2E0QA

Crystal structure of k53e thioredoxin from sulfolobus tokodaii strain7
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
VIHLDSKNFDSFLASHEIAVVDFWAEWCAPCLILAPIIEELAEDYPQVGFGKLNSDENPDIAARYGVMSLPTVIFFKDGEPVDEIIGAVPREEIEIRIKNLLGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of thioredoxin domain of ST2123 from thermophilic archaea Sulfolobus tokodaii strain7
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule keywords thioredoxin
total genus 26
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2e0qA00
3CSJA 1R26A 2DJ2A 4ILFA 2KUCA 1G7OA 2HSHA 1M9BA 1N8JA 3D4MA 1EV9A 1E6BA 4BVXA 2V6OA 2MBTA 2YWIA 1JLWA 5DVBA 1Y25A 2CVDA 4O7HA 1XW5A 4IN0A 4K0NA 1SL2B 3NOFA 2XC2A 3GV1A 3BD2A 3TB2A 2LNSA 2OA7A 1ACVA 4IBPA 3VFIA 2JSYA 5JCGA 1XWAA 4TR1A 5CO3A 2NTOA 2F8AA 3A3TA 4NWYA 3IBHA 4KX4A 2PVOC 3UARA 2C0EA 2LSTA 3KZQA 3GKNA 4X43A 4I8BA 4GWRA 2R2JA 2X8HA 4IP6A 1GUKA 3PGTA 3IK7A 3HVSA 4ML6A 1YQ1A 4MJEA 2L4QA 5EPFA 4CW9A 2YJ7A 5B8BA 2DMLA 1JFUA 1OE8A 2LS5A 4TR3A 1NHYA 4PX1A 1THXA 1N2AA 4FYBA 2NPBA 4KA0A 3H4KA 2QC7A 2F3MA 1TDIA 2J9HA 4WBJA 3FK8A 2E7PA 1B48A 4JZQA 4LMVA 1MTCA 4GF0A 1XFLA 2HZFA 3W8SA 1MDKA 3F9UA 3GKXA 4PURA 2KLXA 1T00A 4L5OA 3O76A 1DUGA 2VCWA 5G31A 3ZIVA 1IYHA 5IMCA 3WYWA 3ZVJD 2VD0A 4WEYA 1MEKA 1X5CA 4XTSA 1TRVA 1TW9A 2R5GA 4ULXA 1Z9HA 4I97A 3HYPA 3TJJA 5IOWA 5ECIB 3LORA 11GSA 2CQ9A 2D2ZA 4WKWA 3KMOA 1OC9A 4HS1A 3SBCA 4KAEA 5JWQB 2B1LA 1QGVA 3EWLA 1Z5YE 4IKHA 4ZB6A 4L0WA 1TK8B 2VD1A 3DRNA 3A5WA 4K7IA 3PINA 1U3IA 4QQ7A 3L0HA 1WP0A 4OFMA 3QAWA 2IL3A 1GTUA 5EL8A 2F9SA 1THOA 2AJQB 1T4YA 3GL3A 3OR5A 3GUSA 3HVXA 4D73A 1OKTA 2DIYA 4WETA 6GSWA 6GSYA 3CTGA 1XWKA 1Z3EA 2FWFA 3L9UA 1SJ6A 2RM5A 3EC3A 4POMA 4CHSA 1XOBA 4N0ZA 1TU7A 1A24A 5DCGA 1WMJA 3I69A 3VI7A 1EWXA 2FA4A 3QD9A 5IM9A 4XIHA 1QMVA 1RK4A 3GSTA 4HQZA 5ECHB 2H1AA 1ST9A 4IP1A 4DEJA 2V32A 3FR9A 4JEDA 3MSZA 6GSUA 3QFAC 4ECIA 4KCEA 1SKWB 5GSTA 1TTZA 3CTFA 2REMA 3IK9A 2K8SA 5AISA 4AF2A 5FWGA 3C1RA 4F2IA 2B5EA 3EU3A 1DE2A 3A2XA 4TRXA 2FHEA 5D9TA 