3FK8A

The crystal structure of disulphide isomerase from xylella fastidiosa temecula1
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
131
structure length
131
Chain Sequence
ALNLPYDEHADAWTQVKKALAAGKRTHKPTLLVFGANWCTDCRALDKSLRNQKNTALIAKHFEVVKIDVGNFDRNLELSQAYGDPIQDGIPAVVVVNSDGKVRYTTKGGELANARKMSDQGIYDFFAKITE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of disulphide isomerase from Xylella fastidiosa Temecula1
rcsb
molecule keywords Disulphide isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Xylella fastidiosa
total genus 51
structure length 131
sequence length 131
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3fk8A00
2L6CA 3C7MA 4LMWA 5C00A 4XRAA 2GVPA 1HD2A 4OD7A 4OFTA 5LCZA 2H74A 3K8NA 4F0CA 4GTUA 3ERWA 3VPQA 2YNXA 3LQ7A 1ZL9A 1B4QA 5GSTA 1TI3A 1N8JA 2V41A 2OE0A 2VL2A 4XS6A 2PGTA 6GSUA 3QAWA 3ZRDA 4IP6A 4EF0A 1RQMA 2LNSA 2FA4A 4WKWA 1O8XA 2H1DA 3IE3A 3KTLA 1AUCA 3GHAA 1M99A 5DAKB 3DIEA 2XPEA 4DSSB 4EL1A 2GS3A 4FYBA 4O7HA 2IMKA 3GSSA 5H5SA 4WBJA 2HT9A 4PUAA 4AJ7A 1R5PA 2G0FA 5LNKe 2X99A 4D73A 5D9WA 3KM6A 4KSOA 1MTCA 2HSYA 2WFCA 3Q6OA 1GNWA 3GYKA 1SENA 2MMNA 3PR8A 3F9UA 2P31A 3GX0A 4EXJA 1ST9A 3US3A 1X9MB 4DEJA 3LSZA 3GX8A 2B7KA 2N5FA 2ZUPA 2I4AA 2JSZA 4JRRA 1SKSB 1VRSD 1B9YC 3GN3A 3IAS2 1XCCA 4NWYA 2VCXA 5JCUA 1FB0A 3L9SA 4ZB8A 3IOSA 3TKSE 3WGXA 3TKQA 2CT6A 3VURA 5J4UA 2IFQB 1AAZA 16GSA 2H76A 3ERFA 3F4SA 1C72A 2H0GA 2YZUA 3C1SA 1TTZA 5JWRB 1SJ6A 3EE2A 5IMZA 2AUVA 1MD3A 2X8HA 3ZIVA 5EVOA 4MJCA 3J7Yk 3M8NA 1ZYQB 4PQ1A 2OKAA 4BWSA 2OE3A 5KN0A 3QR6A 1T3BA 2WDUA 1GSUA 1QK8A 3E0UA 1K3YA 3PINA 1Z5YE 4X0XA 4WETA 5CRWA 3M0FA 3HA9A 3VK9A 1AQWA 2F8FA 3HD5A 1M2BA 3GRXA 4L0WA 4GXZA 1DUGA 1KNGA 1UC7A 4MK3A 1M7TA 5G5FA 1XWCA 2VAFA 3WYWA 1SL1B 3HCZA 1LBKA 6GSVA 4BPYA 3I6AA 2MBTA 4MF7A 2FD3A 3FZ9A 2TRXA 2LQOA 4ML6A 5ENUA 4NXIA 1ZYEA 2YOIA 4KDXA 3ZFBA 1GRXA 1K0BA 2EIOA 2C8UA 4HJ2A 4MJEA 5GSSA 4FYCA 1XOBA 1J0FA 2HRNA 5G2ZA 4JU5A 1VGLA 2REMA 1ML6A 3I9V2 3L0HA 2XHFA 4TVEA 3EINA 3C8EA 1TK0B 2DJ1A 5JCWA 4HU9A 