3RHBA

Crystal structure of the apo form of glutaredoxin c5 from arabidopsis thaliana
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
100
structure length
100
Chain Sequence
SRMEESIRKTVTENTVVIYSKTWCSYCTEVKTLFKRLGVQPLVVELDQLGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFVCGKHIGGCTDTVKLNRKGDLELMLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutaredoxin-C5, chloroplastic
publication title Arabidopsis chloroplastic glutaredoxin c5 as a model to explore molecular determinants for iron-sulfur cluster binding into glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Oxidoreductase
total genus 37
structure length 100
sequence length 100
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rhbA00
1WWJA 2YJ7A 4I5QA 2GQMA 5DALB 2LJAA 4ILFA 3IBHA 1SJZA 3ZFBA 1R26A 1OAZA 4GWRA 5A4WA 1C72A 3DXBA 3GV1A 2HRNA 3DGQA 1SL0B 1A2LA 3EC3A 1OC9A 2GSTA 2V2GA 4ZL8A 4PQHA 2F8FA 3GH6A 4OD7A 1ZCPA 3GURA 3BBYA 3IAM2 3ZVJD 2E2MA 1LBKA 1FG4A 2O7KA 5DJMA 5IOWA 3UBKA 2VCTA 2VCWA 3KH9A 2HZFA 3LWAA 2V6KA 1F6MC 4HQSA 2ZNMA 4XRAA 3O76A 4Q5RA 4XS6A 2LQQA 4ZB9A 1NHOA 4N11A 3C8EA 4V2NA 3WGDA 5ECOB 3GKXA 6GSXA 4HI7A 1RW1A 1VGLA 17GSA 4EUYA 4N0VA 5LNKe 3QMXA 5CRGA 4ML1A 4F0BA 4F03A 4PGTA 1ON4A 2I4AA 1XWGA 3CYNA 4GXZA 4D73A 1U3IA 4OFMA 1A23A 4XS1A 3ZVJA 4NHZA 3GN3A 1W89A 1DBYA 2L5LA 4KAEA 4PQIA 4DSSA 1BEDA 2VL2A 2GQLA 2V32A 1ACVA 2V6OA 2X8GA 2PN8A 2GZPA 4HU7A 3UJ1A 1TRWA 2MMZA 2GLRA 4P3YB 4KW6A 3P8WA 5J41A 3F3QA 4H86A 1SJ6A 3P2AA 1K0BA 3CSJA 2BTOT 1YZXA 4LLRA 2H1BA 3SBCA 3KGKA 2YV9A 2I1UA 3WGEA 2H8LA 1TK8B 4Q5FA 1GTUA 3I9V2 1Z7RA 4QQ7A 1KNGA 3CTGA 1R5PA 4YAVA 2L4CA 4MZWA 1DSBA 1QXHA 3PH9A 1WRYA 5COHA 4EKZA 3V1WA 3TUEA 4ECBA 1Z6MA 1ML6A 2B1KA 1ABAA 3F4TA 1F9MA 2VLUA 1Q4JA 4LMVA 4L0UA 1MTCA 2FA4A 3EU4A 1TI3A 5ECPB 3VFIA 2MMAA 1MD3A 3G7JA 1GULA 4NPBA 5H5SA 4I2TA 1EV4A 3W6GA 4ZBBA 1GL8A 3ZMLA 2QSIA 1OKDA 4ZB8A 5KEJA 4XS4A 2AAWA 1T00A 2C1YA 2CAQA 5J3RA 4GQFA 4MF6A 3L0HA 1XVQA 3KP8A 2WS2A 1G6WA 1EV9A 1V40A 2DMLA 1GTAA 2A2SA 2E2GA 4GSNA 1V9WA 1AQXA 