2PPT | Genus

Total Genus 39

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	39
sequence length	149
structure length	149
Chain Sequence	MMGAKMAESLRLTCLACGQANKVPSDRLAAGPKCGICGAGLITGKVAGIDPAILARAERDDLPLLVDFWAPWCGPCRQMAPQFQAAAATLAGQVRLAKIDTQAHPAVAGRHRIQGIPAFILFHKGRELARAAGARPASELVGFVRGKLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Rhodobacter capsulatus
publication title	Crystal Structure of thioredoxin-2 rcsb
molecule keywords	thioredoxin-2
total genus	39
structure length	149
sequence length	149
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date	2007-04-30

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.20.28.140	Mainly Beta	Single Sheet	Rubrerythrin, domain 2	Rubrerythrin, domain 2	2pptA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2pptA02

4KAEA 3CSIA 3KJYA 1N8JA 3G7JA 3E0UA 1SJ6A 1S3AA 1K3OA 2C0EA 4JU5A 1YEPA 1K0AA 2FGXA 3VFIA 1I9DA 1O6JA 3KXOA 2FCHA 2YNXA 1Q98A 5FT3A 1FOVA 2AB6A 3HDCA 2IWTA 4DSSB 4K8MA 5IQYA 2GVPA 1W4VA 3ME8A 1XZOA 4IN0A 5FHIA 2GSSA 1VF1A 1R26A 3F3RA 3C1RA 3FRCA 5KN2A 2VCZA 4MJAA 4FO5A 2HSHA 1X5EA 4RUVA 3IOSA 4HJ2A 4HS1A 1DBYA 1ERVA 2B5XA 3TJKA 2OKAA 3H1NA 3F4RA 2OACA 4KW6A 4ZXGA 1VF4A 1BQ7A 4MP4A 3BCKA 4MABA 1G0TA 4O7HA 2BJXA 4ZB8A 3FK8A 1PKZA 4GLTA 2DJ0A 5CP1A 2M46A 3Q6OA 4OFMA 3TRPA 2XPEA 5IOWA 1O73A 2IJYA 1WIKA 3BOAA 2CV4A 4BWQA 1XOAA 4G9HA 4KSOA 3LQ7A 2H19A 2GDRA 5COHA 5IO0A 2BTOT 2MMAA 2MBTA 3BBYA 3P2AA 1FW1A 1G7OA 5CRGA 4I5QA 4L0UA 2GS3A 1XW5A 5HR1A 5KN3A 2WULA 2KUCA 4TN8A 3APQA 3P8WA 4JRRA 2X8CA 5KN1A 2VCVA 3BCIA 1OE7A 5G5EA 2VM1A 3ED3A 2JSZA 2KLXA 5F8BA 1GSUA 4L5LA 1SENA 2DIYA 3LYKA 4POKA 4ZL9A 1YY7A 1EOGA 3CMIA 2XPDA 1OAZA 4J56E 3WT1A 1USBA 1SL2B 3UVHA 3KM6A 4IQAA 2RLIA 2C0FA 4GF0A 1XVWA 1KTEA 