5INYA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f8
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 48
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5inyA00
2ZCTA 4ULXA 3TKSC 3BJ5A 4ACSA 1A2MA 1F3BA 5KN3A 4K6XA 2LJAA 4FO5A 2VD0A 4IP1A 3LGCA 1AQXA 4I2TA 2DJ1A 2X8GA 1CQGA 2N5AA 1AUCA 3TJKA 5J3RA 5JWRB 3ZFLA 1X5EA 4KDUA 5GZZB 5AGYA 3LFLA 3H79A 1ZGNA 3M1GA 1ILOA 1BYEA 2KLXA 2PVOC 4I5QA 1CQHA 1XIYA 4WF4A 1TRWA 1GP1A 4XS4A 2H0GA 3P8WA 1GTUA 5H5RA 1GSDA 1RW1A 2E0QA 2H0IA 2KHPA 4IJ3A 1Z6MA 2HYXA 3FR3A 3UEMA 3VLNA 1JZWA 4WR5A 1BQ7A 3ZZXA 1I9DA 2OE0A 2PWJA 2VM1A 1FW1A 2F51A 3A5WA 3FR9A 2YV7A 4K7NA 2WJUA 3I43A 4N11A 1HYUA 4Q5QA 2VL9A 1U88A 2CX3A 4MZCA 1HNCA 5KEJA 3F3RA 1Z7RA 3TGZA 1T4ZA 2PUKC 4EDYA 3ME7A 3TKSA 2YWOA 5DDLA 5D9TA 3IPZA 1SL2B 4MA9A 4RQXA 3L4NA 1Y25A 3CTGA 2FWGA 2JU5A 4ZL9A 2I1UA 4GF0A 5B7CA 3IA1A 3GN3A 2VAFA 1OC9B 4JRRA 3IK7A 1HD2A 2I81A 2JZRA 5CNWA 4P3YB 2OBIA 2LRTA 3QCPA 5F07A 1SJIA 3DXBA 4MJAA 2VCQA 4BWQA 3TKSE 2IMKA 3FK8A 3F4TA 2ES7A 4ISDA 2MMZA 3HVXA 11GSA 3TJFA 2H72A 2GT6A 4ML1A 1PGTA 2GQLA 3UJ1A 3P90A 5KN0A 5IMDA 3LQ7A 4O92A 5DALB 1GTIA 4EE0A 1GUMA 1W89A 4QL7A 5IPGA 1PSQA 4NWYA 1S3AA 4PQHA 4OO5A 3EINA 3I6AA 3FEUA 5HR2A 3VURA 2P31A 2B5YA 2WGRA 4Q5NA 1RQMA 2TRXA 4GQCA 2TRCP 1SD8A 4V2MA 1ERWA 2CAQA 2N5FA 3H93A 2HRNA 3ZIVA 5G1LA 1K0BA 2O87A 1EZKA 14GSA 2H19A 20GSA 3OR5A 4WR4A 5ENUA 2ON7A 1T7PB 1TI3A 2O85A 1MDKA 1Z5YE 3HYPA 2ON5A 3I9V2 5GSTA 4NPBA 1GL8A 3IHQA 5IIZA 4Q5RA 2IMDA 3C8EA 1A24A 4LA1A 4F0CA 2B5XA 1TU7A 4RQRA 3M3MA 1B9XC 1SK2A 1VF3A 3H8QA 1SKRB 2DJJA 1EP8A 4TVEA 2GS3A 4FH8A 2I3YA 1FHEA 5EPFA 4OFNA 3GTUA 4HOJA 3PR8A 2IJYA 1DSBA 5D93A 1KBNA 4MP4A 5F0GA 4IJIA 1PQNA 3TDGA 1GSYA 3TB2A 2JADA 4MCUA 3KCMA 4N0ZA 3APOA 1K0CA 2FWFA 3QAGA 4TXOA 2FCHA 2G0FA 3M0FA 2EIQA 3F4RA 1PL1A 1FAAA 1HNAA 3IAM2 1SL1B 1A2LA 3A3TA 4MZBA 1XWKA 1O8XA 4K1FA 3U6VA 2H8LA 1OVNA 1TXXA 4ECJA 4AJ7A 1VF4A 2IMEA 3H1NA 