3HA9A

The 1.7a crystal structure of a thioredoxin-like protein from aeropyrum pernix
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
NAPRAAGHSEEVLEREASFSLTTIDGEVISLNNVGGDVVILWFMAAWCPSCVYMADLLDRLTEKYREISVIAIDFWTAEALKALGLNKPGYPPPDTPEMFRKFIANYGDPSWIMVMDDGSLVEKFNVRSIDYIVIMDKSSNVLYAGTTPSLGELESVIKSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords uncharacterized Thioredoxin-like protein
publication title The 1.7A Crystal Structure of a Thioredoxin-like Protein from Aeropyrum pernix
rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 51
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ha9A00
2LV3A 3K8NA 1Z7RA 4FYUA 1XWKA 1ZL9A 4BPYA 1JZDA 3IHQA 1WMJA 4XHMA 2K9FA 3NOFA 4IHUA 3GFKA 4N30A 2CT6A 4BVYA 4F0CA 1ZYEA 2M80A 4LL4B 3QMXA 1SL1B 3GL5A 7GSSA 2HSHA 3CSHA 2RLIA 3HVVA 2DMLA 3HXSA 3FR3A 4ILFA 4V1Ap 1UN2A 4XRAA 1FVKA 3VURA 3UEMA 1DSBA 4IKHA 1XIYA 1MD3A 4OD7A 2JZSA 3FR9A 2H72A 4CDOA 2C0EA 3HKRA 4ZB6A 2OE0A 5D9VA 5DALB 4HZ4A 1QK8A 2IFQA 1SENA 2H01A 4BVXA 2PBJA 4KH7A 4K1FA 5ELAA 2HLSA 3GYKA 1GUMA 1XBSA 1J08A 1TP9A 3CTFA 3LXTA 2N5AA 2WRTA 3FHKA 3TB2A 2XPDA 3LXZA 3QAWA 1A2LA 4JR4A 3Q6OA 2DMMA 5GAPD 1BG5A 4G10A 3IA1A 3IOSA 1YDKA 4KGIA 5DJLA 2RUFA 4J2FA 3UVTA 3L0HA 1T4YA 3FZAA 2LQQA 4HJMA 5F06A 4OO5A 2GT5A 2FD3A 2GS3A 2XHFA 3F4SA 2PVQA 1GUHA 3ERGA 3L4NA 2GSTA 3Q19A 5DJMA 3L9SA 3DIEA 4PQ1A 1M9BA 2QC7A 4PQIA 4GQCA 5ECMB 1NSWA 2VCXA 2DSAA 1PSQA 3HCZA 5LCZA 3QD9A 1QXHA 1YY7A 3F3RA 1T8EB 5CNWA 5F07A 1O8WA 3VFIA 1T3BA 4ZXGA 1TDIA 2NPBA 3VI7A 3ZLPA 1K3YA 2O85A 2AHEA 3TUEA 3GHAA 3KGKA 5B8BA 1FB0A 2H73A 1XOBA 2EIOA 3GUSA 3E9JB 4ZBDA 1ACVA 5KN3A 2VCZA 3RHCA 1XXUA 1OKDA 5B6NA 1GRXA 5IPHA 4JRRA 1VF3A 1XWGA 1G6WA 1PD21 5A4VA 1OE7A 3GTUA 5FWGA 5J3RA 1GTBA 2MYGA 2LEGA 3GRXA 2XBIA 1X9WB 2D2ZA 2LS5A 5G2ZA 3GA4A 2BJXA 1SL2B 1H4OA 1M7TA 2IMKA 1MTCA 1GSUA 2QKEA 2ZNMA 1B9YC 3ME7A 5HQPA 1A8YA 4KAEA 1USBA 3BCKA 4NWYA 1K0MA 3D0ZA 1TU7A 2H0GA 5CP1A 4X1UA 4MZCA 3A2XA 4KDYA 4QL9A 3HZ8A 1WJKA 2EIRA 3ZITA 4HOJA 3QPMA 2IMEA 