3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
3FIMB 3URHA 1GRFA 5EB4A 3GD3A 2QAEA 2B9XA 2A89A 3WE0A 1PXCA 2V6OA 2YWLA 4FX9A 4RG4A 4OPTA 4UDPA 5KRQA 4CBQA 4X9MA 4CNKA 4B65A 4NEWA 5ER0A 3SM8A 2VVLG 4EQXA 3S61A 1NPXA 1F6MA 2WU2A 4OPGA 1DNCA 1GV4A 2C73A 2I0ZA 2XDOA 3EAOA 4Y4NA 3OZ2A 2J3NA 4UDRA 3ICTA 4EQRA 3ICRA 4EQWA 4U2LA 3AE7A 3AEBA 2GR2A 1K0LA 2XFNA 3O0HA 3VR9A 4AOXA 1Q1RA 4TM4A 4U2SA 5U1OA 1KSSA 4Z26A 3C4NA 4C3YA 4YT0A 2VZ2A 4CCRA 1ONFA 2VQBA 1KNPA 2X8CA 1GETA 1OJDA 2ARDA 3LOVA 2WPFA 3M0OA 3NYCA 4H4VA 3ALJA 3AEFA 1AOGA 4BK1A 3GDPA 2EQ8A 2C75A 4B1BA 2GMJA 4Z2RA 1M64A 4LIIA 2BK5A 3PS9A 3Q6JA 2F5ZA 3FBSA 4OPDA 5JCKA 3CGDA 1GSNA 5HY5A 3CNSA 2EQ7A 5HYMA 3QFAA 1REOA 3UKQA 4ECHA 2YQUA 1E1LA 4GUVA 1K0JA 1S3BA 1LV0A 4DNAA 2WQYA 4YSHA 2XFQA 5KVIA 3RHAA 1B37A 3NLCA 3SQPA 4JY3A 3QVRA 2XVHA 3KU9A 2YG7A 2JB3A 3AE1A 1H86A 2EQ6A 3LB8A 4H50A 5HHFA 5J7XA 1CC2A 2WDQA 4K22A 1BZLA 3UKLA 4B66A 1TDOA 4H2PA 4X9NA 4HB9A 1L9CA 2C67A 3PVCA 4OPLA 2IVEA 2PHHA 2GQWA 4IVOB 4O5QA 4EM4A 1KDGA 3P1WA 1MOKA 1EBDA 3VR8A 3P4RA 3UCLA 3NKSA 4H4UA 4K5RA 1XANA 2BA9A 1XPQA 1TDNA 1IUUA 4C77A 3NK2X 1YQZA 2WDVA 3GMBA 4U2TA 2NVKX 4U8JA 3ATQA 1LQTA 1PBDA 3NK0X 2QA1A 1CF3A 3LADA 1F3PA 2YLWA 2XYOA 2OLOA 1K4QA 1GALA 2YG3A 2YLTA 1H6VA 2R4JA 5KOWA 3D1CA 4ZN0A 1EL5A 2B7RA 2WHDA 3KKJA 4YTMA 4B69A 1PN0A 2E5VA 3ABVA 2YG6A 2CDUA 2OALA 2DKIA 3UOVA 4YSYA 3ADAB 3KLJA 2X3NA 2YG4A 5CKUA 3UTGA 3G5SA 2BS3A 4EMWA 1LVLA 2GV8A 1IUWA 1TYTA 5U25A 4KPRA 1N4WA 2WS3A 3G5RA 1H7WA 4NEVA 1SEZA 5C2TA 2BXSA 2C70A 3ALMA 4E0VA 2RGJA 2BS2A 3DMEA 2V60A 2BC0A 3GWDA 1VQWA 3S5WA 1BGNA 4C3XA 3NTDA 4YXDA 4H2QA 2JB1A 4FK1C 2WPEA 4USRA 4D04A 2BK4A 3LZXA 3RP8A 4H4SA 4P9SA 4H2NA 5IQ4A 1FOHA 4BURA 4U8MA 1GTHA 1NHRA 2WDRA 1MXTA 1IJHA 4B64A 3ISHA 3P4QA 3DJJA 1L9EA 2VOUA 3AE8A 1JRZA 1QJDA 1OJ9A 3CPIG 5EBKA 2XVJA 2YVFA 4B67A 4A6NA 1EL8A 3CNJA 2BACA 3UOZA 3V3OA 4I59A 2WP6A 5IPYA 2B7SA 2WETA 2R0CA 4O5UA 3CNDA 3V3NA 2Z5XA 2ZZCA 2GRTA 1GERA 2VVLA 2VVMA 5M10A 4AP1A 1D4CA 4H4ZA 2YLXA 2H88A 5GRTA 4Z44A 4CRTA 4LU6A 