3V1WA 2QC7A 1PSQA 1FB6A 2H1AA 2L57A 1SKRB 3KIJA 2VL2C 2AJQB 2I9HA 3APQA 5G31A 4BA7A 3TKSC 2E2MA 1FVKA 2DLXA 2NTOA 3DEXA 3EU4A 5HR1A 4G9HA 4Z7XA 3GKXA 10GSA 1GWCA 1H4OA 4V2MA 2VCQA 4EO3A 4ULXA 4P3YB 4V2NA 1AW9A 2ALBA 3TRXA 2GSTA 4ZXGA 2H71A 4FIWA 2K9FA 5IPHA 1J08A 2V6KA 1URMA 4I6XA 4MP4A 2VLTA 5JWOB 3LYKA 2PBJA 1AQVA 5ECRB 2H1BA 1B9XC 2YV9A 5E4WA 2VL9A 19GSA 4MH3A 4TRXA 6GSTA 4JE1A 1Z3EA 2PN8A 4HZ4A 4PNGA 1NSWA 3D0ZA 2B6MA 3IPZA 1XWGA 3MAKA 3NOFA 1PA3A 3TOTA 2YWNA 14GSA 3GKKA 4OCFA 1JZDA 1SYXA 3HVVA 3VWXA 4ACSA 1SK1A 2XBIA 2MMZA 4POBA 5KN1A 1IYIA 4TR4A 4D73B 1EEMA 2LJAA 1FO5A 1TU7A 4TXOA 3TRQA 2C0DA 3FY7A 2DIZA 1U87A 5KEJA 2ZCTA 3VPTA 5IOXA 3UAPA 1IYHA 3C71A 3UIWA 1SK2A 3KGKA 4HDEA 2C0GA 2OBKA 1T4YA 1Z9HA 1PGTA 5IMVA 5IIZA 1WMJA 2WRTA 4V2LA 2NVLA 2O8VB 5F8BA 4MLYA 2XPDA 1RK4A 2R4VA 3VLNA 2H01A 1TRUA 4MZBA 3E9JB 2E2GA 2R37A 1OYJA 2B3SA 2R3XA 2HZEA 3UARA 3WT2A 1VF4A 4N0VA 3GTUA 2JZTA 1R7HA 1ZCPA 4G2EA 2VCWA 3C1RA 3HZ4A 3W8JA 4ZILA 2GSSA 1X0RA 4GRFA 1A2MA 1BJXA 2LRTA 1GP1A 1WJKA 1SK0A 4TR0A 2OACA 4NV2A 1BG5A 2PWJA 1JZWA 1UVZA 3KD0A 4NHZA 2DJ3A 2PMTA 5JWQB 2C0EA 1X5DA 5EPFA 3GH9A 4K2DA 5B8BA 1TOFA 5G5EA 1XWKA 3CSIA 1GTIA 1PX6A 1FHEA 2HLSA 3QDNA 1VF2A 5INYA 4G10A 3QOUA 4JR4A 5G1KA 3A5WA 1ZGNA 1EZKA 2K6VA 1U3IA 5B7CA 1TI1A 4FH8A 1SU9A 4HI7A 4ZBAA 2B7JA 2AB6A 1V58A 3DGQA 3N5OA 2K8SA 2N5AA 3FHKA 1XW6A 5HFGA 3BBYA 4I5QA 1SD8A 3GL5A 1MDIA 3BCKA 3RPPA 2V6OA 4HJMA 3TKPA 4NMUA 1XW5A 4Q5FA 2K8VA 5HR2A 3DVXA 1GTUA 3F63A 1K0MA 4QQ7A 2CX3A 2HFDA 3TOUA 2FWGA 1Z6MA 3FR6A 2YANA 2PVOC 4KGIA 5D93A 2JACA 3FR3A 2OE1A 2DMLA 3ME7A 5HR0A 4MZCA 5D9XA 1ABAA 3TKSA 1G6YA 2YV7A 3CTGA 1GH2A 4KA0A 1ERVA 2IPAA 3F3RA 2FWFA 4IVFA 4L5LA 2YPMA 3ZYWA 2CVDA 3ZMLA 1M9AA 1G0TA 3QFBC 3F4RA 3UVHA 3M9JA 2CQ9A 3W8SA 4JZQA 4AJ6A 4XS4B 5CNWA 5ECOB 4N11A 1B48A 1V40A 2D2ZA 2FLSA 1E2YA 2IIYA 2NBSA 2M72A 5ELGA 2IWTA 1USBA 1THOA 1TW9A 1YY7A 5GZZB 3ED3A 3GIXA 3H79A 1G7OA 4LMVA 3EYTA 4PXOA 3DWVA 4ECIA 4HU7A 1V2AA 3QAVA 4K6XA 4TOPA 4OO4A 4XS1A 1YJ6A 2WCIA 1GUHA 4I2UA 