3WT1A 3IPZA 4V2NA 2PMTA 3IK9A 5DCHA 2VLUA 3P90A 3RPNA 4FYBA 4EUYA 1F2EA 1Q4JA 5H5RA 3IAM2 1SU9A 2R4VA 2PN8A 6GSWA 1SKSB 2IIYA 4TW5A 2GTUA 1TRVA 2VCQA 2HFDA 1FG4A 1PMTA 2R2JA 3L9UA 5HR1A 1B4QA 1LU4A 1GSYA 2P31A 4IQ1A 5ABRA 2DJ3A 1E6BA 2E0QA 2I3YA 2L5LA 2VCVA 4WBRD 4CHSA 1I9DA 4MZWA 3LORA 4NV5A 3NIVA 2CX4A 5B8AA 1EGRA 3TCOA 3FZ5A 4IQAA 4MPFA 2X8CA 3UBLA 4EDZA 2YJHA 3KP9A 4MH2A 4OCFA 1T1VA 3GSSA 5HFGA 1EGOA 3HJOA 4YAPA 5IM9A 1YZXA 2PUKC 3EE2A 1GULA 3IC4A 2IFQB 2GZPA 2VL2C 3LYKA 4WR4A 3BJ5A 3DD3A 5DAKA 2VCWA 3DRNA 3LJRA 3TKQA 1V58A 3HYPA 1M99A 3D4TA 2R5GA 4Q5QA 2VCTA 1X5EA 3ZFLA 4I6XA 2ALBA 3ERFA 3BOAA 4V1Ag 2GZZA 5LNKe 2LTKA 2EC4A 1XWCA 1GUKA 2VO4A 4F03A 4F2IA 5DALA 4OFNA 4JBBA 2CX3A 3KMOA 2LJAA 3ZYWA 14GSA 2R37A 4EDYA 8GSSA 3E3EA 4F9ZA 2PU9C 3CRTA 1OC3A 3D6IA 3S9FA 2REMA 1R26A 17GSA 3WYWA 19GSA 4AJ6A 2CAIA 2O87A 4O5RA 2YV9A 3N9JA 13GSA 1WIKA 4NHZA 3DMLA 3UAPA 2WB9A 4KB3A 3A3TA 4XS4A 4QQ7A 2HT9A 3FEUA 2KHPA 4I8BA 4ECCA 6GSUA 4POBA 1JZWA 1U6TA 2C0GA 2ON7A 2GQLA 3F9UA 1AW9A 3TGZA 1Z6NA 4ECIA 5COHA 5F05A 1TOFA 1BJXA 4WETA 3RPPA 3DWVA 3LSZA 3GTUB 4JU5A 4WBJA 1N8JA 1TK8B 4PNGA 2FWEA 1M2DA 4ACSA 4EKZA 1GH2A 3P2AA 1S3DA 5JCGA 5ECPB 2I81A 2V6KA 3LEFA 2A4VA 1GSDA 4IJIA 1GSFA 4L5OA 4L5LA 2H1GA 5IO2A 4OFMA 4ID0A 1WE0A 2C3TA 2OE1A 3GKKA 2EIQA 2VL9A 3GIXA 1GNWA 4H86A 4Q5RA 2HI7A 3EVIA 1GLPA 1MDJA 3EINA 1Y25A 3TJGA 2DBCA 2H8LA 10GSA 3LYPA 3KEBA 1OC8A 5G1KA 2X8GA 3E0UA 2VLVA 2VL2A 3IK7A 4AJ8A 1AXDA 3TKSE 1V57A 2R6KA 2CV4A 1G6YA 4NXIA 2G0FA 2AUVA 1YEPA 2VOCA 3UJ1A 4GQFA 1N2AA 3APQA 1FB6A 2KP1A 4MCUA 2OE3A 1O85A 3GSTA 3KP8A 2WCIA 3IV4A 2WS2A 4EC0A 2WJUA 3DYRA 4I5QA 3D4MA 2XC2A 3HZ4A 1A2MA 1F37A 1YKCA 2B1KA 4MH3A 4EE0A 4ZB9A 5INYA 2LRNA 5ECNB 2JADA 4KE3A 2B3SA 5D9TA 3H1NA 2OBKA 2LRCA 4I97A 4MJBA 5DAKB 4GSTA 2JU5A 2IMIA 3ED3A 2V2GA 5A4WA 2KOKA 4TRXA 3UVHA 3ZMKA 1E2YA 3GKXA 1JLWA 2LSTA 3W8JA 3F6FA 2AYTA 3O76A 4K0NA 5HFIA 2BTOT 1SJZA 3FW2A 2I9HA 3I69A 3G7JA 4I2UA 1PGTA 2PVOC 2DC5A 3MSZA 1BEDA 5IOXA 1EOHA 3ZREA 4IN0A 3MAKA 3EU4A 