA 3IXRA 5DBQA 1EV9A 4OCEA 2V41A 1ZL9A 2GT5A 1GSYA 2OE0A 2V32A 3VFIA 1V40A 4L5LA 1U6TA 4QL9A 1MEKA 5IMCA 1LBKA 3UIWA 2NDOA 3IBHA 4PQHA 1PRXA 4D73B 2HYXA 2R37A 1SL1B 2P5RA 2OKAA 3BD2A 2GSTA 3DD3A 4G9HA 1JFUA 5EL8A 1MTCA 1NW2A 3DRNA 5G5FA 1G7OA 3FRCA 2PN8A 2OJLA 1WRYA 2H73A 2HNLA 4PQIA 5KN3A 4CHSA 4GRFA 1XWBA 1ERUA 3HZ8A 5HFIA 2PUKC 10GSA 1X5CA 5DALB 2MMAA 2B5EA 5ECOB 4LL4B 5DVBA 3TJGA 3L0HA 5ECMB 5IMDA 1TK0B 3WT1A 2B7JA 1E2YA 2CX4A 1Z3EA 3ZIVA 3F6DA 1V2AA 2I3YA 4XHMA 1RK4A 4POMA 4AJ7A 2LKUA 3ED3A 4ECBA 3L9VA 3M1GA 2E2MA 1SL2B 5JCWA 1Q4JA 2R2JA 4I8BA 1Z6MA 3CXGA 2YCDA 2H0GA 2F8AA 3KH7A 1V9WA 1T3BA 4LMWA 1UC7A 3DWVA 1TXXA 2K18A 5LD0A 1TRWA 2VM2A 4QL7A 9GSSA 4OWYA 1IYHA 2VLTA 3FKFA 4ZBBA 4Q5NA 1T4YA 2GTUA 2CX3A 3GKMA 1XWGA 3G9BA 3F6FA 1Y25A 4LMVA 1JLVA 4E8EA 3U5RE 3ME7A 4DEJA 4IHUA 1GSDA 4AJ8A 1GUKA 3ZVJA 3DVWA 1PL1A 1B48A 4JEDA 4NPBA 4TRXA 4TVEA 4XRAA 3KIJA 2O87A 4IELA 2YWNA 2MZCA 4ILFA 1SJIA 3I6AA 3P2AA 4D73A 2CZ2A 1EEMA 2NBSA 4YQMA 1WOUA 4BA7A 3ZITA 4X0XA 2VM1A 5JWQB 3UEMA 3D21A 1TTZA 3TDGA 1FOVA 1ST9A 2H1AA 2E7PA 4YH2A 4PUFC 2CVBA 2CZ3A 5E59A 3ZFBA 5HQPA 1N2AA 5DQYA 5ID2B 4TXVA 5DALA 1ZZYA 4HZ4A 2EC4A 4K7NA 1THXA 1XBSA 4K9ZA 2HXKA 3F8UA 3FZAA 5JWOB 4OMVA 2H6YA 4HJMA 2VOCA 4CDOA 4ULXA 4I2UA 4PGTA 4CW9A 3APSA 5JCGA 3F9UA 2HZEB 4TR4A 4TR1B 3TGZA 1OE8A 3UVHA 3FEUA 1QMVA 2DC5A 1SL0B 3VI7A 4MF6A 2GZPA 2IIYA 1S3AA 1VF3A 3FYGA 1IYIA 5CRGA 3QPMA 4J2FA 6GSTA 4GXZA 2EIRA 1KTEA 1HNBA 2L57A 4I6XA 1Y6EA 2F3MA 2H75A 1YZXA 1XXUA 1YKCA 1HD2A 3GHAA 3KP8A 2CVDA 1TOFA 2QC7A 1KNGA 3L78A 4OFMA 16GSA 1YQ1A 3GURA 3ZZXA 1UVZA 1Z5YE 1MDIA 2Z9SA 3F3RA 1FW1A 4JRRA 2IN3A 5KN2A 1G0TA 1GLPA 2GQLA 1YY7A 3ZRDA 3GX0A 3M3MA 2XPEA 2GVPA 3BOAA 1B4QA 4F82A 3ISOA 4MZCA 2ZNMA 2L5LA 1A2JA 5D73A 5DDLA 2WZ9A 3GSTA 3W6GA 3TJJA 1JLWA 1AUCA 2G0FA 1PQNA 2LRCA 1I9DA 5J5NA 4EDYA 14GSA 1G7EA 3VWUA 3KMOA 6GSVA 3KMNA 3KGKA 4LLRA 3ZL5A 1J9BA 2P0GA 3ZFLA 1ILOA 2IFQB 4J56E 1ZCPA 3ZMLA 1TJDA 5B6NA 3ZMKA 3K8NA 2AB6A 1EV4A 3LXZA 4PXOA 4WBRD 2B3SA 4N0VA 1F6MC 1YDKA 4HOJA 4IVFA 5KN1A 3S9FA 2YV7A 4I97A 5ENUA 2VAFA 3EE2A 1GP1A 1FB6A 1HNAA 2JU5A 1K0AA 4EKZA 4X1UA 2YJHA 