5KN2A

Native bovine skeletal calsequestrin, high-ca2+ form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
LDFPEYDGVDRVVNVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMDELILELAAQVLEDKGVGFGMVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSVYVFKGDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDDNKLIGYFKNKDSEHYKAYEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVSFVEAHKRSTLRKLKPESMYETWEDDLDGIHIVAFAEETDPDGYEFLETLKAVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFNIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Calsequestrin
publication title Characterization of Post-Translational Modifications to Calsequestrins of Cardiac and Skeletal Muscle.
pubmed doi rcsb
total genus 105
structure length 352
sequence length 352
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn2A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn2A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn2A02
4MMMA 5ECPB 3TOUA 1WMJA 2JSYA 2C8UA 2DBCA 5J5NA 1ZL9A 4WF5A 1GUHA 3LYKA 5HR1A 2CAQA 1GLQA 1TK8B 3UOMA 1X9SB 2YV9A 4ECIA 1IYIA 2QSIA 4QQ7A 2GTUA 3HA9A 3DVXA 5F8BA 2AYTA 3DXBA 4JBBA 3GX8A 3O3TA 2IMKA 4FIWA 2J23A 5KEJA 13GSA 4IJ3A 4KSOA 1TK0B 5DVBA 17GSA 1PL2A 4FO5A 1A23A 5J3RA 3UBKA 3EU3A 3UIWA 3HKRA 1Z7RA 4PUFC 4KE3A 4MH2A 1FHEA 2QGVA 3IE3A 2VD0A 4ZB8A 4HDEA 2KUCA 1Z9HA 2NVLA 3VWXA 2DJ2A 1EV4A 4XRDA 1PRXA 2V6OA 5L71A 2LQOA 4LL4B 2VD1A 4PURA 4HOJA 2IN3A 4HJMA 5KN1A 3GSTA 4D73B 1PA3A 1TI3A 4I8BA 3GV1A 2H6XA 1S3CA 3TJJA 3KM6A 3TJKA 1XZOA 4KW6A 1OC9B 4MJBA 1UA5A 2H1GA 2VM1A 3H4KA 5GZZB 3TRXA 1FW1A 2ON7A 1HYUA 2IFQA 1R4WA 3J7Yk 2YPMA 4KDXA 3TJGA 2GZPA 2K8SA 4ML6A 4MZWA 2ZUPA 4OMVA 2KP2A 1SJ6A 3QDNA 1ILOA 1TJDA 2B3SA 1K3OA 4XRAA 4MCUA 4POBA 4PNGA 2VL3A 1T1VA 2YCDA 2NTOA 4JR6A 6GSTA 3H1NA 3HD5A 3P7XA 3P8WA 5ID2B 3DWVA 5F0GA 3H79A 2VLUA 2MMNA 2L5OA 2TRXA 1FAAA 1EP7A 2JL4A 3QAGA 3VI5A 4K2DA 2HYXA 3KXOA 2ZNMA 1GP1A 5EL8A 1GTIA 2VOCA 3FY7A 4L0UA 3KP9A 1XOBA 4EE0A 3BCKA 5DALA 2HRFA 3BBYA 3LEFA 4ZB9A 4XS4A 5D9TA 2E2GA 5FWGA 2VL2A 3HCZA 3KMNA 2O89A 2FWFA 3EVIA 3GNJA 