3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2CVJA 2VRLA 4CCRA 3SQPA 3ICSA 1JU2A 3AD7B 1CBOA 2FJBA 3UTEA 2XFNA 1KNRA 4AT0A 1S2QA 5JCNA 3G5SA 1ZP0A 2EQ9A 1ZMDA 1GT8A 3NIXA 1YY5A 2YLSA 5FS9A 4OPTA 4B1BA 3IHGA 2VVMA 4CBQA 4YTNA 1RP0A 3CGDA 3P4PA 3QFAA 2WPFA 2Q7VA 3NN6X 2BCGG 3L1RA 1GXFA 2ZZ0A 4WX1A 1TRBA 2PYXA 4H4PA 4AOSA 3AYLA 4C77A 1YQ3A 3DGHA 5FS7A 1N4VA 4H4WA 4RSLA 2V6OA 2WS3A 3NYFA 2Z5YA 4EQSA 1XDIA 1IJHA 3GYJA 1BKWA 1S3EA 4U2SA 4XWRA 4YSXA 3AE3A 3H8LA 4HA6A 2BCPA 3KD9A 2QCUA 4TM4A 2XYOA 3IWAA 4CY8A 1P2HA 2C75A 3KPFA 3NH3X 4H2NA 2X50A 1CC6A 3NRNA 2YWLA 5JCMA 1GRFA 1IUSA 4C3YA 3R9UA 1K0LA 5HY5A 1BF3A 1K0JA 3COXA 1W4XA 3QVPA 1PBCA 3NTAA 4K2XA 1ZMCA 3GRTA 1LQUA 2R9ZA 2BS3A 2O9ZA 3BI2A 4AOXA 3PVCA 1KF6A 4H4RA 1SEZA 4Y4MA 4BK2A 1FCDA 3GRSA 3RNMA 1B37A 2YG3A 4H4UA 5M10A 2RGJA 2A87A 4XXGA 2YG7A 5EB4A 1QLBA 2XLUA 3AE6A 4ICYA 5KVIA 3AEEA 3CNPA 4FDCB 2R0GA 1FEBA 1E1LA 1F3PA 4BK3A 3P1WA 2WETA 3UTHA 2YLWA 2IVDA 1F8RA 3CN8A 4EMJA 4AP1A 4EQWA 4B67A 5EBKA 4U8PA 4Z24A 3UOVA 2YLXA 3UKAA 1H6VA 1TYTA 1CJCA 2BACA 1CC2A 3LZWA 2XVEA 1BGJA 1YQZA 2QAEA 3P4QA 2OLOA 3KA7A 2WDRA 2TPRA 4Z43A 1HYUA 2EQ6A 2F5ZA 2GQWA 1ZY8A 4C3XA 1GOSA 3UKFA 2GV8A 3DJGX 3KKJA 1PXBA 4TM1A 4GDEA 2RABA 1MXTA 2JB2A 2Q0LA 1E6EA 3DK8A 3F8RA 4OPCA 1JEHA 1OJTA 2V60A 3D1CA 2RGOA 2OLNA 4GCMA 1H84A 3CPJG 3GSIA 4GRTA 3BNMA 4H4QA 3SGLA 4E0VA 4EIPA 5IQ4A 3VR9A 2GVCA 2XVFA 4J33A 2JB1A 3K7QX 1K0IA 2BK3A 1DOEA 3AE9A 3LXDA 4TLXA 1S3BA 1D4CA 4C5OA 1OJ9A 2YLZA 2GF3A 4OPUA 2B9XA 1JRYA 2BS2A 3GD4A 3ALLA 2NPXA 2R45A 3NK2X 2GAHB 2QA2A 4JN9A 4LIIA 3LZXA 1YKJA 1H83A 4A5LA 3EAOA 2Z5XA 1Y56A 1MO9A 2GR1A 4H4ZA 2HQMA 1EL9A 1PBBA 3AEFA 3AB1A 2WP5A 1TDKA 4CNJA 1QO8A 1GPEA 2X8HA 3QSEA 3OC4A 5GRTA 2C65A 4FK1A 2YVFA 3Q6JA 5FS8A 1PBFA 1PJ7A 1IUTA 1AOGA 2ACZA 2EQ7A 5C2TA 4EM3A 5CKUA 2WOWA 2XLPA 2UZZA 4K7ZA 1GSNA 3CNTA 4RG3A 1FECA 1PDHA 3AE8A 3UKQA 4Y4LA 2YR6A 2Q0KA 3P9UA 3NG7X 1F8SA 3GDNA 1LTXR 5KRQA 3DJDA 3OZ2A 1P2EA 1GRGA 1Q1RA 1DXLA 2V3AA 1LPFA 2A8XA 1M64A 1NPXA 2AR8A 3UKHA 4ADWA 4CCQA 5JCIA 