4X43A 4JR6A 1OVNA 3GNJA 1A2JA 1T4ZA 4EE0A 2YWMA 3QD9A 4OO5A 4GWRA 1HYUA 4JEDA 2WJUA 1M2AA 4K7OA 1DSBA 4PX1A 5ECPB 3VWUA 4GSNA 1A23A 5HR3A 3EVIA 5ECMB 1TXXA 2FWHA 1UA5A 3JCML 2LTKA 5EY6A 5CRGA 4J2FA 4MCUA 2C3TA 1F37A 1EOHA 1DE1A 2CZ3A 1QGVA 4IQ1A 1MEKA 4EC0A 2LKUA 1R26A 2I1UA 2LNTA 1CQHA 1OC8A 1HNCA 4JBBA 2LV3A 3LXTA 1F2EA 1GTBA 3D22A 4WF5A 2OA7A 1YKAA 1O6JA 4E8HA 3MDKA 1JLWA 1O81A 5IMCA 4KNDA 3H4KA 4I2TA 4MJAA 2CZ2A 1A0RP 6GSSA 2C4JA 4KB3A 4FO5A 3CSJA 2VOCA 3UEMA 1FAAA 2YWIA 5AISA 4TXVA 3L9UA 3D6IA 3IAM2 5B6NA 4EVMA 1OC9B 2LQQA 3M3MA 2YZHA 3FRCA 1PKWA 2CA8A 4AJ8A 4ECJA 3ISOA 2PUKC 2R6KA 3FZ5A 4RUVA 1I9DA 3I69A 3BCIA 2VCTA 4I8BA 1WWJA 3TUEA 3TCOA 3CYNA 4GQFA 4MZWA 2DJJA 5G30A 3LGCA 1AXDA 4KE3A 1XBSA 1TRVA 2L6DA 2XBQA 3ZVJA 4MJBA 2AYTA 3RAZA 2KLXA 3IBHA 1YDKA 3IDVA 1DE2A 2LJKA 1GNEA 1OAZA 4L8EA 2VD1A 2O7KA 5ID2B 2IMEA 2E7PA 3IK9A 2HSHA 5F05A 1U6TA 2F9SA 1K0CA 5A5KA 5J9BA 4KH7A 1XZOA 2H66A 2NPBA 4GCIA 4IQAA 1PQNA 4ZB6A 3HVSA 5CYYA 1PL2A 1EEJA 3FZ4A 3ZITA 4ZL8A 2TIRA 2DMMA 2JSYA 3F8UA 2J9HA 4O92A 5DALB 3SWLA 2OADA 3U5RE 4WR4A 4MF6A 4TR1A 2Z9SA 1EOGA 2FGXA 2B1LA 3ERGA 5ECHB 3KJYA 2JU5A 5A4WA 2I3YA 1O8WA 2GSQA 1XFLA 3P8WA 1SYRA 5IPGA 4PUFC 4PURA 1GULA 1K0NA 3ZMKA 4MH2A 2K18A 4N10A 4Q5QA 5KN2A 5IMDA 4F2IA 3PH9A 1MDKA 1Y6EA 6GSXA 8GSSA 3UVTA 1TRSA 5L71A 4AF2A 2RUEA 5ECLB 1OKDA 2B5YA 5ECQB 3TB2A 1OE8A 3TJFA 1ERTA 2GGTA 3FEUA 4GSSA 3G7JA 4LLRA 2L59A 5DAKA 3VWWA 4GSTA 2LRNA 2H0IA 3G7YA 4DSSA 2KP1A 3EC3A 5AN1A 2PERA 3O3TA 3WGDA 3A2VA 1T1VA 4ID0A 4ZBBA 1X5EA 5FHIA 1NM3A 3GV1A 1G7EA 3F6FA 4N0ZA 3IR4A 4OCEA 1CQGA 1M2DA 4KDUA 5DJLA 4YAVA 1B4PA 5F06A 1QUWA 5ECNB 5J41A 3A2WA 5D8IA 1XW9A 2X64A 1N2AA 1ILOA 2HYXA 3VWVA 2RUFA 3EURA 3QCPA 4MABA 3UMAA 4ISDA 3L4NA 4KDYA 5J3RA 4RI7A 5HFKA 1Q4JA 3TRPA 3RHBA 4MMMA 2P5QA 3D4MA 3HY2A 6GSYA 1TDIA 1AIUA 3TJGA 1S3CA 2P0GA 4POLA 2F3MA 4IW9A 4NHWA 1V98A 4K0GA 2RM6A 2H19A 3ZIJA 5DCHA 4CDOA 20GSA 1O85A 1XOAA 1TK5B 3IV4A 1SKWB 1A8YA 3KP8A 3G9BA 2H1GA 2ON7A 13GSA 4XRDA 2H70A 3U6VA 4XTSA 2AV4A 22GSA 