2ES7A

Crystal structure of q8zp25 from salmonella typhimurium lt2. nesg target str70
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
119
structure length
103
Chain Sequence
b'FSALWQRLLTRGWQPVEASVGDGVILLSSDPRRSDNPVMIAELLREFPQFDWQVAVADLEQSEAIGDRFNVRRFPATLVFTDGALSGIHPWAELLTLMRSIVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Q8ZP25 from Salmonella typhimurium LT2 NESG target STR70.
rcsb
molecule keywords putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Isomerase
total genus 20
structure length 103
sequence length 119
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07449 HyaE Hydrogenase-1 expression protein HyaE
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2es7A00
10GSA 2HNLA 1X0RA 2V2GA 4GCIA 3GL3A 4NWYA 1THOA 4DSSB 3GSTA 5GSSA 5J9BA 3TKRA 1A2LA 4MP4A 3HZ4A 3KTLA 1F3AA 2XPEA 2KHPA 3KEBA 2N5BA 2N5AA 2RM5A 1PKWA 2V1MA 2C1YA 3O3TA 2VAFA 4KE3A 4L0WA 3E0UA 2JADA 3ERWA 2H71A 4DSQA 2DBCA 2X8HA 1B4PA 1EGRA 2GGTA 3HYPA 2HSHA 2GSQA 4IJIA 5CAXA 1G7EA 3GKKA 3H8QA 4POLA 1K0MA 1GSEA 5EL8A 2VCXA 1DSBA 5L71A 4K2DA 6GSWA 1TRWA 2P5QA 3Q19A 3DD3A 12GSA 2GS3A 2GZZA 4TXVA 3TKPA 5ELAA 4WF4A 3TJBA 4V2NA 2I9HA 3LG6A 4MF5A 4KCEA 4WEYA 1SK0A 1GTAA 2GVPA 2P31A 4FO5A 4J2FA 3FY7A 2DJ0A 1FB6A 4KCAA 4DSRA 3EE2A 1M9AA 3EVIA 2HSYA 1AAZA 1SKRB 2I1UA 3IC4A 4ZBBA 4OO5A 3HVXA 4X1UA 2CZ2A 3VWUA 3H93A 1GRXA 4MK3A 2K6VA 4IP6A 1OE7A 4GQFA 4TW5A 5JWQB 1GSFA 4O92A 1J9BA 4MJCA 1JZOA 1Z9HA 3ERGA 3ME7A 2YP6A 3V1WA 4V2MA 2FA8A 3HHVA 1YDKA 4D73B 2VO4A 4IJ3A 3WYWA 3Q6OA 4GWRA 2A4VA 2LUSA 3DYRA 2B6MA 3GYKA 2FWEA 1WWJA 1XXUA 4GSNA 2OE3A 2PBJA 3KZQA 2XC2A 2YV9A 1XVWA 1GP1A 3L9VA 3ERFA 1TXXA 1WE0A 1XW6A 1JLVA 3GN3A 1B8XA 5AN1A 4ZL7A 4KDUA 1Z7PA 3AY8A 3FEUA 1V57A 2LJKA 1A8YA 2YJHA 3RBTA 5JWRB 5F8BA 1S3DA 3PINA 1N8JA 3D22A 3L0HA 3KH9A 3UL3A 1ZOFA 1EGOA 3ZLPA 1ERVA 5CRDA 2JZSA 2G0FA 1PL2A 3C73A 1SL1B 3FRCA 1RW1A 1EP8A 5F07A 4IP1A 5IMDA 8GSSA 17GSA 1M2AA 3W8SA 2CZ3A 4MF6A 1GWCA 4K7OA 2R2JA 2YJ7A 3HJMA 4ISDA 4F0BA 1K0AA 1XWCA 1UVZA 1K0BA 2YPMA 2X8GA 