4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp. pga64
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
2XLUA 2QAEA 4RSLA 1E39A 3VR8A 3DJGX 2RGJA 3CGEA 1N4VA 5KOXA 1N4WA 1ONFA 4NTDA 1PHHA 3LXDA 4YSXA 4IV9A 2BC0A 3H4KA 3M13A 1FEBA 1CBOA 2ACZA 2YLRA 4HA6A 2QA2A 1GESA 4YSHA 4EM4A 1CJCA 3ABVA 3ATQA 3D1CA 3QVPA 4U8KA 5FS8A 1QLBA 5FS6A 2WU5A 4UDPA 4ECHA 2BK4A 2WU2A 2GB0A 3DGZA 4LIIA 2Q7VA 4GDPA 1LPFA 2XLPA 2E5VA 1K4QA 4H2NA 4YKFA 1GETA 4H2RA 3FIMB 3AYIA 2XDOA 3CTYA 3NT6A 3C4NA 4CBQA 1ZOVA 2JAEA 2C3CA 1EL9A 2RGOA 4JY3A 1YQZA 4O5QA 5GRTA 3UP4A 4AOSA 3RHAA 1JNZA 3AE8A 4BK3A 2YAUA 2BACA 2EQ8A 3NN6X 1V59A 4Y4LA 2Q6UA 4N9XA 4OPTA 3RP7A 4BJZA 3UKFA 4E0VA 2GRTA 1CC4A 1DOCA 1REOA 2VVLG 4TLXA 4C74A 4ZN0A 2NVKX 3P4SA 3E1TA 3NGCX 2EQ6A 1ZX9A 2APGA 4D03A 5KRQA 4U8NA 1EL7A 1JOAA 2WEUA 3I3LA 3NNEA 3GD4A 2TPRA 5BRTA 3NIXA 2ZZBA 4TM3A 2A87A 3AECA 4KX6A 2WDQA 5M10A 3GYJA 5FS9A 1PBDA 1E1LA 1TYTA 1IJHA 2AQJA 2XVFA 2ZZCA 3RP8A 4YSZA 2A8XA 3GWFA 4EQSA 2WDRA 5JCIA 2X50A 4J56A 5KVHA 4NEWA 2X8GA 1KDGA 3EAOA 3IHGA 2ZZ0A 3R9UA 1TDKA 3AEGA 1GXFA 3KPFA 4REKA 4XWRA 3CPJG 4B67A 2AAQA 3CNTA 1L9CA 3AYJA 4PAAA 4JQ9A 2ARDA 3UP5A 3KU9A 3SFEA 4K8DA 3Q6JA 3WE0A 4YWOA 1RSGA 4CY8A 1K0JA 3OC4A 4U8OA 2VQ7A 1GRGA 1OJTA 2BS2A 2GF3A 3M12A 4I59A 2IVEA 2B7SA 1Q9IA 2XVIA 4DNAA 4OPCA 3SGLA 4U8LA 2WOWA 1NEKA 2FJBA 2EQ7A 5KWFA 1F3PA 4H4ZA 4H4YA 1H7WA 3AEAA 3ZYXA 4GRTA 2V60A 2BC1A 3UKHA 1LQTA 1NHSA 3NG7X 1PBEA 3IWAA 1IUUA 1O5WA 2WHDA 2BCGG 2V3AA 4UDQA 4EIQA 1PJ5A 3UKAA 4Z2UA 2R4EA 4B65A 2YR4A 5JCLA 3QVRA 3ALMA 3F8PA 2XFPA 1GRAA 3IF9A 3OZ2A 2GR1A 4PABA 2R9ZA 2XFOA 4ADWA 3AE6A 4A7AA 2X8HA 2Y6QA 4JNAA 2QA1A 1H84A 3NLCA 1L0VA 4H2QA 1JNRA 3UKKA 1K0LA 1DNCA 4NEVA 1E7PA 4LU6A 4TM4A 3NH3X 3EANA 1P2HA 3H8IA 3LOVA 4B66A 2HQMA 2RGHA 3B6DA 2XFUA 1RP0A 2B9XA 3KLJA 1NPXA 3CN8A 3RP6A 1H81A 1ZDLA 4I58A 4H4TA 1KNPA 1KSUA 1XPQA 3ICTA 4CCQA 3VRBA 1Z6LA 1BGNA 2XLTA 3CGDA 1Y56B 4OPUA 1EL5A 4YSYA 4Z26A 2O9ZA 3DH9A 4Z25A 4K5RA 2V5ZA 2XVEA 3LZWA 3UKLA 3SQPA 4GUVA 3AE3A 5C3JA 2J3NA 2V61A 2ZBWA 5IPYA 1ZY8A 2JBVA 