3HA9A

The 1.7a crystal structure of a thioredoxin-like protein from aeropyrum pernix
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
b'NAPRAAGHSEEVLEREASFSLTTIDGEVISLNNVGGDVVILWFMAAWCPSCVYMADLLDRLTEKYREISVIAIDFWTAEALKALGLNKPGYPPPDTPEMFRKFIANYGDPSWIMVMDDGSLVEKFNVRSIDYIVIMDKSSNVLYAGTTPSLGELESVIKSV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords uncharacterized Thioredoxin-like protein
publication title The 1.7A Crystal Structure of a Thioredoxin-like Protein from Aeropyrum pernix
rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 51
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ha9A00
4HQSA 1F9MA 1GSSA 2WZ9A 5AISA 1YY7A 2KHPA 1OC9B 3BD2A 5CO3A 1EEMA 5IMFA 3L78A 4WR4A 2YANA 3D4TA 1O7UA 2YJHA 1ZGNA 5A5KA 3GN3A 2RUEA 1F37A 5B8AA 2ON5A 1AAZA 1X9WB 2LQOA 4PNFA 2FA4A 1DUGA 3QMXA 4OFTA 3U6VA 2IFQB 2YNXA 3KGKA 3ME7A 4K2DA 3WGEA 5G30A 2VD1A 2LSTA 4KAEA 4H86A 2VL9A 4GWRA 1ABAA 2OE3A 3ED3A 1JZWA 2OJLA 4LMVA 4BWSA 1XWGA 4WF4A 2C0FA 2GSQA 1EOHA 2F9SA 5IMZA 2AJQB 3I9V2 2JZSA 3GL3A 1PQNA 3LEFA 1ON4A 3GL5A 3HJMA 4ZL8A 4JR6A 3KMOA 3FHKA 2D2ZA 2GZPA 4MCUA 1LU4A 2GT6A 1X9MB 1DBYA 2HSYA 3WGDA 1XWBA 3TGZA 3L9VA 3IV4A 3TKSE 3C7MA 19GSA 3LYPA 2VM2A 4MF5A 1T7PB 1GSDA 5GSTA 3FRCA 1ST9A 2I4AA 1EZKA 3FZ5A 3UJ1A 2MMZA 2FY6A 1I5GA 3CYNA 1TRUA 2L5OA 3JCML 3WT1A 4MP4A 4AJ7A 5JWRB 2A2SA 4D73A 3ZREA 4G19A 4Q5FA 2I3YA 3IA1A 1TDIA 3VI7A 1BJXA 3BOAA 2YV9A 2AAWA 4YQMA 5AGYA 1O8XA 2R3XA 4DSSB 1TI3A 2WB9A 4Q5NA 14GSA 4ZBBA 1A0FA 2VIMA 4RI6A 5C04A 5IPGA 2H0HA 3D4MA 4IQ1A 2J23A 2L5LA 4ZIJA 3M8NA 3D21A 3HVSA 2X8CA 4EL1A 2AYTA 3CBUA 2K9FA 3EU3A 4OD7A 2JL4A 1GSEA 5DJLA 18GSA 3IE3A 4ZB9A 2I9HA 2O89A 3HJOA 4PUFC 1ML6A 1WP0A 4O5RA 4OO4A 3IOSA 2PVOC 2VCXA 3HA9A 2I81A 4MH2A 2CX3A 1ZCPA 5IOXA 1TU8A 1XWCA 4MZCA 4DSQA 1Q4JA 1G6YA 2JADA 2LRCA 3DWVA 3G7YA 3NIVA 2PGTA 4ZL7A 3EC3A 4GSTA 2H0GA 3ZIJA 1ZYQB 2HZEA 2GGTA 2LV3A 3LWAA 3J7Yk 1Z6MA 1JZRA 2DBCA 3QDNA 5IPHA 2IMDA 4MH3A 2R6KA 2IMFA 4IN0A 1EP8A 5G2ZA 2OBIA 4MJAA 1A2JA 4K1FA 2DJ3A 