2CT6A

Solution structure of the sh3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
GSSGSSGMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNVPPEKKPTQGNPLPPQIFNGDRYCGDYDSFFESKESNTVFSFLGLKSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title solution structure of the sh3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Homo sapiens
molecule keywords sh3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2
total genus 24
structure length 111
sequence length 111
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ct6A00
4AF2A 5HR1A 4MF7A 3FZAA 1O8XA 2YWIA 1GNEA 3IC4A 2DJ0A 3A5WA 2AUVA 4HZ2A 1IYHA 5JWOB 2CT6A 5DVBA 1XWBA 4IELA 4MLYA 1N2AA 2L6DA 1G6WA 1JFUA 2B1LA 3ZTLA 1NHOA 4L5LA 2OE1A 3KH7A 2HZEB 3GA4A 2C80A 1W4VA 3C1SA 6GSSA 3IBHA 2TRCP 2TIRA 3VWWA 5J4UA 2GZZA 3G7YA 3H93A 5JCUA 5HFIA 5CRWA 6GSUA 1XOAA 2HLSA 1SL1B 2YJ7A 4O5RA 3E9JB 4IP1A 4G2EA 4K7OA 4HJMA 4ZL7A 1TKDB 1FHEA 5B8AA 4KSOA 4RQXA 4K0NA 3VPQA 5F06A 1ZZYA 3VPTA 2JL4A 4DVCA 4PNFA 5ENUA 3EU3A 2PU9C 4IBPA 2NPBA 1T1VA 1BYEA 4IQ1A 3UIWA 5J5NA 1HD2A 5JWQB 1SJ6A 1T8EB 5ECIB 3E3EA 2VLVA 4FYBA 4J56E 5G5FA 4HU9A 4WETA 4F0BA 2PN8A 3IHQA 3FR6A 3WGDA 2L4QA 4JBBA 2JSYA 1MDKA 1PD21 3IXRA 1U3AA 3LYPA 2OE0A 1FVKA 4MZWA 4ZB9A 1XZOA 4AGSA 3FY7A 1EEMA 4TXVA 5IO0A 4PXOA 1OE7A 3BOAA 4IQAA 2E2MA 3DGQA 5B6NA 3RPNA 2B1KA 2BJXA 2C0EA 1K3OA 1QQ2A 2LNSA 2OACA 2O89A 3Q6OA 3RPPA 4WXTA 4X0XA 3Q19A 3TKQA 1K0CA 3QMXA 2OE3A 5J9BA 22GSA 2GTUA 5HQPA 3ED3A 2CV4A 1ERUA 2PBJA 1HQOA 2PERA 3GX8A 3GL5A 4NHZA 4XRAA 1YF0A 4WF5A 2QKEA 2ZNMA 2WFCA 2LJAA 3QOUA 5G1LA 3ZZXA 1EEJA 3PINA 3WD6A 1XPVA 4YQMA 3S9FA 5ECMB 1EGRA 4HU7A 3ZRDA 1TXXA 3ZREA 2R2JA 3F4SA 2B5EA 1YKCA 1G6YA 2GSRA 3QPMA 3APOA 2M72A 4MDCA 3P90A 3BCKA 1PQNA 4ML6A 2JU5A 1KBNA 5HR3A 2H6XA 5DAKA 4WKWA 5AGYA 3KZQA 3CBUA 1XOBA 3TUEA 1UA5A 1OAZA 1X9MB 2LJKA 1U88A 2H19A 2H0HA 3NZNA 3FKFA 1YY7A 1T4ZA 2WJUA 1F37A 2H01A 1TI3A 1G7EA 2X99A 5H5QA 1GSFA 4KB3A 4OWYA 1ML6A 2F51A 5IOWA 1ZMAA 4X1UA 1SKSB 1EGOA 5F05A 