2AV4 | Genus

Total Genus 42

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	42
sequence length	150
structure length	135
Chain Sequence	HHMLQHLNSGWAVDQAIVNEDERLVCIRFGHDYDPDCMKMDELLYKVADDIKNFCVIYLVDITEVPDFNTMYELYDPVSVMFFYRNKHMMIDLGTGNNNKINWPMNNKQEFIDIVETIFRGARKGRGLVISPKDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Thioredoxin-like protein 4A (DIM1)
publication title	Genome-scale protein expression and structural biology of Plasmodium falciparum and related Apicomplexan organisms. pubmed doi rcsb
source organism	Plasmodium yoelii
molecule tags	Structural genomics, unknown function
total genus	42
structure length	135
sequence length	150
ec nomenclature
pdb deposition date	2005-08-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02966	DIM1	Mitosis protein DIM1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2av4A00

2KLXA 4GSSA 4ZB9A 4J2FA 1ERTA 1A2MA 1M2DA 2WDUA 3GKNA 4Q5RA 4HOJA 4KDYA 3ME7A 3Q18A 3TB2A 2R5GA 2CV4A 3ZREA 19GSA 2B7JA 1OE8A 5DQSA 4ML6A 2I1UA 3U5RE 2IN3A 3RAZA 1F3BA 3GSSA 3MDKA 3KH7A 1FHEA 1S3AA 4KDXA 2PUKC 1ACVA 1GP1A 4I2TA 5AISA 4MJCA 1MDIA 1T8EB 2IIYA 4KCAA 3FK8A 3KMOA 2B1LA 2VCQA 3HVSA 3UMAA 3HJMA 4HU9A 4V1Ag 3HJOA 3O3TA 4DSQA 2LEGA 4ECJA 4MCUA 5B8AA 2B1KA 5HR3A 1F3AA 4XIHA 3D4TA 5IIZA 3D6IA 2VL2C 2CAIA 2MMAA 5CRWA 1Z5YE 4YH2A 3DXBA 4DEJA 3BCIA 2A4VA 3GURA 4MZWA 5KEJA 3ERGA 5CYYA 4EC0A 2H19A 1XWGA 2QSIA 2YN1A 5D8IA 5DALB 2MYGA 3WD6A 2LRNA 2JZSA 5AIVA 4O5RA 5AN1A 2GT5A 1BQ7A 1THOA 4JEDA 1SL1B 3GFKA 3DYRA 2R37A 1BAYA 3LQ7A 3D4MA 2NVLA 2C80A 1WWJA 3KM6A 4J57E 2B5EA 1C72A 1K0DA 2V6OA 4K7NA 2CZ2A 3MWHA 1GTAA 3EC3A 3I43A 2HSHA 1J08A 2MBTA 1A24A 5IO2A 1YZXA 4V1Ap 1T3BA 3LXZA 1TRWA 4ULXA 1WMJA 1OYJA 2KOKA 