4KX4A 3J7Yb 3ZITA 2HT9A 2AJQB 2OJLA 3DVXA 3HZ8A 5LCZA 1FVJA 3MAKA 2R3XA 1XZOA 2R5GA 3LYKA 4K7IA 5FT3A 1XWKA 4DSQA 4POMA 3TRQA 5L71A 2E0QA 1EZKA 1THXA 3AY8A 1XWAA 1I9DA 2H71A 4K7OA 3Q74A 1TW9A 1Z5YE 5J9BA 5HR3A 4GRFA 2GGTA 3TGZA 2RUEA 2RM5A 3C1SA 4MCUA 1MD4A 1G6YA 5C00A 1NHYA 5G30A 1YEPA 3RBTA 3QAWA 1VF4A 4I97A 1XOBA 5J4UA 4MH2A 4PUAA 4BVYA 4WBRD 4QL9A 1K3LA 2QGVA 4KCAA 5D9XA 4EC0A 1PL1A 4J56E 4MMMA 1SKRB 3D4MA 3FEUA 4WETA 2H72A 4XCSA 3L78A 2CQ9A 4K0NA 2H6ZA 2M46A 5ID2B 3GHAA 2RM6A 5IMDA 5IMZA 1WOUA 4KDUA 1Z7PA 13GSA 5GAPD 1FOVA 1X5EA 4F9ZA 1ZMAA 1GLPA 3I69A 3BCIA 2CX4A 1U3AA 4DSRA 5F8BA 1SU9A 2P0GA 1Y25A 4MABA 2QKEA 3VK9A 1T4ZA 1YY7A 2PERA 2DJ3A 1O8XA 1SL2B 5IPGA 3HD5A 5G1KA 2K6VA 2LJKA 1TU8A 5JCGA 3GL5A 3ZMKA 5IO2A 3TKQA 2GVPA 4MJCA 2L4QA 3I43A 2ALBA 5D73A 2JU5A 2EC4A 2IIYA 4TXVA 5JWRB 1U6TA 3GFKA 1F2EA 1UN2A 8GSSA 2E7PA 2PUKC 2EIRA 1F3AA 1PKWA 5FWGA 1A0FA 5EL8A 2YV7A 2LRNA 3M1GA 1XVWA 2FLSA 4NV2A 2GSSA 4V2LA 2C4JA 3H4KA 1QFNA 4RQXA 3ZTLA 3QR6A 2B1LA 1V58A 4ZBDA 3KMNA 2HLSA 2K8SA 5IIZA 5ECRB 4OFTA 1GUMA 2F9SA 3TJFA 3WYWA 2RUFA 3LORA 3QPMA 2VL3A 4JE1A 3WT2A 2VCQA 3EYTA 3M0FA 1B9YC 6GSSA 2MYGA 5E59A 4MLYA 1ZGNA 3F4RA 1J08A 3A2XA 1EEMA 2L57A 2LS5A 1V57A 5CNWA 1Y6EA 5DVBA 1O8WA 1GNEA 3GMFA 3M9JA 4MZBA 3KP9A 2H74A 4OO5A 6GSVA 1GSFA 3GTUB 5HFIA 5JCWA 2ON7A 4Z7XA 3QFAC 1QGVA 4NHWA 5AN1A 1NSWA 3KCMA 5B7CA 3D6IA 12GSA 2VL9A 2L5OA 1RK4A 4BVXA 2JSYA 3GUSA 2VLTA 1OVNA 2H75A 3C7MA 2KHPA 3SWLA 4FYBA 3H1NA 1GUKA 2O89A 16GSA 1ZYEA 2PU9C 5IM9A 1SKSB 1UC7A 3GRXA 4OMVA 2P5QA 2AV4A 1TK5B 2C8UA 5JCUA 1USBA 3TDGA 4K1FA 2FWHA 1GRXA 3VPQA 1A8YA 5G1LA 1EP7A 4WBJA 3N9JA 1FB6A 2Z9SA 1FB0A 1F3BA 1XWCA 4POBA 3HY2A 1GUHA 3EMPA 3NOFA 4XTSA 4FO5A 4WR5A 5D9VA 1URMA 4L0WA 4FYUA 2B7KA 3D22A 4TR1A 4ZL7A 4EF0A 4AGSA 4ACSA 1WJKA 3APQA 3U5RE 1PRXA 1AW9A 4E8HA 1JZOA 2HSHA 3TKSA 2FGXA 1JLWA 1H4OA 2R6KA 5DALA 2HFDA 3KEBA 2YN1A 3Q18A 1A2MA 1ERUA 3KMOA 1CQGA 3KZQA 2DBCA 2PGTA 4DVCA 3FKFA 3IXRA 4YQMA 3GNJA 4MPGA 3M3MA 1WP0A 4KA0A 5AGYA 1K3OA 2R2JA 2IMDA 1PN9A 1RQMA 3IPZA 