5INYA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f8
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
b'TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 48
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5inyA00
3E9JB 3UJ1A 1QFNA 5J5NA 5J4UA 4E8HA 1M7TA 4KDUA 2F8FA 4RI7A 3KMOA 4PQ1A 5IMFA 2YJHA 2CVKA 3CYNA 1PKZA 4IVFA 1KNGA 5A5KA 3TJFA 4GSTA 4MF6A 5D96A 5HFKA 4EKZA 2A4VA 2K9FA 1WPIA 4GRFA 5DALA 3G7JA 2CT6A 1YQ1A 4NV2A 2KLXA 3TJKA 1ZCPA 2VL3A 1K0CA 2PBJA 4E8EA 2A2SA 2H1BA 3BJ5A 3IXRA 3IAM2 3DXBA 1B48A 1J9BA 1HD2A 4POKA 5AGYA 1K0NA 5H5QA 5D73A 1K0MA 4JEDA 2C0GA 3LORA 4HDEA 3M0FA 3C1RA 5DAKB 2GQMA 4YH2A 2DJJA 1N8JA 5IQYA 1U3AA 2CAQA 1F3AA 3ZIJA 1E6BA 3DKSA 1S3DA 2GSRA 4X43A 2FWHA 3KCMA 1J08A 3TOTA 2ALBA 1Q98A 4DSSB 2MBSA 1ACVA 3PR8A 2H19A 2YP6A 1OC9A 3APOA 4TN8A 2TRCP 2F51A 2H30A 1Z7PA 3FZ4A 1THXA 2Z9SA 3QDNA 2MZCA 3GKKA 5AISA 2L5LA 3GA4A 2CX4A 3CTFA 3O3TA 1U87A 2B7JA 1G6YA 1G0TA 4RQXA 5IPGA 1OKDA 1FW1A 5CNWA 3FHKA 4IJIA 4XS4A 6GSSA 1X9SB 2XBIA 2KP1A 1HYUA 2H8LA 3VURA 1BYEA 2R4VA 5J41A 4WR5A 2H66A 1M9AA 4OFNA 1XW5A 5ECPB 11GSA 2V32A 1GLQA 2E2GA 1MDKA 5KN2A 1ILOA 3ZREA 3UVTA 1XIYA 2VM2A 2CQ9A 2YWIA 4TRXA 1GUKA 4JZQA 4K7NA 1DE2A 5IPHA 1ST9A 3QAVA 5FWGA 1I5GA 2E2MA 4PXOA 3ZMKA 4NV5A 3UVHA 3UIWA 3GFKA 3GX0A 3ZFBA 5IOWA 2RUFA 3A2XA 2EIQA 4KX4A 1F2EA 3FKFA 4BVXA 4IQ1A 2N5FA 4NMUA 1A23A 2YWNA 4GTUA 3RHCA 1XOBA 2FHEA 1S3CA 3W6GA 5G31A 4YQVA 2GQKA 4FYUA 1AUCA 3L78A 1GL8A 3IAS2 1T4YA 5KN3A 4IGJA 1DBYA 1K3OA 2HRFA 2WS2A 3H8QA 3GL5A 1G7OA 4ZBDA 2V41A 4K6XA 4I97A 1A2JA 3APQA 2PERA 3RHBA 2GT6A 4KB3A 1YDKA 1ZGNA 2VCWA 5H5RA 3IDVA 3HJPA 4IBPA 3TOUA 2G2QA 2YZHA 3O76A 1SD9A 1MEKA 1ERWA 2H71A 3WYWA 1ZOFA 4OMVA 3JCML 3ZITA 3EU4A 8GSSA 1JLVA 22GSA 3KH7A 4ECJA 4TOPA 1R26A 1TJDA 4KE3A 3GH6A 17GSA 4MZWA 1T8EB 5LD0A 2NDOA 2H1GA 3TJJA 1A8YA 4IELA 4GQFA 3TKSA 3PGTA 2MMOA 2M72A 2LRTA 2C3TA 4GQCA 2PGTA 4IKHA 2CZ2A 3E3EA 3GRXA 1XFLA 1M2AA 