4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp. pga64
molecule tags Oxidoreductase
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
5BRTA 2C64A 1K0JA 4H2QA 3ZDNA 4EM3A 1B37A 1KSUA 3C4NA 2B7SA 1LVLA 3O0HA 4H4SA 1D4CA 1GRGA 2DKIA 1OJCA 2Q0KA 1KNPA 1S3BA 4NTCA 2PHHA 4DSGA 1KFYA 3NK0X 1N4VA 2QAEA 2WEUA 3ALJA 2WU5A 1E1KA 4APNA 4J56A 2TMDA 2GRTA 4C77A 3AYLA 2JKCA 3NGCX 3AEAA 3NN0X 3AEDA 5CQFA 2Y6QA 4U8MA 3IC9A 2BK3A 2GR3A 3GYIA 3UKLA 4A99A 4BK3A 2C65A 4Z43A 4JY3A 3ICTA 1BWCA 1D4EA 2Y6RA 1L9CA 3KU9A 2WPCA 1E6EA 4EMJA 2BS2A 5HY5A 2V3BA 2WOVA 1V59A 4TM1A 3L8KA 3COXA 1IJHA 3BI5A 2XVEA 3UKQA 4NTEA 5IQ4A 4EQRA 2JAEA 1QLBA 3UTEA 1BF3A 1TDFA 2NPXA 1VG9A 1B8SA 2BABA 1YY5A 5EB5A 4OVIA 1Y56B 1GXFA 1PHHA 4KPRA 4OPCA 2BC1A 1KDGA 3OC4A 1Z6LA 5CKUA 3FIMB 5U63A 3UTHA 3CGCA 3AE9A 1SEZA 4K8DA 4UDQA 3ALMA 2IVEA 2V60A 1TYPA 3C4AA 3DJJA 3KKJA 5KXJA 3DGHA 2VQBA 3UKFA 1EL9A 4LIIA 3PO7A 3KD9A 2B9YA 2C75A 4Z26A 3UKKA 1LTXR 2E5VA 2AQJA 2VZ2A 1PJ5A 4K7ZA 2YVJA 4BK2A 4J31A 2YLWA 4H2RA 5BUKA 5DBJA 3CGEA 1OJAA 3B3RA 1ZK7A 3KVEA 4EIPA 2QA2A 3NYFA 1E1LA 2OA1A 3GYJA 1H81A 2GR0A 3GDNA 4H4VA 4JNAA 4U8PA 3NH3X 3G5RA 4LU6A 2R9ZA 3UKPA 3UTFA 1DXLA 2OAMA 3BNMA 4BK1A 2YLTA 1M64A 2EQ7A 3GRSA 3LB8A 2X99A 3P1WA 1N1PA 4NEVA 4OPIA 1JRZA 4ZN0A 4NTDA 4YWOA 4USRA 2XVHA 2C66A 4GCMA 4U8KA 1QO8A 5GSNA 3REDA 3S61A 1DOEA 1H7WA 1NHPA 2WP9A 1LV0A 3NYCA 4Z2UA 1EBDA 3AE3A 2ZZBA 3P4PA 1XDIA 2DKHA 1PBEA 1GNDA 3DH9A 3GWDA 1L9EA 1YQZA 3WE0A 4YKFA 2YG6A 1PBFA 3EF6A 1VQWA 4AT0A 3UOZA 4Z2TA 3DA1A 1K4QA 3AEFA 2RABA 3CNTA 3KA7A 4J33A 4GF7A 3UOVA 4EQSA 1CJ4A 5KRQA 3CNSA 3URHA 1XPQA 1ZOVA 3GMCA 3BHFA 3S5WA 4YT0A 3ABVA 4HA6A 2ACZA 1GESA 5EB4A 3NN6X 3B6DA 4DGKA 1MO9A 3NK2X 3AEEA 1FEBA 2YLXA 2WOWA 4OPTA 3UCLA 3D8XA 4B69A 4EMIA 2WBAA 2XLTA 3P4SA 5FS7A 2H88A 1D5TA 1ZY8A 2XCGA 3SQPA 3DMEA 3JSKA 1K0IA 2YLSA 2Q0LA 5M0ZA 1ONFA 1LQUA 3AECA 4C3YA 2YM2A 3IHMA 3NIXA 1TDKA 3G5SA 4X9NA 3DK9A 2YWLA 1S2YA 3AEBA 3K7TA 5J60A 2YR6A 3ATQA 1JEHA 1GRBA 5ER0A 4CBQA 1F8SA 1Y0PA 1VG0A 3CIRA 3SGLA 3V76A 1KNRA 3CTYA 3NKSA 3QSEA 2HQMA 