4IA6A 1CJ2A 3AE7A 3LADA 4REKA 3CIRA 1N4UA 2C64A 3ICTA 3CGCA 3REDA 5BULA 3AE1A 2WESA 3CNJA 2XLTA 1DJNA 2E1MA 1Q1WA 3GWDA 4B64A 2BC0A 3LB8A 3VR8A 4DNAA 3DMEA 2X8CA 5KVHA 3UKLA 4CRTA 3ISHA 4K5RA 4NTCA 1GERA 3P4SA 3CGEA 2XDOA 2R4JA 4OPLA 1ZDLA 2B7SA 5FS6A 2TMDA 3CNSA 2WDVA 1LVLA 1N4WA 5KOXA 3CNDA 4GUVA 1RYIA 3BNUA 4I59A 3VRAA 1BWCA 4DSHA 2WP6A 1L9DA 3M12A 4HB9A 4N9XA 1NG4A 3GDPA 1GTEA 1ZX9A 3L8KA 5IPYA 1D5TA 1NDAA 2XFQA 4Z2RA 1JNZA 1H7XA 1N1PA 2BABA 3CGBA 3NLCA 4JY2A 3V3OA 1E1KA 4YKGA 5GSNA 3UTGA 5BRTA 4O5QA 2DKIA 2BS4A 3GWFA 3VQRA 2FJAA 3I6DA 1GRBA 3S5WA 3H8IA 2GR0A 4K5SA 4LU6A 2C73A 3DJJA 2YG6A 3JSKA 4M52A 4BURA 3CPHG 4U8NA 4D03A 3FBSA 3UCLA 1NHPA 2RGHA 2NVKX 4UP3A 4OPDA 5ER0A 2XVIA 3ADAB 4USQA 2OALA 3K7MX 1O95A 2WBAA 2ARDA 1O94A 1GV4A 4Y4NA 3DK9A 4EQXA 4YSZA 3IC9A 4BJYA 2BK5A 1ZOYA 3AE2A 5U63A 3V3NA 3AECA 2WOVA 1EL8A 2X3NA 2C76A 2PHHA 3G5QA 3KLJA 4Z26A 4UDRA 4ZCCA 1O5WA 3M0OA 4NTDA 2XLRA 1JOAA 4TM3A 1KFYA 4Z25A 3GYIA 1PJ5A 3II4A 1L9EA 1PBDA 3ABVA 1LV0A 2ZZBA 1CF3A 4JQ9A 3H4KA 3NKSA 2H89A 2J3NA 3M13A 2WHDA 5J60A 3AE4A 2BC1A 1Y56B 3B6DA 2FBWA 3NHOX 1DOCA 3ITJA 3NYEA 2GH5A 1TDOA 1VDCA 2YR5A 3DGZA 4CNKA 1CJ4A 2C70A 4A9WA 2YQUA 1M6IA 3AEGA 2YVGA 3K7TA 3AXBA 3URHA 4IA5A 4OVIA 2FJDA 2XFOA 4B66A 3E1TA 3C4NA 4YT0A 2WPEA 2YM1A 4J36A 4OCGA 2V61A 1E1NA 3ICRA 4I58A 1GEUA 4B68A 3ALJA 2E4GA 3AE5A 4H4YA 4XWZA 2VZ2A 3DJEA 2B7RA 2EQ8A 3EANA 1LQTA 4B65A 4U8OA 1IUUA 4YTPA 1PN0A 1GREA 1D4DA 2C3DA 3C4AA 2WEUA 3AYIA 3AWIA 3FG2P 3BI4A 2XCGA 3HZLA 2GEWA 2YG5A 3SFDA 1GESA 3F8DA 4NZHA 1TYPA 3DA1A 3GMBA 2Y6QA 4U8IA 4K8DA 2BXRA 4NEWA 1GALA 2VVLA 4ZCDA 5HXIA 1JRZA 1Q9IA 1REOA 2CFYA 1DJQA 1YQ4A 3LOVA 1PBEA 3UKPA 3RP7A 1XHCA 1DOBA 1H81A 3EPTA 4OPGA 2JAEA 1CHUA 5FMHA 3NK0X 3P4RA 3UKKA 4GF7A 2A89A 2C67A 4H50A 2R0PA 1S2YA 2GAGB 3LJPA 1VG9A 3RP8A 1F8WA 2ZBWA 3G5RA 3AYJA 3QJ4A 4O5UA 3V76A 1JRXA 1GRAA 1BGNA 5BUKA 2WQYA 1NG3A 3F8PA 1CC4A 2C7GA 2JBVA 4GR1A 4J34A 5EB5A 4J2WA 1COYA 4BK1A 3ALMA 2VVLG 3NNEA 4Z2UA 2YR4A 5M0ZA 3KVEA 4B63A 2WU5A 4YXDA 1D7YA 3FMWA 2YM2A 1VG0A 