1GRXA 4ZB9A 3P2AA 4TXOB 4WR4A 1EWXA 1RW1A 1CQGA 2C3QA 1GH2A 1B9YC 3RPNA 1XWAA 3ZVJD 2YOIA 3R2QA 2YWMA 1X9WB 4TW5A 3VWVA 3TJGA 4DSRA 3EVIA 3MDKA 5D9TA 3F4RA 4BA7A 3QFBC 2VD0A 2GTUA 2FWEA 2YANA 2HNLA 3IK9A 1TTZA 2C0EA 1TOFA 4JU5A 5DJLA 5J9CA 1SJ6A 3C8EA 4L8EA 4MZBA 1JZRA 3IHQA 4JBBA 2H6ZA 4I2TA 4GSNA 3KP9A 1WOUA 2PMTA 3P7XA 4EF0A 4KAEA 1QK8A 4Q5NA 3IK7A 1O8WA 1A8LA 1ERVA 1QMVA 1V9WA 1ERUA 4IQAA 3GKXA 2WRTA 3ME8A 1PA3A 4Q5FA 4ZB6A 4ZB8A 4V1Ag 2WB9A 5FT3A 1AC1A 1T4ZA 1BX9A 2GVPA 3APSA 2GZZA 3DRNA 5CRHA 1SK2A 5GZZB 1VRSD 1O6JA 5F06A 1MDIA 4HS1A 4IP6A 1YEPA 4LL1B 3DIEA 1NM3A 5ECMB 3HJMA 2IWTA 2V2GA 2OACA 3D5JA 3GUSA 5A4UA 1SL0B 1ML6A 4K9ZA 4MP4A 4PQHA 1Z5YE 1AQXA 4TR1A 5ID2A 5LNKe 5CREA 4TR3A 1A2LA 5IMZA 1H4OA 3SBCA 1TKDB 2LJAA 3VLNA 2R37A 2FCHA 3CSHA 2GZPA 4TVEA 5G30A 1XWKA 2FUG2 5HQPA 3NOFA 1I9DA 2LS5A 1EV4A 1YF1A 3KM6A 5ECIB 1FG4A 3VWUA 5IMCA 1XCCA 3D22A 3M9KA 1M9BA 1R4WA 1TU8A 3F63A 1SD8A 2D2ZA 3FR9A 2RM6A 1AW9A 1YKCA 1T00A 3KTLA 4WXTA 2DSAA 3KZQA 16GSA 2H1AA 1K0OA 1GLPA 1XVQA 1YF0A 2H0IA 2J9HA 4HJMA 4KGIA 3M1GA 3LGCA 1AXDA 1F9MA 3ZLPA 4IHUA 2LNTA 4HJ2A 5C04A 4K7IA 4MPFA 1WWJA 5IM9A 13GSA 1UVZA 3RBTA 3ZRDA 1XWGA 4K1FA 4EE0A 1EV9A 5E59A 4QQ7A 1YEXA 2G0FA 2JZSA 5HFGA 1XWBA 4EDZA 4MLYA 1N2AA 2IMKA 5H5SA 1X5EA 4CDOA 3CTGA 4XS1A 3TKSE 2FGXA 3F6FA 6GSXA 3LXZA 1PMTA 3LSZA 1A2MA 3DWVA 2LSTA 4KA0A 1R7HA 1GTBA 1SL1B 5ECNB 1OKTA 4LMWA 5L71A 3HKRA 3HHVA 4PNGA 1BQ7A 3UAPA 2YNXA 2NTOA 4F82A 3Q6OA 4GF0A 2X64A 1XPVA 2V6KA 5ECSA 3KIJA 2YZUA 1BEDA 4KDYA 4TR0A 5IOXA 3KXOA 2YV7A 1TRVA 2ZCTA 4OCFA 2ZUPA 4RI6A 4V2MA 4KSMA 2IMEA 2C4JA 7GSSA 3QMXA 4QL7A 2OE0A 2H73A 3FW2A 2H0HA 5HR2A 1OE8A 1EGRA 1FOVA 2OADA 1PX7A 3FZ9A 4ML1A 3DMLA 2VD1A 1WRYA 1XXUA 1X0RA 1HNAA 3L0HA 4MDCA 4F03A 1XW6A 1V57A 4LA1A 2FY6A 5HR0A 4FYCA 2V6OA 2R3XA 3NZNA 1OC3A 1U6TA 1O73A 1URMA 4IP1A 2B7KA 4AF2A 4J57E 2HE3A 1PQNA 4O92A 2YJ7A 1T3BA 1AQVA 2N5BA 4L5LA 2LEGA 5EL8A 2HI7A 3VPTA 3IA1A 