5INYA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f8
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 48
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5inyA00
2PWJA 5GSTA 1B4PA 4L0UA 3KMOA 3GMFA 3HA9A 4TR3A 2PU9C 2HLSA 1A8LA 1XVQA 2HZFA 2H6YA 1MDIA 4OFNA 4OCEA 2GGTA 2P0GA 11GSA 1G6YA 3EWLA 1WOUA 4EDYA 4K1FA 2I9HA 3O6TA 3TOTA 4GSTA 3M8NA 5CO3A 4XS4B 2YANA 5GSSA 2VM2A 3H93A 3D6IA 1JLWA 3G7IA 2FWEA 4P3YB 2H0IA 2E0QA 2VIMA 2REMA 1U3IA 3CRTA 3PGTA 3HVSA 2BTOT 1BX9A 2CA8A 2WDUA 1TK8B 4YQUA 3BJ5A 4ZIJA 4EKZA 16GSA 1O8XA 2B1LA 4DEJA 4HU7A 1CQGA 1Q98A 1SK2A 3HJMA 3CTGA 4TW5A 3C73A 2QSIA 4ISDA 2LS5A 3W8SA 4PNFA 5C00A 2MZCA 1E2YA 5EL8A 3CMIA 1ZCPA 1TRUA 3ZMKA 4NV2A 1TRWA 3HYPA 2YWOA 5ECLB 1YQ1A 5IOXA 1T00A 1WIKA 4ZBAA 4LMVA 2OE1A 2V32A 4MABA 1YEPA 1TTZA 2B3SA 2GDRA 3HJPA 3KTBA 2MMZA 3L9UA 1GWCA 4JR6A 2AB6A 3TKSE 2B5EA 1OC3A 1R5PA 4WBRD 1EGRA 4MCUA 2RIIA 2M46A 4V2MA 4XS4A 1SKWB 3A3TA 2NPBA 3ERFA 1XIYA 3DMLA 4BVXA 4N30A 4EL1A 3S9FA 2CZ3A 3FZ5A 1FVKA 4NHZA 2HRFA 5IMAA 1SU9A 4EUYA 3KEBA 2GVPA 3BOAA 4Q5FA 3VWWA 1HNCA 1GL8A 2J23A 3HDCA 4ZB6A 1AQVA 5J5NA 4GLTA 3Q6OA 3KZQA 3N9JA 2OACA 1DE2A 1XW5A 2WB9A 5EY6A 4WKWA 5IM9A 3H8QA 4OFTA 3PR8A 3WD6A 3ZLPA 5J3RA 5G1LA 1KNGA 5HR1A 2YWNA 1K0NA 4H86A 2JZSA 1EGOA 1SKRB 1HNAA 3FR6A 3CSHA 1AUCA 4KB3A 4Q5RA 3W6GA 4IP6A 5IIZA 4GTUA 5CREA 2MBSA 3F9UA 3WGXA 3LWAA 3P90A 3QD9A 1FAAA 5IMFA 2LJKA 1W89A 2VCVA 4FIWA 3C71A 1G6WA 3VK9A 2A2RA 3TKRA 4OD7A 3GX8A 2NBSA 3BBYA 4MZCA 2VL2C 2P31A 3HCZA 17GSA 3FZ9A 5DCHA 3TOUA 2YOIA 1THOA 1XVWA 1EEJA 5G5FA 3IAM2 5AGYA 4IQ1A 2OE3A 3QAWA 3HVVA 4NPBA 2C0DA 4K7NA 1B9XC 3ISOA 4K7OA 3DYRA 4NWYA 3IA1A 2PERA 1TKDB 2VL9A 2LUSA 3DD3A 5G2ZA 4WXTA 2WULA 2I3YA 3CBUA 1ZYQB 5IQYA 3US3A 3HY2A 5H5QA 5DBQA 2LQOA 1I9DA 3ZIJA 2XPDA 3CYNA 1WMJA 2JSYA 2ON5A 3F4RA 3GKNA 2E7PA 8GSSA 2ES7A 3EMXA 4L0WA 3GHAA 4MDCA 3KP9A 6GSVA 5HFGA 5KN2A 1V98A 1EV4A 2HRNA 5DDLA 3FK8A 2DJ1A 