4OD7A

Complex structure of proteus mirablis dsba (c30s) with a non-covalently bound peptide pwatcds
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
ADISEGKQYTNLSKPVAGAPQVVEFFSFYSPHCYQFSEVYKVNSTVEKNVPENTKMARYHVDFLGPLGKEMTRAWAVAIALGVEDQVSPALFKGIQETQSIRSVDDIRTTFINAGVKAEDYDAAINSFVVNSLVSQQQNAVTDFQINGVPAMVIDGKYKMKNDGISAKSPEEYAKAYSDVVNQLLMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
publication title Crystal Structure of the Dithiol Oxidase DsbA Enzyme from Proteus Mirabilis Bound Non-covalently to an Active Site Peptide Ligand.
pubmed doi rcsb
source organism Proteus mirabilis
molecule tags Oxidoreductase/peptide
total genus 61
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4od7A00
4J56E 1TKDB 2C1YA 3NOFA 1EWXA 4ZL8A 4WKWA 3W8JA 5ECQB 1EGRA 3D4TA 1M0UA 1GSSA 3LSZA 1AUCA 1O85A 4NXIA 4NMUA 3ZIVA 1M2BA 1SK1A 1TOFA 2LRTA 3HVSA 3DVXA 2LS5A 3GKKA 4XTSA 5IMAA 4FH8A 3DRNA 4H86A 4MDCA 5JCGA 1T4ZA 2I3YA 1N2AA 2E0QA 4OFMA 2LJRA 2LQOA 2R5GA 3TCOA 2IJYA 1RW1A 3WT2A 1UC7A 1B8XA 2KUCA 1QQ2A 1NHYA 3HDCA 3I9V2 3WGXA 1GP1A 1AQWA 4O5RA 2HLSA 2XPDA 3KH9A 2YWMA 4YAPA 5ECKB 2HRFA 4MH3A 5AIXA 4EVMA 3ME8A 3SWLA 1XVWA 3UIWA 1X0RA 5G30A 5ECPB 4JE1A 1DUGA 5KEJA 5D8IA 4CDOA 2VL9A 2KP1A 1M2AA 2VL2C 1EV4A 2V6KA 2JADA 4XS4A 2RM6A 3EMXA 3A5WA 4EO3A 2G2QA 3DEXA 5B7CA 2DLXA 2HZEA 3H79A 2EIRA 2GZZA 5IOXA 5ENUA 1B48A 2L6CA 3QAVA 1N8JA 4IN0A 2H70A 2E2MA 1TRUA 4PUAA 3QFBC 4LMVA 3GH6A 5D9VA 4POLA 3GSSA 1JZWA 1O8XA 3M1GA 1K0MA 4EC0A 5EPFA 1PRXA 17GSA 2FY6A 1VF3A 6GSXA 2GSTA 1A2MA 4TKYA 4TW5A 2P0GA 4ISDA 5HR2A 3DD3A 1GTUA 4I2TA 3FR3A 4EL1A 1K0DA 4F82A 7GSSA 1OC9A 1XWBA 3IK9A 1XOBA 2F8AA 2YJ7A 4GSSA 3EVIA 2VD1A 1PSQA 2DJKA 1GSEA 