1W89A 4WBRD 1E2YA 3QD9A 2H72A 2H74A 2O89A 3EYTA 4HOJA 2HZEB 3HXSA 3ZTLA 2ZNMA 2FWGA 2P5QA 3PH9A 4F0BA 2TIRA 2VM1A 3QAGA 3HY2A 1BJXA 4EDYA 2YPMA 3GTUA 1K0AA 2WULA 2X8HA 3WGXA 4EXJA 3HCZA 5IO0A 4NXIA 4DSQA 4TKYA 2B5XA 2DJ3A 4V2LA 2L6CA 5ECHB 2LUSA 3TRXA 1BG5A 4MH2A 1K3LA 4OO5A 2CVBA 3LQ7A 2RIIA 4MH3A 3AY8A 1KBNA 3TKQA 5GAND 2VCZA 4L0WA 3D4MA 2AB6A 5B8BA 4F2IA 4HU9A 4N11A 4PX1A 3F6DA 5J3RA 2OE1A 4IN0A 4MPGA 2IMDA 2MMZA 3KJYA 1SK1A 3MNGA 1YJ6A 4OFTA 1UA5A 2CVDA 4V1Ap 4FYBA 3UEMA 1X9MB 1HNCA 1EP8A 1Y25A 5ECKB 3WGEA 3IPZA 3QPMA 4NWYA 3GMFA 2I9HA 4F9ZA 2M80A 2XPEA 3VPQA 2IPAA 5CRGA 2B1KA 5EPFA 1A24A 2VCQA 5D9XA 2XHFA 2CZ3A 3ISOA 1G6WA 3I6AA 3LG6A 3J7Yk 5KEJA 5ECRB 1XVWA 1O81A 1FB6A 1SL2B 1J0FA 1AQWA 4NHWA 2MMAA 1C72A 5CYYA 4K0GA 5ELGA 4FIWA 1VGLA 2IIYA 5CO3A 3GKMA 2GGTA 3FK8A 3KD0A 5DALB 1XOAA 4MK3A 5B7CA 3EURA 5ENUA 4HUAA 1EEJA 19GSA 4EO3A 2P0GA 4F0CA 4EL1A 5ECOB 3UL3A 2RM5A 2AV4A 4ILFA 2QC7A 4NPBA 4BVYA 2LNSA 3KTBA 2IFQA 5C00A 3GKNA 1TRWA 4D73A 3WT2A 4GWRA 6GSYA 1T7PB 3D0ZA 1B8XA 4IW9A 3MAKA 1XBSA 5IMAA 1GTAA 1TRSA 2DJKA 3H4KA 2YCDA 3GX8A 4ZXGA 1M0UA 5DCHA 5JCUA 3EWLA 3W8JA 4ECCA 5G2ZA 5CP1A 1PN9A 2IMFA 3DEXA 4J2FA 1SJIA 2LJKA 5F05A 3VWWA 2HZFA 2B1LA 4G19A 2JU5A 5DBQA 3TDGA 18GSA 3Q74A 2MMNA 1OC9B 1IYHA 1V58A 5EY6A 3C1SA 3FRCA 2OKAA 4AGSA 2VO4A 2V1MA 1B4PA 4OO4A 4XRDA 2P5RA 2YV9A 4L0UA 3GIXA 4PUFC 4V2NA 20GSA 1JHBA 2PVQA 4WETA 1Z6NA 2ON5A 2HRNA 3F9UA 4G2EA 3HA9A 4POMA 2XBQA 4XS4B 4PQIA 1R5PA 1PD21 4K7OA 3DVXA 2AJQB 1EGOA 3QCPA 1JFUA 1PGTA 1V40A 3QFAC 2O85A 2NPBA 4ACSA 4HZ2A 5JWQB 2OA7A 1TI1A 3CBUA 1SU9A 4NHZA 2ON7A 2IL3A 3TKRA 5D8IA 2LQOA 4MA9A 4RUVA 2CAIA 4LMVA 1GSEA 5A4WA 3CMIA 2VL9A 3M9JA 3GYKA 2HXKA 5E4WA 2X8GA 2C1YA 3DD3A 4L5OA 5HR1A 5DAKA 2K18A 1F3BA 1PRXA 1GTUA 3VWXA 2LV3A 1G7EA 2PVOC 3WGDA 1O8XA 4CW9A 4DVCA 3LYPA 2E0QA 2FA4A 2C0DA 2ES7A 1V2AA 4MJEA 5LCZA 3KMNA 3FZAA 3QOUA 1K3YA 2QGVA 1TP9A 5G5EA 2VLVA 3HZ4A 5CAXA 3IR4A 1ZL9A 