4N11A

Crystal structure of plasmodium falciparum reduced glutaredoxin 1 (pfgrx1) complexed with cisplatin
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
TSEAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Cisplatin with plasmodium falciparum Glutaredoxin 1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 39
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n11A00
3ERWA 4H86A 1PL1A 3BCIA 2VL3A 3F3QA 1B4QA 3LQ7A 3I6AA 2DBCA 3VLNA 1RQMA 3F6FA 4EUYA 4NHWA 2C0DA 2CVDA 5IMCA 1SL2B 4AJ6A 5COHA 5C04A 2VLUA 5CRWA 5HFKA 4E8HA 1MDJA 3BJ5A 3ZFBA 2GDRA 4F9ZA 2LV3A 16GSA 4POLA 1BEDA 1J9BA 2OBIA 2KUCA 3RPPA 3CSJA 2I3YA 3A2VA 3TKPA 4P3YB 2XPEA 1WRYA 1EWXA 3UOMA 4I2UA 3QDNA 4HDEA 5F8BA 1YEPA 2MMNA 3FZ9A 3D22A 5EY6A 4WF5A 2TIRA 1K0MA 3IA1A 5IIZA 4ID0A 2VM1A 3TJFA 2F9SA 4OCFA 1TRUA 3MAKA 1X0RA 3GH6A 2AAWA 1TU8A 4FO5A 4KDUA 2NTOA 3VPTA 1S3AA 5DALB 1VF1A 3CXGA 4V2LA 5D9VA 5ID2B 3EINA 3FZAA 3HDCA 2HXKA 2C0GA 2MBTA 4WKWA 4POBA 4GTUA 1X9SB 2DJ0A 1T8EB 1A2LA 1EOGA 4ZB6A 2H8LA 4WR4A 5AGYA 1ZL9A 4MABA 3P8WA 4L5LA 1PX6A 5FT3A 3HVSA 3D0ZA 8GSSA 1E2YA 5JWQB 2YCDA 2NBSA 4V1Ap 4K6XA 2TRCP 4KAEA 4LA1A 3DVWA 1JZWA 2O85A 1Z5YE 2R3XA 1A8YA 2VO4A 4ZIJA 4KA0A 1PL2A 3F63A 5ECPB 1QK8A 4TVEA 3TJJA 4PGTA 3F4RA 2VD0A 3H1NA 3IK9A 3ZYWA 5CNWA 1XW9A 3E3EA 3ZMKA 5HR3A 3LORA 1V40A 1VGLA 2YPMA 1M2DA 1BYEA 5D9TA 4MJBA 3P2AA 1HNAA 2H1BA 2GGTA 1B9XC 1U87A 2VLTA 4DSSA 1QFNA 1FW1A 5HFIA 4OO5A 1TXXA 5F06A 2GS3A 1T4YA 1EZKA 2GLRA 1K0BA 3QD9A 2FA4A 5INYA 1GNWA 1K0CA 5D9XA 3WT1A 2LJRA 1WPIA 1MDIA 4XS4A 1TRWA 4HU9A 2O7KA 3RAZA 3MWHA 5CRHA 4MCUA 1O8WA 1E6BA 1UN2A 1LJRA 2GQLA 3C1RA 4GXZA 2B5EA 2AV4A 14GSA 2HNLA 3ZVJD 2IMIA 2EIRA 1K0OA 1Q4JA 1EP8A 3QFAC 1GLPA 3FZ5A 1AAZA 3LJRA 3F4TA 3M9JA 4MZCA 1F2EA 1OE8A 1ZGNA 4PUFC 3UMAA 1F37A 3VWWA 4K9ZA 1Z7PA 3EURA 3GSTA 3F8UA 5E59A 4BWQA 1WE0A 4FYCA 4LLRA 2N5BA 4GLTA 1BQ7A 3BOAA 2H6ZA 2LTKA 2YOIA 5D93A 4KCEA 1SJZA 3TJGA 5F07A 3ZVJA 4BA7A 2PVOC 1KEBA 3IDVA 1J08A 