4RUVA

Crystal structure of thioredoxin 2 from staphylococcus aureus nctc8325
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Elucidation of the mechanism of disulfide exchange between staphylococcal thioredoxin2 and thioredoxin reductase2: a structural insight.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus nctc 8325
molecule keywords Thioredoxin
total genus 30
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ruvA00
2JZSA 3IXRA 2RIIA 3KM6A 2ALBA 1JZOA 2PMTA 1M2AA 2FA4A 2MMZA 5JWRB 4IGJA 2FLSA 4KCAA 5CO3A 3GKNA 5F07A 2CT6A 4L5LA 1TI1A 1JHBA 4GF0A 1SD9A 2YWMA 3D5JA 3DVXA 3IAM2 5IQYA 2GQLA 4MLYA 1A0RP 3R2QA 3ZFBA 2VD0A 4BWSA 2HSHA 2G2QA 1V58A 3L9SA 2GZZA 3VFIA 5DALB 2X64A 4OD7A 3QFBC 4POLA 5IO2A 1PL1A 1VF1A 2LQOA 2YZUA 4MZBA 3PINA 5ELGA 4HQSA 1WMJA 4BWQA 4TRXA 2YWOA 1OC9A 3C1RA 4PX1A 3GKMA 3HJPA 1V2AA 4JZQA 3NIVA 3IHQA 2GT6A 1A2LA 2H0HA 4CDOA 2H1AA 4G19A 2H0IA 3C8EA 1SENA 4LMVA 3W6GA 5ECPB 2LSTA 1PKZA 2GZYA 3ISOA 5HR3A 3CRUA 5ECSA 5H5RA 3CTFA 1GP1A 4EC0A 5A4UA 1PRXA 3MDKA 2VAFA 2YJ7A 4DSRA 1JLWA 4WBJA 4GWRA 5ID2A 2WS2A 3C7MA 1CQGA 4AJ6A 3F0IA 4JEDA 1EWXA 2DJ3A 1KEBA 1MDJA 3P90A 3JCML 1FG4A 1SJIA 4YQUA 4J57E 5HFKA 3HKRA 2GGTA 6GSVA 1A8LA 1E2YA 1PA3A 4TR1A 1YY7A 1NHYA 5IPHA 2PVOC 3RBTA 2HFDA 2Z9SA 1SYRA 1EEMA 5CRGA 2JSZA 2E7PA 1SD8A 4QL7A 2AHEA 4IVFA 5J41A 5J3RA 5E4WA 1EP8A 1VF3A 2OJLA 3ERWA 1K3LA 4ZBAA 1R5AA 3FR6A 2VL2A 3ZRDA 4KUNA 1G7OA 2VL3A 2KLXA 1FVJA 1B8XA 2MZCA 2K8SA 2CV4A 2H1BA 3FZ4A 2I9HA 3GKKA 2ZUPA 4Q5FA 1GTAA 2HZFA 2O85A 4I6XA 4I8BA 5D73A 5H5SA 3BCKA 3GFKA 1ZOFA 4ZB9A 3EE2A 3CMIA 2R2JA 3APQA 5DALA 1Z5YE 1ZCPA 2FWGA 3LQ7A 1VF4A 1NSWA 2L4CA 2MBSA 1IYIA 3MWHA 3CXGA 1FB6A 2JADA 3GTUB 2L6DA 1GNWA 3HD5A 2H0GA 2CZ2A 2C3NA 2OE3A 4I5QA 4WR4A 2FWFA 5AIVA 4L8EA 5IO0A 4MDCA 4BVXA 6GSTA 2F8AA 3G9BA 5D8IA 1UN2A 2AV4A 3DD3A 2P5QA 3HVSA 5IMVA 2YPMA 2VCTA 2YWNA 3CSHA 4HJ2A 2C0FA 1Y6EA 2DJKA 3GSTA 2N5FA 3LYPA 4MK3A 2KP2A 4MH2A 4IQ1A 4IELA 4NHZA 4TXOB 4WBRD 5DCGA 