4XS1A 3LFLA 2HZEA 4RQRA 4TR1A 4PNGA 3TRQA 5H5RA 3HJMA 5IOWA 1ABAA 3TKSE 3F0IA 1BX9A 3LYPA 3LG6A 5HR2A 3NZNA 1N8JA 1GLQA 3ME8A 4FYCA 1A24A 2H76A 1OC8A 3A5WA 4IS0A 4MA9A 1DSBA 1EOGA 4HQSA 3CTFA 5F06A 2AUVA 1O85A 4I2TA 4ZILA 1FAAA 2RLIA 2DJ3A 2DSAA 3VWWA 1OYJA 3HA9A 4Q5RA 1RQMA 4MPGA 4JBBA 2YNXA 4JZQA 3IAM2 3JCML 1OC3A 2A2RA 3D5JA 4N11A 2V1MA 4HU9A 1M9AA 4OFNA 2XC2A 2RUFA 1SYRA 2YANA 2VCWA 4BWQA 3VK9A 2VD0A 2KP2A 3PINA 4ZXGA 2LNTA 4KA0A 5G1KA 3FZ4A 4XRDA 1EWXA 1VF1A 3J7Yk 3A2XA 4TXOB 1GL8A 1ERVA 4MABA 4KW6A 3QAWA 4V2NA 4TW5A 1A8LA 1TW9A 1AW9A 3HJPA 1H4OA 2TRXA 1BJXA 4L5OA 3LSZA 1W4VA 3F63A 3C1RA 2HRFA 3KM6A 1KBNA 4BVXA 4HDEA 3PGTA 2TRCP 3CSJA 3EWLA 4ECIA 2YPMA 2FCHA 1SK2A 2VUPA 1WP0A 1NHYA 4K8MA 3Q18A 4MLYA 2C3TA 2KUCA 2IMIA 5A5KA 5FHIA 2ES7A 4IQ1A 4PUAA 3IK7A 2N5BA 2P5QA 3DEXA 2WCIA 1GRXA 1I5GA 4ZIJA 4K7IA 1EEJA 2VL9A 2X8HA 1O7UA 1FB0A 5G5EA 3DXBA 1O73A 3O76A 4IP1A 4KAEA 4WETA 3N5OA 1TKDB 5DAKB 1YEPA 4LA1A 4XS4A 5DQSA 3A3TA 5J3RA 1T4ZA 1OC9B 1E6BA 2GGTA 4POBA 2RUEA 4ACSA 5CRWA 1R4WA 5IO2A 4N30A 1JZRA 1XCCA 5F0GA 17GSA 3GIXA 4KDUA 2LJKA 4EC0A 3RHCA 2REMA 1PKWA 2BTOT 3QCPA 1SKWB 3FZ9A 5EPFA 2WS2A 1AAZA 6GSXA 1K0MA 5G30A 1J0FA 3ZIJA 3TRPA 4NXIA 2LJRA 1QQ2A 3CRUA 3UJ1A 1O81A 3D0ZA 5F8BA 1GSUA 2PWJA 3EYTA 3F3QA 1BQ7A 3QFAC 3QAGA 1TI3A 3TUEA 4RQXA 2OBKA 3H4KA 2H1DA 3HVSA 5EY6A 2N5AA 4FO5A 2C3NA 4K6XA 1T00A 2GS3A 3TJFA 2DJJA 5ELAA 1MD3A 1R5AA 2K9FA 1WPIA 3H79A 2C0GA 4KUNA 5D9VA 4DVCA 3GSSA 4DSRA 2OA7A 3LQ7A 3TB2A 3L4NA 2IWTA 4MH2A 3CYNA 2H6ZA 2VCXA 5IMAA 2F51A 4OD7A 2DJKA 2IL3A 2H72A 3I43A 5A4UA 3PH9A 3DGQA 4OO5A 5COHA 2B1LA 3IAS2 3D6IA 2IMEA 2H70A 5GSSA 1GH2A 19GSA 3H8QA 1VF2A 3RPNA 4IGJA 2C80A 2R3XA 2L4CA 1F3BA 5FT3A 3ERWA 4RUVA 5L71A 2MMZA 3KXOA 3EMPA 3IDVA 1M7TA 4PX1A 5ABRA 3MWHA 1V98A 2FLSA 2YWIA 1M2BA 1SYXA 4E8HA 2LRNA 2E2GA 3UOMA 4IKHA 3J7Yb 1VF4A 4Q5FA 4MJAA 1USBA 1K0CA 2K8VA 3TKQA 1PA3A 2H8LA 2HE3A 4GQFA 1GSSA 4V2MA 1PKZA 5LNKe 4IP6A 1OC9A 2HLSA 2MMOA 1ERTA 3FY7A 5A4VA 3RDWA 4KX4A 1TDIA 4OO4A 1TU7A 2YP6A 1O8WA 1QK8A 5A4WA 5KN0A 4KDYA 1EGRA 2GDRA 4K7OA 1TK8B 1SKSB 2OE1A 1WJKA 2O8VB 2FWGA 1ON4A 2A4VA 3WD6A 