2KP2A 2X8CA 1R26A 2X64A 3G7IA 3LXZA 1XW5A 4YQMA 2V6KA 2XPDA 3QOUA 1URMA 3GL5A 1TU7A 2O87A 2VCVA 3APSA 4IN0A 1CQHA 2O8VB 5IPGA 1SL1B 1OC8A 1PGTA 4O92A 1BJXA 2G0FA 3VWUA 4JR4A 1XWKA 2HSHA 2YANA 1SK2A 2L59A 5HQPA 1YF0A 1KTEA 4HOJA 2DIZA 1HYUA 3DKSA 4POKA 3MSZA 1GH2A 4HZ2A 3F3RA 4ZBDA 2QSIA 4GQCA 3HZ4A 2OJLA 3KZQA 2H1GA 3AY8A 2WGRA 2G2QA 2LQOA 3E0UA 1WP0A 3BBYA 3CTGA 2B6MA 4RI7A 1O8XA 1A0RP 3FZ4A 3FEUA 3APOA 4MP4A 1XWGA 2IFQB 4HZ4A 1Y25A 2H72A 4F0CA 4ILFA 4MJEA 3HD5A 3UVTA 1EV9A 1K3YA 4G2EA 5DBQA 3A2XA 3GKNA 3KCMA 1V9WA 1SK0A 4ML6A 3OR5A 4MZBA 5KEJA 3LG6A 3CRTA 2V1MA 5C00A 1IYHA 4XRAA 2GQMA 3IPZA 3G7JA 2CA8A 4GSSA 5IO0A 1MEKA 2DMLA 1WWJA 4RQRA 3G7YA 4HQZA 4OFTA 6GSYA 5ELAA 1R5PA 3ERFA 3ME8A 2C3QA 1GRXA 2E7PA 4AGSA 4KUNA 1YKCA 1SU9A 1WOUA 2H73A 2IMKA 2L4CA 1OE7A 2FWFA 1A2JA 3R2QA 2V6OA 3EMPA 2WZ9A 2FA8A 5DQSA 3TJKA 1XVWA 3VURA 5ECRB 2YWOA 4TXOB 3FR3A 5EVOA 1T7PB 3ME7A 1TK0B 4KCAA 3ZITA 3RHBA 1H75A 1FVJA 1S3CA 1F3AA 4OFMA 2DSAA 3DMLA 4POMA 2H70A 2YWIA 2CZ3A 3VK9A 3CSIA 3TKSC 1I5GA 2TRXA 2H30A 3TKSA 4KW6A 4TKYA 1FB6A 5IO2A 2VD1A 2ZCTA 1HQOA 3UBKA 3GTUB 2N5AA 2NPBA 1TKDB 3TCOA 2YV7A 1AQVA 4IVFA 3J7Yk 5D9WA 1X9MB 2X8HA 4EDYA 5DVBA 2L5OA 1X5CA 1ILOA 2DMMA 1ON4A 2I4AA 2M80A 3H93A 5DJMA 2PUKC 3J7Yb 3TUEA 2LS5A 2VL9A 1ABAA 3KTBA 5KN3A 1OC9B 3QR6A 2LRNA 4N0ZA 1ST9A 2LJAA 3KJYA 3H4KA 3I9V2 4DVCA 5D96A 2VCZA 2WFCA 4J57E 3UVHA 1K3LA 3DYRA 2YNXA 2X99A 1SL0B 4ZBAA 1GSUA 4Q5QA 2VCWA 1YY7A 1DBYA 4QQ7A 5J4UA 1TDIA 1FO5A 3UL3A 3KIJA 4NPBA 2LKUA 4TR1B 2GSTA 5G1KA 5LCZA 1ZOFA 3KTLA 4CHSA 2PERA 2H0HA 5G1LA 2IJYA 2REMA 4IHUA 3M9KA 1XCCA 2VAFA 5A4WA 5HR1A 5ECHB 1K0NA 5CREA 3M8NA 3CMIA 5ECSA 3C73A 6GSVA 2WRTA 5L71A 2ALBA 4IBPA 5CYYA 4PNGA 3ZREA 5J41A 3UBLA 1NHOA 17GSA 1Z9HA 3DXBA 3DVXA 1W89A 2GZYA 4HEA2 2H75A 3IRAA 3O6TA 2BMXA 4GQFA 2WB9A 2I9HA 4I8BA 2V2GA 2AHEA 3TRXA 2IMEA 2DJ3A 3QFBC 2M72A 4Z7XA 4EF0A 5J5NA 1NHYA 2GZPA 2H19A 5CRDA 3GKXA 1SK1A 1YZXA 3CYNA 2PVQA 2FWHA 4Q5NA 2C1YA 4ULXA 