5HFIA

Cytosolic disulfide reductase dsbm from pseudomonas aeruginosa with gsh
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
210
structure length
202
Chain Sequence
LTLHYLYDPLCGWCYGASPLLAAACEVTGLDVRLHGGGMMTQPVGAGLRHMPHDLRIAQLTGQPFGKDYFDGLLRDTSAVFDSAPPTAAVLAAEALDGLGAAMLARIQRAHYVEGRRIAERPVLLELGAELGLGEGFAEAFDACSGEPLRAHFADSRRLMNRLGAAGFPTFALERRLQVLDTGRYLGQPDDWRAFLETQLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Uncharacterized protein, cytosolic disulfide reductase DsbM
publication title Crystal structures of the disulfide reductase DsbM from Pseudomonas aeruginosa
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 69
structure length 202
sequence length 210
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hfiA00
4GCIA 3J7Yk 4JZQA 4ZXGA 2KOKA 1YQ1A 5ECLB 1QGVA 2M80A 3D0ZA 4IQ1A 1Z6NA 3DGQA 5G1LA 6GSXA 3Q19A 11GSA 1JZWA 3L4NA 3P90A 3EMPA 2FY6A 2JADA 2B5EA 1TP9A 2YN1A 2YZHA 4KNDA 3DRNA 2GVPA 2VD0A 2LJRA 3H79A 3I43A 3GKMA 1FVKA 2MMOA 2HE3A 3Q74A 2D2ZA 5DVBA 2H30A 4GF0A 4MA9A 2L5OA 2LRCA 4LA1A 1UA5A 2J23A 2JZRA 2PUKC 5IMCA 2C0EA 2OACA 5H5SA 2VLUA 3HXSA 3TGZA 5FHIA 3IOSA 1IYHA 1MD3A 3F6FA 4KDXA 3ZFBA 1SKSB 3A5WA 2IMDA 1VRSD 1JLWA 4CHSA 4J57E 3EWLA 1F3AA 3IBHA 4HJ2A 4RQRA 1OE8A 4BWSA 1GSEA 3HDCA 1T00A 4I2UA 9GSSA 1X5DA 2VOCA 4DSQA 6GSUA 5KN1A 1Z9HA 2I4AA 4PQHA 2K18A 4KDUA 2GS3A 4KA0A 3UEMA 1B9XC 3S9FA 4ID0A 2KP1A 1TW9A 4KSOA 5FWGA 1VF4A 1OYJA 2IFQA 5GAND 2XBQA 1AW9A 1TJDA 1M0UA 2H72A 1OC8A 3SBCA 3LXZA 4OCEA 2BTOT 3L0HA 1PL2A 5GAPD 3V1WA 1M2AA 2IMEA 1JZOA 4PQIA 2H1AA 4L0WA 3GX8A 4FIWA 1OKTA 4I6XA 4V1Ag 2GT5A 3EC3A 1A2MA 1UC7A 1XW5A 1T4YA 3GKKA 4N0ZA 4IJIA 1X9WB 4JBBA 1VGLA 3TRPA 4I8BA 2R37A 2IMIA 