2H01A 5ECIB 2YNXA 2OACA 3UOMA 3ZREA 3DVWA 1M0UA 3F4SA 4PUAA 3ZLPA 4DEJA 3F9UA 2PMTA 2LJRA 1V58A 2GSRA 2FNOA 4O32A 1IYHA 4G19A 5IM9A 2VUPA 2OADA 5CP1A 2B6MA 1T3BA 3BCKA 4KSOA 1PX6A 4BVXA 4V1Ag 1JLWA 1XXUA 3J7Yk 3HJMA 3HA9A 5ID2A 3UL3A 1T4YA 5B8AA 2NTOA 2B7KA 2CAIA 1XPVA 4EVMA 2DIYA 2C80A 5IMAA 2YCDA 4DSSA 1AQVA 2O7KA 4MJEA 1NHOA 5D9XA 5JWQB 2H6ZA 3DIEA 3P7XA 3RPPA 1M7TA 3DD3A 4MJCA 1EGOA 4HS1A 2IMFA 1F37A 3QFBC 4AJ6A 1K3LA 2WCIA 4OD7A 5DJMA 5C00A 1A23A 3EMPA 3ZIJA 3QFAC 5CRDA 2B1KA 3UIWA 2Z9SA 3HCZA 4YQVA 5ECMB 3HJOA 4K8MA 4V2NA 3FHKA 4K2DA 4ZIJA 4NXIA 1X9SB 1R4WA 1TTZA 4GSTA 5G1KA 3TJJA 5DCGA 5IQYA 3FZAA 4RI7A 1UC7A 4WEYA 2DJ0A 4IP6A 3ERWA 3BOAA 5G31A 1W4VA 4D73B 2REMA 3CRTA 5F8BA 2XPDA 4HQSA 1MD4A 1MTCA 1ON4A 2E7PA 1F3AA 1QFNA 3TUEA 1PD21 3IK9A 1V2AA 1X5CA 3L9VA 4ZBBA 5J4UA 2QC7A 2X64A 4F03A 4LMWA 4POBA 5HQPA 5GSSA 3IV4A 1WPIA 4JZQA 3DEXA 1XOBA 3S9FA 1PKZA 1FVKA 5CRGA 3MWHA 1YEPA 3GRXA 4EXJA 2EIOA 3C7MA 5IPHA 4ZB8A 5IOWA 2H1AA 2NBSA 3G7JA 2V6OA 1WRYA 1O6JA 5DJLA 4G9HA 3UBKA 1AQWA 1GH2A 2C0DA 1AXDA 2WFCA 1EEMA 4PNFA 1K0MA 1R7HA 2VL3A 1AC1A 5CRHA 4H86A 4MZWA 3FZ5A 2L4QA 3UBLA 2AYTA 2V2GA 5A4VA 2RUEA 4Z7XA 3FR6A 2I4AA 8GSSA 1OE7A 3L9UA 1JFUA 4IS0A 1ABAA 4FYBA 3RBTA 4ML6A 2FY6A 3HXSA 2A4VA 1O85A 2O8VB 4MPFA 4FYCA 4TXVA 3GSTA 1OYJA 4TKYA 2D2ZA 1JHBA 2DMLA 1RK4A 2R37A 4F82A 2M72A 4KE3A 1XVQA 1G6YA 2MBSA 4XS4B 1V57A 3M8NA 4TRXA 2X8HA 3WGDA 1SU9A 5L71A 4K0NA 2JZSA 2M46A 4N0VA 5HR0A 1QXHA 3K8NA 3GYKA 1M2AA 1ZL9A 3DVXA 5B6NA 4HZ4A 3APQA 3MSZA 3GSSA 1A0RP 4PXOA 4OCEA 4ZL8A 4OFMA 1AIUA 2TIRA 2VL2C 5ECNB 6GSWA 1OE8A 2R6KA 3GL3A 2L5OA 3ZVJD 3QPMA 3F0IA 3SWLA 4K7IA 2YJHA 2GGTA 2RIIA 2L57A 1MDJA 3MDKA 4CDOA 2DJ2A 3HHVA 4MLYA 3GV1A 5CREA 4KGIA 1KTEA 1X5DA 2FUG2 2VCZA 2H73A 4N10A 4K7OA 2YZUA 4L5OA 2VCXA 3GKKA 1F9MA 1UN2A 3GX0A 1GTBA 4PX1A 1B9YC 3U5RE 1FB0A 1JZRA 4BL7A 1XW5A 2VCVA 2JSYA 4IW9A 4IVFA 2GTUA 2MBTA 4KDXA 1KEBA 3KTBA 1TRUA 3IRAA 