3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2C67A 2GMJA 1ZX9A 3IWAA 1CC2A 1GNDA 2Y6QA 1CJ3A 3CN8A 4D03A 4U8JA 3UP4A 4A99A 3AD7B 2BCPA 2YG4A 5FS6A 2C72A 3UTEA 3AWIA 3UTFA 4B67A 2JB1A 2C75A 3DH9A 2JB2A 4H7UA 2YLWA 3F8PA 2XVIA 4OPUA 4JY2A 3PS9A 4GR1A 3AE4A 1IUXA 3DK4A 1FL2A 4N9XA 3ICSA 1PDHA 3VRBA 2OALA 2GQFA 1VRQB 1H82A 1ELIA 2Q7VA 1CC4A 4GDPA 2YM2A 2IIDA 1BGNA 3GYJA 4XWRA 4H4YA 1W4XA 3UTHA 1D5TA 1PXCA 3BHKA 2YAUA 1V59A 3ICRA 3AE6A 1NENA 5TR3A 2E4GA 4Y4MA 2OAMA 4APNA 3QFAA 1KF6A 2V61A 1KSSA 1O5WA 4I59A 1BKWA 4GUVA 1GPEA 4ICYA 4TM0A 2V3BA 4LU6A 3IHMA 3R9UA 3ISHA 4B66A 1LQTA 3RP6A 1EL9A 3D1CA 3SM8A 3UKQA 3ZDNA 3QJ4A 3QVRA 4I58A 3IF9A 3V3NA 4UP3A 2JBVA 3B3RA 5KOWA 2BABA 2YG3A 1PHHA 4H4WA 2WPEA 3BI4A 4TM3A 1IUSA 1CJ4A 1NDAA 3DJEA 3C4AA 2RGJA 1D4CA 3UKFA 2QA1A 4EQXA 2Q0KA 4KPRA 3DJJA 4H2NA 1YQZA 1BWCA 1VQWA 2WESA 3AE1A 3DJDA 2VRMA 4J57A 4YTMA 4C74A 3AXBA 4OPTA 4B63A 3ALMA 5DBJA 2C70A 3K7TA 3UOYA 3FIMB 4ZCCA 1DOEA 2ACZA 3DK8A 4CNJA 2JKCA 3OC4A 4XWZA 4NTDA 4X9NA 1GEUA 4EIQA 5FMHA 2VQ7A 3AEGA 3UCLA 3ATRA 1GRBA 1DXLA 5CKUA 3NT6A 2FJDA 3NN0X 4WX1A 5KXJA 2I0ZA 3FPZA 2QAEA 2WP9A 1GREA 3M13A 4Z24A 1PJ5A 3IC9A 4USQA 4NZHA 5BUKA 1REOA 2PHHA 5U25A 2WHDA 3K7MX 3QSEA 4RG3A 3V76A 4IA5A 4AT0A 4EM4A 5L46A 4B69A 4DGKA 1F8SA 2EQ7A 2WU2A 3RP7A 1GT8A 1YQ4A 3S5WA 3II4A 4BK1A 4YTPA 2R4JA 4E0VA 3ALLA 1VG9A 4J34A 1DOCA 3P4QA 5U1OA 5KVHA 1TDFA 2CFYA 2BS2A 1GRGA 5EB4A 5EOWA 1LJ1A 4OCGA 4XXGA 1IUVA 1K0IA 4JN9A 1EL5A 1ZOYA 1B37A 3EANA 4CCRA 1N1PA 2GQWA 4MJWA 1PBEA 4CCQA 5JCNA 2XLSA 1S2YA 4O5UA 2AQJA 1NHPA 1GTEA 2XYOA 3S61A 3BI2A 2FBWA 1GSNA 1DODA 2DKIA 3DJGX 3UOZA 1GRAA 1H83A 1E39A 2R9ZA 4Z2UA 4UDQA 1JU2A 1H81A 2C3CA 1CJCA 1GRHA 4U8LA 2FJEA 3AE8A 3BI5A 3G5RA 1IUWA 2YLXA 1GRFA 3H4KA 2GMHA 4JY3A 4CRTA 2O9ZA 5IPYA 4ZN0A 1H6VA 2XLRA 1GALA 3CNDA 3CPJG 2B9WA 2B76A 2WP5A 1B8SA 2X8GA 3CGCA 2FJBA 3NYEA 1OJCA 3NK0X 1FECA 2OA1A 3AEEA 5GRTA 1X31B 2V5ZA 1HYUA 4ADWA 5EB5A 4YWOA 3CNSA 4YSZA 1H7XA 1RSGA 2V6OA 1BZLA 5CQFA 1E1KA 1TYPA 4OPDA 3AE5A 3VR8A 1XDIA 2BK3A 