3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
4CNKA 3UP5A 1QO8A 3CN8A 3PVCA 2GF3A 4U8JA 1GETA 3EAOA 2BACA 2C64A 4YTNA 3CIRA 3BHFA 4D03A 1ZY8A 1BKWA 2E4GA 4HA6A 2FJEA 1L9CA 4H4TA 2X50A 4I58A 4XXGA 3CNSA 5C3JA 3SFEA 3NNEA 4YKFA 4WX1A 1OJ9A 2XLSA 3RHAA 3AEAA 2W0HA 1JRYA 3M0OA 3DMEA 3REDA 3SQPA 5FS6A 2YVFA 4X9NA 2JB1A 4JY3A 4FK1C 4U8PA 2EQ6A 4BK2A 2WBAA 1FEBA 1H7WA 2BC1A 1IUXA 2APGA 2CDUA 2Q0LA 3VQRA 1F8RA 1E1MA 1HYUA 2WEUA 2XYOA 3KVEA 3UOXA 3VR9A 1E6EA 2QAEA 1YQ4A 4A6NB 5KOXA 2JBVA 3NK0X 3P4RA 1DODA 2TPRA 2XVJA 3F8DA 1JRXA 5M0ZA 2AR8A 2A87A 4KPRA 1JU2A 2XVEA 3RNMA 2R46A 2JAEA 2YVGA 3H4KA 4O5QA 1L9EA 4H4SA 3ATRA 3R9UA 1QJDA 1S3BA 1REOA 2GR0A 2R45A 5GSNA 4C5OA 1JEHA 2YR6A 1GV4A 3QVRA 4Z2RA 1VG9A 2RGOA 2VVMA 3COXA 1SEZA 2DKHA 1TDFA 3UCLA 5JCKA 2Z5XA 1DOCA 3S61A 4AT2A 4D04A 3CNPA 5HYMA 2XFUA 4EQRA 1E1NA 1H83A 5L46A 5JCMA 4LU6A 5M10A 3CNJA 3FG2P 1YY5A 4JNAA 1PBDA 4Y4NA 3QSMA 2GMJA 4U8NA 3QFAA 4FDCB 2OLNA 4IVMB 3AD7B 4USRA 2QA2A 3GMCA 3AEFA 4U8OA 4FX9A 4YWOA 4GRTA 1GRGA 1NHQA 2VQBA 1GSNA 1JRZA 1PBBA 1LTXR 2C72A 3AEGA 4BURA 3UKKA 1K0LA 1N1PA 4Z2UA 4IA5A 3DJJA 3LXDA 4GDPA 1GXFA 2Q0KA 3UKFA 4M52A 5U1OA 5FS8A 3UTEA 5BVAA 2B7RA 3VR8A 2WETA 4J56A 1LQUA 1MXTA 1F8SA 3AE3A 1GTHA 3AWIA 3ZYXA 4YSXA 1KFYA 5ER0A 1H82A 2R0PA 2R0GA 2WOVA 2XFQA 4Z24A 4A99A 3NIXA 3QJ4A 1CC4A 2CULA 1XHCA 2X8HA 3NH3X 1TYPA 2TMDA 2YR4A 4REKA 3P4SA 4OPTA 4B67A 1DOBA 4BK1A 4APNA 2XFOA 3D8XA 2X99A 4OPGA 4ZN0A 3I3LA 4JN9A 1NG4A 1IUVA 3G5SA 2CFYA 2BK3A 4JQ9A 1P2HA 2PYXA 4U8IA 1S2YA 3UTHA 1JNZA 4CY8A 4CCQA 4EM3A 4A9WA 3BI5A 3UKHA 1TRBA 3ZDNA 3ICSA 4CCRA 3GSIA 2GB0A 3BNUA 5CKUA 3EF6A 3QFBA 1VQWA 2IVEA 2BK4A 3AYIA 3UKQA 4Y4MA 1COYA 1LQTA 2GH5A 2R4EA 1TDNA 2YAUA 4MJWA 4CY6A 1TDEA 4OPUA 4OPLA 5J60A 1EL5A 1ONFA 3C96A 2A89A 2C67A 