4OD7A

Complex structure of proteus mirablis dsba (c30s) with a non-covalently bound peptide pwatcds
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase/peptide
source organism Proteus mirabilis
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
total genus 61
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4od7A00
2QC7A 1XOBA 3TUEA 2PUKC 1QXHA 1EOGA 3GL5A 1EWXA 2DJJA 1NHOA 3PR8A 4TXOB 1URMA 3HVSA 3GTUB 4KAEA 2IIYA 5JWOB 1A0FA 1FO5A 2E0QA 1PSQA 3UAPA 3LXZA 1BJXA 1NHYA 1GTBA 4Z7XA 6GSTA 1GSSA 2O8VB 4L5LA 1TK0B 5IMCA 1V9WA 4GWRA 2O7KA 1VF4A 3TOTA 4ZL8A 5ECIB 2FGXA 5IMAA 1XFLA 3KIJA 1JFUA 2B1LA 1S3CA 2KLXA 3EMPA 3C7MA 3FY7A 2V32A 2DIZA 4FYUA 5F07A 2OBKA 4LLRA 1Z7RA 2N5BA 1OAZA 3HJPA 13GSA 4HJMA 2VM1A 4WF4A 4KGIA 4J57E 4CW9A 2K8SA 4QL7A 2JACA 4XS1A 3O76A 3FR6A 4TW5A 2OJLA 1PX6A 1KEBA 4DEJA 1TW9A 1M9BA 3KMOA 2PWJA 2LV3A 3W8JA 2GDRA 3ZZXA 11GSA 1FB6A 4JRRA 3S9FA 1KNGA 2K18A 4BVXA 3HJOA 1H4OA 5AIVA 2OADA 2FA8A 1LBKA 2PVOC 2JZRA 3TRQA 2HSHA 3VI5A 1I5GA 1A8LA 1C72A 1K0OA 1PD21 5FWGA 4K8MA 2H0IA 1EP7A 2MMNA 1AC1A 2DLXA 3TKQA 2K8VA 1R5AA 4EUYA 1ZYQB 3LG6A 2YJHA 3GN3A 2GS3A 3RPPA 3FZ9A 3GH6A 4EF0A 4N11A 1K0MA 2FCHA 2WGRA 2TIRA 4XCSA 1YDKA 3UBKA 3LYPA 4MJEA 2R2JA 3ZITA 3GKKA 4KH7A 4WBJA 1TTZA 3VPTA 3P2AA 3APOA 2YWIA 4PUFC 1EV4A 1Q98A 2VCVA 4XTSA 4V2LA 1R7HA 3UIWA 1EOHA 1PQNA 2IMDA 2WJUA 1CQHA 3QFAC 5D93A 2H75A 1W4VA 2E2MA 1DSBA 4XS6A 5DQSA 2M72A 1S3DA 1ERUA 2B5EA 2LTKA 2CX4A 3L4NA 5IMFA 1ERTA 2L4CA 1BX9A 1BYEA 2R6KA 1XW6A 5CP1A 4OFNA 5AIXA 3FKFA 3HVVA 3C73A 5AGYA 3CRUA 4IQ1A 1SD8A 4AF2A 2XBIA 3KH7A 4GRFA 1O7UA 2NDOA 2PBJA 4IBPA 4LL1B 4X0XA 5LNKe 1FOVA 4POLA 1A24A 3F6DA 1TI3A 2KHPA 1E2YA 1M99A 4IVFA 16GSA 1BEDA 1EGOA 2VCXA 1GLQA 2HE3A 5ECQB 2YV9A 5G1LA 3EURA 3F9UA 2MMOA 1JLVA 2H66A 5LCZA 2FHEA 3DIEA 2PVQA 4TR4A 1V58A 2KP1A 5KN1A 1B9YC 2JSYA 5CAXA 4K7NA 4Q5QA 5GSSA 2H71A 1M0UA 4J2FA 5GZZB 4V1Ap 3D4TA 3U5RE 2GQLA 1DBYA 2R5GA 1YY7A 4MJBA 4PNGA 1QGVA 