1XVQA 5FWGA 3UEMA 3BD2A 1EV4A 1TP9A 4MH3A 5ECPB 2DIZA 1TJDA 2XBIA 4OO4A 4AGSA 3ZFBA 4MJBA 4POMA 1RK4A 5IO2A 5IOWA 4NV2A 5DQYA 2FUG2 1ZCPA 5DALA 3IXRA 1X9MB 2V6KA 3F4TA 3UBKA 5CREA 1MDKA 4EO3A 1M99A 3F4RA 1DUGA 3HXSA 1OC9A 3GIXA 1SJIA 1X5CA 2O7KA 4PXOA 2LV3A 5LNKe 2J9HA 1TRUA 1Z6NA 1OE8A 2F3MA 1TK0B 3UARA 4MH2A 2ALBA 4F9ZA 5G5FA 2PN8A 1ZGNA 2H1AA 2IMDA 3VWWA 1TU7A 1JLWA 5AISA 1I5GA 3C1RA 3KP9A 1X5DA 4HQSA 4FIWA 3HD5A 2TIRA 1K0CA 3EU4A 3FK8A 1J0FA 1GNWA 3VFIA 4IQ1A 4PGTA 4ZL8A 3C7MA 4ILFA 1MD4A 5KN2A 3QOUA 5C04A 1H4OA 5HR1A 4HZ2A 2I81A 1OKDA 4K1FA 2GSRA 2VUPA 1Q98A 2OJLA 1EWXA 3KJYA 2REMA 2LNTA 3EMPA 4IN0A 2DLXA 2CX3A 2F9SA 1MD3A 2VCQA 4BL7A 5J4UA 3TJFA 4KUNA 3A3TA 1S3CA 2PVOC 1TK8B 2CV4A 4EL1A 1R4WA 3ZYWA 4CDOA 1LJRA 1FO5A 5FT3A 2L5OA 1FG4A 2NVLA 2TRCP 4JR4A 2VL3A 1FVKA 3I9V2 3TRPA 5JCWA 4MF7A 4HQZA 3BCIA 1WOUA 1VF2A 4WR4A 2YWMA 3HKRA 5G2ZA 3VLNA 2H70A 2LRTA 1NHOA 1OC8A 4ECBA 3DGQA 4QL9A 1YKCA 2LEGA 1EP7A 2MMZA 2K8SA 3PR8A 2C8UA 3FR3A 5IMCA 1B9YC 3BOAA 5CRHA 1A8LA 4K0GA 1TOFA 3GUSA 1OAZA 1AIUA 1K3LA 3C8EA 2EC4A 2XHFA 1QMVA 5CYYA 4Q5FA 2F51A 3FZAA 1PL1A 1BG5A 1SKWB 2GQKA 3NOFA 1U3AA 3GTUA 2MMAA 3A5WA 2WULA 3IOSA 2MMOA 4JR6A 4MDCA 2JZTA 5DBQA 2WCIA 4POBA 3FKFA 4IVFA 4ZBDA 3D4TA 2OADA 2ES7A 4TR3A 1TU8A 3RPPA 4YQUA 2GDRA 4BVXA 2H0IA 2XPDA 1A0FA 4ZBAA 1ERUA 2H0HA 4GTUA 1RQMA 2H75A 2E0QA 2LRNA 1ZZYA 2PVQA 4QL7A 4TXOA 5D8IA 1T7PB 5GAPD 2C3QA 2DJJA 2MZCA 6GSXA 2DC5A 3EWLA 3TRQA 1ZL9A 3C71A 2JSZA 3WD6A 4FYBA 4BPYA 1AXDA 1SL0B 3KTBA 4QQ7A 4K6XA 2HZEB 2DMLA 4ZB9A 3W6GA 3VPTA 5G30A 1SL2B 2F8FA 3EURA 3KMOA 3UIWA 3ZZXA 5HR0A 1M9BA 3LJRA 4OFNA 1K3OA 4K8MA 4I5QA 5ID2A 1WRYA 3ZFLA 2LTKA 1G7OA 1K0NA 1MDJA 2EIQA 1TI3A 1PGTA 3ZRDA 2HT9A 5JCUA 5DAKB 5ENUA 4TVEA 1SKSB 1YZXA 2WB9A 3IHQA 1XPVA 5DCGA 4FYCA 2AB6A 4ZILA 3VI5A 1LU4A 3MNGA 4LLRA 5AIVA 4XCSA 1F37A 4G19A 2E2GA 1JFUA 2FA4A 3EINA 4BVYA 3BBYA 2B3SA 2EIOA 2P5RA 1XCCA 1FAAA 1KBNA 2WJUA 2O87A 4YAVA 1ILOA 3LEFA 2X99A 3IE3A 4TR0A 1J08A 2V6OA 4Q5RA 5CO3A 3OR5A 2YZUA 4MLYA 4MCUA 5COHA 1A0RP 