1AC1A 1U6TA 4DVCA 1M0UA 1B9XC 3L4NA 5H5RA 3GN3A 3PR8A 1YF1A 2R6KA 2H01A 4ZILA 3H79A 3FZ9A 4ECCA 1PX7A 4TR0A 3GH9A 2AAWA 2EIQA 1ZMAA 2BJXA 5CREA 4EDZA 4BWQA 4FYCA 3G7YA 4HZ4A 4O92A 2WB9A 5D73A 2PGTA 5ECMB 2L6DA 2CAIA 2P0GA 3KP9A 1DBYA 3GRXA 4KDXA 2JADA 1T3BA 5EVOA 4K9ZA 1I5GA 3ZMKA 2GZPA 1V58A 2QKEA 2GS3A 2V2GA 4V2MA 2TRXA 2LRCA 3IA1A 5HFGA 4O32A 5ECNB 4BVYA 1GSDA 4HEA2 3TKPA 3N9JA 3FZ5A 2VCVA 2H71A 3LQ7A 5HFIA 3LXZA 1B8XA 1ZZYA 5F05A 2H0HA 2PVQA 2PBJA 4MF7A 4CDOA 5JWRB 1XPVA 1W89A 19GSA 1YEPA 3LXTA 4O5RA 2YV7A 4FH8A 5DALB 1VF4A 2RM6A 5ENUA 3AY8A 4HDEA 3DD3A 2RLIA 3GL5A 2MBSA 2GSQA 1B4QA 4AJ6A 1WJKA 2CVBA 2F8FA 5H5SA 2CZ3A 5HR2A 3L9VA 1RW1A 1GSFA 3RHCA 3EMXA 5DAKB 3DXBA 2IPAA 4G9HA 3TRPA 1DE1A 3D4TA 4V2LA 4EUYA 3GMFA 4ZL7A 2YOIA 4KW6A 1VGLA 3IC4A 2YP6A 1A0FA 5LCZA 2G2QA 3GH6A 1J08A 1A23A 2K6VA 3TJFA 2WCIA 2H1GA 1TXXA 4MCUA 4RUVA 4MLYA 2GQLA 2FLSA 1NM3A 1GH2A 2C0DA 4OMVA 2CVKA 3ZLPA 3J7Yb 2H19A 5B6NA 3VWVA 4MJCA 2FY6A 5B7CA 3KH7A 2IMKA 3F6DA 4EO3A 3GA4A 2VLVA 3DGQA 4K8MA 3ZYWA 1SU9A 3QR6A 2CV4A 2PERA 4L0UA 1DSBA 2HI7A 1EZKA 3US3A 2I1UA 5DJLA 1PN9A 1HNAA 3LG6A 1ILOA 1F6MC 1K0BA 1Z6NA 1EEMA 3VURA 6GSXA 5CRHA 2P5QA 1O73A 2B3SA 2KOKA 2M72A 4GXZA 5HR0A 4ZB9A 3FW2A 1VF1A 2JACA 4IQ1A 3TKSA 1TU8A 1HNCA 2GZZA 3IAS2 5H5QA 2C3TA 4F82A 1GLPA 4TR1B 1TRUA 2YCDA 3KCMA 3NZNA 3F4RA 5GSSA 1QXHA 4LL1B 4KSMA 4ZXGA 2VAFA 3ISOA 3MWHA 1R5PA 4MABA 1X9MB 2JU5A 3FR3A 4OCEA 3UVHA 5KN3A 2C3QA 2HNLA 3QMXA 2AUVA 2HXKA 1U88A 13GSA 1W4VA 4WF5A 5HQPA 3KH9A 2HE3A 4N0VA 4MZWA 1XWCA 3M0FA 2CX4A 1K0NA 3HJMA 3DMLA 3F8UA 2WJUA 3KIJA 4IQAA 4DSRA 2LJKA 3G9BA 2L5OA 1PKWA 1T8EB 3D6IA 2PN8A 3HZ4A 3W6GA 2VIMA 3TJBA 2VCZA 2ZNMA 1K0MA 4JRRA 2PMTA 4N11A 2YWNA 5J4UA 3S9FA 2VCQA 1GULA 2H0IA 2IFQA 3DIEA 12GSA 2RUFA 3F63A 2VOCA 4HJMA 5G30A 4OO4A 4BA7A 1NSWA 1SD8A 2YJHA 2PPTA 5ECLB 1GP1A 2H6XA 1M2BA 2VM2A 3HHVA 5G1LA 3MDKA 2HZEB 3HXSA 4DSSA 2H0GA 2X99A 1YZXA 1GTBA 1ON4A 1OC9B 2XPEA 1AXDA 3TKQA 4MMMA 4GLTA 1PL2A 2N5BA 2A2SA 3LGCA 1V98A 4YAVA 2H6ZA 5J3RA 