3F0IA 3GKXA 4HJ2A 4J56E 1O73A 2HXKA 4MP4A 5FHIA 3UIWA 2B5YA 1T7PB 3GA4A 4EC0A 3J7Yk 2L6DA 3D0ZA 1WPIA 2OA7A 3PINA 4MF6A 4RQXA 2VLTA 4LL1B 1U87A 4L8EA 3QFAC 2LJAA 1GRXA 4DSQA 2EIRA 1UVZA 3BD2A 1NSWA 3HKRA 2LKUA 1JZRA 1F3AA 2FWFA 1YEXA 4TKYA 3UL3A 2FHEA 2YNXA 5DJMA 3E0UA 4QL7A 1VRSD 4QQ7A 1THXA 1ERVA 1A2JA 1PQNA 5J4UA 4NHWA 5IPGA 4JU5A 5EVOA 4O5RA 2WJUA 4MLYA 3ZIVA 1AIUA 2L6CA 3IE3A 3TDGA 3CSJA 2FCHA 1R4WA 3IAS2 4XRAA 2R37A 1GP1A 1YF1A 4E8EA 2JZTA 5COHA 5HFIA 3GV1A 3VI5A 4RUVA 4ILFA 13GSA 4MJAA 4GSSA 2AYTA 4ZB8A 1PA3A 2DJKA 4BVYA 2PPTA 3V1WA 4MZWA 5ABRA 3ZVJA 4IJ3A 1TXXA 5CRGA 3UVHA 1NW2A 1K3YA 4MA9A 3DVXA 2HYXA 1S3AA 1ST9A 1Y25A 2V6OA 2VL2A 4DSRA 1T8EB 1T4ZA 2XHFA 1BJXA 5IO2A 2R3XA 1E6BA 2GSSA 1EV9A 2GQLA 5IPHA 5CRHA 4I6XA 1TDIA 3QDNA 2J9HA 1QGVA 4MJBA 4V1Ag 2YV7A 5IO0A 1WRYA 1HNBA 4IQAA 1U3AA 5HFKA 3ZL5A 1U6TA 1GNWA 4IS0A 4NAXA 4N10A 4EVMA 5FT3A 3HZ4A 2EC4A 4POLA 1YJ6A 1ERWA 4TRXA 4PQHA 2LJRA 3KD0A 3GFKA 3EVIA 1T1VA 2C3QA 3UBKA 3DRNA 2IJYA 1JFUA 3KM6A 4GSNA 4MJEA 2HSYA 5INYA 2CX3A 4IP1A 1SD8A 2H76A 1FO5A 2PN8A 2IMEA 3GL5A 3P7XA 4YAVA 2KOKA 2IL3A 2F3MA 5B7CA 2IPAA 1YKCA 4MH3A 4EF0A 4Q5NA 4PXOA 2GQMA 2VAFA 4GXZA 4ECJA 4BPYA 2KHPA 3RHBA 4TXVA 2L4CA 1JLVA 1OVNA 2VOCA 2DLXA 3O3TA 2TIRA 4IBPA 2DJ3A 3FEUA 2HFDA 3I43A 3GNJA 3F4SA 3C1RA 1AC1A 2C3TA 5ECQB 3EMPA 4CDOA 3KMNA 4ID0A 3ME7A 1W4VA 2LEGA 4Q5QA 4ZL9A 4IGJA 3F3RA 1MDKA 3M9KA 3LYPA 4LL4B 4PQIA 1TOFA 3LG6A 1SJIA 1FG4A 2WZ9A 4GQFA 4IVFA 4POMA 4KDUA 1EWXA 2PMTA 1V2AA 1NM3A 5CRWA 2TRCP 1HD2A 2E2MA 3LFLA 2FY6A 1FOVA 1VGLA 4MF5A 2KP1A 3LJRA 5ECSA 4OCFA 4XIHA 5ECIB 4BA7A 5IMDA 20GSA 5D93A 1AQXA 3ERGA 1KEBA 2CV4A 3M0FA 5G30A 1OYJA 4HEA2 2FWHA 1ON4A 3ZFLA 2XC2A 2LTKA 2ZNMA 4ML6A 3H4KA 3SWLA 1V40A 3F63A 2VCXA 2LQQA 5LCZA 3F3QA 1DSBA 3VWVA 1GSUA 1B4QA 5D8IA 2C0FA 5ID2B 3UAPA 2BMXA 3A2VA 5L71A 4OO4A 5ECMB 3APQA 3KTLA 4HS1A 1BQ7A 2I4AA 4AJ8A 1SL0B 2FNOA 1K0OA 3EINA 3TUEA 1VF2A 3IBHA 3UOMA 