3F6FA 4YQVA 1UVZA 4N11A 2IWTA 5HR1A 1THXA 4MP4A 2H8LA 4OCEA 4ZB8A 1OC3A 4EDYA 4ZL7A 3TRQA 2GS3A 2L5OA 3LG6A 3U5RE 4PQ1A 1URMA 4YAVA 2WFCA 3W8JA 2V41A 1XW9A 2NDOA 5D9XA 3GH9A 3ZMKA 1GTUA 4MJBA 3FHKA 2C80A 1MD4A 1BEDA 1JZRA 4NXIA 5ECHB 2XBQA 1V9WA 5CRWA 5IMAA 2PVQA 4FYBA 4ZILA 4K6XA 1X9SB 2XPEA 1DUGA 4HJMA 6GSSA 4L0WA 3APOA 4EE0A 2TIRA 5ECMB 5GSTA 2IMKA 1U3IA 5B6NA 4K7NA 4MCUA 5IMDA 4XIHA 1I5GA 2LQQA 5JWOB 1GSYA 1W4VA 1ACVA 1ERWA 2FY6A 2NBSA 2VM2A 6GSYA 4ZL8A 3L0HA 1A24A 2LEGA 4GLTA 1SKWB 4V2MA 1H75A 2LNTA 3P8WA 1G6YA 4EO3A 2H73A 1Q4JA 5IOXA 5J5NA 1GUKA 1O85A 3WGEA 5AN1A 1TRSA 1PX6A 4D73B 1A0FA 5B6MA 1ERVA 3DMLA 5KN0A 3Q19A 2XPDA 3OR5A 3IV4A 3M0FA 2R3XA 3DGQA 2L4QA 1EEJA 1XWKA 4JBBA 5AGYA 1TRUA 3V1WA 3TKQA 1THOA 3F4TA 4ML6A 2WULA 1HNBA 4EVMA 1SYXA 2XHFA 3K8NA 5J4UA 4TR4A 2HNLA 2H71A 2F51A 1QXHA 4OCFA 2CAQA 2VLTA 1K0MA 2VIMA 3M3MA 3AY8A 3Q6OA 4KH7A 3LJRA 2GQMA 5AIXA 3ZFLA 4JRRA 1XVWA 3TGZA 1U6TA 1EV9A 3QAVA 2DJJA 3F4SA 3FEUA 2VM1A 1GSDA 3M9KA 3SBCA 5G5FA 1BAYA 4L0UA 4CHSA 4KCEA 3GA4A 2L59A 3HA9A 2LJAA 5IMFA 4ACSA 2F8FA 4GQFA 1NW2A 5GAND 2AB6A 2KUCA 2HSYA 1OC9B 5HFGA 1CQHA 1B4QA 1ILOA 1K0OA 3TUEA 1QK8A 3GX0A 3UBLA 4KDXA 1U3AA 2CX4A 3UARA 2I3YA 3FR9A 5FWGA 2IIYA 1SKRB 1EOHA 1AW9A 1GSUA 3FKFA 3UJ1A 2M80A 3PH9A 4X1UA 1T8EB 4MZCA 3TKSC 4NPBA 3P2AA 5A4VA 1OKDA 2I4AA 2HI7A 1EZKA 1G6WA 3TRPA 2QSIA 2FCHA 1K0CA 2VLVA 4TW5A 1Z6MA 4KDYA 19GSA 1GTBA 3ZTLA 1A2MA 1F9MA 3ERFA 1J9BA 3QOUA 3WGDA 2XC2A 3MNGA 1B9XC 20GSA 3NOFA 5ECKB 4YH2A 1F2EA 1K0NA 5IM9A 2YOIA 3HJMA 4ECBA 1B9YC 1M99A 5IIZA 3GL5A 3I9V2 4RQXA 3N9JA 4WXTA 5FT3A 4CW9A 4MF7A 4Z7XA 2B7KA 2VCZA 3KP9A 2H74A 2IPAA 4IKHA 1V98A 2C1YA 5ECLB 1TP9A 1Z7RA 2B3SA 4MMMA 4O5RA 5GZZB 1XWBA 2QC7A 3TRXA 3KD0A 5HR0A 5ECNB 1AQWA 4O32A 2OBKA 3Q74A 5B7CA 1AXDA 4ZBBA 1BYEA 2VCQA 1WOUA 3DRNA 3IA1A 3BBYA 2NTOA 2CX3A 4FYUA 3RHCA 2VUPA 2H19A 4TXVA 5EVOA 1U87A 4K2DA 3ZIJA 2M46A 5D93A 2A4VA 2GLRA 1PX7A 4QQ7A 1PGTA 2AYTA 1ZMAA 1SK0A 1OC8A 4WEYA 3J7Yb 2HRNA 