1BQ7A 4I6XA 3KD0A 5AN1A 3IV4A 5ECSA 2OADA 3GRXA 3UL3A 3M0FA 1R5PA 2A4VA 1XOAA 1VRSD 4BL7A 4XS4B 3A2VA 3DYRA 3HVXA 1PX6A 2HYXA 1BEDA 4P3YB 2ZCTA 4MF7A 4KB3A 1U3IA 2DSAA 3FZ5A 1QUWA 3UVTA 2TRXA 3MWHA 1GTBA 3EURA 1Z3EA 5H5QA 2FWFA 3TGZA 2LNTA 1ERWA 3FKFA 1GRXA 2FNOA 1A8YA 3LYPA 2DJ0A 5G1KA 1LBKA 3D21A 3IR4A 4KA0A 2K18A 1SL0B 3HKRA 3TOUA 2K9FA 2IFQB 2KHPA 2ON7A 5COHA 2V6OA 1BJXA 2AB6A 4FYUA 4KAEA 1MDJA 5HR3A 3OR5A 3GHAA 4DSQA 2EIOA 1T00A 2RUFA 2LRCA 2YJHA 5DAKA 1USBA 5DVBA 2YWIA 2H01A 3ERGA 4ZIJA 5D9TA 22GSA 5IM9A 4QQ7A 2GLRA 3HZ8A 2NTOA 2FA4A 3O76A 1DE1A 2AYTA 1ST9A 1XWKA 2O7KA 2CV4A 3H1NA 2I1UA 2CX4A 3C71A 3D6IA 4MPFA 2DJJA 1RQMA 3C7MA 4NV5A 5D9XA 4K0NA 5DJMA 3A3TA 3F0IA 3L0HA 2O8VB 2K8SA 3KIJA 5F8BA 1ZGNA 3TRQA 2OKAA 3UVHA 4K0GA 4YAVA 4KX4A 2B5YA 2ZUPA 3U6VA 2H1AA 4GXZA 2H76A 1DE2A 4L5LA 4XS1A 1TK0B 5GSTA 1J9BA 2IWTA 4WBRD 3JCML 5LCZA 4G10A 4OO4A 3VI5A 3S9FA 2YV9A 2H0IA 4PURA 3CRTA 5A4WA 3FRCA 5IMVA 1GLQA 4O92A 3P90A 2DMLA 4Z7XA 3PH9A 2H8LA 4ECCA 3KMOA 5B6NA 4KSMA 3LJRA 5HFGA 2VCTA 4N10A 1YZXA 1SL2B 5KN1A 3KH7A 2BTOT 4XS6A 3ZIJA 4BWSA 1EZKA 1G6WA 3RAZA 4FIWA 2H6ZA 3CTGA 4TXVA 1FG4A 4AJ7A 3GNJA 3L4NA 4IJ3A 2GSSA 1YDKA 4MLYA 1K0AA 3VPTA 4MMMA 2CVBA 4OO5A 2AJQB 5C04A 2RUEA 3DXBA 1F9MA 5IO0A 1URMA 4MZBA 3HVVA 1K0NA 3C8EA 3TJGA 5HFKA 3KGKA 1FB0A 5J5NA 4TR1A 2H72A 3KP8A 1M7TA 2YV7A 1XWCA 2F8FA 4RI6A 1Q4JA 1ERVA 2L59A 3PGTA 1GNEA 1R7HA 2DBCA 4TVEA 5JWQB 1Q98A 3H4KA 4XRDA 2TRCP 4ZB8A 4E8HA 2X8CA 2XBIA 1O81A 1TJDA 2NVLA 3RHCA 4V2MA 1GH2A 5D96A 1G6YA 16GSA 1JZOA 2C3NA 2XPEA 5JWRB 2CX3A 1WMJA 1K3LA 2C8UA 4TRXA 4WETA 5IMFA 3TB2A 1EP8A 3GIXA 3RPNA 1YQ1A 4I97A 3LXTA 1YY7A 1A24A 4PQ1A 5AIVA 4DEJA 1C72A 3EMPA 4ECJA 