2X8HA 1ERVA 2XPDA 4GQFA 2H1GA 4Q5FA 2OJLA 1VF3A 4KGIA 5IOXA 2PBJA 4JRRA 1ERWA 2LQQA 1MDJA 5ABRA 2E7PA 4MZCA 2IL3A 2ZNMA 2D2ZA 3D0ZA 4O7HA 2V32A 4O92A 2B7KA 2DC5A 2KUCA 4IGJA 1T1VA 2NBSA 2EC4A 4F9ZA 3V1WA 5CRDA 4ECBA 3FEUA 2BTOT 3D21A 3VPQA 3J7Yb 2AJQB 2DBCA 1JZRA 2P5RA 2DMLA 4IELA 1EP7A 3TJBA 3GH6A 3F4TA 1WIKA 8GSSA 1PL1A 4GTUA 3GL3A 2PU9C 2IMKA 3TRQA 2LQOA 4ISDA 2KP1A 2CX3A 3KIJA 3N5OA 3FR9A 4K0NA 1X9WB 4P3YB 5J4UA 1DSBA 1TU7A 4POMA 2F51A 4K2DA 3IR4A 2RIIA 3RDWA 3IBHA 3ZYWA 4ZB8A 3LXTA 2YJ7A 4XRAA 4JZQA 3UEMA 2CA8A 4G19A 5IPHA 1K0CA 1PX6A 4X1UA 5G5FA 2H01A 2FCHA 2OBKA 2H75A 1CQHA 5KN2A 1EP8A 2NDOA 4Q5QA 4AGSA 1U87A 3KZQA 1GUMA 4MF5A 1X5CA 3Q19A 4LMVA 2L6CA 4OO5A 4TXOA 4MPFA 4TW5A 1WRYA 2HRNA 3IAS2 4F0CA 2VLUA 2L6DA 4I2UA 5F0GA 2E2GA 1SU9A 5D9TA 3VI7A 1BYEA 4EKZA 2H70A 4KSOA 2GSSA 1U3IA 3E0UA 2YANA 4MA9A 3RPNA 1GSSA 4HS1A 2YWMA 4IJIA 2IJYA 4I5QA 3CXGA 4GWRA 1EV4A 5CREA 5EL8A 4EDZA 11GSA 2R6KA 1JFUA 1JHBA 1W4VA 2RM5A 4OFMA 1SYRA 2XBQA 1BG5A 4X43A 1PGTA 3L78A 2CZ3A 1XXUA 2LJAA 1WE0A 1I5GA 4MH2A 1XVQA 3TKQA 3ZITA 18GSA 3C1SA 2BMXA 5IOWA 1NHOA 1QMVA 3I69A 2QC7A 4IJ3A 4Q5NA 1Z6NA 3IDVA 3RPPA 3IPZA 3TCOA 1I9DA 2C0EA 2K8VA 2GQMA 3UBKA 2VL3A 2VL2A 2WZ9A 5IMCA 1YF0A 1SD9A 1HYUA 3BJ5A 3W8SA 1R4WA 1T7PB 3ZFLA 2K9FA 5GAPD 2AV4A 1GSEA 1FG4A 5CRHA 1XVWA 2DIYA 3C7MA 2GTUA 2YV7A 6GSVA 4BL7A 4MJBA 2ON5A 3EVIA 1GULA 5HR0A 2JSZA 3ED3A 2K6VA 2H6ZA 2HZEA 4E8HA 2GSQA 1AQVA 4ZL7A 1AC1A 2GLRA 1GTIA 2WRTA 1R5PA 4POBA 1KNGA 1V40A 1S3CA 4KX4A 3HCZA 4PNFA 3LORA 3TJJA 5F05A 1SENA 5IMDA 1ZMAA 5GSTA 1S3DA 4D73A 2IWTA 2AUVA 3IHQA 3UVTA 3F63A 1USBA 4PUAA 4GRFA 3WT2A 2EIRA 2RM6A 1U88A 1CQGA 3EINA 2VCWA 2FLSA 1PMTA 4FO5A 3A5WA 4N10A 1GSDA 3GHAA 3TJFA 2FY6A 4YQMA 2EIOA 