3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2C7GA 2C75A 2GQWA 2W0HA 3ZDNA 1TDOA 4EM3A 1E7PA 2GR3A 2WU5A 4B69A 3ITJA 1B5QA 4BV6A 2XFNA 2GRTA 4YSXA 3ALJA 4DSGA 2RGHA 4H4SA 5M10A 3UOZA 1BWCA 3S61A 2R0CA 1ZP0A 1E39A 5KVHA 3UTHA 4YSHA 3KD9A 1XDIA 3DJGX 2YR5A 3CNJA 3G5QA 3C96A 3CIRA 4I59A 2EQ8A 3IC9A 1AOGA 3FG2P 1H81A 3FPZA 3SGLA 1Y0PA 2GMJA 1S2YA 1N4WA 1MOKA 2GAHB 4EQXA 3L8KA 3NKSA 2Q0KA 3B3RA 1JRXA 3LXDA 2XFOA 4ICYA 4AT0A 1QLBA 2WPFA 2BYBA 2YQUA 3NN0X 3GMCA 4APNA 3EF6A 2EQ9A 1IUVA 1S2QA 1S3BA 2B9YA 3GYIA 1CL0A 4H2PA 1N1PA 1NHPA 4OPCA 4NTCA 2I0ZA 1GERA 1GSNA 2JB3A 2VVMA 1CF3A 1PBDA 1VRQB 1PBCA 2R4EA 2VQ7A 4GR1A 4JNQA 2UZZA 1DOCA 4B66A 3HZLA 3BI5A 4CNKA 2YWLA 5HY5A 2XCGA 2H88A 4Y4LA 1KF6A 4KX6A 4ADWA 2WDRA 1GNDA 1S3EA 4JNAA 5U63A 2C73A 4EQWA 4B68A 1KSUA 3CGCA 2YM2A 1EL9A 4YSYA 1FL2A 1TRBA 2BS3A 4D04A 3QJ4A 3QVRA 3ALMA 2XVJA 2BCPA 3DH9A 3DMEA 2GEWA 4YT0A 3QSEA 1GXFA 1ONFA 3VR9A 2V3AA 3UOXA 4Z44A 3P4PA 1D7YA 1NENA 2XDOA 4CRTA 1O95A 2YVGA 4D03A 2BA9A 2JBVA 2GV8A 3AD7B 3AYJA 4Z25A 2NPXA 3NRNA 5J7XA 3O0HA 2Q7VA 1B4VA 1DODA 1ZMCA 2GH5A 2YLRA 2WDQA 1PXBA 2BXRA 5KOWA 4ZCDA 3UKLA 3P1WA 4CY8A 4PABA 3H8IA 4RG4A 5BULA 4H7UA 3P4RA 4JDRA 3EAOA 4IA5A 3AWIA 3BI4A 5DBJA 3IHMA 4NTDA 4CCQA 2WOVA 3ICTA 3D8XA 2X8GA 2QAEA 1LPFA 2QCUA 1IUUA 2BCGG 3AE9A 3AYLA 1X31B 2IIDA 2WHDA 2VOUA 4J56A 2BABA 1ZOYA 3PO7A 2YG3A 1O5WA 3LZXA 2WESA 2YLZA 2X50A 4BJYA 2XVFA 1YQ4A 3OC4A 4Y4MA 1BKWA 1DNCA 1PBFA 1D4CA 1F3PA 3ATRA 2B7SA 4EMIA 1JNRA 1JRYA 1D7LA 3BHKA 1GRTA 4USRA 1Q9IA 1OJDA 2BACA 1Y56A 3M13A 4H2NA 1VQWA 4JN9A 1H84A 1CC4A 3LOVA 1P2EA 3I3LA 1PJ6A 4B65A 3JSKA 4K5SA 1LVLA 4YTMA 1VG9A 5CKUA 1QJDA 4LA1A 1NEKA 3ABVA 3QFAA 1IUSA 3C4AA 3AD9B 2GAGB 2XFQA 1E6EA 2GVCA 3CNPA 2JB2A 1GRAA 2GF3A 4BK1A 4AP1A 1EL8A 1F8WA 2AAQA 4FK1A 1LTXR 2C64A 5KXJA 1W4XA 3KKJA 2B9XA 4H4YA 3EPTA 2VRMA 1LQTA 3AEEA 3SFDA 3CPIG 3NHOX 4AT2A 5C2TA 3FMWA 1H6VA 4U8LA 4PAAA 2C67A 2DKIA 3UOVA 3SQPA 4J31A 4EMJA 3GD3A 1D4EA 5JCLA 4GDEA 4Z2TA 3AEDA 2WEUA 2YG6A 4CY6A 1ZMDA 1JRZA 3NTDA 3UP4A 3NH3X 