2LKUA 3BCKA 4I5QA 3ERWA 3GH9A 1FVJA 5ECLB 3ME7A 1THOA 2BJXA 1M2BA 4HQSA 3I43A 4JE1A 1GP1A 2O87A 2OE3A 2KP2A 3CSJA 3WD6A 3H93A 3LWAA 2PU9C 5G5FA 2L5OA 2EIRA 4KDXA 5KN0A 1RQMA 2DJ2A 3D4TA 2H1DA 3ZL5A 1TXXA 2FD3A 4G9HA 4I2UA 3ZVJA 1OC8A 1GSDA 3RDWA 1DE1A 2VAFA 4HU7A 2LRCA 3L4NA 2JZRA 2WGRA 3ZIVA 3ED3A 3L9VA 4PGTA 1UN2A 1DUGA 2PWJA 5F07A 4ML6A 1LU4A 3EMXA 5KN1A 3MWHA 1PSQA 3M3MA 2L4CA 3IRAA 2VL2C 2I3YA 4BL7A 5IO2A 3BOAA 1K0BA 2IMIA 1OE7A 2L4QA 3K8NA 3KH9A 1NHYA 2GQLA 2P31A 4YAVA 2OBKA 2CV4A 3GHAA 4PURA 2CX3A 2FNOA 1LJRA 1TW9A 4H86A 3EU3A 4GLTA 4TR4A 3ZZXA 2RLIA 5A4VA 1ON4A 3GURA 4ID0A 4AJ7A 4G10A 3D21A 3BD2A 1PX6A 1OYJA 2H01A 3VK9A 3SWLA 2JZTA 2YN1A 2PN8A 2R2JA 1TI3A 3WT1A 2PPTA 4XTSA 4POLA 3DGQA 1F37A 1GTIA 3F0IA 3J7Yb 1T1VA 3FY7A 4OCEA 4XCSA 4KNDA 2DLXA 3I69A 4MJCA 6GSUA 5JWRB 3HVSA 2JSZA 3GNJA 4KCEA 1QGVA 5AIVA 4YAPA 4BWQA 2A2RA 3M8NA 4WBJA 2HYXA 3RPPA 2PUKC 3N5OA 1HQOA 2X8CA 1Z9HA 3TGZA 3TRPA 1XZOA 3DVWA 2DC5A 3P90A 4NAXA 4ECIA 5GSSA 4ZBAA 6GSVA 1VF4A 3Q18A 2AAWA 3PINA 2NVLA 2VIMA 3A3TA 2JACA 2JL4A 3E0UA 4TXVA 5G1KA 1CQHA 2I4AA 2IN3A 3TB2A 4RQRA 1A0FA 1QXHA 2O7KA 2XPDA 4ZL7A 5D9WA 5ID2B 4TR1B 2WZ9A 2GDRA 5GAPD 4TXOA 2H6YA 4DEJA 1XWCA 4P3YB 2LJRA 2VCVA 1WE0A 3OR5A 1SKWB 4IJ3A 4N10A 3UBKA 5ABRA 3TRQA 2FA8A 3HJOA 4XRAA 4CHSA 1U3IA 1SKSB 4ECBA 3EINA 2QSIA 4MCUA 1GNEA 1MDJA 2REMA 1WJKA 4HZ4A 2KOKA 1MTCA 1GUMA 2DIYA 1H75A 1EP7A 2TRXA 1Z6MA 2FWFA 3H79A 1QUWA 3N9JA 3VFIA 1U88A 1SJZA 5IMDA 4EVMA 2HT9A 5CRWA 5JWOB 2BMXA 1OAZA 1QQ2A 2DJ0A 5AIXA 3C73A 1OVNA 3UOMA 5D9VA 1WMJA 5DDLA 2CA8A 3KP8A 1NHOA 4ZL9A 2GT5A 4PUAA 5ECQB 1MD4A 2F8AA 4XS6A 2EIOA 2LQQA 2DIZA 4N0VA 2RUEA 5F8BA 2L59A 3U6VA 3FR3A 4AJ8A 2GSTA 3IV4A 3MSZA 3UBLA 2EC4A 4BPYA 3EC3A 2YWOA 4Z7XA 3IOSA 10GSA 3Q19A 2LTKA 3FR6A 4KH7A 2DJ1A 2AUVA 3IBHA 4MF7A 2HSYA 3ERFA 3HYPA 1GSQA 3G7IA 6GSTA 3IE3A 1ERTA 1FAAA 3G7YA 3BBYA 1Y6EA 3CRTA 5IMVA 5DVBA 1R5AA 3GSTA 1ZYEA 2AYTA 4YQUA 4ISDA 2O8VB 