3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
b'APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
5IPYA 2YG3A 5KXJA 3DGZA 1DOEA 2WP6A 4EMJA 3P4SA 2R4JA 5FS8A 1QO8A 1H81A 2C72A 2Y6QA 3NIXA 4I59A 3LZXA 1CF3A 2YLTA 2YQUA 1BKWA 2RABA 3F8RA 3UOVA 5FS7A 1PJ5A 1D4EA 1DODA 2VOUA 2XLPA 3H4KA 4GUVA 4K2XA 1GRBA 2EQ8A 1ZX9A 3B3RA 1F6MA 2QAEA 4C74A 5LV9A 4WCTA 2BS4A 2YLRA 4CCQA 4YSZA 3R9UA 1IJHA 1JEHA 5HYMA 4A5LA 2AAQA 4U2TA 1OJAA 1GRAA 3V3NA 3AWIA 1EL8A 4JNAA 2RGJA 3QSEA 1W4XA 4B66A 5JCLA 3GWFA 2XLRA 3II4A 1GRTA 2IIDA 4K5SA 1F8RA 4OPDA 2C75A 1FEBA 3KKJA 2Q0LA 3NKSA 3IHMA 4Z24A 4IVMB 3SGLA 3GYIA 1M6IA 5IQ1A 3UKAA 2EQ7A 2YLZA 4NEWA 3DK4A 1N1PA 5IQ4A 1JRXA 1NHQA 1GOSA 4YWOA 3T37A 1NHRA 2V5ZA 1F8SA 1GREA 4Y4NA 1IUXA 1E39A 1L9CA 3KVEA 3DK8A 3C96A 1H86A 1PBEA 3P4PA 4BJYA 3QVRA 1NHPA 1FECA 1S3EA 2YG7A 3UCLA 4D04A 2EQ6A 1GRGA 4H4XA 2CVJA 1GTEA 1F3PA 2UZZA 1YQ4A 3UKPA 4A7AA 4C77A 3EF6A 3RNMA 5J60A 3CGCA 1PXBA 1B8SA 2GMJA 4J31A 5EB4A 3WE0A 3H8LA 1AOGA 2BS3A 2XCGA 2XLTA 2Z5YA 2E4GA 1PBCA 2BK4A 3AD8B 3PS9A 1NG4A 4YTPA 2TPRA 3NG7X 2BABA 2GR0A 3NRNA 4USRA 3NK0X 1FCDA 4J33A 4Z44A 5TR3A 1NENA 1BWCA 2X99A 3SM8A 4HB9A 1P2EA 3NGCX 4FK1A 3FPZA 1NG3A 5DBJA 3F8PA 3F8DA 3VRBA 1GPEA 2YVFA 2GF3A 2A89A 4TM3A 2VVLA 3CGEA 3ZDNA 1GEUA 3KD9A 4B68A 1ZMDA 1H84A 2RGOA 4Y4LA 3PO7A 1CC2A 1YQZA 3D8XA 3NK2X 1VDCA 4H4VA 4MJWA 3QSSA 1MOKA 1NHSA 2XLSA 1PHHA 4RG4A 4C3YA 4U8PA 1Q1WA 3L1RA 3NLCA 2YAUA 5HXIA 1K0IA 2ZZBA 1CL0A 2EQ9A 4RG3A 4OCGA 2YLSA 4UP3A 3G5RA 5BVAA 4CY6A 4K22A 1H7WA 2VQ7A 3KA7A 4H50A 2X8CA 1GXFA 4OPTA 2JB2A 1XHCA 2B9WA 2WQYA 3VRAA 4JY2A 2WOIA 4JQ9A 4C3XA 4H4UA 1CJCA 2WEUA 2C3CA 4Z25A 1B4VA 3EPTA 3S5WA 3SFEA 1OJTA 2HQMA 5GSNA 3CN8A 2WOWA 4YSXA 2H89A 1IUVA 2WDRA 3REDA 2DKIA 4Z2RA 1O5WA 2GAHB 2ZZ0A 4O5UA 3AE4A 1RSGA 2WOVA 1HYUA 1KDGA 2Y6RA 2X8GA 4YXDA 2IVDA 4TLZA 1JRYA 4U8IA 3LOVA 3ZYXA 3DJJA 3AYLA 5KOWA 2AQJA 4OPIA 1CJ3A 3UTEA 2WDVA 2CFYA 1EL7A 4JN9A 3UTGA 1E6EA 4A65A 3NTAA 2YVJA 3NYFA 2GB0A 2WPFA 4YTNA 3FBSA 2R46A 3GMCA 3AE7A 2XYOA 3AEEA 3RP6A 3UKFA 1H6VA 1ZDLA 