3J7Yb 4AGSA 3O3TA 1GTAA 3NZNA 3TOUA 3N9JA 2H1GA 1OAZA 5COHA 1HNBA 4ECBA 2PU9C 1EV9A 1TW9A 4LL4B 1J9BA 4F9ZA 4CHSA 5AIVA 3TRXA 2DBCA 3CYNA 2PBJA 1SJ6A 1SK1A 4O5RA 4IQ1A 5DQSA 1B8XA 1WJKA 2VL2A 3ZMKA 5G30A 2IFQA 3O6TA 4KA0A 5HFIA 2GZZA 3KGKA 2K8SA 3TOTA 5B6MA 1B4QA 3KJYA 5FHIA 4NHWA 1XZOA 3TKRA 3GMFA 2XBIA 4TR1A 2H0HA 5H5QA 2PN8A 3US3A 5JCGA 2CQ9A 3Q18A 2IN3A 1NW2A 4WBRD 3ZFBA 3G7IA 2PVQA 5KN1A 3C1RA 1VGLA 2L5LA 2GSTA 4LL1B 5H5SA 2GZPA 3IC4A 1A8LA 1H4OA 22GSA 2LTKA 3UVHA 3KH7A 2XC2A 1U3AA 5D96A 4ID0A 2V32A 2WDUA 3GTUB 4I6XA 2AV4A 4E8EA 2VCWA 1XWGA 5IMZA 2FD3A 3TKQA 2DSAA 3NIVA 2N5BA 3FKFA 3KMNA 1VF1A 1FOVA 3WGEA 4WXTA 4HU9A 1NM3A 3KP8A 2IPAA 2R5GA 1TK8B 6GSTA 2OJLA 3L9SA 2HZEA 4X1UA 3KEBA 3RHBA 4MF5A 1TK0B 4TXOB 3H4KA 3GKNA 1Z6NA 4F2IA 3EU4A 1QGVA 3HY2A 5G5FA 3HZ4A 2X8CA 1GSSA 3E0UA 3VI7A 1X0RA 5IMFA 4BWSA 3R2QA 3PGTA 4EO3A 5DALA 4HJ2A 2YN1A 5JCUA 4IELA 1GWCA 5ELGA 4OFTA 3IOSA 2R4VA 1XWCA 1OKTA 4ECIA 1V98A 4L8EA 5DAKA 4XRDA 2LRCA 3GNJA 2CV4A 2FWEA 2H1BA 2C3QA 2AB6A 4OO4A 5B8BA 1DE1A 2C4JA 3ZVJA 1ERVA 4TR4A 2P0GA 4LLRA 3UVTA 1XOAA 2EC4A 2GVPA 2IIYA 3W8SA 2ZUPA 5JWOB 3Q6OA 4TN8A 3GUSA 3QOUA 2B3SA 1PA3A 2NVLA 4MF6A 1TI1A 5ID2B 1GRXA 3ERFA 1LJRA 2MZCA 5HFKA 2QKEA 3ED3A 1J08A 2H75A 4XS1A 2GLRA 1AAZA 2LNTA 3G9BA 4DSSB 1Z3EA 1THOA 4J56E 3KTLA 3ISOA 5G2ZA 3LSZA 2WS2A 3F6FA 1TRVA 4WETA 3TRQA 4GSSA 4OMVA 4QL9A 2DIZA 1Y6EA 2OE3A 3FZ9A 2H76A 4HDEA 3HKRA 1K0NA 2KUCA 1TKDB 5CYYA 1FB6A 2PPTA 1EOHA 1EV4A 4L0WA 2K6VA 4J2FA 3AY8A 2AUVA 2AJQB 4QQ7A 4V2LA 1T00A 2YPMA 2C0EA 3A2XA 2YJ7A 3VFIA 13GSA 1G7OA 4TOPA 3EWLA 3CSHA 2HI7A 2FLSA 2H1DA 4BPYA 4I97A 1XW9A 1SYRA 2IWTA 1Q4JA 1WWJA 4AJ8A 3WT1A 1NSWA 4MF7A 3APSA 3BD2A 4IGJA 3FRCA 4LMVA 3ZITA 3VPTA 3F63A 4WBJA 3FY7A 5ECSA 5C04A 2CVBA 2F8FA 4EF0A 5HFGA 2GT5A 5E4WA 3EVIA 4XRAA 1GUKA 2YWMA 4PNGA 4MPGA 1NHYA 4EC0A 2C0FA 3LXTA 2IL3A 2CVDA 3D0ZA 2FA4A 2DJ3A 1OC8A 6GSUA 2HNLA 5F06A 1GNWA 4F0BA 1QK8A 