1XCCA 1XFLA 3CBUA 2OADA 2L5OA 4G19A 1THOA 5AGYA 3FK8A 5DCGA 3QDNA 3O6TA 4ML6A 5GSTA 2DJ0A 4MJCA 1GWCA 2VD0A 3APOA 4HUAA 3DXBA 5FT3A 4IS0A 1AIUA 1JZOA 3RAZA 3DGQA 1W4VA 2O89A 1AAZA 4ZBAA 3TRXA 2H0IA 5C00A 3Q18A 1BYEA 2LJKA 4XS4B 2F3MA 2CZ3A 1MDIA 2FHEA 1G0TA 3I9V2 2HRFA 2M46A 1XOAA 2H70A 2YOIA 3WT2A 5ECLB 2PGTA 2YWMA 1QMVA 1VF2A 1T7PB 1GTIA 3DEXA 3LWAA 22GSA 3GL3A 4XS1A 2DIZA 5DDLA 3TKRA 1EWXA 1SKWB 2KUCA 4RUVA 1HD2A 1K0CA 1F9MA 5D9WA 3VWUA 3HJMA 1O8XA 2YWNA 1TU8A 1S3AA 2GSSA 4TR1A 1OAZA 2YZUA 2C80A 1GLQA 3U5RE 4ZBBA 2OACA 3W8SA 2VL3A 2CVDA 3L9VA 3WGEA 5HR2A 2AAWA 1DE2A 3P7XA 5G5EA 4WR5A 1EOGA 2YNXA 2H6ZA 4MJEA 5G5FA 4Q5FA 1YF1A 2DJ2A 2JACA 1TI3A 2CVKA 3TJJA 3TRPA 4N0ZA 3VI5A 2DJJA 4MP4A 1V2AA 2F9SA 1THXA 2ZCTA 4KSOA 5J9BA 1T4ZA 2JL4A 1PRXA 3ERWA 5IQYA 4MMMA 5FHIA 3PH9A 4D73A 1M2AA 1R5PA 2DLXA 4HDEA 11GSA 3CTGA 5C04A 2HZEA 4HS1A 2JZRA 3GKNA 6GSXA 6GSVA 2JSZA 5H5QA 3F8UA 1U88A 4OWYA 5J41A 3KMNA 1M2BA 5IPGA 4JR6A 4PUAA 5IMFA 3VWWA 2LQOA 3GX0A 3KTLA 2VUPA 4OCEA 1TRSA 4FIWA 3IRAA 1MDKA 2TRCP 3UARA 2A2RA 1V40A 1XVQA 3EURA 4JZQA 3D5JA 4MLYA 2L57A 5JCWA 4N11A 3V1WA 2C4JA 2OA7A 3F3QA 1YJ6A 1NW2A 4OO4A 1B8XA 3CSIA 2H6XA 5ECRB 1CQGA 4HU9A 5DVBA 2FGXA 1BX9A 1XWAA 2YCDA 3N5OA 2B7KA 2IWTA 1GL8A 3KZQA 1R5AA 2PWJA 3EMPA 3VWVA 4PQHA 4Q5NA 2K6VA 4I2TA 5G1LA 1O6JA 3H93A 4KW6A 4MABA 1ZOFA 5IMAA 1SD9A 5ENUA 4GCIA 1Z6MA 2ON5A 2H66A 3C1SA 1SK1A 1DUGA 2MMNA 2FA8A 3HHVA 4KSMA 1HQOA 1A2JA 1R7HA 1F3AA 2H0HA 3KXOA 4XCSA 3HD5A 4K7OA 2LNTA 3M1GA 3M3MA 4FO5A 4V2LA 2YWOA 3US3A 5IOWA 1DBYA 3OR5A 3U6VA 2IMDA 3M9KA 5CREA 3ZRDA 3C73A 1M9AA 4PURA 1X0RA 2BMXA 1MD4A 2FWFA 5A5KA 1WPIA 1AQXA 1TKDB 4GTUA 2TRXA 5JWRB 5ECIB 3TKSC 1A0FA 3RDWA 4PXOA 1OKTA 4J56E 4NAXA 5J5NA 3A2WA 1NM3A 1U87A 5KEJA 1EV9A 1T00A 1ZGNA 2N5FA 3FZ9A 9GSSA 1EEMA 1VGLA 4TR1B 5IMCA 5IMVA 3IBHA 2OJLA 3BD2A 4RQRA 4EO3A 4MZBA 1WP0A 1XW5A 5A4UA 2H1BA 5ECHB 1ERVA 3G7IA 4WEYA 1HNBA 4YQMA 3GNJA 3RBTA 3KJYA 5ECOB 1F6MC 1V9WA 3R2QA 4LA1A 3GX8A 4WF4A 4KDUA 1UA5A 4POMA 2MBSA 3EC3A 1SJ6A 