1TTZA

X-ray structure of northeast structural genomics target protein xcr50 from x. campestris
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
75
structure length
75
Chain Sequence
ALTLYQRDDCHLCDQAVEALAQARAGAFFSVFIDDDAALESAYGLRVPVLRDPMGRELDWPFDAPRLRAWLDAAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of Northeast Structural Genomics target protein XcR50 from X. campestris
rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Xanthomonas campestris
total genus 25
structure length 75
sequence length 75
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05768 DUF836 Glutaredoxin-like domain (DUF836)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ttzA00
4MZWA 1ZZYA 4POMA 1B9YC 3BJ5A 3EE2A 2AB6A 3DRNA 2JZTA 3A2XA 4EUYA 1OVNA 4MPGA 1B48A 1FB6A 4MK3A 4TR0A 1JLVA 5IMCA 3ERGA 3GA4A 3VFIA 3TKPA 3IA1A 1GTAA 1EV9A 4ZBBA 1WWJA 3ERFA 2MMZA 1F37A 4KA0A 5G2ZA 4QL9A 5HR2A 3CTFA 2PUKC 3UIWA 5A4WA 5G5EA 2EIOA 1YF0A 4OFMA 1B8XA 5CO3A 1K0NA 2MBSA 2FHEA 1BJXA 1XVQA 3ZFBA 3O3TA 3WGXA 1J0FA 4HEA2 3HA9A 1QUWA 5CYYA 1PL1A 4RI6A 1EZKA 2PN8A 3TUEA 4TXOB 2K9FA 2LJKA 1TU8A 3WT1A 3EMXA 5AIVA 1ST9A 2VIMA 3ME8A 3EVIA 5LNKe 2PERA 3DXBA 3QAGA 4AJ6A 1OC8A 3F6DA 1ILOA 1T4YA 5AIXA 1UVZA 1GRXA 3ZVJD 5C00A 3TJBA 2V32A 5KN1A 1W89A 4KX4A 5ID2A 1NW2A 1VF4A 4N0ZA 4OMVA 4IGJA 1C72A 3A2VA 5F07A 1AQWA 3N5OA 1T00A 5IM9A 2DJJA 2AYTA 2LEGA 3CSJA 2YCDA 1TRSA 2N5BA 2YOIA 4TR4A 4MLYA 4GSTA 4NWYA 2MZCA 1V2AA 3DGQA 3LQ7A 2V1MA 3FZ5A 4K0NA 3APQA 4ULXA 2GLRA 3NIVA 3ZRDA 4N0VA 1GTBA 1BX9A 4KDXA 2VL9A 5CREA 1X5CA 2GZPA 4OFNA 4OO4A 1JZWA 4IP1A 1WOUA 3C71A 3BD2A 3C1RA 1ZGNA 4OO5A 6GSTA 5GZZB 4IKHA 1ZYQB 4L8EA 1HD2A 2A4VA 3FHKA 1TI1A 2XPEA 3O6TA 4KGIA 2XBQA 2G0FA 2H74A 3M0FA 2A2RA 2VD0A 4I97A 1GUMA 3CSIA 5ABRA 2FWEA 2REMA 1SK0A 2C3QA 2DMLA 3P7XA 1WE0A 1UA5A 3IRAA 1NM3A 4EC0A 5JWOB 3KCMA 3F3RA 2LKUA 1JZRA 3ME7A 3HCZA 2GQLA 1TJDA 4GRFA 3L78A 1TK0B 4ISDA 5ECSA 4MMMA 1ERWA 2B1LA 6GSYA 3U5RE 1YEPA 4RQRA 1TI3A 4TXOA 2IWTA 1ABAA 3CRUA 3IDVA 12GSA 5INYA 