2PERA 1Z9HA 1PL2A 2B7JA 3RHCA 4EDZA 3IAS2 1O81A 3QR6A 3GL5A 5A4UA 1E6BA 3KMOA 2LV3A 4XIHA 5DVBA 2PGTA 2YZHA 5D9VA 1U87A 1TOFA 2FHEA 3GH9A 2F9SA 2HXKA 2VLTA 1GSFA 3VI5A 2LQQA 4AF2A 4KAEA 1YF0A 4GXZA 9GSSA 3CSJA 3ZMLA 3CBUA 2JACA 4ZB9A 4JE1A 3A2WA 2YANA 2E2GA 2WB9A 2ALBA 6GSXA 1YEXA 4MJBA 2HZFA 2YWIA 2H70A 1B4PA 1M2BA 3ZL5A 1ZCPA 4D73A 3GHAA 3LXZA 4RUVA 4KSMA 3KM6A 12GSA 2MMNA 3VWWA 5IO2A 3E3EA 2ZNMA 3MAKA 5ECKB 1K0AA 2MMAA 4DSQA 1XW6A 3CSIA 3GURA 4J57E 2XHFA 3PINA 1X9WB 1YKAA 2KOKA 2XBQA 3BCIA 1WOUA 4ZL7A 2X99A 4GWRA 4BVYA 2G2QA 3D5JA 3IR4A 4K0GA 5ECQB 1EWXA 1QQ2A 4IBPA 5EY6A 2AHEA 4KW6A 2HSYA 3TRPA 4POMA 2LUSA 1FVJA 5HR1A 1R5AA 1R26A 2V6KA 1THXA 3WGXA 2LJKA 2KP1A 2OKAA 4IN0A 2GZYA 5F05A 4RI6A 4JU5A 2DC5A 5CO3A 2GSQA 1FO5A 1OKDA 2C3TA 2QSIA 4PURA 4FIWA 2MYGA 3VWXA 18GSA 4I8BA 1M9BA 1GSQA 2YP6A 1YJ6A 4IQAA 2DJKA 4WKWA 5IO0A 2RLIA 3EC3A 5D73A 3ERGA 5ECLB 2WRTA 1YQ1A 4I2UA 1GULA 1EGRA 1PRXA 3IBHA 3EE2A 3NOFA 1X9MB 3LORA 4ZBDA 5DCHA 1EOGA 5A4WA 2B5EA 1YF1A 1TP9A 2IFQB 4YAPA 2RM5A 4MMMA 4TW5A 2NPBA 4PGTA 16GSA 5J9BA 4EUYA 1QMVA 3WT2A 3V1WA 4TR1B 1LBKA 4EKZA 4JR6A 4MDCA 4NV5A 5GAND 1XWAA 2VD1A 3GIXA 1IYIA 1B48A 3IDVA 2P5RA 4DVCA 2HE3A 5KN2A 1SJZA 2CT6A 2OBKA 1M9AA 4GTUA 3VWUA 2L6CA 3D6IA 3UARA 1I5GA 3D21A 1GNEA 2R3XA 2E2MA 1XVWA 3LYPA 5LD0A 4OWYA 1VF2A 2DLXA 2QGVA 3WYWA 2CZ3A 4MK3A 3W8JA 4TR0A 3HJPA 2P5QA 3QMXA 3LYKA 3L78A 1SKSB 2WZ9A 1ML6A 3FYGA 5HR3A 2VM2A 3DMLA 3DWVA 3JCML 3DYRA 17GSA 3C73A 4YQMA 5J9CA 4HEA2 3LEFA 2H30A 1FG4A 2K8VA 2HZEB 2VLVA 3DKSA 3C71A 3CTFA 1ERTA 4JR4A 1XCCA 3KD0A 4L0UA 1PMTA 4GRFA 2F8AA 1SK0A 2C1YA 2VCTA 1N2AA 1YKCA 3GX8A 3GKMA 4JEDA 4GQFA 4KB3A 3KXOA 1SL0B 1TK5B 1GUHA 2NDOA 4YAVA 2A2RA 2J23A 5ECRB 3ZTLA 4NMUA 5EVOA 4XHMA 1E2YA 3KZQA 1DE2A 2OA7A 3HDCA 2V1MA 5DAKB 1U6TA 1OC9A 1N8JA 3P2AA 1WIKA 3CMIA 4HU7A 1GLQA 4YH2A 5INYA 3HZ8A 1G0TA 1PX7A 2EIRA 2H6YA 3D4MA 1YZXA 2WULA 3GA4A 3IXRA 2BTOT 1R5PA 1UA5A 