4N30A 4TN8A 12GSA 2IL3A 5AIXA 3BD2A 5G31A 4D73B 9GSSA 3PR8A 3VWVA 4I5QA 3TJBA 2L57A 3A2WA 4E8EA 1R4WA 4O7HA 1ERTA 2JZTA 1M9BA 1PA3A 2FNOA 6GSSA 3ZTLA 1HNBA 1Z3EA 1BAYA 2GT5A 4QL7A 1B4PA 2BTOT 5CO3A 2RIIA 4XS6A 1TTZA 5KN1A 1A2MA 3GHAA 5B6MA 5DJLA 4HU7A 4KH7A 1DE1A 6GSWA 2JACA 5J9CA 4JZQA 2F51A 4QL9A 1VF3A 5ECNB 3GKMA 1V98A 4K0GA 2MMZA 4IQ1A 2GT6A 1USBA 2VCQA 11GSA 3HJOA 1YEXA 1X5DA 4PUAA 2L5LA 3EC3A 1QQ2A 3WGDA 3MNGA 1M0UA 1YKAA 2QC7A 4KB3A 4MMMA 1ZZYA 4WBJA 4IJIA 2WULA 3L9VA 2H1AA 4IJ3A 5IM9A 2F8AA 2Z9SA 3DIEA 3KMOA 3EU4A 1G0TA 3ZRDA 2I1UA 5A4VA 2RM5A 4G19A 1OKDA 2IPAA 2P31A 4XS1A 2B7KA 1SYRA 2EIOA 3RBTA 2LSTA 5IQYA 2H71A 5DQYA 3ERGA 3IE3A 2XBIA 1JZRA 1U6TA 5IMVA 5LD0A 3F0IA 3LFLA 5H5RA 4V2MA 4NWYA 4ECJA 5ABRA 4YQVA 2H1DA 2HZEB 5JCUA 5CAXA 2C0FA 3UARA 4IGJA 3GNJA 2VIMA 1ERWA 4GSNA 3GH9A 3GA4A 3CRUA 5AISA 3GV1A 2NVLA 5G5FA 4DSRA 1ZYEA 1GSDA 3IOSA 2R5GA 4EDZA 3FW2A 3L9SA 4KSOA 2YV9A 3VI5A 1BG5A 1DSBA 3CSHA 2QKEA 4G9HA 4OWYA 4K7NA 4XRDA 3IXRA 4YAPA 3DGQA 1G7OA 1V57A 4KGIA 1X9WB 1XPVA 1VF2A 2B3SA 3GX8A 3F4SA 2P5RA 5ECOB 1AC1A 1TK5B 1GWCA 1PD21 4L8EA 5DCHA 4DEJA 2XBQA 5DAKA 2HSYA 1XZOA 2K6VA 3QAGA 1HD2A 5D73A 2YWNA 1M7TA 3GFKA 3ZL5A 3UJ1A 1PRXA 5F05A 1EV4A 1XFLA 3I69A 2FUG2 3DD3A 1VF4A 3TOUA 5IMZA 1HNCA 4WXTA 4KX4A 2C3TA 2FD3A 1TW9A 2FWGA 1SJ6A 2C4JA 3EE2A 2MBSA 2GVPA 1ACVA 2HLSA 3QPMA 1T4ZA 5J3RA 5G5EA 4MDCA 2D2ZA 4GWRA 1GTAA 4TXVA 1U88A 1N2AA 5JWRB 1EGOA 3FR9A 2YZHA 20GSA 2VOCA 1K0DA 3IAM2 3KH7A 3PH9A 2VLVA 1M99A 1GTIA 5E4WA 1A8LA 3HVVA 4AJ8A 3JCML 2GSQA 4O5RA 1SKRB 2JSYA 2K18A 1PN9A 3QCPA 5GSSA 1RW1A 1XVQA 3EMXA 1SKSB 1G6YA 4ECBA 2DLXA 3WT2A 3L4NA 4J56E 4MJAA 3GX0A 4V2NA 2RUEA 3KGKA 3ZIJA 4HJ2A 3D4MA 4ISDA 3APQA 2FGXA 4TR4A 6GSXA 1G7EA 3EVIA 1PSQA 1JHBA 1SD9A 1SENA 3HZ8A 1A0FA 2C3NA 2MYGA 1AQWA 4L5OA 3IK7A 4MH3A 3Q18A 3EU3A 1V58A 4ZBBA 2X8GA 1MDKA 1UA5A 1QXHA 3LYKA 4DSSB 1AXDA 1JLWA 1O85A 2B5XA 1O7UA 5ECKB 5ELGA 2JZRA 2BJXA 1JFUA 1BX9A 4ZB8A 3VWXA 4N10A 3IC4A 