1VDCA 2Z5XA 2R0CA 4U8JA 3GMCA 4Y4MA 5J60A 1E1NA 4TLZA 3FPZA 3COXA 1GRHA 3HZLA 4DGKA 5EB4A 4USQA 1SEZA 3CPIG 3DMEA 2FJDA 1XDIA 2AR8A 5EBKA 2V6OA 1DXLA 3AE7A 4RG3A 5ER0A 4U8MA 1FEAA 5JCNA 1H83A 3FBSA 3QSEA 1ZP0A 1B5QA 2R46A 3GRSA 3AEEA 5EOWA 1IUWA 3ALJA 1DJNA 4H50A 2EQ9A 3F8RA 5U25A 2BXSA 1FOHA 1TRBA 3AD8B 1AOGA 1BKWA 1PBCA 1ZMCA 1JEHA 2C7GA 3NTDA 3UOXA 2E4GA 1QO8A 2WP5A 3VRDB 1H86A 2PHHA 3AEFA 3KA7A 2Z5YA 3Q9TA 3K30A 2YG5A 4IA6A 3UTFA 2XFQA 4H4UA 4M52A 2B7RA 2R0PA 2X3NA 4AT2A 1VQWA 4Y4NA 3NYEA 3VQRA 3QFBA 4YT0A 1NENA 1GALA 1NHPA 3DK8A 2OALA 4HB9A 2VRLA 2CULA 3ITJA 2GMHA 3CGCA 1KSSA 3CGBA 4C5OA 3DGHA 3AE1A 4X9MA 2GR0A 3UOYA 2B9WA 5KXJA 3ZDNA 2GAGB 3QSSA 4LA1A 4OPIA 1OJDA 5BULA 1ZMDA 2BYBA 5JCMA 3AB1A 4FX9A 3AE2A 1K0IA 5TR3A 2XVHA 2VVMA 4CRTA 1VRQB 1DODA 4OPDA 2BS4A 1O94A 1D5TA 1GT8A 1YQ3A 4MJWA 4K22A 4TM0A 1H7XA 5HYMA 1DJQA 1Y0PA 5FS7A 4KPRA 5HHFA 4FK1A 4Z44A 4BK1A 2GR2A 2C76A 3KVEA 4J31A 3GDPA 3AE5A 3RNMA 1TDEA 2DKIA 1GRFA 4J33A 2OAMA 4B64A 2YLSA 2GR3A 2GAHB 3NN0X 1MOKA 3H8LA 1YQ4A 2VVLA 1BGJA 1S2QA 4H2PA 3BI2A 3UCLA 4EQRA 4H4PA 3DK9A 3CNPA 5GSNA 5FMHA 2JK6A 3F8DA 1COYA 4A6NB 1MO9A 4ICYA 1OJAA 5DBJA 4BV6A 2VOUA 3GD3A 3AYLA 2GV8A 3DK4A 5C2TA 3PS9A 1CJ4A 1NHQA 3ALLA 4OPGA 5L46A 3ICSA 4U2LA 3AD9B 2WDVA 2YLTA 3B3RA 3SFDA 5LV9A 3P4PA 1N4UA 1IUTA 2JKCA 2C70A 4UDRA 4Z24A 3CIRA 2OLOA 5CKUA 4A5LA 1PDHA 2BS3A 2YM2A 4YTNA 1DOEA 2C66A 4IA5A 4EQWA 3S61A 4AP3A 2C73A 2BA9A 4NTCA 2R0GA 4JY2A 1GRTA 3CNJA 4A6NA 4AP1A 3NK1X 1B8SA 1XANA 2FJAA 3UTEA 3DJEA 3S5WA 1EL8A 3BNUA 1GV4A 3LZXA 1TYPA 3LB8A 1GTHA 4H7UA 1L9DA 1KNRA 3UKQA 2B76A 3VR9A 4U8IA 1GTEA 2YWLA 3GYIA 4WX1A 5BUKA 3UOZA 1F8SA 1TDFA 3DJDA 5U63A 3BNMA 2WQYA 1PBFA 1H6VA 1JRYA 1TDOA 1PJ7A 2F5ZA 2Y6RA 3ATRA 3P1WA 4J57A 4APNA 4OCGA 4YKGA 4K5SA 2E1MA 1E1KA 1PXAA 2XYOA 3V3OA 1GSNA 2YR6A 2YVFA 3P4QA 3KKJA 3NRNA 5IQ1A 1D4DA 4GCMA 1JRXA 2H89A 2YLXA 1FECA 2VRMA 3SM8A 5KOWA 3KD9A 3NHOX 1OJ9A 2XLSA 3L8KA 4B68A 3JSKA 4A65A 3AEDA 4GF7A 4Z2RA 2GMJA 2YR5A 2BXRA 2H88A 3AE9A 5M0ZA 1BZLA 5CQFA 1Y56A 4C77A 3M0OA 1IUXA 2DKHA 