1KTEA 5JWQB 4RUVA 2O8VB 2K6VA 5IIZA 3O6TA 4L0UA 1Q98A 1GSYA 3HCZA 4Q5RA 1EZKA 1K3OA 1BEDA 1CQGA 4HU7A 3UJ1A 1AQVA 2GSQA 2GT6A 2WFCA 3HZ4A 4G9HA 1TK5B 4I5QA 3RBTA 3K8NA 3KGKA 3ZIVA 4KSMA 4HI7A 5J9CA 5DQSA 2PPTA 2LQOA 4OFNA 2B3SA 4TR1A 1GSFA 4PX1A 3F8UA 1PSQA 1K0MA 2DJ0A 3ZVJD 3E3EA 3DYRA 4XCSA 3FY7A 2H70A 3D21A 2LV3A 3M3MA 3QAWA 4ECCA 4ZB6A 1OC9B 4G10A 3LYPA 4HQZA 3CSHA 4POKA 1PMTA 4IBPA 1YEXA 4AJ8A 1A0FA 4FYCA 3WYWA 4AGSA 4ZILA 3HJMA 4DVCA 2IMFA 5D8IA 1GSDA 1MDKA 1CQHA 2WULA 2H0GA 14GSA 6GSTA 3ZZXA 5IMFA 19GSA 10GSA 3C73A 3UMAA 5DALB 2EIQA 3N9JA 5EVOA 3GHAA 3GMFA 1K0AA 2HSYA 3VWWA 2B7JA 1O81A 2OADA 1QXHA 4MJAA 3MNGA 2DJ3A 2X64A 3GFKA 2VAFA 2DMMA 3UARA 1A2JA 3A2XA 1OC9A 3N5OA 1HNCA 2KHPA 3DKSA 3W8SA 3QOUA 5HFIA 2HSHA 3BCIA 5A4UA 3JCML 2B1KA 4K6XA 1BAYA 3QCPA 5F06A 4ZIJA 1EEJA 5IMAA 2A4VA 4G2EA 2NPBA 4ISDA 2DBCA 5HFGA 1USBA 2OE0A 2GQMA 2FCHA 5AN1A 1TKDB 1SL1B 3FZ4A 1FG4A 3TJFA 2FNOA 3GL3A 3CTFA 4YH2A 4PGTA 2RIIA 1O85A 2AV4A 1SYXA 3KP8A 5IMVA 1R5AA 4JRRA 1SJ6A 4F2IA 4BA7A 13GSA 4EL1A 4D73A 3F3RA 3E0UA 1SKRB 1SD9A 2GQKA 5ECOB 2AYTA 3WT1A 1SK1A 2DJKA 1KBNA 4MF5A 3GTUB 1SL2B 1ZOFA 3ZMKA 2PWJA 4BVYA 3EVIA 1TU7A 1W4VA 1SKWB 4TXOA 3BJ5A 2VUPA 3ERGA 3QMXA 4KX4A 1GUMA 1B48A 4MZWA 1HD2A 1VF2A 2LSTA 2YP6A 2N5AA 2BJXA 2I1UA 1OC3A 1K0NA 4WF4A 3HY2A 3SWLA 5GZZB 3FEUA 1TK8B 4MPFA 2C4JA 1S3AA 5ELAA 1Z3EA 5A4VA 3GSSA 5J5NA 2A2SA 3VWXA 4HQSA 1MDIA 1XWKA 3VI5A 2KLXA 1A24A 4KB3A 5ABRA 1DE2A 3NIVA 1B8XA 5HR2A 2YCDA 4QQ7A 5L71A 4WR5A 1FVJA 4TR3A 2MBSA 6GSYA 3C1RA 1BX9A 4TN8A 2HT9A 5JCWA 2NTOA 3IHQA 3KCMA 1M2BA 3HVVA 2WRTA 1K3YA 3Q6OA 3FKFA 6GSVA 2B6MA 4TW5A 2GSTA 4Q5QA 4OFMA 3IR4A 2V41A 2LJKA 2FA4A 2H6ZA 2HRNA 4HDEA 3IK9A 2H6YA 