2X8GA 2VRMA 3IF9A 1ZY8A 2GAGB 1CJ4A 3I6DA 3PO7A 4RG3A 1CHUA 2E1MA 3AYJA 2WEUA 5BVAA 3R9UA 1S3EA 2GR1A 2WPCA 3KPFA 1BWCA 3GWFA 1YQ3A 3FG2P 3GSIA 2QA2A 2CULA 2BK3A 4UP3A 4JDRA 4BK3A 1O5WA 3UKPA 4JNQA 1PJ6A 3DJDA 4H4PA 2JAEA 4CNJA 4H4WA 4H4YA 3NNEA 1DJQA 2BYBA 3LJPA 1HYUA 1RP0A 1ZP0A 1VG0A 3D8XA 3DJEA 4MJWA 3SFEA 3QFBA 1BF3A 1YQ4A 1P2EA 3GYIA 2WOVA 5JCIA 4AT2A 1DODA 2V3AA 3AEDA 3EANA 4U8PA 3EF6A 3H8LA 4NTEA 4D03A 5IQ1A 4JY2A 1F8SA 2NPXA 2YR6A 3BI2A 4CCQA 1LPFA 2A8XA 3CPJG 4NTCA 3DGZA 4LA1A 3CPHG 4H4QA 2V61A 1PS9A 4PABA 5JCLA 4GR1A 4USQA 5HXIA 1JRXA 2HQMA 4REKA 4EMJA 1FCDA 2CVJA 3P4PA 4TM3A 2VRLA 3DA1A 2DKHA 1S2QA 3G5QA 1D5TA 4OPCA 3UKKA 2YR4A 3AD8B 2YLZA 2V3BA 1FEBA 2WU5A 2Z5YA 3GD4A 2R0PA 3EPTA 2ZZBA 1GRGA 4FDCB 3L1RA 2XVFA 1JU2A 3FPZA 4GCMA 4J34A 3AE6A 2C66A 3C96A 1NHQA 1H81A 3ATRA 1PDHA 3AXBA 3NG7X 3ICSA 3UKHA 3UP4A 4APNA 3QJ4A 1B8SA 4DGKA 5KXJA 3REDA 3ALLA 2WOIA 2XLPA 2RGHA 2XFPA 3NN6X 4ZCDA 4Y4LA 1TDFA 1CJ3A 1EL9A 2YG5A 2FJBA 2OA1A 4XXGA 3OC4A 2X8HA 1N4UA 2B76A 2GR3A 2OAMA 2YM2A 4N9XA 1PXBA 3AE5A 1E1KA 2R9ZA 1MO9A 1LJ1A 4XWRA 2BS4A 3RNMA 4ZCCA 4CY6A 4UDQA 3K7QX 4M52A 1E39A 3AE4A 3VRDB 4DSHA 2YR5A 1E6EA 1VDCA 4H4TA 4YWOA 3NRNA 3UTEA 4BV6A 4X4JA 2GF3A 4FK1A 4A6NB 1KSUA 4K7ZA 4IV9A 5L46A 3FMWA 2X50A 4A79A 2TPRA 2QCUA 3M12A 3NTAA 5BRTA 3CTYA 3H4KA 2IVDA 2ACZA 2GAHB 1ZOYA 2GVCA 1NENA 2AR8A 1QLBA 1GRHA 2C3DA 1GOSA 2FJDA 5KOXA 1TDEA 2BABA 3Q9TA 1Z6LA 2V5ZA 4WCTA 1TRBA 3SFDA 4JN9A 2Q6UA 1JEHA 1VRQB 2C3CA 2OLNA 4B68A 1KF6A 1O94A 3UTFA 5BUKA 4TLZA 3NYEA 4A9WA 2Q0LA 1D4EA 4B63A 2IIDA 2XVIA 3NH3X 2VQ7A 1D7YA 1H82A 3BI4A 3AE9A 3P4SA 3GRSA 2WESA 2C7GA 1H84A 4HA6A 1RSGA 5TR3A 3AE3A 1L9DA 4GDPA 4BK2A 1GRTA 1DOEA 4Z25A 4OVIA 3ITJA 1DXLA 2BCGG 3F8RA 1ELIA 3CGEA 3K7TA 1GXFA 2Y6RA 1PBCA 1F8WA 2Y6QA 4C74A 2YM1A 3KVEA 1ZX9A 2Q0KA 1B5QA 4AOSA 4GF7A 1DOCA 4J2WA 2E4GA 2GB0A 4J33A 2WP9A 3BNMA 3IWAA 3P9UA 3ZDNA 3L8KA 4Y4MA 2W0HA 3UP5A 3RP6A 2GQFA 3DK4A 2R4EA 1QO8A 2JB2A 2XLRA 3AECA 3SGLA 1FL2A 2WBAA 3DGHA 5FS9A 3B6DA 2YAUA 4GRTA 1D7LA 1YY5A 4H2RA 5EB5A 