2V6KA 4JE1A 1J08A 4EKZA 3M8NA 2VCXA 4PUAA 2H6ZA 3ME8A 1BX9A 1RW1A 3GL3A 4LL4B 5IOWA 3DWVA 4NV2A 2LUSA 3A2VA 2GSSA 4HZ2A 1XWAA 3GX8A 4LL1B 3TKPA 5H5QA 3L78A 2YJHA 1DE2A 4KA0A 4GSSA 3MSZA 1TOFA 2DSAA 4N30A 2JZRA 3HJOA 4POKA 3ZVJD 4NWYA 1GSQA 2FA8A 2FUG2 3EU3A 5LNKe 3QDNA 3UIWA 4XS6A 1FOVA 1X0RA 1PMTA 1LU4A 4XHMA 3M9JA 2X99A 4KE3A 3LORA 2H66A 3DYRA 3L9VA 4DSSB 2B5XA 1JZDA 2H70A 2TRXA 3D4TA 1PKWA 1RK4A 5L71A 9GSSA 1F3BA 1A2JA 1M2DA 2GVPA 5ABRA 3O6TA 4N0VA 4P3YB 4MH3A 3ME7A 2DJ2A 3QMXA 1WP0A 1XFLA 2R5GA 3KH9A 3NZNA 3QD9A 4KGIA 3ZREA 1ZL9A 1TK8B 2RM5A 3EVIA 2X8HA 1PSQA 1VF2A 3VPQA 3QFAC 1SL0B 3IE3A 3RPNA 3UVTA 3BCIA 2DBCA 4H86A 2HT9A 3KEBA 4MJEA 1X5CA 2VCVA 1M7TA 4OWYA 4MF5A 2I81A 3UBKA 1OVNA 3DIEA 4NHWA 1R7HA 1TU8A 3LFLA 4WKWA 3M1GA 1UA5A 1S3DA 5KN2A 2GT5A 4GQCA 7GSSA 2PN8A 4ILFA 2H76A 1EV4A 4V2NA 4AJ7A 13GSA 4GCIA 3H4KA 4KSOA 18GSA 3A2WA 1K3OA 1R4WA 4MZWA 3TB2A 4HEA2 3H8QA 1YJ6A 2GDRA 1TW9A 1VGLA 1TTZA 2HYXA 1B4PA 5GSSA 1HNAA 3KZQA 4F0BA 1AC1A 2C3TA 3GH6A 1TKDB 4OMVA 4HU9A 2HZEB 4XRDA 2L6CA 4DSQA 1AIUA 3KTBA 5HR2A 3TJKA 3CYNA 4MA9A 1ABAA 2X8CA 1QUWA 3C71A 1KNGA 3HDCA 3HVXA 5DQYA 5F05A 2C3QA 4PGTA 1YDKA 3QCPA 3WT1A 4DSSA 3TOTA 5DJMA 3HZ8A 3LXTA 2DJ1A 4TR0A 4TOPA 2F3MA 3F3RA 2ON5A 2GSTA 2EIOA 2VO4A 1Z6NA 1TK5B 3G7JA 2LRNA 4IP1A 4XS4B 2YN1A 3N5OA 2WJUA 3D0ZA 4RUVA 3F63A 3GKXA 4L5OA 2DJ0A 2DMMA 2VOCA 3H1NA 3O76A 5EPFA 1XBSA 2R4VA 5C00A 5AISA 2IMFA 2GSRA 3GMFA 3GHAA 4MPGA 3HY2A 5G5EA 1N8JA 1ZYQB 4N10A 5IMZA 4IS0A 3QPMA 4HQZA 1GTIA 2H30A 3FY7A 3GN3A 3VWVA 3UL3A 5COHA 1I9DA 2MBTA 1T4YA 1X5DA 2IJYA 5CREA 4OFMA 1X9WB 4V2LA 1YF1A 2LJKA 5ELAA 4I97A 5DBQA 3GSSA 2QKEA 1S3AA 1GSSA 5C04A 1WE0A 3KXOA 1X5EA 2JSYA 4IN0A 2DIZA 1XIYA 2CVKA 1PN9A 3E3EA 5G2ZA 2G0FA 3E0UA 4QL9A 3TDGA 3HXSA 1Z9HA 2FNOA 2AAWA 2RUEA 5ENUA 4K1FA 5CAXA 5KEJA 3ZVJA 5GAPD 1ST9A 1ZGNA 3L9UA 4KSMA 2K18A 3TKSA 2V1MA 3RAZA 3O3TA 3RHBA 3IOSA 5INYA 1YZXA 3QR6A 3EYTA 14GSA 3ZZXA 3ERGA 1XXUA 2V32A 3QAGA 3F4RA 1GL8A 3FZ9A 2HXKA 