3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2R0CA 4TM1A 3BI5A 3M13A 2WP5A 3CGEA 3ZDNA 3S5WA 5CKUA 2XFUA 4GDPA 4HA6A 1IUWA 5M10A 1B5QA 5LV9A 4WCTA 2BK3A 1K4QA 3AE4A 5EB5A 1NHRA 2JB3A 4J56A 2R46A 3VRDB 1TDKA 3UTHA 5U25A 1FL2A 3O0HA 3Q9TA 1D4CA 3LXDA 4H4WA 3CPJG 3GD4A 1CBOA 4B65A 1E1LA 3GMBA 4GUVA 4AT2A 1GNDA 1TDOA 4A6NA 2IVEA 1GT8A 2Q7VA 2VOUA 3F8PA 2GR1A 2V6OA 1YQ4A 3JSKA 4N9XA 3UOYA 4A6NB 4H4PA 2PYXA 4H2NA 2YG3A 4ICYA 1KSSA 4YTNA 3UKLA 1NHQA 4A79A 3BNUA 5U63A 1F3PA 1TRBA 3UKKA 5KWFA 1M6IA 3UKPA 3URHA 2XDOA 5KXJA 3KU9A 1P2EA 1QO8A 2NPXA 1XANA 3DJJA 4ECHA 1VG9A 1EL5A 4JDRA 4BV6A 5IQ4A 2V61A 4YTMA 2XLSA 4LU6A 2B9YA 3D1CA 3DGZA 2XFOA 4IA5A 1IUVA 1JRXA 1FEBA 3AWIA 4TLZA 4B63A 4D03A 5EOWA 1PJ7A 1FOHA 1YKJA 1PXAA 4APNA 4EQWA 1GRGA 1XDIA 2QA2A 2QCUA 2RABA 2XLRA 3NTDA 4CRTA 3D8XA 4BK3A 4BJYA 2BC0A 1E39A 1MOKA 4AP1A 3K7TA 4Z25A 4Y4MA 4J2WA 4C5OA 1KNRA 1ZP0A 2V3AA 3AE6A 1JNZA 2YLTA 1FCDA 3BHKA 1PXBA 4GCMA 4JNAA 3AEGA 4B64A 1S2QA 4OPTA 5JCNA 3COXA 2YLRA 2R4EA 3P4RA 3DK4A 5EBKA 5HYMA 2ZZ0A 4RG4A 4DNAA 1Z6LA 2FJEA 4CNKA 4YSXA 4Z2UA 4H4QA 1N4WA 2XVEA 2XFNA 4JY3A 3ALMA 2VQ7A 1GREA 4H4XA 2WHDA 4C77A 2GB0A 3BHFA 3NRNA 3VQRA 1GTEA 3NIXA 4CCRA 5BVAA 1GV4A 1BZLA 1GRAA 1JNRA 3FG2P 1D7LA 1S3EA 3NT6A 3UTFA 3NYEA 4U2LA 2OLNA 3UP5A 3VRBA 2WS3A 4EMJA 2Y6RA 5FS8A 1CJ2A 1EL9A 3EF6A 1XPQA 2A8XA 3ZYXA 4OPUA 3G5QA 1L9DA 2YWLA 5CQFA 2EQ7A 2VRMA 3AYJA 4MJWA 3SFDA 1PHHA 3BI4A 4H4SA 1DOEA 3DGHA 1H84A 3AEEA 3I3LA 2BS3A 2ACZA 3DK9A 2A89A 4ZCCA 3ALLA 2WPFA 1L0VA 2X99A 3ICSA 2C66A 4JNQA 3H8LA 1CJ4A 1LQTA 1PXCA 2R0PA 4H2QA 3LADA 3NHOX 2FJBA 1LPFA 2WDVA 2YG7A 3UKFA 1K0JA 2Y6QA 3UOZA 1E1NA 3RP6A 4YSHA 5JCIA 4I58A 3M0OA 5FS6A 2WQYA 1NAAA 2O9ZA 3L8KA 4NEVA 5L46A 1CC4A 2FJDA 2WETA 2C67A 1D4DA 4IVOB 3K7QX 4A7AA 1H86A 3E1TA 2EQ6A 4BK1A 2J3NA 3R9UA 4OCGA 2R4JA 1PBEA 2CVJA 2X3NA 5JCMA 4U8NA 1LV0A 2BABA 2WP6A 3CTYA 1QJDA 3EAOA 1ZOVA 2BK4A 2BXRA 2YLZA 4O5QA 4OPIA 3IHMA 1N4VA 4GDEA 3AEDA 1CJ3A 3SGLA 1AOGA 5JCKA 3NYCA 4Y4NA 1TDEA 1LJ1A 1KF6A 1VG0A 3NN0X 4K7ZA 1KDGA 