4A65A 1M64A 2B76A 3LZWA 1H7XA 1PJ7A 4XXGA 2XVEA 1GOSA 3GYJA 3QSSA 2V5ZA 4J2WA 4FX9A 4DGKA 3AE4A 1PXAA 4OCGA 4AP3A 4TLZA 1ZX9A 1PBBA 2A8XA 1YY5A 1RSGA 1YQ3A 3NK1X 2GR0A 2XFPA 2C66A 2OA1A 5JCNA 1KDGA 4U8PA 1KFYA 4YKFA 4OPTA 1H7WA 2OALA 2WPEA 5FS8A 2YAUA 3DK9A 5U1OA 4EQSA 4H4PA 1ZK7A 4OVIA 4CNJA 4AOSA 5JCIA 5JCMA 1GPEA 1NG4A 4C77A 2GQFA 4YSZA 1TDNA 5GRTA 4H2RA 4K8DA 1RP0A 2OAMA 3CNSA 3NYCA 2BK3A 2XLSA 4A6NB 3SM8A 4WX1A 3CPHG 4GF7A 3IHGA 1JNZA 2YR6A 3E1TA 2WP6A 1OJ9A 2R45A 2Q6UA 2ZZ0A 3S5WA 5TR3A 2B9WA 2FJEA 4A7AA 3NYFA 5FS7A 1ZOVA 3K7MX 2C65A 2GR1A 3EANA 1GRGA 2AR8A 3UKAA 2RGOA 5EBKA 3P9UA 2E5VA 4LU6A 4WCTA 3UKKA 4Z24A 2VVLG 4Z2RA 1IUWA 3NYEA 3NK2X 2R4JA 1XHCA 3C4NA 2E1MA 3BNUA 1GEUA 4H50A 4OPIA 4RG3A 2Y6RA 3KU9A 4H4ZA 4JY2A 4A5LA 1B37A 3CGBA 3AE7A 3LADA 3AEFA 2RGJA 3B6DA 1M6IA 2C72A 4U2TA 4GRTA 1F8SA 3ATQA 4YKGA 4OPLA 1ELIA 2AQJA 3ADAB 4IV9A 3RHAA 5FS9A 3CNTA 3DJEA 3ZYXA 5KRQA 3GWDA 4IVMB 3GRSA 4MJWA 4REKA 2TMDA 1PXCA 2A89A 4TM1A 2ZZCA 1KNPA 5HHFA 5KWFA 4BURA 3QSMA 3P4QA 2BK4A 4GDPA 2BS4A 1PS9A 3VRBA 1CJ4A 5KVIA 5LV9A 4H4XA 3K30A 1O94A 2EQ6A 3GWFA 3NNEA 1K0IA 1NAAA 2OLOA 4K22A 2C70A 3DJDA 1E1KA 4RSLA 1XPQA 4NTEA 3UKHA 3ICSA 4BK2A 2YG5A 4J33A 3K7QX 2ZZBA 1PN0A 3KVEA 1K0JA 3R9UA 1GTHA 1Q1WA 2YLXA 3URHA 3CGDA 4U8NA 5U25A 1ZY8A 4JY3A 3FIMB 3COXA 3NLCA 2C3CA 2BXSA 3UP5A 4C74A 3NTAA 1IUTA 3BHFA 5FS6A 2WQYA 1CHUA 2FJBA 3DGZA 3AEAA 1PBEA 1L9DA 2WPCA 1Z6LA 3BI2A 4H4RA 2VRLA 5FMHA 4XWRA 3VQRA 1E1NA 4Y4NA 3M0OA 1D4DA 1COYA 3AYIA 2NVKX 1DJNA 2X8CA 3FBSA 1PDHA 4KPRA 2R9ZA 4U2LA 1CJ3A 3II4A 5JCKA 4H4UA 2YM1A 1XANA 2CVJA 2JAEA 2JK6A 3D1CA 3GD4A 2JB1A 1JU2A 3ICRA 2PYXA 3IF9A 4OPDA 4ZN0A 2F5ZA 4P9SA 1H83A 2QA1A 2WOWA 4TM4A 1BGNA 2BK5A 4J36A 2X8HA 2EQ7A 3NT6A 3F8PA 4H4WA 3DA1A 3UKQA 1TYTA 1IUXA 3K7TA 1PHHA 1E1LA 1N4UA 1TDEA 3QFBA 4LIIA 5BVAA 2WBAA 2WP5A 5IQ4A 1BZLA 4EQRA 3NIXA 5HXIA 3DK8A 5CQFA 2R0GA 4H2QA 2DKHA 3V3NA 1NHQA 4O5UA 2Y6QA 4YWOA 2GR2A 4IVOB 2XLTA 1YKJA 4Z2UA 1HYUA 2XVIA 5HYMA 3DK4A 4B63A 5EB4A 1D5TA 2YLWA 4EIQA 2YVJA 3LJPA 4N9XA 4FDCB 