1YQ3A 1O95A 1VDCA 1Y56A 5FS9A 3QFBA 5IQ4A 2C66A 5BULA 1QJDA 1VG0A 4TM1A 5LV9A 4H50A 1Q1WA 4YKFA 3SFEA 4J36A 3KU9A 4HB9A 3P4RA 4FX9A 2ZZCA 4H4RA 4H4SA 1TYTA 4B1BA 1JRXA 1GERA 1LPFA 4UDPA 1JRZA 3HZLA 2GR1A 4NEWA 4AOXA 4EM3A 2RGOA 3GDPA 4EQWA 2V60A 2C7GA 3KA7A 4WCTA 3KPFA 1LTXR 2IVDA 5KOXA 2PYXA 1OJTA 3AB1A 5JCMA 3LXDA 2CVJA 3IHGA 2XCGA 2YG6A 1BGJA 3AE9A 4YSXA 1XPQA 2YR5A 3LB8A 1KSUA 2GVCA 2EQ9A 2XFNA 3NGCX 3UTGA 3AEDA 1KNRA 4BK3A 1MOKA 1CBOA 2R45A 2Z5XA 3AD8B 3KD9A 2C3DA 1IUUA 4EMIA 4YKGA 1D4DA 2WEUA 2JAEA 3L8KA 3NYFA 3AE2A 1GV4A 1TDKA 2GAHB 4GF7A 4U8NA 1H84A 2B9YA 3B6DA 2BS3A 3ICTA 1OJ9A 2GV8A 2BC1A 3CPHG 2BACA 3LZWA 4REKA 1IJHA 3RHAA 2X3NA 1JNRA 3DGHA 4YT0A 4AOSA 2BXSA 2VVMA 3GWDA 4C3YA 1IUTA 3P1WA 3G5SA 1GESA 2GEWA 4GDEA 4U8KA 3D8XA 4H4ZA 1PXBA 1JEHA 1M64A 4EMWA 3NTDA 2XFQA 2NVKX 2HQMA 4LIIA 4Z44A 3ALJA 1COYA 1Y56B 3EAOA 1NAAA 3GD3A 2WDVA 4RG4A 1L0VA 3SGLA 3M0OA 2JB3A 4BK2A 3QSMA 4Z43A 1LVLA 3QVPA 2GF3A 4GRTA 4YTNA 1ZK7A 4AP3A 1ZKQA 5JCIA 4K8DA 4NTCA 5EBKA 1CL0A 1RYIA 1E1LA 2AAQA 1NG3A 3AEAA 3GWFA 2WPFA 3NK2X 2EQ6A 2A87A 3H8IA 1E1MA 3LZXA 2BA9A 3NKSA 1S2QA 3LADA 2APGA 4C3XA 2JK6A 2VQBA 3AE3A 3GMBA 1L9CA 4DSGA 2WOWA 2H89A 1DJQA 2XDOA 3ATQA 4IVMB 3KKJA 3AYLA 3Q6JA 2C73A 3NRNA 3AYJA 1NHRA 4B64A 2BXRA 2BCGG 3NTAA 4HA6A 3NK1X 3AEFA 2DKHA 3SFDA 1F8RA 2YG7A 4U8IA 4PABA 2WOVA 2OLNA 2AR8A 2WQYA 1PJ6A 2VOUA 1O94A 3E1TA 1TDOA 3REDA 3UKAA 5M10A 2R46A 1F3PA 3ABVA 1ZDLA 4TLXA 2C76A 1GRTA 2YLZA 2WS3A 2RGHA 4JQ9A 1MXTA 4DSHA 1GTHA 2YLTA 4Z26A 4X9MA 1GETA 5JCLA 2W0HA 3UKKA 4OPIA 2WP6A 3UKPA 2BYBA 1DJNA 4C77A 2R4EA 2VZ2A 4LA1A 4B68A 1ZMDA 3H8LA 2A8XA 2YWLA 1H86A 2R0PA 2WDQA 3EF6A 5KRQA 3CGBA 5FS8A 1NPXA 2YVFA 4M52A 5GSNA 2ZZBA 2EQ8A 1AOGA 3GRSA 3UKLA 2TPRA 1E7PA 1ZMCA 2TMDA 3AE7A 5ER0A 1PJ7A 3UOXA 1UKVG 1ONFA 2B9XA 2GH5A 4OPCA 3RP8A 1PBDA 2YVGA 5U63A 3VRDB 2RABA 2Y6RA 1CHUA 3CGDA 1YKJA 3CNPA 1DOBA 2XFPA 4YXDA 4EIPA 1L9DA 1N4UA 1Q1RA 2FJAA 2V3AA 4OVIA 3CTYA 1K4QA 3C96A 4H4QA 1NHSA 4U2TA 2YQUA 4YSYA 2GR2A 2BK4A 4GCMA 2BS4A 5JCKA 4BJYA 4H4XA 4H2RA 