1JRYA 4H4RA 5IQ1A 3AD7B 1NENA 2AQJA 1RP0A 2PHHA 3FIMB 4JN9A 4UP3A 3RP8A 1JRZA 2EQ9A 2GMJA 2YLSA 3IF9A 3CN8A 2VVMA 4C3XA 1NPXA 2FJAA 2YG4A 4UDQA 1PBBA 4B66A 3QFAA 4A65A 5KVHA 4HB9A 3REDA 2XVJA 2GMHA 1IUUA 1F6MA 2XVFA 2YLWA 1DJQA 3PS9A 2BXSA 4U8LA 3ABVA 3EANA 1H7WA 2H88A 2YR4A 1JU2A 1PBDA 1GXFA 1BGNA 4Y4LA 1Q1RA 4NEWA 2WPEA 3GWFA 2R0GA 2BACA 4DSHA 2WPCA 1RYIA 2E4GA 4FX9A 1PJ6A 4TM0A 5IPYA 4A99A 3AECA 2FBWA 3WE0A 4YSZA 2APGA 1E1KA 3AXBA 4UDPA 3CNPA 3SFEA 2JK6A 4C74A 4B69A 5U1OA 2BK5A 3AE9A 4XXGA 1GRHA 3K7MX 4YKGA 2XVIA 2BYBA 1MO9A 1VRQB 3CGDA 3AEBA 3UP4A 4BJZA 1E6EA 2C64A 3CNSA 3CPIG 3QSSA 4C3YA 3C4AA 1OJTA 4KX6A 4RSLA 1QLBA 2YM2A 3CGBA 2I0ZA 5EB4A 4NTDA 2WBAA 3Q6JA 1D5TA 4OPCA 2WOIA 1LQUA 1DXLA 3S61A 4B68A 2YR6A 1BKWA 4GRTA 1TDFA 3NNEA 3GDPA 4H7UA 2Z5YA 3HZLA 3UKHA 2HQMA 3VRAA 4AT0A 3FMWA 2V60A 3NK1X 3KD9A 4XWZA 3P4QA 5KVIA 4TLXA 2JBVA 2BS2A 2H89A 2TPRA 3ICTA 4U8IA 3CGCA 4CY8A 2XFQA 3DA1A 5HXIA 2Q0LA 1Q1WA 3VR9A 4EQSA 1SEZA 4TM3A 1V59A 3B3RA 2WDRA 1S3BA 1YY5A 2GR2A 3NK0X 4USQA 2GH5A 1RSGA 2XLPA 4U8MA 3IC9A 1GRBA 3AD8B 1DOCA 4K5SA 1Y0PA 1GPEA 2BCPA 2GAGB 2IIDA 2GR3A 1MXTA 3FPZA 1DOBA 2GV8A 3KKJA 2TMDA 1O94A 2X8GA 3DH9A 3AE2A 4Z2TA 2BCGG 3NN6X 1NEKA 1ZY8A 1DNCA 1B8SA 3NTAA 1O95A 1H82A 3VR8A 3C4NA 2GR0A 5JCLA 2IVDA 2UZZA 1LTXR 3AE7A 3SQPA 4DSGA 1IUSA 4J34A 3NG7X 2YQUA 2C73A 2OA1A 1PJ5A 3DJEA 4OVIA 4EM4A 1Y56A 2NVKX 4REKA 2GRTA 2JB1A 2VVLG 3BNMA 2GQFA 2JKCA 3UKAA 5FMHA 2VQBA 4K5RA 4JY2A 1H83A 1CC2A 2EQ8A 3AB1A 3C96A 4CCQA 4EMIA 5BUKA 1IJHA 4H2RA 2C70A 1H81A 1IUTA 4B1BA 3L1RA 2JB2A 4O5UA 1GEUA 2XFPA 4NTCA 2DKIA 4TM4A 1GTHA 2YLXA 1BGJA 1IUXA 2ZBWA 3I6DA 3UTGA 4I59A 2YAUA 3QSMA 2YR5A 3PO7A 4E0VA 2OLOA 2VRLA 4U2SA 1P2HA 1B4VA 2YVJA 4EMWA 2DKHA 4LA1A 4YTPA 2AAQA 2XLTA 4H4TA 5GRTA 3AE8A 1F8RA 4USRA 1REOA 3DMEA 5BULA 1D4EA 3P4SA 2C3DA 1OJCA 2V3BA 3BI2A 5KOXA 4BK2A 2QA1A 2GEWA 2B7SA 3DJGX 1HYUA 3IWAA 5J7XA 2JAEA 3ICRA 2WU5A 2ZZCA 5KRQA 1H7XA 1S2YA 5C2TA 5HY5A 1Y56B 3CPHG 1JEHA 1GESA 3AD9B 5FS7A 3GDNA 5DBJA 4CNJA 3LOVA 2RGOA 3UKQA 2BS4A 4U2TA 