2CVDA 1XFLA 2WZ9A 2CX3A 3PR8A 5JCWA 2FNOA 4O92A 5DQYA 2IJYA 2XPDA 3U6VA 2J23A 2PPTA 3GSSA 1IYIA 1BEDA 3CSIA 3ZFBA 4I2UA 3M9JA 5E4WA 1WPIA 3GFKA 3UVTA 1RQMA 3QFAC 1Z7RA 4KNDA 1DE1A 6GSVA 3VI7A 2HXKA 1X5CA 1A8YA 1GSUA 4FO5A 3VLNA 4IKHA 2DSAA 1EWXA 1YEXA 2AB6A 2VL3A 3QFBC 1PN9A 3E0UA 4Q5RA 4EXJA 4Q5QA 4V2NA 5CRHA 3HZ4A 4IW9A 4QL7A 1M2BA 5H5SA 1BAYA 5HR2A 5CRGA 5B7CA 2TRXA 3FYGA 2VM2A 2N5BA 3KEBA 3UBKA 1EV4A 5DALA 1AAZA 2RM6A 3QCPA 4XS4A 2H74A 4KA0A 3GHAA 2L5OA 1AQVA 3EURA 2C3NA 2YV9A 3CSJA 16GSA 2DLXA 2H75A 1AIUA 3GKKA 3GH6A 5E59A 2WULA 3D4TA 3L9SA 2H6YA 4GF0A 3UOMA 4EO3A 3WYWA 2F9SA 3GTUB 2YWMA 3D5JA 7GSSA 2X8GA 3M0FA 5GAND 3EMXA 4DSRA 1O85A 1VF4A 5INYA 2DMLA 2IMIA 4CDOA 4I6XA 2V2GA 3KP8A 17GSA 2X8HA 5HR0A 4WR5A 3TRQA 1A23A 5KN3A 3IAM2 2YWOA 2GQLA 2QC7A 2X64A 2MBSA 4WF4A 1KEBA 2YV7A 2CQ9A 4XCSA 1CQGA 3FW2A 1BX9A 1SYXA 5IMVA 5IIZA 1OYJA 4XTSA 1F6MC 2A2RA 1I9DA 1LBKA 1TP9A 4MF6A 3O76A 1B4QA 5A4VA 4YAVA 3ZMLA 1M9AA 1V2AA 4MJBA 2VL2C 3TKSE 3KM6A 4IJIA 3HZ8A 2WCIA 4XS6A 5DAKB 1GSDA 1C72A 2AAWA 1RW1A 1Z7PA 1Z5YE 2GT6A 1OC9A 3H1NA 3UARA 1JZDA 3DYRA 1VRSD 2MMAA 3WGEA 1X9SB 4HQZA 2IPAA 2EIOA 3D0ZA 4PUFC 4POBA 1WE0A 1MTCA 3UAPA 2XBIA 3R2QA 3TKRA 1PMTA 3CMIA 3HYPA 5J41A 3ME7A 2C1YA 4RUVA 2BMXA 4L0WA 4KW6A 1SL2B 4IJ3A 1SK2A 4J57E 2LQQA 4KE3A 4AJ6A 1NW2A 1SKRB 3HJMA 5CO3A 5F07A 3TJGA 1OKTA 4ECJA 1U3IA 2EC4A 3CSHA 2YNXA 3KTBA 4L5OA 5G2ZA 5ECQB 1B4PA 3DVXA 4BVXA 1A2LA 3FRCA 1ABAA 2H30A 1SU9A 2R37A 5F8BA 5EY6A 3GL3A 3ZVJA 1MEKA 3A3TA 3VWUA 1XW5A 2C3TA 3QAWA 3KIJA 4BL7A 2KP1A 1ON4A 1FO5A 5DALB 4XS4B 3P7XA 4K7NA 2GSQA 2L57A 5HFKA 5CP1A 4JEDA 3TOTA 3ERGA 3C7MA 2DIYA 3BJ5A 2H8LA 1EZKA 2R5GA 2VL9A 4JR6A 1Y25A 2H73A 5CNWA 1GLPA 5JWRB 4YH2A 5CAXA 2GVPA 2YANA 4ML1A 2RUFA 1BG5A 3EU4A 1O81A 2R3XA 3L4NA 5EPFA 1VF1A 1LU4A 5CRDA 2V41A 5IMDA 2ALBA 1SL0B 1RK4A 1H4OA 2FUG2 2B5XA 2GZPA 5C00A 1XW6A 3ZLPA 1U6TA 1FB6A 4PNGA 2YZHA 2M80A 1J9BA 3QD9A 1ST9A 3F3RA 5FHIA 3L9VA 4PQHA 2A2SA 2OJLA 4MP4A 5B6MA 3ZVJD 1GSQA 1TOFA 3M3MA 