1TTZA

X-ray structure of northeast structural genomics target protein xcr50 from x. campestris
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
75
structure length
75
Chain Sequence
b'ALTLYQRDDCHLCDQAVEALAQARAGAFFSVFIDDDAALESAYGLRVPVLRDPMGRELDWPFDAPRLRAWLDAAP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of Northeast Structural Genomics target protein XcR50 from X. campestris
rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein
source organism Xanthomonas campestris
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 25
structure length 75
sequence length 75
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05768 DUF836 Glutaredoxin-like domain (DUF836)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ttzA00
1SJIA 1G0TA 3HVSA 3EU4A 4MDCA 4OCFA 1ZYQB 3BBYA 3GUSA 1X5EA 2YV7A 2P5RA 4TN8A 4XS4B 1XWCA 2LJAA 1KBNA 1ERTA 3TDGA 3APQA 2IPAA 1G7EA 2MYGA 3FRCA 4EDZA 1Z9HA 1WRYA 2GZPA 5GAPD 2MZCA 5DALA 1YF1A 2C8UA 4KDUA 2MMNA 2Z9SA 4NWYA 2R37A 2H74A 4GWRA 1X9MB 1SL2B 1U3AA 5DJLA 5FHIA 2VD1A 1BQ7A 4G9HA 2LTKA 17GSA 2VUPA 4OMVA 4BL7A 3GFKA 3ERWA 1M0UA 4G2EA 3FHKA 4EL1A 2HE3A 4XRAA 4TR1B 3J7Yb 1K0DA 2YZUA 3RDWA 2P0GA 4GF0A 1X9SB 5LD0A 5H5RA 1A2JA 5CP1A 2WZ9A 2EIOA 3O3TA 3U6VA 2WFCA 1W89A 1JZDA 3P7XA 1PD21 4NMUA 5DQYA 3WD6A 1OC9A 1BAYA 1U88A 3UAPA 2E7PA 4RQRA 6GSVA 1Z3EA 4RQXA 2CVDA 4Q5FA 2H01A 3L4NA 4IBPA 4K0GA 1B48A 4Q5NA 2P5QA 1U6TA 4OFTA 2FUG2 2VCXA 3WT2A 3VURA 1SKSB 5F0GA 2DJKA 3AY8A 4KAEA 1OYJA 2AJQB 1GL8A 4F9ZA 1M7TA 2FLSA 3W8SA 1GP1A 2IWTA 1SJZA 6GSWA 3FZAA 5DCGA 1TU7A 2C0GA 5INYA 5IPHA 1HNCA 5ECRB 12GSA 3UMAA 1TW9A 5D96A 2DC5A 4ZIJA 3GSTA 5IM9A 3ZFLA 3LQ7A 4AGSA 1X0RA 3QDNA 1TRVA 5COHA 5DVBA 4JBBA 4PQIA 4HI7A 1KEBA 1XXUA 1YF0A 1HYUA 3MSZA 4J57E 4JR6A 3LFLA 3RPPA 4K7OA 2LQQA 3KMNA 2GS3A 3M8NA 3D0ZA 3PH9A 3H79A 1XWGA 1XW5A 1MTCA 3GA4A 4V1Ag 1OKDA 2N5FA 3KCMA 2IMIA 3TJFA 5G5FA 3MNGA 2AHEA 2V1MA 1O7UA 2CQ9A 3VWXA 4GSTA 1X9WB 2R2JA 3L0HA 2GQLA 2RIIA 4XRDA 3US3A 4KCAA 4ZBDA 2YPMA 5FT3A 3TKQA 2O87A 2DJ1A 1SENA 1PGTA 