2PYXA 1B37A 3G5RA 3P4RA 1BWCA 2X8CA 2VQBA 2FJEA 2WETA 1S3BA 1PXCA 2C64A 3NKSA 1M64A 3VRAA 1F8RA 4JDRA 5HXIA 1NAAA 4YTMA 1GOSA 4OPLA 2I0ZA 3NK0X 1CJ3A 2GVCA 3AE4A 2C65A 3C96A 4K7ZA 4X4JA 2YM1A 3GDNA 1PJ6A 4K2XA 1LJ1A 2Q0LA 1GERA 4ZCCA 2WPFA 5IQ4A 5U1OA 1QJDA 2QCUA 2JB2A 2WOIA 1LTXR 4EMWA 2CVJA 4BURA 3BI4A 1GRBA 4J34A 3CNSA 1E6EA 1CJ2A 2Q0KA 3DJJA 3II4A 4U2SA 1KF6A 4FDCB 1LV0A 4H4RA 5J7XA 1YKJA 1D4CA 2R4JA 2C67A 1CHUA 2WPEA 3QJ4A 2GQWA 4IVMB 4WCTA 1ZK7A 4H4XA 2IVDA 5BVAA 2OLNA 4O5UA 2OA1A 3GMBA 4D04A 4NTEA 3GSIA 2X99A 1F6MA 2XVJA 2YVGA 3UOVA 4J2WA 5HY5A 1IUSA 3G5QA 2IIDA 2V3BA 4IVOB 1LQUA 1VG0A 3K7MX 2YLWA 3D8XA 5EB5A 3K7QX 1CC6A 3BI5A 1NG4A 2WS3A 2YVJA 4Z43A 1S3EA 2BK5A 4FK1C 1H82A 3CPHG 1XHCA 2BABA 3UTGA 1GREA 1W4XA 1O95A 1P2EA 3PO7A 4EMIA 1DOBA 1Q1WA 2BCPA 2RABA 3O0HA 4EIPA 4OVIA 1E1MA 5KVIA 3UKPA 4AT0A 4YTPA 2YLZA 1NDAA 4ZCDA 1OJCA 3AWIA 3NTAA 1F8WA 4EM3A 2XLRA 2JB3A 3T37A 3QSMA 1S2YA 4XWZA 2JB1A 4J36A 3URHA 1GPEA 4GR1A 1NHRA 2YG4A 3PVCA 4H4WA 1BF3A 3NYFA 4X9NA 4XXGA 1YY5A 4GDEA 5JCKA 3G5SA 4Z2TA 3GRTA 2YG6A 3K7TA 1JU2A 1UKVG 1PN0A 3AXBA 3EPTA 4TM1A 1LVLA 1MXTA 3DA1A 4JN9A 4B63A 3BHKA 3CNDA 1CF3A 2A89A 2WP6A 4DSGA 1RYIA 4EQXA 2XFNA 1NG3A 1ZKQA 1GNDA 1HYUA 3ICRA 3REDA 3FMWA 4CNKA 2YQUA 3V3NA 4A79A 4H4VA 3QFAA 2WESA 4CY6A 3ADAB 3AD7B 2W0HA 3AEBA 2YG3A 1FL2A 3LADA 2YG7A 1PXBA 1X31B 1GEUA 1L9EA 2XCGA 4U8PA 4C3YA 4BK2A 2C72A 2GEWA 4UP3A 1EBDA 1D7YA 1N1PA 2VZ2A 4C3XA 3LJPA 4H4QA 1PS9A 1CL0A 3GWDA 3IHMA 1D7LA 2NPXA 3L1RA 4U2TA 1D4EA 4DSHA 1IUVA 3NK2X 1ZOYA 2R45A 2WP9A 3C4AA 2C3DA 1Q1RA 2UZZA 2B9YA 4JNQA 4CNJA 2WOVA 1ELIA 3IC9A 3EF6A 3NYCA 4EMJA 2GQFA 1VG9A 3V76A 1M6IA 2WBAA 4A9WA 3UTHA 2CDUA 4B1BA 1TDNA 3BHFA 1PBBA 2C75A 4BJYA 3FG2P 2FBWA 2GH5A 1JRZA 3P9UA 4H4SA 2CFYA 3ISHA 4A99A 4P9SA 4USRA 4CCRA 4AOXA 1CC2A 1B4VA 4YXDA 1FCDA 3I6DA 4RG4A 4NZHA 2TMDA 2WPCA 2BK3A 4B69A 1KFYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XLUA 2OADA 4OFTA 3VR8A 4G73A 1N4VA 4F9ZA 1N4WA 1PHHA 4YAVA 5IMCA 3FR6A 1ERTA 5AIXA 2BC0A 4HA6A 1CBOA 4U8KA 1EV9A 3VWWA 