4LL1B 5H5RA 4RI6A 2HE3A 3G7IA 2X8GA 1OC3A 3TDGA 4KAEA 5JCGA 3GKMA 3GUSA 1XXUA 4KCEA 11GSA 3MSZA 1QQ2A 3HJMA 3A3TA 4WEYA 4TR3A 3PGTA 2VD0A 2LRCA 4LL4B 5DQYA 1LU4A 2VIMA 3LG6A 2VO4A 1G6WA 2HRFA 2O89A 3P90A 4YH2A 3LORA 2GTUA 1YQ1A 4QL7A 1EWXA 5DCGA 3IRAA 2FCHA 2YJ7A 6GSWA 5AIXA 2B5XA 3TJJA 2MYGA 1FG4A 3LWAA 5G1LA 4MF5A 2H73A 1X9SB 2V1MA 2J23A 2RIIA 4BL7A 4L0UA 2CAQA 4PQIA 3KCMA 2G2QA 1O7UA 5H5QA 4ECCA 1JZRA 2HZFA 4K7IA 2O87A 2CX4A 1PX7A 4HS1A 2F51A 4K1FA 1BX9A 5KN3A 1W4VA 3HJOA 2OBIA 4KSMA 2H0HA 3O76A 4K0NA 4KUNA 4DSRA 5DVBA 17GSA 4EKZA 1TJDA 5ELAA 3QAGA 2O85A 2GLRA 1TU8A 4DSQA 1X5CA 3GA4A 1ERWA 3MNGA 2VLUA 4EDYA 3TJKA 1SL0B 1WIKA 5CP1A 3P2AA 3HKRA 4F82A 1YKCA 3M9KA 3HDCA 1KTEA 1EP8A 3FYGA 5COHA 2BMXA 5HQPA 2H6ZA 2GZYA 1VF1A 2C3NA 2H8LA 3DMLA 2GZZA 2C1YA 1GUMA 2LJRA 2KUCA 4TR1B 4N30A 4HQZA 2IJYA 4G19A 4XCSA 4Q5NA 1JLVA 1F3AA 1ERUA 3DKSA 2FUG2 2H30A 4BWQA 2BTOT 5DDLA 4E8EA 5DJMA 2FY6A 2VCVA 1HNBA 5CO3A 3APOA 4PQHA 1EP7A 1JHBA 4GF0A 1BQ7A 1K3OA 4V1Ap 3KMOA 1T00A 2VM2A 3L9VA 3NZNA 2FWEA 4RQXA 3IHQA 3QFAC 1R5AA 1GSSA 5ECSA 2AAWA 1SJZA 3FW2A 2C80A 9GSSA 2H6XA 1NHOA 3LFLA 2A2RA 1HNAA 3ZTLA 5IO0A 4F9ZA 4F0BA 2AHEA 5AGYA 5A4UA 1NW2A 1BYEA 1PD21 1WP0A 4MA9A 1YZXA 1ZZYA 2HNLA 3FK8A 5IMFA 2KOKA 3ZVJD 5AIVA 3L78A 3APSA 2A2SA 2M80A 3UJ1A 2A4VA 1BEDA 2GQKA 3HJPA 1I5GA 3CXGA 1KBNA 3QMXA 4O32A 1JFUA 1FOVA 2OJLA 2HXKA 3P7XA 2KHPA 5GAND 3R2QA 1XVQA 4ZBDA 5CAXA 4TXOB 2GQMA 5IO2A 3Q18A 1F9MA 3O6TA 4IGJA 2QGVA 2DBCA 2LS5A 3H1NA 3Q19A 1M9BA 3UL3A 4PGTA 2DC5A 4MDCA 1FW1A 7GSSA 2CVKA 4KCAA 2QKEA 3BD2A 2VM1A 5B6MA 2MMOA 3DD3A 5D73A 2IMIA 1FVJA 3OR5A 2PVQA 1JZOA 4L5OA 3RDWA 2LUSA 5IMAA 2GQLA 2I81A 4KX4A 3CTFA 4FYUA 4OMVA 2WZ9A 1VF3A 1GLPA 3ZLPA 2ZNMA 4IJ3A 3KTBA 1B8XA 4GLTA 3GKNA 3BOAA 2YCDA 4OWYA 3KEBA 3CRTA 1J9BA 1PKZA 5CREA 1QMVA 5B8AA 2V2GA 2H6YA 2HZEB 1XVWA 4WR5A 3VI5A 2JZRA 3NIVA 4POMA 1WPIA 3CRUA 1UN2A 2F8AA 3GTUB 5ECKB 4HZ2A 3GMFA 2JADA 2L5OA 1XPVA 18GSA 3CSHA 2IMDA 5DBQA 3D4TA 5CRDA 2VL3A 1WOUA 5DQSA 1GSYA 1WE0A 5GAPD 4IP1A 