4KNDA 4CW9A 5EL8A 1USBA 3KP9A 1F2EA 3N5OA 5ELAA 3LWAA 1URMA 4EL1A 1WE0A 3DRNA 1UVZA 2VIMA 2LNSA 5D8IA 4GLTA 1TU8A 4MH2A 4HJMA 5FT3A 4HUAA 4K9ZA 4ZILA 1GSEA 1TRSA 1BEDA 1TJDA 2RM6A 5LCZA 1XWBA 4Q5FA 1J0FA 3QD9A 2HSHA 3ME8A 1U3IA 2B1LA 1ST9A 1G6WA 3F8UA 1VRSD 4MH3A 5ECOB 1MEKA 1PKWA 1S3DA 1V40A 5DBQA 3CXGA 1WMJA 2H66A 1ACVA 2BJXA 1WP0A 3EURA 2FWHA 3D22A 1ERUA 4TR3A 1BX9A 2L59A 19GSA 3TJBA 3QAWA 2LSTA 3A2VA 5CRWA 4G2EA 2L6DA 2CX4A 4GSNA 1F6MC 4HI7A 3VPQA 2YOIA 4N30A 2O89A 5AISA 3KH9A 3HVSA 3FW2A 1GLPA 3HD5A 4FYUA 1O7UA 6GSYA 1OC3A 5JCWA 1ZOFA 1JZOA 1M2DA 1XFLA 3C1SA 3VK9A 3F3QA 3L0HA 1M99A 2J9HA 1EEJA 3ZRDA 2HRFA 1Q98A 5IMVA 3TJGA 1T1VA 3GH6A 2V41A 1K0DA 1BAYA 1SD9A 1A2JA 3F6DA 3FZ4A 1DUGA 4V1Ap 3QAVA 4ZB6A 1LU4A 4POLA 4POKA 4KDYA 3LJRA 2YV9A 4KH7A 4ILFA 2A2SA 1SENA 2MMOA 1A8YA 4IKHA 2GQKA 3HVVA 4NAXA 1C72A 3EU3A 4PUFC 3Q74A 4HQZA 3E9JB 3W6GA 2C0GA 1AW9A 4JBBA 2H6XA 2H74A 4GCIA 2F3MA 4G10A 2FGXA 2HT9A 5AN1A 4KCAA 4XTSA 3WD6A 3KIJA 2LQOA 3QDNA 3SBCA 7GSSA 3TCOA 3LG6A 4WF5A 5GAPD 5D9WA 4YQUA 3PH9A 3UAPA 2GDRA 4PQIA 3RDWA 1MD3A 1Z7PA 2K18A 4X0XA 1BG5A 1BJXA 1GSUA 2I9HA 3O76A 2KP2A 1ZYQB 2JL4A 5CAXA 5AIXA 3EYTA 5A5KA 2M80A 2BMXA 3DGQA 3M9JA 1V9WA 1EP7A 2R2JA 1XBSA 2JZTA 1SYXA 2H71A 2GSSA 3BBYA 4MABA 2YWNA 4OCFA 1MDIA 1O73A 4KCEA 5E59A 2GQMA 1O8WA 2LEGA 4KX4A 4BA7A 2OE1A 2IMIA 1JLVA 5ECPB 3VWVA 3RPNA 5J5NA 3CRUA 10GSA 4ZBAA 1QUWA 2VLUA 1HQOA 2LS5A 2C8UA 4PQ1A 3Q19A 4HZ2A 1H75A 2AAWA 1S3CA 1YY7A 2CVKA 3MNGA 5IMCA 3TKPA 5ECHB 1A0FA 1YDKA 3G7YA 1ZYEA 4XCSA 3M9KA 1K3YA 2FA8A 1DBYA 2CZ2A 5ABRA 4O7HA 3I69A 1KNGA 1SKWB 5J41A 4NHZA 2K9FA 4ZXGA 3GKXA 4X43A 1G7EA 1TDIA 2VOCA 4ECCA 4KUNA 2L4CA 2HFDA 2LKUA 1JZDA 2HLSA 1K0OA 2RUFA 4L5LA 5LNKe 2VO4A 1ZZYA 1PN9A 6GSSA 1ZMAA 2XPEA 3D4TA 2CA8A 4IHUA 2C3NA 5G5EA 3IE3A 3UMAA 2LRNA 5IOXA 5DQYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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