4ML1A 1J08A 2LEGA 1O6JA 4NHWA 3IC4A 3H4KA 2H30A 2DJ3A 2VLTA 2HXKA 3E9JB 1GSUA 2MMZA 1KTEA 1EGRA 2VL2C 1LJRA 2R3XA 3ZIJA 1GSFA 1N2AA 2GZPA 2M80A 1GSEA 1GNWA 3VWVA 3KZQA 3HA9A 2J23A 2H1BA 4BPYA 3HY2A 1VF3A 3SWLA 2H76A 2GZYA 3VWWA 4IS0A 5D9VA 2YJ7A 2VL2A 1XW5A 3TRPA 1QFNA 2BTOT 2CAIA 3QAWA 3ISOA 2XBQA 4OMVA 1FB0A 2L57A 2FA4A 3P90A 1GH2A 1KBNA 4MZWA 2AAWA 1Z3EA 5CRDA 3TKSE 2REMA 1X0RA 5ELAA 4ZB6A 1VRSD 4L5OA 1SK0A 4OCEA 2VLUA 5E59A 2L6DA 2IFQB 2GLRA 1HD2A 5KN2A 3I43A 2YPMA 2VCQA 4TR3A 1K0NA 1ON4A 5H5RA 5HFIA 2LRNA 3IA1A 2FY6A 4EO3A 3HZ4A 2K9FA 3EWLA 3KP9A 6GSWA 4JR6A 1X9WB 3FZAA 2QGVA 3F63A 3VK9A 3Q18A 2V41A 1TP9A 1NM3A 2VCWA 3UVTA 3GSSA 3HXSA 2MMAA 1Z6NA 1TK5B 2C8UA 5DALB 4FYBA 5ECLB 5J5NA 2F51A 3H1NA 2H74A 4L0UA 3WT2A 3UARA 4TXVA 4LMWA 1NW2A 1ABAA 5CYYA 5A4VA 2DBCA 3C8EA 4I6XA 1GUMA 1RK4A 5A4UA 2JSZA 1WJKA 3DEXA 5HR0A 3TJGA 4F03A 1MDJA 4V2MA 1G7OA 2KUCA 3ZYWA 1OE8A 1E6BA 3QR6A 3ME8A 2GVPA 2X99A 4I2TA 3RBTA 3C1RA 4IJ3A 2LSTA 5DQYA 3UJ1A 3Q19A 2WCIA 4ECIA 3GIXA 3LWAA 4ECJA 4RQRA 2YZUA 3LEFA 18GSA 1ZL9A 1F3AA 3LYKA 1EV9A 2PMTA 1T8EB 4I2UA 2TRCP 1HNAA 2YWOA 3F4RA 4IN0A 1W89A 3DWVA 2GSRA 1G6WA 4PXOA 3IXRA 4BL7A 3K8NA 2YWMA 3EC3A 3ZLPA 4H86A 1PL1A 3MSZA 1A23A 5D96A 3CMIA 2CQ9A 1HYUA 4YH2A 1OKTA 4OO5A 1JZDA 2C0DA 2PU9C 2WULA 1XWKA 5ID2A 3GRXA 5IIZA 2ZCTA 4WF5A 2CVBA 1VGLA 2CZ3A 3KH9A 3FR9A 1T3BA 4E8EA 2LS5A 4GXZA 1AQXA 4IGJA 3KGKA 4KNDA 4PURA 2WFCA 2HZEA 2I9HA 2VOCA 2HFDA 1JHBA 2GQMA 3GURA 1VF1A 5CRHA 2CAQA 5ECKB 1AQVA 2O89A 1U87A 2V6OA 2H6ZA 1GRXA 4KW6A 3DVWA 2RIIA 5D9WA 2LJKA 1X9SB 3GX0A 10GSA 4F2IA 1YKCA 3L78A 22GSA 3FK8A 5IMVA 1OKDA 2RM6A 3BCKA 3GKNA 2KP2A 2GTUA 2VO4A 2JU5A 1Y25A 4PQ1A 4EDYA 3IE3A 2ZNMA 5IOXA 2DMMA 2P0GA 1SYRA 3G7IA 4HUAA 1XXUA 4E8HA 6GSSA 1K0BA 4GQCA 2HRNA 4DSSA 1THXA 3OR5A 1GP1A 5KN0A 2EIOA 2GT6A 5ECOB 2R37A 1WE0A 5B6MA 3EU3A 6GSXA 3ERGA 4JBBA 1PL2A 4HZ4A 1PGTA 5J41A 3TOUA 5ECNB 3ZVJA 5A4WA 5ENUA 2B7KA 3A2WA 2GZZA 2I1UA 1RQMA 2F3MA 