1TXXA 2DJ1A 1SKWB 3VK9A 2LNTA 4Z7XA 1PD21 5JCGA 1SK0A 5ECOB 3N9JA 4XHMA 4ZBBA 2C0FA 2VCZA 1Z7RA 3HZ4A 2FWGA 1TDIA 4POLA 2WFCA 5GZZB 1BEDA 4V2MA 1PKZA 1X9SB 2YWNA 4H86A 5H5QA 2YOIA 2I3YA 1EOGA 4MDCA 3ZFBA 3K8NA 2EIQA 1OVNA 2YP6A 3D5JA 3UBLA 5C04A 3C71A 4YAVA 2MMOA 2PMTA 4WBJA 1X5EA 2H66A 1EGRA 1V9WA 4XTSA 3P7XA 1K0NA 2X64A 5HR1A 1AUCA 1VF2A 2N5AA 4HU7A 1A0RP 1T4YA 1B4PA 1XPVA 4HDEA 5IMVA 4GXZA 3TOTA 1SJZA 5ID2A 1NM3A 4KH7A 2I9HA 1GWCA 4QL9A 1W89A 5G5EA 2M80A 3DIEA 2IMFA 3CTFA 4HJMA 1AQXA 2OBIA 2VD1A 5DALA 4CW9A 4XS4A 2FA8A 3FRCA 2IFQA 1A8LA 4IS0A 1KBNA 1MD3A 3KP9A 4PQIA 4PURA 3HVXA 1K3LA 1QGVA 3HY2A 1WOUA 4K1FA 4RI6A 1R5AA 3L9SA 3VWVA 4BPYA 1HNAA 1RK4A 3S9FA 2M46A 4EF0A 1K0BA 3RHBA 3VLNA 4NXIA 2DJ0A 2YZUA 3MSZA 5A5KA 4BVYA 1TK8B 4LMWA 3LG6A 4AJ8A 3F4RA 1OC3A 2GZYA 1TI1A 3GN3A 5ECHB 4EO3A 3HKRA 2H8LA 5A4UA 4DVCA 1FW1A 1A2LA 2LRCA 5ECPB 3FR3A 4IP1A 4OCEA 4BWSA 1A8YA 2NPBA 9GSSA 1TW9A 17GSA 5DDLA 3M1GA 1SL2B 1SD8A 3H79A 2REMA 3FZ5A 1F9MA 2HI7A 4N11A 4KW6A 4NHWA 4FYBA 2OE1A 1RQMA 1Z3EA 1G7OA 3ZRDA 1PKWA 1N8JA 5ID2B 3E3EA 1OC8A 2FWHA 5G30A 3LEFA 1YKCA 2LUSA 1XOBA 1A0FA 1Z6MA 3MNGA 3TKSE 3A2XA 3G7YA 4XS4B 1M2BA 4L5OA 3GYKA 4HJ2A 4FYCA 5ELGA 2XPEA 3DD3A 1HNBA 4HEA2 2IFQB 1DE1A 2LNSA 2I81A 2JZTA 5KN1A 3RBTA 4N30A 4TRXA 1GSFA 1O73A 1UC7A 3IV4A 4PQ1A 1GUKA 5LD0A 2WB9A 3SWLA 2M72A 1FVJA 1G7EA 1Z9HA 5ECIB 5D93A 5ECNB 5EPFA 4HZ2A 3I9V2 1AIUA 2VM1A 2N5FA 1XW6A 4QL7A 1OKTA 1TKDB 5IMZA 2TRXA 2DJ2A 3G7IA 4NV2A 2H1DA 3EU4A 1K3YA 2R3XA 4G9HA 5F8BA 2J23A 4MJAA 4TR1A 2OACA 1URMA 2HLSA 2VLTA 2YWIA 2P0GA 2VCXA 3IC4A 1H75A 2HE3A 3H1NA 5ECQB 2YJHA 4HI7A 1O8XA 4BVXA 3TOUA 5B7CA 4WR5A 4KNDA 1NW2A 1XW5A 2H1BA 2L59A 2VCTA 3FYGA 4OMVA 2MMNA 2DJ3A 2E0QA 1GUHA 2YPMA 