3QCPA 2RM5A 3EYTA 4XS1A 2C3QA 1TKDB 1ZMAA 4X0XA 4O32A 2H6YA 4ZL8A 2EC4A 2YOIA 2JU5A 2KHPA 1BEDA 4TN8A 5AIVA 5F07A 2FWEA 3I69A 4YQVA 3GH6A 5IM9A 1K0BA 2CQ9A 3ZTLA 1A2JA 2DJ1A 1K0AA 4TOPA 1OKTA 2FWGA 2YZUA 1KNGA 1XXUA 3O76A 1XWBA 4IW9A 5IMAA 4POMA 3C71A 4HU9A 3PGTA 1I5GA 2WCIA 1PX7A 2LNTA 3W8SA 5ECHB 4WR4A 4HEA2 3KTBA 1BX9A 2H71A 3M9JA 4IHUA 4F0CA 4MABA 2LJAA 2IMDA 2X8HA 2YJHA 2OACA 2BJXA 3HHVA 4I6XA 5CRGA 4BWQA 11GSA 1F3AA 2IMEA 3ZMKA 1WIKA 3DRNA 4BA7A 2PU9C 3DYRA 4F9ZA 3TJBA 2N5AA 3F4SA 1PSQA 2B1LA 4ZILA 5CAXA 3EWLA 4O7HA 1URMA 4MH3A 3QAVA 3RDWA 1TOFA 1J08A 4V1Ag 4G9HA 1SL2B 4AF2A 1X5DA 4AJ7A 3GRXA 1GWCA 2IFQB 2FNOA 2L6DA 4Q5NA 2I9HA 2EIQA 3Q19A 2QC7A 1QFNA 3M1GA 4IP6A 2H0HA 4IJIA 3TRPA 2O87A 4EO3A 1SU9A 4KB3A 1YY7A 5ELAA 4F2IA 2L59A 2GQLA 1Y25A 5IOXA 2I3YA 3ZITA 4EL1A 1M9AA 4DEJA 4F03A 1FOVA 5H5SA 2LV3A 1X9WB 3VPQA 4MK3A 3WGDA 1R5PA 5IMVA 1E6BA 1VF1A 4MPFA 3D0ZA 2PBJA 4KX4A 4HZ2A 5COHA 1VGLA 1SK1A 1Z5YE 1XBSA 3P90A 2CAIA 1GUKA 4EDYA 5ABRA 2H01A 2D2ZA 4FYCA 5GAND 1E2YA 2XBQA 3QFBC 2FCHA 5DJMA 1XPVA 2HSHA 1GSUA 5ECMB 2PN8A 5DALB 3GN3A 2DMLA 3ME7A 1SENA 4JEDA 1JLVA 2H73A 3MNGA 4XS4B 3IRAA 4CHSA 1YJ6A 4N10A 3LXZA 2P31A 2PERA 3ZMLA 1HNAA 5G2ZA 3DIEA 3HVVA 4TW5A 4K7IA 1XVQA 2MMAA 1U88A 3D22A 3ZYWA 2PMTA 1XIYA 3UL3A 1OC3A 2B1KA 3C8EA 3LXTA 1RQMA 4GCIA 2C0FA 2FWHA 5CREA 2AAWA 2OKAA 2X8GA 3J7Yb 2C0DA 5DCHA 5FT3A 4ACSA 1BAYA 2OE3A 4JZQA 4GTUA 3CSIA 5CRWA 5CYYA 4ZB6A 3TJFA 1T8EB 4IQ1A 4K8MA 2F8FA 3C73A 5ELGA 3ZREA 2LUSA 1VRSD 4N0ZA 2C0EA 5B8BA 2FHEA 2RLIA 2R4VA 1N8JA 3G9BA 4QL7A 2M72A 2C4JA 2L5LA 3GIXA 2IMFA 4KUNA 1ERTA 3UBLA 4RI6A 3GKMA 1MD3A 1EEJA 3IDVA 6GSUA 3A2WA 2NDOA 4ISDA 16GSA 4ECCA 1USBA 5LD0A 1V58A 2ALBA 4Q5QA 2F9SA 4WKWA 3RPPA 1TU8A 1XW5A 5JCUA 2WRTA 5IPHA 3IHQA 3H8QA 4RI7A 3W8JA 3TKSA 1EZKA 2VM2A 4YAVA 1DUGA 2VCQA 5G1KA 1ST9A 2GVPA 2LS5A 1SKRB 2WFCA 4CW9A 2H8LA 3IOSA 4POKA 4EUYA 3QAWA 1ERUA 1GSYA 3A3TA 4MZCA 4EDZA 1SYRA 2PGTA 1LBKA 3ZVJD 3KD0A 1O81A 1THOA 4XS6A 3GX0A 4P3YB 2B7KA 2WZ9A 1FG4A 3EINA 4OWYA 3ZVJA 1OE7A 5CNWA 4IN0A 5HFGA 4YQUA 4EXJA 2GSSA 2V32A 5D96A 