3IAS2 1ACVA 4FO5A 3GSTA 4LLRA 1CQGA 2D2ZA 2LNSA 3GKNA 4DSSA 1TU7A 1VGLA 3TKPA 4TN8A 1SD9A 1PX7A 4F2IA 3E0UA 3GYKA 1O7UA 3GX0A 2CVKA 2OE1A 4V1Ap 4MCUA 1U88A 5ELGA 4ULXA 1YEPA 1V57A 4TOPA 2JSYA 3LWAA 3Q6OA 5FWGA 3IOSA 4KE3A 4QL9A 1U87A 4XCSA 4NHWA 5A4UA 5D93A 1GLPA 3UBLA 2JZTA 1Z9HA 2QSIA 5INYA 3IBHA 1EV9A 2YWOA 2M80A 1V9WA 6GSWA 4N30A 1PN9A 5CNWA 2LTKA 4MJEA 1RK4A 3P8WA 4JBBA 5ECHB 4HQZA 2GS3A 2WCIA 4CW9A 1E6BA 4ZBDA 2IMEA 4CHSA 2HSHA 3NIVA 3ZLPA 3IE3A 2B1KA 5FT3A 4RUVA 2OBKA 5F05A 1GSFA 3P2AA 3KJYA 3QPMA 5J3RA 3GH9A 2H73A 1TW9A 2GTUA 3QMXA 3O3TA 4EDYA 2OACA 2WJUA 5ECIB 1GULA 2OE3A 1KEBA 2OJLA 3KTBA 3DWVA 1X5EA 6GSYA 2VCXA 5D73A 3CRUA 3P7XA 2OE0A 2PMTA 4LL1B 4ILFA 1BG5A 1NM3A 2F51A 3WYWA 4MZWA 4HEA2 1UVZA 4YH2A 4IW9A 2GZPA 1SKSB 1EP7A 1GL8A 3PR8A 1GNWA 2FLSA 3N5OA 3TOTA 2H75A 3TKSC 4K8MA 3UAPA 4AF2A 2RIIA 2GGTA 2GSQA 2Z9SA 2VCWA 5DBQA 4MF6A 1M99A 4AJ6A 5HQPA 3BOAA 3HYPA 1ON4A 2E2GA 5J9CA 5HR1A 3QAGA 5EY6A 4JU5A 3TKSE 3ZTLA 2YWNA 4EXJA 1EOGA 1HNBA 1YKCA 4K6XA 2WB9A 3V1WA 1JLWA 2JL4A 4I5QA 3APSA 3WGEA 2F3MA 4WBJA 14GSA 2CAQA 3F4RA 2VM1A 3GMFA 2L5LA 3MSZA 5JCWA 1M2DA 6GSTA 4WEYA 8GSSA 1V2AA 4IBPA 1LJRA 1JZDA 2FGXA 1Z7RA 4MZCA 1GSYA 1YEXA 3G7IA 4JEDA 3FZ4A 3M8NA 2R4VA 3CBUA 2H66A 4BVXA 2IFQA 1OKTA 1M9BA 3F6FA 1XCCA 1M9AA 2EC4A 3HA9A 3UMAA 3GX8A 1K3YA 2JZSA 2H1BA 1ABAA 3IHQA 4JZQA 1HNAA 1K0CA 1JFUA 3QCPA 2L5OA 4DVCA 2YZUA 1H75A 3IA1A 3VWUA 1PMTA 4GSNA 4IP6A 1PL1A 4V2NA 2K6VA 4V1Ag 5H5SA 4KCEA 4ZL9A 1WRYA 3DKSA 3SBCA 4KW6A 2C4JA 1A23A 3CYNA 5CREA 4HZ4A 2O87A 2WGRA 3EU3A 2B1LA 4TR4A 3GL5A 1Z7PA 2MYGA 1TRSA 2H19A 4N0VA 3RDWA 1SYXA 4JRRA 5IMDA 4OD7A 3GUSA 2VM2A 3ZZXA 3IC4A 4MF5A 1TI1A 2H0HA 1A8LA 3KCMA 3ZFLA 4IQ1A 