3GX0A 1YKAA 4NAXA 5KN2A 2C0GA 4KE3A 4XS4B 1R7HA 1AIUA 4G19A 2OE0A 5AN1A 1USBA 1O85A 4XRDA 3UBLA 4ZBDA 1A2JA 4YQMA 3FHKA 4I5QA 4POLA 16GSA 3HCZA 2R4VA 1K0CA 2MYGA 2ZCTA 1HQOA 4KUNA 2DJ3A 4XS1A 4TW5A 2H8LA 1PMTA 1T4ZA 5IMZA 2GSRA 1ERWA 4BWSA 5KN1A 3DVXA 4ZIJA 1ZCPA 1Z7RA 2FWEA 3R2QA 1M2AA 4XHMA 4GQFA 2OKAA 5COHA 2AHEA 5J5NA 3GTUA 2KP2A 1LBKA 2YN1A 2H1DA 1BAYA 2M80A 3RPPA 2G0FA 5KEJA 5JCUA 1YF0A 5IMAA 1M2DA 4PNGA 1PQNA 4TVEA 2N5FA 2PUKC 5CP1A 5DJMA 3DWVA 2LTKA 3UIWA 4MH2A 3LJRA 1A2LA 1KTEA 2X8GA 4LA1A 1B4PA 3HJPA 4NHWA 3TOTA 4RQRA 1KBNA 1WWJA 2H66A 7GSSA 1A0RP 1SYXA 1SKSB 2WGRA 4JR4A 2IMEA 1YDKA 3N5OA 4PNFA 2IMDA 3GFKA 3FR6A 2DBCA 5F06A 1UN2A 3TOUA 1GTIA 2RUEA 2J23A 3I6AA 5A4WA 3C71A 2K8VA 4HU7A 2QGVA 17GSA 4BL7A 3EVIA 4PGTA 3IV4A 5B6MA 3O3TA 2HFDA 3FEUA 4PUFC 5IPGA 4IVFA 2ON5A 3UMAA 2ES7A 4EC0A 3KTBA 2WRTA 2GLRA 2R3XA 2PWJA 3TCOA 6GSVA 4KDYA 5A4VA 4E8EA 2OE3A 2FWHA 3ED3A 1RQMA 3QOUA 5G5EA 3DKSA 2LJAA 2RIIA 3TJKA 4F0CA 1J9BA 2OBIA 3LFLA 2O7KA 3D21A 3GSSA 22GSA 1TOFA 2HT9A 4I2UA 3A2VA 5LD0A 4I6XA 2VCXA 1BG5A 2CX3A 1ABAA 1KEBA 4N10A 2OJLA 3RBTA 1OC3A 3WGEA 3RDWA 1IYIA 3H1NA 5DCHA 1M99A 4TOPA 5KN0A 4F03A 4I2TA 2H70A 2BTOT 3RHBA 3IPZA 1PRXA 4ZBAA 1QQ2A 1GWCA 2CZ2A 4K7NA 5ID2A 3BCKA 3CYNA 3MAKA 4MP4A 3I43A 1XXUA 3H93A 3WGDA 2HYXA 2A2RA 2GDRA 2LEGA 3ZL5A 1XZOA 1EP7A 3U6VA 1Q98A 3G7IA 3WGXA 1K0AA 1JZOA 2X64A 3GIXA 2HLSA 3TKSC 2H30A 2O87A 5ECOB 2C0FA 1EV4A 2E2GA 1PL1A 3F4SA 3BOAA 3HVVA 1G6YA 3KM6A 2XHFA 5F8BA 1FB6A 1ML6A 1VF2A 3P90A 1GUHA 2CT6A 4HU9A 3F3RA 4POKA 3JCML 1GTAA 5DQYA 4GQCA 1KNGA 2V1MA 4FO5A 3BBYA 5G5FA 1JZDA 4GSNA 3UVTA 3APOA 4EE0A 3F6FA 1YEXA 4K7OA 9GSSA 2YNXA 3Q6OA 1XIYA 5INYA 3FY7A 4RQXA 1XOAA 1FG4A 1YJ6A 3CRUA 5D96A 2DJ0A 1F2EA 4NV5A 4X1UA 3LYPA 2VL2A 2M46A 4MZBA 3C7MA 1XWGA 3HZ8A 1HD2A 5GAPD 2JSZA 1O81A 4TN8A 1ZL9A 1GNWA 4GSTA 2V6KA 1EP8A 4MDCA 5GZZB 4AJ7A 4TXOB 4OWYA 1F9MA 3F4TA 3ZFLA 1A8LA 1F37A 1U87A 3VK9A 1R5AA 4FIWA 5GAND 4EL1A 2L5LA 2C4JA 2JL4A 3J7Yk 1BJXA 4MF5A 1WE0A 2WDUA 1S3AA 1K0OA 2YPMA 