3EMPA 1V57A 2VUPA 3BOAA 5D9VA 3FW2A 1EGRA 1K0MA 1GNEA 3UJ1A 2XPDA 1KTEA 1SJZA 4TR1A 1M99A 4JU5A 4K1FA 4ECBA 3PH9A 1PN9A 3GUSA 1UN2A 3HXSA 4EVMA 1GTAA 4IVFA 2YV7A 3HYPA 1B4PA 3F4RA 3GYKA 3IK9A 2HI7A 2O7KA 2LTKA 1JLWA 1BG5A 1XWKA 2JSZA 1C72A 3TOTA 3CBUA 5DQYA 1GRXA 3KEBA 1SKWB 1TU7A 3CYNA 2X64A 5HFKA 4POLA 22GSA 1A24A 4GQCA 2VL9A 1KBNA 2PPTA 4HJ2A 12GSA 3ZIJA 4TVEA 2TIRA 2R2JA 3FYGA 5EPFA 2B5EA 1BQ7A 2R3XA 2O8VB 5ECIB 3VLNA 2H0IA 3FHKA 1XWGA 3VI7A 1K0OA 2O85A 3HDCA 3SBCA 4OFNA 4NHZA 1GLPA 3H93A 2K18A 3E3EA 5G1LA 4NV5A 3C1SA 4X43A 1F6MC 4GSNA 3UAPA 2V6KA 3IAS2 4XHMA 4ZIJA 3BJ5A 4G10A 5CRDA 1F2EA 5G30A 4KH7A 1YKCA 3CXGA 1GSQA 4MJCA 4PGTA 2RIIA 4TRXA 2WB9A 2IPAA 3LFLA 5G5EA 4WR5A 3EURA 4KGIA 10GSA 1VF2A 4ZL7A 2HE3A 3GTUA 5EVOA 2AUVA 4Q5RA 2LJKA 3F6FA 1MDKA 3F6DA 20GSA 3TGZA 1OVNA 5F05A 3IA1A 3APOA 3MAKA 2VCTA 5CP1A 7GSSA 2H66A 2M46A 1SYXA 5JCGA 2F8AA 4YAPA 2K8VA 4ILFA 2AV4A 1YDKA 1U3IA 1SK0A 2LRCA 2P5QA 3ERWA 3ED3A 5F06A 1JZDA 5GAPD 2V41A 5GSSA 2EIRA 4WF4A 2GQMA 3P2AA 1NSWA 1ON4A 3HJPA 3RBTA 2GLRA 2HNLA 3DGQA 1Q4JA 2H76A 1BJXA 5JWOB 3F9UA 4IS0A 3RHCA 5IMDA 1CQGA 4MDCA 3EC3A 2LRNA 4HQSA 3VK9A 5IOWA 4FH8A 3DMLA 4JR4A 3FZAA 5D9WA 3WGEA 1B9YC 4ZXGA 1ERWA 4TR0A 4HU7A 4RQXA 4EKZA 3C1RA 5DJLA 1M9BA 2GZYA 1AXDA 1V2AA 1PKZA 4CDOA 3D21A 5DDLA 3KCMA 1M2AA 1QUWA 5ECLB 3F63A 4TR1B 1GSDA 2HLSA 3IPZA 3CMIA 3M0FA 4O5RA 1FB6A 3ERGA 1GTUA 2DJ3A 3FR6A 1PMTA 4LMWA 5J9CA 2OA7A 5IMFA 3HVSA 2ZCTA 4G19A 2E7PA 1Y6EA 3LYPA 2BMXA 1TXXA 2VCZA 3GL5A 2B5YA 3GH9A 3HZ8A 1AC1A 2YP6A 3IR4A 3DKSA 4DSSA 4IQAA 1EWXA 4EC0A 4AJ8A 2VO4A 4MF5A 3ZRDA 2H19A 2KOKA 3ZLPA 1TP9A 1B4QA 3UARA 2H72A 5IO0A 1HQOA 1J9BA 3LG6A 4DSQA 1VF4A 4DVCA 2HZFA 2L4CA 1WWJA 1T00A 1AQVA 1N2AA 3L9UA 5ECRB 2IWTA 4WETA 1WPIA 4N11A 1OAZA 1ZYEA 4TXOA 3FR3A 4XCSA 3KH7A 1MD4A 3RHBA 3UEMA 5CRHA 1EV9A 1M2DA 2I1UA 1ZCPA 4K7NA 3VURA 4MPGA 1XW6A 5HR3A 1MEKA 2H74A 2XC2A 3SWLA 3GSSA 2JADA 3ZFLA 1XW9A 3IK7A 4ML1A 2X8CA 3FK8A 2TRCP 3VFIA 5INYA 1NHYA 3GTUB 19GSA 1V9WA 4GQFA 9GSSA 3TKQA 3IBHA 3VWVA 1XFLA 1DBYA 5LCZA 2X99A 3GKKA 3RPNA 1X0RA 4L5OA 1K3LA 1GSSA 