2L5OA 3EURA 2FWGA 3EMXA 2FNOA 2VM1A 1SL0B 3S9FA 2H6XA 1PL1A 1DE1A 2OE3A 1C72A 1XW6A 4XS4A 2YOIA 3EVIA 5GZZB 1YJ6A 2AB6A 2GLRA 5JCGA 2EC4A 4ZB6A 1F9MA 1I5GA 3TCOA 1A2MA 1E6BA 2WS2A 3D5JA 4E8HA 1W4VA 3G7JA 4LMVA 4ACSA 1GLQA 1J0FA 4AJ7A 2YWIA 1WWJA 4I6XA 5IMVA 2LQOA 3E9JB 3EMPA 3P90A 3GRXA 1FO5A 5CREA 3DD3A 5HR0A 5B8AA 2H1DA 3LYKA 1ST9A 2JL4A 2JSYA 4ULXA 3FR3A 3A5WA 2TRXA 4TR1A 4X43A 2H72A 1EV4A 2OBIA 1SK2A 1TOFA 3EINA 3APSA 5E4WA 1GUMA 3F4SA 3UBKA 4WETA 4JZQA 2GSQA 2V6OA 3L9VA 1ML6A 3F6DA 1BEDA 2H66A 3HYPA 1DSBA 3RAZA 2C3QA 1OE7A 3K8NA 5J41A 3V1WA 4POBA 4CHSA 2AV4A 4KSOA 2DIYA 5IMZA 3TJJA 3NZNA 4LA1A 1K0AA 4PUFC 1DBYA 1N2AA 5DCHA 1H4OA 4TXVA 1GWCA 1XW9A 3I6AA 1XZOA 1HNAA 5LCZA 4MJEA 2DSAA 5IMCA 4MZBA 2DMLA 4MCUA 1YKCA 4KH7A 4WBRD 1BJXA 3KP8A 4AF2A 4MJCA 3QCPA 2NVLA 1VRSD 3VWUA 1K0NA 1KTEA 1EGOA 2B6MA 1WMJA 3ZLPA 4E8EA 2A2RA 2F9SA 1QGVA 1ACVA 1EP7A 1XWAA 3KGKA 2FD3A 4ZB8A 4Q5QA 3DYRA 5ECPB 3H8QA 2ON7A 3GH6A 1DUGA 4MF6A 2GSSA 1TKDB 3NIVA 3Q74A 1RQMA 4CW9A 2JACA 1YY7A 3QFAC 2FCHA 4MZWA 4IP1A 3ZVJD 1UA5A 4MABA 2IJYA 2XBQA 1B4QA 2G2QA 2LRNA 2YP6A 2B5EA 4OFNA 4HU9A 1ERUA 4GRFA 2M46A 4JE1A 3RPNA 1YEXA 2HNLA 4MP4A 4BPYA 1VF1A 2LEGA 5J9CA 2DIZA 1XWBA 3ED3A 10GSA 2K8VA 5IOXA 1A8YA 2X64A 2L6CA 3KTBA 1UN2A 5D9VA 4L0UA 4YAPA 2I81A 2V2GA 5ECNB 2X8GA 2VL3A 1GSUA 3HD5A 5C04A 5KEJA 5G30A 4YQUA 1T1VA 3VI7A 3TKSA 1V58A 3JCML 3EC3A 4TRXA 3TB2A 3A2XA 2FA8A 4L5OA 1URMA 4MPGA 2E2MA 1OKTA 1EV9A 2YANA 3I69A 3IXRA 2B7KA 3QD9A 5CRGA 3Q18A 2PUKC 3HVVA 4OCEA 1O85A 5DAKB 3TJGA 4KDXA 3CRTA 3DXBA 1A0FA 4TXOB 2FA4A 6GSYA 2AUVA 3F6FA 4FO5A 1SK1A 5G31A 1K0OA 2FWFA 3LSZA 1USBA 2YWNA 4JRRA 1V2AA 4EKZA 1T4YA 3LGCA 4YH2A 2YZHA 3E3EA 4KX4A 2VLUA 2IMDA 5G2ZA 3C1RA 2VLVA 2GT6A 5D8IA 2L5LA 3H4KA 1AQWA 3DVXA 4ECJA 1EWXA 2H76A 4TR3A 5JWQB 3MWHA 2GQMA 4HUAA 1SK0A 4FH8A 1JHBA 5DJMA 4PQHA 4K2DA 2C0DA 2YJHA 3KM6A 4IQAA 3A2WA 1GUHA 2KP1A 1JFUA 2V32A 2XPDA 7GSSA 2KUCA 5KN0A 4LLRA 2RUEA 1AW9A 1A23A 2LJKA 3GMFA 4FYBA 3P8WA 2H1BA 3TKPA 2R4VA 5AISA 2QGVA 4KB3A 1GSQA 4WR4A 1THXA 2RM5A 