3GD4A 2VVLA 3BNUA 2B7SA 4U8MA 3UKHA 3UP5A 1TDNA 1PBBA 4EQSA 2J3NA 1E6EA 2YM1A 1OJDA 1NG4A 4K7ZA 1XHCA 1EL8A 1K0JA 5HYMA 3CGEA 4Z25A 4B65A 4U8PA 2WBAA 5C2TA 4IVOB 3ZYXA 3DMEA 3GYIA 4C5OA 4H4VA 2CULA 1Y0PA 4USRA 1QLBA 2A89A 3AD9B 1CC6A 3ADAB 3KLJA 2R0GA 3NG7X 4AP1A 4FDCB 2QCUA 3QSSA 3KVEA 2VRLA 3GSIA 1E1NA 4CY8A 2WDRA 2XLTA 3ITJA 2X8HA 1S3BA 1F6MA 3NLCA 4H4TA 5J7XA 2Z5YA 2ARDA 1NEKA 1H7WA 3EPTA 4JNAA 1S3EA 2IVEA 3DGZA 4A7AA 3AEBA 1ZOVA 1GOSA 1JRYA 5HXIA 1ZP0A 2WPCA 1LQUA 4X4JA 1B5QA 2YLRA 3AYIA 3DK9A 3LJPA 1N4WA 4RSLA 4TLZA 3NYCA 3V3OA 5BRTA 4JNQA 5HHFA 1K0LA 4KX6A 2GR0A 3G5QA 3URHA 1F8WA 4OPGA 1M6IA 3GMCA 1Q9IA 4U2SA 4O5QA 2R0CA 1JOAA 2Q6UA 2YG5A 3K7QX 4BJZA 4DNAA 3Q9TA 4NEVA 2E5VA 2VVLG 2OLOA 3CPIG 2X99A 3FMWA 1DNCA 1PBFA 4Z2RA 4UDRA 1PBCA 1XANA 1FEBA 1OJAA 4Z2TA 3SQPA 1SEZA 4ZCDA 2X8CA 3BHFA 4A6NA 1FEAA 4A5LA 1GXFA 2GB0A 1B4VA 2H88A 5C3JA 3P9UA 3P4SA 1Z6LA 5BVAA 3GDNA 4CY6A 4H2PA 1D4EA 2XVFA 3M12A 2XVJA 2ZZ0A 5IQ1A 1P2EA 1QO8A 1N4VA 2C64A 2C65A 1FOHA 4K5RA 5FS7A 4CNKA 1RP0A 1JNZA 3O0HA 5HY5A 3LOVA 2GRTA 2UZZA 2YR6A 2GAGB 2F5ZA 4IV9A 3CNTA 1KNPA 3CIRA 2XVEA 3FBSA 3C4NA 1EBDA 3T37A 3VRAA 2X50A 3JSKA 1KDGA 3VR9A 2XLUA 2XLPA 3F8DA 2YR4A 1PN0A 1CF3A 4A9WA 2NPXA 3L1RA 2B7RA 2E1MA 1P2HA 4J56A 4OPLA 3UOVA 3I6DA 2XFUA 1MO9A 1D7LA 3RNMA 4EMJA 5J60A 1TDEA 3P4PA 2XFOA 3NH3X 3OZ2A 3NHOX 4H4UA 4K2XA 4PAAA 3NIXA 2WOIA 1CJ2A 4Y4LA 1L9EA 3K30A 1YY5A 4YSHA 3I3LA 1D7YA 4P9SA 5KWFA 2Q0LA 2YVJA 3NNEA 1FCDA 1ZY8A 3GRTA 2WETA 4J2WA 3COXA 4J31A 2ZBWA 3CNJA 3PVCA 1BF3A 2GR3A 1EL7A 4J33A 4BURA 4AT2A 4TM4A 1PXAA 4EQRA 4K22A 2YLSA 2QA2A 4IA6A 4ECHA 4FK1C 4NTEA 3VQRA 4A79A 3FG2P 4U8OA 5M0ZA 3F8RA 4JDRA 2BC0A 3WE0A 4FK1A 3DA1A 3NN6X 2CDUA 4A6NB 4CBQA 1KFYA 1PS9A 4Y4NA 5KVIA 1NHQA 4H2QA 3BNMA 4K5SA 3PO7A 1LV0A 4A65A 2XVHA 1TRBA 4D04A 4BV6A 2WU5A 2BK5A 4U2LA 4H4PA 3AECA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZX9A 3VWWA 4MJEA 1PGTA 1O81A 4RI6A 3VLNA 3VK9A 3ZNQA 2GSTA 4GF0A 1PMTA 4XIHA 4G0IA 1NHYA 2IWTA 2PBJA 4B67A 2BRAA 2JB1A 3DH9A 4OCFA 1XW9A 