1ZYQB 1PSQA 4KSMA 3AY8A 1SD9A 3CBUA 3GH9A 4WXTA 1K0DA 5B7CA 2HSYA 4MCUA 3GL3A 2GSRA 2KP1A 1AXDA 2JZTA 4MDCA 1SD8A 2IMKA 5G31A 2DIYA 1M0UA 1V57A 3KTLA 3MSZA 3I9V2 4HU7A 5DJMA 2H0IA 3MAKA 4MF7A 4POKA 5CAXA 4K2DA 2ZUPA 3E9JB 4IN0A 2E0QA 3EU4A 2ZCTA 3SBCA 1OKDA 2B5XA 3C1SA 1B4PA 2DJ1A 2MBSA 2VLVA 3KJYA 3QDNA 2FY6A 1GSFA 4AF2A 5HFKA 4YQVA 1PD21 2F8FA 1XW9A 3RAZA 5IOXA 5J41A 5F05A 1QXHA 3A2WA 3GKXA 5AIVA 5C00A 3NIVA 3LWAA 3F4SA 2VIMA 1U88A 2GZZA 4ISDA 3GL5A 4ID0A 5J9BA 5IPHA 3TOUA 3KCMA 2F9SA 5FWGA 4MK3A 3M8NA 4PURA 3TRXA 2C1YA 4V1Ag 4WKWA 1OKTA 2HSHA 4KCAA 1PMTA 5IIZA 2LQQA 2FD3A 4O5RA 12GSA 20GSA 3BCKA 1HYUA 1GNWA 3G7YA 1X5DA 3GV1A 5ECPB 1PGTA 4AJ6A 3VWVA 2GQMA 3GMFA 2VL2A 3MDKA 2HI7A 4HI7A 1AQWA 5IMZA 1XOBA 2FHEA 2DIZA 4NHZA 1XWCA 5GSTA 2DJ2A 1TRSA 3H1NA 3PR8A 3OR5A 2R6KA 2FNOA 4HEA2 4JR6A 3HYPA 2L4QA 3KZQA 1X9WB 1S3CA 2V2GA 3ZVJD 2LSTA 1ACVA 3ZTLA 2VCTA 2LS5A 4MJEA 1O6JA 2I81A 3TJKA 3QOUA 1JZDA 1FO5A 5ID2A 1GSEA 4ZL8A 1XWKA 2YN1A 2FGXA 3IRAA 1S3DA 3M0FA 5JWRB 11GSA 1YF0A 4MH3A 2R5GA 4YAPA 4HJ2A 3E0UA 2R4VA 1J08A 2DBCA 7GSSA 1F37A 2H1GA 2PGTA 1ZMAA 3UL3A 3LGCA 1XPVA 4KH7A 4O92A 4WBJA 2B1KA 1F2EA 4FYUA 1SK0A 3IPZA 3RHBA 1TP9A 2C3QA 1C72A 3EURA 4GQCA 2P31A 4ZBAA 1Z6NA 1GUMA 1NSWA 5ECSA 2VL2C 1GULA 1JZOA 1RW1A 2GLRA 2A2SA 5H5QA 22GSA 1CQGA 2MBTA 3US3A 3M9KA 3TKRA 1TU8A 2H01A 2OE3A 2KLXA 5G2ZA 1GNEA 1R26A 1A2LA 3QD9A 5ECQB 2PPTA 5D93A 1B9YC 1AQXA 1GTIA 3APOA 2PMTA 2CA8A 2LV3A 1M2DA 2NPBA 3HY2A 5IM9A 3IA1A 1DUGA 4EVMA 1XVQA 1XW6A 2H71A 4N0ZA 3GX8A 3FR6A 1PX6A 2JSZA 2GSSA 2VO4A 3C73A 5HR3A 3UBLA 3GYKA 2D2ZA 3CSHA 1SKRB 2B7KA 3M9JA 1XZOA 3N9JA 2DJ0A 4MZBA 1G6WA 3IR4A 4JR4A 4F0BA 4MMMA 2CVKA 2IJYA 4TR0A 4GF0A 2HFDA 2IFQA 5AIXA 2K8SA 3LJRA 3WGEA 2GT6A 2VCZA 3GH6A 3RBTA 1U3IA 3P7XA 2I4AA 5GAND 13GSA 2RM5A 2M80A 3QMXA 3HVXA 4Z7XA 2YWOA 3QAVA 2FA4A 3HJOA 3VI5A 1GUHA 3GN3A 4ZBDA 2BMXA 1SJZA 3D22A 3F4TA 2EIOA 2HRNA 2XBIA 2XHFA 1PN9A 2XBQA 3LORA 1DE1A 4GTUA 1K3YA 2LTKA 4TOPA 4NAXA 3VPQA 2FWEA 4EUYA 1WIKA 5INYA 1A0RP 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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