4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptomyces sp. pga64
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
2JB3A 3D8XA 2AR8A 3VRAA 1DNCA 2GR3A 4KX6A 1TYPA 1OJ9A 4YSHA 3EPTA 1E39A 4H4QA 3IHMA 2DKIA 2Q0KA 4J56A 4A65A 1PJ7A 3BHFA 3DA1A 4OPGA 2VRLA 3QVPA 2GEWA 2VQ7A 3V3OA 3AXBA 2VOUA 2V5ZA 3S61A 4XWZA 4H2PA 4GF7A 2ARDA 4AT2A 3B6DA 4Y4LA 1JNRA 2Q6UA 1GRFA 2Q0LA 4U8PA 3AYIA 1JNZA 3EANA 1FL2A 2RGOA 3AE6A 2YG5A 5EB4A 2YLSA 4U8MA 3CGEA 1CL0A 4LU6A 4NEVA 1OJDA 5JCKA 2C3DA 2QCUA 3ABVA 3UTFA 2Z5XA 2VZ2A 3RHAA 4Y4MA 4ZCDA 1M6IA 3UKKA 4U2TA 3DGHA 1O5WA 1FEAA 3NN0X 4CY6A 2IVDA 4EM3A 3II4A 4NEWA 4B1BA 4REKA 2BC1A 3AEAA 3P9UA 3NIXA 1QO8A 4Z2RA 2BS4A 3P4RA 5EBKA 4AOXA 1K0LA 2E1MA 2XLPA 4H4WA 1N4VA 3PVCA 3F8PA 4APNA 1REOA 2R4EA 5HHFA 1GPEA 2XDOA 2CULA 4OCGA 1NAAA 4U2SA 4DSGA 5C3JA 1KF6A 2QA1A 1E7PA 5FS6A 1PJ6A 3I3LA 1D4EA 2BA9A 2J3NA 3NTDA 4FK1A 3SGLA 5KVHA 1ZOYA 2GV8A 2NVKX 2CFYA 2C76A 1F3PA 1NDAA 5KOWA 1QLBA 2OALA 1GT8A 2JBVA 2JKCA 1LPFA 5FS7A 3B3RA 4AP3A 2C66A 3G5SA 2Y6RA 3HZLA 2ZZBA 4J31A 5IQ4A 3AEGA 3M12A 3CTYA 4CBQA 3GRSA 4TLXA 3P4SA 3ICRA 4YTPA 1H81A 1KSUA 3Q6JA 1MO9A 3ADAB 3E1TA 3K7QX 2WP6A 4WX1A 2BS2A 3ICSA 1EL5A 4JY3A 4CCQA 1CHUA 1IUTA 2FJDA 3QFAA 2ZBWA 3ISHA 3PO7A 4GRTA 4IVMB 1EL7A 1CJ3A 4EQXA 3H8IA 2YQUA 2XLTA 3KLJA 2R0PA 1IUWA 1D4CA 2GAGB 3ALLA 3DJGX 4TM0A 4ADWA 2YM1A 4D04A 4ZN0A 1H6VA 4Z2UA 4J57A 3QVRA 1NEKA 2BCPA 3UTEA 5J60A 3LB8A 4BK2A 3AD9B 4NTDA 1NHRA 2YLZA 4PABA 5TR3A 3UTGA 4DNAA 2YVJA 3CPIG 2V3AA 4CCRA 3NYCA 4H4ZA 1IJHA 4ICYA 3AE8A 1RSGA 4FDCB 1TDOA 2Q7VA 3OZ2A 4J33A 3BI5A 3CGBA 3GRTA 4K7ZA 2C72A 3LXDA 2C75A 4C3XA 1FECA 1PBEA 3CN8A 4U8IA 3Q9TA 1XHCA 3NYEA 1NENA 4BV6A 1JEHA 2XVEA 1YY5A 3UKLA 1V59A 4EQSA 2R0CA 2C7GA 2H88A 2R9ZA 2V6OA 4I59A 5FS9A 1B37A 1P2EA 5FS8A 3R9UA 3WE0A 1K0JA 3LADA 1F8RA 2JB1A 1FOHA 2GMHA 2XVJA 5J7XA 4NZHA 2XVHA 4H4UA 2YR5A 3NTAA 4ECHA 1YKJA 1ZP0A 3ITJA 3GDNA 2VVMA 3ATQA 1S3BA 4X9NA 3UCLA 1L9EA 3UOVA 1JRZA 1H84A 3AE4A 4DGKA 1OJCA 3AEEA 1LQTA 1ZDLA 4C74A 3CNPA 4B67A 1QJDA 4N9XA 3EF6A 3C96A 1O94A 1S2YA 