3FMWA 2BS3A 2XVFA 5EBKA 1XHCA 2BK4A 1JOAA 1GRTA 4U8OA 1W4XA 5FS8A 3AEGA 3G5QA 5J7XA 2C76A 3L1RA 3I6DA 3UP5A 1X31B 4CNKA 4B64A 1BGNA 1KSSA 5HXIA 4IA5A 3NT6A 4J34A 1GOSA 4TLXA 1P2EA 1LJ1A 4GR1A 1CL0A 4EMWA 4YSHA 4ECHA 1H82A 2CULA 2YG4A 1IUXA 2GMJA 3NLCA 3GWFA 1IUTA 1YQ3A 2B9XA 3KPFA 3SFEA 2GF3A 4AT2A 4NZHA 5C3JA 2AR8A 5JCKA 1IUWA 1JNRA 1NPXA 3NTDA 1JU2A 1XANA 4FX9A 1GV4A 3K7QX 4H4RA 4RG3A 4Y4LA 3VRAA 4YKGA 1EL8A 4TM0A 1S3EA 2E4GA 3ZYXA 4BJYA 3M13A 3GRTA 4K22A 4PABA 4XWRA 2R0GA 3DJGX 2YR4A 2C7GA 3LXDA 1E1MA 1OJ9A 1H84A 1H86A 2FJBA 4OCGA 2BXRA 4D03A 1NENA 3CPIG 3QVRA 1FCDA 1GETA 5IPYA 3AE4A 3KLJA 3P4RA 4H4YA 2GQFA 1TDEA 4H4TA 2VQ7A 4J2WA 3RNMA 2XYOA 2YR5A 3AXBA 1E7PA 2WPEA 3T37A 1F8WA 1JNZA 2XFPA 3RP8A 2ZBWA 2VVLG 4UDRA 1ZKQA 1E1NA 1HYUA 4JQ9A 3V3NA 3M12A 3NTAA 1GTEA 3RP6A 2R4EA 2Q6UA 2WP5A 2YLZA 4N9XA 4O5QA 3QFBA 3DJDA 3FBSA 2ZZCA 1GSNA 3ITJA 3CN8A 1VRQB 2YVGA 3K7MX 2Z5XA 2JB2A 4B63A 4Z25A 2X3NA 3CPHG 2EQ9A 3FPZA 3SM8A 4K5SA 2XFOA 1CJ3A 2BS4A 2CFYA 3AE7A 4TM4A 4YTMA 4CY8A 4EM4A 2C3DA 5JCMA 2JK6A 1D4DA 1TDNA 2GAGB 5U25A 4GDEA 4EQWA 3M0OA 2XVJA 5KWFA 4IA6A 4JY2A 2JBVA 4OPUA 4Y4NA 4XXGA 2ARDA 2YG5A 4YSYA 2GR2A 3K30A 2BCPA 5GRTA 2YM1A 4H7UA 2QA1A 3DK8A 2JB1A 5JCLA 3D1CA 1PJ6A 2F5ZA 3Q9TA 2GB0A 3NYEA 2WOIA 1OJDA 5KOWA 1GRAA 2C73A 3AD8B 4H2NA 3F8DA 4IVMB 4X9MA 4Z24A 2GMHA 2NVKX 4U2LA 3LJPA 4RG4A 3GMBA 3C96A 1E39A 3AE2A 1S2QA 3UOYA 4JDRA 3ALLA 1PBDA 5L46A 4OPDA 4CNJA 1PXCA 1RYIA 1O94A 4ZCDA 2PYXA 1LQTA 2GEWA 2VRMA 3VRDB 1DJNA 1MOKA 3DGZA 2BACA 1LPFA 4H4QA 1PJ7A 4DNAA 4TLZA 4A5LA 4K5RA 4CRTA 3NNEA 4D04A 3AD9B 5M10A 3NG7X 1UKVG 3UKAA 1TYTA 2BCGG 1O5WA 2FJEA 1BGJA 3CGDA 1GTHA 3AE5A 1PXBA 1JRXA 4YXDA 3GDPA 4UP3A 4A7AA 4X4JA 1GREA 4FDCB 5KVHA 2APGA 5LV9A 4XWZA 4ICYA 3UTGA 2V5ZA 1D7YA 5HHFA 1BKWA 5HYMA 2GQWA 1RSGA 3VR9A 3HZLA 1CC4A 1GRFA 5BULA 1F8RA 3AWIA 2C67A 4ADWA 2V6OA 1D7LA 3IHGA 3DJEA 2XLUA 1CJ2A 1GPEA 2GH5A 2WDRA 4H4UA 1NHRA 1JRYA 1PN0A 3CGBA 2C3CA 1KF6A 2R45A 2AAQA 2TPRA 1GALA 2BYBA 1NAAA 1PBBA 1NG3A 3AB1A 4OPGA 4UDPA 3RHAA 2XVIA 2H89A 4USQA 2OLNA 1ZDLA 