2WDVA 1BF3A 2CFYA 3CGEA 4TM0A 1EL7A 1LJ1A 1MO9A 1DOBA 3GSIA 4EM4A 1N4VA 4Z43A 3UTEA 1ZDLA 2FJDA 1PJ5A 4FK1C 1P2HA 4YXDA 3SFEA 1EL5A 1FEAA 1B8SA 3VR8A 3Q9TA 2Q0LA 3AEGA 2IVEA 3QVPA 1KSSA 4YTNA 2OLNA 1L0VA 1L9EA 3CTYA 4A6NA 4OPUA 4U8OA 1JEHA 1NG3A 3RP6A 2C76A 1F6MA 1TDFA 2VZ2A 3UKPA 2FJAA 2XLRA 4C3XA 4OPGA 3NGCX 4NEWA 3AE2A 2YG4A 3BNMA 2H89A 3AE6A 1JOAA 3G5SA 1SEZA 1NHSA 2WP9A 4Z26A 3WE0A 1DXLA 2FBWA 4U2SA 5ER0A 4BJZA 3V76A 1K0LA 2CULA 2XLUA 2APGA 2XFUA 3GDPA 2GB0A 2JKCA 1L9CA 2VVLA 4UDPA 4M52A 3AECA 1ZKQA 2BC0A 2HQMA 1VDCA 3M12A 1FEBA 4X4JA 1REOA 1NHRA 3AE8A 4U8JA 2Z5YA 4HB9A 1GETA 5EOWA 4JQ9A 3H4KA 1GTEA 3H8LA 4GCMA 1FCDA 2YVFA 2RABA 4ZCCA 3KLJA 2XLPA 3DJJA 3UKFA 2ZBWA 4XWZA 2V3BA 1K4QA 2A87A 1DOEA 1RYIA 3AB1A 3AE1A 4YTPA 3GDNA 2VQBA 5IQ1A 4USQA 2BS2A 1GRFA 3F8RA 4O5QA 3REDA 3L1RA 5BRTA 1OJCA 1V59A 2BC1A 2CDUA 2YR4A 4U8MA 3UTGA 3LB8A 4AOXA 1DJQA 1OJAA 5J60A 1UKVG 4K5RA 4UDRA 4DNAA 4K2XA 2E4GA 3AD8B 4TM3A 3RP7A 4A99A 5L46A 1KNRA 1F8RA 4B64A 2J3NA 3UOYA 2WU2A 1H86A 3RP8A 3GRTA 1GRHA 3NG7X 2X99A 2R0PA 2YLSA 4EMWA 3T37A 2X3NA 4X9NA 4CCRA 1H82A 4K7ZA 4UP3A 3CNDA 3Q6JA 5GSNA 4H4TA 4DSHA 1E1MA 1Q1RA 5KOXA 3IWAA 2XVHA 2YLTA 4NZHA 1LV0A 2TPRA 2GMHA 3CN8A 2ARDA 3V3OA 5BUKA 2QA2A 2R46A 3VRAA 3NN6X 1GRBA 5EB5A 1CC2A 1GESA 2IVDA 3AE3A 5C3JA 1TDKA 3CPJG 2Z5XA 3OZ2A 1GT8A 2WOIA 3UTFA 1FECA 2V6OA 3ALLA 1IJHA 3NK0X 4H4QA 1OJTA 2C3DA 2YG7A 4NEVA 1LQUA 4CBQA 4B1BA 2O9ZA 1VG0A 5M0ZA 2B7RA 1YQZA 3ISHA 4U8KA 2XYOA 3GMBA 2V61A 3PVCA 4HA6A 1FOHA 4EIPA 4A9WA 1GALA 4H4VA 3AEBA 3AE5A 2WETA 3DGHA 1Y56B 2V60A 3I6DA 3PS9A 2ACZA 4GUVA 4U8IA 4UDQA 3VRDB 1EBDA 4B67A 4C3YA 3KA7A 4J34A 3UCLA 1GREA 3RNMA 4X9MA 1GV4A 4J57A 1CC6A 3G5RA 1BGJA 4I58A 4C5OA 1CJ2A 4E0VA 3AXBA 1NDAA 4A79A 3F8DA 1TYPA 4TLXA 3P4SA 4IA6A 2PHHA 5IPYA 4BK3A 1NPXA 1CBOA 4ECHA 1MXTA 1QO8A 2WS3A 3KPFA 1CJCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZ9A 4KW6A 1ERWA 4B69A 4MJAA 3ITJA 4YSXA 2R37A 2GRTA 1R26A 2V6KA 3UOZA 3WGDA 3FRCA 1SK1A 5E59A 1XVQA 3AY8A 5KVHA 1XDIA 4JU5A 3HJOA 2RM5A 