4IJ3A 1H4OA 1LJRA 2MMNA 3OR5A 3FR3A 2YJ7A 4JR4A 1FAAA 1EGRA 1T1VA 2IMEA 3EURA 1GRXA 5EY6A 3S9FA 3A3TA 4BVYA 3CMIA 5L71A 1T3BA 3UVTA 1M2BA 5DALA 4YQVA 5DDLA 2QKEA 3GH9A 1NW2A 1GL8A 2K8VA 3FZ4A 2AB6A 2H1DA 3PR8A 1SL2B 2DIZA 1V98A 3N9JA 3F4SA 3D22A 2VD0A 3ZFBA 1K3YA 4YAVA 4GQCA 3CRUA 1R7HA 3TDGA 1XOAA 3LXTA 5KN3A 5LD0A 5ID2A 4ECIA 3VWWA 3TCOA 4GF0A 3F0IA 12GSA 2E2MA 5A4WA 2E2GA 2H1GA 2CVKA 2H75A 3GA4A 5FT3A 2PN8A 3VFIA 4ZB6A 1BYEA 3IAM2 2WS2A 2R4VA 4RUVA 1XCCA 3KCMA 1FG4A 2XBQA 4K0GA 6GSVA 2NTOA 4CW9A 1T4ZA 3SWLA 2C80A 2FUG2 4KX4A 3WT2A 3F4TA 2VLUA 1CQHA 2WGRA 2K6VA 4TKYA 2NVLA 3FK8A 2VOCA 5CREA 1FOVA 4OWYA 4EC0A 4D73B 5ENUA 4HOJA 3WYWA 2O85A 3GTUA 4F9ZA 3C1SA 5DJMA 4KCEA 2VUPA 1RQMA 3F4RA 2HFDA 3ZVJA 4TR3A 2GDRA 3SBCA 2C4JA 1KBNA 4MZWA 2IIYA 1XWKA 3KD0A 4KCAA 1SK1A 5ECRB 1NHYA 1N8JA 2DLXA 1NSWA 3H79A 3QAGA 3GUSA 2IPAA 1GUKA 4QQ7A 5CRWA 3HVVA 1AIUA 3PH9A 4PQHA 4HDEA 3VWXA 3ZMLA 3LFLA 2XC2A 1ERTA 2YV7A 2H71A 2CX4A 3H4KA 4V2MA 1TK8B 3DKSA 1B4QA 1K0AA 4IW9A 2DIYA 3TRXA 2HRNA 5ABRA 2I1UA 5B7CA 3F3QA 2P5QA 3TOTA 2YWIA 4G2EA 4PUAA 1PL1A 3EINA 4L5LA 2OE1A 2BJXA 1TI1A 5CRGA 3ERGA 2H72A 1U87A 4ISDA 3D5JA 2HZEB 3A2WA 2XHFA 3GSTA 4MF6A 5HR0A 4N0VA 3EYTA 1MDKA 4CHSA 5J4UA 4E8HA 4GRFA 4HUAA 4BWQA 3EMXA 2Z9SA 2HNLA 3IRAA 1O6JA 3D6IA 1ERWA 3I43A 2H30A 2B1LA 5F06A 5ECSA 1HQOA 3G9BA 3MWHA 3GV1A 1FVJA 2CZ3A 1XPVA 4X1UA 3P2AA 5DALB 2DSAA 2H19A 3P8WA 1B9XC 1V57A 4I2UA 1QK8A 2FHEA 3LGCA 2VL2C 2TRCP 4JBBA 1GWCA 1NHOA 1ACVA 6GSTA 4HU7A 6GSUA 2GSRA 5AIXA 4AJ6A 1THXA 1IYHA 2E0QA 2YOIA 3BCKA 4TR1A 4YQUA 4FYUA 3Q18A 5KN0A 1URMA 1GLQA 2RM5A 4XRAA 3UAPA 2HSHA 3C73A 4MJCA 2H6ZA 3HHVA 3DYRA 4L0UA 1MDIA 2C1YA 4MMMA 4ACSA 1OE8A 3PINA 1XVQA 2WJUA 2B5EA 5HFKA 1XIYA 1XOBA 4L5OA 1FHEA 4PX1A 1H75A 1T4YA 1TJDA 2N5AA 3ZMKA 4E8EA 4GXZA 1AXDA 3F3RA 2LNSA 3W8JA 2LNTA 1GUMA 1YEPA 3F6DA 2KLXA 1PMTA 1EWXA 1R4WA 1JLWA 2GSTA 2CA8A 4V2NA 16GSA 5IO2A 3IAS2 2JACA 5B6MA 3RDWA 1OYJA 3H8QA 2BTOT 3A5WA 2GQLA 2YZHA 1DSBA 3APSA 1OKTA 2KUCA 4TXOA 2A2RA 4F2IA 2H01A 