1TK0B 4DSRA 4L8EA 1SYRA 4D73B 3VK9A 1ZCPA 4ULXA 4ECJA 1AQWA 4ECBA 2HZEB 3BCIA 1SKRB 4GRFA 2FWGA 1OVNA 5DBQA 3MWHA 4G2EA 4V2MA 2H76A 5IIZA 4EXJA 3ZZXA 1JLVA 2V32A 4YAVA 1GP1A 3UMAA 3SWLA 5B7CA 3TJFA 2IN3A 1YQ1A 5ID2B 1K0DA 4G9HA 2I1UA 2RM5A 3QFAC 4WKWA 2HYXA 5CAXA 2E7PA 1B9XC 1LJRA 1GTAA 4XS6A 2AB6A 1YF0A 2HNLA 5F8BA 4L0UA 3UBKA 1V98A 3CMIA 4TVEA 2RM6A 1J0FA 5HR0A 1MEKA 2H1AA 2IMFA 4IP1A 2MMOA 3QFBC 2L6DA 4JEDA 1WOUA 3M0FA 1O7UA 1W89A 2AV4A 4GLTA 4MA9A 3F63A 1GSEA 3LFLA 2PPTA 3C8EA 1JHBA 2J9HA 3G7YA 4PUFC 4BL7A 3TKPA 2WDUA 3FYGA 2K18A 2VM2A 4DSSA 5CRHA 1QQ2A 2CVBA 2ZUPA 6GSYA 2MBTA 2GVPA 3TKSA 3C1RA 1HYUA 3L78A 1U3IA 3KH9A 4ZIJA 1URMA 3HY2A 1GNEA 1BAYA 1XWBA 4J57E 5EPFA 3MNGA 2IL3A 2H1DA 4EF0A 4NPBA 1VF1A 5CRGA 3ME8A 3HJPA 1EV4A 2DJKA 1AC1A 4N10A 4IGJA 2DJ1A 4K2DA 4TR4A 4XIHA 1UVZA 4X0XA 4KUNA 4N0VA 5D93A 4NV2A 1XVWA 2FCHA 1PX6A 2MMAA 2V41A 3APSA 2JZTA 4IVFA 3TOTA 3HVSA 4TN8A 16GSA 2VIMA 1K3OA 2MZCA 3GN3A 4IW9A 4GSNA 2B1LA 4LLRA 1OC9B 2K8VA 2MMZA 3C71A 1K0AA 3PINA 2HZFA 2HRNA 4WF5A 1ILOA 1EP8A 3UL3A 2QSIA 2OKAA 2WGRA 1JZRA 2P5RA 2YJ7A 4ML1A 2P0GA 4FYCA 3LG6A 1AQVA 3ZL5A 5ECQB 3JCML 4DVCA 4K7NA 1VF4A 2YN1A 1GTUA 12GSA 2H75A 3MDKA 4KCAA 5DQSA 3VPTA 3J7Yb 5GZZB 1A23A 3CRUA 1ERWA 1A0RP 2J23A 1SD8A 2NTOA 2YP6A 2F8AA 1XPVA 2RUEA 2DIYA 2V1MA 5HFKA 1PA3A 5IO0A 3IR4A 4RI7A 2WZ9A 4TR3A 1PX7A 4Z7XA 2CAQA 1DE1A 2YV7A 6GSSA 4K8MA 1WWJA 5AIVA 4FH8A 2B5EA 2C3QA 5D96A 2C0FA 1Q98A 2X8HA 2GDRA 2QGVA 5CRWA 3ZTLA 1YKAA 5KN0A 4ZILA 2FY6A 4MF7A 1ZMAA 1KEBA 2WFCA 1TJDA 5G31A 1FHEA 3ZMLA 5ECSA 5D9XA 3QOUA 2E2MA 5GAND 1ZZYA 1AUCA 3BBYA 5GSSA 1B48A 4HQZA 2C1YA 4ZL8A 2FA4A 1Z3EA 3HDCA 1PKZA 3M9JA 2H30A 3EU3A 1K0BA 1C72A 3WGXA 4MDCA 2FWHA 2FNOA 2O7KA 4TXOA 3ZIVA 4GXZA 1IYHA 1FW1A 4KCEA 2E2GA 4IELA 2CZ2A 2C0DA 1TK5B 1X5CA 1ST9A 2VLTA 2B7JA 4HI7A 3KCMA 5CO3A 3EMXA 4DSQA 3ZVJD 3F0IA 2X64A 3TRQA 3FZ4A 1M0UA 4O32A 4PNFA 2V6OA 3GURA 3EYTA 3J7Yk 3I6AA 4QL7A 20GSA 2NBSA 5ID2A 2GLRA 5KN2A 2NDOA 5DQYA 1JFUA 4BWSA 2A2SA 4LMVA 5JWOB 2AJQB 