1BYEA 2OE0A 3QDNA 2H6ZA 6GSVA 4L0UA 3TKSC 4F82A 5HFGA 2VCTA 2FA8A 4KDUA 4EXJA 3TCOA 2YZHA 4EO3A 3DMLA 4OD7A 2I1UA 4ECCA 2KHPA 4HUAA 10GSA 2B5XA 3GX0A 3ZZXA 1K0CA 3VWUA 5HR1A 3LEFA 3IE3A 1A0RP 2WULA 3KXOA 3BOAA 4K8MA 3Q6OA 5E59A 1B4QA 1TRUA 2B6MA 4WKWA 1O8XA 4HU7A 3AY8A 4HQZA 3VI7A 1URMA 2H30A 4K2DA 4YQUA 5CAXA 5J9CA 3F4SA 1S3AA 3TRQA 1ZCPA 2CAIA 4X0XA 1EGOA 3UBLA 4XS4B 1XWCA 1GLPA 2OACA 4KB3A 2WZ9A 2NTOA 2YN1A 4IQ1A 3EINA 5IMVA 2K6VA 2OADA 5IPHA 4LA1A 3LWAA 2CVKA 3VK9A 2GS3A 1F2EA 3W8SA 4FYBA 3BCKA 1EOHA 1UN2A 2GZZA 3CBUA 2C0FA 2EIRA 4NXIA 3UEMA 1XOAA 1OKDA 1SJIA 1O85A 3TJGA 1MEKA 2GQMA 1IYIA 1O73A 3ZFLA 1K0OA 3LXZA 1EOGA 5JCGA 1XWBA 2IMKA 1ERVA 4L5OA 1GSEA 4EL1A 4V2NA 14GSA 2MMNA 2VL3A 5KN3A 1GSQA 2PPTA 2CA8A 1PGTA 3FKFA 4NPBA 5CRWA 1OE8A 4PQIA 3IAM2 5ECIB 3QD9A 1TXXA 3K8NA 5FT3A 4ACSA 2GT5A 3RDWA 3EMPA 4O32A 1GSDA 5HR3A 2CVDA 2WCIA 4DSSB 1K0BA 1QMVA 5F0GA 4BWSA 2E0QA 2LNSA 3IV4A 3QAVA 1G6WA 5FHIA 2H0HA 4NAXA 3J7Yk 3FZ4A 1OAZA 2I4AA 2HZEB 2DSAA 3VWWA 3TOUA 3NOFA 2F51A 2C1YA 1EEJA 1XOBA 2H19A 3W8JA 1AQVA 4JEDA 4AJ7A 1R5AA 2CX4A 1XXUA 2YV9A 3IPZA 2FD3A 4KCAA 2YWIA 1VF3A 3KEBA 4E8EA 4JZQA 3LYPA 2HT9A 1XVWA 4IN0A 4GCIA 4K7IA 5ECNB 1HNAA 5ELAA 3WGDA 1FO5A 4XS4A 1T3BA 2L4QA 4K0GA 4TRXA 2VM1A 2O7KA 3CMIA 4HS1A 2N5AA 3ED3A 5DQYA 5A4UA 4JRRA 2QGVA 3PINA 4I2TA 2KP1A 1NHOA 1R4WA 4KW6A 2YNXA 2XC2A 2X8GA 3GL3A 2PWJA 1R5PA 2OBKA 4YAPA 4I2UA 1PL2A 4F0BA 2TRCP 1Q98A 3ZMLA 2VL2C 2OE1A 4KDYA 4GTUA 3MDKA 4XCSA 5ECQB 2E7PA 4K9ZA 5IMAA 3F63A 4CW9A 2L59A 5F8BA 3L9SA 2MMOA 4XHMA 1BEDA 1LBKA 2H73A 2IPAA 5HQPA 1DSBA 1THXA 3QFBC 3L9VA 3LFLA 2DIYA 4POBA 2IMFA 2M80A 3KH9A 1F3BA 1YDKA 2YV7A 3RHBA 4DSSA 1Z6MA 2FA4A 1EGRA 1FVKA 1B4PA 5IMFA 5D8IA 7GSSA 5G30A 4MJAA 3MAKA 2I81A 5IOXA 6GSXA 3C8EA 2IIYA 2H0GA 5ECOB 4KH7A 3F4RA 4BPYA 1RQMA 3L4NA 1MDKA 3QAWA 1SKRB 5CRGA 3IK7A 3KP9A 4G9HA 5GSSA 3P90A 2X8HA 5H5RA 1SK1A 2RUFA 1RW1A 1PQNA 17GSA 1XPVA 1S3DA 1RK4A 3DEXA 4GSSA 1K3LA 3MSZA 2JZRA 1ERUA 1MDJA 2P5QA 3FY7A 4IHUA 5G31A 3ZMKA 1VGLA 3TKQA 