4WETA 2YWNA 1Z9HA 2GAHB 3HVVA 2WGRA 1EVIA 4YH2A 1PQNA 5J3RA 1SK0A 3OR5A 2EQ9A 3CMMA 4KGIA 1F3BA 2TIRA 3CRUA 1CL0A 4AF2A 3VWXA 1GERA 2VVMA 1PBCA 2R4EA 4JNQA 4IQ1A 1AXDA 3HZLA 4CNKA 1WJKA 2H88A 5ECQB 1KF6A 4KX6A 3ME8A 2C73A 2TRXA 3VWVA 1EL9A 4XS6A 3TKSA 4YJHB 4D73A 4RI6A 1TRWA 1XW5A 4YT0A 1GXFA 2X64A 2V3AA 4ZBDA 2WB9A 3UOXA 3BOAA 2OE1A 4E8EA 3HA9A 3FHKA 4G19A 3HYVA 3CRTA 4GAVA 5GZZB 3NRNA 2HI7A 1B4VA 1ZMCA 2WDQA 4YJGB 4PTSA 2GQKA 1BG5A 2ZNMA 3P1WA 4PABA 5DQYA 3F4RA 4JDRA 3SWLA 4NTDA 3BCIA 1EZKA 1W89A 4XIHA 3AYLA 2IIDA 1HD2A 3GL5A 3NOFA 2BABA 1ERTA 2DLXA 1O5WA 2WESA 13GSA 5G30A 2JL4A 2XVFA 2BJXA 1YQ4A 1FB6A 1GSSA 2MMOA 1JLVA 1YJ6A 2WULA 3KXOA 2FWGA 1OYJA 1GWCA 1TK8B 2VD1A 4HOJA 3GFKA 4H2NA 4KDXA 1VQWA 3I43A 1CC4A 3GKXA 3LOVA 4JN9A 2E48A 3JSKA 1SJZA 1SD9A 2K8SA 4V1Ag 2IPAA 1VG9A 1QJDA 4CDOA 1ZCPA 5FHIA 4AP1A 4XS1A 1F8WA 4TRXA 1LTXR 2C64A 1W4XA 4H4YA 6GSVA 4JZQA 3FMWA 1H6VA 4LMVA 3WT2A 3MIXA 1AAZA 4JBBA 4J31A 1GSQA 4NHWA 1D4EA 5JCLA 4GDEA 5ID2B 2B6MA 3WT1A 2WEUA 2VCXA 2YG6A 1GTAA 4G6HA 3KMNA 2LQQA 3NH3X 4A65A 3LZWA 3DGQA 4QL7A 4MMMA 4XXGA 4OO5A 3QSSA 2V5ZA 2J9HA 1PXAA 2RLIA 4TLZA 1ZX9A 2A8XA 3NK1X 3M9JA 3GNJA 3QFAC 4KSMA 1H7WA 1MDIA 2L5LA 3LSZA 4IJ3A 1SENA 1TDNA 2H1DA 2JSYA 4H2RA 5IMVA 2HRNA 1MDKA 5GSTA 1TI1A 1RP0A 2CVKA 2XLSA 4A6NB 3MWHA 1NHOA 2HSYA 4GF7A 2IFQB 5F0GA 3EINA 4NNJA 1DBYA 2ZZ0A 2Q6UA 3VFIA 1XCCA 5IMDA 4KH7A 5ECSA 4GRFA 2YPMA 1OC3A 3K7MX 3EANA 2RGOA 4YJHA 3J7Yk 3P9UA 1KTEA 2E5VA 3UKKA 3UOMA 4I6XA 3NYEA 2R4JA 3G7YA 3C4NA 2NVLA 2E1MA 3QPMA 4EKZA 2F8AA 1B37A 3AE7A 3LADA 2RGJA 3B6DA 4HU9A 1M6IA 4F0BA 4OPLA 1JHBA 3RHAA 2VM2A 2HE3A 5ABRA 4FYBA 3KPKA 1OC9B 2A4VA 1CJCA 4YJGA 4MJWA 5B8BA 2TMDA 1GTIA 3CSHA 1FB0A 2DC5A 1R7HA 1MD3A 4GDPA 2CV4A 4ILFA 3VRBA 1I5GA 1CJ4A 3CTFA 1MEKA 1T4ZA 3K30A 3GWFA 5INYA 1GTUA 5D9XA 2H0GA 1XPQA 5JCGA 2YG5A 5EPFA 3K7QX 4LL1B 3KVEA 1K0JA 1GTHA 1WPIA 1Q1WA 4G0KA 3MDKA 2VO4A 2AJQB 4U8NA 5U25A 3SZ0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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