4CW9A 2VAFA 2RIIA 3A2VA 4DSSB 1Y6EA 4MF5A 1G7EA 1PN9A 5EVOA 1U3AA 3FR6A 5J9CA 2I4AA 1OE8A 1XW9A 1J9BA 4HZ2A 3A5WA 5AISA 2L59A 4LMWA 5D73A 2VD1A 2B5XA 3IXRA 3KIJA 3PGTA 3WGDA 2N5BA 4OFTA 4GSSA 2Z9SA 1R4WA 1PL2A 5EY6A 4NMUA 2LNSA 1K0OA 5JWQB 1TI1A 3G9BA 1G7OA 1ON4A 3KD0A 4KX4A 1TXXA 3P8WA 4KNDA 4XRDA 1Z5YE 4AJ7A 4WXTA 4K7IA 3KM6A 4ZB8A 4X43A 4TKYA 2F51A 2B5YA 2WULA 2GSRA 2KP2A 2PERA 2KLXA 1FVJA 4YQUA 2L4CA 1B4PA 3ZVJA 3UOMA 1HNAA 4MK3A 2GGTA 5IMDA 3D21A 3GKMA 1K0NA 4HJ2A 4KA0A 2LRTA 4AF2A 1FAAA 3C7MA 1EP7A 1KTEA 2IPAA 4HEA2 5G30A 1NHOA 2GZYA 3VPQA 5F0GA 1IYIA 5E4WA 1XZOA 4EL1A 2C8UA 4MPGA 3H8QA 2H19A 3KTBA 1WRYA 4DEJA 1VRSD 5J4UA 4TR0A 4PGTA 3ZIJA 3PR8A 3AY8A 1ABAA 3M8NA 1RW1A 1XW6A 1RQMA 3KH7A 3NZNA 2YWIA 4K0GA 1OC9A 4TOPA 3CSJA 1K3LA 4RI6A 1RK4A 3WD6A 1O81A 3F4TA 3HA9A 1SYXA 3FRCA 2H71A 1SK0A 4F82A 1ERTA 1PQNA 4IP6A 3QAVA 3GV1A 1SJIA 1PL1A 1SL0B 2HSYA 3ISOA 4POKA 3IAS2 2TIRA 4K9ZA 1TW9A 5ECKB 4BA7A 1KNGA 3CYNA 4E8EA 2YANA 5AN1A 3FKFA 1O73A 3RHBA 4PX1A 2F8FA 2FLSA 2K8SA 4O92A 3SBCA 2GSQA 3QAGA 1BQ7A 1Z7PA 1X9SB 2LKUA 1OYJA 4GF0A 2YPMA 3VLNA 5ELGA 5LD0A 4L0WA 5E59A 5EL8A 4AGSA 3QR6A 3H79A 2XPEA 2L4QA 1PKWA 4NHWA 5D8IA 1QFNA 4RQXA 1TRWA 2P5QA 4POLA 2GQKA 5HR3A 6GSTA 2C3NA 1FOVA 4O7HA 1KBNA 4TXVA 1H75A 5JCUA 4TXOB 2CQ9A 3TJKA 3GH6A 1CQHA 3D22A 1QUWA 4GWRA 3Q74A 4MJAA 4BWQA 1TTZA 18GSA 3TJBA 4HU7A 2VM1A 3TDGA 2R3XA 4JE1A 4K6XA 1Z9HA 3DVWA 3EWLA 4KDXA 1TRUA 1A24A 2NVLA 3QCPA 4IBPA 2H74A 2JSYA 1GSSA 4MF6A 3LGCA 4HQSA 1EEJA 5KN1A 3IE3A 1A8LA 1LBKA 3I43A 1GSQA 4ZL7A 1UC7A 4P3YB 1ML6A 3UIWA 2M72A 1X5DA 2FUG2 3F6DA 2LJRA 4ZL9A 3DKSA 2O8VB 2X99A 4YQVA 3H4KA 3VWXA 4XTSA 2GT6A 5CRDA 2L6CA 2G2QA 3HVXA 3W6GA 1X9MB 3ZFBA 2LUSA 3FY7A 3IDVA 1ERUA 2CA8A 1EZKA 4LL1B 4OMVA 2OBIA 5IMZA 3TOUA 2B6MA 1FO5A 1F3BA 4E8HA 2IJYA 1YEXA 1ZYQB 1QGVA 5L71A 4YH2A 1HNCA 3O3TA 3DVXA 3GMFA 5B6MA 5H5SA 2YZHA 3GH9A 4IJ3A 4ISDA 1SK2A 3F4RA 2GQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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