3CSHA 4PQIA 2MYGA 4ZILA 1Y25A 2V6KA 3GTUB 2RUFA 22GSA 2C0EA 5H5RA 3DVXA 1TP9A 3KTBA 4ECBA 11GSA 2WCIA 1GUHA 3AY8A 2M72A 3GHAA 2VAFA 5DCGA 1O81A 3P7XA 4Z7XA 1K0CA 6GSSA 1XBSA 2GT5A 4V1Ag 1OC8A 2VL3A 2VCWA 4EVMA 2CAIA 5G31A 2EIQA 5IMAA 1K0BA 1SJ6A 5KN1A 3QPMA 2LEGA 5ELAA 3GRXA 3TRQA 3K8NA 3FR9A 3BJ5A 3LYKA 2NBSA 4MPGA 4V2LA 2C3QA 4J56E 4WBRD 4PXOA 3VURA 5GAPD 2LTKA 4KA0A 5IMDA 2B7JA 4DEJA 4ID0A 3GKNA 3HD5A 2VL2A 4MPFA 1G0TA 3FYGA 3UL3A 1UA5A 2C3NA 5CNWA 1UC7A 1EV4A 1Z3EA 1QFNA 3LXZA 1F3AA 3ZIVA 2ZUPA 4HEA2 4IHUA 3CSJA 1RK4A 2NDOA 1GNEA 3NZNA 1FO5A 4XCSA 3FY7A 2GS3A 1WIKA 4AGSA 2VO4A 1GP1A 5ECIB 3CTGA 3MNGA 2DJKA 1M99A 5E4WA 2GLRA 5ECMB 2HT9A 3VPTA 1X0RA 4KUNA 2F8FA 4GCIA 1A2LA 1V40A 5JCUA 3TB2A 4KNDA 3HVXA 4IQAA 3GKKA 4KSOA 1MEKA 2HI7A 3VWUA 2NPBA 2OE0A 1MD3A 4NMUA 4J57E 1GTUA 2DC5A 1SYXA 3APOA 2C8UA 8GSSA 4ZL9A 5JWQB 2CVDA 2HE3A 13GSA 1GULA 1UVZA 2R5GA 3CTFA 5CRDA 5D9XA 2B3SA 3DGQA 2PVQA 2GZYA 2B1KA 2JSZA 2GVPA 3IBHA 3Q19A 1PKZA 2H1BA 3QOUA 4F0CA 3RBTA 3HZ4A 4EF0A 2LQQA 2KP1A 1MTCA 4TR1B 2N5FA 4NHZA 1WWJA 1X5CA 1CQGA 4EO3A 4J2FA 3DVWA 1ZYEA 3LQ7A 1DE1A 2H8LA 1OE7A 4POLA 4JU5A 3F6FA 4ECJA 5J9BA 3FZAA 4XRDA 1IYIA 2LRNA 1HNBA 1ERUA 2QGVA 4IBPA 2N5BA 1T00A 1QQ2A 3DIEA 3GKXA 2LS5A 3WD6A 1KEBA 5GZZB 1K3LA 4XS6A 3FW2A 4O32A 3CXGA 3WGXA 3LJRA 4OFMA 1EV9A 4QL7A 3KP9A 5D96A 3L9UA 4PQ1A 2GQKA 3M0FA 1QXHA 4TXOB 1TW9A 1B8XA 3C71A 1O73A 4N30A 3V1WA 5F0GA 5D93A 4BL7A 4TXVA 3D0ZA 4GSNA 4HS1A 4GTUA 1PGTA 2FCHA 5ECHB 5HFIA 4EE0A 2XBIA 4PNGA 1TRVA 3HZ8A 4TVEA 1WJKA 5HR1A 2CQ9A 3HKRA 1EGOA 5B8BA 1HD2A 3NOFA 4HJMA 1F3BA 2VCVA 1FW1A 1TKDB 3KJYA 4XHMA 2C0DA 3BCIA 4N0ZA 2F3MA 5AIVA 1O8WA 4P3YB 1M7TA 2V41A 3QFBC 1TXXA 3J7Yb 4F82A 1GSUA 1PA3A 3C1RA 1X5EA 3GNJA 1A8LA 3E0UA 3G7JA 2ZCTA 3LORA 20GSA 1JZDA 4TOPA 1K0MA 2HYXA 5FWGA 3O3TA 2DMMA 1QUWA 2AHEA 4MJEA 4DVCA 4FIWA 1TRWA 3ZFLA 2JSYA 4FYBA 3O6TA 4JEDA 2FD3A 2O7KA 4LLRA 3UARA 1WE0A 3EMPA 4JZQA 4XTSA 5ECNB 3TKPA 4KDYA 1PN9A 1A24A 2PERA 2M80A 3IC4A 1XVWA 2QSIA 1QGVA 1SENA 4NV5A 5IO0A 