4H2QA 2XLSA 2BS3A 3SQPA 5U1OA 3UKAA 4YTMA 1XPQA 2C3CA 2GRTA 3M0OA 2XFOA 2Z5YA 4U8OA 2C73A 3CNJA 4H4SA 1DOBA 3UKPA 4OVIA 2R4JA 4A99A 1IUVA 5DBJA 1NHQA 1DJQA 3AE3A 3CGCA 4ZCCA 3DK8A 1PBDA 1BKWA 1CC4A 4H4YA 2HQMA 2YAUA 3GWDA 5BUKA 3KPFA 5JCMA 4IVOB 4H4XA 2GF3A 2YG6A 4OPIA 4BJYA 1ZKQA 1N4UA 1GOSA 3NK2X 1COYA 1GSNA 2ACZA 2WOWA 5KOXA 4HA6A 2UZZA 4A7AA 1PXBA 1IUUA 1GRGA 1ZMDA 2GH5A 4B66A 1NPXA 2GB0A 4I58A 1S3EA 1CBOA 4GCMA 4UDQA 4BURA 1E1LA 1GTEA 3F8DA 4B64A 2YG4A 2FJBA 1EL8A 3ATRA 3UOXA 2GMJA 4USQA 4A79A 4LA1A 1SEZA 3UTHA 1D7LA 5KXJA 1FCDA 1IUSA 3NRNA 1LJ1A 1NHPA 3UOZA 2WETA 3AB1A 3CGDA 2YR6A 4Y4NA 4JDRA 4RG4A 4O5QA 5C2TA 4Z43A 2WU2A 4TM3A 3P1WA 2B9XA 2XLUA 4NTCA 2R45A 3L1RA 3FMWA 4C3YA 1PXAA 1TRBA 1YQ3A 3NK1X 3RP6A 5IQ1A 3T37A 2I0ZA 3CPHG 4FK1C 3IWAA 3G5QA 2VRMA 2GR1A 2TMDA 4H4TA 2X8HA 3P4PA 4J36A 4EMJA 1Y56A 1BF3A 3SFDA 4DSHA 4C5OA 2BCGG 3BNUA 3DH9A 4JNAA 1JRXA 4U8KA 4UP3A 2WPCA 3UP4A 1LTXR 5GSNA 3QSSA 2XFQA 3VRDB 5JCNA 1GNDA 1X31B 5L46A 4B65A 3CNDA 4GUVA 2C70A 4AP1A 3K7TA 5U25A 3GDPA 1TDNA 2YWLA 4FX9A 1CJ2A 5ER0A 1PHHA 4UDPA 1CC6A 5GRTA 1BWCA 4EMIA 4P9SA 4GDPA 4EMWA 1EL9A 2BYBA 3K30A 3QSMA 2B7RA 3V76A 1E1MA 4H4VA 5CQFA 4C77A 3DK4A 3S5WA 2OLOA 2QA2A 5FMHA 4BJZA 3AEFA 3AD7B 3GYIA 4K5SA 5BRTA 4CY8A 2GR0A 4UDRA 5BULA 1ZX9A 4YSZA 2XLRA 1GRBA 2WBAA 1ZY8A 2FJAA 3VR9A 1GESA 2NPXA 4TLZA 4K5RA 4H7UA 4GDEA 1BZLA 1E6EA 3GYJA 5U63A 3DGZA 1XDIA 2WS3A 1DXLA 5KVIA 4CNKA 1UKVG 3AEBA 4U8NA 3DK9A 3F8RA 3AEDA 4J2WA 2E5VA 1CJCA 1MXTA 2EQ6A 1ZMCA 2BK4A 1GTHA 3H8LA 2X3NA 3DMEA 5JCLA 3AE7A 4OPLA 2C65A 4H4PA 2C64A 3OC4A 3AE2A 2V3BA 3FIMB 1TDKA 1KNRA 1FEBA 2X8CA 2OLNA 2A87A 1Y56B 4H2NA 4TM4A 4Z24A 4YSYA 4K2XA 2BK5A 1D4DA 2B9YA 1Q1WA 2YG7A 3AE1A 3NKSA 4U8LA 1ONFA 1PBFA 2VQBA 3IF9A 4IA6A 1GREA 3KA7A 4HB9A 4JY2A 4XXGA 5JCIA 4TM1A 3LJPA 1Z6LA 3REDA 4GR1A 5M0ZA 3UOYA 4JNQA 3C4AA 3KD9A 2E4GA 1NG3A 1KSSA 1MOKA 3GMBA 1B4VA 1RYIA 2GQFA 3LOVA 3NGCX 3QFBA 3SM8A 1GERA 3NN6X 3QSEA 4E0VA 3RP7A 2O9ZA 2WQYA 1ZK7A 2WPEA 2WESA 3BI4A 4OPDA 5HYMA 2WP5A 1CF3A 4RG3A 3ZDNA 4X4JA 3AYJA 4CRTA 2WOIA 