4EDYA 3GMFA 2C8UA 5A4WA 4NPBA 1WWJA 2KOKA 2RUEA 3F9UA 1S3DA 2B7JA 5ECRB 3JCML 1A8LA 3BD2A 3A2XA 3GIXA 4FIWA 3NOFA 2YP6A 1OC3A 3FEUA 3GURA 3HY2A 4MMMA 1OC9B 3IDVA 3FZ4A 1WMJA 1SK0A 2LNTA 1WOUA 3KP9A 3M9KA 2CA8A 4XS1A 1XXUA 1PX6A 2WGRA 1TU8A 5LD0A 3VURA 4ZL8A 4PGTA 4I5QA 4TR1B 2DC5A 3RAZA 3TKSC 3HVSA 3EE2A 3APQA 1XVWA 1YZXA 1G7OA 4PX1A 4OCFA 2JADA 5ECKB 1HNAA 1HYUA 1ZGNA 8GSSA 1SK1A 2HRNA 4ZL9A 1XWAA 3AY8A 1FG4A 2H72A 4L0UA 1GLQA 4OO4A 2DJKA 3I69A 4ULXA 2LTKA 3DVWA 1O73A 4EUYA 4ISDA 1ERWA 2KHPA 5ELAA 1M7TA 4NV2A 5KN1A 1B48A 2HSYA 4WR4A 3A2WA 3IRAA 4DSSA 5GAPD 1A2MA 2VOCA 2DBCA 2CVKA 1ZYQB 2O7KA 4YAPA 5GSTA 5A4UA 5ID2A 2CAQA 1SYRA 4KAEA 3VFIA 1S3CA 4E8HA 1GWCA 3US3A 5D93A 4OO5A 3CRUA 3HJOA 2I1UA 3FZ9A 5A5KA 1M0UA 1DE2A 4I2TA 4X43A 2QSIA 2GZYA 4NXIA 2XBQA 2QGVA 3UBLA 2YOIA 2P5QA 4XIHA 1T00A 2Z9SA 3ZYWA 3EYTA 3EC3A 3M8NA 1KNGA 4MH2A 3MWHA 2VD0A 4EKZA 1JZOA 5ELGA 2PUKC 1F3BA 2CZ3A 3QAVA 4OCEA 1MDJA 5AIXA 1AXDA 2OBIA 2PGTA 3GX0A 2LRCA 1GSYA 1WP0A 4XHMA 4TVEA 4N0ZA 2LQOA 4OD7A 4RI7A 1K0OA 3Q74A 1ZCPA 4K0GA 2CAIA 3HA9A 4V1Ag 4JE1A 1X5EA 1Z6NA 5ECOB 2MZCA 4EL1A 1NHYA 4TR3A 3F8UA 2AHEA 4GTUA 1A24A 2C0DA 1DUGA 5EVOA 2GT5A 5CREA 2HE3A 4JU5A 4TR0A 4HEA2 4DSQA 2D2ZA 4FYCA 2YZUA 3C71A 4GLTA 4IN0A 12GSA 4BWSA 11GSA 4Z7XA 2I4AA 2GDRA 4H86A 1XW9A 2H1DA 3ZIJA 2X8CA 2H0GA 3TKSA 5D9TA 2OBKA 3LGCA 3MNGA 1AUCA 1A2JA 3KJYA 4I8BA 1O6JA 1XBSA 3J7Yk 1GUKA 1PGTA 3TJKA 1K3LA 1PRXA 4F82A 3TOUA 2IWTA 3ME8A 4YQVA 4LMWA 4HQSA 3L0HA 2ES7A 1THOA 4K1FA 4Q5FA 2MMOA 1K0MA 4KUNA 3GRXA 5AN1A 1O7UA 3MAKA 1Q98A 3CRTA 3TCOA 2K18A 1XIYA 2VD1A 4MK3A 2IN3A 3U5RE 4DSSB 2DJ2A 5JCGA 4ZB6A 5C04A 5IO2A 2B7KA 3BBYA 2CX4A 3K8NA 3L78A 1TU7A 3GSTA 4MPFA 4GQCA 2FY6A 4GQFA 2JZSA 2H71A 3ERWA 2DJ3A 1PX7A 1TRVA 2V6KA 1XWGA 4J2FA 3VK9A 3KMNA 2GQKA 5KN0A 2H66A 3CTFA 4GRFA 3BCIA 3F4RA 4AJ8A 3TJJA 4PQIA 4ZILA 4RQRA 4LL1B 3PH9A 2KLXA 3G7IA 3CYNA 2JZRA 2FWHA 4K6XA 2WDUA 2WS2A 1HNBA 1XVQA 3HKRA 5G1KA 1XCCA 1J08A 6GSYA 4ECCA 2R6KA 1FVJA 3WT1A 1K0AA 3OR5A 