4EF0A 1F3BA 4KA0A 1T00A 1DUGA 1A8YA 5D96A 4YQMA 4TRXA 4F0BA 5IPHA 1T4ZA 2K6VA 5ELAA 1PX7A 5EY6A 2B7JA 2R2JA 4YQUA 2B1LA 2GSQA 2KP2A 6GSXA 2QC7A 2KHPA 4EXJA 1KBNA 1T3BA 3IAS2 4ZL7A 1K0MA 3FKFA 5ABRA 2H75A 3UARA 3FR3A 4D73A 3P7XA 1F6MC 1TTZA 1ERWA 3QPMA 1SKRB 1UC7A 2PBJA 3VWVA 2WDUA 3DKSA 3ERWA 2L6DA 4JR4A 4NPBA 2I9HA 4XIHA 2CA8A 1AC1A 3N9JA 2IN3A 2AAWA 2VOCA 2C80A 3TKSE 2PMTA 5CRHA 3I9V2 2HYXA 3GSSA 5IMZA 1V58A 2EIOA 1K0OA 5KEJA 2ES7A 3ZZXA 4MJEA 4BVXA 1MDKA 4MF7A 4NV2A 4TR3A 1UVZA 4KDXA 3FZ5A 2M72A 3IE3A 4K9ZA 3LWAA 2HZEA 3EMXA 1XBSA 3IDVA 2L57A 2FA8A 1QQ2A 4DEJA 1TI3A 2H1DA 3HJOA 5B6NA 2WJUA 5B8AA 6GSSA 1YKAA 1XCCA 1FHEA 2D2ZA 14GSA 20GSA 2VLVA 1AQVA 4GCIA 3NOFA 1PQNA 3VURA 2RUFA 5CYYA 5GSTA 4ECCA 1ABAA 1QGVA 3GYKA 3G7YA 2PN8A 1OC9B 9GSSA 1O8WA 3UAPA 3F6FA 1M2AA 2VD1A 3NIVA 2KP1A 2HXKA 1OE8A 1O7UA 1M2BA 1OC8A 3P90A 5AIXA 1AQWA 5LNKe 1FVJA 1PL2A 4KCEA 1ZMAA 3VWUA 4DVCA 1TOFA 1X9SB 2R5GA 3GIXA 3H8QA 3KZQA 2XC2A 1WWJA 4EUYA 2VL9A 1GUMA 4ECJA 1RQMA 4ML6A 5HFKA 2PPTA 4F0CA 3HVVA 3W8JA 4HQSA 4QL7A 4AJ7A 2OBIA 3LXTA 2CT6A 2OJLA 3VI5A 5IO2A 2QSIA 5DCGA 2A2SA 3LXZA 1M7TA 1TP9A 3HJMA 1J08A 4ZL8A 4EKZA 2AYTA 3LEFA 4NHZA 5IMDA 1TRVA 3O76A 3M1GA 4I6XA 4MCUA 4MPFA 2DIZA 5ENUA 4POLA 2H1BA 3ZITA 5A5KA 3Q18A 2H73A 2QKEA 1SD8A 4ZB9A 2NDOA 5JCWA 2J9UB 3UMAA 4LA1A 6GSUA 1MDJA 3ZMLA 1A2LA 5JWRB 2LRTA 2YOIA 5DBQA 22GSA 3F63A 4TR4A 4BPYA 3CRTA 4ZB6A 2LJRA 5DCHA 3VPQA 1B9YC 1SKWB 3HZ4A 5ECRB 2GT6A 1XWGA 4PNFA 1R5AA 4IP6A 4N10A 2FA4A 2H6XA 4E8EA 1V98A 2GZZA 3IV4A 2NBSA 5IPGA 5G2ZA 4XS6A 3W8SA 4GXZA 1B9XC 4HUAA 3LYPA 3TJFA 1MD3A 1GSQA 2FWGA 5DAKB 3J7Yk 3ERGA 4JR6A 4OFTA 1X5DA 4AGSA 1ON4A 2ON5A 1B4PA 3Q74A 1WMJA 3GFKA 2CX3A 4TXOB 2IMKA 5HQPA 3DMLA 1XFLA 5G30A 5ECNB 2C3QA 2VCWA 4G19A 