1JZRA 3QAWA 1DE2A 4XS1A 2F3MA 3D4TA 3HCZA 3TJBA 4MJBA 4FYCA 4YAVA 2H0IA 2XBIA 5ECSA 2RUFA 1XPVA 4TW5A 2JU5A 1GH2A 2B3SA 3CTGA 2FY6A 2K8SA 5E59A 1FVJA 2H8LA 3TKSC 1ZOFA 2YJ7A 2IMEA 3GL3A 3FY7A 4GCIA 2I4AA 2FWEA 4EUYA 4TKYA 1JZOA 3ZREA 3M3MA 2HRFA 3UEMA 3G7YA 3IBHA 3FZ5A 3QOUA 2WRTA 1GSDA 2ZUPA 5B6MA 4HZ4A 2LV3A 3D22A 5F05A 3GKKA 1PN9A 1B9YC 3M1GA 1M99A 4DSRA 20GSA 1XOAA 2XC2A 2YWMA 1ON4A 1NW2A 2PWJA 4ZILA 3BCKA 2DJ3A 4PNGA 1GSFA 4F82A 4FIWA 2PVOC 2MBSA 1N8JA 1T3BA 3WGXA 3EE2A 4I8BA 5ID2B 2J9HA 4XCSA 4NHZA 2WB9A 2CVKA 3UBLA 4J56E 3KD0A 1SU9A 1MEKA 3QPMA 3DWVA 2LRTA 2L59A 5DAKA 2JSZA 1FB6A 1Z7PA 3LORA 3BD2A 5KN3A 2GDRA 4TXOA 4EDYA 3NOFA 13GSA 1V57A 3KEBA 2MBTA 1F3BA 1AC1A 5AN1A 4WF4A 2DMMA 1G7OA 2NBSA 4ML6A 1XBSA 3HZ8A 1I9DA 4PNFA 1Z7RA 5DDLA 3KH9A 5ELGA 6GSSA 1FAAA 4ECIA 4MLYA 4K6XA 1H75A 1GLPA 3UVHA 4GSNA 4BWQA 1G6YA 2MMOA 5CAXA 2OJLA 4ILFA 2LNTA 2J23A 1PKZA 1ZZYA 3HVXA 5ECQB 3P2AA 1K0BA 1TK5B 2X8HA 1R5PA 2HYXA 1FHEA 3G9BA 4HQSA 1ZGNA 2ES7A 5LNKe 4QL9A 6GSUA 3VWVA 2G0FA 4KE3A 2H0GA 3ZMKA 2VAFA 3IE3A 5JCUA 3CTFA 3R2QA 1B4PA 2LKUA 1V98A 2YNXA 5D9WA 1T00A 3KZQA 4OFMA 2I9HA 3HXSA 1VGLA 1GSEA 4MF7A 1Z6MA 2OA7A 3C1SA 4ZL9A 3IDVA 4GTUA 1GNWA 4ZBBA 4NV5A 5ELAA 4MMMA 3F4TA 2DJJA 2HZEB 1PRXA 4NV2A 3DGQA 3RBTA 2V6KA 3SWLA 3D21A 2OE1A 4HU7A 2IIYA 2GZZA 1ABAA 1CQGA 1RW1A 4I2UA 4L5LA 5D93A 3IAS2 16GSA 2PMTA 3DMLA 5A5KA 4YQMA 2A4VA 4AJ8A 1FVKA 22GSA 2AYTA 4GQCA 3FEUA 4H86A 4IJ3A 1BYEA 1EOGA 5IPGA 3ZITA 3FR9A 3E0UA 5AGYA 4J2FA 2H70A 4LL1B 4ECBA 3GKMA 2OBKA 1SD8A 4JR4A 2WGRA 3APOA 2O7KA 1NHYA 3CSIA 3HJOA 3IRAA 1VF4A 3GTUB 3J7Yk 3KMOA 3FZ9A 1O73A 4CDOA 4F0BA 4IELA 3QAGA 1TI1A 1A24A 5ID2A 1M2BA 5IMDA 6GSTA 5IO0A 3FKFA 5KN2A 1T8EB 4RI6A 4Z7XA 5DQSA 2IL3A 2MMAA 2DJ0A 4HS1A 3ZTLA 4O32A 2CZ2A 2F8FA 1K0CA 4PGTA 4KNDA 4MH2A 3Q6OA 1JLVA 1AIUA 1ZCPA 3F4RA 4N0ZA 4F0CA 4GXZA 1F3AA 4JU5A 3C71A 3HHVA 3M9JA 3UJ1A 4EE0A 2PGTA 2XHFA 2X99A 3HA9A 5CRWA 4F03A 3D4MA 4KUNA 5HFKA 2CVBA 3DIEA 2R5GA 1OAZA 4DSSB 5ECOB 1SJ6A 3IPZA 2YN1A 4HOJA 5JCWA 1U87A 4OWYA 1TI3A 2C0EA 