1W4XA 4I59A 2YWLA 3UKLA 4B68A 3GDNA 3L1RA 4Y4LA 3NT6A 4UP3A 3UTGA 1O94A 3AB1A 2YG3A 3Q6JA 4OPDA 4U8LA 3S5WA 4A79A 4A7AA 1PBCA 1ZOYA 4K5SA 4XWRA 1CHUA 3P4PA 3V76A 3KA7A 4K5RA 3NN6X 2YLTA 2XLRA 3ATQA 3EANA 1ZDLA 1CBOA 4AOXA 4J31A 1F8WA 3IHGA 4Z25A 3BNMA 2WPEA 2X8GA 4C3YA 4OPCA 1F3PA 4A5LA 2WU5A 1ZMCA 5CQFA 4EMWA 3P9UA 3P1WA 2JKCA 5U25A 3UTFA 1JNRA 3NYEA 1PBEA 3GD3A 4EMJA 4OCGA 1V59A 3UOYA 3LADA 2B9XA 3JSKA 1B5QA 2XLUA 2YVJA 2BABA 1LPFA 4RG4A 2WESA 3NG7X 2GR3A 4IA6A 2C76A 4K7ZA 2WDQA 2WPFA 3FMWA 4P9SA 2GV8A 2E1MA 3ABVA 1VG0A 1GRHA 4X4JA 1D4DA 3SFDA 5KRQA 3VRBA 1RP0A 1KSSA 3P4QA 1N4WA 3KKJA 1CC2A 4H4UA 2AQJA 4ZCDA 2WU2A 1S2QA 1CC6A 2B7SA 4H2QA 3AE6A 2JB2A 3O0HA 4H4ZA 4EIPA 4J36A 5EB5A 3UKAA 3UP4A 3AE7A 1Y56A 4EQWA 5JCIA 5TR3A 4LA1A 4IV9A 1XPQA 2B9WA 4EQSA 4Z44A 2FJBA 2XVFA 3GYJA 4TLXA 4YSHA 3M12A 1FEAA 3DJDA 5KXJA 1H81A 3AXBA 4U8MA 5KVHA 2QA1A 4PABA 1B8SA 1GRBA 4GCMA 2GVCA 1K0JA 4TM4A 4USQA 4H4YA 2WP5A 3NYCA 1BGNA 4NTCA 2YLXA 2RABA 2ZZ0A 4OVIA 2EQ9A 2XLPA 3DGZA 2GR1A 3NKSA 2NVKX 4DSGA 4NTDA 1MOKA 4PAAA 4H4RA 3ICTA 2Y6RA 3LZWA 1DNCA 4OPIA 4Z43A 5BUKA 4ZCCA 3UOZA 2I0ZA 3RP8A 4YTPA 1DOEA 1O95A 4BJZA 3CPHG 1BWCA 3NLCA 3RP6A 1L0VA 1RYIA 2OA1A 2VOUA 4NEWA 4A65A 4BJYA 3LJPA 4NEVA 2C70A 3C4NA 1OJCA 3V3OA 3WE0A 2V3AA 4H2NA 2IVDA 3AEBA 2C7GA 1H6VA 4ECHA 4EQXA 1KNRA 3LZXA 1B4VA 1L9DA 5HXIA 3GYIA 3CPIG 4EIQA 1E7PA 3BI2A 4C3XA 1ZX9A 3K7QX 1XDIA 2WOWA 2O9ZA 5IQ4A 1KDGA 3NK1X 5JCLA 2V61A 3NHOX 2WOIA 4BK3A 1X31B 1M6IA 1Q1RA 4E0VA 1GOSA 1NG3A 1S3EA 2GRTA 3EPTA 3VRDB 3AYLA 4TM0A 2YG5A 4K8DA 3AYJA 3AE1A 5FMHA 2WP6A 4BV6A 2BXSA 1CJ2A 2XVIA 2EQ8A 4JNQA 1VRQB 2VVLA 2YG7A 2OAMA 3AEDA 3CNDA 3M13A 2WDVA 2C3DA 3RP7A 3KLJA 4B1BA 1EL7A 3QSEA 4C77A 3GWDA 3AECA 1VDCA 1IJHA 4LIIA 1KSUA 2NPXA 1GEUA 1PXCA 5DBJA 3KPFA 