4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp. pga64
molecule tags Oxidoreductase
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
2VVLG 3LZXA 3C4NA 2WDRA 2XCGA 4IV9A 4A65A 1GTHA 2WPFA 5BVAA 2X8HA 4OPUA 3UKAA 1GSNA 4CNJA 3SGLA 3CGBA 5KXJA 4USRA 1NHQA 4Z2TA 2WPEA 4Z24A 3UKPA 4AOXA 2OALA 2XLSA 4K22A 1VDCA 4APNA 1JRXA 1ZMDA 4JNQA 3EANA 4B1BA 2WBAA 4GRTA 2VVMA 1CC2A 2VRLA 2YG4A 3K7MX 4PAAA 5BULA 3ITJA 1ZP0A 2OLNA 2BA9A 1M6IA 1CJ3A 1YQ3A 2YR5A 2FJBA 2YR4A 4K5SA 2IIDA 3ATRA 3AYJA 3FIMB 4H4PA 2C66A 3D1CA 2YQUA 4BK3A 5JCIA 3DJGX 3UCLA 1PBBA 5EB4A 3DJDA 2YLZA 4H4YA 4YKFA 1F8RA 2C75A 2B7RA 4J36A 4H2PA 2C3CA 3UTFA 4DNAA 3CNSA 3V3NA 4Z26A 3UOZA 4P9SA 4BK1A 4O5UA 3UKKA 2BCGG 3DH9A 3IHMA 1CC6A 3CPJG 3KKJA 2GR3A 3NH3X 1QJDA 1S3EA 1N4UA 2C64A 2C7GA 1DODA 2VZ2A 1GV4A 4XWZA 4YSXA 4H4VA 4ZN0A 2XDOA 1H6VA 4B65A 3UOVA 2WDVA 3URHA 2OAMA 3WE0A 1NHPA 2WOVA 3LB8A 3QJ4A 3S61A 1LQTA 2WOIA 1NG3A 3Q6JA 4OPLA 1D7LA 1H81A 3DA1A 1Z6LA 3NN6X 1SEZA 4JN9A 4U8IA 3GMBA 1F8SA 1BWCA 3AD7B 1K0LA 2Y6RA 3NT6A 3NIXA 4EQSA 4U8JA 2C73A 1VQWA 1TDFA 2YM1A 2GRTA 2F5ZA 3GRSA 2WQYA 3FPZA 3NRNA 2BXSA 2YM2A 1ZDLA 2W0HA 4C74A 2WDQA 1FCDA 1NAAA 1Y56A 1F3PA 1OJDA 4RSLA 5C3JA 4JDRA 2YG5A 2UZZA 4NTDA 5FMHA 3II4A 2X99A 3IHGA 1RYIA 1PBCA 1VRQB 2YLTA 3DGZA 3AD9B 3ALMA 3UOYA 3UP4A 1CJCA 1ELIA 2AQJA 3DK8A 2EQ9A 4LIIA 2A89A 1TYTA 1K0IA 2Q0LA 1DJQA 1PS9A 2Z5XA 4H4UA 3ATQA 2GMJA 2QA2A 4GUVA 2R4JA 4DSHA 2X50A 1RSGA 2Y6QA 4D04A 2VQBA 4UDPA 4EMWA 1ZKQA 4Z43A 1ZOVA 1JNRA 1ZK7A 4BJYA 1GRBA 1BKWA 1H84A 1H86A 1TYPA 2B76A 3CPIG 1B4VA 3D8XA 4EQXA 2BXRA 2YR6A 1ZY8A 4X9MA 3V3OA 1F8WA 1D7YA 1VG9A 3IWAA 5FS8A 2JBVA 2WOWA 3SQPA 3L8KA 4YT0A 1BZLA 2YLWA 3AEAA 1EL7A 4NTEA 1MOKA 1M64A 4O5QA 3NTDA 2WU5A 5KVHA 2WP5A 4CBQA 4ADWA 4BJZA 2RABA 3AE2A 4YKGA 1PBFA 1FL2A 5KVIA 4K8DA 4OPDA 4JY2A 1GALA 2V5ZA 4U8OA 5BRTA 2RGJA 3CGDA 3GWDA 3COXA 1JU2A 3QSMA 3DGHA 3ICRA 4B66A 2XFNA 3ABVA 3CN8A 3RP8A 4A99A 5U63A 1E1NA 2GB0A 3EF6A 3VRAA 1AOGA 1H7WA 2XYOA 1IUVA 2YG3A 1D5TA 4BV6A 4TM4A 3AE9A 4B64A 2XFQA 1EL8A 3NK0X 1X31B 2AR8A 3NK2X 