2YANA 4LLRA 3WD6A 1B9YC 4IGJA 1GSEA 4IHUA 5D9XA 3DVWA 4L8EA 2K9FA 2IIYA 4QL7A 1MDIA 4J57E 4HJ2A 1OAZA 4WR5A 1V40A 1GSYA 4JR6A 2VCTA 1R4WA 3UEMA 3C73A 1X9SB 1SL0B 1MD4A 1Z7PA 1LU4A 4KGIA 3SWLA 2NVLA 3TUEA 4EDYA 3IDVA 1ERVA 4EF0A 3QCPA 3CMIA 1H4OA 1O7UA 4PQIA 4V1Ag 8GSSA 1ERUA 2X8CA 1ZYQB 4HUAA 1X0RA 4IW9A 1JLVA 2FNOA 3TRXA 1JHBA 2H75A 2OADA 3FZ4A 2BMXA 3CRTA 4MH3A 3W8JA 2GTUA 1FAAA 1FHEA 3EINA 2FGXA 2IFQB 4V2NA 4Q5FA 3UL3A 1QK8A 5DALA 5A5KA 2GGTA 5ABRA 2O89A 4V1Ap 2DJKA 1SL1B 2H6YA 5E4WA 1SJZA 4TKYA 5G2ZA 3ERWA 4YH2A 2B1KA 3ZMLA 2Z9SA 3QFBC 5DAKA 2H74A 2B5YA 4ISDA 3IE3A 4OD7A 1WOUA 2I81A 1ZYEA 1E2YA 2VL3A 2HRNA 2GVPA 2FA8A 1X5EA 1FOVA 4IJIA 4KNDA 5C04A 5EY6A 2O8VB 3BCIA 4J2FA 1U3AA 1PX6A 2WULA 2B7JA 4ID0A 1GLQA 2MMZA 2E2MA 1GL8A 3C8EA 1AQWA 4YQVA 3Q18A 1TP9A 2DMMA 3WT2A 5L71A 1AAZA 3GX8A 2DC5A 1T7PB 2HSYA 1K3OA 2F51A 4K6XA 1URMA 3GTUB 1FO5A 3LWAA 5DBQA 2GQKA 2P31A 2LRNA 18GSA 1MDJA 2H1BA 5IQYA 3HY2A 3KP8A 4PUAA 4F9ZA 1XW6A 3UBKA 4OCFA 1Z6MA 3F0IA 1S3CA 1ZGNA 4MA9A 2FD3A 1SYRA 2GSSA 3FRCA 2B7KA 1WPIA 2I4AA 3QPMA 5IO2A 3EMPA 1PA3A 2OACA 4LMWA 1H75A 2VL9A 4N30A 3E9JB 3LYKA 1EGRA 5J9BA 2FCHA 2VO4A 1FVJA 1FW1A 3ERGA 1GUMA 3O6TA 4LL4B 4AJ8A 2H73A 3Q19A 4L5LA 4EXJA 2ALBA 6GSSA 4IJ3A 1SK2A 3IXRA 1M9AA 4WR4A 5HR1A 1FB0A 1XVQA 1XW9A 3ZIJA 4D73B 3LSZA 4K0GA 1OE7A 4ZL8A 2AV4A 3WT1A 5ECKB 1F3BA 1UC7A 4BPYA 4KSOA 1O8WA 2YV9A 4K2DA 1TJDA 4KH7A 1Q4JA 3GURA 4MK3A 4PQHA 1A8YA 2L4CA 1VRSD 3KTLA 3VWUA 5DDLA 4OFNA 1NHOA 4MF6A 1K3LA 4YQUA 3VWWA 4Q5NA 3P7XA 1EGOA 4ACSA 1PKZA 1OVNA 2FWGA 1CQGA 1LJRA 1M7TA 2A4VA 4NMUA 4RI6A 5ELAA 1BEDA 2HZEA 3EE2A 1QUWA 2GT5A 2DIZA 2NBSA 2TRCP 2YWMA 2IJYA 1JZRA 3TGZA 3M9KA 3ZTLA 2VL2C 2TIRA 5IIZA 1SENA 3IOSA 2L6CA 1EEJA 3M1GA 5ID2B 4JBBA 1V2AA 2JZRA 4WXTA 5IMFA 3HA9A 1O6JA 3L9SA 3M9JA 2KP1A 1K3YA 3APSA 4IS0A 4MJAA 4P3YB 2EIOA 4NXIA 4H86A 2IMFA 3KXOA 1GSSA 1WIKA 4XS4A 1A2MA 2MMAA 3TJGA 1QFNA 2AYTA 1F3AA 1I9DA 1HNBA 1O8XA 1AQXA 5IOXA 1PGTA 4MJBA 3KEBA 3FYGA 3VPTA 5ELGA 3HJOA 1HYUA 3F3QA 4POBA 2B5XA 