3I6DA 3L8KA 1KFYA 4USRA 1HYUA 3DJDA 2B9WA 1YQ4A 2PYXA 3COXA 3FBSA 2YR4A 2GQWA 4YKGA 2YM2A 3O0HA 2GR2A 3VQRA 3AD8B 1H86A 2WU5A 2RGJA 1GV4A 5CKUA 2GAHB 4B69A 3BI2A 1IUXA 4YT0A 3KU9A 4Z26A 4H2RA 4BK1A 1B8SA 1LVLA 2Y6QA 2XVIA 5HXIA 5KWFA 1RP0A 2QAEA 1JRYA 2YG3A 3AE9A 3NK0X 5EOWA 3AE5A 2DKHA 3BHKA 3D1CA 3QJ4A 1KDGA 4JN9A 2JB2A 4JQ9A 1K0IA 2OAMA 1Q9IA 3P4QA 1JU2A 1OJTA 1LQUA 2BACA 3CNTA 2AAQA 3NT6A 4O5UA 2XFNA 4NTEA 3JSKA 2ZZCA 3GD3A 2IVEA 4A9WA 4YXDA 4H4RA 2CDUA 1PJ5A 2EQ8A 3ALJA 3CNSA 2YVGA 2V61A 2WP9A 2YLRA 2H89A 4AOSA 2FBWA 1L9DA 1PDHA 4EM4A 4AT0A 4K22A 4XWRA 4M52A 2JK6A 1L9CA 1N4WA 2APGA 1PBBA 3GSIA 1DOEA 1F6MA 3LZXA 3NNEA 1F8SA 3ALMA 1PBCA 2WDVA 5KRQA 3BNMA 1Y0PA 1W4XA 1H7WA 2RABA 2YLTA 3NYFA 1M64A 4J34A 4IA5A 3M13A 1ELIA 1F8WA 2EQ9A 4RSLA 1P2HA 1NG4A 3NH3X 1DODA 4A6NA 1H7XA 2CVJA 3ICTA 5LV9A 2F5ZA 2R46A 1ZOVA 1N1PA 3DJJA 3UKHA 2XCGA 1AOGA 2WOVA 3AWIA 3DJEA 2A89A 2XFUA 4KPRA 1DJNA 1O95A 5EB5A 1NHSA 3VR8A 3NHOX 2W0HA 1VQWA 4CNJA 1OJAA 2IIDA 2X8GA 4IV9A 1GRHA 4EQWA 3SFEA 2VVLA 2ZZ0A 4YKFA 4U2LA 2VVLG 1D5TA 2A8XA 3URHA 2AQJA 2B7SA 2V60A 3NG7X 3PS9A 1L0VA 1K4QA 3C4NA 1LV0A 2XYOA 4MJWA 4B68A 1E1KA 1GETA 3K7MX 4U8JA 1CC2A 1KNPA 1VDCA 2XVFA 4BK3A 3RP8A 4Z44A 1CJ4A 1JOAA 2EQ7A 2OA1A 4OPTA 3FPZA 1VG9A 3AECA 3KVEA 1YQZA 2WPFA 2WHDA 1VG0A 1TYTA 2BK3A 3GD4A 3GWFA 4EQRA 3IC9A 2XFPA 2YLXA 4YTNA 2BC0A 1H82A 1PXCA 4B63A 1BGJA 1PS9A 3GMCA 3UKFA 4OPCA 5IPYA 2BXRA 2BXSA 3IHGA 1XANA 1BGNA 2GVCA 3FG2P 2WEUA 1H83A 1GRAA 1PN0A 3LZWA 3AYLA 3H4KA 4A5LA 1B5QA 5BVAA 3UP5A 4Z25A 2TPRA 5M10A 1S2QA 4H50A 3CPJG 1E1NA 2C67A 1GXFA 2FJEA 1GALA 3CIRA 4WCTA 4PAAA 3EAOA 4A6NB 3ZYXA 3UKQA 2YLWA 2X50A 3G5RA 1TDFA 2R0GA 2RGHA 4X9MA 4D03A 1DOCA 3KKJA 2PHHA 2B76A 4YSXA 1Q1RA 3NLCA 1GEUA 4LIIA 4YWOA 4OPUA 1TDEA 1VRQB 3RNMA 2X99A 1GRTA 4Z2TA 4K8DA 2BABA 2WDQA 2WDRA 3V3NA 4EIQA 3VRBA 5HY5A 1D7YA 2YVFA 1EBDA 2JAEA 4EIPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YF1A 1DNCA 2VCZA 3EPTA 1E39A 2NBSA 3E0UA 4TN8A 2YWMA 5HFKA 3BHFA 2HSYA 1X9SB 2LRCA 1ZL9A 2CX4A 3IE3A 1XXUA 5EVOA 3TGZA 