2YP6A 3C71A 1ERWA 3L9UA 3KJYA 5KN3A 3HHVA 1PRXA 3IV4A 2VL3A 1G0TA 4HI7A 2HZEB 3I9V2 1ZZYA 5B6NA 2X8GA 2MBSA 1JZWA 4WBRD 1M7TA 1SU9A 1XCCA 2YCDA 4N30A 3MWHA 17GSA 5J3RA 4KX4A 4TKYA 2WRTA 5IPGA 4MPGA 3A2VA 5JWQB 4BVYA 4POMA 2FD3A 3TB2A 5J9CA 4JEDA 2M46A 4PQIA 3IK9A 2OBIA 4OWYA 4QQ7A 5J9BA 7GSSA 2IMEA 2YNXA 2OE1A 3TKPA 1TXXA 2HNLA 1XWGA 2YOIA 3Q74A 2L59A 1ZGNA 4ILFA 4RI6A 2N5AA 2LQQA 3I69A 3AY8A 4KA0A 1AIUA 3N5OA 4AJ7A 4DSSB 1V2AA 2GSTA 3GYKA 1WP0A 3BBYA 2KOKA 4F0BA 4ID0A 5DBQA 5FT3A 4K7OA 1TKDB 1WRYA 1B9XC 1YJ6A 3VWXA 1TU8A 3CTGA 2FWHA 1X5EA 4GSNA 3QFBC 1R26A 5B8AA 4K7IA 5G5FA 2ALBA 3QOUA 5GAND 4RQXA 3F3QA 5ECHB 3A2XA 2GSSA 3IR4A 4EKZA 3BD2A 1A8YA 2OE0A 3F8UA 4EDZA 4KCAA 4ULXA 4MZCA 1AUCA 1OE7A 1A2MA 5G2ZA 5C00A 4CHSA 2WS2A 1HQOA 4MMMA 1NSWA 5INYA 2C1YA 5CRWA 1WMJA 4RUVA 4POBA 4XHMA 4O5RA 4ZL7A 4F82A 4WR5A 2AYTA 2ON7A 3UBLA 3VLNA 2DIYA 3F6FA 3ME7A 2L6CA 4V1Ag 4MH2A 2A2SA 1USBA 4IW9A 3ERWA 2DJ1A 3IHQA 2HT9A 2HI7A 4YAVA 3M1GA 1Z5YE 5ECPB 1ZOFA 4BA7A 4NAXA 1QK8A 4NPBA 5HQPA 1UA5A 1WWJA 3PINA 4G2EA 3L0HA 4XS4A 2E2GA 1U88A 1YF1A 1GWCA 1U3IA 3WT1A 2PGTA 3ZTLA 5DJMA 1A2LA 4MDCA 4EVMA 3CSIA 2D2ZA 2R4VA 3D5JA 5AN1A 5AISA 1BAYA 3W6GA 3UL3A 1GULA 4ML6A 3IPZA 4WXTA 2LNSA 5KEJA 1SJZA 1A2JA 3R2QA 4NV5A 4FIWA 1CQGA 4K6XA 1PMTA 4IP1A 4JZQA 3NOFA 3KEBA 4HQSA 4F9ZA 4HS1A 1PX7A 2YZHA 2H6YA 19GSA 5D9XA 2YANA 1T7PB 3M8NA 1K0DA 5CRGA 1BG5A 1OC3A 5DCGA 3UMAA 1SKRB 1O8WA 3GMFA 2NBSA 2H01A 5HR2A 3H93A 1Y6EA 2BMXA 3JCML 2PN8A 1XWCA 5EY6A 2IMKA 2JZSA 1B4QA 3ZRDA 1QQ2A 1F2EA 2LUSA 2V6KA 1GTIA 1SL2B 2VM2A 4CDOA 4I5QA 1F9MA 3C1SA 3L9VA 4BWQA 2DC5A 3LQ7A 2LRCA 3KTBA 2OA7A 5F05A 4XIHA 3D0ZA 5IOWA 2HZFA 4EXJA 9GSSA 4XS4B 3BCIA 4WEYA 5EPFA 1SYXA 4PGTA 3WYWA 1T1VA 2VCZA 2XPEA 2JL4A 1O81A 1FVJA 2LJRA 2P5QA 4ECBA 1S3AA 3RDWA 3KXOA 3EU4A 2ZUPA 3CXGA 6GSYA 2VL9A 3WGDA 5IO2A 1DE1A 1WPIA 4MH3A 1XPVA 4GCIA 3GA4A 3EVIA 1T00A 4HU9A 2IL3A 1M2AA 1X5DA 3GHAA 3CRTA 3QPMA 2LJAA 3DVXA 3FW2A 5F06A 3DMLA 