1G0TA 2NVLA 10GSA 6GSXA 3F6DA 3IRAA 3ZL5A 1HYUA 3TJBA 3FZAA 3HVVA 4ZBDA 1GH2A 1S3CA 2I1UA 2HZEA 3KGKA 4EF0A 2WRTA 2YWIA 2DIYA 3E9JB 4RI6A 4EUYA 2IMDA 4HZ4A 2F9SA 3HCZA 5DAKA 2HE3A 3GIXA 1MDIA 4PQIA 1GWCA 2A2RA 3CBUA 2CAIA 5A5KA 1FVKA 1YKAA 4XS4A 3RDWA 3HHVA 2AUVA 3CTGA 2QGVA 4G10A 5F06A 4G2EA 1QQ2A 3S9FA 4F82A 2CVDA 3SWLA 4XRAA 5KN3A 2PU9C 2VLUA 4IJ3A 4ZB6A 2MYGA 2B7JA 5ECIB 4MJAA 1G7EA 2LTKA 2LV3A 1YF0A 5JWQB 2C8UA 4POBA 3H79A 1K3YA 1A23A 2K6VA 4HS1A 2PWJA 1FAAA 4GSNA 4MF6A 1U88A 3GURA 3VI7A 2OE0A 1W89A 3FW2A 4OO4A 2R6KA 4WF4A 1QMVA 1XW5A 1PL2A 4DEJA 2M72A 1Q98A 4X0XA 3DKSA 3DEXA 4XCSA 1UC7A 1T4ZA 1C72A 1T7PB 1M9AA 1YEPA 4ID0A 1X9MB 3IBHA 3VPTA 1KBNA 3D6IA 4E8HA 2CVBA 1SJ6A 4TR3A 3TJGA 2ES7A 3LWAA 2CQ9A 1M9BA 1ON4A 2O7KA 2J9HA 2N5BA 1AQVA 5HQPA 4K8MA 3APSA 3BD2A 3VK9A 2H6YA 3G7IA 5DDLA 2LS5A 1F6MC 5G30A 3C1SA 3D22A 17GSA 3UVHA 1NHOA 4KAEA 2K9FA 4OO5A 1XWGA 3IK9A 4IP6A 4LA1A 5JCGA 3ZITA 1JFUA 4KNDA 5LCZA 2OKAA 4TKYA 3KP8A 1TU7A 4J56E 4RI7A 3QAWA 3W8SA 3PGTA 4GRFA 1OAZA 2OACA 5EY6A 4BVYA 2IMEA 2KHPA 1HNCA 2RLIA 1IYHA 1HD2A 2WGRA 3F8UA 1XOAA 1NM3A 4ML1A 1DE1A 3BJ5A 2V6OA 3ZIVA 2LKUA 1O6JA 1GUMA 2JL4A 1WRYA 3H93A 3TCOA 3EINA 1WWJA 5D96A 1TJDA 1XPVA 2A2SA 5B8AA 1GRXA 2JZTA 2EIRA 1WIKA 4K9ZA 1ML6A 2VCWA 1K0AA 3KCMA 4PXOA 5J9BA 3EMXA 4E8EA 2AJQB 2WZ9A 1XOBA 1B48A 2LRTA 2YNXA 2LNSA 5CP1A 1E6BA 5G1LA 4F0CA 1OKTA 2ZCTA 1M0UA 5IMCA 2H1GA 3VWUA 4JR4A 2D2ZA 1O73A 3RPPA 1GUHA 4GSTA 2YZHA 5ECQB 2OBIA 1SK1A 4JR6A 1O8XA 2CA8A 3VI5A 3G7YA 6GSWA 3WD6A 1BQ7A 2PPTA 3KJYA 2MMOA 3VWXA 1XCCA 2LRCA 2P0GA 3KIJA 1OE8A 2YV9A 4G9HA 5E59A 3WYWA 5JCWA 5F8BA 1QGVA 2JU5A 2DLXA 3EWLA 3LXZA 2FGXA 2GZPA 1XVQA 3BOAA 5DJLA 1TRWA 3MAKA 3KMOA 2KP1A 2LJRA 2OA7A 2V2GA 1A8YA 4KX4A 4XTSA 5ECRB 2O87A 3FK8A 3CRTA 1M2BA 4O92A 4WR5A 1O81A 3TJJA 1KTEA 1AUCA 4MPFA 1FW1A 1TRVA 4EDZA 2XBIA 1AAZA 1LJRA 5A4WA 5G31A 4HU7A 1OE7A 3D21A 1WJKA 3VLNA 4Q5NA 1Z7PA 1F3AA 2FWEA 3VURA 2VD1A 2HLSA 5HFIA 3D4MA 4N0ZA 5DQSA 3A2XA 