2LRTA 4EE0A 1M9BA 3D5JA 1MDIA 2H70A 1V40A 2CX3A 3KGKA 3M9JA 4MF5A 5B8AA 3LYKA 1M2AA 3RPPA 3RPNA 2RUEA 1IYHA 3UVHA 3GX8A 4WBJA 3LJRA 5DAKB 1WIKA 4HOJA 4ZXGA 4WR4A 4XS6A 5KN0A 2BJXA 4BWQA 5ECKB 3EURA 4F0CA 3BBYA 4AJ8A 3HJOA 3TKRA 1TP9A 4PXOA 3HZ4A 1GH2A 1TK8B 3ERWA 3KH7A 3MNGA 4KCEA 2X99A 5J4UA 2VM2A 1J9BA 2KUCA 4WETA 1JZOA 2VL2A 3KMNA 4OFTA 1GULA 4Q5RA 3ZL5A 2B3SA 4HI7A 1XBSA 4BL7A 1OE7A 3UARA 4XS1A 3C7MA 2IMEA 3H79A 2DJ0A 3FZAA 2Z9SA 2I9HA 5DQSA 1V9WA 5H5SA 2ON5A 5AGYA 4NHZA 4PUFC 3V1WA 3KZQA 4YH2A 3VLNA 5ECPB 3HKRA 1AAZA 2OBIA 1Z3EA 1GSFA 2CQ9A 1FB0A 4IELA 1EP8A 4DEJA 5IO0A 5IIZA 1SJ6A 3G7YA 2ES7A 3HZ8A 3VWXA 1X9WB 4O92A 2WJUA 2JU5A 5HFIA 4NHWA 2HNLA 1LJRA 2F8AA 1GNWA 3QR6A 4RQXA 1GWCA 3D21A 1GNEA 5LCZA 5L71A 2E2MA 1AXDA 2AHEA 1YQ1A 4MH2A 4F9ZA 1AUCA 3PH9A 5IQYA 2YZUA 3ZLPA 2XHFA 3EU3A 3F3QA 2M46A 4IW9A 3L9UA 5EPFA 4DVCA 1LU4A 2GZYA 4XIHA 5IO2A 4HU9A 2DJ3A 1AIUA 2AV4A 2OA7A 5GAPD 5EL8A 5D9WA 3DYRA 2VUPA 3HYPA 4ZB6A 1ON4A 5DAKA 1CQHA 3GH6A 1VRSD 1VF2A 4GQCA 3Q19A 1PX6A 1M2DA 1BAYA 1GUKA 4Q5FA 1TW9A 2PVQA 1Q4JA 4JBBA 4QL7A 3UVTA 2BTOT 3HVSA 2V2GA 4JE1A 3QMXA 2IN3A 3VWVA 5HFKA 1A8LA 1A2MA 2LRCA 2K18A 2X8CA 4KSMA 2HLSA 5DBQA 2B1KA 1GSYA 4MP4A 2GQKA 5DCGA 4GWRA 4N11A 3CRTA 2ZCTA 4N10A 4PQHA 3U6VA 4ZL7A 4J57E 3HDCA 2JACA 4L5LA 4ZBAA 3GKMA 2LS5A 2VCVA 1XW5A 1JFUA 1YZXA 2YJHA 4Q5NA 3E9JB 3A5WA 2FWFA 3IBHA 4YQMA 1H75A 4PQ1A 3US3A 4V1Ap 3MWHA 4L0WA 5B6NA 2VLVA 2R3XA 5A4VA 3DVWA 4WXTA 3GUSA 1T1VA 2R4VA 5IPGA 4OCEA 2C0EA 2NDOA 1WPIA 1XIYA 1XWKA 1OKTA 5ENUA 3J7Yb 5G1KA 2GTUA 3HHVA 4MF7A 3HVVA 4FYCA 4PURA 1F9MA 22GSA 4MH3A 3E3EA 3A3TA 3M1GA 2GSTA 4G19A 2DLXA 1E2YA 1QK8A 4V1Ag 3CTGA 1DE2A 5CP1A 3M8NA 3LORA 2PGTA 4I5QA 3PR8A 4K6XA 3ZIVA 3VPTA 1FG4A 5IMZA 2KP2A 1X9SB 1XZOA 3GKNA 4ILFA 2VCQA 6GSWA 2LV3A 1M7TA 1MD4A 4F2IA 3TKSE 4V2MA 3KTBA 2YJ7A 4E8HA 1SL2B 3IXRA 4DSQA 1GUHA 1FHEA 1G6YA 4TVEA 2J9HA 5D93A 1KNGA 2M72A 2PBJA 3RAZA 2YPMA 3S9FA 4I6XA 4JU5A 3P2AA 1WMJA 5CRDA 1A8YA 2V6KA 1PA3A 3ZVJA 2NVLA 4D73A 2R5GA 4PUAA 1Z9HA 5F06A 