3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2Z5XA 3CNJA 1VDCA 4H2NA 1W4XA 2B76A 5TR3A 1DOCA 3IHGA 1UKVG 2X99A 1VG9A 2FJDA 1GRGA 3AECA 4AOXA 5BVAA 3P4QA 2WDQA 4KPRA 3NN6X 4B63A 1MOKA 2C3CA 4U8JA 2BC1A 4IA5A 1MO9A 1PXAA 4FK1A 4Y4LA 1S3EA 2XLTA 2Y6QA 2C64A 3I3LA 3SQPA 3CIRA 3CNPA 3NGCX 2ZZCA 2VVMA 3LJPA 3KA7A 3UTGA 1GRBA 1Y56B 2OALA 2YVGA 4NTCA 1O5WA 2CVJA 5JCIA 1IUVA 4TM4A 1ZK7A 2Z5YA 1LTXR 2C70A 2NVKX 3IHMA 4NZHA 2F5ZA 2X8CA 4CRTA 2B9XA 2R9ZA 3NT6A 4H4QA 3L8KA 4JY2A 3V76A 3F8PA 4U8IA 1YY5A 1EL7A 2NPXA 1NPXA 3AEFA 1N4UA 3O0HA 3K7QX 4FDCB 1TDOA 2AR8A 4OVIA 1E7PA 1GTHA 3UCLA 3CN8A 4E0VA 1GRFA 4U8OA 3NTDA 3CGBA 3AEBA 3NTAA 3ATQA 5FMHA 3I6DA 4OPUA 3IF9A 5U1OA 1TYTA 1KSSA 2XCGA 1FOHA 4TLXA 4YXDA 5HY5A 3UTEA 3BNMA 1IUWA 2CULA 2WOVA 4U8KA 1GALA 3GSIA 1NHRA 1JRXA 4IVMB 4D03A 4UP3A 3OZ2A 1P2EA 2XYOA 4B69A 4YSHA 4OPDA 2YLZA 2WHDA 4X9MA 4CY6A 3AYJA 2XLSA 4GF7A 4GR1A 1CL0A 3AEAA 1F3PA 5M10A 3H4KA 2A89A 2JK6A 1CBOA 5EB5A 1PJ7A 3KPFA 3GD3A 4A5LA 4B67A 2DKIA 4A99A 4YTNA 3ZYXA 3KD9A 3UKLA 4BJZA 5J7XA 3K7MX 1F8SA 2PHHA 3S61A 3KLJA 2FJEA 2XDOA 1F8RA 4EM4A 3LADA 4H2RA 1RP0A 1DJQA 2WU2A 4OPCA 4EMIA 4GRTA 3PVCA 3P4RA 4HA6A 5JCKA 5BUKA 3ALLA 3K7TA 1K0IA 2CDUA 2BACA 1CJ4A 3DJGX 3UOXA 3AB1A 4B66A 5M0ZA 2BCGG 2JB2A 4X4JA 5FS9A 2JKCA 2XVIA 2X8HA 3P9UA 1JRYA 3NIXA 2GAHB 3D8XA 4PABA 1VRQB 2GR1A 4XXGA 4WX1A 1DJNA 2OA1A 3B3RA 4LIIA 3UP5A 1YQZA 2WP9A 4DSGA 1CJCA 1OJAA 5KVHA 1GRAA 2JAEA 2GQWA 4H4XA 2XFUA 1FL2A 3AD8B 4BK2A 2ZBWA 2BC0A 3H8LA 4ECHA 1E1MA 3G5RA 2TPRA 4A9WA 4YSXA 3GD4A 5BULA 1GV4A 1FEBA 3GRTA 4LU6A 2WBAA 1OJTA 1XPQA 3CPJG 4B68A 1REOA 4J34A 4BJYA 3CNTA 2YLRA 4A79A 3ABVA 1VG0A 1D7YA 4K8DA 1NG4A 3H8IA 5IPYA 2WQYA 4X9NA 1GRHA 3RNMA 4CY8A 1L9EA 1Z6LA 1ZOVA 4J57A 5IQ1A 4HB9A 2C76A 3ADAB 4RG3A 2EQ9A 3AE8A 3LOVA 3BI4A 4RG4A 4ICYA 4YKGA 4N9XA 1XDIA 3REDA 1ZOYA 3EAOA 5HHFA 4CCQA 5J60A 1OJCA 4CBQA 1M6IA 4NEVA 4APNA 2Q0KA 3GMBA 1SEZA 3AEGA 2WPFA 1GTEA 2YQUA 3COXA 4JQ9A 4Z25A 3PO7A 4TM1A 1H82A 1LVLA 2FJBA 1PBEA 2GEWA 3C4AA 1PN0A 2R0CA 