3GN3A 2LS5A 4LMVA 4HUAA 1PSQA 4MZCA 5IMCA 3FR3A 2HZEA 2HSHA 3P2AA 2LRNA 3DRNA 3D4MA 1B8XA 1V57A 1FB0A 3GKMA 2VCWA 5AISA 3Q18A 5G30A 1GSSA 1Z3EA 4MH3A 3IPZA 2I81A 4POKA 5IM9A 3KH9A 2F8AA 3PGTA 5G31A 1PL1A 1M9BA 5COHA 1TK8B 2CZ2A 1QUWA 1SD8A 1W89A 3IOSA 4NWYA 3I43A 5DBQA 2FWGA 5FT3A 5CYYA 2EIQA 4LL4B 3HCZA 4CHSA 5D9XA 4EF0A 3HDCA 1GH2A 1EP7A 2HFDA 2B5YA 4KH7A 3IAS2 4TN8A 3QDNA 5IOXA 2F8FA 4ECIA 1EOGA 3C8EA 1JZRA 1G0TA 4TRXA 4TXOA 3P8WA 2H70A 1JZWA 4IVFA 2I3YA 1V40A 5ECHB 4MPGA 1JHBA 1T7PB 1H75A 2H1AA 4G19A 2LSTA 3GKNA 5DJLA 4O32A 2VLUA 3H4KA 3UL3A 1SENA 3F6DA 3EWLA 4IS0A 2IMEA 3W8JA 2PMTA 4TW5A 6GSXA 4OMVA 1ZOFA 2K8VA 3DKSA 5DCGA 3F6FA 5LCZA 1BQ7A 3SBCA 4ZXGA 4POLA 4GSTA 1YEPA 2GS3A 2DJJA 3DEXA 2ZCTA 2VIMA 3I9V2 2M46A 2L6CA 2FLSA 4D73A 2PVOC 1R5PA 3RHCA 1UC7A 3CTGA 2P31A 2VL2A 1QGVA 4EC0A 2I9HA 1BJXA 4TR4A 5G5EA 1AQWA 1GUMA 4Q5NA 4KDXA 3GKXA 2C3QA 4K2DA 3RBTA 3RDWA 3GYKA 4ACSA 14GSA 1ILOA 2IMFA 1LJRA 3D6IA 3W6GA 4P3YB 2VCZA 3EVIA 1QMVA 4HS1A 3IE3A 2H76A 4FYUA 4K9ZA 5IPHA 3V1WA 3WGXA 3G9BA 1X9WB 2KP2A 1T3BA 3KTLA 5F0GA 2VM1A 1R7HA 1AW9A 5L71A 3VWVA 1YKAA 2E0QA 4E8EA 3HD5A 4N0VA 3FZ5A 1NM3A 4WBRD 2VUPA 2HRFA 4KCEA 20GSA 3TJFA 3ERFA 1ERTA 4F9ZA 1Y6EA 1GTAA 3LQ7A 1EOHA 3RHBA 1WJKA 2IMDA 1VF3A 5DDLA 3APSA 4GCIA 2JSZA 2L59A 1A0RP 2HZFA 2FA8A 4JR4A 2A4VA 4K7IA 1M2AA 1GTIA 1R5AA 3LORA 2FWFA 1JLVA 1YQ1A 2DJ1A 3H79A 5ECLB 2IMKA 1GUHA 2AV4A 4MABA 1O8WA 3D21A 5IMFA 2N5AA 1KTEA 1DBYA 1MD4A 2K8SA 2LUSA 3TJBA 4JZQA 4V2MA 1UN2A 2G2QA 4EVMA 1XWKA 1URMA 4TXOB 4F0CA 1B9YC 2AJQB 3H8QA 4NHWA 4MA9A 3UVHA 4XRDA 3C73A 2ZUPA 3QAGA 3GTUA 2E7PA 3L9UA 3VWXA 4EE0A 1F2EA 1USBA 3TDGA 6GSWA 2K9FA 4KX4A 3GUSA 2XC2A 1UVZA 2C0FA 3G7JA 4I97A 5J9CA 4V1Ap 1ACVA 4GSSA 3UEMA 3ZIVA 3EINA 1PA3A 4QL9A 1K0NA 2H1GA 1F3AA 3WT2A 2L5LA 4ID0A 2XHFA 2R4VA 4LLRA 2AYTA 3ZL5A 1GNWA 3NIVA 2IL3A 3TKPA 1DSBA 5LNKe 4ZB8A 1K0DA 2HNLA 5ECPB 3ISOA 2HYXA 1V58A 4NMUA 3IK7A 2JACA 5KEJA 4D73B 2H6ZA 2J9HA 3LJRA 3TB2A 2ON5A 4KGIA 2NDOA 2MMNA 1FAAA 5AIVA 1PKWA 