2D2ZA 3FHKA 1QMVA 4MZBA 2PBJA 2FLSA 6GSSA 4K8MA 2YP6A 1XW6A 3TKSC 1LU4A 4I97A 1M99A 1F6MC 2F8FA 1EEMA 1X9SB 3HVXA 4POBA 5B6NA 2B7KA 2H1DA 1QFNA 3TRQA 2CT6A 1XPVA 4PUFC 3FR3A 2LRTA 4E8HA 5JCUA 2L5OA 2N5BA 1M2BA 2H66A 4IELA 4HZ4A 5G31A 2HZEB 22GSA 2DSAA 3HJOA 3ME8A 4AJ7A 3IXRA 1OAZA 5CRDA 1X5DA 4RI7A 3E3EA 5KN3A 1PX6A 1GNEA 2Z9SA 5ID2A 4PNGA 3GL3A 1YY7A 3FW2A 2FGXA 2MYGA 6GSUA 3EU4A 3MAKA 1EOGA 1B9YC 1OC8A 4FYUA 4DVCA 2YN1A 1A23A 5JWQB 1N2AA 1AAZA 1SJZA 3KIJA 3QFBC 3CTFA 1GTBA 4IKHA 1TJDA 5D96A 2N5FA 1Z9HA 2FWGA 1GSQA 2IMFA 4KCAA 5E59A 1VF1A 2F9SA 2GTUA 1F9MA 10GSA 5EPFA 3TJFA 4TVEA 1FVJA 4V2LA 1J9BA 2AUVA 4YQMA 1Z5YE 1MTCA 2DC5A 2GQKA 1SL2B 3G9BA 1JHBA 1URMA 4QL9A 2RUEA 3Q18A 3L9SA 3LYKA 2HNLA 2QC7A 2QKEA 1A2MA 1T4YA 1FW1A 4KE3A 1TI3A 3NOFA 2YJ7A 4EXJA 3RHCA 5DQSA 1GLQA 3MSZA 1OE7A 2M72A 3L9VA 5AISA 4KH7A 1EP7A 2HZEA 1K3OA 4K0NA 3MWHA 3RBTA 3TJKA 4GQCA 3P8WA 2R5GA 3KH7A 5JCGA 1PMTA 2X64A 3UEMA 1M9AA 2R2JA 5F06A 2O85A 4YAPA 3NZNA 1SL1B 3D4TA 2K6VA 3GUSA 3M1GA 2BJXA 3HZ8A 2O87A 2DIZA 1XWBA 3GX0A 5F8BA 1SK1A 2L59A 2XPEA 2ON7A 3QMXA 2GS3A 5ECHB 3U5RE 2AHEA 5JCWA 5ECRB 5A4UA 4CW9A 1GSEA 3VPTA 3DVWA 2H1GA 5D9VA 3LORA 2XBQA 4KW6A 1XOBA 4ECBA 1IYIA 3MDKA 2JACA 1GSSA 3APSA 3KJYA 3VPQA 5F05A 2PVOC 5F0GA 1ZMAA 3TKSA 1GUHA 5KEJA 1J08A 1USBA 2HT9A 1EZKA 2MBTA 3TB2A 4FO5A 5GAND 2GSTA 2LV3A 3TJBA 1ABAA 2LNTA 3IK9A 1DUGA 4YQVA 4X43A 4EE0A 3QR6A 3WGEA 5C04A 3ZZXA 5ELAA 5CAXA 1K0CA 2A4VA 2XBIA 4KX4A 3P2AA 5ECOB 1WJKA 4KAEA 4ECIA 3O76A 4WR5A 4PUAA 1A0FA 3LQ7A 2C4JA 2LRNA 2GLRA 1OC9B 1XWCA 4F0BA 1VF3A 1V57A 2H71A 5IMZA 3BCIA 1Z3EA 2VD1A 2H6ZA 3CXGA 5F07A 2KP2A 1XCCA 2FA8A 1ZZYA 4PGTA 2GT5A 5GAPD 2F51A 3GKMA 2DMLA 3APOA 5HR0A 3H79A 2YZHA 3GSSA 1UN2A 3UBLA 4G2EA 3QCPA 3L78A 4I2UA 4LLRA 3GH6A 2C0EA 2RLIA 1TU7A 4NMUA 5D9WA 3Q19A 6GSWA 9GSSA 1K0DA 5J9BA 2FA4A 2JL4A 1Z6NA 4F9ZA 4JZQA 3JCML 3W8JA 1NHOA 3WT1A 4XHMA 3IK7A 4BWQA 1K0AA 1DBYA 4TR4A 