3CNTA 4PAAA 2BC1A 3COXA 3QSSA 4IA6A 5GSNA 3II4A 3AD9B 2B9YA 3AYLA 1IUTA 5DBJA 4Z43A 1NG3A 1NAAA 4A65A 1IUSA 1YKJA 5M0ZA 1Y56B 2XLUA 5CQFA 1N1PA 1BGJA 2WP5A 2XVEA 4JQ9A 3VQRA 4A7AA 5U63A 3GMCA 2XLTA 3BHFA 1F8RA 1B4VA 2C64A 1OJAA 3K30A 3GYJA 1PBBA 5BULA 1PHHA 4U8NA 5C3JA 4EIQA 3QSEA 1CJ2A 4BJZA 1PJ5A 3BNUA 4YSZA 3GDNA 1BKWA 2WOWA 4I58A 1NDAA 2JBVA 4A99A 1GRBA 4J36A 1P2HA 3AE2A 1E1MA 4H4RA 1NEKA 3V76A 1OJTA 1ZOVA 3JSKA 2R45A 4YSXA 1GESA 1CBOA 1DJNA 3GRTA 4NTDA 4YKFA 4AT0A 3NN0X 1IUVA 2C72A 3AD7B 4YTPA 1H7XA 4IVMB 2X99A 2UZZA 4U8LA 4J31A 2FBWA 1E1NA 2FJAA 4U8KA 3RP7A 1Y56A 2R46A 3CIRA 1D4DA 1JOAA 2R0GA 2C76A 4NZHA 3NYFA 1H83A 1LQUA 1GEUA 2B9WA 3LXDA 1KFYA 2JK6A 5KWFA 3ZYXA 3C4AA 2XLSA 1M6IA 1JRYA 4AP3A 1JNRA 3AWIA 3QSMA 4OPIA 1ZDLA 4K2XA 1VG9A 1COYA 4XWZA 1RYIA 4WX1A 4EM3A 2H89A 3CNPA 1Y0PA 4OCGA 2ZBWA 2GH5A 1E7PA 2TMDA 2GEWA 2YLRA 3F8PA 2ZZ0A 1PXAA 2APGA 4U8OA 1Q9IA 1CJCA 3NK1X 1W4XA 1ZMCA 3NIXA 1N4VA 1FECA 2AAQA 4EIPA 1ZKQA 1TDKA 2FJEA 4TM0A 2PYXA 3NT6A 4GDEA 2A87A 1NHSA 5FS7A 4K8DA 1TYPA 1UKVG 3VRBA 2BCPA 4RSLA 3NHOX 4A5LA 4J57A 5FS8A 2O9ZA 2EQ9A 3DH9A 3UKFA 4YKGA 1IUXA 1GPEA 5FMHA 4U8IA 1PJ7A 4C5OA 3AEAA 3NGCX 1DOBA 3IHMA 1XDIA 4K5SA 1CC4A 5LV9A 1CL0A 2XFOA 1KNRA 2C65A 1ZK7A 1PBEA 1K0IA 3I3LA 4TLXA 3CN8A 5FS6A 1ZMDA 3HZLA 5JCMA 4Z2TA 3KA7A 3QVPA 3E1TA 1CC6A 3CGCA 1GRAA 3IHGA 1EL7A 3AEEA 3IC9A 4JNAA 1LTXR 3H8IA 4Z2UA 1GTEA 2RABA 3AEGA 1NG4A 3AYIA 3UOXA 4KX6A 1X31B 2YVJA 3UOYA 4CY8A 1GREA 2GMHA 2RGOA 2YLSA 4OPUA 4YTNA 4TM1A 5J60A 1JNZA 5JCNA 2XCGA 3B3RA 4H7UA 1GT8A 3AB1A 4BJYA 3KD9A 1FEAA 2GR0A 2XFUA 4EMIA 3DK9A 1GNDA 3T37A 3UKAA 3BI5A 3UTHA 4ICYA 4H4XA 4ADWA 4DSGA 1O95A 2CFYA 1OJCA 3F8DA 1Q1WA 3VRAA 1NHPA 4J56A 3M13A 2JKCA 2YVGA 1V59A 3CGBA 3LZWA 2BXRA 1XHCA 3BHKA 3DK8A 1L0VA 1S2YA 3K7MX 1PBFA 2AQJA 5KVHA 4EQSA 2Q7VA 3DJGX 4Z24A 4IA5A 5EOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EB4A 3GD3A 2QAEA 3KMNA 2L6DA 1PXCA 4FX9A 4HEA2 2VUPA 4B65A 3SM8A 4BWQA 3TCOA 2VVLG 2RUEA 1NPXA 2JZSA 1F6MA 2WU2A 3EU3A 1GTIA 4POMA 3CXGA 