1JOAA 4H2QA 1REOA 4ZCDA 2XLUA 2J3NA 1E1MA 2WP5A 3KU9A 2GR2A 1B37A 3GSIA 5FS9A 2OLNA 4CNJA 1GESA 3K7MX 4TM4A 1F8WA 1ZP0A 2Q6UA 3K7TA 4H4RA 4LU6A 3GD4A 4YTMA 3GRTA 1DOCA 1PS9A 2YLWA 3GDNA 5JCMA 5J7XA 4H7UA 5U63A 1LV0A 2WHDA 2XVEA 1OJCA 1TDFA 2VVLG 1MO9A 2C64A 3AE5A 4X9NA 3UKLA 3NYEA 1N4WA 5C3JA 2V3BA 1N4UA 4PAAA 4I58A 3ALLA 2B9XA 4J56A 4K5RA 2FJDA 2WDQA 2I0ZA 3GDPA 4EQXA 1QLBA 2ACZA 2XFNA 4UDPA 1D7YA 4EM3A 1O94A 2C3DA 2XFOA 3RP8A 4EQRA 3DJEA 1RYIA 1ELIA 1ZMCA 2B9YA 1GSNA 3P9UA 1H82A 2YG5A 3GWDA 5GRTA 3ADAB 1S2YA 2V6OA 3H8IA 4GRTA 1L0VA 3O0HA 1X31B 4KPRA 1K0LA 2OALA 3VQRA 2XVJA 4H4YA 3CTYA 2E5VA 3AD9B 1FL2A 3KPFA 5EBKA 4BURA 2JK6A 4B65A 2JKCA 3NT6A 1TDNA 2GEWA 3URHA 2R0CA 3SFDA 3AEBA 1S3BA 2VZ2A 4U8NA 1PXAA 4X4JA 1PBBA 3AEFA 2BC0A 5CKUA 3B6DA 1RP0A 2GRTA 2RGHA 3AYJA 4H4QA 3ATQA 1GRFA 2PHHA 3CIRA 3OZ2A 1BGNA 1IUTA 2XFQA 2GR3A 4XWRA 5HY5A 3CGBA 1GRHA 4OPCA 1D4CA 1JNZA 1GV4A 2WS3A 2APGA 2C73A 4AT2A 5C2TA 2WU2A 4YKGA 2NVKX 3BI4A 1JRZA 3UTHA 2BYBA 3DJDA 1NPXA 2R45A 1SEZA 1BGJA 2VVMA 3LB8A 2XDOA 3AE6A 4UDRA 2OLOA 3ATRA 3C4AA 5ER0A 4AOXA 1IUSA 2O9ZA 1KSUA 2YM1A 3VR8A 1BZLA 2WESA 3LJPA 4U8LA 4EIPA 3AE1A 4J57A 1TYPA 1UKVG 4A9WA 4B69A 1GNDA 3Q9TA 3NK1X 1LQUA 4PABA 3LADA 4U8OA 3K30A 3ITJA 2WP9A 4A79A 1PXCA 1VQWA 3ALMA 3CPIG 4BK2A 4KX6A 1GETA 1VG9A 2JBVA 2XVHA 3GRSA 2GQFA 4RSLA 4TM0A 4CBQA 2BACA 4JNQA 1DOBA 1XDIA 3AE8A 5JCNA 3AE3A 2R4EA 2V60A 1Z6LA 2QCUA 3CNJA 2CULA 3GYJA 2WETA 5L46A 2C67A 4J34A 2CDUA 1CHUA 4BV6A 4IV9A 1KSSA 3BHFA 1PBFA 3QSMA 2YR6A 1N4VA 3HZLA 5JCIA 4NEVA 4OPGA 4YT0A 3DH9A 4B64A 1XPQA 3RP7A 4EQSA 1PJ6A 4GCMA 2B76A 4IA6A 4U8MA 3COXA 2ARDA 1LPFA 3S61A 4FX9A 2BCPA 4REKA 4U8KA 1JU2A 2WU5A 3UP5A 1M64A 3ABVA 5M0ZA 2GVCA 4CNKA 1Y56B 5JCKA 5KWFA 3EAOA 2JB1A 1BF3A 3AD7B 2A8XA 2A87A 1TYTA 3CNSA 1CJ2A 1DJNA 3FMWA 2C65A 5U1OA 1S2QA 3M12A 2FJEA 3AECA 2YG4A 4LIIA 3EANA 4CCRA 2YVGA 4C5OA 4DSHA 3UOYA 3OC4A 5HHFA 5KOXA 1GERA 2BK3A 5FMHA 1D5TA 5BULA 2BA9A 4Z2UA 3BI2A 1TDKA 1ZOVA 3CPHG 3DGHA 4ICYA 3LZWA 2IVEA 4H4ZA 4A99A 4Z26A 1VG0A 2WPEA 4GF7A 2B7RA 3P4RA 