2LJKA 2R6KA 1FVKA 2V1MA 1THOA 3F3QA 1GSUA 4EE0A 5AGYA 5B8BA 2H71A 1YF0A 1VF2A 2YOIA 2JSZA 3CTFA 3F3RA 2H1GA 1W4VA 3G7YA 2VAFA 2MMZA 4AGSA 3EE2A 1B4QA 4O32A 1FVJA 1X9WB 1BYEA 4KNDA 4MJCA 3LYKA 2X99A 3ZVJA 4ZL7A 4MPGA 1NSWA 3F6DA 2VCVA 1F3AA 3G9BA 3CSJA 2NPBA 1R5AA 4N0ZA 3VLNA 1NHOA 2B6MA 2X64A 4KDUA 5DQYA 4PUFC 2IMFA 3TJJA 5L71A 4KSOA 5F07A 1VF4A 1ZCPA 2DC5A 5IOWA 3EYTA 2VCZA 2WS2A 2IL3A 2H6YA 1PA3A 3DIEA 2VL3A 4L8EA 1QMVA 2C3TA 1OYJA 3GKMA 2DIZA 3C1SA 4XRAA 1TU8A 2LJAA 5F06A 5JWOB 2F9SA 3A2XA 1UN2A 1JHBA 1KTEA 1SU9A 2JACA 2J23A 2YCDA 1ML6A 1T8EB 1X9MB 2JU5A 2H1DA 5EL8A 1PL2A 2CZ3A 3APOA 1ZYQB 3UARA 1AC1A 1XFLA 3GKXA 2MMAA 4PQHA 4POBA 1PD21 2L4CA 20GSA 2GQLA 1G7EA 3KP9A 4I2UA 5IQYA 3RHBA 2AUVA 5KN0A 4TXOB 2O89A 1E2YA 2JZRA 1WE0A 2R2JA 2TIRA 2E7PA 3GTUB 4BVYA 4PXOA 2CAIA 3F4SA 1Y25A 4OFNA 4HZ2A 2REMA 3E3EA 3GV1A 1K0OA 1F3BA 3GA4A 1F6MC 4POKA 1XBSA 5CYYA 3QD9A 3IXRA 4L0UA 2P5RA 4GQCA 2HT9A 3DVWA 1JZRA 5DCGA 2FD3A 4HI7A 2N5BA 3IK7A 4IS0A 1GSQA 2C0FA 1XIYA 2PWJA 1THXA 3QAWA 3QDNA 3TDGA 2HI7A 4K7IA 2ALBA 3MAKA 1W89A 2OA7A 1MD3A 3FW2A 2R3XA 2QKEA 1FHEA 4FYBA 1WJKA 3ZYWA 4PGTA 3VPQA 2I4AA 4HS1A 3UEMA 3I43A 2AV4A 1BX9A 1J08A 1XPVA 4FYCA 2P5QA 1HD2A 5GZZB 5DJLA 3Q18A 1GUHA 4L0WA 1WP0A 3D5JA 1V98A 2V2GA 3D22A 6GSSA 3CXGA 4HOJA 2A2SA 2XHFA 4K7NA 3RPPA 2VD0A 1O6JA 3HD5A 2WULA 4MJBA 3G7JA 4OCEA 1AW9A 4J2FA 1OE7A 1MDKA 4K9ZA 3TJBA 3TJKA 4K1FA 2FWHA 1T4YA 3VK9A 1WOUA 2AAWA 4IP1A 4OWYA 1T7PB 1SL1B 2CVDA 1OE8A 3KTLA 3HJOA 4HDEA 1PGTA 3ME7A 2HXKA 3WGDA 2P31A 1JLVA 3CSHA 1V40A 10GSA 1R26A 2B3SA 4RI7A 5AISA 2RLIA 3BD2A 1ZOFA 1GTIA 2DJ3A 2LUSA 5IPGA 2QC7A 1ZL9A 3M3MA 2MZCA 1Z6MA 4XHMA 4EF0A 3TJFA 4QL7A 3CMIA 4ZILA 2N5AA 