3DMEA 2J3NA 3PVCA 5GRTA 1W4XA 4H4RA 2JB2A 1PXBA 1PHHA 2TPRA 1YQZA 2FJDA 5BUKA 3QVRA 1LV0A 1UKVG 1TDEA 2PYXA 2TMDA 3NHOX 4OPTA 4XXGA 3AD8B 4PABA 2XLUA 5TR3A 4B69A 2BABA 3AE3A 3DJJA 1PBDA 2YVFA 4U2TA 3GD3A 4Y4LA 4H4SA 3SM8A 3K30A 2ZZBA 3AEFA 2R9ZA 3RP6A 3ICSA 3NYEA 3CGEA 1B8SA 2QAEA 4XWRA 1IUXA 3NGCX 3GDPA 2BACA 2GR1A 4IA6A 4U8KA 2WPCA 4JY3A 4CY8A 1KSUA 1N4VA 4NEVA 1FOHA 5IQ4A 3LXDA 4H2QA 1CF3A 1IJHA 1S3BA 1QO8A 1EL5A 4MJWA 4N9XA 4M52A 1KSSA 2YLSA 4JNAA 4A5LA 4U2SA 5JCNA 4OCGA 1OJTA 4J56A 1JRZA 1XDIA 2GMHA 2GF3A 2GV8A 5CKUA 4U8NA 4C3YA 1LTXR 4X9NA 3AEGA 2OA1A 3ALLA 4GR1A 5LV9A 1MO9A 2NVKX 3KU9A 3NYCA 2Q0KA 2WHDA 2ACZA 2Z5YA 4H2NA 4H7UA 5JCMA 2JKCA 3IC9A 4DSGA 4I59A 3Q9TA 1IUUA 2GQFA 2X8GA 2WP9A 1E7PA 3GD4A 3RP7A 5J60A 3QSEA 1L9EA 5U1OA 1PXCA 4U8PA 3RNMA 4Z25A 3M0OA 1L9CA 2XLRA 3AE4A 3NN0X 4EQRA 1ZMCA 4NTCA 2JAEA 4ZCDA 3VQRA 4H4ZA 1H83A 2VQ7A 3AE6A 4A9WA 3K7TA 1TDKA 2YG7A 5GSNA 4D03A 3UTEA 4OPGA 1P2HA 2BK5A 2XLPA 3AE7A 4UP3A 4JQ9A 4EQWA 2XFOA 1IUWA 2IVEA 3P4SA 3EPTA 3UKQA 4H4XA 3P4QA 2GEWA 4CCRA 1N4WA 3P1WA 4K5RA 1ONFA 3UKLA 2C72A 2XFPA 1PJ6A 3ZYXA 3CIRA 1GXFA 2VOUA 3LADA 3BI2A 2V61A 1LJ1A 5KOXA 2V6OA 1O95A 2YLRA 1YY5A 1S2YA 2BC0A 1JRYA 3BI4A 2E4GA 4WCTA 1LVLA 3CPHG 3I6DA 3AE8A 1GOSA 4NEWA 2EQ6A 2C67A 4A6NB 2C70A 1B37A 2XVEA 1F6MA 3ALJA 1H7XA 4H2RA 2BC1A 2V3AA 2B9WA 1D4DA 2GAGB 5HY5A 3RHAA 2O9ZA 3GDNA 2Q6UA 1PXAA 4GF7A 4DGKA 3ZDNA 4B63A 3I3LA 2YWLA 2GAHB 4J33A 4E0VA 4I58A 4REKA 1GPEA 4C3XA 1XPQA 2BCPA 1BF3A 2B7SA 4H4QA 2CVJA 5EB5A 1ZX9A 3AEEA 4HB9A 3AXBA 1YKJA 2B9XA 3QFAA 4LA1A 1PDHA 2NPXA 3BNUA 3NNEA 2V60A 2GR2A 1DJNA 1D4EA 3NKSA 3BI5A 1GRFA 4H4WA 1CL0A 1S2QA 4OPCA 3BNMA 3GWFA 1PJ7A 3KA7A 4OVIA 4U2LA 3AB1A 3GSIA 2R0GA 4B67A 2E1MA 5M10A 1CBOA 1JOAA 4TLXA 3OC4A 2GH5A 2YAUA 2X8CA 1Q9IA 2APGA 1E1LA 1Q1RA 2Q7VA 1HYUA 5FS6A 5EOWA 3M12A 3H4KA 3AEDA 2VVLA 1NDAA 3LZWA 4TLZA 1LPFA 4X4JA 1B5QA 4CRTA 1PBEA 4EM3A 1KF6A 1GRHA 4Z2RA 2ARDA 1KFYA 4C77A 3NTAA 5EBKA 2QA1A 3B3RA 3GRTA 3BHFA 4YTMA 1GESA 5J7XA 3AECA 1L0VA 1PJ5A 3UTHA 1NHRA 5U25A 3F8DA 4NZHA 3GYJA 4EIQA 