4JNQA 4NTEA 4U2TA 2V3BA 3BHFA 3NT6A 4X9MA 4JY3A 4A65A 1OJCA 2I0ZA 4YSHA 1H7WA 2GR3A 1GTHA 2WDQA 2X8GA 1PS9A 1E1MA 1TDFA 4UDPA 2H88A 4BJZA 4EMWA 1VQWA 4IVOB 4H2QA 1FEAA 4YTMA 2Q6UA 1NENA 3CPIG 2XVJA 4P9SA 4AP3A 1PXAA 4H7UA 1D4EA 3VRBA 4FK1C 4RG4A 5L46A 4OPIA 4DSGA 3UOXA 1EBDA 3K30A 3RHAA 4PAAA 1L0VA 4IVMB 2OAMA 1ZK7A 4H2PA 1IUWA 3NTDA 3SFEA 2JKCA 4D04A 1CL0A 2WOIA 1ZOVA 5TR3A 1KSSA 1BZLA 1KNPA 1NEKA 4ZN0A 1VRQB 4U8MA 2WP9A 1H86A 2C72A 2YVJA 1NHQA 3C96A 4X9NA 4Z44A 3I3LA 3FPZA 4H4TA 3ATQA 3AEDA 4H4VA 1ZKQA 2W0HA 5HHFA 5KWFA 2R46A 4NEVA 2DKHA 1XANA 5U1OA 1NHSA 4H4XA 4APNA 4TM0A 1EL5A 4EIQA 2VRMA 1F6MA 1B4VA 2GMHA 1ELIA 1Z6LA 3B3RA 3QSSA 4B69A 5IQ1A 1IUVA 3AD8B 3WE0A 3NYCA 3PO7A 1D7LA 2GMJA 1MOKA 4IV9A 1PJ6A 4KPRA 2B76A 2X99A 2YLRA 2BA9A 3GMCA 2BK4A 3AEBA 3RP6A 2GR2A 2JB3A 3O0HA 3S61A 3GD3A 1B5QA 2OA1A 3T37A 3NGCX 3EF6A 4PABA 2YAUA 3QFBA 1B8SA 4JDRA 1KDGA 1XPQA 4WCTA 2GQFA 2QA1A 2C66A 1H82A 2YG4A 2GRTA 1GNDA 1OJAA 2GB0A 2ZZCA 4A6NB 3UTFA 3KU9A 3D8XA 1E7PA 4CY6A 3NN0X 4H4SA 4A99A 1DODA 2IVEA 3PS9A 3QVRA 5J7XA 1FL2A 1NAAA 2Y6RA 2WU2A 4TLZA 1TDNA 4U8LA 4X4JA 4BV6A 1IUXA 3UOYA 4ECHA 2XFUA 5CQFA 1FOHA 2XLSA 3UP4A 1PXCA 3DH9A 4JNAA 3NK1X 4LA1A 2YLTA 4YWOA 4K22A 2JK6A 3ZYXA 4DGKA 4U8KA 1ONFA 1E39A 2BYBA 1DNCA 2FJEA 5KXJA 1LJ1A 2VQ7A 3BHKA 1PHHA 3SM8A 2BXSA 5JCLA 3IF9A 3AEAA 1EL7A 1GRHA 1JNRA 2VOUA 2XVHA 1V59A 4EQRA 5LV9A 4GDPA 2IIDA 4EM4A 4EMIA 3UOZA 1UKVG 4YSYA 4A6NA 1L9CA 1CJ3A 4C74A 1GETA 3BI5A 4MJWA 1K4QA 2B9YA 3ZDNA 5KOWA 4H2RA 2R0CA 1Y0PA 5JCKA 2C3CA 4YKFA 4J31A 2AQJA 4U2LA 2VQBA 3IHMA 3DK4A 4U8JA 4UDQA 4FX9A 2XFPA 4J56A 4A7AA 1QJDA 2APGA 2B9WA 3FIMB 2CULA 3ATRA 5DBJA 4AT2A 4A79A 4USRA 1GRTA 2CDUA 5C3JA 2WPCA 2R4EA 1TDEA 2V5ZA 4Z2TA 3VRDB 1RSGA 1X31B 5HYMA 4J57A 4KX6A 5BVAA 1OJDA 2AAQA 3CTYA 5EOWA 1NHRA 3QSMA 3Q9TA 3AD9B 1KSUA 2E5VA 5U25A 3UP5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CCRA 16GSA 4LMWA 1CBOA 2FJBA 5CRHA 5JCNA 1N8JA 1ZMDA 3HYWA 2YLSA 5FS9A 4B1BA 1PX7A 2VVMA 1YZXA 3CGDA 1TK8B 4D73A 3I9V2 3KZQA 4GSNA 2Q7VA 