1H75A 1DNCA 2C73A 3EAOA 3OZ2A 1A8YA 2J3NA 1UC7A 1G6WA 3AEBA 2JL4A 2CZ2A 4GWRA 3SBCA 1R7HA 5ECLB 1VF3A 4G0LA 1SL0B 5U1OA 2VL2C 1EP7A 1GULA 3DD3A 3ZYWA 2X64A 2VZ2A 4JR6A 4YT0A 1FG4A 1GETA 2ARDA 1AOGA 5HFIA 3AEFA 4BK1A 1XWAA 1PX6A 2GMJA 1K3OA 4HSCX 3GX0A 2BK5A 3PS9A 3Q6JA 3FBSA 1BEDA 4CHSA 3T2ZA 5JCKA 2C3NA 3FZ4A 4Q5QA 3GMFA 3CNSA 3E9JB 3QFAA 4GQFA 4WR4A 2TIRA 4KSMA 1OYJA 3F4RA 2CT6A 4GUVA 2VM1A 1S3BA 1GL8A 1LV0A 1MEKA 2RM6A 1SKRB 4GQCA 1B37A 4GSTA 3SQPA 2XVHA 2YG7A 3AE1A 1B4PA 4H50A 2TRCP 1BZLA 2OE1A 4H2PA 4PNGA 1JHBA 1XWCA 4PNFA 3LXZA 2C67A 3F4SA 3DVXA 2VM2A 4IVOB 1TRSA 4TXVA 4EM4A 1MOKA 1T4YA 3VR8A 3UCLA 3NKSA 2EIOA 2QSIA 5E4WA 4WXTA 1IUUA 4MP4A 3HXSA 4C77A 5CRGA 2BRYA 1ML6A 4NHWA 4U2TA 5DAKB 2DU8A 3ATQA 1PBDA 1LQTA 5F05A 2QA1A 1K0AA 1GUMA 2GVPA 12GSA 3EWLA 4ZN0A 2B7RA 4ZB6A 2MMZA 1PA3A 4YJGB 4NWZA 2OALA 2R37A 1F37A 3GV1A 1I9DA 5CKUA 3T14A 4ULXA 2CVKA 1LVLA 1UN2A 3BCIA 1SK2A 5D9WA 5U25A 1R5PA 2F51A 2LKUA 1SEZA 5C2TA 2UZ8A 2PN8A 2BS2A 2G2QA 2LRCA 2BC0A 2OACA 3NTDA 1H4OA 1AQVA 1JZWA 4USRA 1OAZA 2BK4A 4OFNA 4BURA 2H1AA 2WDRA 1NHRA 3KJYA 1X9MB 1Z5YE 4DEJA 1JRZA 1OJ9A 4B67A 4MF7A 2YVFA 3V3OA 1TW9A 2WS2A 4I59A 2WP6A 2PBJA 4XHMA 2WETA 1FB0A 2HYXA 4O5UA 5A5KA 5CRHA 4WR5A 1M3IA 1YDKA 2VVMA 3RPNA 3NOFA 1SL2B 3RHBA 4H4ZA 4ZL7A 2AHEA 1NHOA 1I5GA 2VL2A 3EVIA 4BVYB 2M80A 1SK1A 3DIEA 4V2NA 3GWFA 1YQ3A 1SL1B 3KTBA 2BK3A 4UP3A 2MMAA 4ACSA 4H4PA 2L4QA 4OPLA 4MF6A 1DJQA 4G9KA 1ZP0A 3D8XA 1VG0A 2YWNA 3ZIVA 2RUFA 3SFEA 3GYIA 19GSA 2WOVA 5IMZA 1XOBA 1O8XA 3AEDA 3EANA 2VCVA 4O7HA 5H5SA 3GKKA 5HR1A 3GNJA 1XIYA 2QC7A 2NPXA 2YR6A 5J4UA 4KSOA 3TKSE 1S3RA 2YZUA 4G0KA 3KGKA 4NTCA 3J7Yb 3CPHG 4GR1A 4REKA 2C0GA 2HQMA 5IIZA 1FCDA 2CVJA 3P4PA 5EL8A 4TM3A 2DKHA 5FWGA 3G5QA 1D5TA 2B7KA 2CX3A 3C7MA 3KH9A 3GD4A 1XXUA 1IYHA 3CRUA 2ZCTA 3TRPA 1PKZA 5DJLA 2HRKA 4GCMA 4J34A 3C96A 1NHQA 1H81A 3ATRA 3AXBA 2KP1A 1PL1A 3EURA 3CUKA 5KXJA 3ALLA 1AAZA 2VO4A 3WT1A 2WOIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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