1U3IA 1G0TA 3KGKA 2VL2C 2FY6A 3ZVJA 1GSYA 4E8EA 1VRSD 2QSIA 4I2TA 3TGZA 3I69A 4PUFC 3IBHA 2OBKA 2B1KA 1FB0A 5CRWA 3LXZA 1TRVA 4KSOA 5EPFA 2CAQA 3GKXA 1GUHA 3IK9A 2MBSA 22GSA 4XRDA 5DJMA 4RI7A 4JBBA 1HQOA 2CVBA 1XFLA 3CTGA 1TK5B 3ME8A 1E6BA 3GTUB 4TOPA 3UMAA 2GZPA 2AYTA 4EDZA 4V1Ap 3S9FA 2PMTA 4KB3A 2NPBA 1E2YA 3D0ZA 3BCKA 1B9XC 2GTUA 5CNWA 1T4ZA 4MPGA 1EZKA 2X64A 3VWXA 4HJ2A 1ZYEA 4HDEA 2D2ZA 2BTOT 1TW9A 2M80A 3GMFA 2OA7A 4NAXA 4F03A 2C0FA 3D21A 3H1NA 5C00A 1PRXA 2L59A 3HZ8A 3M9JA 5HR3A 3RHCA 3VPQA 1AC1A 1Y6EA 3GNJA 1KTEA 3G7JA 3MSZA 2H1DA 4HZ4A 4EUYA 1XWGA 4IQAA 3L9UA 1O6JA 3L4NA 4WBJA 4IGJA 1G6YA 2XBQA 5ECSA 1OKTA 2X8CA 1M2DA 1VF3A 4XS1A 3BJ5A 4EDYA 3G9BA 1DE2A 2ZUPA 5A4UA 4Q5QA 2FWGA 4F0CA 2ZCTA 5D96A 1ML6A 2RM6A 2CAIA 1A2MA 5E4WA 2KP1A 3QCPA 1K0OA 5ID2B 4DVCA 1OVNA 1EOHA 2VL2A 3GX8A 5A5KA 1PX7A 4H86A 3CSHA 4LA1A 1XW5A 3WGEA 4WR5A 1PMTA 3TDGA 2IJYA 1UC7A 3U6VA 3QR6A 4WETA 5H5RA 3LQ7A 5D73A 3DMLA 4POKA 3CRTA 3DIEA 4KSMA 3R2QA 4KAEA 5D9XA 3FW2A 2VD1A 3QPMA 1XZOA 3GA4A 5EY6A 5ECIB 2ON7A 2FWHA 4IW9A 3TOTA 4ZIJA 1HNBA 3KP8A 2VCVA 1XBSA 1PN9A 1AUCA 4KDYA 11GSA 2VLVA 1ZYQB 2MBTA 5HQPA 1XOAA 4ID0A 1TI1A 1KEBA 4NV5A 4RQRA 3M8NA 1GL8A 2YANA 3VURA 4GSSA 3F6FA 2CX4A 2QKEA 4BWSA 3ZMLA 2YV7A 5KEJA 2CVDA 3FYGA 1PKZA 1AQWA 5F0GA 5KN1A 2DJ1A 3GURA 2O8VB 3VK9A 3TKSC 5ECQB 5LD0A 2GT5A 4TRXA 4HEA2 1GNEA 1X9SB 2C80A 4N10A 2CQ9A 3LXTA 4NHZA 4TN8A 3M3MA 6GSUA 4HJMA 3DKSA 1NW2A 2YNXA 4XIHA 4KA0A 5DVBA 1V9WA 5DCHA 1YJ6A 3JCML 5J3RA 2IFQA 5D93A 2I4AA 5D9VA 1ST9A 4XS6A 3CYNA 1T3BA 3TUEA 1XWBA 4PQIA 3DWVA 3ZTLA 5IMAA 1USBA 2AUVA 2B1LA 1N2AA 5CP1A 2IMFA 2B5EA 3J7Yk 1HYUA 2GSTA 1ACVA 1JHBA 2H30A 4KH7A 2H19A 3IAS2 2DSAA 1EV9A 1G6WA 1Y25A 4JRRA 4NXIA 2C0DA 4OCFA 3LYPA 4HU7A 2H6ZA 4ML6A 4CW9A 4DSSA 3HVSA 1R26A 5B6MA 2VCZA 3LGCA 2C3TA 2CVKA 5G5EA 2VLTA 2HZFA 3TB2A 2RUFA 3CXGA 3TKQA 2YWNA 14GSA 4N0VA 5ELGA 3GH6A 2OKAA 2LJRA 3M9KA 9GSSA 2JACA 4NMUA 2R3XA 4HOJA 5ECLB 1FW1A 4J56E 3CBUA 4Z7XA 4LMWA 5B7CA 1BJXA 1M7TA 2B7KA 3ZIJA 2IL3A 2Z9SA 2OACA 1X5EA 1SJ6A 