1WE0A 3FZ9A 1M0UA 2O8VB 2KOKA 2VUPA 3GNJA 1LU4A 3DVXA 3GKXA 4IBPA 2YWIA 2H6YA 4N0VA 1PA3A 4GRFA 1SU9A 4PQ1A 3EURA 1GWCA 1A0RP 1IYIA 1K0BA 4MA9A 3D4MA 1YZXA 2WRTA 3IR4A 3F8UA 4XS1A 1A23A 1RK4A 1T7PB 4MH2A 1XWBA 3QAWA 2O7KA 1DE1A 2CVBA 2H76A 4JBBA 3DVWA 2JZSA 2YV7A 3FY7A 3DXBA 4KDUA 3KH7A 5CREA 2O87A 2E2GA 2RM5A 4L5OA 4DSRA 1T8EB 4PNGA 2IPAA 4I97A 2MBSA 4EO3A 3D22A 4EC0A 1DE2A 3ZRDA 2K8SA 3CSHA 3E3EA 2LEGA 2F3MA 2LNSA 2JU5A 1AXDA 2B1KA 4IJ3A 1Q4JA 1F9MA 1K0DA 2CAIA 3ZVJA 2N5FA 1ILOA 3DD3A 4PGTA 5F0GA 2CVKA 3CYNA 3CTFA 4K1FA 3EU3A 2LQOA 4OO5A 2YJ7A 2X99A 3G9BA 2VIMA 2R3XA 4K7NA 1ZYEA 4F82A 4K2DA 3TUEA 1G6YA 3VLNA 4KUNA 2I3YA 4LMVA 3VWWA 2DJ2A 4GSSA 1THXA 4HI7A 2GQMA 2R6KA 2IIYA 4GTUA 1MEKA 3GX8A 4WF5A 5AGYA 1U3AA 1K0NA 1E6BA 3CBUA 4G10A 3IHQA 4G2EA 5A4WA 3EVIA 2EIRA 3GHAA 1QK8A 6GSVA 2PU9C 2GQKA 5ECSA 3D5JA 1A2JA 2WGRA 3JCML 2O85A 2PUKC 2F9SA 2X8HA 5B8BA 1GSDA 1EP8A 1GTIA 2MMNA 3QMXA 2WB9A 2L6CA 2L59A 2OE0A 5DALA 1XVQA 5DQSA 1R7HA 3TJJA 4NHWA 2I81A 3H93A 1HNBA 2VAFA 4OO4A 1M2DA 3BD2A 4V1Ap 5L71A 4XS4B 5C04A 1XWCA 2V6KA 3C71A 1GUKA 1OC9A 5D9XA 3MNGA 4I2TA 3F4SA 4IW9A 3IA1A 5ECMB 4ECIA 3GURA 1GTAA 4WR4A 4YAPA 1XW6A 5CAXA 1TRSA 4OD7A 5CNWA 2H0GA 4KCAA 4TR1A 4ZBAA 4WEYA 1SJZA 5D8IA 1K0CA 2MZCA 2E7PA 1THOA 4JEDA 1SYRA 4DSQA 2DJJA 1FAAA 3KH9A 1M99A 3D4TA 3IC4A 4OMVA 3K8NA 2VCXA 3RHCA 16GSA 1U88A 5E4WA 4F2IA 4HOJA 3FHKA 2C0GA 6GSWA 2AJQB 2C3TA 3MSZA 4ISDA 1BG5A 4ZILA 1T1VA 3IK7A 5CRDA 1SK0A 3QDNA 3W6GA 3WGXA 1ML6A 4Q5NA 1FG4A 1KNGA 3EC3A 4OCEA 4TR0A 2TIRA 2GSRA 3L9SA 1XWKA 3VI7A 5ECLB 1GRXA 3L4NA 1RW1A 4OCFA 3DWVA 3Q19A 2YP6A 2P5RA 1QXHA 2K9FA 2L4CA 5J41A 2H70A 4KX4A 5IMVA 1R5PA 2FWEA 2PVQA 4L8EA 1X5CA 1GP1A 3QFBC 3ZFLA 4PX1A 1J0FA 3CXGA 4P3YB 1EV9A 1ZZYA 1EV4A 2LV3A 