2FWHA 1EOGA 4TN8A 3GNJA 4I2UA 3UOMA 4HUAA 1MDKA 2C0EA 2C4JA 2BTOT 1SK2A 2YV7A 1VRSD 3GYKA 4GTUA 1ZZYA 1EP7A 1Z3EA 3FYGA 4PNGA 1N2AA 1T3BA 4BA7A 4IJIA 1SKSB 8GSSA 2TRCP 4AJ8A 4RQRA 1XW6A 2KOKA 5G1KA 22GSA 3US3A 5CYYA 2C0GA 1MEKA 3J7Yk 1TDIA 2VL2C 5DAKB 2CZ3A 2H75A 3IC4A 4ZIJA 3F9UA 5D9WA 3GRXA 4WF5A 2N5AA 4YQMA 4F03A 4F9ZA 5B8BA 1GSEA 2MMAA 2PERA 1RQMA 2C0DA 2FHEA 6GSUA 1GULA 2B1KA 4PNFA 4EXJA 2YP6A 1PQNA 1USBA 5JCUA 1MTCA 4AF2A 3VWWA 2YANA 2GTUA 2EC4A 2B6MA 4ECJA 2RUFA 4PQHA 12GSA 4IBPA 5IPGA 2DMLA 5CRDA 3C73A 1AQXA 1JLVA 1XZOA 2IN3A 3TKSE 3DVWA 2REMA 2WB9A 4HI7A 3IAS2 4GXZA 1GNEA 2H1DA 2B5EA 4POMA 5EL8A 3HYPA 3CSJA 4K7IA 1TK0B 3IK7A 4NMUA 4XS1A 3UAPA 2JACA 1SL2B 2R37A 3EU4A 4IW9A 3ZYWA 2FD3A 1K0DA 1V57A 1OYJA 1FB0A 2E0QA 1V40A 4FO5A 3LEFA 1LBKA 1QFNA 4YAPA 1H4OA 4KDUA 2E2MA 2B5YA 1TXXA 1O7UA 2BJXA 1SU9A 4ZXGA 3KH7A 2IFQB 4DVCA 2K8VA 1YKCA 3TOUA 3TJFA 3LSZA 2HRFA 2B1LA 3DXBA 4NV5A 3EMPA 2OADA 1BJXA 1GSFA 4Q5RA 4X43A 4IQAA 3GTUA 4PURA 5CNWA 1ERTA 3Q18A 3KMNA 1MD3A 2L5LA 3U6VA 4ISDA 3EC3A 2NPBA 4ECIA 3WT2A 2OE1A 1EGRA 1HQOA 4PUFC 5J9CA 3TKRA 5KN1A 1T00A 3PR8A 16GSA 4WETA 4HDEA 1EGOA 4O7HA 3IR4A 4MJCA 2O8VB 4LLRA 4K7OA 3IPZA 4K0NA 4JU5A 2BMXA 2L57A 3GUSA 3P7XA 3WGXA 1R5PA 3UEMA 1SL1B 1R26A 1ZYEA 1SJZA 3I6AA 4TXOA 3HZ4A 1JZWA 1TI3A 3CSIA 4KB3A 3I69A 4LMWA 4V1Ag 5FHIA 2RM6A 3FR3A 5DCHA 1K0BA 1FHEA 1FO5A 4ULXA 4KW6A 4V1Ap 2WCIA 4I2TA 4FIWA 4BPYA 3A3TA 3ZLPA 3ED3A 3IDVA 1DBYA 2P5RA 2PGTA 5D9VA 4EL1A 1O8WA 2PBJA 2YCDA 2H01A 3ZMLA 2ON7A 1GLPA 1GLQA 1WPIA 2H72A 4FYCA 4MABA 1BG5A 4HOJA 4TVEA 3LGCA 2O89A 4AGSA 4BL7A 2GQKA 2MMNA 2J23A 1PD21 1YEXA 2VL9A 4ECCA 2P31A 1DSBA 4F2IA 4ZL9A 5ID2B 2IL3A 4Q5QA 1F37A 4NAXA 1XWCA 3KTLA 4FH8A 4OFNA 11GSA 5CRHA 2E2GA 3FZ5A 5LD0A 3UMAA 3I43A 3EURA 2DC5A 5ECOB 4TR1B 5D9TA 3F3QA 2GSQA 2H6XA 5F0GA 4K0GA 2IFQA 2EIQA 4D73A 1Y25A 4OFTA 3GV1A 4IHUA 2ZNMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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