2DJ0A 2IJYA 2VLTA 4TR0A 3ERFA 3I6AA 3GIXA 2IMKA 5JWOB 3TKSC 2L6DA 2VCTA 2B6MA 2AUVA 2E7PA 3GMFA 1ZL9A 1AC1A 3TJKA 4PGTA 1A8YA 1SYRA 1SD9A 3FEUA 1U3AA 1B4PA 3P90A 1VRSD 1ZMAA 3KP8A 1TTZA 4RQXA 9GSSA 4Q5RA 4IGJA 1YF1A 5DBQA 1J9BA 1FB6A 5F8BA 3GKMA 1BX9A 1A0RP 3HYPA 2L59A 4I97A 2X8GA 4YAPA 4FYCA 3EVIA 1LBKA 5LNKe 2GTUA 1GTAA 4KDUA 2R2JA 5HQPA 1NM3A 3GURA 1XW5A 1SU9A 4KDXA 1YKAA 1R5AA 3ZL5A 4HZ4A 1THOA 2VM1A 3IPZA 4WEYA 2OA7A 5EVOA 2CV4A 1GSQA 4I5QA 1J0FA 3ZITA 1JZOA 1JFUA 3QAWA 4KH7A 1AQWA 2YN1A 2CT6A 4GLTA 4WETA 2B5YA 3RPPA 2O87A 4LL1B 2YWOA 2IN3A 2MMAA 5EL8A 2FA8A 1PRXA 4OCFA 1C72A 3LG6A 1B48A 1JHBA 3W6GA 4GSSA 2IWTA 4V1Ap 5J41A 4EDZA 3TJFA 5LCZA 4K7IA 1Q98A 4K9ZA 3C8EA 3MSZA 4WKWA 1MDJA 2HRFA 4IELA 2VCQA 3FKFA 3RAZA 1R5PA 3KEBA 5ECPB 4ULXA 2YP6A 4HU9A 1X9SB 1DE2A 4F0BA 3TKSA 1YEXA 1XW6A 4EDYA 2TRXA 1FVKA 4NWYA 5GSSA 5IQYA 2CZ2A 2L4CA 4IVFA 2J9HA 3UBKA 3DXBA 1USBA 5G1KA 5H5QA 3RHBA 3KH7A 3N5OA 5GAND 3HDCA 3QAVA 3R2QA 5CYYA 4BA7A 4IS0A 1PX6A 4WR5A 4X0XA 1TRSA 1TK5B 1XXUA 1FB0A 3KH9A 1GTIA 1VF3A 1GLPA 5IM9A 3E3EA 5ECLB 3TJGA 4IP1A 1W89A 1GSYA 1BEDA 2AV4A 1JLVA 3F9UA 1A23A 3EU4A 1YQ1A 3VLNA 1I9DA 2PMTA 5CAXA 3HXSA 2ZNMA 2H0IA 1HNAA 1M2AA 2L6CA 1K3OA 4MK3A 4ECCA 3U5RE 1M2DA 4G9HA 2FWHA 4MLYA 1EEJA 5FHIA 4MABA 2WULA 2WFCA 4ML6A 3TJBA 4RI7A 3E9JB 4O92A 2A4VA 1OC3A 2JZTA 2V1MA 5DAKA 2XPEA 1U88A 4K8MA 1WRYA 2ES7A 1U6TA 1OAZA 3KTLA 3H93A 1M0UA 3TKQA 4YH2A 2C3TA 2L57A 4JE1A 3W8SA 3DEXA 2PUKC 4I8BA 1E2YA 2WRTA 5F05A 2FWFA 2H74A 4POMA 5HR2A 6GSWA 1BQ7A 1WOUA 4IJIA 4HZ2A 5AN1A 3LSZA 1PSQA 5J3RA 3L4NA 2LUSA 2REMA 2OACA 3ERWA 2F8AA 2P0GA 5D9TA 4HJ2A 3IXRA 1U3IA 5JCWA 3ZZXA 3QFAC 2PBJA 5G5EA 4ZB8A 4TRXA 4OO5A 4BPYA 1WPIA 1F6MC 2OBKA 4XS4A 7GSSA 4HI7A 5ECQB 1SKSB 2P31A 2LJRA 1Z6NA 3VI5A 5F07A 5DCHA 1YKCA 3ZRDA 2YCDA 1PKWA 1SD8A 4DSRA 1YZXA 1PD21 1T8EB 2IMIA 4EUYA 2KOKA 3GYKA 4K7NA 3Q74A 3VWVA 3PGTA 4LA1A 2CAQA 3KIJA 5INYA 2CVBA 1O85A 2PWJA 1EOGA 4POBA 4NXIA 2YWNA 5D9VA 17GSA 4OFNA 4LMWA 2RLIA 1Z5YE 1K0OA 2HZFA 2H6XA 