1KTEA 3EC3A 1MDJA 1FB0A 1UA5A 2H72A 2NTOA 1Y6EA 4ZL7A 1QUWA 4HU9A 3VI7A 3KCMA 2YCDA 2H01A 2VLVA 4TR1B 4WETA 1O85A 3U6VA 4PURA 12GSA 1PL2A 5E4WA 3TKPA 1OC9A 5AIXA 3D21A 5ECNB 1V9WA 2O7KA 2ZCTA 2H0GA 2HI7A 4O92A 3D4MA 2WS2A 4D73B 4GF0A 4WF5A 4GCIA 2VD0A 2X8GA 4LMWA 5ECKB 2IMIA 3QAGA 1ERUA 3IDVA 2DBCA 1XWKA 1Z7PA 3TKQA 1RQMA 5CNWA 1FB6A 3TRXA 2JZRA 1GTAA 2MMOA 3DIEA 3M3MA 1O81A 3UJ1A 3A5WA 1GUKA 2LRCA 4K0GA 1I5GA 4XS6A 4XS1A 1ILOA 3HD5A 4O32A 3ZRDA 3IOSA 4HJMA 5IMCA 5LNKe 3GSTA 4MK3A 4Z7XA 4K2DA 1X0RA 3IPZA 3C1SA 5D9TA 2C1YA 3GRXA 2GSQA 2H70A 2VO4A 1BG5A 2X8HA 1F3BA 2P5RA 5DAKB 1GUMA 2IMDA 2O8VB 3F6FA 3GH9A 3QOUA 3TCOA 1Q4JA 3VWUA 4TR1A 2IMKA 4CHSA 3IV4A 1GSDA 4V1Ap 3RPNA 4J2FA 4J57E 3ZREA 3EE2A 3DEXA 4D73A 3D5JA 1YKAA 3UMAA 3K8NA 1ZYEA 2IIYA 1NHYA 2DJ2A 3VURA 1MD4A 2GZPA 3E9JB 4N0ZA 1GULA 1GTIA 2M80A 1J0FA 4WR4A 3CRUA 2YWMA 4MF7A 2VUPA 4KDYA 2RM6A 4HQSA 4POKA 2L5LA 1AW9A 2PGTA 4PX1A 4MH2A 1H75A 3J7Yb 1RK4A 1DE1A 1GTUA 2C3NA 2L4QA 1PD21 1JZWA 1R7HA 4X0XA 5DJLA 1SJ6A 1O7UA 1V58A 1PRXA 5G5EA 1QQ2A 4O7HA 2B6MA 1U88A 2IWTA 2WFCA 4ML1A 5DAKA 1X9WB 2N5AA 1GH2A 2L57A 3GN3A 3GIXA 1N8JA 3A2XA 3FR9A 2LSTA 3DGQA 1WP0A 1SENA 5G1KA 2YPMA 1FHEA 7GSSA 1K3LA 3ZMLA 2DJJA 1JZOA 2WCIA 1SK0A 1ZOFA 2K9FA 3NIVA 4KSOA 2OE0A 1XOAA 4XCSA 5AIVA 1AXDA 1TI1A 5FWGA 2ALBA 4ZL8A 4FYCA 5D9XA 1EP8A 2JADA 4I5QA 5IMVA 5AN1A 14GSA 2B7JA 3C7MA 3KH9A 5KN0A 1LJRA 1G0TA 3ZFBA 1H4OA 5ECPB 3R2QA 2OJLA 5H5RA 2CVBA 3GURA 4JBBA 1XFLA 4IN0A 3I69A 4IHUA 5J9CA 2H74A 3TJJA 2IN3A 4EO3A 1Z6MA 2K8SA 3MNGA 5DCGA 3QPMA 3KGKA 3LSZA 1PGTA 2OBIA 1SYRA 1SYXA 1ML6A 1BEDA 5H5SA 2IFQB 5B8BA 2OKAA 1A0RP 2LNSA 3G7JA 3A2WA 1TU8A 4HZ2A 3SBCA 2VCQA 3VFIA 4V2NA 3ZYWA 4YH2A 3WGDA 2O89A 1F2EA 3H1NA 2TRXA 1TK0B 1M7TA 1MD3A 1PKZA 1SKSB 2CAQA 4NXIA 2HE3A 3IR4A 5HQPA 4ZXGA 4ECCA 1EOHA 3EU3A 1R26A 4F03A 4I8BA 3TJGA 1Z7RA 2C8UA 3KXOA 2DJ0A 4HOJA 6GSXA 3FKFA 4MMMA 4HUAA 3F6DA 4OMVA 1G7OA 4K7IA 