3LJRA 5GSSA 2C0GA 2DJKA 4V2LA 2X8CA 1MD4A 2H6YA 2YZHA 2OADA 1WP0A 4GCIA 4ZXGA 4FYUA 4HQSA 4O32A 2P5QA 2V41A 1XBSA 1O85A 3HXSA 4DSRA 1XOAA 2B6MA 2GS3A 2FHEA 3ZZXA 1QXHA 20GSA 5G1KA 3KTLA 2LSTA 5A4VA 2AB6A 1GNEA 2OE3A 3IAM2 2JSYA 2VCVA 2ZCTA 2TRCP 4ZILA 4OFNA 4KCEA 3QAVA 3FKFA 1HNCA 4CHSA 16GSA 4IHUA 5IQYA 5J5NA 5JCUA 3M0FA 4MJEA 3TKSC 2C1YA 3W8JA 2E2MA 3VI5A 1EWXA 1X5DA 3EWLA 3VWXA 2H6XA 3M3MA 5AIXA 4K6XA 5DVBA 2VOCA 3PR8A 2GVPA 3DVXA 4RQXA 1U6TA 4TR1B 4JR4A 2GZZA 1Y25A 2H74A 4HUAA 2CX4A 2K8SA 2V1MA 2DIZA 1ZL9A 4YAPA 3NZNA 3C8EA 4RUVA 2C3QA 1TU8A 4POKA 3FY7A 3WYWA 3IRAA 5G1LA 1SK1A 5J9BA 3HJPA 2Z9SA 1TI3A 5L71A 2LJRA 1G6YA 1TK5B 3GKMA 2IMEA 2F8FA 1B8XA 3PH9A 5INYA 4XS1A 3GTUA 2O89A 3BD2A 5JWOB 3EMPA 3QDNA 3Q6OA 4MMMA 5B6NA 5E59A 1GLQA 3F3QA 4EUYA 3DKSA 1IYHA 2L57A 3UJ1A 4TKYA 1ON4A 1AAZA 3ZVJD 3ZIVA 4KB3A 1XWBA 1PQNA 3L9UA 2FD3A 3NIVA 3F8UA 1GTBA 1SYXA 2IMDA 2PVOC 2DMMA 2LV3A 1VF4A 3FW2A 2JADA 2C3TA 4QQ7A 3A2WA 2VIMA 1XWAA 2K18A 3QR6A 2C3NA 1ZYEA 1J0FA 3EYTA 3FZ4A 4L5LA 4IQAA 3DVWA 4K9ZA 1IYIA 4FIWA 4ZBDA 1J9BA 1F2EA 1PRXA 5DAKA 2FUG2 5J9CA 4KSMA 1SK2A 4K7IA 1EEMA 1OKDA 4G10A 3SBCA 1LU4A 3QPMA 3P8WA 3I6AA 2FA4A 5FT3A 5JWRB 4IP6A 4F0BA 1DE2A 1X0RA 4ECIA 3G7JA 2N5BA 2VAFA 2G2QA 1G0TA 5ECKB 5G2ZA 1HD2A 1Q4JA 3KH9A 2R4VA 4YQUA 3ZMLA 4NV5A 2YNXA 4IVFA 5IPGA 2V6KA 3A3TA 2RLIA 3F0IA 3CMIA 4ZL8A 3GTUB 3KJYA 4LLRA 2GZPA 3CRUA 4KE3A 5C00A 5CAXA 3F4SA 2RUEA 4GSNA 1UVZA 2WGRA 4N0VA 1ZGNA 2JZRA 2MMZA 3KXOA 1BX9A 1SJIA 5ECRB 3IK9A 4AJ7A 5ECMB 3RHCA 3EU3A 4LL4B 1AQWA 5D9XA 3W6GA 2MBSA 3WGEA 3L0HA 4WR4A 3QD9A 1PN9A 1XIYA 1TP9A 4FH8A 5DQYA 3A2VA 1YQ1A 3C1RA 3TKRA 1OC9B 3OR5A 14GSA 1XCCA 3TKSA 5ECSA 3ERFA 3ZMKA 4MZBA 2L4CA 2VLVA 2JACA 1UN2A 4J56E 4IW9A 