3F8PA 2XVIA 1Z7RA 5AN1A 5BMUA 2VLUA 3ICSA 1PDHA 5A4VA 3KZQA 2OALA 1SJIA 2X64A 3KD0A 2IIDA 3U5RE 4ZBAA 1QXHA 1M2AA 3BHKA 2YAUA 14GSA 1OC8A 1GTUA 1V57A 4XCSA 1KSSA 4IVFA 2F8FA 2H8LA 4G10A 4TM0A 2H01A 3IHMA 3R9UA 3QAWA 1LQTA 2FWFA 2AYTA 2GZZA 2HSMA 2V6KA 3QJ4A 3V3NA 1SJZA 2YWNA 3UJ1A 4H4WA 4TM3A 3P8WA 1CJ4A 1R26A 3A2VA 3W8JA 3KH9A 4EUYA 2QA1A 4EQXA 4KPRA 1YQZA 2FA4A 1VQWA 2CX3A 2VRMA 3CTGA 4MZCA 2H74A 5J9BA 3K7TA 2H71A 2G2QA 5G1KA 1XVQA 2L4QA 1WOUA 4X9NA 2K8SA 7GSSA 2VQ7A 3UCLA 3A2WA 3EMPA 1TU8A 3GKNA 3IAS2 3NT6A 5KXJA 3WGXA 2I0ZA 1ZMAA 2WP9A 2B5YA 1GREA 3W8SA 5CRHA 5BUKA 2PHHA 4CW9A 2WHDA 3K7MX 3QSEA 2HYXA 2WU2A 4PQIA 4GQFA 1YQ4A 3S5WA 4BK1A 3WGDA 4YTPA 3QCPA 2CAIA 4J34A 3ERGA 3QAVA 4KH7A 4TXOA 2CFYA 2BS2A 1GRGA 3S9FA 5EOWA 3FK8A 5IIZA 1N1PA 3TKSC 4MJWA 2XLSA 4O5UA 2AQJA 2L6CA 2XYOA 2KHPA 5F0GA 2YWOA 1GSNA 2DKIA 5CAXA 1GULA 1YKAA 3W4IA 1GRAA 3ZNNA 3F6DA 3US3A 2R9ZA 2O8VB 2B1KA 3DMLA 1I9DA 3N5OA 1CJCA 3SXIA 1Q98A 3AE8A 4YH2A 3WT2A 5B8BA 5EY6A 4YJGB 3ZFLA 2OADA 3ZMKA 4ZN0A 1GALA 3PGTA 2LQQA 4KCEA 3DGQA 4D73B 3HJOA 3CGCA 3CMMA 3NK0X 1EGRA 5H5SA 2OA1A 3AEEA 4YQUA 2HE3A 2V5ZA 4ADWA 2PVOC 2IMEA 5J5NA 2FD3A 3WT1A 3CNSA 4YSZA 2DLXA 1MDJA 1H7XA 2K9FA 2V6OA 1BZLA 4NAXA 1Z3EA 2L5LA 3VR8A 2E4AA 4JR6A 3KP8A 1XZOA 5IQ4A 4G19A 4TM1A 4NWYA 1U87A 4DEJA 3KU9A 1FO5A 2MYGA 1KBNA 3HYPA 4YJFB 3L78A 1JRXA 4NNJA 3ZVJD 3HZLA 1WE0A 4AOXA 3GDPA 3HVXA 3KIJA 3KA7A 4J2FA 3KPFA 2FWHA 4GRFA 2DIZA 2I1UA 1M9AA 4KCAA 1OJTA 1PKWA 3AB1A 3SY4A 1X0RA 3IV4A 2F3MA 4O5RA 6GSYA 1XPQA 3AE9A 3LB8A 1Z6NA 2GVCA 3V1WA 5FT3A 2XFNA 3AEDA 3CRUA 1T1VA 3NZNA 4K2DA 1CBOA 1MOKA 3GH6A 1IUUA 1GLQA 2C3DA 1D4DA 2PGTA 2WCIA 4MPFA 2FHEA 5D9WA 2JZTA 1AC1A 3GNJA 3EE2A 3RHAA 1IJHA 1JNRA 5IQYA 3KPKA 1A23A 1VF1A 3FZ4A 3MDKA 3APOA 3KM6A 3GWDA 1Q4JA 4IN0A 1TP9A 3LG6A 3LGCA 3P1WA 4WF5A 2GEWA 4GDEA 2E7PA 3D8XA 5G1LA 1PXBA 5D8IA 3FY7A 3HVSA 2HQMA 1X5CA 1Y56B 2OE1A 2C4JA 3GD3A 1FVKA 3M9JA 4POKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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