3I43A 3UBLA 4XHMA 4CHSA 4LA1A 3BJ5A 4YQUA 5E59A 1A24A 4GQCA 3ZL5A 1EV9A 1TKDB 2GZPA 1KEBA 4IJIA 1DBYA 2BJXA 3GSTA 1SJIA 3EMPA 3TJBA 3M1GA 4HEA2 3A2XA 3J7Yb 3DRNA 1LJRA 3D21A 4ECBA 2JL4A 1W89A 2GSRA 2FNOA 1WRYA 2R5GA 3F0IA 3TGZA 1PMTA 2L4CA 5LD0A 1PRXA 1RW1A 3HHVA 3KP9A 4KW6A 4POKA 2EC4A 5F0GA 3DYRA 3ME8A 4YQMA 4IKHA 1GLQA 2DJ2A 3AY8A 2IN3A 5F07A 4ZL7A 2FA8A 4WXTA 2C3QA 3IXRA 3HVXA 5C04A 2RM5A 3VI7A 1ZOFA 2R2JA 1HQOA 2DIYA 2YWOA 3VFIA 1U88A 4OFNA 1GTAA 3FR9A 1F3BA 2EIQA 2WS2A 4TN8A 1BAYA 2VLVA 1ACVA 3LXZA 1XWBA 1A2LA 2N5BA 4F03A 2PPTA 4HUAA 4V1Ag 1EGOA 5D96A 3RBTA 1TP9A 1SL2B 4YAPA 3QPMA 3KZQA 4I97A 4HOJA 1S3AA 3FKFA 4K9ZA 1GSQA 2YN1A 4MPGA 4XS4A 3CBUA 4J56E 2M46A 3E3EA 4PNFA 2DJ0A 4HQSA 1E6BA 4DVCA 5FWGA 1Z7RA 2HI7A 5FT3A 2EIRA 2X8CA 3IK7A 2WULA 1H75A 2IMFA 4TKYA 2YP6A 5D9VA 1TRWA 1A0FA 4Q5RA 1K0DA 3S9FA 1U3AA 1K0OA 2DSAA 2V32A 2H75A 3IC4A 1GUKA 3EU3A 5EL8A 3CMIA 3Q74A 1YEXA 3UBKA 2NDOA 4X1UA 1YF1A 2XC2A 3TKRA 3C73A 3WD6A 1GSEA 1S3DA 4J57E 2L5LA 3LEFA 1EV4A 1PL1A 1XIYA 1MDJA 1GSDA 2IFQA 4BVXA 3FZAA 2H72A 4TW5A 5IM9A 3N9JA 2ES7A 4AGSA 4YQVA 4IBPA 3HZ8A 1QXHA 3GURA 3WGEA 2WGRA 5CRHA 4ZB9A 3WT1A 1PN9A 1OKTA 5J5NA 4QL9A 4EUYA 4ILFA 5HFIA 2B1KA 2MBSA 3W6GA 4ZL9A 2GT5A 4K8MA 4H86A 5IQYA 3HXSA 1T8EB 4RQRA 2MMAA 4OFMA 1Q98A 4IS0A 3LJRA 5J9CA 3MWHA 1O73A 3RHCA 1R4WA 3HYPA 2FHEA 1M0UA 1QFNA 1Z7PA 2VUPA 5D9TA 4O5RA 1OC9A 1X9WB 1NHYA 2CV4A 1TK8B 4CW9A 1YF0A 2YJHA 3H93A 3IA1A 2WB9A 2GDRA 1V57A 3KH9A 1AC1A 1OE7A 3KH7A 3ZZXA 4K7NA 1ON4A 2PU9C 2E0QA 1K0AA 1T7PB 2MZCA 3GFKA 3UOMA 1A8LA 3RPNA 1XWAA 1ZMAA 2KP2A 3KXOA 4NV5A 3DVWA 1SD9A 2JZSA 4WF4A 3LYPA 1EGRA 2GT6A 1Z6NA 4IELA 1K3LA 4ML1A 1V9WA 3H8QA 1F6MC 1AQXA 4IN0A 4BVYA 5IOWA 2QSIA 4ZIJA 4NPBA 2C0FA 3D5JA 2L4QA 2TRCP 3ZREA 3GH6A 5ID2A 12GSA 1YEPA 1MD4A 4IHUA 3F6DA 4XIHA 2CVBA 3GL3A 2RLIA 3DXBA 3EWLA 4WBRD 3F4TA 1THXA 1GL8A 3F3QA 3KMNA 5ECIB 2DJKA 2B5EA 4NAXA 2P5RA 2LSTA 2LEGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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