2IMIA 4F2IA 4E8EA 5IO0A 2ES7A 3BBYA 1QQ2A 3H8QA 4LL1B 5DAKB 4K0GA 3CRTA 1GSUA 4ZBAA 4MF6A 3US3A 3KCMA 4TR3A 3F6DA 2TIRA 4PQHA 13GSA 3MAKA 3KTBA 4LA1A 3LFLA 2DSAA 6GSWA 1TJDA 3F9UA 4XCSA 1M9AA 1VF1A 5IMFA 4JU5A 3GX0A 6GSYA 2P31A 3ERWA 3ZVJA 2FGXA 3KD0A 3UVHA 4WF4A 3DGQA 5ELAA 2O85A 4EXJA 3BCKA 2MZCA 2PGTA 1PX7A 1F6MC 3QMXA 1A2JA 1M2AA 4XS6A 1EOHA 1XWKA 3BOAA 1M0UA 2CVKA 2WCIA 3TRPA 1E2YA 2FWEA 3UARA 1F37A 1XZOA 2VL9A 1MTCA 2PWJA 4PUFC 2CVBA 1TOFA 3CSJA 7GSSA 1WPIA 3TUEA 2KP2A 2HRFA 5HFKA 1TTZA 5HFGA 1DUGA 1V57A 4TR0A 3HHVA 1PSQA 1DBYA 1U3AA 1V58A 1AW9A 2H1AA 3AY8A 4NMUA 1XW9A 4DSSA 2OE0A 2HZFA 4KDUA 3LYPA 1YKAA 3IK7A 2X8GA 3APQA 1FAAA 2OA7A 3ZIJA 1YJ6A 1NHYA 6GSSA 5DCHA 3QOUA 4I97A 1JLVA 4KUNA 2F3MA 3L9VA 1SJ6A 1TK0B 3TRXA 4WETA 1B9XC 5E4WA 3APSA 2L5LA 4TR4A 4TXVA 5DJMA 2LRTA 4NHZA 1EV9A 5CNWA 4RQRA 2DLXA 2B3SA 4ZIJA 2PN8A 1YDKA 4HZ4A 3WGDA 3KMNA 2RUFA 1OAZA 1RW1A 5LNKe 4ECCA 4GF0A 4TVEA 2HFDA 1ABAA 1GL8A 1K0OA 4GSTA 4ILFA 4F03A 1EGOA 2H30A 3GIXA 3VWWA 3FZ9A 2GGTA 2XBIA 3HVVA 10GSA 5ECLB 5H5RA 3LYKA 2LTKA 4CDOA 4EVMA 2CVDA 4WBRD 4WKWA 4L8EA 5JWQB 1MDKA 3FHKA 5B8BA 5EVOA 4NWYA 4I6XA 4OWYA 1GRXA 2O7KA 4ZL9A 1E6BA 1G6WA 4X0XA 5D9WA 1M7TA 1XWCA 2A2RA 2FWFA 22GSA 4JE1A 3GL5A 3LWAA 3C73A 4DSSB 1GTUA 1GLPA 3EMXA 1K0AA 4ZB6A 3ME8A 1HQOA 1K0MA 3NOFA 3ZLPA 3UAPA 3CSIA 4ID0A 2WJUA 2CT6A 2PERA 5KN3A 1XFLA 3LSZA 1NSWA 2L5OA 3KP8A 1TRUA 5GAND 2ZUPA 2VO4A 5AGYA 2FNOA 3UIWA 4K8MA 3GV1A 4IKHA 4L0WA 2GQLA 1FO5A 5DBQA 2CQ9A 4JBBA 5EY6A 3GRXA 3QCPA 4NPBA 4WF5A 1O7UA 3P90A 1VGLA 5CP1A 4AJ6A 4HQZA 5FHIA 2B5YA 3DEXA 1VRSD 4ML1A 1ILOA 2QGVA 4TOPA 4IN0A 3VURA 2VUPA 3IA1A 3KEBA 4PXOA 2VM2A 1KEBA 2BJXA 3UOMA 3ISOA 1EZKA 1B4QA 2HT9A 1Y6EA 4G2EA 1TRVA 3CTGA 2O8VB 3GSTA 