3GSIA 1GALA 3FBSA 1EL7A 3NLCA 3V3NA 1NHSA 3GD3A 4UDRA 1K0LA 1BWCA 1GERA 3NH3X 2XCGA 4K8DA 3ALJA 1KNPA 1NG4A 3QSEA 4M52A 4Z44A 1H6VA 4KPRA 4A5LA 3OC4A 4Z24A 1GSNA 1OJ9A 4IVMB 3QVRA 1E7PA 3UTEA 1JOAA 1KFYA 3UOXA 3OZ2A 3IHGA 1L9CA 3ISHA 4K2XA 1TDNA 4X9NA 1K0IA 2Z5XA 3ATQA 4YXDA 2ARDA 2WDQA 4H2PA 1GRFA 3B6DA 3GRTA 4X9MA 2WP9A 3AE3A 4U8PA 4EQRA 1YQ3A 3QFBA 1ZK7A 4LIIA 2C65A 1Q9IA 2Q6UA 4H4ZA 3V3OA 4A9WA 1FECA 1ONFA 4U8KA 4H4UA 4DGKA 4ZN0A 1BF3A 2YM1A 5TR3A 3V76A 3P9UA 1ZX9A 1DJNA 1YQZA 1ZDLA 4EIQA 2Q0KA 2X50A 3AEAA 5J60A 1N1PA 2VVLA 5M0ZA 4EQXA 4CBQA 4Z2RA 1ZMCA 1ZKQA 4PABA 3NK2X 1UKVG 4PAAA 4H4YA 2R9ZA 5ER0A 3G5RA 4EIPA 3SM8A 1CL0A 2B7RA 2QAEA 3GMCA 3LZWA 2RGJA 1VDCA 4J57A 3GYIA 4J36A 3UOVA 4YT0A 2YVGA 4D04A 1NDAA 1OJAA 1FEAA 3EPTA 2C75A 3GWDA 1O5WA 2XYOA 4OPDA 4Z26A 1W4XA 1CJCA 3CNTA 3NGCX 3T37A 4WX1A 4ADWA 3GYJA 3F8DA 3GRSA 4FK1C 4IA6A 3KA7A 2OALA 4RG3A 3CNDA 2OAMA 1GRTA 1OJDA 2X8HA 3NKSA 1EBDA 1F8WA 4OPLA 5HHFA 2E1MA 1TYTA 3ITJA 2CDUA 2VZ2A 4J31A 4AOSA 3H4KA 3DJDA 4YKFA 4EM3A 2YG5A 4X4JA 1CHUA 2B76A 3F8RA 3M12A 1NHPA 3DK8A 2GF3A 3AYIA 1X31B 4GF7A 2B9WA 2GVCA 3II4A 1F8SA 2WOVA 2GQWA 1PBCA 3ADAB 3G5SA 4NZHA 1COYA 4U8JA 1PBFA 1D7YA 3ATRA 4Z43A 4U8OA 5C3JA 2WESA 2V5ZA 3KLJA 4FDCB 5GSNA 3KPFA 2AR8A 3RP7A 4CY6A 1EL8A 1LVLA 5FS9A 1PS9A 3AYLA 1NG3A 2XVHA 4H4VA 3H8IA 3PVCA 4J33A 1GOSA 3AE1A 4OPGA 2R45A 1KSUA 1PN0A 2C7GA 2BA9A 3KVEA 4YWOA 3QVPA 4NTEA 1ZMDA 4YSYA 2WU2A 3AE5A 3RHAA 3P1WA 3LJPA 1TYPA 3RNMA 3QJ4A 1GETA 1CF3A 1N4UA 2XLUA 4FK1A 1VQWA 2YVFA 3K30A 4JQ9A 1DODA 4P9SA 2W0HA 2C76A 4XWRA 2C72A 2F5ZA 5BRTA 3CIRA 2C3CA 2YG6A 1CC6A 1XHCA 3NYFA 3LB8A 4GR1A 5KOWA 4ZCDA 1PDHA 2WEUA 3CNJA 3UCLA 4AP3A 1E1MA 3LZXA 1B37A 2ZZBA 2CFYA 2RGHA 1ZOYA 2A87A 2E5VA 3P4PA 2B9XA 4IV9A 2CULA 4H50A 4K22A 2X8CA 4AOXA 1L9EA 1M64A 4BURA 2BC1A 2GAHB 1ELIA 4B67A 2WOWA 3AEFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TM1A 4N0VA 3G7IA 3CGEA 2NPBA 5CKUA 3Q74A 4GDPA 4KCAA 1K0DA 3LORA 2FA4A 1M7TA 2C3QA 3DVXA 5EB5A 3IV4A 1NHRA 3IOSA 2R46A 4TR3A 3RHCA 5E59A 