3N5OA 4MZCA 5ECKB 3ZFBA 1R26A 5DALB 3M0FA 5H5QA 4ZBAA 2GSTA 2HI7A 1GSSA 3MAKA 4DEJA 18GSA 5L71A 4IKHA 1JZWA 1GSYA 4TR4A 1BG5A 5A4WA 1TTZA 1TRSA 4P3YB 1F6MC 1LBKA 2B7JA 1M2DA 2H75A 4POKA 1MD3A 4KGIA 2M72A 5HQPA 2XPEA 4DVCA 3CYNA 3PR8A 1XCCA 3H93A 4EXJA 1ERVA 1PX7A 3F9UA 4HEA2 1XVWA 4KDYA 5F06A 1T7PB 4GQFA 5H5SA 1Z5YE 4IW9A 4IVFA 4WXTA 5HFGA 2HZEA 2LUSA 3MDKA 2C0FA 3DEXA 3M9KA 1PL2A 3ZYWA 2LJRA 2GGTA 2WCIA 1O6JA 2L4QA 1OC9B 4IJIA 1QQ2A 4PURA 2CA8A 5CYYA 2KHPA 5J5NA 4KSMA 2L57A 3LEFA 3ZL5A 2LNSA 2H0HA 3LXTA 2O85A 3ZIJA 2CAIA 5F8BA 3VPTA 1SD9A 3ERFA 2I1UA 1J9BA 3IR4A 2VCQA 3A3TA 4IQ1A 1MDKA 4EC0A 1TXXA 3SBCA 1TRWA 3UVTA 3DVWA 3GTUA 4ISDA 4TOPA 1QUWA 1WPIA 1QFNA 1GTIA 2JZRA 1TU8A 2O89A 4MPFA 1AQXA 5HR2A 3LWAA 4KCEA 1B8XA 2NDOA 1QK8A 3N9JA 5HR1A 1UVZA 2VLTA 3UL3A 4BA7A 4HZ2A 3GKXA 3BOAA 3EWLA 2R6KA 2VO4A 1QMVA 3TKSE 4KA0A 2FHEA 1GTUA 1PA3A 2TRCP 1SKRB 3UARA 1TDIA 1MD4A 4JEDA 3CMIA 2WDUA 3KIJA 19GSA 4OO4A 2BTOT 1CQHA 5A4UA 3H1NA 3ZIVA 2VL2A 3VFIA 2DJ2A 3KH7A 2OE0A 3DKSA 3WYWA 3GH9A 1R5AA 5IO2A 1M9AA 4O7HA 4DSSA 3LJRA 3KP9A 4EF0A 2N5AA 5ECIB 1U3IA 2CX3A 5CRHA 4G10A 4ZXGA 3G7IA 2M80A 3D6IA 1S3DA 2VCTA 3C73A 2REMA 2NPBA 3VLNA 2L4CA 1AXDA 1OC3A 3IK9A 5G1LA 2H19A 1AQVA 3FZ4A 1R7HA 1IYHA 2E2GA 2H73A 3A2VA 5G5EA 2C1YA 1EEJA 4N0VA 3GNJA 2RM6A 1ILOA 4V2LA 8GSSA 4HJMA 1HQOA 2DBCA 2HSYA 2OKAA 3L9SA 3TOTA 3LXZA 2H6ZA 4HJ2A 3IK7A 4V1Ap 4ML1A 3CXGA 2P31A 3GURA 2K6VA 4XHMA 2PVQA 2OADA 1QXHA 3PINA 2ON5A 3KJYA 2GZYA 1AUCA 1K3YA 2FWHA 3CSJA 3GX8A 2HSHA 1BX9A 2HXKA 2KOKA 3I9V2 1LJRA 2A2SA 5GAND 1Y25A 4N11A 2PPTA 1PKWA 4X0XA 2BMXA 3F63A 3GN3A 1GTAA 3L78A 1O8WA 4PUAA 4BWSA 3IC4A 2F51A 4K9ZA 5D9TA 2N5BA 1A0RP 4NAXA 2QC7A 2CT6A 2C80A 3W8JA 2VL2C 2DLXA 2YCDA 5IMAA 1PSQA 3ME8A 5B8BA 3ME7A 2QSIA 2F8AA 3CRUA 1MDJA 3F0IA 1V40A 3CBUA 3IA1A 9GSSA 1XOBA 2H30A 4XTSA 1MDIA 5IIZA 3GL5A 1YKAA 3GHAA 4LMWA 2GQKA 4Q5RA 2YWOA 2KP2A 1O81A 1B9XC 1YEPA 3WGDA 4L8EA 2AAWA 3TRQA 2L6DA 1FG4A 2VL9A 4IGJA 4K1FA 3KXOA 4I2TA 1FW1A 1NHOA 3GIXA 2LSTA 2E0QA 1ERWA 1M2AA 1GUKA 4EVMA 11GSA 