1R26A 4L0UA 2LJKA 2VD0A 3HYPA 5B6MA 2NTOA 2KHPA 4PX1A 2A2SA 3TGZA 3PGTA 5H5SA 1QK8A 1FVKA 4EDYA 1ERUA 3M9KA 4BA7A 5HFIA 1SKSB 1YF1A 1ZZYA 1JZDA 1YEPA 2F8AA 4F82A 3JCML 1A23A 2X99A 1B48A 2YCDA 4MP4A 3R2QA 1LJRA 2H72A 3IXRA 4EE0A 5G31A 1H4OA 1X9MB 3TKPA 2QKEA 1JLWA 4ACSA 5A4WA 3TJKA 5IM9A 4MLYA 2DJJA 5CRGA 1T00A 1M9BA 2XC2A 1FB6A 2OKAA 3P2AA 3TDGA 3CSHA 5JCWA 4MK3A 2GQKA 2H0IA 4MH3A 4KAEA 3IOSA 4KA0A 1WJKA 3WT1A 5IMAA 2O87A 3PINA 2PVQA 1LBKA 2AYTA 2WULA 3O76A 4XRDA 1KTEA 5J3RA 5D9VA 3H93A 2H76A 6GSTA 1ST9A 2AHEA 4OFTA 2IPAA 1SKRB 3QAWA 1B9YC 1ZCPA 1AXDA 3QFAC 1YY7A 3TJGA 1OC9A 2JL4A 1UA5A 6GSUA 1ZYQB 4GQCA 4TXOB 2C4JA 5D96A 5CO3A 2R2JA 5HQPA 2H0HA 1QUWA 3F6FA 2V2GA 4PNGA 3HA9A 2J9HA 4OCFA 5ENUA 5D73A 4GLTA 1O8WA 2B5XA 2H73A 3QFBC 2GSRA 2L4QA 3M8NA 1BJXA 3WGXA 4TN8A 4YQVA 3L4NA 1Z7PA 2C0DA 4K7OA 4JR6A 1QFNA 3H4KA 5KN0A 1T4ZA 5J41A 2H71A 3GMFA 4AF2A 2HXKA 3KGKA 3O6TA 3VWUA 3HD5A 4MPGA 1Q98A 2ON7A 1N2AA 3GNJA 2GT6A 1ML6A 1EEJA 12GSA 2I4AA 1O81A 4PGTA 1PA3A 1PL2A 4EL1A 2LKUA 5COHA 2GSTA 2CAQA 1OE7A 3DMLA 1GH2A 1GSQA 4IQ1A 1JZOA 1V2AA 4MABA 3GKXA 1V98A 2AAWA 3F3RA 1GSYA 3HZ8A 1M99A 3ZL5A 1ZOFA 3GX8A 4OO4A 5DCGA 3GH9A 3VPTA 3GA4A 2HSYA 4NAXA 5F06A 1FOVA 1FB0A 2JU5A 3D22A 4MF7A 3Q74A 4V2NA 2XHFA 4I8BA 2YV9A 1MEKA 3FZAA 3EE2A 2YWOA 4OD7A 1GNWA 4RI7A 2HZEB 4WXTA 3QAGA 3LGCA 3G9BA 3APOA 3GKKA 6GSXA 3IE3A 3VFIA 5HR2A 2ALBA 1JZWA 3EURA 1K3OA 5FWGA 1O6JA 5F07A 2LS5A 3DRNA 2C8UA 1SL0B 2H0GA 3E9JB 2G0FA 4WEYA 2GDRA 3CBUA 3CYNA 1YEXA 1TRSA 3DWVA 3FR6A 3M9JA 3ZTLA 3GUSA 4D73B 1R7HA 3J7Yk 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2AV4A

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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