1N2AA 3QDNA 4NXIA 3IV4A 3S61A 3B6DA 1JNRA 19GSA 1PKWA 3EANA 4PUFC 3F3QA 2RGOA 5LNKe 2C0GA 2GT6A 2MMNA 2H73A 2YG5A 4RI7A 3ZVJD 4QL9A 4U8MA 1SJ6A 3CGEA 4NEVA 4AJ6A 3UTFA 2VZ2A 3RHAA 1R5AA 1GLQA 5IOWA 4ZCDA 4U2TA 3NN0X 1FEAA 4EM3A 3TRXA 4NEWA 4REKA 3P9UA 1QO8A 4Z2RA 3P4RA 2MBSA 1K0LA 3CRTA 2E1MA 1N4VA 3PVCA 1GPEA 1TU8A 2CULA 1F6MC 4U2SA 5C04A 4HZ2A 3WGXA 1KF6A 2H6YA 3I3LA 4HDEA 2BA9A 3HHVA 2NVKX 2C76A 4WR5A 1B4QA 1GT8A 2GTUA 3IK7A 1F3BA 3HZLA 3UL3A 1F9MA 4PNGA 4CBQA 2VL2C 3P4SA 1H81A 5ECKB 3I6AA 1MO9A 3E1TA 1ZGNA 5KMPA 1ST9A 4WX1A 2TIRA 4ZBAA 3QFAA 2ZBWA 3PO7A 4EQXA 2XC2A 4J2FA 2YQUA 12GSA 1FW1A 1GRXA 3Q74A 3KLJA 4YQVA 2OE3A 2R0PA 4D04A 2GAGB 2YM1A 3M8NA 1A24A 3O3TA 2H76A 4J56E 3UTEA 5J60A 5B6NA 4BK2A 1F2EA 3EMXA 2YLZA 3LFLA 4PABA 1GSDA 1OC9A 4H4ZA 1RSGA 3F6FA 4FDCB 3HKRA 2JZTA 4J33A 1HNBA 3TB2A 3CGBA 2L6CA 1BYEA 3VK9A 1NENA 1XG8A 1EP7A 1SYRA 5A4UA 1JEHA 4L8EA 1YY5A 5G1KA 1V59A 2R5GA 4EQSA 2C7GA 2R9ZA 4I59A 5FS9A 4JE1A 5ECLB 3RDWA 3ERFA 2RUEA 1ZYNA 2WFCA 4LLRA 4TR0A 5CRWA 5J7XA 4EL1A 3VWUA 1A2MA 4NZHA 5AIXA 5ECOB 3NTAA 4ECHA 13GSA 3LYPA 1BX9A 3GDNA 2VVMA 4MH3A 4N0VA 1L9EA 1JRZA 4ZXGA 1OJCA 1LQTA 3CNPA 3K8NA 2GLRA 4YTMA 2XFOA 2C73A 4II3A 3I9V2 4BPYA 4F82A 1EWXA 4H4YA 1HNAA 3ZTLA 4POMA 3KPFA 4IVOB 4IN0A 4H4XA 4BJYA 1N4UA 2C3NA 2XBQA 1GSNA 3KCMA 2WOWA 3IR4A 2UZZA 1ZMDA 4NAXA 4ZL9A 4B66A 4MF7A 4I58A 3A2XA 4BURA 1GTEA 3ATRA 4V1Ap 2JL4A 2GQKA 4J57E 4USQA 2YN1A 2IPAA 3SYIA 1FCDA 3NRNA 2C3QA 4G0KA 1NHPA 1BEDA 3UOZA 2WETA 2YR6A 4Y4NA 4JDRA 4RG4A 5C2TA 3I43A 4TM3A 3L1RA 3ZRDA 1PXAA 3NK1X 1NSWA 3KH7A 2IMEA 3FYGA 3IWAA 1TRVA 3BD2A 3P4PA 1Y56A 20GSA 5DVBA 4MLYA 3DH9A 4JNAA 1QFNA 3L0HA 3NIVA 3PGTA 2CA8A 1IYHA 2WPCA 1LTXR 3CTGA 1GNDA 3F63A 4AP1A 3K7TA 2I3YA 5GSTA 3GDPA 1TDNA 4FX9A 3L9VA 2NTOA 4KX4A 1Q4JA 4EMWA 1EOGA 4GDPA 2BYBA 2ON7A 3RHCA 3EWLA 4C77A 4JR4A 3FZAA 3KGKA 3I69A 3AEFA 2CT6A 2CQ9A 4CY8A 3W8JA 3HCZA 5BULA 2VCTA 3GTUA 1ZX9A 4YSZA 2XLRA 2WBAA 1ZY8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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