1G6WA 4XS4B 5B8AA 2H76A 4EXJA 3LSZA 5EL8A 4OCEA 1QUWA 3TKQA 1XIYA 2OADA 5H5QA 3Q74A 1QMVA 3GUSA 4ZL8A 5G2ZA 3D6IA 2KP1A 1DE2A 2LNSA 2KOKA 3ISOA 1NW2A 1K3OA 4N0VA 5EPFA 5B6NA 2GSRA 1U3IA 3KEBA 3PGTA 4KNDA 4I97A 5GAPD 2LQQA 1TOFA 1PMTA 1B48A 3K8NA 1TI1A 2JL4A 4AJ7A 2R4VA 5DALA 1Z7RA 5ID2A 1UC7A 4YH2A 4HS1A 4YAVA 4TOPA 5ECMB 1ZMAA 4RQXA 1OAZA 3LXTA 3VI7A 3ZMLA 1SD8A 2H01A 4MH2A 4NAXA 2P0GA 2CX3A 5GZZB 1FAAA 1FVKA 4PQ1A 1A23A 1YDKA 2JADA 19GSA 1EGRA 4X0XA 2IIYA 2DJ2A 2WDUA 4MPGA 4K7IA 4ZILA 1JLVA 4TR3A 10GSA 4JR6A 1PX7A 5IMFA 4ZXGA 4GCIA 4EO3A 4J2FA 3KP9A 4WEYA 2VUPA 5A4UA 4EE0A 2IMFA 3H79A 4GF0A 3FKFA 4BVXA 3VFIA 3S9FA 2ES7A 2CT6A 4EL1A 1U3AA 1ZCPA 3KM6A 3C71A 1M9AA 4X43A 4MF6A 2DJJA 3KD0A 1M2BA 2H0IA 5ECLB 2JU5A 3O3TA 4HQSA 2VCTA 3GN3A 1F6MC 3SBCA 4PX1A 4WF4A 1XOAA 2EIQA 2OBKA 2ON5A 2WS2A 6GSTA 2DIYA 4IKHA 2FWEA 4JEDA 3TRQA 1KBNA 4Q5RA 1GULA 4OD7A 2DJ1A 1THXA 4IP6A 2MMAA 3ZFLA 1NSWA 2PBJA 4WETA 2K9FA 5ECIB 3TB2A 4K1FA 1OYJA 3IAS2 4PQHA 4EC0A 4FIWA 4K7OA 4KDXA 4RUVA 3A3TA 3QAVA 3LWAA 2AJQB 5GAND 2H74A 4NHZA 3HYPA 3IBHA 2FY6A 4IQAA 2CVBA 2GQKA 3M0FA 1JZOA 2FLSA 4XHMA 2CVKA 4CDOA 1TRVA 1TK8B 2JSZA 4NV2A 3US3A 1MD4A 3QMXA 5HR0A 4ECIA 3GIXA 2YWMA 3NIVA 2HI7A 2HRFA 4F2IA 3TDGA 5AN1A 5IMAA 3GSSA 4OO4A 2AUVA 2R2JA 2VL2C 4OMVA 5IOWA 3TRPA 2VL2A 2XC2A 3RHCA 3D21A 4FYUA 2C80A 2QGVA 3HCZA 3GURA 2E2GA 2J23A 4XCSA 4JBBA 2JZSA 5CRGA 5D8IA 3TOTA 5IMDA 1XOBA 3C8EA 2CAIA 1RK4A 4G10A 2LEGA 4TR0A 2HFDA 1AQXA 4FH8A 3TGZA 2L6DA 4MF5A 1V2AA 4BL7A 4BWSA 1B8XA 2IFQA 1X5EA 3HJPA 2AYTA 1EOHA 2WJUA 2A4VA 1AW9A 3UIWA 3FRCA 4Q5FA 1GSQA 1AIUA 4AF2A 3P7XA 4X1UA 4NXIA 3U5RE 3KP8A 5HR2A 4MJCA 1SYXA 1SKWB 3NOFA 1LU4A 1CQGA 4PQIA 2CZ2A 2AB6A 4GSTA 3GRXA 4PURA 2L6CA 3I43A 5JCWA 4F0BA 1XWAA 1R5AA 4GRFA 2VM2A 2KLXA 3IV4A 5F0GA 4JE1A 3CBUA 2ON7A 4MA9A 2PGTA 5ECQB 2C0EA 4JRRA 3N5OA 2F3MA 2HT9A 3CTFA 4PXOA 1TP9A 2WCIA 1J0FA 2H6YA 4IP1A 2A2SA 4TXOA 2HYXA 4I2TA 5JWOB 3L9UA 1EEMA 4CW9A 1S3DA 2VCXA 2NDOA 