2VLVA 2HSYA 1R5PA 2C0GA 4N0ZA 3WGXA 5L71A 3TKRA 2CT6A 4L8EA 3LJRA 3J7Yb 2B6MA 5G5EA 2H1GA 2AUVA 1B8XA 2GT5A 5DDLA 4NV2A 1AAZA 4JE1A 2FUG2 4MF7A 4TXOA 5IO0A 3RHBA 1G6YA 3F3RA 3GTUA 2YV7A 4MZBA 1AXDA 3QMXA 2WB9A 4ISDA 3MAKA 2L5OA 2QKEA 1QMVA 3IAS2 1UN2A 1SJIA 3GFKA 3W8SA 3NZNA 1OC9A 4MLYA 5CO3A 2IMIA 3KM6A 1ZMAA 1Z9HA 1ZYEA 3TDGA 3D6IA 5CREA 1IYHA 1BQ7A 2V2GA 5IM9A 4ECCA 3TJFA 4O92A 4Q5NA 2RM5A 4V2NA 1F37A 3TGZA 4JU5A 1RW1A 3EYTA 3ZMLA 3KTLA 2C80A 3M9KA 4LL4B 4ZBAA 3QDNA 4G9HA 3UEMA 3U6VA 4P3YB 1V57A 1LU4A 4LA1A 2DJ0A 4IP6A 3TJKA 3RPNA 4IJIA 2CVDA 4OFMA 2VAFA 5ECSA 2WZ9A 4MK3A 1GSYA 3P7XA 2C3NA 3APSA 2C0FA 3HYPA 3GNJA 3GH9A 1PKWA 5ABRA 4QL9A 2VCTA 4NWYA 4IHUA 4IKHA 2LRTA 12GSA 4ZILA 4WKWA 2GGTA 1T4ZA 2YN1A 1TU7A 4RI7A 3CBUA 3DD3A 20GSA 4GF0A 5GSTA 1HNBA 4DVCA 4IQAA 4KDYA 3I6AA 4D73A 1GSQA 4TRXA 4K0GA 5LD0A 3GKXA 2E7PA 2HLSA 3RAZA 2RLIA 3HZ8A 2B5XA 2I81A 4X43A 4MJCA 5JCGA 4ZBBA 4FYCA 3SBCA 4NHZA 2F8FA 2JZTA 4AJ8A 1OC9B 2A4VA 1XZOA 5DJLA 4FO5A 1Z6MA 3DRNA 4HOJA 4GSTA 3UOMA 1SENA 8GSSA 2H1AA 4GQFA 2IJYA 1WIKA 4WR4A 3QCPA 5DCHA 1JZOA 2B3SA 3EINA 2LKUA 3O3TA 3ZFBA 3F4TA 5HR1A 3ZL5A 3HD5A 1XIYA 5IPHA 5EL8A 4HEA2 5ID2B 2IMFA 5JWRB 6GSVA 5D8IA 4PUAA 3IDVA 4N10A 1Z7PA 1MDKA 5JCUA 2AJQB 4ZIJA 1XVQA 3LSZA 2CVKA 1FG4A 3FR3A 2B7JA 2C3TA 1K3YA 4GTUA 1M9AA 3QAGA 3UVHA 1ILOA 4K0NA 4PNFA 3VFIA 2IN3A 3US3A 1K3LA 1TRWA 4YQVA 5DAKA 2FLSA 2A2RA 4YQUA 2VIMA 4MPFA 1UC7A 4ACSA 1X9MB 1XOAA 4HU7A 3LORA 2OKAA 3EE2A 4MCUA 3H79A 1XWBA 2GSQA 4D73B 3GL3A 3IOSA 1N8JA 2H0HA 1H75A 4OD7A 4K9ZA 2P5RA 3M0FA 1TRVA 1OYJA 4I8BA 5JCWA 2FWEA 1U6TA 2H73A 1EEJA 3CSJA 3LFLA 3ZMKA 2B1KA 4TN8A 2FNOA 3CSHA 4LMVA 3ERFA 1PKZA 2AV4A 2I4AA 2GQKA 2H0GA 3J7Yk 5B7CA 3FZ5A 4KCEA 1GUKA 2DSAA 1MD3A 1YQ1A 1M2DA 4XRDA 1G7EA 1MEKA 1I9DA 2X8CA 2O87A 3M9JA 1TRSA 4MF6A 3WGEA 3FEUA 1XW9A 1TOFA 4WETA 6GSUA 3E3EA 1MTCA 2HYXA 4KDUA 4MA9A 3P8WA 4KUNA 3PGTA 1SL1B 4OCFA 2ES7A 3IK7A 4KB3A 2NTOA 3QAVA 4ZB9A 2XC2A 4HQZA 