2FJAA 2C67A 4OPLA 2Q7VA 3CPIG 2BCPA 3AWIA 2RGJA 2YWLA 3DK8A 3QVPA 3NYCA 2BS3A 4Z2UA 3CPHG 3DK4A 4A65A 3JSKA 1OJ9A 4H2QA 2PYXA 1GESA 4Z24A 2XLPA 3DGZA 3UOVA 3VRAA 1DNCA 3URHA 1FEAA 4U8NA 3P4PA 2GH5A 1BGNA 2XFNA 3GWFA 3QJ4A 1RSGA 1F8WA 3AE5A 5BRTA 2WU5A 5C3JA 3BI5A 1GXFA 4DGKA 1EL8A 3UTFA 1XHCA 4B64A 1CJ2A 1H7WA 1OJDA 1LJ1A 4H4YA 3DMEA 4U2TA 3ALMA 3NYFA 5C2TA 3EPTA 1O94A 1Q1RA 1AOGA 2ZZBA 2QA2A 2E1MA 4ZCCA 2YR6A 2B7RA 2JBVA 3AD9B 2V3BA 4K5SA 1H7XA 3M13A 2VRMA 2RGOA 3KVEA 4TM3A 1GNDA 1FECA 1GREA 3LXDA 1JRZA 3GMCA 3AEDA 3LB8A 1O95A 4Z43A 2BS4A 2OLNA 4J31A 3Q6JA 3DGHA 4OPTA 5JCNA 2C7GA 3UKFA 2WS3A 4Y4MA 4P9SA 4GDEA 1QJDA 5EOWA 4NTEA 1N4VA 1NAAA 2GR0A 3AE3A 3IWAA 3T37A 1BZLA 3D1CA 5CQFA 2GR3A 3RHAA 2BYBA 1D4EA 4EQWA 1GRTA 1D5TA 4AP3A 1IUXA 3QFBA 4JNAA 2R4EA 1H86A 1IJHA 2R4JA 1NENA 5FS6A 1JNZA 1NDAA 1ELIA 1BKWA 2GF3A 3KKJA 4EQXA 2WOIA 1EL9A 1B4VA 1E1LA 2GV8A 4JDRA 2YLTA 4I58A 5EBKA 1TDNA 4YSZA 1NEKA 3NRNA 2WPEA 4UDQA 3UKPA 4H2PA 2O9ZA 4J36A 3UKQA 4GDPA 2YVJA 4IVOB 1Y56A 1PXCA 2IVEA 2YG5A 4WCTA 3M0OA 1TYPA 2UZZA 2V6OA 4J33A 4PAAA 1B37A 1PS9A 4AP1A 4C74A 2XVFA 2YLWA 2H89A 2YM1A 3GYIA 3C4NA 4EIQA 1PBFA 4TLZA 4U8PA 3NN0X 3ITJA 3F8RA 1EL5A 3F8DA 1IUSA 2R0PA 4GCMA 2Q0LA 1H6VA 1GT8A 3AXBA 4O5UA 4USRA 3QSMA 1JOAA 2VOUA 1PBCA 2VVLG 1PXBA 2A8XA 5LV9A 5L46A 2WOWA 4YSYA 1CC2A 3ICSA 2C3DA 3AE6A 1VQWA 4B65A 1DOEA 1ZMDA 1N4WA 1S2QA 1Y0PA 1Q9IA 4YKFA 1N1PA 1YQ4A 3CGCA 3DJEA 2BXRA 4K22A 1ZP0A 3CNDA 3OC4A 4EIPA 1FCDA 4NTDA 3AE4A 4H4WA 3BI2A 2YLXA 4JNQA 4BK3A 3NHOX 1GSNA 1GPEA 3WE0A 4RSLA 3NG7X 3NLCA 2XFQA 3DJDA 1CC4A 1E1NA 3FMWA 3DJJA 2FBWA 3S5WA 1V59A 2BK5A 2IIDA 3V3OA 4MJWA 3VRBA 5KOWA 1BF3A 4UDRA 1B5QA 2BS2A 1YKJA 2XLUA 2WEUA 2ZZ0A 4H4TA 5FS8A 3R9UA 3RP6A 4Z26A 3DH9A 2QCUA 5KVIA 3P4SA 3ATRA 1F6MA 5JCMA 3ICRA 1PHHA 4K7ZA 3G5SA 1DODA 2BK3A 1PJ6A 3NH3X 1BWCA 1RYIA 1ZDLA 4JY3A 1E1KA 4H4SA 2X50A 1IUTA 2GB0A 3SGLA 2VVLA 4TM0A 1PBDA 2GR2A 2YAUA 4EQSA 1H84A 1Q1WA 4H50A 3SM8A 5JCLA 2YG3A 2WP6A 1L0VA 1YQ3A 5HYMA 2GMJA 2VRLA 1JU2A 2BK4A 1PDHA 1TDFA 