3WT2A 1Z7PA 3M8NA 1BYEA 5AN1A 5KN3A 2C1YA 5AIXA 5B6MA 2IL3A 2CVKA 4KNDA 4GRFA 2YANA 3TKPA 2LKUA 3F8UA 1Q98A 5D73A 1K0CA 3L9VA 4MF6A 1J0FA 2E2MA 4V2MA 4L0WA 3ME8A 5ECOB 1MDJA 1AIUA 3LGCA 2JZTA 4E8EA 2WDUA 1EOHA 2YZHA 3F0IA 4GXZA 2LNSA 2HRNA 2PWJA 4PXOA 3TKSC 4F82A 2G0FA 4WBJA 4KA0A 1FVJA 4GLTA 1AAZA 1U3AA 4KCAA 3L0HA 2H1BA 3UVTA 3KJYA 4PUAA 3F4TA 2REMA 2B6MA 2GT5A 1PQNA 2MYGA 4YH2A 2FGXA 2JACA 4KCEA 5ECNB 1K3YA 2OBKA 3OR5A 4K0GA 1EGOA 3FZ4A 1RW1A 4L5LA 3CRTA 3NIVA 4KAEA 1O7UA 3APSA 2CZ3A 3QFAC 3GL3A 5E4WA 1AQWA 3EE2A 3LWAA 2I81A 4OO5A 1K0DA 4OO4A 3CRUA 6GSXA 3QOUA 5DCGA 3DVWA 3D6IA 4I2TA 4Q5FA 4ZBAA 4AGSA 4BVXA 1YZXA 4HI7A 4DSSB 1M7TA 2OE0A 2KP1A 1Z3EA 5C00A 2AHEA 1GUMA 1YKAA 2CVBA 2CA8A 4FYUA 1SJIA 4IELA 4MA9A 2R6KA 2LSTA 3GHAA 1T7PB 2WULA 3CSJA 2C3NA 1U6TA 4JE1A 1NW2A 3LJRA 3APQA 4TR4A 1ZOFA 1ZGNA 3WT1A 1G6YA 2CT6A 4XIHA 1B8XA 1HD2A 4OFTA 1V40A 2A2RA 3MSZA 4KDYA 4TXOB 4OD7A 3IC4A 4NWYA 2GQKA 2XHFA 5B6NA 3QPMA 1YEPA 3TDGA 1SK2A 2ES7A 5DAKA 3TKSE 2C3TA 1XVWA 3HY2A 2YWIA 2CVDA 1NHOA 2QKEA 3N9JA 5H5QA 2K9FA 4LL1B 1VF3A 3EMXA 2V2GA 3PINA 4KSMA 2OADA 2GT6A 18GSA 1YEXA 1V98A 2CZ2A 5KN0A 1EEMA 4WBRD 1PL1A 1PD21 1AW9A 4MF7A 1QGVA 1GNWA 5IIZA 5IMCA 1PGTA 4LA1A 2AB6A 4GF0A 1M0UA 3KIJA 1Z6MA 3ZFBA 1I9DA 3M3MA 3N5OA 1WJKA 2JZSA 1R5AA 1QK8A 2DJJA 1TI1A 4AJ6A 5IQYA 2HFDA 4V2NA 2G2QA 2B5XA 3D4TA 1G0TA 3A5WA 2VCVA 1XWCA 4L8EA 3UMAA 3TCOA 3HVXA 4OFMA 3CTGA 3LSZA 3V1WA 1WE0A 1TK5B 2XBIA 2ON5A 1U87A 4OCEA 1YQ1A 1S3DA 1JZWA 1KEBA 4PQHA 4ZBBA 1OC8A 1QXHA 2VL2C 3VWWA 5HR2A 2M80A 3M9KA 4PX1A 1X5CA 1UVZA 1W89A 1GSEA 3L4NA 1TRSA 2VCXA 3I6AA 3US3A 1TRWA 2L4QA 4X1UA 4ID0A 3HZ4A 4HUAA 5G31A 2B7JA 1A2LA 5ENUA 5ECSA 1H75A 2I4AA 4ECJA 3CTFA 4K7OA 3QD9A 2EIOA 3D4MA 3E9JB 3KP8A 2VAFA 2IMIA 2MBSA 5G5FA 1TDIA 2DLXA 1TTZA 5FHIA 2PVQA 4I2UA 1ERVA 5LNKe 2VLTA 3DD3A 1X5EA 4I5QA 3NOFA 3F3QA 3KH9A 4NAXA 2OJLA 4IGJA 2MMZA 4BVYA 1DSBA 4NMUA 1ACVA 1AUCA 1SD9A 4V1Ap 3S9FA 2YWMA 1G7OA 2F51A 2RM6A 2N5BA 1O6JA 4NV2A 4MJEA 1HNBA 3HJOA 3TKRA 4EF0A 4I97A 3U5RE 5A4WA 5IO2A 5DBQA 2RUEA 4GSSA 3KGKA 3A2VA 2MMOA 3I43A 