3DD3A 1SK0A 2ON5A 4G19A 3TDGA 4ZL9A 3P8WA 1AUCA 4XTSA 4OMVA 3F4TA 2PMTA 2P0GA 2V2GA 5CAXA 3GL5A 4DSSB 3KP9A 3DEXA 4NMUA 3F3QA 4RI6A 4K9ZA 1N2AA 3RPPA 2G2QA 3FZAA 1AIUA 1TTZA 2TIRA 3P7XA 16GSA 2LTKA 2NBSA 3VWVA 3EURA 1TDIA 5DQYA 2C3TA 5ECSA 1JZDA 1O8XA 1XWBA 4N10A 3A2VA 2WS2A 4IHUA 3TKSC 1PX6A 2WZ9A 2F51A 3GNJA 3RHCA 4HUAA 5KEJA 2VL2C 4ULXA 1TOFA 2DMLA 3AY8A 3IA1A 5DJMA 2VCQA 2IPAA 4WEYA 2NVLA 3D4TA 3UBLA 2VIMA 4YQMA 1TRVA 2G0FA 1BQ7A 2AJQB 2N5BA 4F0BA 1GNEA 2MMNA 2RLIA 4TXVA 1EOGA 1FB6A 2AAWA 5KN2A 4I2TA 4JR6A 1NSWA 1FHEA 4IS0A 3PGTA 5LNKe 3H1NA 5H5QA 3WT2A 2RUFA 4GQFA 5ECKB 3ZMLA 4GRFA 1XVQA 2MZCA 1M99A 2YWMA 1GSUA 1UVZA 2FWHA 2PERA 2OBKA 2C3QA 2B5YA 1PQNA 4HU9A 2R5GA 2JACA 4MJEA 3F63A 3BOAA 3WGEA 5G31A 4AJ7A 4FYUA 1Y25A 2K8VA 4NAXA 3IXRA 3VWUA 2GZYA 4BL7A 2WCIA 4K1FA 2O85A 3W6GA 2FD3A 12GSA 1LU4A 1THXA 1T7PB 2VLVA 4WBJA 3HA9A 5EL8A 5LCZA 1EGOA 1SENA 2GSSA 2QC7A 3CMIA 2PN8A 5LD0A 5ECPB 4YAPA 4IKHA 3KZQA 3C7MA 1KEBA 4YQVA 2H75A 3ZRDA 4MCUA 2VCVA 1O73A 3EU4A 3IV4A 1AAZA 4K2DA 2EIOA 4LMWA 3EE2A 2H6XA 3TCOA 4KH7A 1RW1A 2CT6A 3LSZA 1YKAA 2YJ7A 5DAKB 5B8BA 5FT3A 2PVQA 2H1BA 2YJHA 1XOAA 1XVWA 1F3BA 4V1Ap 5CRWA 2VCXA 3GV1A 3TKSA 2VLTA 2V6KA 3QPMA 1YJ6A 1ZYEA 2HYXA 1GL8A 1LBKA 3FZ9A 1E2YA 2X8HA 1GTAA 1VF1A 4YQUA 1PGTA 2VL2A 1GTIA 1FOVA 2F3MA 1GUKA 1PRXA 6GSWA 2XC2A 1FO5A 3VFIA 2I81A 1K0BA 4KUNA 5IQYA 1U6TA 2B1LA 3ME8A 2WDUA 1ERTA 4NPBA 3GUSA 5B6NA 2OBIA 2IN3A 4MZBA 3CTGA 2PGTA 1ERVA 4KAEA 5HR1A 2EC4A 2LUSA 4IP6A 4OWYA 5C04A 2X8GA 3LORA 5ELGA 3KIJA 4OD7A 1U88A 5KN3A 3UL3A 5H5RA 1QUWA 3HD5A 4NV2A 3TUEA 4XHMA 2OE1A 5EPFA 5F8BA 2CX4A 5JWRB 1ERWA 2VL9A 2VM2A 4XS4B 3EINA 4WXTA 1DBYA 5ECMB 2GDRA 3EYTA 1Z5YE 3HKRA 2E2MA 1A23A 1SJIA 2XPEA 1F37A 4IGJA 3ED3A 4K7OA 2H76A 3M0FA 4IJ3A 4MABA 1FAAA 1R4WA 3LWAA 4HS1A 3CSJA 3US3A 3P2AA 1TU8A 5DDLA 3M9KA 3I69A 3DMLA 5F0GA 3TJBA 1MEKA 2F8FA 3RPNA 2H66A 4XRDA 3TKQA 1J9BA 3A3TA 2JL4A 2FWEA 1F6MC 4POBA 3LFLA 2L4QA 1EWXA 4YAVA 3ZFLA 5IM9A 2YPMA 1JLVA 5ECHB 1N8JA 3KH7A 5IO2A 2LQQA 3KEBA 4L5OA 2L6CA 4K7IA 1XWCA 3QAVA 1HNAA 2DC5A 3IDVA 1ERUA 2JU5A 1UN2A 1RK4A 3QD9A 4WETA 1G6YA 6GSSA 2LEGA 4FYBA 3C8EA 2FWFA 4WF5A 3ZVJA 1F2EA 3H93A 1U3IA 2AUVA 3C1SA 1OAZA 4NHWA 3UVTA 2QGVA 3ME7A 2GLRA 1I9DA 4N30A 1GSSA 1Z7RA 1ZMAA 2HZEB 3CBUA 2YWNA 3VURA 1AXDA 3MDKA 2QSIA 2AHEA 1QQ2A 1XWGA 3KMNA 5DCHA 1TRUA 3J7Yb 1V98A 3O76A 3KXOA 5DALA 4PUFC 1GNWA 5E59A 1PKZA 2LS5A 4L8EA 3VPTA 5CREA 3BD2A 5JCGA 1Y6EA 2R3XA 2MYGA 5D93A 3RHBA 1WJKA 1K0DA 3MAKA 1AQWA 5CRDA 3FR3A 2WGRA 1WPIA 4TR4A 1V40A 2IMKA 4XRAA 4F82A 2FUG2 4IP1A 1OE7A 4GSSA 1M7TA 2E0QA 2JSYA 5G5EA 4OCFA 2CAQA 1V9WA 3GX0A 3LXTA 4CDOA 4AF2A 2CA8A 4EKZA 2FWGA 1G0TA 1ST9A 1XFLA 1Z6MA 1XW6A 2GQLA 3TKRA 1R7HA 3KM6A 4P3YB 2GTUA 3GH6A 1SYRA 4E8HA 1EOHA 1V57A 2WJUA 1XPVA 1NM3A 1HQOA 1SL0B 2H0HA 1S3DA 3GTUA 3VK9A 4BWQA 4ACSA 4GLTA 4MLYA 2VM1A 3HVXA 4MJCA 5G2ZA 1G7EA 3FR9A 2XPDA 5D9TA 4MDCA 3H4KA 1FW1A 5CYYA 1ILOA 1NHYA 1W89A 5IMDA 4JE1A 2M46A 1B9YC 3HJPA 2BMXA 2KP2A 3PR8A 1V58A 22GSA 3TB2A 4ZB9A 5DJLA 1AC1A 2DJJA 3D6IA 3F6DA 2P5RA 1PX7A 3C71A 4BVXA 2L5LA 4ILFA 4PXOA 1XZOA 4ZL8A 3IC4A 3Q18A 2RUEA 2ZUPA 4TR0A 1SU9A 2ZNMA 4MJBA 3QR6A 1F9MA 3A2WA 1K3LA 1EEMA 1OVNA 4HZ2A 5GSTA 2VO4A 4GQCA 1ML6A 1WWJA 4XIHA 1TK0B 3NOFA 3PH9A 2QKEA 1G6WA 2H71A 3GH9A 3L78A 2OJLA 4ZL7A 1BJXA 4MPGA 2V32A 2HRFA 2O87A 3ZREA 2JSZA 1C72A 5C00A 2VD1A 4GXZA 2CVKA 4KW6A 1GUHA 2L4CA 4XS6A 2H8LA 1XWAA 3ZYWA 