4MJCA 3FW2A 2RM6A 3H93A 1Y6EA 3D4MA 1WJKA 2ZUPA 1G0TA 1Z7RA 2FNOA 4LL1B 3CSHA 3TJKA 2L6DA 1A2JA 4G2EA 3GMFA 4K7OA 2GDRA 3L0HA 1ERTA 1EV4A 2H0IA 4KUNA 4FH8A 5AISA 6GSUA 4MA9A 3Q18A 2O8VB 2GGTA 1SYRA 4YQVA 2AAWA 2F8FA 3FRCA 2LJRA 4WF4A 4XRAA 4DSRA 1O81A 4EDYA 4GQFA 3GHAA 3KIJA 2CV4A 3UJ1A 3FYGA 5D73A 1DE1A 5G1LA 2JZSA 1NHYA 1YJ6A 3RBTA 2YWOA 1VF1A 2ZNMA 1XW6A 4MZBA 5E4WA 4ECIA 2DJ2A 2L6CA 3GTUA 2H6YA 4POLA 2TRXA 1SD8A 2H1GA 3SBCA 1SKWB 2IJYA 1K0MA 4XRDA 4MDCA 3DWVA 4ECBA 5GAND 2PU9C 3GIXA 2MMAA 3KM6A 1PD21 4GLTA 3CYNA 4TXVA 2RLIA 4CDOA 2YWNA 3G7IA 5IOWA 1GL8A 2EC4A 1SJZA 4O5RA 1W4VA 4PNGA 1WP0A 1I5GA 4BVYA 3OR5A 1NSWA 2P31A 3M3MA 3WGEA 6GSSA 1THOA 4X1UA 2L4CA 4FO5A 3F9UA 4TKYA 1SL1B 3KTLA 3KJYA 3D22A 2IMDA 1PKZA 2LJAA 4TOPA 2VLTA 3GURA 3ISOA 2VLUA 1XFLA 3GSTA 1M99A 4JR4A 5CNWA 4TR1B 1ZYEA 1KEBA 1HNBA 3IR4A 2KOKA 2O89A 4HZ2A 2HSHA 2JL4A 3KMOA 3FZ9A 5DJLA 2LTKA 2LSTA 1AW9A 4IS0A 1U88A 1TRWA 2C4JA 1E6BA 3BCIA 5D9XA 1FOVA 4IJ3A 4MABA 2O87A 4TR3A 2FCHA 1ZMAA 2WRTA 1X0RA 1Z5YE 3G9BA 2H01A 5H5QA 3LG6A 5IMDA 1A23A 3GH9A 4ZB9A 2B5YA 18GSA 1GSSA 4GF0A 4BVXA 3FR9A 3ZIJA 3HXSA 3C1SA 1U3IA 3TOTA 2FWGA 2H71A 4ECJA 1SK2A 4KSOA 1R7HA 2JADA 4EDZA 4IP6A 3VPQA 4EKZA 4ID0A 4J2FA 1TRVA 4KE3A 2VO4A 2HXKA 4IVFA 1XWGA 2JSYA 3A2WA 1TOFA 1AQXA 1HYUA 3WD6A 2E2GA 2KLXA 1DBYA 1CQGA 3VURA 1AC1A 3HD5A 1Z6NA 1SKSB 2OJLA 4HQSA 4HZ4A 3H1NA 1U87A 2HFDA 3SWLA 5F05A 1SD9A 2HZFA 1YF1A 13GSA 2G2QA 2L57A 4ZB8A 2IL3A 3R2QA 4K7NA 1A0FA 3TGZA 4K1FA 1J08A 4Q5QA 3IAS2 5D96A 3QFAC 1ACVA 3WT2A 1PX7A 4G10A 8GSSA 1HQOA 4P3YB 1GTIA 2QC7A 3EU4A 2D2ZA 2YANA 4LMVA 1X5EA 2H8LA 5J3RA 2HI7A 1SU9A 5G5FA 3HJPA 2GSSA 5ELGA 3E0UA 3I9V2 4TR1A 3IK9A 2K8VA 1ZOFA 3F4TA 1ZL9A 3H4KA 3FR3A 2FLSA 5COHA 4X43A 4KAEA 3W6GA 1GP1A 2N5FA 3UAPA 4IBPA 1OYJA 2H6XA 3HJMA 5HR0A 1WRYA 4N30A 5GSTA 4AF2A 1QXHA 2YP6A 2VD1A 3UL3A 1QFNA 2V6OA 1Z7PA 1PKWA 1FW1A 5DCHA 4I8BA 4FIWA 5JCWA 1V58A 4ZILA 3F6FA 5JCUA 5D9TA 2V41A 1V98A 2JSZA 3N9JA 2H66A 3NZNA 4OCFA 2H1DA 1V57A 3GYKA 3TRXA 5C04A 2A2SA 