1DE2A 4ULXA 5DQSA 3NZNA 2LRTA 4TKYA 4F0BA 1A0FA 4NXIA 3GURA 3LQ7A 5HQPA 2VIMA 2GS3A 5DAKB 4IKHA 6GSYA 1G7EA 1TRVA 3L9SA 2C80A 4K0NA 4MP4A 3ZZXA 3Q6OA 2L6CA 3IV4A 3JCML 1Z6NA 1WOUA 3BCIA 3ERFA 4V2LA 4E8HA 3FKFA 3WGXA 1GULA 5A5KA 1DE1A 5KN2A 4HS1A 2N5FA 3KZQA 2CX4A 2YNXA 2IJYA 5JWQB 5B7CA 3VPTA 2F3MA 5HFIA 1YF1A 4HZ4A 4N30A 3TUEA 2H75A 2MZCA 4IP1A 2GSRA 4JRRA 5B8AA 3IAM2 2P0GA 1O8XA 3U6VA 3TB2A 2DJKA 3ZIVA 5D93A 4K6XA 2GZZA 5GSTA 1O73A 4PNFA 6GSVA 4NHWA 1UC7A 2L57A 1K0NA 1GSFA 4TXVA 5A4UA 4J56E 5IMZA 2NPBA 1B48A 4ZBDA 3MWHA 2DC5A 2HZEA 3FEUA 2YJ7A 2LQQA 1MDIA 1HNCA 1H4OA 4ZL9A 3RAZA 2YWNA 3TRQA 4NPBA 3GMFA 1EP8A 1XCCA 2FLSA 2CV4A 2HXKA 4RUVA 1A2MA 3EU4A 3PR8A 4Z7XA 2BTOT 3C7MA 2R37A 2GDRA 5JWRB 4GWRA 3IXRA 2HT9A 1FB0A 1F3BA 2DIZA 5IPGA 1PKWA 2LEGA 3Q74A 5J9BA 2PVOC 2FUG2 3F3RA 4PQIA 2WS2A 1T3BA 2HSYA 2C0GA 1SL0B 3GKNA 4QL9A 2VCWA 1THXA 3UVHA 1OYJA 4K9ZA 1F37A 3A2XA 3FZ5A 1WP0A 1S3AA 3K8NA 4H86A 3GA4A 4KDUA 5CO3A 2Z9SA 1TRUA 1ZZYA 3QMXA 4J2FA 4PQ1A 4BPYA 3GKXA 4RQRA 1JHBA 1G6WA 4DSRA 1RK4A 1SL1B 2IIYA 2OE1A 1B9XC 1FO5A 4XTSA 1QQ2A 5H5RA 3G7IA 3FRCA 2JZRA 5D9XA 2DJ0A 1XOAA 4GSTA 2NBSA 3ZL5A 1WRYA 1LU4A 5EY6A 4O92A 3QR6A 3FZ9A 4BWSA 4IBPA 1X9MB 2H0GA 2FA8A 3CSHA 5C04A 3MDKA 2K6VA 4BL7A 2GSTA 2WJUA 1ABAA 2DIYA 4MLYA 5D8IA 1T4ZA 1GTBA 4MZBA 1JZRA 4OCFA 5AISA 2DMMA 4TR3A 4LMVA 4D73A 3AY8A 2OBIA 3O6TA 2VLVA 2XPEA 3FR9A 3KTLA 4N0VA 1OC9A 4MJAA 1XWAA 2WGRA 2GGTA 2AJQB 2MBTA 6GSWA 2A2SA 4G2EA 2RUFA 5AGYA 3KMOA 1AQXA 1SD8A 1M2BA 3L78A 2LJRA 2CX3A 2H6ZA 2E0QA 1ML6A 1SKSB 1R26A 3WYWA 1JFUA 3I9V2 2R5GA 3G7JA 3E0UA 1LJRA 8GSSA 1TW9A 1R7HA 1YF0A 1FVKA 2H30A 1JZOA 1O85A 1OE8A 5E59A 2FD3A 6GSSA 1QMVA 2KLXA 3G7YA 4FYBA 1EOGA 3ISOA 5HR0A 5ID2A 3D5JA 3VWUA 2FY6A 2H1DA 4HQZA 1GH2A 3LORA 5JCWA 1A8LA 2V1MA 2YN1A 2GSQA 5J41A 2P5RA 3W6GA 1GL8A 4LLRA 2HZEB 5J4UA 1A8YA 2YWOA 5A4VA 1OKDA 1F9MA 1NM3A 4WEYA 1PX6A 3HJMA 5ECKB 4YQMA 3R2QA 1CQHA 2A4VA 3WD6A 3Q18A 1IYHA 2H70A 2J9HA 3DEXA 2DSAA 1ZYQB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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