3H8IA 3KU9A 1LV0A 1GREA 3NN0X 2GQWA 2V6OA 1DJNA 1GRTA 4J2WA 4RG3A 2V5ZA 2BYBA 1EBDA 2Y6QA 3D1CA 4H4QA 1K4QA 2IIDA 3E1TA 4TM3A 2E5VA 2XFPA 3SGLA 3G5QA 2BK5A 1CJCA 3ICRA 1NEKA 1XANA 2YR5A 2YLSA 1EL8A 1Q9IA 2C73A 1H7XA 1CF3A 1NENA 5KVIA 1NAAA 4RSLA 3F8RA 2JB3A 4IVOB 1GT8A 4U8KA 1Y56B 1PJ7A 2Q6UA 1YKJA 2FJDA 3IF9A 1H86A 1PHHA 4H4PA 2X3NA 1ZK7A 4K2XA 1TYTA 2WHDA 3DK4A 1EL9A 4WCTA 2VRLA 1PDHA 2VQ7A 2ZZBA 2FJAA 3DJEA 2Z5YA 1F6MA 1FECA 2VRMA 4J34A 4B64A 1GRFA 1GTEA 1D7LA 1P2EA 3HZLA 3F8PA 4GDEA 2VVLG 5FS9A 1BZLA 3IHMA 1CJ3A 1NDAA 3DGHA 3NGCX 4ICYA 3FPZA 1ZMDA 4YSYA 3OZ2A 1D7YA 4EMIA 1H84A 3FBSA 1PN0A 1GNDA 1GPEA 5EBKA 2BS2A 1E39A 1OJDA 4H50A 4H7UA 3ADAB 1PJ5A 2R9ZA 5J7XA 3SM8A 5C2TA 3OC4A 3GMBA 3GDPA 4ADWA 3CGBA 1IUWA 2X8CA 3DK8A 3G5RA 3DJGX 1ZKQA 3IC9A 4B63A 3ALLA 4DGKA 2GAGB 2GMHA 4XWZA 3T37A 1NHPA 2WQYA 3AE2A 2OALA 2QCUA 2H89A 2V3BA 4AT0A 3AE8A 3LOVA 3NK2X 2XLTA 3B3RA 4J33A 4DNAA 2YG6A 3ISHA 3CGEA 1GERA 4AP3A 3GWFA 1B37A 2BS4A 5HHFA 1KNPA 2JK6A 3NTDA 4HB9A 2BCPA 2GEWA 2XDOA 2ZBWA 4J57A 2V60A 3PS9A 2GR2A 5GRTA 1PBFA 1Q1WA 1IUSA 2C75A 2EQ7A 4JDRA 2ZZCA 3DK9A 1IUUA 1TDOA 4U2SA 3V3NA 1YQZA 1BGJA 2RGHA 2XCGA 4NZHA 4GF7A 1PXAA 2ARDA 1OJAA 2C3CA 3II4A 2CVJA 1DJQA 3H8LA 2WP9A 3KD9A 2J3NA 4O5UA 4H2RA 4H2PA 2YG4A 5LV9A 2WDRA 4JY2A 5HY5A 1M64A 3NRNA 2VZ2A 3BHKA 1LJ1A 2ACZA 2WS3A 4NTEA 1N4UA 4TLZA 4AOSA 5EOWA 3B6DA 3UOVA 2B76A 1PJ6A 4TM1A 3C4AA 5BULA 1DXLA 3UKPA 5KWFA 1TDKA 1K0IA 1AOGA 1D4CA 4Z2TA 1CL0A 1N4VA 3QVPA 4UDQA 1PXBA 5BRTA 2PHHA 3CNTA 4A6NA 4AP1A 4K22A 1NPXA 1OJTA 4C74A 1D4EA 3PO7A 1Z6LA 1LVLA 2Q7VA 1ZP0A 2YM1A 3GRTA 3CGDA 4YXDA 1PS9A 2OLOA 4YSZA 4N9XA 3BI4A 3GD4A 5EB4A 2BCGG 1D5TA 4X9MA 4CNJA 4GUVA 1GESA 1NHRA 5KOWA 2B9YA 4Z26A 1ELIA 1QLBA 2C65A 3K30A 4H4WA 4YTMA 3K7MX 3VRAA 2R4JA 3AE9A 