3GH6A 4YAVA 2V32A 4MF6A 3ZIVA 1U87A 2DSAA 5DAKA 2RM6A 4HQZA 4XCSA 1VF2A 3ZREA 3GKKA 2HNLA 4MMMA 4TXOA 4QQ7A 4MLYA 3ZVJD 2VD0A 2GLRA 1VRSD 1WPIA 4O92A 1JZWA 1ERUA 18GSA 3HZ8A 2H1AA 4CHSA 1VF3A 1AIUA 3TJGA 4PQIA 3F9UA 1M9AA 1Z5YE 4YQVA 4KGIA 1F3AA 1A0FA 1Y25A 2JSYA 3I6AA 1I5GA 5ECIB 3EYTA 5EPFA 3GH9A 11GSA 1OC3A 2HE3A 4WKWA 5IMAA 3U5RE 2V6OA 2ZUPA 4F9ZA 5HR2A 1PRXA 2MMOA 1H75A 2CX4A 3A2XA 1HNAA 2NPBA 2CVDA 4IP1A 1T4YA 2H8LA 5H5SA 5IIZA 1TJDA 4PUAA 2H72A 1GL8A 4MZWA 1XW9A 1Z7RA 2YZUA 4NV5A 5J4UA 3GL3A 4WBRD 3DIEA 1YEXA 3FYGA 1TW9A 3PR8A 3UIWA 4ILFA 5AN1A 5JWOB 3HD5A 3LGCA 3L9VA 2EC4A 2P31A 2TRXA 3M9KA 3TOTA 3M9JA 3CRUA 2GZYA 2VCTA 2YWNA 3IPZA 3ZIJA 1GNEA 4TVEA 1NSWA 3C7MA 4EL1A 1PSQA 3IK9A 7GSSA 8GSSA 1OKTA 4DSSA 1JFUA 4MZBA 1TK8B 4IGJA 3KGKA 2OBKA 5EL8A 1X9WB 2YWOA 4POMA 1UA5A 5ELGA 1TU7A 1JZRA 2FY6A 5JCGA 3M8NA 3I43A 4KE3A 2VL3A 5INYA 4MZCA 5G1LA 4GSNA 1GULA 3DYRA 2HFDA 5DVBA 3APOA 2R37A 4MH3A 4IS0A 3KP9A 17GSA 3FR6A 3V1WA 1XOBA 3O6TA 4TOPA 1GSYA 2YANA 3KD0A 3HA9A 2PWJA 3GN3A 3TB2A 1SL1B 3UJ1A 1GNWA 3D6IA 1V9WA 3ZMKA 5D9VA 5DJMA 5EVOA 1GLPA 4ZBDA 2H66A 1NW2A 1YF0A 3TKPA 4XS4A 5DDLA 4GQCA 3GTUB 3TRXA 2NTOA 3PGTA 1TU8A 3QAVA 4XRAA 4RI7A 2HLSA 5IMCA 1BAYA 5AIVA 1U6TA 4KDYA 1ZCPA 3M0FA 3QOUA 2MYGA 5GZZB 5KN0A 3U6VA 1FO5A 1GH2A 1Z7PA 2LNTA 1ZL9A 2YZHA 2GQLA 3HJPA 1SD9A 1UN2A 2G0FA 1EZKA 3L78A 1TK5B 4MJCA 4JZQA 2OE3A 1R4WA 4MDCA 5F06A 1YQ1A 4MK3A 2OE1A 1B8XA 1B48A 3WGDA 4JE1A 3M3MA 2WFCA 2V41A 1S3DA 5IOXA 1GUHA 3TKSC 1MD4A 3SWLA 1LBKA 1GSSA 4LLRA 3KMOA 3RAZA 1U3IA 2DBCA 5HR3A 3VPTA 3NZNA 3ERFA 1EWXA 2IL3A 2VL2C 2RIIA 2H01A 1EGRA 3A2VA 2DLXA 1KEBA 5J9BA 4ULXA 3MWHA 4GSTA 1O81A 1URMA 1YF1A 2FD3A 2JZTA 4I8BA 3WGEA 1DSBA 5ECKB 1V57A 3GX0A 3RPNA 4KSMA 1GLQA 4H86A 