5KEJA 2H75A 4JR6A 1XCCA 1TDIA 5ECHB 4EVMA 1FAAA 4CHSA 3TJFA 4GSNA 3WYWA 2HE3A 2WGRA 3DIEA 3ZYWA 1G7EA 4HJMA 1TK5B 2VOCA 2DBCA 4ZL8A 1QQ2A 1K3OA 3GKXA 5ECMB 3RHCA 1YEXA 11GSA 1SL0B 2HRFA 3G7JA 2MBTA 3F8UA 2NPBA 5DDLA 1X9MB 4WF5A 1OC9B 4LLRA 4O7HA 1O8WA 4OWYA 1T4ZA 2QSIA 2F3MA 5B6MA 2PMTA 2WS2A 4NMUA 1EP7A 1GSUA 1T7PB 1X5DA 5CRHA 3TDGA 5ECLB 3DVXA 3P8WA 2LNTA 2DMMA 2CAQA 1G7OA 4D73B 4MJBA 3EC3A 2P0GA 5DJMA 3UOMA 1UC7A 2P5RA 3C73A 1K0DA 3LGCA 4QQ7A 3I6AA 4HJ2A 1TTZA 4MCUA 4WEYA 2CVBA 2YWMA 1SENA 3GNJA 4HDEA 2CZ2A 1K3YA 2LRNA 5LD0A 1KBNA 3KD0A 1MTCA 1A2LA 2H1AA 1HNCA 3F0IA 2R37A 4GXZA 1PRXA 4Z7XA 5DVBA 4LL4B 1F3AA 3ZTLA 1JLWA 2HYXA 1O6JA 4J56E 4PNFA 3DD3A 3GRXA 2XPDA 3TRPA 4V2LA 4YAVA 5AN1A 2VCXA 3GSSA 2ALBA 3HY2A 3GTUB 1N2AA 4POKA 5EY6A 4MPFA 1B9XC 1OC3A 4IQAA 1O7UA 2B7KA 2HRNA 1M9AA 3CXGA 2RIIA 3GN3A 2LUSA 2GT6A 2IMIA 3FK8A 4TN8A 1DUGA 2L5OA 1U6TA 4ZBDA 1S3CA 3UBKA 1TU7A 3KP8A 4MF6A 4NV2A 1PSQA 3IOSA 2IFQB 1N8JA 2HSYA 1K0AA 2B5EA 2AUVA 1TKDB 3GL5A 1FVJA 2FWHA 2VAFA 4MJEA 2PVOC 3ZREA 9GSSA 4RUVA 1XWAA 1SYXA 1OC9A 3QOUA 3APSA 3O76A 5ECRB 2DJ1A 1YKCA 1M2BA 2OKAA 5KN2A 1EEMA 1QGVA 19GSA 4XTSA 2H76A 1BQ7A 4BA7A 1A24A 5J9BA 4PX1A 1U3AA 2EIQA 5FWGA 2I3YA 5D9VA 1M0UA 3LSZA 5DALB 3DKSA 2C80A 2GVPA 1YY7A 3FR6A 2RM5A 2BMXA 4TW5A 4H86A 1USBA 3VI5A 2GSQA 1H4OA 1EWXA 3EWLA 3IHQA 4KNDA 2CT6A 3APOA 4WR5A 2DJKA 2WB9A 2CZ3A 2F9SA 2C3TA 1MD3A 1KTEA 5A5KA 3IC4A 3GKKA 3TKSA 3M9KA 4PGTA 2WDUA 4F03A 4ML1A 3ZITA 2TIRA 4ZIJA 2J23A 3HVXA 2VCWA 3FEUA 3QPMA 4ZL9A 2FUG2 4EF0A 2NBSA 2XBIA 2VCZA 1PMTA 2H72A 16GSA 3D4TA 4MZCA 2C8UA 3I69A 4NV5A 2FGXA 4RI7A 2GSRA 3EYTA 2OE3A 5EVOA 3Q74A 2C3NA 1GLQA 2K8SA 2LQQA 2MYGA 3PGTA 3GV1A 4LMWA 1XW9A 2FY6A 2DC5A 2DIZA 2LQOA 3I43A 4FYUA 2R2JA 3UMAA 5J41A 1YKAA 5B7CA 5JWRB 2IFQA 3GFKA 2X64A 1ML6A 3D6IA 2C0GA 1F6MC 2WFCA 4WBRD 2R6KA 3TJJA 3QCPA 1JZDA 1GTUA 5J5NA 1PN9A 3TB2A 5B8BA 3JCML 1JHBA 1R26A 4AGSA 1I9DA 3H8QA 5JWQB 3D0ZA 2H1BA 2QKEA 20GSA 2L5LA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite