4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp. pga64
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
3CPJG 3OC4A 1LQUA 2R46A 5IQ1A 1S2QA 3T37A 2XLPA 2VRLA 1BF3A 3VRBA 2C67A 3CGCA 3G5RA 4J33A 3UKQA 3NRNA 2QA2A 1H7XA 1GT8A 2XFUA 1GALA 1GSNA 3QSMA 3NT6A 3KPFA 1DJQA 3CNDA 3AE5A 4H2PA 1RYIA 4OPUA 2PYXA 2Q0KA 3AEEA 4IV9A 5C3JA 5KWFA 1GREA 5HHFA 5LV9A 3SGLA 2GEWA 4GRTA 1D4EA 2QA1A 1VG0A 1N1PA 4BJYA 2BC0A 4BK3A 5GSNA 3DJEA 2GV8A 2WBAA 5FS8A 1DOEA 2B9YA 1UKVG 2IVEA 4WCTA 4CRTA 4U2SA 4U8JA 3H8LA 1N4UA 2GR3A 3LXDA 3QVRA 2E1MA 2ZZ0A 1VQWA 2RGOA 2VVMA 2WHDA 1TDFA 2ZZCA 2XFOA 3K7MX 4USRA 4OPIA 3B3RA 2V3AA 3GDNA 3NKSA 3BI5A 1PBFA 3GYIA 3FBSA 4H4YA 1NG4A 2WP6A 5JCMA 1CF3A 2XVFA 4UDRA 4EM3A 2XVJA 2YQUA 4GR1A 1NHQA 4K8DA 1CC6A 2AR8A 2X8HA 4AP1A 3AB1A 1H6VA 2YLRA 5U25A 2TMDA 5HXIA 2YLSA 1OJCA 2WU2A 2WS3A 2ZBWA 5JCNA 4C3YA 4HB9A 4LIIA 3Q6JA 4LU6A 4Z2UA 4H4RA 3IC9A 3S5WA 1MOKA 3K7QX 4UDPA 1LV0A 5JCIA 2UZZA 4H7UA 5HY5A 3G5QA 2BK5A 1S2YA 3DJGX 3H4KA 3KVEA 1M6IA 1JEHA 3C4NA 3FG2P 4EQRA 3ATQA 1KNPA 2XLSA 4IVMB 1TDKA 4JDRA 1PHHA 1V59A 4GDPA 2FJAA 3ZYXA 1GV4A 1OJDA 4O5UA 4H4XA 4YWOA 3DGHA 3PVCA 2WOVA 1JRXA 3AE7A 2GB0A 4ZCCA 3SM8A 2VRMA 1CJ4A 2OALA 1TYPA 3F8DA 4JY3A 2VZ2A 3NGCX 3SFEA 3O0HA 4AOXA 2R45A 1FL2A 4EIPA 2WPCA 3BI2A 4CNJA 2GR2A 1D7YA 2GQFA 5IQ4A 1YQ4A 3P4QA 2XFNA 3UTGA 2YG7A 4FK1C 1S3EA 1S3BA 2YG6A 3L8KA 4EMJA 2JB2A 4Y4MA 2CFYA 4OPGA 3L1RA 3ITJA 1PDHA 2WDRA 5J7XA 2VQBA 1D7LA 1O5WA 2YG4A 3CNJA 1Q1RA 2E4GA 4K5SA 3AYJA 4B66A 3DK9A 3F8PA 3UOVA 1FCDA 2BCPA 4U2LA 3UOZA 2C66A 3GYJA 1VRQB 1GPEA 3ATRA 1EL7A 4TM0A 1GEUA 2VOUA 1YKJA 1GRHA 2BS4A 3KD9A 1PN0A 1D5TA 4ZCDA 3K30A 3V3NA 1RSGA 2WDVA 4LA1A 1LTXR 1TDNA 1ZP0A 2BACA 3D8XA 4JNAA 4J34A 2XDOA 3P9UA 1QJDA 2BK4A 4CCRA 4D04A 1F8SA 5BULA 1JRZA 5KRQA 2BYBA 2BS2A 3IF9A 3Q9TA 2GAHB 1F8WA 3CIRA 4MJWA 3AEBA 5BRTA 1H7WA 3ALMA 3NK1X 4C74A 1GETA 3BI4A 4RSLA 4AOSA 3M13A 3KU9A 4H2QA 5M0ZA 3QFBA 1LJ1A 3JSKA 3NK2X 1O94A 3AYLA 4A6NB 1EL8A 3AE2A 3M0OA 2X8GA 3AEFA 1DJNA 2CVJA 3UKAA 1XHCA 4H2NA 3AE3A 4USQA 4DSHA 3DH9A 1GNDA 2V60A 1MO9A 3V76A 1B8SA 1CL0A 1FOHA 3KA7A 3P4PA 2H88A 3REDA 4YKGA 2I0ZA 1F8RA 3UTEA 4ADWA 4D03A 2OLOA 1NG3A 2XCGA 3UTHA 3AXBA 4BURA 4A99A 2IIDA 4CY6A 5CKUA 1IUVA 1P2HA 1D4CA 4X9NA 4A6NA 1JNRA 1IUTA 1W4XA 3CPHG 3I3LA 2FJEA 4OCGA 4CBQA 2WDQA 3WE0A 3COXA 3I6DA 3ADAB 3FMWA 3D1CA 4ECHA 4Z2TA 1ZOVA 2F5ZA 5BUKA 1LQTA 4I58A 3CPIG 1KF6A 4GDEA 2C3CA 4U8IA 2A8XA 2WOIA 4UDQA 4APNA 1KSUA 2YLXA 2XYOA 3F8RA 4EMWA 2XFQA 4GUVA 4B64A 2DKHA 2OAMA 2WOWA 1H82A 4EQWA 4CY8A 2EQ9A 1KDGA 3AEGA 4GCMA 2WPEA 3ZDNA 1BKWA 1GOSA 4H4WA 2Q6UA 3UKHA 3GD3A 5KVIA 4YT0A 3QVPA 1NHRA 3VRDB 4H4QA 1GESA 3CTYA 3LZWA 2C75A 1LPFA 5U63A 4C3XA 2BXSA 4EMIA 3CGBA 2VVLG 3EPTA 4BV6A 3ICTA 5GRTA 4ZN0A 1Y0PA 4TM4A 2WP9A 3URHA 1XANA 4KX6A 1Y56B 3IHMA 3LJPA 1NHPA 2YM2A 3P1WA 3S61A 3CNSA 1DXLA 2YR5A 4OVIA 4C77A 3QJ4A 3BHFA 4JNQA 1PJ5A 2BA9A 1DODA 4P9SA 3UCLA 1BGJA 2CULA 3GWFA 3RHAA 4Z43A 2IVDA 1Y56A 3GWDA 3NYEA 2Z5YA 4DNAA 1XPQA 3RP8A 3NNEA 2BXRA 1AOGA 2JB1A 3IWAA 3DGZA 3UP4A 4GF7A 2GRTA 3K7TA 3KKJA 2B76A 4B69A 2TPRA 2X3NA 4IA5A 4DSGA 3CNPA 2JB3A 4NTCA 2C72A 4PABA 4WX1A 1KFYA 1E1MA 2RABA 2C73A 1VDCA 1CC2A 1NPXA 4EIQA 2B7SA 4H4PA 4U8MA 2YVGA 1TDOA 3AD9B 3RP6A 3E1TA 3UOYA 5DBJA 1HYUA 2VVLA 2X8CA 1B5QA 1PXCA 3UOXA 1PBCA 1BWCA 2XLUA 3AWIA 1ZKQA 4B1BA 2FBWA 1PJ7A 1NAAA 1CC4A 4FDCB 1OJ9A 2H89A 2EQ6A 2V61A 2JAEA 1TRBA 1GRBA 3GRSA 5EB5A 1NHSA 2OA1A 4AT0A 2ARDA 4IA6A 3EAOA 4FK1A 1NENA 2GR1A 4OPDA 2NVKX 2VQ7A 2Q7VA 4XXGA 2WPFA 2R0GA 4J56A 1GTHA 4J36A 3FPZA 2C7GA 4OPLA 4Z26A 1CJCA 3DMEA 2WP5A 2WQYA 1PS9A 3ICRA 3IHGA 1IUXA 4Y4LA 4B67A 4YXDA 2YVFA 4U8LA 4REKA 4JQ9A 3GMCA 1Z6LA 1NDAA 3NN6X 1GRTA 1QO8A 4AT2A 3FIMB 2YVJA 4XWZA 1COYA 5M10A 4XWRA 3AEDA 1H81A 1CBOA 2YAUA 3VR9A 3UKKA 1M64A 2C76A 2J3NA 3ABVA 1D4DA 3B6DA 3HZLA 4OPTA 1Q1WA 1ZOYA 2C64A 3PS9A 1E7PA 4HA6A 1EL5A 1GRAA 4NEVA 3R9UA 5IPYA 1LVLA 3AE8A 1GRFA 4K7ZA 5FMHA 1L0VA 4YSHA 3CGDA 1CJ3A 4IVOB 2R4EA 2B9XA 1IUWA 5HYMA 2BABA 5KOWA 4H4SA 4AP3A 4OPCA 2WESA 4PAAA 1ELIA 1K0JA 5L46A 2V6OA 1B4VA 1ZMCA 3RNMA 4EQXA 1N4WA 2HQMA 3AD8B 1H83A 2YLWA 3LADA 4CNKA 2GF3A 1GERA 3DK8A 3RP7A 4YKFA 4EM4A 2CDUA 1MXTA 1DNCA 5JCLA 3ALLA 4A5LA 1PBBA 1EL9A 1B37A 3VR8A 4B63A 1FEAA 3BHKA 3AE6A 3ISHA 4H4VA 4JN9A 1KSSA 1CHUA 2GMJA 2V3BA 4CCQA 4O5QA 3BNMA 1E39A 3CGEA 3UKLA 4E0VA 2GMHA 2X50A 1IUUA 2Y6QA 4X9MA 2R0PA 2BCGG 1OJAA 3UKPA 1GTEA 3LOVA 4Y4NA 3V3OA 3AE1A 3KLJA 2YR4A 4BK2A 4DGKA 1E1NA 5EOWA 2YG5A 3DA1A 2WU5A 3DK4A 3G5SA 3VQRA 3AD7B 3C96A 2XLRA 2WETA 1PXAA 2A87A 1FEBA 3AE9A 1BGNA 3GDPA 1SEZA 4A7AA 1QLBA 4TLXA 4Z24A 3LZXA 1TYTA 3C4AA 3AE4A 3UTFA 3VRAA 2BK3A 1Q9IA 2XVEA 3EF6A 5EBKA 5KVHA 3NHOX 1H84A 5KOXA 1F6MA 4KPRA 5JCKA 2Z5XA 4H4TA 2JK6A 1K0IA 1IJHA 2V5ZA 2A89A 2NPXA 3ALJA 4K5RA 1KNRA 1JU2A 5ER0A 4Z44A 4YSXA 1ZK7A 2X99A 2Y6RA 1GXFA 2W0HA 4NTEA 1ZY8A 4YSYA 2XLTA 4U8NA 1L9CA 3P4RA 4H2RA 3EANA 2AQJA 3M12A 1L9DA 5CQFA 1P2EA 1H86A 1ZX9A 4J57A 3GRTA 3UP5A 3H8IA 1K4QA 4A79A 1PXBA 1DOCA 3DJDA 3QSEA 5FS6A 4M52A 1PBEA 4BJZA 2ZZBA 4FX9A 1TDEA 2E5VA 1JNZA 1ZMDA 2GQWA 2APGA 2B7RA 2R9ZA 5KXJA 4H4ZA 4YTPA 2GR0A 4JY2A 4ICYA 2XVIA 4YSZA 1O95A 4B65A 3NN0X 1OJTA 2OLNA 1PBDA 5BVAA 3GSIA 1JOAA 3NH3X 3NK0X 4U8PA 2YWLA 3UKFA 2QCUA 2B9WA 3AEAA 5FS9A 1L9EA 2C70A 1DOBA 3ICSA 3NLCA 1CJ2A 4H50A 3PO7A 3P4SA 3NYFA 1FECA 2ACZA 5C2TA 1BZLA 2GH5A 4TM3A 5J60A 1NEKA 2FJBA 2JBVA 4J2WA 2O9ZA 2C3DA 4UP3A 4H4UA 2PHHA 1N4VA 1ZDLA 4U8KA 4N9XA 4Z2RA 5U1OA 4NTDA 3AECA 1K0LA 1F3PA 4RG4A 2R0CA 1RP0A 1JRYA 2FJDA 4K2XA 2DKIA 3QSSA 4TLZA 3GMBA 1XDIA 2GAGB 2XFPA 4C5OA 3GD4A 3SFDA 4U8OA 2BS3A 1EBDA 3II4A 3CN8A 4RG3A 2JKCA 1YQZA 2QAEA 2RGJA 3AYIA 3NTAA 3CNTA 3NG7X 4NEWA 5EB4A 3NTDA 1E6EA 4K22A 4NZHA 1E1LA 2RGHA 2EQ8A 3SQPA 2WEUA 2GVCA 1IUSA 3NIXA 3QFAA 4B68A 1REOA 1PJ6A 1YY5A 2XVHA 4BK1A 1YQ3A 4A65A 2YG3A 1X31B 2R4JA 1GRGA 4EQSA 3DJJA 2YM1A 1E1KA 3LB8A 3BNUA 4TM1A 2EQ7A 5FS7A 4Z25A 2YR6A 3NYCA 4A9WA 4I59A 4J31A 2YLZA 5TR3A 2Q0LA 1ONFA 2BC1A 2C65A 4U2TA 4X4JA 1VG9A 2YLTA 2AAQA 4YTMA 3OZ2A 4YTNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1F2EA 3UBKA 1LQUA 5IQ1A 4AF2A 4K7OA 2XLPA 1TP9A 5IMZA 3NRNA 2XFUA 1H7XA 1SD8A 4D73B 3E3EA 1DJQA 2QSIA 3CNDA 3HJPA 2PYXA 