4B68A 2FJAA 4U8IA 2XFUA 1DODA 2IVDA 5TR3A 1M6IA 1COYA 3RP7A 2GVCA 3F8PA 4H50A 2E1MA 2XDOA 3AYJA 4CY6A 1MXTA 3BI2A 4IV9A 1DJQA 2Q7VA 4C5OA 3QFAA 4TM3A 1YKJA 2YLRA 4H4PA 2BXSA 2XFQA 4U8LA 4FK1C 2YG3A 2UZZA 2XLSA 1GRHA 1ZX9A 2GAHB 3H8LA 3DK4A 3P9UA 4EIQA 4JN9A 1H6VA 3FG2P 1YQ4A 3VR8A 4AP3A 4A9WA 2WU2A 1P2HA 5FMHA 2WESA 3SFDA 1L0VA 5FS6A 2A8XA 2FJDA 2RGOA 3LOVA 4O5UA 1IUSA 2W0HA 2GR1A 2WETA 3UP4A 4GRTA 4AP1A 4DSHA 4EQXA 5C2TA 1O95A 5U1OA 3VQRA 1TRBA 3CPJG 1PDHA 1RP0A 1ZMDA 2QCUA 4LA1A 2GV8A 1FECA 1N4WA 3H4KA 2R0CA 1CJCA 2C72A 4A79A 3AYIA 1NHSA 3NK1X 4A65A 1PBCA 1ZOYA 4YSXA 4P9SA 4U8JA 4B66A 5KVIA 1OJTA 3F8RA 2YQUA 1H83A 1N4UA 4U2TA 3UKHA 2XFNA 3ICSA 3ADAB 2EQ6A 4Z44A 2B9WA 1B5QA 3EPTA 4FK1A 4GDPA 1GT8A 2OALA 3E1TA 1IUUA 1NEKA 2CDUA 4J36A 2RGJA 4AOXA 1B4VA 4REKA 1H7XA 2V61A 2WDVA 3PS9A 4B65A 3EAOA 3ISHA 1IUVA 1CF3A 1NG4A 2A89A 3BHKA 4J57A 4B1BA 2A87A 4CCQA 1AOGA 4BV6A 2BC0A 4AOSA 4H4WA 3QSMA 2JB3A 3Q6JA 5KOXA 3IWAA 3GD4A 1NDAA 1ZMCA 4H4ZA 2VOUA 4ZCCA 3CNDA 1F3PA 2WDQA 4RSLA 3LADA 2XLPA 2B76A 4YTPA 2V3AA 1EL7A 4B67A 2EQ8A 2WHDA 2O9ZA 2BK5A 5JCNA 4OPLA 3QJ4A 2BA9A 1TDOA 4U8NA 4KX6A 1DOCA 4A6NA 4BURA 2X8GA 4K2XA 3QSSA 3R9UA 2CVJA 4NEWA 4CCRA 1K0LA 3CNJA 1BZLA 2J3NA 1ZP0A 2VVMA 4U2SA 2X50A 1REOA 2YAUA 3GSIA 3AD7B 1EL5A 3UOXA 3V3OA 1F6MA 2VRLA 1FOHA 2YG7A 3CNPA 3P4QA 4I58A 3OZ2A 5JCIA 3GD3A 2B7RA 4Y4MA 2FBWA 4WCTA 1FL2A 4YTNA 1CC6A 4HB9A 4C3XA 5EOWA 3I3LA 4C74A 2X8HA 3LZWA 4I59A 3AE8A 3PVCA 1CHUA 4WX1A 3LZXA 1Q1RA 3H8IA 4M52A 4YSZA 2VVLA 3QVPA 2X8CA 2R46A 4MJWA 1QJDA 2WPFA 1GEUA 2C70A 1DOBA 1DNCA 4E0VA 2YVFA 1ELIA 4Z2RA 4BJZA 2WQYA 2R4JA 3NRNA 1NHQA 2IIDA 4GUVA 1VDCA 4H4XA 2WP6A 3EANA 2Z5YA 1PS9A 2WS3A 1L9DA 3AE1A 1FEAA 3IF9A 3II4A 4H2PA 2R0PA 3VRBA 1Q9IA 3BNUA 5IQ1A 1CC2A 1GERA 4A6NB 1CBOA 2I0ZA 3AE6A 5FS9A 1Y56A 1Q1WA 3ATRA 2XLRA 3NHOX 4JNQA 3ICRA 2ZZ0A 5BVAA 1PXAA 3BI4A 4IVOB 2OLOA 4PAAA 2RGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S3RA 17GSA 4ZB8A 1GSEA 1D4CA 2VLTA 5KMQA 2WCIA 1GNEA 1KNPA 4DSGA 3EWLA 4C77A 3CYNA 3AYLA 1AIUA 4YQVA 3AEDA 1JZOA 