2L5LA 3DVXA 3IA1A 1Z5YE 4EF0A 5J5NA 1O7UA 4GRFA 1YKAA 1GLPA 2FCHA 1GSQA 5AIXA 3RPNA 4FYUA 2OE0A 3ZMKA 3Q74A 16GSA 2AAWA 1W4VA 2NBSA 2GQLA 4X43A 3IDVA 2L4CA 1HD2A 3NZNA 3DVWA 2BJXA 4G10A 4ECCA 5INYA 2HRFA 3UAPA 2PGTA 5DALB 2PUKC 1TKDB 3TJGA 1M2BA 2PERA 3F6DA 5H5SA 1OC9B 1GUMA 2L6DA 4ULXA 4YQMA 5IOXA 2R6KA 4XS4A 1LBKA 1JZRA 3QAGA 4MZBA 3A2WA 4N11A 3EYTA 2LJAA 3KM6A 1C72A 4D73A 1QGVA 2VCWA 5HFKA 1JZWA 2VD0A 1GUKA 1V98A 5ECNB 4GSTA 2K9FA 4MZWA 3P90A 7GSSA 3GH9A 2YWIA 3P8WA 3UBLA 4EE0A 3HDCA 3IPZA 5F06A 2MMNA 4HS1A 2RLIA 3C1SA 1YEXA 2H74A 3U5RE 19GSA 4L5LA 1BEDA 4V2LA 3FZ9A 1KNGA 3KH7A 4I6XA 3I43A 1O8WA 3LYKA 3IK7A 2NTOA 2TRXA 3E3EA 3TRXA 2AV4A 1U88A 4MABA 5FHIA 2P0GA 1YF0A 6GSYA 3VI7A 2QC7A 5IM9A 4YH2A 3N9JA 3FHKA 1WIKA 4K9ZA 3RDWA 1AQVA 3P2AA 2B7JA 2DIYA 2H72A 5ECRB 4OMVA 4KGIA 3ED3A 2ON5A 2WGRA 2R5GA 1UA5A 3DEXA 5LCZA 3DXBA 4PNGA 1A24A 2H0GA 2CT6A 4IHUA 5ECMB 4ZB6A 4IKHA 3CSJA 4RUVA 5GZZB 3FR6A 1F9MA 4TR1A 4XRAA 3ZITA 2R37A 4E8HA 1GSDA 2EIRA 3QDNA 2HXKA 2PWJA 4N30A 1URMA 2MYGA 4AJ6A 4LMVA 2C0EA 4NPBA 3MWHA 3QMXA 5ECHB 2YOIA 2LKUA 1FVJA 1QUWA 5IQYA 2H76A 1XOBA 1HNCA 2L6CA 4O32A 5B6NA 2OBIA 2HFDA 1YEPA 4KW6A 5JCGA 3PH9A 1GULA 1FOVA 2H6YA 2FLSA 3QFAC 3APOA 3CMIA 4JU5A 3QAWA 6GSTA 1HNAA 3KXOA 4FH8A 5A4WA 4K7NA 4YAPA 3DRNA 3ZIVA 5E59A 1YY7A 3N5OA 2VM1A 2V41A 5EVOA 1V58A 2H1BA 4G2EA 1WPIA 3M1GA 4MMMA 2O85A 3QAVA 4IBPA 1SU9A 2H8LA 4JEDA 2RIIA 5HFGA 4X0XA 4OD7A 3APSA 1GSSA 1YF1A 3KCMA 2VOCA 2YCDA 4WF5A 1ERWA 5HFIA 2PU9C 4TXOB 4OWYA 2E2MA 1I9DA 4EVMA 3RHBA 4MJEA 5J9CA 4XS4B 4GLTA 1ZMAA 4F2IA 1GTUA 4MPFA 3TCOA 3H4KA 4HI7A 2OE1A 2K8VA 4HUAA 1BYEA 2JL4A 3FZ4A 2YZHA 2B5XA 2L4QA 4I97A 3FR9A 1WMJA 3F8UA 3F3QA 4XHMA 4MJAA 3EMXA 2WFCA 1SD8A 4K7IA 2IMEA 5F05A 3D5JA 13GSA 5ABRA 4JZQA 2WZ9A 4ML1A 2JZRA 1GSUA 5IMVA 1GH2A 1ON4A 2LRCA 1JZDA 2DMMA 2FHEA 2F8AA 3KMNA 3GL5A 5IPHA 4OFTA 1R5AA 4AJ8A 1SYXA 3HA9A 2CA8A 2FGXA 2HE3A 1IYHA 2M46A 3WGXA 3M0FA 4RI6A 4CHSA 2C4JA 2GLRA 3F63A 1F3BA 3GHAA 4PUAA 2LQQA 1Q4JA 2IMIA 3UJ1A 1OYJA 1T4YA 1W89A 3FZ5A 3HCZA 