2Q0KA 4IV9A 4KCAA 1SJIA 1M2BA 4HS1A 1D4EA 1Z3EA 3T2ZA 4BJYA 2BC0A 5HQPA 2GV8A 3DJEA 1DOEA 1Q98A 3QAWA 3CXGA 5DALB 2B9YA 1EOGA 2IVEA 1TK0B 2P5RA 5IIZA 1J0FA 1XFLA 3H8LA 1Y25A 2GR3A 1X5EA 2KHPA 3QVRA 3LEFA 1K3OA 2VO4A 3GYIA 3FBSA 2PERA 5GZZB 4UDRA 2AJQB 4K6XA 2XVJA 4MA9A 2DIZA 2AR8A 1A2LA 4AP1A 3AB1A 2XBQA 4FQUA 3LW9A 2FCHA 5HXIA 2YLSA 1OJCA 2WU2A 1WE0A 5JCNA 4LIIA 4LU6A 1TK8B 3K7QX 3HVXA 5JCIA 3G5QA 1S2YA 3H4KA 3C4NA 5D9TA 2GQKA 3ATQA 4IVMB 2GQLA 2OKAA 1V59A 5ECOB 19GSA 3I9V2 3ZYXA 3ZVJA 2XC2A 1OJDA 4H4XA 2CZ3A 1GSYA 1K0DA 2GB0A 3FYGA 4OD7A 2VM2A 3SM8A 2OALA 2L57A 2VZ2A 2OE0A 4AOXA 4RQXA 1ST9A 1FL2A 2YWNA 4PTSA 2GQFA 4EKZA 5HR0A 8GSSA 4TW5A 2XFNA 3P4QA 5H5RA 1PL1A 5IO2A 1BYEA 1SK0A 2CZ2A 3LJRA 1SKWB 2VQBA 4LL1B 3RAZA 3EWLA 3GKMA 4P3YB 1D7LA 1O5WA 3CNJA 12GSA 2E4GA 4K5SA 3IR4A 3AYJA 2H71A 3UOVA 5J5NA 3HA9A 1GPEA 4POBA 3NOFA 3ATRA 3VK9A 1YKJA 1GRHA 1ZCPA 3KD9A 1PN0A 3F4RA 1K0MA 4J57E 3QFBC 5G1KA 1LTXR 3FR6A 1MDJA 4J34A 4IVFA 2XDOA 1F8SA 4F82A 1OKTA 1TKDB 4ZL9A 5KRQA 4HEA2 2K9FA 2GAHB 3Q9TA 2V32A 3CIRA 2FWHA 4XCSA 5DAKB 3L0HA 1JLVA 4RSLA 4AOSA 3DD3A 2WRTA 1K0CA 3CQFA 4HI7A 4OO5A 4H86A 1SK2A 2R6KA 1EL8A 3AEFA 1DJNA 3SZWA 4USQA 4HZ2A 2I81A 4DSHA 1MO9A 1WIKA 4YKGA 2I0ZA 4ADWA 3Q74A 2OLOA 2XCGA 3T14A 5FT3A 4GF0A 4BURA 1ZOFA 2C4JA 4HZ4A 1IUVA 1P2HA 2FA8A 2X64A 4TN8A 4ISDA 1W4XA 3NZNA 3CPHG 4TR4A 3I3LA 4OCGA 1Z6NA 3WE0A 3G7JA 3I6DA 1GTAA 3ADAB 1VF2A 3CMMA 3TKSE 4Z2TA 2GVPA 2H76A 1B4PA 2G0FA 3ISOA 5ECNB 3FY7A 2DJ0A 2A8XA 2WOIA 4APNA 4EMWA 4TVEA 1S3RA 1T1VA 2OAMA 2WOWA 4K7IA 1H82A 1V9WA 4CY8A 3AEGA 2WPEA 3GTUA 3IPZA 2VCWA 3IRAA 1TJDA 3QVPA 1USBA 3LZWA 4DSQA 1TI1A 3PINA 1LPFA 6GSVA 1UVZA 2BXSA 3CGBA 1ZL9A 3UARA 4EMIA 2GZPA 2TRXA 2WP9A 3GH9A 1XANA 4GCIA 4V1Ag 2BMXA 1DXLA 4C77A 3BHFA 4E8HA 1DODA 4P9SA 3LYKA 5IMVA 3A2VA 2CULA 3GWFA 2IVDA 3EURA 1T00A 4GQCA 5DCGA 4ZXGA 3NNEA 1FVKA 4MK3A 4L5OA 1YKAA 3DGZA 3SZFA 3UP4A 3W8JA 4ML1A 2GRTA 1LJRA 4B69A 2C3TA 2DLXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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