1HNAA 1QUWA 1F37A 1ERTA 1Q98A 1VF2A 3QOUA 4JR4A 2H66A 4TN8A 4PX1A 2K18A 3IDVA 2KP1A 2OKAA 3ERGA 1KBNA 2YWOA 2AUVA 3IAS2 3RHBA 1SD9A 5D8IA 4ECCA 2WULA 3UEMA 1AXDA 2LTKA 2G2QA 3M9KA 2G0FA 1VF1A 2GS3A 2L6CA 2XC2A 2FCHA 3IC4A 2NTOA 1TP9A 3TOTA 3ZZXA 4HDEA 1YQ1A 3GKNA 2PVOC 3GKMA 3ISOA 2CAIA 2WFCA 3IA1A 5HFKA 5HR0A 2FWFA 5EVOA 3IK9A 1XXUA 2F3MA 3J7Yk 4KH7A 2OA7A 3GYKA 1JZRA 3S9FA 6GSYA 4GSSA 1VRSD 4WKWA 3OR5A 3UL3A 2MMNA 4GLTA 3HHVA 3TCOA 4PXOA 4XIHA 3HVVA 3LJRA 20GSA 4ISDA 1A24A 3HXSA 5ECHB 5CRDA 4NMUA 2C0GA 2OADA 2TRCP 3FZ5A 3CBUA 4KSMA 4MJEA 2FUG2 2X64A 3ME7A 2IN3A 1GH2A 4KNDA 1PSQA 1Z6NA 3WT1A 3DYRA 11GSA 3CTFA 4ULXA 5G2ZA 1OKTA 3GKKA 1UVZA 2OE0A 3FZ9A 4LL1B 1J9BA 2HI7A 2DLXA 4TKYA 3TOUA 3UBLA 1TTZA 1ZL9A 3F3RA 1PMTA 2DSAA 3Q19A 4ZBAA 2C0FA 1O6JA 2WZ9A 4TOPA 2HZEB 2YZHA 5CRWA 2H70A 1XFLA 2TRXA 2IMFA 4LMWA 4GTUA 3RPNA 1ST9A 3A2VA 3PINA 2B7JA 6GSUA 1IYIA 2X99A 1AUCA 1A8LA 4MF7A 1PL2A 5LD0A 1T8EB 3VWUA 3HYPA 3DRNA 3LXZA 5IMFA 5B8BA 4AF2A 4ZXGA 5AIVA 4FH8A 4MP4A 2AB6A 1SYXA 3C73A 5A4VA 4G10A 3VWXA 2J9HA 5GAND 1NM3A 2KLXA 5ECIB 3QD9A 4IBPA 2GSRA 1BJXA 1I5GA 2CV4A 3LGCA 1OC8A 6GSTA 3M8NA 1SJIA 2H0IA 4NV5A 3UARA 3D4TA 4J2FA 1FHEA 3VWWA 5J5NA 2XPEA 3A5WA 4GSTA 3F0IA 5IQYA 4WF5A 1X9SB 3F6DA 2NDOA 2VIMA 4MPFA 3L4NA 1V2AA 1EOGA 5B6NA 1T3BA 4OO4A 2VM1A 3BCKA 3VURA 5IMCA 3FYGA 1XW6A 2VM2A 1YF1A 3RHCA 3R2QA 3I6AA 4JZQA 3TJJA 5KN3A 2LKUA 2HSYA 4G2EA 2LRCA 4EO3A 4J57E 3GSSA 1X0RA 1M9BA 2LEGA 1SK1A 2C3TA 4I8BA 4L5LA 2LQOA 2LUSA 3LG6A 2H19A 4MK3A 2ES7A 2WB9A 1HD2A 1CQHA 2FWEA 5DQYA 5ID2A 4DEJA 2H0GA 4LA1A 3ZLPA 4Q5QA 3TJGA 3FK8A 2A2RA 3KM6A 2V1MA 1AC1A 5D9TA 4O92A 5H5QA 2XBIA 4POLA 3ZIVA 1DUGA 2M72A 4YH2A 1XBSA 1Z9HA 2CZ2A 3P7XA 3N5OA 2HYXA 4BA7A 1AIUA 4N10A 2VUPA 1YKAA 5G5EA 2A4VA 3G7IA 5ECLB 4K6XA 2YWIA 3FW2A 5DAKB 1T4YA 4MZCA 2FY6A 4HJ2A 4V2MA 1A0RP 1TRVA 2VCVA 1JZDA 1MDKA 1OYJA 1EP8A 5G5FA 1YEXA 4JU5A 5EY6A 5E4WA 3CRTA 4WF4A 3QCPA 4RUVA 4TR0A 4ZL9A 2OBIA 3IR4A 3A3TA 4HEA2 2EIOA 2J23A 5KN0A 1BX9A 3H79A 1K3YA 3GX0A 4IJIA 5ECQB 4FIWA 5D9WA 