3F0IA 3O76A 2HLSA 3TKSE 4V1Ag 4ZXGA 2HYXA 2JU5A 2N5FA 1PQNA 2B5YA 1SJZA 2GSSA 1F2EA 4IS0A 1EOGA 4O5RA 1R5PA 4L8EA 2H66A 4J57E 6GSVA 1S3AA 5CRGA 3ZVJD 2LS5A 4BWQA 5AGYA 5IMFA 1NSWA 3GKMA 2VLUA 3O6TA 5JWOB 4ACSA 3GX0A 4TR1B 3SWLA 3I6AA 2K18A 1QQ2A 3D6IA 2YWOA 1O81A 1XIYA 6GSSA 1TRSA 1GLQA 4Q5NA 1X9WB 4KDXA 1TDIA 5IO0A 1V2AA 1Z7RA 2V32A 2IWTA 2GT6A 1U87A 4PQ1A 4L5OA 5H5QA 3GKNA 2M72A 1MTCA 1QFNA 2BMXA 20GSA 1AW9A 1R7HA 1CQHA 3MAKA 2IIYA 4TR4A 2QGVA 3EU3A 5IMZA 2KP2A 1BAYA 1CQGA 4XTSA 1XWAA 4AJ7A 3ZREA 4WXTA 2KUCA 1Z6MA 3IAM2 2HZEA 2ZNMA 1TTZA 2JSYA 1H75A 3EC3A 5ECOB 4OFMA 4I8BA 2FD3A 2H73A 2AHEA 3W8JA 2G2QA 4GF0A 1EEJA 2O89A 3WT2A 3QFBC 5DAKA 2PPTA 5G1LA 3CSIA 3HJOA 4NHWA 5D9TA 4O7HA 1BX9A 1GTBA 3VWVA 1SENA 1THXA 2LSTA 4RQXA 1VGLA 3WGDA 2I3YA 3NIVA 1T00A 3F4SA 1SYRA 4P3YB 1PD21 3TJKA 3D4MA 3KIJA 4GQCA 4F82A 3WT1A 2GZYA 2A2SA 3GSSA 5ECKB 2DJ2A 3APQA 4AF2A 1F6MC 3CTFA 3CRUA 3US3A 3UVTA 1SK2A 4MZCA 1A23A 2NDOA 2L57A 3SBCA 2YN1A 1FHEA 4EXJA 5B8BA 3IR4A 2H1GA 2IPAA 1PX6A 5KN0A 1QXHA 3HY2A 1DBYA 1MEKA 4PQHA 2J23A 3QD9A 3J7Yb 4K0NA 4PNFA 5D9WA 3PGTA 3L9SA 4JE1A 3LFLA 4DEJA 4OCEA 4BA7A 3A2XA 1SD9A 2H6XA 1VF4A 3H79A 5B8AA 1XW9A 2WS2A 1WJKA 3L78A 1Z3EA 4ECIA 3GV1A 5IPGA 3TKSA 1O8XA 1T1VA 1OC3A 2LQOA 4MA9A 3HVVA 1T8EB 1AQXA 1NHYA 2GQMA 2HI7A 1K0DA 1O85A 1M0UA 4LL1B 2A2RA 3E9JB 1O73A 5IIZA 2H01A 3G7YA 2KLXA 1EEMA 1MDIA 4ZL9A 4G9HA 4PX1A 2IN3A 1K3YA 3RAZA 2LNSA 3F3RA 3HJPA 2VIMA 1U6TA 2AJQB 2HRNA 5GSTA 5GAND 3K8NA 1GTIA 3LORA 4EKZA 4WKWA 4TKYA 1WP0A 2VCTA 1A2JA 3TJJA 1VF1A 3KD0A 2R4VA 3P7XA 1IYIA 2RUEA 3MDKA 1B4QA 1SK1A 1B48A 2WRTA 3ZL5A 1ERTA 1PSQA 3Q18A 3TOUA 4PURA 4ZB8A 3GFKA 4L0UA 4ECJA 2DJKA 3F9UA 1BQ7A 2E7PA 2C0GA 1QK8A 3GRXA 5KN3A 4HU9A 2IFQB 4N0ZA 5J41A 4I2UA 1DE1A 3G7IA 2WDUA 5A4VA 3ISOA 1NM3A 1V40A 2KOKA 2DJ3A 5DJLA 3LWAA 5DQSA 4YQVA 2FWFA 1ABAA 2FNOA 4GXZA 5G1KA 5G31A 3UOMA 2VL9A 4KX4A 3A2VA 1UN2A 4EC0A 18GSA 3IV4A 3IRAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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