4WF4A 4K1FA 2DJJA 1PD21 5IPHA 2IWTA 3IRAA 4NV2A 1TRWA 3ZREA 5LNKe 2CA8A 3IAM2 2YZHA 3UOMA 2C3NA 3HD5A 4HQSA 2O85A 3RPNA 3KMNA 4HZ2A 2K18A 5D9WA 2GT6A 1Y6EA 2B6MA 3ME8A 3TDGA 1TK5B 5ECPB 1AW9A 1MD3A 1UVZA 2XPDA 1TI1A 4XRAA 3BJ5A 4EKZA 1G7EA 3ERFA 3C1SA 4EVMA 4TR4A 4GSSA 3KJYA 1SJIA 3DEXA 5G1KA 4OFTA 3FZAA 3ME7A 3KGKA 5J41A 3DYRA 5DQSA 5E59A 1BX9A 3EURA 5F07A 2C80A 2V41A 1J0FA 3G7JA 1G0TA 5IO0A 4F0BA 3I9V2 4KB3A 4X0XA 2C8UA 3M3MA 2H76A 2LUSA 5J9CA 2E0QA 1TI3A 4JE1A 3L78A 2LQQA 5ECQB 4ECJA 14GSA 3IR4A 1PSQA 5CYYA 4GTUA 1JZWA 5HFKA 3D5JA 3P2AA 2L59A 2PU9C 3TKRA 3MNGA 3QAGA 3VI5A 3H8QA 1SK1A 5D9VA 2EC4A 3RAZA 4JU5A 4PQ1A 4WBRD 1YKCA 4TXVA 5C00A 1XVWA 2GSTA 4HI7A 2R37A 3K8NA 2GZYA 1EOHA 3UJ1A 4NPBA 5HR3A 5F0GA 5ECSA 2QSIA 1AQVA 2YWOA 1TKDB 3GNJA 1T1VA 4GCIA 1G6WA 1X5DA 2WZ9A 5ECRB 4E8HA 5IMDA 4Q5RA 5AIVA 1BYEA 3UAPA 1C72A 2DLXA 4G10A 2IN3A 3D0ZA 1OKDA 2MMOA 3CSIA 4XS6A 1ERTA 5JWOB 2C1YA 1K0DA 2LJRA 2L57A 2VUPA 2LNTA 1VF3A 2DJ1A 3EYTA 3PH9A 5CRGA 3M8NA 1V9WA 2OBKA 2VLTA 5B8AA 5CRDA 3HKRA 3U5RE 3D22A 2DSAA 4G2EA 4ZL9A 3E0UA 5D8IA 5IMVA 4IELA 4J56E 5CAXA 1XBSA 2HRFA 2WFCA 4MPFA 3GYKA 3LEFA 1ZOFA 1NW2A 1OC8A 2LQOA 2VLUA 4AGSA 2XBIA 1GSUA 4YAPA 5FT3A 3V1WA 2LKUA 4ML1A 2LV3A 2NDOA 3P8WA 3TKSE 1SKRB 1GSQA 2FUG2 2I3YA 4KDUA 1EOGA 4RI7A 1YY7A 2P5RA 3KD0A 20GSA 4PXOA 3Q74A 4HOJA 3VPQA 4KCAA 3IHQA 3E3EA 2VM1A 2MZCA 4MPGA 3QAVA 3GKKA 3APQA 1WRYA 3VLNA 2JZSA 4DSSB 3ZFBA 4TXOA 4ECBA 2N5AA 4ZBBA 3FKFA 5AGYA 2EIRA 3TRQA 2ON7A 1TRSA 3NIVA 1TK0B 3CXGA 5D93A 4Q5QA 1X9WB 1UA5A 3HDCA 6GSTA 3CSHA 2MMNA 1XWBA 3VWXA 2KHPA 5FHIA 2AB6A 3EU4A 2YZUA 5CRWA 1SD9A 3GHAA 2LRTA 4MZCA 2IMIA 2OE1A 10GSA 1BQ7A 1OYJA 2GQMA 2JZTA 3ZRDA 5AIXA 4XCSA 3ZVJA 5A4UA 2I9HA 1XCCA 2H72A 5CNWA 4ZB8A 1FVKA 1S3DA 1SK0A 2ZUPA 4OO5A 4FYUA 1GNEA 3CBUA 4GRFA 1CQHA 2CAQA 3ZZXA 3ZITA 4QL9A 5JCWA 2XBQA 4NHZA 4DSQA 1AUCA 3GKMA 1V57A 3QDNA 3A2WA 2WS2A 1GRXA 4Z7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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