1K0CA 2C0GA 2BK3A 4A99A 2A4HA 4GSSA 4JY3A 2Y6RA 1L9CA 1VF4A 4J56E 3FZAA 3H79A 4EMJA 5HY5A 2V3BA 3AY8A 1IJHA 5IQ4A 5COHA 1QLBA 1TDFA 1Y56B 1HNCA 4KPRA 18GSA 4TW5A 1K3YA 1SEZA 1ON4A 4TR4A 2V60A 3O76A 3UKFA 3QOUA 2KP1A 1XWBA 1J0FA 2IJYA 1ERTA 3FKFA 1XFLA 4J31A 3KP9A 3T0KA 3KVEA 4EIPA 4X43A 5FHIA 1YKCA 4I8BA 3GDNA 2GR0A 4CW9A 3F4RA 2R9ZA 6GSSA 2YLTA 3IK7A 4EDYA 5IMVA 5JCUA 2XVHA 2H71A 2DIZA 1SK2A 2HFDA 3ERWA 1BYEA 1A2JA 2KUCA 4MDCA 5GSNA 4OFMA 2H1BA 5CP1A 3NYCA 3GSTA 5ECIB 3WE0A 2YG6A 1PBFA 1F3AA 2O8VB 1XCCA 2H01A 1VQWA 2OJLA 5E4WA 3VI5A 3DA1A 1K4QA 3CNTA 3LWAA 5F0GA 3DIEA 3GMCA 3S5WA 3BHFA 1ML6A 3ABVA 4HUAA 2UZ8A 2AJQB 3ZIJA 5EB4A 3TKSC 2YLXA 1DE1A 3MDKA 2LTKA 2H88A 1OE7A 3F4SA 2CX4A 4NWYA 3DMEA 3HVXA 3FYGA 3G9BA 1A0RP 4PQHA 3JSKA 1A2LA 1JZDA 5AIVA 4RI7A 2YLSA 2Q0LA 1G7OA 5ABRA 3FZ9A 3G5SA 4K9ZA 4X9NA 3ATQA 4CBQA 3N5OA 3GTUB 4JEDA 3S9FA 3GKMA 3EMPA 1XHCA 5EVOA 3AEGA 1TI3A 3L1RA 2VL2A 2YPMA 1FAAA 4B64A 4CNKA 3TJKA 1KSSA 1O85A 1GOSA 4TLXA 4OCFA 1LJ1A 3KZQA 3IC8A 2PMTA 2YWIA 4TOPA 4ECHA 2GMJA 3GWFA 1YQ3A 5JCKA 3SFEA 4IELA 4NV2A 4AT2A 4NZHA 1IUWA 3NTDA 4FX9A 4Y4LA 1X9WB 1GV4A 3K7QX 3VRAA 4RQXA 2H1DA 1K3OA 5ID2B 1ZYPA 2C3QA 1EZKA 3EYTA 2E4GA 2YZHA 3L4NA 1LJRA 2AV4A 4K22A 1SK1A 2WB9A 3W8SA 3JCML 3MIXA 2YR4A 1SYRA 1OJ9A 1H84A 1H86A 2VIMA 2NPBA 2XPDA 3CPIG 3QVRA 1FCDA 2VM2A 1TK5B 3UMAA 1T4ZA 4YQUA 4H4YA 2FCHA 1AQWA 3MNGA 3HY2A 3RNMA 3T2YA 4I5QA 1XOAA 3IHQA 1JNZA 4MABA 2ZBWA 4JZQA 1M2BA 4UDRA 1HYUA 4USSA 1E1NA 3NTAA 3RP6A 1WOUA 2YLZA 2B5XA 2GSSA 2HRAA 2X49A 4O5QA 2GQKA 3M9JA 3CN8A 3SBCA 4K7IA 2CVKA 3C8EA 2Z5XA 3K7MX 2X3NA 2NTOA 3FPZA 4K5SA 2OE3A 1CJ3A 4F0CA 3AE7A 2H73A 3IPZA 3VPQA 2C3DA 3D21A 4EM4A 1TDNA 5AGYA 2FLSA 5KWFA 4TVEA 2F8FA 4IA6A 2VCWA 4XXGA 3IV4A 2VAFA 4YSYA 1WIKA 3K30A 2XBQA 3Q18A 3UJ1A 3FEUA 2GGTA 3D1CA 1XW5A 4ZIJA 3IK9A 3UVTA 4ZILA 3TJJA 3ISOA 1A2MA 1GRAA 3AD8B 4X9MA 3HYWA 2C3TA 4Z24A 5GAPD 2NVKX 4MJBA 5A4UA 4JU5A 3ALLA 1PBDA 4OPDA 1PX7A 5KN0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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