3QVPA 4J2WA 1E1KA 4M52A 2QA1A 3G5QA 4AP3A 4BK1A 1GALA 3V76A 1D7LA 1FEAA 5KRQA 2FBWA 4OVIA 1CJ4A 4A6NB 3V3OA 4B1BA 1CC6A 3JSKA 4TM1A 5BUKA 2VRMA 3DK9A 2GH5A 3NTDA 2R0PA 1H83A 3CNTA 5FS6A 4EIQA 4E0VA 3I3LA 2XFUA 2YR5A 3M0OA 3ISHA 1ZY8A 2Q0KA 1E1NA 3P1WA 4Y4MA 1KF6A 2XVIA 1YY5A 3G5SA 4OPUA 2B7SA 4XXGA 3UKHA 2BXRA 2QA2A 3NH3X 1Y0PA 1V59A 2PYXA 1L9EA 2WPCA 3RHAA 3AYIA 2X3NA 4H4SA 4B63A 4U8JA 1D4DA 1NAAA 3P4QA 4EMWA 4JY3A 3CNDA 1L9DA 1VRQB 4ECHA 5M10A 1B5QA 3CNPA 1H7XA 2ZBWA 1COYA 2XVFA 4YSHA 1K0JA 2XFPA 2YLXA 1OJDA 3ICRA 3NHOX 2V3AA 4GR1A 5KVIA 1DXLA 1DNCA 2JAEA 1OJ9A 2OA1A 3M13A 1LJ1A 3NN6X 4U2SA 4XWZA 4EM4A 3BI5A 4UDQA 3VRDB 3BHKA 4YKFA 1LTXR 1IUUA 2C66A 3QFAA 3ICTA 1KNRA 4ZN0A 4GDPA 4AT0A 4EMIA 1E7PA 4USQA 3VR9A 1GT8A 1ZOYA 2BCGG 2GQWA 2YR4A 3UP4A 1NEKA 3QJ4A 3DA1A 2X50A 3AB1A 1XANA 4Z43A 3SQPA 4BK3A 1K4QA 1IUWA 2DKHA 2R9ZA 3BNMA 2WBAA 3CPJG 4IVOB 4TLXA 4D03A 2YWLA 1PN0A 1TRBA 1PBDA 1Y56A 2FJAA 4YSYA 2R0GA 2YG6A 3IWAA 1TDOA 5EB5A 5EOWA 4P9SA 3UOZA 4BJZA 1LVLA 2Z5XA 3DMEA 2W0HA 1EL9A 3Q6JA 5KVHA 4ADWA 5CQFA 1KNPA 4H4PA 3AEDA 4AP1A 4DGKA 1O95A 1YKJA 3IC9A 3GMBA 2BK5A 3PVCA 4WX1A 3L8KA 5BRTA 4NTDA 4DSGA 4O5QA 2C7GA 1TDEA 4H2RA 2GMHA 1E1LA 4X9MA 3AXBA 4N9XA 1PDHA 2AR8A 1FOHA 2GV8A 4K7ZA 1CBOA 3IHGA 2YM2A 3AEAA 3K7QX 4CY8A 3AE9A 4APNA 2VRLA 4Z2TA 2C70A 4AOSA 4NZHA 2E1MA 2NPXA 2ZZCA 3CGDA 4H4WA 2H88A 3BNUA 4NTCA 1PJ7A 1Q9IA 1EBDA 3D1CA 1Q1RA 4U2LA 2F5ZA 1ZK7A 2BXSA 4A6NA 4ZCCA 2BS2A 3NN0X 4IA5A 2GR1A 5U25A 4HA6A 1MXTA 3AEGA 4OPLA 1YQ3A 4J36A 1P2HA 3NYCA 2Q7VA 3GD3A 1KFYA 3C4NA 4NTEA 2V61A 3FG2P 4B67A 1JNRA 3IF9A 3UTFA 2GAGB 2OAMA 2VQBA 2C76A 4GDEA 2FJBA 3UKKA 1GTHA 1ONFA 3NNEA 1ZKQA 2TMDA 3KLJA 4CRTA 3DJGX 1QJDA 3AE2A 1LQTA 1CC4A 4H4TA 4JDRA 3LXDA 3QFBA 2BC1A 4DNAA 4FDCB 3ICSA 4EQWA 3ALJA 3UOXA 4K8DA 2X8HA 4H2PA 1DJQA 3FIMB 3I6DA 4FK1C 3E1TA 3UKQA 2JB3A 4LA1A 1EL5A 1NDAA 4H2NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZIVA 4JBBA 5D9WA 2WP6A 3D22A 3HYVA 2R4JA 1MD3A 2LJRA 3NIXA 1ON4A 1V57A 4TW5A 2RABA 3UOVA 5FS7A 1PJ5A 1D4EA 1FO5A 2G0FA 