1FL2A 1TKDB 1D4CA 4H4WA 1DAOA 4IQ1A 3CPJG 1OVNA 4EDYA 1OC9B 9GSSA 3TKRA 4II3A 4A6NA 4BK2A 3JSKA 3UBLA 3UOYA 4A6NB 1GTUA 4N9XA 1AW9A 1OKDA 2JSYA 3GKXA 2YG3A 2YV7A 4A79A 2CZ2A 3BNUA 2RUFA 3UKKA 5KWFA 8GSSA 1M6IA 3UVTA 2C4JA 2E49A 2I9HA 4K9ZA 1XANA 3ZLPA 4ECHA 4JDRA 4BV6A 3VPQA 2V61A 4YTMA 1KIFA 1YJ6A 2IJYA 2O89A 4IA5A 1XVWA 4DEJA 2B7KA 1A8YA 1FOHA 4HU7A 3OR5A 3SYIA 4KDYA 1ERVA 5D8IA 2DU8A 1YEXA 4GAPA 1A2JA 4BK3A 4K6XA 5GAPD 3K7TA 1JLVA 4Z25A 4O92A 1KNRA 2H1GA 3GSSA 2YLTA 1FCDA 4JNAA 1PXBA 5AIXA 3AEGA 1AAZA 3GL3A 4JEDA 2R4EA 1GLQA 5EBKA 4DNAA 2FJEA 2N5AA 2K9FA 3ZYWA 2XVEA 2I1UA 2HZFA 2WHDA 4C77A 3BCIA 4I2UA 5BVAA 1GRAA 3UTFA 1XIYA 3C8EA 1CJ2A 2PVQA 2A8XA 2UZ8A 3C1RA 1PHHA 2TRCP 1F3AA 5ECRB 4XHMA 3IK9A 5ECQB 2BS3A 2RIIA 1Q4JA 2A89A 2AUVA 2ES7A 2X99A 4JRRA 3ICSA 4MP4A 3HJMA 1CJ4A 3H8LA 3D4TA 1PXCA 1PMTA 3VI5A 3QFAC 2E0QA 5IPGA 2LKUA 3VLNA 2V2GA 5CRGA 5CRDA 5DCHA 2Y6QA 4ECCA 1B4QA 4ZIJA 2C67A 4IVOB 4YJHB 1TRVA 5ECPB 1AQWA 3KIJA 2EQ6A 4TXVA 3TJJA 2R4JA 1GTIA 3TOTA 2CVJA 4MPFA 4U8NA 2H0IA 3CTYA 2AHEA 4GDEA 2FUG2 1VG0A 2L4CA 3CRUA 1NENA 2AQJA 3FIMB 3H1NA 2I3YA 4YQUA 2VCVA 2RLIA 3GMFA 1R5PA 4TVEA 3CN8A 2FY6A 1NPXA 2YG4A 4UDQA 5AGYA 4B66A 5KVHA 3FR6A 4HB9A 2IMDA 3D5JA 4D73B 5IOWA 3Q6OA 2XVFA 3P2AA 1H7WA 1HNAA 1PBDA 1QMVA 4X0XA 4X1UA 1BGNA 4Y4LA 1Q1RA 1M3JA 4FQUA 4NEWA 3IXRA 2WPEA 3GWFA 1XWGA 2BACA 2WPCA 4FX9A 4TM0A 2GLRA 1ZYEA 3AECA 1KEBA 1WRYA 4GQCA 4KW6A 2VL2A 4Q5QA 5ECNB 5D93A 2A2RA 2IMFA 5B8AA 4I6XA 5DJMA 5FHIA 3ERGA 4YH2A 4BJZA 1U87A 2VCTA 3H8QA 1QLBA 4RUVA 3KP8A 2YOIA 3P90A 1XWKA 5GZZB 1TDFA 3NNEA 3I6AA 3UKHA 4XWZA 3P4QA 5KVIA 4TLXA 1TJDA 2JACA 4ZILA 2P0GA 2ZCTA 4U8IA 4ZBDA 3DWVA 5DDLA 2HRFA 1K0OA 1MDKA 1T1VA 4L5LA 1GSYA 4TM3A 1V59A 1FVKA 2WDRA 4USQA 4ZL8A 3UMAA 2GH5A 1MDIA 4U8MA 2WGRA 1OC8A 1K0AA 1DOCA 2EIOA 1GUHA 1GPEA 4IP1A 2GR3A 4K0GA 2OBIA 1MXTA 17GSA 1RK4A 2TMDA 2X8GA 3AE2A 3CSJA 4NV5A 4V1Ap 4K7OA 4FYCA 4GAVA 5JCLA 2IVDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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