1S3AA 5D96A 1M99A 4OFNA 2FD3A 3LXZA 4BA7A 1GTBA 3UMAA 1JLWA 5IMZA 1V98A 2JZTA 3GH9A 3KCMA 4WBJA 1XWCA 1CQHA 2E2GA 2DIZA 2VLTA 4PURA 4GWRA 1OE8A 4FH8A 3HHVA 4MJCA 1NSWA 3SWLA 1GULA 4BPYA 3LSZA 1A0FA 1QFNA 1X5DA 4MZBA 3GNJA 1U87A 5DJMA 3I6AA 1TRWA 3IR4A 3DIEA 1OC8A 2IFQA 4BWQA 3UJ1A 2YN1A 3HXSA 2KUCA 2O85A 1J0FA 5IQYA 5H5RA 3CXGA 2H0IA 1TRSA 1VF2A 4ECBA 4NV5A 4IGJA 1PKZA 1OKDA 1X0RA 2MBTA 3N9JA 2LJRA 4KDYA 4TOPA 3LWAA 4HJ2A 2VO4A 2LV3A 4POMA 1GP1A 1Z6MA 3LXTA 1ERVA 2O87A 2B6MA 4N30A 4ILFA 3N5OA 5KN2A 2FA4A 4O7HA 3F0IA 2DMMA 2V6OA 4PQ1A 2VCVA 5D8IA 1OVNA 2YWNA 3DD3A 4IHUA 4LA1A 1YJ6A 1K3YA 3J7Yb 1MDIA 4L8EA 3F4TA 4KCAA 3F3QA 2ON7A 2NBSA 1N8JA 5FWGA 2WB9A 2F3MA 3HJPA 4G10A 4MJEA 5ID2B 1F9MA 3KXOA 4ZBBA 2HI7A 1FW1A 3GV1A 2GSSA 1V9WA 3KGKA 1GRXA 2LRTA 5GZZB 2OADA 2LEGA 1GL8A 4ZBAA 2PVQA 2YJHA 2MYGA 2K6VA 10GSA 1EV9A 1QXHA 2OKAA 4F2IA 4MCUA 4CW9A 4ZIJA 2C0GA 3IK9A 3D22A 4ZBDA 4KSMA 1M2DA 2FCHA 4TKYA 1B9XC 2RIIA 3DXBA 2LKUA 4GSNA 5ECNB 4G9HA 19GSA 3ZITA 1SD9A 5EL8A 3FHKA 3EMPA 5J3RA 3M1GA 1Q4JA 2V1MA 1TTZA 2VCQA 2N5FA 2RLIA 1VGLA 3LFLA 4N11A 2VAFA 2MMZA 3IA1A 1THXA 2L4CA 4RI6A 5GSSA 2XPEA 1SJZA 2P5RA 2NTOA 1YDKA 4WEYA 1ZYEA 18GSA 1EP8A 1R4WA 2O8VB 4YQUA 4K8MA 2VCXA 3LEFA 1WIKA 2NVLA 3KMOA 3W8SA 1TK0B 3MDKA 4IP6A 1TJDA 1QK8A 3ZMKA 1R26A 3LYKA 1PL2A 1E2YA 3KD0A 4V2LA 5D9WA 3QR6A 3TRPA 3TGZA 2GLRA 4TR1A 2IFQB 2OA7A 4PUAA 5D73A 3HVVA 2FGXA 6GSTA 1MD3A 13GSA 2V32A 4JRRA 1AQXA 1TK5B 2REMA 5B8BA 5DCHA 2B3SA 5ABRA 4EDZA 4F03A 2GSTA 9GSSA 3FK8A 1Z9HA 3DWVA 2YCDA 4BVYA 4NAXA 2VCTA 4HDEA 5IMAA 4GXZA 2BTOT 2G0FA 3FR9A 1FOVA 3DMLA 1GSEA 1SJIA 2GQMA 1AC1A 3TRXA 2IIYA 5D9VA 4HI7A 3O3TA 2P0GA 1TI1A 2FWEA 3IV4A 4N10A 4KDUA 4DEJA 3A2VA 4AJ7A 1K0BA 2RM5A 2EIRA 1TRUA 2PWJA 3VI5A 1WRYA 3LG6A 2CVBA 4QQ7A 3O6TA 5DQSA 2FHEA 1TDIA 5ECSA 2GGTA 5HFGA 3C1RA 1E6BA 2HT9A 4OFTA 1ZL9A 1HNCA 4HZ4A 1SKWB 1TW9A 1T4YA 4MF5A 1YF1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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