1GRTA 1GRGA 1E1MA 4U8LA 3NK1X 2R0PA 1E1KA 2BS2A 3B6DA 5IQ1A 3CNDA 4ECHA 2RGOA 3UKFA 2YVGA 3F8PA 3FMWA 3DJEA 5HXIA 2C65A 1CJ4A 5C2TA 3O0HA 4YWOA 4CNKA 3UKHA 4YTPA 1D4CA 1K0JA 1NEKA 1NENA 2H89A 4LU6A 1KNRA 4UDRA 3M13A 1ZOYA 2QCUA 2WETA 2X3NA 4WX1A 1NHSA 3QSSA 1E6EA 1TDOA 1GRAA 5HYMA 3AE5A 2FBWA 1NPXA 4EMIA 3ADAB 4J2WA 2GVCA 3P9UA 2R4EA 5KWFA 4YTNA 3UTGA 3VRDB 3UOXA 5HHFA 1PN0A 2XVHA 2WU2A 4Z44A 2R45A 2WESA 3KVEA 3SFEA 1FECA 4AP3A 3ICTA 1MXTA 2XLTA 3HZLA 2FJAA 4GDEA 4AT0A 2BYBA 3AYIA 3KD9A 2A87A 4A6NA 5L46A 3H8IA 3CTYA 1DOCA 1H82A 4BURA 1K4QA 4U8MA 2C76A 2JK6A 2YLXA 1KDGA 5KRQA 4J57A 2V3BA 3QFBA 2YG6A 3K7QX 4IA5A 1FEAA 5JCLA 2JB3A 3CNTA 4H50A 2IVDA 2B9YA 2A8XA 4H4TA 2ZBWA 3V76A 4AT2A 4FK1A 3DK4A 3IF9A 5KOWA 1L9DA 2CDUA 4USQA 2JB1A 1TDNA 3NG7X 1E39A 1IUSA 2AAQA 4C5OA 3VR9A 2EQ7A 2YVJA 3CNPA 4GDPA 3EAOA 2BS3A 5FS7A 3S5WA 4TM1A 1GETA 4Y4MA 2XVIA 5ER0A 4YXDA 3E1TA 3FG2P 2BK4A 2RGHA 4AOSA 1NG4A 1O5WA 4FK1C 1JNZA 1OJ9A 4TM0A 1IUTA 3C96A 3QVPA 4GCMA 1JEHA 2BS4A 4EIPA 4Z2UA 3LOVA 4KPRA 4YSHA 4IVOB 1P2EA 2GR0A 1XANA 2H88A 3G5RA 1N1PA 4RG3A 3AYLA 2VRMA 4ICYA 5JCKA 1EBDA 2CULA 3ISHA 1KNPA 1REOA 3FBSA 3G5QA 4Y4NA 3R9UA 2HQMA 4K7ZA 1Q1WA 1Y56B 2R46A 4A7AA 4CY6A 1EL9A 2C3DA 5IPYA 3F8RA 4KX6A 3REDA 1V59A 4FX9A 3PS9A 3GMCA 4RG4A 1GT8A 4B68A 4HA6A 3VR8A 2WP6A 3CNJA 3LJPA 3AWIA 3PO7A 4YSZA 3P4PA 1GTEA 4EMJA 1VG0A 3KLJA 3VRBA 1YQ4A 3NYFA 3C4AA 2XFUA 2DKHA 4BK2A 1DNCA 3BHKA 1COYA 1GERA 3G5SA 4CCQA 1GREA 3OZ2A 5M0ZA 3L1RA 1BGJA 1DXLA 3AEBA 3DK9A 3P4RA 4TM3A 4FDCB 2E5VA 3JSKA 3SFDA 1DOEA 1FEBA 1DOBA 3H8LA 1Y0PA 4UDQA 4A79A 3NLCA 2CFYA 3CGCA 3GYIA 2WEUA 1RP0A 3KPFA 1BGNA 1OJAA 2PHHA 2XVJA 3UP5A 2GQWA 3AE1A 2WS3A 4J34A 4ZCCA 3T37A 1CJ2A 4J31A 1GNDA 2XVFA 2BK3A 4IVMB 4EM4A 1XHCA 2DKIA 4YSYA 1OJCA 2ZZCA 1GEUA 2R0CA 4OPIA 2I0ZA 2FJEA 2ZZ0A 2OLOA 4K2XA 1O94A 2EQ8A 1QLBA 1CHUA 1TRBA 5CQFA 5DBJA 5FS9A 4AP1A 1CC4A 1LQUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VVLG 3LZXA 3TJKA 4IV9A 4A65A 2AB6A 3WT2A 2D2ZA 3HY2A 5BVAA 1QXHA 1JLVA 1YKCA 3GSSA 2MYGA 3CGBA 1SKWB 4AOXA 4K9ZA 