2VCTA 3WGXA 2C1YA 4POMA 5A5KA 2X8CA 3PINA 2IJYA 3LQ7A 5B7CA 3OR5A 4Q5FA 1WRYA 2HXKA 4DSSA 5CP1A 5CRGA 2PBJA 2A2RA 4RQXA 1BG5A 1XW9A 1H4OA 1MD4A 2R4VA 5HQPA 1X9MB 2X99A 5D96A 2YOIA 1ABAA 4NWYA 3L9VA 2YV7A 2HI7A 5JCUA 1SJZA 2TRXA 3NZNA 1T8EB 4MMMA 3D5JA 4Q5NA 3GKXA 3IRAA 1XCCA 3HYPA 1Z7PA 2LRTA 2CV4A 1XBSA 2H01A 3LYKA 1Q4JA 1A8YA 4OO5A 3F4SA 3F4RA 2H0IA 1ZZYA 2PU9C 5D9VA 1NW2A 2RM5A 3IK7A 4N0VA 1IYIA 1GP1A 3APSA 5CNWA 1RQMA 1FB0A 4K7NA 5INYA 2ES7A 1DUGA 1X5CA 4ML1A 1U3AA 5DCGA 3LGCA 3UBKA 2M72A 3TRXA 1M9BA 5B6MA 2CZ3A 1THOA 2IFQB 4K0NA 2P31A 5ECIB 3E9JB 2C0FA 1A8LA 1T1VA 5IMZA 4J56E 1PD21 5F07A 4JU5A 2L6DA 1YF0A 5IOWA 4CW9A 3U6VA 1DE1A 5HR3A 2VCZA 4O5RA 1YEPA 2CQ9A 2YNXA 3W8JA 1GLQA 17GSA 4GSNA 3QDNA 3F0IA 3KJYA 1QMVA 1QK8A 2V6OA 1R26A 5ECNB 4EF0A 4PUAA 2CZ2A 2I9HA 1A2LA 1R5PA 5J3RA 3M1GA 3FK8A 2K8SA 4GSTA 2FA8A 4JEDA 2E7PA 3LG6A 2YWIA 3UAPA 1HNBA 3TOTA 1GWCA 5DAKA 4TR1B 3VPQA 3QFAC 4EXJA 1G7OA 3KH9A 3G7YA 4TVEA 3FHKA 3KMOA 2PVOC 3DVWA 4ECIA 1X5EA 1PL1A 1EV9A 3DWVA 3CYNA 3VI7A 4I97A 2MMZA 4GWRA 3GIXA 2H1DA 2H19A 5JWOB 4ECBA 2KUCA 4TRXA 1URMA 4TKYA 3ERWA 3U5RE 1U87A 1X9SB 1GLPA 2HZFA 3TKPA 2O7KA 2LJAA 3QFBC 2C0DA 4MK3A 1DSBA 2C8UA 4LL4B 4TOPA 1GH2A 5GSSA 2FHEA 2NDOA 1EP7A 3KTBA 2C0GA 1I5GA 3IAS2 1EGRA 1GTBA 1ZYQB 1T4ZA 2YZUA 3CXGA 2MBTA 2DIYA 4ZBAA 4PURA 2P5QA 4EDYA 1YY7A 3R2QA 3I6AA 4QL7A 2GGTA 3H8QA 1VF3A 4EDZA 2CVDA 3HZ8A 4V2LA 4ZBBA 4HEA2 3TJJA 4XS4A 5CRHA 3G9BA 2XHFA 4O92A 4WR4A 4JR4A 4EE0A 2OA7A 3GA4A 1KNGA 3RAZA 1NHOA 4KCAA 1OKDA 1YF1A 2R2JA 4V2NA 4PNGA 2H74A 4KDYA 3FR6A 4D73B 1X0RA 3GN3A 4PNFA 4J2FA 4K8MA 2VL3A 4X43A 2CAIA 3APQA 3RDWA 1H75A 1EP8A 1ZCPA 2E2GA 3ISOA 7GSSA 2ON7A 4TXOB 4ECJA 2RM6A 5D9WA 5EY6A 