4KW6A 3VPQA 1XWAA 1K0NA 4G10A 4ZBDA 2X8HA 1SKRB 2R37A 2DJ1A 2ON7A 2FWEA 4NHWA 1F2EA 1PX7A 3US3A 4K6XA 2H76A 1AQXA 3GX8A 3ZYWA 2LJKA 3M9JA 2FLSA 3IR4A 2X99A 2LJAA 3DD3A 6GSXA 1V2AA 1BAYA 10GSA 3L0HA 1GH2A 4TR4A 3ZVJD 4N11A 2OKAA 4TN8A 5DVBA 2VLVA 3UMAA 1M9BA 1J08A 4XIHA 2JU5A 2L4QA 3M3MA 3QR6A 1GNWA 5H5SA 1Z7PA 2MBSA 2P5RA 5D9WA 4EKZA 1V9WA 2K18A 4KGIA 4L8EA 4EXJA 1OKDA 4XS1A 3EE2A 2XPDA 4IKHA 4N10A 1W4VA 1EP7A 3ZTLA 2KP2A 5IIZA 2HXKA 3GX0A 5G1LA 4MF7A 5IMVA 3TKRA 2EIRA 4K7OA 3GH6A 1VF1A 3HY2A 2H73A 2V2GA 4ML1A 3RPNA 1SJZA 3IDVA 5IOWA 4X43A 3I69A 3F8UA 5DAKB 3EWLA 3UVHA 3G7IA 1G7OA 3TOUA 3UIWA 4TW5A 1SKWB 1ILOA 1QMVA 2QC7A 1OC9A 2DJ2A 1SK2A 3FZ9A 1G7EA 2F51A 3A2VA 4WXTA 3MDKA 3BBYA 4OCEA 2X64A 4MA9A 4JRRA 2GSSA 1TU7A 5CRHA 2GZZA 2H70A 1Z9HA 3L9SA 3ME8A 3O76A 3IK7A 1XW9A 2H1AA 2IFQA 4F03A 3KZQA 3TUEA 4OMVA 4I6XA 3H1NA 4AJ8A 1YDKA 3Q6OA 3IK9A 5JCGA 5A4VA 3RHCA 4KSMA 3HCZA 1ZOFA 5DQSA 1VF4A 4K0NA 1AQVA 3APQA 3KMNA 2OADA 4MZBA 5IMCA 5J5NA 1SJIA 4XS4B 2TIRA 1AUCA 1X5DA 2EIOA 3M1GA 4Q5QA 3KXOA 5CP1A 1VGLA 1G6WA 3UEMA 2O8VB 4RQRA 2LKUA 1AW9A 5KEJA 1XFLA 4WF5A 4L0WA 2JZRA 2ALBA 4NPBA 2PPTA 3DRNA 5ECOB 1HNCA 4CDOA 4PURA 3M9KA 1ERVA 1OVNA 1HYUA 1MD4A 5DQYA 5HR3A 3ISOA 2V32A 2B5XA 1VF2A 3UBLA 1V58A 3HJPA 3IHQA 2G0FA 1UN2A 3A2XA 4QL9A 1TOFA 2M46A 4KB3A 1SL1B 2PU9C 4FO5A 1PL2A 1S3AA 5E59A 4MJBA 1GSFA 4DSSA 1M9AA 1R26A 3QD9A 5A4UA 1KNGA 1E6BA 4IP6A 4O7HA 4ZBAA 2EC4A 3KM6A 4I2TA 4BVXA 2VCZA 1TK0B 2RIIA 1WMJA 3MAKA 4AF2A 4MDCA 5D8IA 4WBJA 1N2AA 3UOMA 1SL0B 2YPMA 2WDUA 3F63A 3CSIA 5EPFA 1BG5A 2BMXA 3FR6A 1Y6EA 1YF0A 2H66A 2FWGA 5ELGA 2DJJA 2DMLA 2FNOA 1ZZYA 5KN2A 2C0GA 3TRPA 5G5FA 1SK0A 5D73A 5C00A 1YJ6A 3VK9A 4ZXGA 4POKA 2IL3A 4LL4B 1RW1A 1S3CA 2H6YA 4NV2A 2V6OA 5ECKB 4GQFA 2G2QA 1K0DA 3CRTA 3GSSA 5COHA 2MMOA 2HLSA 3GFKA 4HQZA 1S3DA 5ID2B 3TJJA 5J9CA 1A2MA 2YZUA 2MBTA 1B9YC 5B6NA 2B7KA 1GTBA 2YWMA 2K8SA 4NAXA 1XZOA 1KTEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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