5B6MA 4KUNA 5HR2A 3RAZA 1OKTA 5DQYA 4KNDA 4HDEA 18GSA 1C72A 2CAIA 4OWYA 1CQHA 1XZOA 2RM5A 3ZTLA 2JU5A 5D73A 1O8WA 2X99A 3I9V2 3RDWA 1A24A 3OR5A 2VCTA 2H0HA 1TK5B 4ZB9A 4F82A 2GZZA 2YZUA 2H73A 1M2DA 1KBNA 2NDOA 2IFQA 1OKDA 2H8LA 4MPGA 3LEFA 5HR3A 2V6KA 4JE1A 2A2SA 1SD9A 1QK8A 3HXSA 5CP1A 4GRFA 2KUCA 4N11A 4G9HA 5DALB 4WBJA 4EDZA 1TP9A 2VM1A 1T3BA 4JEDA 4L5OA 2FUG2 4G19A 1B8XA 3AY8A 2GT6A 4ZILA 1A2LA 1S3DA 3DWVA 3FYGA 4DSSB 4I2TA 2CVKA 1PSQA 1YZXA 4G10A 2EIQA 1A8YA 1IYHA 3GTUB 1ZGNA 2H1AA 3FY7A 2AAWA 2G0FA 2OADA 1XW9A 2CQ9A 5CYYA 3PH9A 1X9MB 2RUFA 1PKWA 4ZBDA 1S3CA 3GYKA 1GLPA 4RI6A 1M2AA 3F4TA 1WE0A 4KGIA 5A4VA 2I1UA 1YDKA 1ERTA 1R5AA 2HSHA 3RPPA 4JRRA 4OO5A 3FZAA 5A4WA 4KA0A 3FZ4A 3F8UA 2QGVA 2H75A 4KDXA 5LD0A 3EURA 5DVBA 2YWIA 5DALA 1AQWA 1G7EA 19GSA 2MMAA 4TOPA 3CSIA 1PX7A 3G7YA 4IW9A 1X5CA 2V2GA 4F2IA 2H6XA 3TRPA 1BYEA 3DKSA 4ACSA 2EIOA 1QXHA 3I6AA 2ZUPA 3L4NA 4DSSA 4IJIA 2V1MA 5IOWA 4WF4A 4MJCA 2VLUA 4BL7A 3FRCA 2DIYA 4TN8A 1OE8A 3GTUA 4AF2A 4RQRA 1VF4A 4KSMA 2H19A 3TGZA 4NV5A 4BWSA 3GKKA 2AJQB 1F37A 3D22A 1GSFA 5GZZB 1UC7A 4MPFA 3WYWA 1HYUA 3LGCA 2GSRA 3M9JA 1O6JA 2E2GA 4AGSA 3VLNA 2R6KA 2F8AA 4FYBA 3ERWA 1TRVA 2CX4A 3IHQA 3Q74A 1LBKA 2MMNA 4L5LA 6GSTA 2JSZA 4XRDA 2H1BA 2B1KA 4KCEA 5B8AA 1B48A 1HQOA 1YF0A 5J41A 2B5XA 2I81A 2H30A 3DXBA 2C80A 2CVDA 3BCKA 4JR4A 2VCZA 3UVTA 4K9ZA 4TXOB 3UARA 2PVQA 1MEKA 1XWAA 2VL3A 2R4VA 1K0MA 2VCWA 1K0BA 4HI7A 5A5KA 4OFMA 3HHVA 3EYTA 1WWJA 3ZVJD 3ZITA 2X8CA 1JZDA 1RW1A 4LA1A 1M0UA 4ULXA 2FD3A 1X5EA 1BAYA 1M9BA 1XWGA 5JWRB 2NVLA 2YV9A 4PQ1A 3LXZA 4ZBBA 1PN9A 4FH8A 3VWXA 2DMMA 5JWOB 4HQZA 1ZL9A 2V41A 3LXTA 3KP8A 2WGRA 2KLXA 3IC4A 2GZYA 1PL1A 4AJ6A 4N0VA 1GSYA 1ACVA 5KN1A 4K6XA 2C0GA 2AV4A 2P5QA 2CZ2A 2WRTA 3QAVA 2PUKC 3N5OA 5ELGA 3WT2A 3L0HA 4WEYA 4X1UA 4F0CA 1XXUA 3IRAA 2K18A 1XBSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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