1K0OA 3TKSE 2L57A 3I9V2 1HYUA 1AQXA 4WKWA 1J0FA 4EVMA 3FRCA 4IVFA 2H1GA 1YDKA 1LJRA 2B5XA 1GTUA 2GSRA 2C3NA 2XBIA 2Z9SA 5AIXA 2OKAA 5AGYA 2IL3A 3TJKA 2DJ2A 3TRQA 2YV9A 1WOUA 5F05A 3APOA 5B8AA 4MH2A 3WD6A 2LKUA 5J41A 2HFDA 2K9FA 4OFTA 4ZBDA 4ML6A 4MF6A 4BPYA 1K0CA 2F8AA 4NHZA 3GRXA 4MH3A 3QAGA 2HZEA 1YKCA 2HNLA 4EC0A 4F03A 3EMXA 1ON4A 4ZB8A 1A0RP 4GTUA 1J08A 3BBYA 5J4UA 4NXIA 4POLA 1TI3A 5DBQA 4MZCA 1WP0A 3WGDA 1V2AA 1WIKA 4KE3A 3IE3A 1O7UA 3LJRA 4Z7XA 4KCEA 3F9UA 3UOMA 4HOJA 3KD0A 1BYEA 5A4WA 5ECQB 1GSQA 2FLSA 4IN0A 1O6JA 3DVXA 3ZITA 3GURA 3LEFA 3O3TA 3MSZA 3UIWA 4H86A 3ZIJA 2C80A 4OO4A 1TI1A 2LNSA 3CRUA 4LL1B 3IPZA 5IOXA 1MTCA 1ZL9A 4QL9A 1YZXA 2GZPA 5D73A 2LRNA 5ENUA 2CVBA 1S3CA 3M8NA 3GKNA 4LMVA 2R6KA 3UVHA 18GSA 2O89A 1ZGNA 1XOBA 2OE3A 2DLXA 2YANA 5ID2B 1TRSA 2HLSA 1QFNA 2N5FA 4X1UA 4O7HA 1E6BA 4MF7A 4K0GA 4MP4A 5E4WA 5HR0A 1GULA 5AIVA 5AISA 2GZZA 2V1MA 1SD8A 2FGXA 2LNTA 3L9SA 2JZSA 5IPHA 2EIRA 3ERFA 4EO3A 3ZTLA 1SK2A 3DXBA 4N11A 2REMA 4F9ZA 5G5FA 4AJ6A 1PN9A 1JZRA 5D9XA 1T3BA 1TXXA 5CO3A 3CSIA 3HJOA 2DSAA 1ACVA 2TRCP 2I3YA 2L59A 3GYKA 4KGIA 3G7IA 4O32A 3HVSA 1PKWA 4PQ1A 8GSSA 1M2DA 4NV5A 3VLNA 1MDJA 2J9HA 3GSTA 4LLRA 4L5LA 1WMJA 5G30A 5J9BA 5COHA 5ID2A 5KN0A 5IO0A 1XXUA 2JZTA 4IW9A 4HZ4A 2DJ1A 4WBRD 3TJGA 1O8WA 3MWHA 4IELA 3ZLPA 1M9AA 3TOUA 3M9JA 4XS1A 4V2MA 2F9SA 4DEJA 3FW2A 4EUYA 5IPGA 1XIYA 2ZCTA 2B7KA 1B4QA 1WE0A 2DIZA 1PA3A 2YWOA 3DIEA 5ECRB 1GRXA 1EV4A 2VCWA 3EU3A 4X0XA 3HHVA 5G1KA 2IWTA 3CRTA 4E8EA 4HJMA 3IAM2 3FYGA 2WB9A 4DSRA 5HFKA 20GSA 2H73A 1B4PA 4RI7A 3BCKA 3D4MA 4F0CA 2ALBA 4FO5A 1JFUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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