2C4JA 4KDXA 1Q4JA 4XRAA 3VPQA 3DKSA 3V1WA 2NPBA 3GSTA 3DGQA 3ZIVA 1SKSB 1FHEA 1DUGA 3O6TA 1SK1A 5FHIA 1YF0A 1MD4A 5DAKB 1WOUA 5F8BA 4DSQA 3G9BA 1IYIA 1ML6A 2OACA 1FVKA 2VD1A 2IWTA 5ECMB 3ZVJD 2FWGA 2VD0A 1J0FA 1GNEA 4TOPA 1AW9A 3D4MA 1T4YA 1THOA 2JADA 14GSA 2HRFA 4HJ2A 4Q5FA 3Q6OA 4EC0A 4FH8A 4O32A 2V1MA 1JLWA 1M2BA 3VURA 3NIVA 4KSMA 5C04A 3MNGA 2H70A 3FZ4A 3A3TA 4AGSA 5CNWA 4TR1A 1V40A 2F8AA 1OVNA 3DXBA 3F4SA 3GUSA 1R4WA 3WD6A 5IQYA 1SKWB 5ELGA 3D22A 4G10A 3KP8A 3IBHA 1B4PA 2H8LA 2L5LA 3TKSC 2L4QA 2IFQA 1ACVA 4MJAA 3VWUA 5EVOA 1V98A 3M3MA 1FAAA 2C0EA 2FWFA 3GV1A 1ERVA 1TI1A 4G19A 3APQA 2ON5A 2Z9SA 2H19A 4Q5RA 3RHCA 2N5FA 3CYNA 3TKSA 1SJ6A 2EIQA 1MDIA 4K2DA 1O8XA 3HKRA 5J4UA 5DALA 1FW1A 1U3AA 3VI7A 2C3QA 3DYRA 4PX1A 5H5SA 1GTAA 1K0CA 4O7HA 3D21A 3IAM2 2PERA 1O85A 3FYGA 1YZXA 3A5WA 3GX8A 4N0VA 1YKAA 3TJJA 2O85A 5D9TA 1GL8A 5G1KA 1SK2A 4ZXGA 1XVWA 3ZREA 1F6MC 1XWAA 2CZ2A 1K0AA 2QSIA 3EMXA 1PA3A 2YWNA 3TJBA 2DMLA 4MF5A 4TR1B 3KCMA 2EIRA 4ZB8A 4ZBDA 4TVEA 2X64A 4EE0A 5D73A 1XBSA 2B5YA 4PQHA 2DJ2A 3H8QA 2G2QA 2CV4A 3HJMA 1EP8A 2PPTA 3E0UA 3PH9A 4KE3A 2AHEA 2H6XA 2CA8A 5GAPD 2I3YA 2TRXA 4ZL9A 5E4WA 4OO4A 1O73A 2G0FA 1TK8B 4K1FA 1GTUA 2K6VA 1J9BA 2WDUA 2BJXA 2EC4A 2LQOA 5HR3A 2VUPA 3TRXA 2DJKA 4YAPA 4MABA 1ST9A 1OC8A 4NXIA 5G31A 2H1DA 2XHFA 5COHA 1DE2A 1GUHA 2H72A 3L9SA 5IMZA 4IELA 4F0CA 4AJ6A 1A0RP 4JR4A 5DVBA 3KD0A 2CX3A 4HDEA 3QD9A 2P31A 1SD9A 2MYGA 2X8HA 1GLPA 4EL1A 3IRAA 3FRCA 1YEXA 1YEPA 2MBTA 4NMUA 5IMDA 1VF2A 4YQMA 1K3OA 1HNCA 2F9SA 2RUEA 1TJDA 3BJ5A 1F3BA 5G30A 4TR0A 4BWSA 3CTFA 3MDKA 1PN9A 4KSOA 4J56E 1X5CA 5F0GA 1TRUA 2LNTA 3F0IA 3G7JA 2OE3A 1UVZA 3HVXA 2MZCA 5ECRB 1ZCPA 1EZKA 2IPAA 4GLTA 1JZRA 1TDIA 1QUWA 3BOAA 5HFKA 1AQWA 3LGCA 3N9JA 5A5KA 2NVLA 4HZ2A 5HFGA 4X1UA 3ZFLA 1EEMA 4L0WA 3TCOA 3HDCA 1SL0B 3HCZA 4MP4A 3GKMA 4GSSA 2XPDA 4I97A 3G7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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