2CV4A 5G30A 4WR5A 1A24A 1O81A 3GYKA 1W4VA 3PINA 4BPYA 3DEXA 3FYGA 2GTUA 3QAWA 3ZIVA 4DSQA 3VPQA 3Q6OA 3D5JA 3W8JA 1EEJA 1XWCA 2KHPA 2PMTA 1PKZA 1FB0A 2HZFA 4MPFA 3Q19A 1GL8A 3V1WA 1T1VA 2H6XA 3GTUA 5HFGA 4KSMA 1GP1A 1GSYA 3H8QA 5FWGA 2OA7A 3A5WA 3TKRA 1FHEA 4KE3A 4LL4B 1QGVA 5JCGA 2C8UA 2FCHA 1GTBA 2V41A 3FR6A 2GZZA 3NZNA 1WMJA 1GSSA 4MLYA 1XWBA 2B1KA 2MZCA 1AUCA 4I6XA 2PPTA 1OC9A 4MK3A 2YZUA 1THOA 1XBSA 1I9DA 5LNKe 1Z6NA 2IMDA 5B8BA 3HXSA 2GSSA 1LBKA 3HJMA 2YJHA 13GSA 3G9BA 4O32A 4EVMA 1C72A 22GSA 2FHEA 2B7JA 3UEMA 4F82A 3IHQA 3EWLA 2RUFA 2O89A 4ZL7A 1KNGA 3LGCA 3LEFA 2OE1A 2R6KA 3SWLA 4TR1A 3GKKA 6GSUA 5H5SA 2LRTA 3U6VA 3F6DA 3GMFA 2YJ7A 3EYTA 4LMVA 3C7MA 2ZUPA 1GUKA 2OKAA 4K0NA 1WIKA 4N11A 4TRXA 4ZL9A 4HI7A 1GTUA 3O76A 5AIVA 5KN0A 2MMOA 2EC4A 1FOVA 1VRSD 1GUHA 2LJKA 1NM3A 1SJIA 1PQNA 3WYWA 3DWVA 2LNTA 3N9JA 2LUSA 3ZZXA 4JU5A 2PU9C 3M3MA 3WD6A 1ML6A 2PN8A 1IYIA 3MDKA 2OACA 2I81A 5B7CA 1WJKA 3UAPA 5FHIA 2E2MA 3GL3A 7GSSA 1M2AA 4ACSA 4YQUA 2CQ9A 3KMNA 4ZB9A 4WBRD 5GSTA 3E9JB 2RM6A 4EKZA 2V32A 1FG4A 2E0QA 2OE3A 1PKWA 4HUAA 1EP7A 5A5KA 2HE3A 4IW9A 4ML1A 4XTSA 1JZDA 4D73A 1Y6EA 4MF7A 1GUMA 18GSA 3FY7A 3HKRA 1B9YC 4FYBA 4NMUA 3KXOA 1TRSA 4BVYA 2YN1A 2CAQA 3ED3A 4MZWA 4TW5A 1Z6MA 2IWTA 1T3BA 3IR4A 1UVZA 4LMWA 1GLQA 1Q98A 1YF1A 3WGXA 2PWJA 3W6GA 5DAKB 3W8SA 5DDLA 2M46A 2H0GA 3D4TA 1F9MA 2YP6A 3LYPA 5IPHA 5J9BA 4KDYA 3TKSE 2OE0A 4K2DA 3HVXA 1O73A 3C1SA 3HHVA 3BCKA 1GSFA 4IS0A 1H4OA 2DC5A 1ERVA 2R37A 2B5YA 5ENUA 1XXUA 1K0AA 4L0WA 2A2RA 1ERUA 3L0HA 4PNFA 1R7HA 4OFNA 2XHFA 1O6JA 2ZNMA 4IELA 4NV5A 3RPNA 3FK8A 1XW6A 3DRNA 2B1LA 1F3BA 3M1GA 1YJ6A 4LL1B 4F03A 2P5QA 2F8FA 4XIHA 1OC3A 1OKTA 1GNEA 3HA9A 1TI3A 3P90A 2J9HA 2K8SA 5IOXA 5KN2A 1ZYQB 2L4QA 5DCGA 3F9UA 4L0UA 4V1Ag 3RDWA 1YQ1A 1GSEA 1N8JA 2H66A 2IN3A 4RI6A 2CX4A 3FHKA 2LRCA 1OVNA 5CP1A 4HJMA 3WGEA 1MD3A 2DJKA 2HZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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