1HQOA 2YZHA 3ZREA 3TKSA 4GLTA 2B7JA 5DALB 3VI7A 1VF1A 2J9HA 2VL2A 1KBNA 4G2EA 5ABRA 1QGVA 5ID2B 3UJ1A 1TP9A 5DDLA 3LXZA 4OCFA 1TK5B 4HJ2A 1TXXA 3GL3A 1SKWB 2K8VA 6GSVA 2HE3A 4L5OA 3ZL5A 2IMIA 2VCQA 3AY8A 4LL4B 2YANA 3EWLA 5FHIA 4KUNA 3FEUA 4XIHA 5IMCA 1SKRB 2L6DA 2BMXA 3VFIA 2ES7A 2MMNA 4HUAA 4ECIA 1LU4A 2V41A 1A2JA 2GQMA 4IVFA 4MA9A 2KP2A 4GQFA 1SK2A 3GURA 3W8SA 2VIMA 4BWQA 1BAYA 4NWYA 3KMNA 2O85A 2HFDA 1I9DA 3HY2A 2PN8A 4TR3A 4F03A 4MABA 5G31A 3I69A 4NHZA 4OMVA 4ML1A 1UA5A 2WDUA 2H74A 2X8GA 2B5XA 5J9BA 4YQUA 4ZBAA 4KDYA 3W6GA 5B6MA 2R37A 4G9HA 5E59A 3HJMA 1S3AA 1PKWA 3TKRA 3L9VA 2LV3A 4BA7A 1B4PA 4ACSA 1ERUA 5GAPD 3WD6A 4PX1A 2VO4A 3FZ9A 1AAZA 5G1LA 2PBJA 2PGTA 1OAZA 5CO3A 4KCAA 1SJZA 5J4UA 2YN1A 2I81A 5DCHA 4GTUA 3N9JA 3IAM2 3M9JA 2HRNA 4K7OA 2XBQA 4ZXGA 3H8QA 3FR6A 5E4WA 1XXUA 2LEGA 5CP1A 2H0GA 3QFAC 2HNLA 2GQKA 2C0GA 4BPYA 4LMWA 1SENA 3L9SA 5HR0A 1T3BA 2IPAA 2ZNMA 1QXHA 1A2LA 3Q19A 2CT6A 2A2RA 1X5CA 4ECBA 4GRFA 3IPZA 1I5GA 1TTZA 2C80A 4IQAA 2QGVA 4KGIA 1ZZYA 2L57A 2C3QA 1FOVA 1S3DA 2NBSA 2DJ1A 1XVQA 2C0EA 1AQXA 2WZ9A 2FWEA 3FK8A 5G5EA 1J0FA 4PQIA 3CSIA 1TRVA 4GCIA 1Y6EA 3ED3A 4JR4A 5JCUA 2VLUA 4IELA 2HZEB 1DSBA 1G0TA 3DMLA 2CA8A 2KLXA 4RQXA 3F8UA 5HFIA 4N11A 2L4QA 1SJIA 3FR9A 3QOUA 3MNGA 4X0XA 4WXTA 2DIYA 2FUG2 1XW6A 5IIZA 18GSA 3H93A 1AIUA 1GUMA 3Q74A 4G19A 1XZOA 4IKHA 2IMKA 4GWRA 5GAND 1GTAA 3U5RE 3F4TA 1OC9B 4PNFA 2H30A 2FWGA 1FO5A 2X8HA 4HQSA 2FCHA 4Q5QA 5LD0A 2LKUA 3HZ4A 4KH7A 4HJMA 4NPBA 2GDRA 4IJIA 3HXSA 1MEKA 3QR6A 1YJ6A 2BJXA 2I9HA 3ERWA 1SJ6A 3ZMLA 1FB6A 2CZ2A 5ECNB 4F9ZA 3LQ7A 1QFNA 1PQNA 1MTCA 5GSSA 4WR4A 3KXOA 1ILOA 3ZITA 2DJ2A 4KDXA 1MD4A 3D0ZA 5IMZA 4K2DA 5IPHA 3FY7A 3EC3A 2PPTA 5CRDA 