1OVNA 2JZSA 2C3TA 3TOUA 1XVQA 2HT9A 4WEYA 1AAZA 3L9UA 1F37A 1ZMAA 4HDEA 2GTUA 4K7IA 4XS6A 2K9FA 1GRXA 2PBJA 4POLA 1A2LA 4ECCA 5CRDA 4TR0A 4RI7A 4IP6A 1OE8A 2ALBA 4YQVA 1NSWA 3QR6A 5IQYA 1ZL9A 2NTOA 3QAVA 3HJPA 4L0WA 5J3RA 4POMA 2R3XA 4ZB9A 2WJUA 3IAM2 3F8UA 1EGRA 5B7CA 1F2EA 1WJKA 3HZ4A 1RK4A 5B6NA 2D2ZA 3HJMA 3EU3A 2O8VB 1FB0A 4NXIA 2IMFA 3O6TA 4I97A 3RHCA 2V41A 5CNWA 4V2NA 3C7MA 4QQ7A 3IV4A 3BCIA 5GSTA 4WKWA 3OR5A 5J4UA 4WR5A 1VF2A 3LYPA 3IOSA 5G1KA 3Q19A 3TUEA 1XFLA 3I43A 5EL8A 1TRUA 1GNEA 2B5XA 4ID0A 1JLWA 1TJDA 2CAQA 1SL1B 1PX6A 2ZNMA 3TKRA 1SKWB 3TRPA 2H1AA 4BVXA 3TGZA 2JZTA 2MMZA 2KLXA 3CSHA 3ZRDA 1Q4JA 5JWRB 2GT5A 4PQ1A 2C4JA 4O92A 3HKRA 3VWWA 2B1LA 4WF5A 2CZ3A 5JWOB 1Z6NA 1EEMA 1WOUA 3PGTA 4MJAA 3W6GA 1LU4A 1K0MA 3FW2A 1THOA 4V2MA 2I3YA 4LL4B 4MK3A 2HFDA 2IFQB 2VCWA 4HQZA 4K7NA 1M9BA 4ZL8A 1PQNA 1TP9A 5EPFA 2LRCA 1VF3A 3FK8A 4K8MA 4D73B 3KTLA 3ERGA 4GSSA 3EYTA 3U5RE 3DRNA 5C00A 4GLTA 1TK0B 3VK9A 5ABRA 4IN0A 2QKEA 3RHBA 1X5CA 3WT1A 4G19A 5AIVA 2RLIA 4IHUA 1WE0A 1OC8A 4MA9A 3ZMLA 1TK8B 1G6WA 3IHQA 4PX1A 5F07A 1EOHA 5DBQA 3LG6A 1KNGA 1XIYA 1WIKA 2ZCTA 5ECMB 4BVYA 3VPQA 2VCVA 4RUVA 4N30A 3UIWA 1O8XA 1GTBA 4X1UA 1V9WA 1EP8A 1K3LA 2EIRA 1S3CA 1T4ZA 2H71A 4F2IA 2PN8A 2PERA 2TIRA 1SYRA 1FOVA 1YDKA 1NM3A 3TRXA 1XWKA 3F3RA 5J9BA 3WGEA 2CV4A 2C3NA 5D73A 2VD0A 2LS5A 5EVOA 4IS0A 4I5QA 4OD7A 14GSA 2BJXA 2H1GA 2K18A 4NPBA 1S3AA 3GV1A 3UOMA 1K3OA 1YQ1A 2GVPA 3VI5A 4NHWA 2IMKA 5ECLB 3O76A 5IOWA 4O5RA 1UC7A 3GYKA 4MH3A 3FYGA 3F3QA 5KN1A 2H6YA 2GSRA 2HRNA 5FWGA 1HNBA 3GKNA 5CO3A 5EY6A 3HY2A 4FYUA 1YZXA 2JADA 2OACA 3ZZXA 1SYXA 2PU9C 2B5YA 5A4VA 3C8EA 3GSSA 4DSQA 3HDCA 1ZYEA 5GSSA 3GX0A 4N10A 2VOCA 2WULA 1X5DA 1HD2A 3TJKA 1IYIA 2YV9A 3FR6A 1J08A 3BJ5A 2VM2A 4XIHA 1WP0A 2B1KA 5HR3A 1A8LA 1Q98A 5HFIA 1EZKA 3QFBC 2IN3A 2FGXA 2VCZA 2HLSA 5ECHB 4MF5A 1R4WA 4KW6A 3ZVJA 3QMXA 1Y6EA 5D9XA 6GSXA 4TVEA 4EO3A 2IFQA 4PXOA 1E2YA 2HZFA 5IMFA 4K0NA 2EIQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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