2C80A 1F6MC 3C71A 4O32A 3HD5A 3QAWA 4J56E 2K8SA 2WJUA 1GSUA 4KW6A 4ZILA 4LL4B 5INYA 2HLSA 1NSWA 2IJYA 2WCIA 5IIZA 3ZFLA 2BTOT 4GSSA 1YKAA 3LYKA 4K2DA 4PNFA 2VLTA 3GL3A 1DSBA 1MD3A 3EE2A 4XIHA 1KEBA 2QKEA 1EOGA 4QL9A 4EC0A 5EVOA 4IS0A 5J9BA 5HFIA 2R5GA 1TDIA 2C3NA 4WF5A 5B6MA 2NBSA 5DCGA 1NW2A 4OD7A 1X5DA 5ELAA 3HVXA 3GV1A 3KGKA 4YQMA 4K0NA 2GSQA 1M2DA 3F4TA 2KHPA 5GSTA 2DMLA 1KTEA 3FYGA 4ZIJA 3F3RA 1B4QA 2H6XA 3KEBA 2F3MA 1V98A 3A2VA 3BCIA 4FO5A 1SK0A 5B8AA 1FB0A 3D6IA 4MMMA 4I8BA 5CRDA 1JZOA 3F8UA 1FVKA 1XW9A 2B5EA 2H0GA 3NIVA 2VOCA 2E7PA 1ZMAA 3UMAA 3HZ8A 2VLUA 1JZDA 3U5RE 1GNWA 2GS3A 1PKWA 4POBA 3LEFA 4ULXA 3LJRA 2I1UA 1W4VA 1SYRA 3V1WA 4Q5QA 2LRNA 2DBCA 3FEUA 1GUHA 3GTUB 6GSWA 3CXGA 1WIKA 4N30A 2B5YA 1FO5A 4XHMA 1A0RP 1FHEA 3HVVA 2N5AA 1BAYA 1ZYQB 5DQYA 3VI5A 4N0ZA 2JSYA 4HEA2 2L6DA 2OJLA 2K8VA 2VL2A 4HI7A 1TRUA 2VCTA 4OFMA 9GSSA 2GLRA 1SKRB 5HR3A 4MF5A 3F4SA 3C7MA 4MJBA 3US3A 4WF4A 1ZZYA 5AN1A 1JLWA 2C8UA 2F9SA 2HFDA 2WDUA 2HSHA 4WKWA 1EZKA 3ZMLA 1SYXA 1EEMA 1B9XC 4GXZA 1AIUA 1AAZA 1LBKA 4MABA 3L9SA 3A5WA 4X1UA 1VF1A 2MBTA 2J23A 12GSA 4WEYA 3QR6A 4AJ6A 3CSIA 4JRRA 5FHIA 1GSYA 1TU7A 1Z7RA 4OWYA 2GSSA 2H76A 2I81A 5COHA 1Z3EA 4KSOA 3VI7A 3GN3A 2AHEA 1X5CA 4KUNA 2B3SA 4ZL8A 4I6XA 2K6VA 4HQZA 3TKSC 3W8SA 4GCIA 1ABAA 2H70A 4DSSA 1RK4A 1GSFA 1GWCA 2L57A 5F0GA 5B6NA 2HZEA 1EOHA 3GSSA 2OBIA 1YY7A 1SENA 1IYIA 1PL2A 4MZCA 2C0FA 5JCWA 4O7HA 2FLSA 1S3AA 4Q5RA 2B6MA 3L9UA 3O6TA 1K0DA 1M99A 2IFQB 4X0XA 3TUEA 4D73B 1VF2A 4FH8A 4MJAA 14GSA 1O85A 2XC2A 3CRUA 2M46A 5DJMA 3H1NA 1TK0B 1GULA 3FZ5A 4LLRA 4ZBBA 3TJBA 3HDCA 3ZYWA 2KUCA 1VF3A 1GSSA 2MYGA 1TK5B 1O7UA 4BWSA 2R6KA 3EMPA 1Q4JA 1PL1A 3DYRA 1USBA 5G1LA 4JR6A 2VUPA 3RAZA 1HNBA 2WFCA 3LXTA 5D93A 4K8MA 2X99A 3A2WA 4JR4A 2JADA 4O5RA 1WP0A 4KCAA 3P8WA 3I9V2 2H75A 3ERGA 2DMMA 3TKPA 3TCOA 4EUYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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