3HCZA 3NN6X 3L1RA 4GSTA 5ECMB 2ZZ0A 4H4PA 5FS7A 4HSCX 1N4VA 4A5PA 2J23A 3IAS2 2B5YA 4H4WA 1XDIA 1IJHA 4E8EA 3HYXA 1BKWA 1S3EA 2LJKA 2V41A 1SL1B 4N0VA 4F2IA 3AE3A 2YPMA 4KF9A 10GSA 2XYOA 3ME8A 4CY8A 1OAZA 17GSA 1PX6A 2X50A 2IL3A 1IUSA 5JWQB 1K0LA 1MTCA 1XW6A 5HY5A 1BF3A 3FY7A 3QVPA 1OVNA 1PBCA 3NTAA 3T2YA 3HY2A 5DJLA 2BS3A 4AOXA 4ZB8A 1M2AA 1YY7A 2GSRA 3W6GA 3PVCA 3GHAA 3I69A 5IM9A 1KF6A 1SEZA 1KBNA 2I4AA 3GRSA 3C1RA 5M10A 2A87A 1XWCA 2H6YA 5EB4A 3TCOA 5KVIA 3UVTA 1FEBA 1Z7PA 4BK3A 4IP1A 1GUMA 2WETA 4EQWA 3UKAA 3FK8A 4YAVA 1VRSD 5DVBA 4O92A 3LZWA 1BGJA 5GAPD 2QAEA 1PQNA 3LW9A 2H1AA 4Z43A 4F9ZA 2F5ZA 2YOIA 4C3XA 3SBCA 2GV8A 5IIZA 3KKJA 2OKAA 2FUG2 3BOAA 5LD0A 4AJ8A 2HRAA 4TR0A 3DMLA 3TJGA 2JB2A 1E6EA 1XWKA 4Q5RA 3D1CA 4GCMA 4G6HA 2OLNA 3QMXA 3CPJG 1J08A 2AV4A 4FYUA 4HS1A 4EC0A 4H4QA 1F6MC 5IQ4A 2GVCA 3DIEA 4MF6A 2JB1A 1EZKA 4I6XA 2HI7A 3K7QX 4ZL7A 1K0IA 4TLXA 3RAZA 2H01A 2WGRA 4GQFA 5KMRA 3IC4A 3UARA 4KB3A 2B5XA 4J2FA 1M2BA 3NK2X 5AISA 1YF0A 4IBPA 1TP9A 4JN9A 2IMDA 2C4JA 4EF0A 3EAOA 3ZNNA 1ZCPA 1MO9A 2GR1A 1DUGA 1MD4A 1K0OA 3KP8A 4EUYA 3AB1A 2X8HA 4MA9A 3QSEA 3OC4A 2C65A 5FS8A 2H19A 1IUTA 1GSDA 5C2TA 2LNSA 5CKUA 5G5EA 3KH9A 2UZZA 3I43A 3CNTA 1FECA 1K0MA 3FKFA 4Y4LA 3NG7X 4ZBBA 1LTXR 1P2EA 1Q1RA 4CDOA 1NPXA 3NIVA 4MLYA 11GSA 1GSUA 5DJMA 4REKA 4POMA 3CGCA 1TRSA 4MF7A 4MJEA 2WESA 3CNJA 4MPFA 1ILOA 3DVXA 4CRTA 4K5RA 4NTCA 4ECCA 1GERA 5HR2A 3GH9A 4OPLA 2B7SA 2TMDA 3EU3A 4G6GA 3M12A 4X1UA 4NPBA 4HB9A 5FHIA 5DCHA 4F03A 1GTEA 4K1FA 1VF1A 2XFQA 1R5AA 1C0LA 3D5JA 1Z6NA 3CTFA 4YKGA 4ZBAA 2VCVA 2VLVA 1BJXA 2JSZA 2DKIA 3GWFA 1TXXA 1GRBA 1XFLA 5ECLB 1V40A 1SYRA 2JZTA 2GR0A 4GQCA 4LU6A 2E4AA 5CYYA 2C73A 4AF2A 4ML6A 6GSVA 3UAPA 1FB6A 2YNXA 3C73A 2NVKX 5DCGA 2K8SA 2FNOA 3D4TA 1GV4A 2I9HA 2H71A 1G0TA 5G1LA 1ZOYA 3V3NA 1EL8A 2PHHA 2X3NA 1JFUA 5A4WA 4ZCCA 2VLUA 4NTDA 2JL4A 1I5GA 1YKCA 2E49A 2H1DA 2X64A 3IXRA 4YJHB 2H73A 4H86A 3AE4A 2BC1A 4DVCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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