1UKVG 3Q9TA 2BXRA 4EM4A 2BC0A 2HQMA 3CTYA 5FS7A 1E1LA 1NHSA 1JOAA 3GRSA 4H4XA 4KX6A 2YLWA 2XFNA 1FL2A 2YLRA 3AD9B 4B65A 1GALA 2F5ZA 3IWAA 1IUTA 4DSHA 1E1KA 1MO9A 1O5WA 4B69A 3NTAA 3K7TA 3ITJA 3QSSA 2RGJA 3ALMA 2A8XA 2YLZA 4U2LA 4UDRA 2R0CA 1FOHA 2C66A 4CRTA 2AAQA 1GRAA 3AE4A 2XVHA 4B66A 2H88A 4GR1A 1CJ4A 5IQ1A 3CPJG 4FK1A 3NYFA 2BA9A 3AEEA 1RSGA 3URHA 1KF6A 2DKIA 2UZZA 4U2TA 3DA1A 4YT0A 3LB8A 2FBWA 3AE5A 2GAHB 5IPYA 3ALJA 2WPCA 2BS3A 3FIMB 2YM2A 4YKGA 1YQ3A 3I6DA 1FCDA 1BF3A 1ZOVA 5JCNA 3L8KA 2GQFA 3AD8B 4H4VA 3CGCA 3DH9A 5U63A 1Y0PA 2YQUA 4UDPA 4CBQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KE3A 5HR3A 4CNKA 4BWSA 4OFMA 4TVEA 1QO8A 1Z5YE 4IJ3A 2GF3A 4U8JA 1GETA 3NZNA 4YTNA 1QQ2A 2R2JA 3WGXA 1M2AA 2X50A 4ECJA 3CNSA 5C3JA 4YKFA 3TRQA 1NM3A 5CRDA 1DDOA 4WX1A 4GWRA 1MDIA 2GZZA 3DMEA 3G3EA 3C71A 4XCSA 3FR9A 2RM5A 3SQPA 5F07A 1USBA 2CX4A 3W8SA 4FYUA 1Z9HA 4L5OA 1T3BA 2EQ6A 1FEBA 2BC1A 2V32A 1IUXA 1YEXA 3VQRA 2E2MA 1E1MA 2C0FA 1G7EA 2WEUA 1E6EA 2QAEA 4K2DA 3C1RA 5KOXA 2JBVA 3Q19A 2TPRA 4ISDA 2YN1A 4RUVA 3HKRA 1B4PA 2O7KA 2YVGA 3ZL5A 2ZCTA 5CRGA 1M9BA 3ERFA 3IK9A 1S3BA 1S3DA 4HI7A 4KA0A 1JEHA 2K6VA 1GV4A 3LQ7A 1VG9A 1OAZA 3GNJA 2VVMA 3P90A 5IPHA 2HRKA 1EZKA 5BMUA 3UCLA 5JCKA 4AT2A 1DOCA 4D04A 3CNPA 1PKZA 5L46A 2OA7A 2C0EA 4YQMA 1XIYA 1YY5A 1PBDA 4YAPA 3M3MA 5IMFA 2EIRA 5CREA 1EOGA 1AC1A 4BVXA 2A4HA 3AEFA 3UL3A 2K9FA 3IA1A 1ZGNA 1GRGA 1NHQA 4GRTA 2VQBA 2XHFA 1PBBA 2DMLA 4OO5A 5EL8A 1N1PA 4EL1A 3MDKA 3LXDA 3CRTA 1ABAA 4M52A 1K3LA 3M0FA 5BVAA 4HS1A 3VR8A 4P3YB 1G0TA 4CDOA 3AE3A 1X9WB 4YSXA 2OJLA 1KFYA 2R0GA 2WZ9A 2XFQA 4Z24A 4RI7A 1CC4A 2GSRA 3NH3X 2TMDA 3ZNQA 4PXOA 4REKA 4OPTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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