2BJXA 4F0CA 3RDWA 2VL2C 3ZL5A 2LJRA 3ERWA 2CZ3A 2GZYA 2V41A 3IK7A 4TRXA 2PWJA 3APSA 9GSSA 4IKHA 4PURA 3FHKA 3CSIA 2H76A 2R37A 1O85A 4ML6A 1S3DA 2IMKA 4GF0A 3HJMA 2H30A 1WPIA 2FA8A 2REMA 3CMIA 2QC7A 1R5AA 2B6MA 2N5BA 19GSA 1MDIA 4TXOB 1GSEA 3GH9A 3EWLA 4TW5A 4NWYA 3APOA 1LJRA 2BMXA 4KCEA 3FY7A 5KN2A 3UVTA 2RLIA 3GTUA 4BL7A 3E0UA 1ILOA 4MJAA 3F6FA 2NBSA 2CA8A 2GT5A 3IRAA 3F63A 1ERWA 4IGJA 5ECMB 5DCGA 4CDOA 4KE3A 1G0TA 3F9UA 4POKA 4XRDA 2AHEA 4L8EA 1Z3EA 2O87A 1WMJA 1M2BA 4LL4B 1TI1A 2C0EA 2CT6A 1GSDA 5CREA 3QAVA 5AIXA 3FR6A 1KEBA 2F8AA 1SL1B 2JACA 1MEKA 1E6BA 2JZSA 4EVMA 4OFNA 1K0AA 1PQNA 4CW9A 2XPDA 3QFBC 2FHEA 1O81A 5F0GA 4AJ6A 3BD2A 2NPBA 4PNGA 4PNFA 4KB3A 1FW1A 1TRSA 2DIZA 1GTBA 4O7HA 2YANA 1M2DA 2PVQA 4OCFA 3HJPA 2I3YA 4X0XA 4XHMA 4L5OA 4IHUA 1DE2A 5B8AA 1K0MA 2YNXA 4PQ1A 4X1UA 4V1Ap 2IFQB 1TJDA 1YJ6A 1GSSA 3UVHA 2KUCA 3TRXA 2PBJA 3DKSA 1QMVA 4EDYA 4TVEA 1PGTA 2DJ0A 2LNSA 2DJJA 3WD6A 3H93A 3E3EA 1EEJA 3KJYA 5CRHA 4RQRA 2PPTA 2DMMA 2FD3A 3HVSA 2WCIA 1IYHA 2VOCA 2KOKA 1OC9B 5FHIA 3HKRA 5JWOB 3MNGA 1M9AA 5HQPA 4NXIA 4HS1A 3FR9A 2FWGA 1GSYA 2C80A 4QL7A 1NW2A 1SYRA 3C1RA 3W8SA 1WE0A 2CVKA 1T1VA 3RPPA 4WXTA 3DIEA 1FVKA 2YCDA 4G19A 3LXTA 2P31A 5B6MA 3PR8A 5G31A 2IMIA 1GSUA 3UOMA 3O3TA 1JFUA 2D2ZA 2OE1A 3ERFA 2H6XA 2H0HA 3FRCA 5ECKB 1O7UA 2XBQA 3MSZA 2H1GA 5AISA 2C3QA 2YOIA 1GLQA 4BPYA 3DMLA 3EVIA 1TXXA 5HFGA 1QK8A 2LV3A 1KTEA 2EIQA 4IVFA 3FZAA 1SD8A 3K8NA 2N5AA 1TOFA 2HE3A 4JEDA 4D73B 1X9MB 2VCXA 3KIJA 3TRPA 5CP1A 3IE3A 4I2UA 1GWCA 5DDLA 4DSSB 2LRTA 3O6TA 1XWBA 1A2JA 2DJ1A 4BWSA 3EMXA 1OE7A 3IV4A 3UMAA 4AJ8A 1XCCA 2LSTA 3LEFA 3PGTA 4X43A 3L9SA 3HCZA 7GSSA 3VLNA 2MZCA 4EXJA 2YWMA 2VLVA 4K0GA 5IOXA 1SK0A 1U88A 3VPTA 18GSA 1HQOA 2H73A 2N5FA 3IOSA 3CSHA 1B9XC 3P90A 1V98A 2OBKA 4YAPA 3HDCA 1S3CA 4N0ZA 3KD0A 1N8JA 3D21A 3A2WA 4IW9A 3GIXA 2K8VA 1W4VA 3H8QA 2GT6A 3UIWA 2YP6A 3FZ4A 1B4PA 1K0NA 4JRRA 4JR6A 5ABRA 2JSZA 22GSA 2P5RA 3FR3A 2IPAA 2O8VB 4F82A 5CYYA 5F07A 1YDKA 3LYPA 2HZEA 3U6VA 3US3A 3TJKA 5IMVA 5HR2A 4IQAA 4IS0A 5CAXA 4ID0A 