1VDCA 2FA8A 3EANA 1DBYA 1CC2A 2A2RA 5BULA 4PAAA 2VOCA 2HYXA 3F6FA 1ZP0A 3LSZA 2OLNA 3ATRA 3AYJA 4K5SA 3F0IA 3D1CA 4IJIA 4KDXA 3A2XA 1BAYA 3I69A 4TVEA 2YJHA 4BK3A 5LD0A 4G9KA 2IIYA 4G74A 4F03A 2YLZA 4H4YA 1J08A 3H8QA 4ID0A 2VLUA 3AY8A 1U3AA 4Z26A 1DUGA 3DXBA 5D93A 5G31A 2BCGG 3A2VA 4PXOA 1VF3A 1WWJA 2L4QA 2GQLA 1USBA 1XW6A 1CC6A 5DCGA 3FZAA 2GR3A 4RUVA 1N4UA 2Z9SA 3D4TA 4HZ4A 5IMDA 4FYCA 4KNDA 2GSSA 4TR4A 1GV4A 1XG8A 4MF6A 1GTIA 1PL2A 1H6VA 2HRKA 4B65A 2O8VB 3TKPA 2OAMA 2WDVA 4IHUA 1NHPA 5IM9A 4E8EA 3Q6JA 4OPLA 3DA1A 1Z6LA 2MMAA 1SEZA 4JN9A 1OC9A 1F8SA 1JHBA 4KDYA 2OE0A 1YKAA 2F3MA 3A2WA 3GYXA 1XWAA 3GRSA 3SZCA 2YM2A 1ZDLA 4C74A 2RIIA 4TRXA 1MTCA 5C3JA 4I97A 2YJ7A 1A2MA 4JDRA 2AYTA 4NTDA 5HR2A 3T2KA 3AD9B 3TKRA 1Z6MA 1CJCA 3HVXA 3E3EA 2EQ9A 4KH7A 1TYTA 1EGOA 2PBJA 4H4UA 4EMWA 4Z43A 1ZYNA 1ZOVA 1JNRA 1GRBA 4EQXA 4FIWA 1J9BA 4X1UA 2B6MA 4K2DA 3IWAA 2JBVA 4YT0A 2VIMA 1MOKA 4O5QA 4F82A 3EVIA 3P2AA 1MD3A 1YQ1A 2KHPA 2V5ZA 2HRFA 3N5OA 3QAGA 3COXA 3GWDA 3KGKA 2N5FA 3DGHA 1SKSB 2DJKA 6GSVA 4B66A 4IW9A 2WRTA 3FW2A 6GSWA 2XHFA 3LYPA 3ABVA 5U63A 3EF6A 1A2LA 1AOGA 2XYOA 3ED3A 2YG3A 1D5TA 2XFQA 3NK0X 2AR8A 3DMEA 2VD1A 1PHHA 2H1AA 2BRYA 1F9MA 3G9BA 4KW6A 2PYXA 2DLXA 4IJ3A 2H8LA 3HVSA 4B69A 3UEMA 3J7Yk 2BABA 3AE3A 4L0WA 1PBDA 4J57E 3GD3A 2ZZBA 4KE3A 6GSTA 1B8SA 4F2IA 1HNCA 2WZ9A 4N30A 3NGCX 2H6XA 2BACA 2GR1A 4IA6A 1N4VA 4NEVA 5IQ4A 1EP8A 3LXDA 2DJ1A 1FO5A 1Z5YE 1T00A 2V1MA 1CF3A 3NZNA 5COHA 3L0HA 4N9XA 2VCXA 2VCWA 4M52A 1KSSA 1F3BA 2M72A 2HRNA 4I8BA 4NWYA 4C3YA 3TDGA 3KU9A 2Q0KA 2WHDA 4H7UA 4HEA2 1AAZA 2V32A 3GNJA 4G0LA 2VL2C 1YEPA 4ZL7A 1X9SB 1E7PA 3IOSA 1L9EA 5KEJA 4U8PA 1EV9A 3RNMA 2H71A 1JFUA 3GMFA 4KAEA 4YAVA 4G6HA 2B7KA 1OKDA 3HXSA 4JR6A 1R26A 4GF0A 4MDCA 2CA8A 2FHEA 3K7TA 4GSSA 5GSNA 4D03A 3CYNA 1SU9A 3UTEA 2BK5A 1TI1A 2XLPA 5F05A 2YWNA 4JQ9A 5ECOB 4ZIJA 2XFOA 4TXVA 19GSA 2DMMA 3GHAA 4KSOA 4OCFA 1AQVA 4H4XA 3P4QA 3BOAA 4HU7A 2VD0A 4ECJA 1A8LA 4KSMA 1UC7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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