2GVPA 4ECHA 2YCDA 3TJBA 4MP4A 1FHEA 2GB0A 3I6AA 3DGZA 1GTBA 2NVLA 4WR4A 1XWGA 1GETA 4H2RA 3BCIA 2O89A 1ZOVA 2C3CA 4MK3A 1MD4A 1NHYA 1YQZA 2VLTA 1TP9A 1AW9A 3RHAA 4V2NA 5KMPA 4OPTA 2ALBA 4BJZA 3GX8A 1VGLA 4E0VA 1DOCA 1REOA 2VVLG 1AUCA 4C74A 1M3JA 1ZX9A 4D03A 3BOAA 1EL7A 2FGXA 5IMDA 3I3LA 5BMUA 2JZRA 3GD4A 3ZLPA 3NIXA 2ZZBA 6GSTA 3HYXA 3W8SA 3RP8A 2AQJA 5IMAA 1TU7A 3L9VA 2LQQA 2C80A 3F4TA 2PWJA 2X50A 4NEWA 4K0GA 2ZZ0A 3R9UA 3WT1A 2H1DA 3KPFA 4DEJA 4B67A 5A4WA 2K18A 1L9CA 3AYJA 5ECHB 3WE0A 1EEJA 1OC8A 4CY8A 2DIYA 3TKSE 2VQ7A 2BS2A 1LBKA 1ZGNA 3CBUA 4IQ1A 3WD6A 3G7JA 4DNAA 3KTBA 4OPCA 1VF3A 1NEKA 4V2LA 4H4ZA 4GRFA 1OE7A 3ZYXA 4MF5A 2VL2C 3LQ7A 4GSSA 5A4VA 2V60A 3LSZA 1NHSA 1IUUA 3I9V2 4DSRA 4UDQA 2YR4A 4NMUA 4J56E 3OZ2A 2R5GA 1F6MC 2R9ZA 1BYEA 2XFOA 4ADWA 3G7YA 4FQUA 1FAAA 3FRCA 2R3XA 1ZYEA 4HQZA 3HHVA 4NEVA 1GTAA 4G9KA 4TXOA 3EANA 3LOVA 2IIYA 2RGHA 2XFUA 1RP0A 2B9XA 3RP6A 4I58A 5DBQA 1KNPA 4KCEA 1UC7A 1SJ6A 4L0WA 4N0ZA 4YSYA 2HSHA 2XLTA 3Q74A 2O9ZA 1GUHA 3TDGA 3DH9A 1PL1A 4ZILA 4KSOA 3PPUA 3SWLA 3LZWA 2GTUA 3GSSA 4K7OA 3UL3A 1EGRA 3AE3A 1ML6A 5C3JA 5IPYA 3GV1A 2WJUA 2JBVA 1VDCA 1M0UA 2FY6A 5KMRA 4U8JA 2YN1A 4TR1A 4TLZA 3COXA 5J41A 2EC4A 3DMEA 2FJDA 5J3RA 2VUPA 1XDIA 2AR8A 5ER0A 2C1YA 1SL1B 4KUNA 4U8MA 1PMTA 4MJEA 1H83A 1Y25A 2PGTA 2D2ZA 2JZTA 2N5FA 3SY4A 2B5XA 3KTLA 2CVKA 3KM6A 3EU4A 1K0NA 1FOHA 5D9VA 3DMLA 3FY7A 1PBCA 1JEHA 1B4PA 3GUSA 2WP5A 1QO8A 3VRDB 3LORA 3KA7A 3K30A 3HKRA 3KMOA 3GH9A 3DEXA 3UTFA 4BA7A 1M2BA 4H4UA 2R0PA 4ULXA 3T2YA 2CV4A 3DK8A 3E0UA 3IAS2 3ZVJD 5B8BA 1SKRB 3ITJA 1T4YA 2H0HA 2BTOT 1FVJA 4KW6A 4C5OA 3GA4A 3ZDNA 5DJMA 1SKWB 1PD21 1TK8B 1ST9A 1GSQA 4XS4A 5JWRB 4EKZA 3AE2A 2XVHA 3GKMA 4CRTA 3FZ5A 19GSA 1O94A 3UAPA 3TKQA 2I3YA 4MLYA 3F3RA 3C73A 4IHUA 5B8AA 4BVXB 1WOUA 4KPRA 3EU3A 5AISA 2P0GA 3KVEA 3BD2A 4J31A 3GDPA 3AE5A 2HRKA 4KSMA 2OAMA 2YLSA 1V2AA 2GSTA 1S3CA 4QL7A 3VWVA 2VVLA 1S2QA 3BI2A 4OO4A 4EQRA 3M3MA 5FMHA 1MO9A 4PQIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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