3OR5A 2EIQA 2YV9A 1SK1A 2DJ3A 3GUSA 4PUFC 2N5BA 4HU7A 5JCUA 3GL5A 3TJBA 4ZBBA 1HYUA 4IQ1A 2PGTA 4HEA2 1YDKA 4MPGA 3IAM2 1FVKA 4ID0A 4BVYA 4WF4A 5JWQB 1MDIA 4IKHA 5AISA 1Z6NA 2JACA 2B5EA 2C3NA 1G6WA 2YCDA 2O89A 5G31A 1QMVA 3LFLA 2CZ3A 4KB3A 3H79A 5J5NA 1Z3EA 2CQ9A 5IM9A 4O5RA 1PKWA 3O3TA 1F37A 2LQQA 4ML1A 2HI7A 3DEXA 4AF2A 3TOUA 4K6XA 6GSYA 5B7CA 3UBLA 1AW9A 1X0RA 1O8XA 4FIWA 2GTUA 3H4KA 2YJHA 1JZDA 1PN9A 4AJ6A 2B7KA 3KP8A 2A2RA 3F6DA 4I2UA 4XTSA 4RI6A 2JZRA 4WETA 2B6MA 4KH7A 3A2WA 2L4QA 3L9UA 3GRXA 3HVSA 1TXXA 4J2FA 1FB6A 2H30A 2DJKA 3QD9A 1QFNA 4HZ2A 3KTBA 3PH9A 2Z9SA 4POBA 3RHBA 1WJKA 2LTKA 4N0ZA 1E2YA 2PERA 3J7Yb 1LJRA 4ACSA 1SYXA 2FHEA 2OA7A 3HVXA 1YKCA 1F2EA 3IBHA 2IFQB 5J9CA 2OADA 5D73A 2LKUA 4HDEA 5ID2B 5D93A 1GTBA 3HY2A 1EEMA 1EOHA 2F51A 2AV4A 1JHBA 5A4VA 3VK9A 3EMPA 2YPMA 1WRYA 1AAZA 1TDIA 10GSA 4IJIA 3ME7A 4RQRA 5HFIA 3FW2A 2I4AA 5D9WA 3ZFBA 2HRNA 4X1UA 4HU9A 2R4VA 5DQYA 1OYJA 2H71A 3HYPA 2J23A 2AHEA 2HT9A 3GA4A 4N11A 5LD0A 3A5WA 1ST9A 2IMDA 4BWSA 1ERTA 2ON7A 3HKRA 1NM3A 1N2AA 5C00A 1XIYA 4GWRA 3C73A 2IMEA 3FEUA 2E0QA 1SJIA 1AUCA 1BX9A 5G1KA 5HFGA 5J3RA 2GGTA 1WP0A 2BMXA 1SL0B 1OKDA 2C8UA 4FYUA 2HZFA 4V2MA 1TK0B 2N5AA 4EE0A 3TRQA 3GTUA 1TKDB 2B3SA 4XXBB 1BEDA 3MAKA 1PD21 2QGVA 1PMTA 1G7EA 2HSYA 3UVTA 3MDKA 4IVFA 3EWLA 4Q5FA 5LCZA 1ACVA 3GKNA 5A4UA 1M9BA 3ZYWA 5GSSA 2IMIA 3HXSA 2C1YA 2H74A 2LJKA 3QR6A 4HZ4A 2M80A 1K3LA 4FH8A 3PINA 2LJAA 5HR0A 3FZAA 4MF5A 5GAND 2LUSA 3QCPA 13GSA 2REMA 5F05A 2VLTA 3GKMA 1O85A 3GV1A 3G7IA 2FNOA 4MJBA 1ZGNA 1XXUA 3N5OA 2PVOC 2VM2A 4TW5A 4F03A 1QUWA 5DALB 4WXTA 3ZLPA 1OVNA 2CZ2A 4O32A 5GAPD 4LL1B 2LS5A 1EEJA 2AUVA 2H0IA 1V2AA 2H1GA 1HD2A 1TRWA 1K3YA 3TGZA 3C8EA 2I1UA 2C6AA 4HJMA 2WS2A 4NXIA 2CAQA 4FYCA 4V1Ag 4NWYA 2P5QA 