2JB1A 4YTMA 2WDVA 3RP8A 4REKA 1CJ3A 2CFYA 2GVCA 5FS7A 5GRTA 3EF6A 1S2YA 3QSEA 2YR4A 4D04A 1KFYA 1EBDA 1DXLA 3SFDA 2ARDA 4YTPA 3UOZA 4BK1A 3NKSA 2W0HA 2HQMA 4H4RA 4H4ZA 2A87A 4EQRA 3NYEA 3DA1A 2X8GA 2TMDA 3AD7B 2WETA 3UP4A 3B6DA 4GUVA 4H4VA 2AQJA 2YG6A 4A6NB 1TDKA 3NK2X 2B9YA 1D4DA 4Y4NA 3KU9A 2BA9A 5KRQA 1H81A 3AE1A 2ACZA 4A7AA 5EB4A 2GMHA 4OCGA 2EQ6A 3AYIA 2RGHA 4EM3A 2XLRA 3FPZA 4Z44A 3VQRA 5HXIA 4M52A 2WP5A 2Y6RA 3EANA 5CKUA 3ALJA 3BNUA 2YG7A 3QVRA 1CHUA 3AE2A 2XFOA 4K2XA 1E39A 1QO8A 1ONFA 2I0ZA 3FIMB 4FK1C 4U8MA 4B1BA 4EMJA 3BHFA 1CC6A 4ZCDA 1B8SA 4YT0A 1JNRA 2VQBA 3RP7A 2Q6UA 3UKKA 3UKAA 1L9CA 1LQUA 1L9DA 2E5VA 2XVEA 3FG2P 1CF3A 3GRSA 3NK0X 1ZX9A 2GRTA 2APGA 3ICTA 1K0JA 2AAQA 1E6EA 2VQ7A 2X3NA 4J56A 4KX6A 3DK9A 4ZN0A 3CTYA 3GDPA 2WDRA 2BABA 1GETA 2C66A 2DKHA 4FX9A 1XANA 2R45A 1LPFA 4I59A 3Q9TA 5U63A 3L1RA 3NK1X 1D7LA 3CGDA 4DSHA 3II4A 4AT2A 3M12A 1D4CA 2C73A 4AT0A 2YR5A 3AEEA 4U2SA 3VRDB 3G5QA 2IVDA 1KNRA 2R46A 2WPCA 1NG3A 1COYA 3LZWA 4CNJA 1X31B 4O5QA 4OPGA 3VR9A 2OLOA 4A6NA 1IUUA 2YM2A 1QLBA 1PJ5A 4Z2RA 2R0GA 3LZXA 4AOSA 1TRBA 4K5RA 2QA1A 1NHQA 3BHKA 5DBJA 2B9WA 2OAMA 1NHPA 1K0LA 1LQTA 3GWDA 3GYJA 4H7UA 5GSNA 1GEUA 3CNSA 2QAEA 1NHSA 3NNEA 4XWZA 3ISHA 3UOYA 2EQ8A 4USQA 1KNPA 2YVFA 2XFPA 4JN9A 4LA1A 2E4GA 4NEWA 2B7SA 2H88A 2VZ2A 5ER0A 2YLSA 4CNKA 4IV9A 4C5OA 4YWOA 3GDNA 2GQFA 1P2HA 3AE9A 3SFEA 2V3AA 1KF6A 2RABA 1KDGA 4C3YA 1ZMCA 2EQ7A 4C77A 3AE7A 2C72A 2XVHA 4Z2TA 2YG4A 4H4UA 3UTHA 4EMWA 2BXSA 5KOXA 3AYLA 3PS9A 1HYUA 3IC9A 4C3XA 1S3BA 3C96A 2C75A 1TDEA 2J3NA 4BV6A 4CCRA 3UKHA 1M64A 3QFAA 5KXJA 4DNAA 3HZLA 3K30A 4BURA 2V5ZA 3CGEA 4ADWA 5IQ4A 1GERA 2XVJA 4OPIA 4J2WA 4U2LA 2V61A 3QSSA 5KWFA 1LV0A 3E1TA 4XWRA 3P1WA 1H83A 1DOBA 3FBSA 3VR8A 4U8LA 5U25A 2C65A 4UDPA 2WESA 4IA6A 1K4QA 1PBBA 1KSUA 2JB3A 2GAGB 1JEHA 4H4PA 3V3NA 1MXTA 1ZKQA 3ZDNA 1BGJA 1ZY8A 2V60A 1GOSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z5XA 1W4XA 3DYRA 2C80A 2FJDA 4LL4B 3ERGA 2H1AA 3NN6X 1V9WA 6GSUA 2C3CA 2BC1A 4FYUA 4ISDA 3I3LA 3TJKA 