2MBSA 4EDZA 4KGIA 1M0UA 3BOAA 6GSWA 2JZTA 1O73A 3G9BA 2I81A 1ZOFA 2I9HA 3G7YA 2VAFA 4ZB6A 1HNCA 3ZIJA 3DEXA 4XS4B 1X9WB 1M7TA 1H75A 1B8XA 4CHSA 4MF5A 3MWHA 3EINA 4ZIJA 4GCIA 2IWTA 3QDNA 4F2IA 2ZCTA 1BYEA 2RIIA 1AQVA 1XOAA 1XW9A 1PX6A 5F06A 1THOA 3ZREA 3Q6OA 3TB2A 2IMEA 1T7PB 3TKRA 3C71A 1TKDB 3W8JA 3CXGA 1JZWA 1DE1A 3JCML 4YQVA 2ZUPA 5A5KA 2H1AA 3GL3A 1XW5A 5EPFA 1OC3A 1QQ2A 5GSSA 2O85A 4PUFC 1BAYA 5D93A 4RI6A 3NZNA 3ZRDA 3BJ5A 4K2DA 4HQZA 1K0CA 14GSA 1N2AA 3TKSC 2WRTA 2GQKA 1YKCA 3F8UA 1AQWA 3QAGA 4JBBA 3VWVA 2ON5A 4N30A 5A4UA 2VD0A 2VO4A 1ZZYA 4V1Ag 1X5CA 3HZ4A 2F51A 2MMOA 4IJ3A 2CVBA 4WR4A 2VD1A 4TR3A 1HNBA 5ELAA 5DQSA 2CX3A 1OE8A 1SENA 1VF3A 2JZRA 4KDXA 5DCHA 10GSA 5CO3A 5HR1A 1G7OA 3UAPA 3VI5A 2GSQA 4YQUA 2KP2A 4IP6A 2WDUA 1SKWB 3KTLA 5F05A 2GDRA 4NAXA 4I6XA 4ECIA 1E2YA 3EE2A 2VCZA 1LU4A 1K0OA 3LSZA 3CRUA 3KXOA 1UA5A 3HVXA 1JLVA 4Q5NA 1SK2A 1GSQA 5DBQA 4HZ4A 1R4WA 3TKPA 4E8EA 3ED3A 1G7EA 1ZYQB 1BG5A 1GNWA 5INYA 4BWQA 1B48A 1B4QA 4TR4A 1J0FA 4IN0A 3HJOA 5DAKA 2IL3A 1PD21 1K0DA 2XHFA 5C04A 3ZFLA 4AJ7A 1JHBA 2H1DA 2C0DA 4K9ZA 5JWQB 3RAZA 4HOJA 2X8CA 5IPHA 2H6YA 4MDCA 5H5RA 1TRUA 4MH3A 4MJBA 3MDKA 4O32A 1M99A 2X8HA 4IQ1A 2DJKA 2R4VA 1EWXA 1R7HA 2AYTA 3D5JA 3F4SA 4GQCA 5IMAA 3ZYWA 1M2AA 4RI7A 5DJLA 3NIVA 2B5YA 1U87A 4WEYA 3TKSE 4K8MA 4KUNA 4ZILA 2OE3A 1FO5A 2NVLA 4HJMA 3IHQA 5KN1A 4KSOA 5GZZB 2FNOA 2DIYA 4TXOA 2GTUA 4MA9A 2L59A 1S3AA 2WJUA 2YZUA 1HYUA 1GTIA 3D0ZA 3LFLA 3ME8A 2L6DA 4IELA 3L9UA 1XPVA 4O5RA 2K9FA 3GSTA 1WIKA 2TIRA 4KDYA 1TK0B 5ENUA 3KTBA 3HA9A 4G9HA 3GA4A 4OCEA 2JL4A 2HNLA 3GX8A 1TDIA 3L9VA 1PKZA 1MDJA 1FAAA 4IP1A 2H01A 3DWVA 2B5EA 3EU3A 5ECNB 2YWNA 3EURA 2DJ2A 1YF0A 5ELGA 1PA3A 4EE0A 4FYCA 5D96A 1XIYA 1EGRA 4K7NA 2YPMA 3LQ7A 2JADA 1BQ7A 2DC5A 3VI7A 1GP1A 1ERVA 3DVWA 2B5XA 4ECJA 2HXKA 3TJBA 1EOHA 2MBTA 2WGRA 1TU7A 4TR1B 2OACA 1AAZA 5IO0A 2LNTA 3DD3A 1X5DA 5GSTA 4HUAA 2GZZA 3KH7A 2HRFA 2B3SA 4HZ2A 1EGOA 5J9CA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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