3D21A 4J57E 3KTLA 4XHMA 2FWHA 3LORA 1MTCA 3CTGA 3KMNA 2JL4A 3WD6A 2FUG2 3KEBA 2V2GA 3QAGA 5DJLA 5IMFA 2F8AA 5CRWA 3UEMA 3UL3A 4V2NA 1AQXA 3RDWA 2V1MA 4TR1B 12GSA 3F3QA 1HQOA 3FR9A 4X0XA 2L5OA 1SKSB 4CDOA 1CQGA 4OWYA 3A3TA 1X9MB 5H5RA 3EINA 1ZOFA 2LSTA 2C0DA 4PQHA 1XWAA 3L0HA 4ZIJA 1VGLA 2LRNA 2H6ZA 4OFNA 5G5FA 3F4TA 4ECBA 3B08B 3LG6A 1EGOA 4WR5A 2FLSA 4K0GA 2B5YA 2YWMA 1JLWA 3IRAA 3RBTA 2MMZA 1GTUA 1GSFA 1W89A 3I69A 3C1SA 2F8FA 2L5LA 4FYBA 4TKYA 3D0ZA 4QL9A 1A2MA 2DC5A 4YH2A 1S3CA 5ECHB 3EE2A 3UBKA 5ECOB 2A4VA 1HNCA 2GSTA 3ZTLA 1NHOA 2GT5A 1TRUA 2X8GA 1PL1A 2C4JA 3LJRA 1YJ6A 3LSZA 3HCZA 2ZCTA 2NVLA 2DMMA 1EP7A 4L0WA 2G2QA 4EVMA 2XBIA 4D73B 4EDZA 4PXOA 1XPVA 5ECQB 4CW9A 4E8HA 2YN1A 3EU4A 5ECPB 2HRFA 1BYEA 4XRDA 2GZPA 4N30A 1SK2A 3E9JB 1JZOA 4K0NA 2WCIA 3GSTA 3TKQA 2WZ9A 3AY8A 4IHUA 4BA7A 3HHVA 3US3A 3F0IA 3GMFA 4EDYA 6GSTA 2ALBA 19GSA 1Z9HA 2VO4A 5CO3A 3S9FA 3SBCA 2XBQA 4NAXA 5B6MA 3VWXA 3BJ5A 2IFQA 1PX6A 4PURA 2DJ1A 1C72A 1ZYQB 1NHYA 5ID2A 3DGQA 4GQFA 2FWFA 2VCQA 4X43A 3RPPA 1TI1A 4K7IA 2HZEB 4LL4B 1Z6MA 4KNDA 1WOUA 5FWGA 4Q5RA 3CSJA 1JLVA 1BJXA 2XHFA 3UOMA 1H4OA 1V40A 5H5QA 2TRCP 3QFAC 1FB0A 5E59A 2C6BA 2RUEA 3R2QA 3WYWA 4NMUA 2DMLA 4Z7XA 4BL7A 2J9HA 2K8VA 4RQXA 2X64A 3TDGA 4TXVA 2E2MA 1GSEA 1CQHA 1A8LA 2K18A 4V2LA 3WT2A 2JADA 4K7OA 3DRNA 2VLUA 4WBJA 1A24A 3TKSA 1IYHA 5D9TA 3B0AB 1J9BA 4AJ8A 3FZ4A 3KCMA 3KIJA 3APSA 2LRCA 2IMFA 4LMWA 3IXRA 2H0HA 3ZL5A 3ISOA 3TKRA 2VL2A 1PGTA 4Q5QA 5F07A 1B4QA 2ZNMA 1Y6EA 2P0GA 3TCOA 4IELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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Chain Sequence

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Chord Diagram

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