3CIRA 3NGCX 2A4VA 1R5AA 3LJPA 4N30A 1Y56B 2ES7A 2YVGA 4POMA 2VCQA 3C71A 1TXXA 1WJKA 3GTUB 4TM4A 4WBJA 2A2PA 1WWJA 4ML1A 1S3AA 3DVXA 1SD9A 1TI1A 3CTGA 3UOMA 1LTXR 4NZHA 1C0KA 2X8CA 2B9XA 3UMAA 4XHMA 1A23A 3V76A 3KXOA 1BJXA 1EL7A 3O0HA 1NPXA 1B4PA 1TDOA 4OVIA 1A8LA 1K0MA 2Z9SA 1E7PA 1AUCA 3CN8A 2LJKA 4MDCA 4MK3A 3NTAA 8GSSA 3ATQA 5FMHA 1AQWA 3GSTA 3IA1A 1FOHA 4IN0A 5HY5A 1YQ1A 2CULA 2O8VB 2LRTA 1H75A 2XYOA 4B69A 3F9UA 4OPDA 5GZZB 2CAIA 3E0UA 4CY6A 4GR1A 4II3A 5M10A 1OVNA 1CBOA 1PJ7A 2P31A 1O81A 4ZB6A 3VWVA 4A99A 2FLSA 4BVYB 1KNGA 2FNOA 4MZBA 3S61A 1B4QA 2HXKA 2VCVA 3ZMLA 3HJOA 4EMIA 1SJZA 3ALLA 1TP9A 1CJ4A 18GSA 3VURA 2OA7A 3UOXA 3AB1A 2BCGG 4IELA 5G1LA 3P9UA 2XVIA 2QSIA 2X8HA 4MH3A 5F8BA 1J9BA 4WX1A 2H01A 5B8BA 4LIIA 4PQ1A 3DGQA 3UP5A 1CJCA 1OJAA 5KVHA 2GQWA 1Y25A 5F0GA 3SBCA 3W6GA 3AD8B 2ZBWA 3SZWA 4K7OA 3EU4A 5DCGA 3TJJA 3GD4A 1GUKA 2GDRA 1GTAA 1J08A 2WBAA 1OJTA 5HR1A 4J34A 3QCPA 3CNTA 2OBIA 4A79A 1VG0A 3HXSA 5DVBA 4K8DA 2WQYA 3GURA 1FOVA 2GSQA 2GSTA 2AHEA 2C76A 4RG3A 1PRXA 2VCTA 3AE8A 1T4YA 3O3TA 4MPFA 4OMVA 1ZOYA 5HHFA 3Q6OA 1OJCA 4NEVA 2WGRA 1SKWB 3FYGA 2YV7A 1GTEA 3L0HA 4JEDA 3D21A 3KTLA 1H82A 2WULA 2CX4A 1PBEA 2R0CA 1TU8A 2I4AA 2FJAA 4OPLA 3C8EA 2DJ3A 2BCPA 3AWIA 2RGJA 3QVPA 4BVXB 3ZYWA 3KH9A 4Z2UA 1X0RA 3CPHG 3GMFA 4A65A 3HJMA 5A4UA 2JZRA 2B5EA 2HRAA 4YJGA 3E3EA 2YWMA 2PYXA 3ZFLA 3C1RA 3BD2A 1GESA 4Z24A 3QFAC 3UOVA 3QAVA 3EYTA 1WIKA 1M99A 1KEBA 1QXHA 5BRTA 3P90A 2M46A 3BI5A 1GSFA 2VM1A 3UTFA 4ZB8A 4L5OA 1H7WA 4H4YA 3DMEA 4U2TA 2QGVA 3EPTA 4OFMA 2O87A 1FW1A 1Q1RA 4IJIA 2E0QA 2JBVA 4GRFA 5J4UA 4DSQA 2PWJA 2L5LA 1FECA 1GREA 3LXDA 5GAND 1YEXA 2OLNA 2WS3A 4Y4MA 4P9SA 4GDEA 1N4VA 4KNDA 5KN1A 3FY7A 3T37A 2FHEA 1D4EA 1IUXA 3KTBA 2IN3A 1IJHA 1NENA 1JNZA 2JSYA 2WOIA 1EL9A 1B4VA 1E1LA 2GV8A 3IOSA 4JDRA 3D5JA 4I58A 4V2NA 2PU9C 2MMZA 3UKPA 4H2PA 1O8WA 2C0GA 3F4RA 4IVOB 3ZNOA 4WCTA 1XOBA 2E49A 3M0OA 5B6NA 2DBCA 1PL2A 2V6OA 3BCIA 4EVMA 1TYPA 4J33A 2OADA 5KEJA 1EV4A 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