2V32A 4POMA 2ON5A 1OC8A 3TRPA 3RBTA 1T1VA 1XWGA 1B9XC 3VWXA 4TXOA 2PUKC 2PERA 4OFTA 3F63A 2LRNA 4GF0A 3GTUA 4DSRA 5ECMB 1U6TA 1H4OA 4JR6A 3KEBA 2KOKA 1KNGA 3C1RA 1AQVA 1WWJA 1ERTA 5ECLB 9GSSA 5CRHA 1X9SB 3IDVA 4PNGA 2PVOC 3TKQA 3L9UA 4I8BA 3TUEA 1ZYEA 2WFCA 1TDIA 1PKZA 2OBIA 1EOHA 1K3OA 1AXDA 3LORA 2M46A 4EDZA 4ML6A 1WPIA 3VWWA 3KM6A 2VLTA 1R4WA 2MBTA 1GUKA 5G5FA 1F37A 4MH2A 2GT6A 1IYIA 5DAKB 3GN3A 11GSA 1U3AA 5B8AA 2DMMA 3C73A 3UBKA 4MJAA 4F0CA 4EUYA 4X43A 1DBYA 2NDOA 5A4VA 3J7Yk 4IGJA 1XW9A 1X5DA 4HU7A 4RQRA 5J41A 4YQMA 1O8WA 1V58A 1FAAA 5A5KA 4X1UA 3HHVA 1G7OA 1O73A 3UOMA 3GFKA 3ERFA 3LGCA 3PINA 2WRTA 1WIKA 4E8EA 1XW5A 1A0RP 1GWCA 3R2QA 2HZFA 3DGQA 1SYRA 2PU9C 3TRXA 5DQSA 4WR5A 3ZRDA 2VOCA 3E9JB 1IYHA 3WT1A 1OVNA 3LFLA 2YP6A 4YQVA 4Q5NA 3FYGA 6GSUA 2RM5A 2YPMA 3O6TA 5G2ZA 5EVOA 2N5FA 2VLVA 4IHUA 4TR0A 1SK0A 1HNCA 5ECRB 19GSA 2GZYA 3BCKA 4HU9A 2FHEA 5IO2A 3FHKA 1EEJA 12GSA 5C00A 1OC3A 1F2EA 3LG6A 4WF4A 2MBSA 3KZQA 5CRGA 3HJPA 3L78A 4ZB6A 3EU4A 2IN3A 2B5EA 4Q5RA 4D73A 2VUPA 1EEMA 4ZB9A 5KN3A 1MDIA 2EIQA 5F0GA 5DALA 1TRWA 3D4MA 4J57E 3I6AA 5LNKe 1NW2A 3ZMKA 3F9UA 2GSRA 5ID2A 1OKDA 2LSTA 4MP4A 4NAXA 5CRWA 1SD8A 4NV2A 4V2LA 4WF5A 1HYUA 4EKZA 2XC2A 5CAXA 2G0FA 2H6XA 4LA1A 2B7KA 3IRAA 3ZVJD 3BBYA 2C0DA 3APQA 1GSDA 2YNXA 3BCIA 2IIYA 1TK8B 2GVPA 4ID0A 4TR1B 1XWAA 1FW1A 4MK3A 1TI3A 5ELAA 3J7Yb 5D9WA 3ISOA 3US3A 3LEFA 2AHEA 3VURA 3FZAA 3MDKA 1A0FA 1Z5YE 3M9KA 3NZNA 1B9YC 2PVQA 3K8NA 3BJ5A 4O7HA 2IMDA 4D73B 2FA8A 2HSYA 2LQQA 2M72A 1Z6NA 3EINA 1QK8A 5KN2A 1CQHA 2GT5A 1YKAA 3A2WA 4AJ8A 3ZFBA 1K0BA 13GSA 3HCZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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