4TR3A 1GRBA 2VCTA 3WGDA 2EQ8A 2YWIA 2B1LA 4C74A 2FWGA 2G2QA 1PL1A 2Z9SA 3R9UA 4A5LA 2H0GA 4L5LA 2AAQA 3GKKA 1OJAA 5G1KA 3V3NA 3AWIA 3QSEA 1F9MA 1W4XA 3EMPA 3GWFA 1XWKA 1GTUA 2XLRA 3KPKA 1WE0A 1GRTA 1I9DA 4K5SA 2DJJA 3TKSE 3FKFA 2C75A 2VM2A 3ZRDA 2GQLA 3KMNA 3GYIA 2XBQA 1M6IA 3TB2A 4KH7A 4PGTA 4EF0A 2EQ7A 2DJ3A 4NEWA 1Z3EA 4ECBA 4G6HA 5IQ4A 1JRXA 2WULA 3CQFA 3O3TA 1NHQA 3T37A 2K8VA 2I81A 2DMLA 2JSZA 4J56E 1HD2A 4AJ7A 1YKCA 3P4PA 1GTAA 2A4VA 5ECRB 3M8NA 3SZFA 4TN8A 1GWCA 1SYRA 2CVJA 3ERGA 3F4RA 3RNMA 1QFNA 3CGCA 2GMJA 2C1YA 4J31A 4IGJA 3WE0A 1AOGA 3VWWA 4I8BA 3AD8B 3PS9A 3UVHA 1NG4A 4KE3A 3M1GA 3NRNA 1AAZA 2IMIA 4K2DA 3F9UA 3F8UA 5TR3A 1JZWA 1SYXA 4HB9A 3HJOA 3NGCX 2LJKA 1B48A 5DBJA 3IAS2 4HZ4A 4KUNA 3VRBA 3ZFLA 2DLXA 2FA4A 4GSNA 2AAWA 5J9BA 4N30A 2C0EA 2E48A 5HFGA 3U6VA 4WF4A 1JLVA 3L9SA 1VDCA 4H4VA 4DVCA 4MJWA 1PL2A 1NHSA 1PHHA 2XLSA 4U8PA 1PKWA 3NLCA 5HXIA 1CQHA 2P5QA 2K6VA 3ZYWA 2YLSA 4A5PA 5CRWA 5B6MA 5KMRA 4E8EA 2X8CA 1E6BA 5C04A 4OPTA 5F0GA 1V2AA 2JB2A 3IR4A 1XHCA 2WQYA 4JRRA 1TDIA 5D73A 1ILOA 2C3CA 3QAWA 3EPTA 4RI7A 2R37A 3HYXA 4YSXA 2JSYA 1S3CA 4HJ2A 3GX0A 3EINA 3UVTA 1KDGA 4YXDA 4OCEA 4TLZA 4U8IA 4EDZA 4MH2A 3LOVA 2KLXA 4FIWA 3AYLA 4POBA 1GTIA 1UVZA 2L5LA 1E6EA 2YVJA 2WPFA 2R46A 3KXOA 5E59A 1NSWA 1H6VA 1ZDLA 3GTUA 3US3A 2F8AA 1ZZYA 5ECHB 1BYEA 4GWRA 1YKAA 2OLNA 4KDUA 1GESA 1PX7A 5ECSA 4TVEA 2Q6UA 1K0OA 4I97A 3UBKA 4G9HA 3K7TA 4H4RA 2M72A 3Q6OA 5KNLA 5JCMA 5J7XA 1OYJA 1LV0A 1AW9A 1TDFA 4I2TA 5C3JA 4K7NA 3ALLA 3V1WA 1X9WB 4BL7B 2WDQA 2PVOC 3VWUA 2I0ZA 1QLBA 1D7YA 4EQRA 1RYIA 3D4MA 2GLRA 2B9YA 3P9UA 2YG5A 3GWDA 4D73B 3O0HA 5GZZB 2OALA 1B8XA 1FL2A 5CREA 1YEPA 4LMWA 4LLRA 1GRXA 2AJQB 2VZ2A 3QFBC 1GUKA 3AEFA 4YJDA 5IPHA 2BC0A 1JHBA 2O8VB 2RGHA 2GRTA 3AYJA 3OZ2A 2YP6A 5DBQA 5HY5A 1B9XC 2L6DA 4BWQA 3GSTA 2KHPA 2FGXA 2FY6A 3WT2A 4IVFA 2WS3A 2GDRA 4WKWA 4YKGA 3UEMA 2VUPA 1JRZA 1TK0B 3LSZA 1NPXA 4NPBA 1GUMA 2OLOA 3C4AA 5EVOA 4AOXA 2H1DA 2YM1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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