4XS4A

Salmonella typhimurium ahpc c165s mutant
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs4A00
2YV7A 2IWTA 1EP7A 3A2XA 2YWIA 2KOKA 1SJIA 1WPIA 2YWMA 2J23A 3BCKA 1B9YC 3N5OA 4AJ7A 1TRSA 3KXOA 2LRNA 2IMFA 4POKA 2X8CA 3M0FA 4NV5A 5D9XA 3GL3A 3NOFA 4LMVA 2PUKC 3FRCA 2GTUA 1LBKA 4I5QA 2DIZA 5G1KA 3GH9A 4ZBBA 2XC2A 2VUPA 4PQHA 2K6VA 2FA4A 2FWFA 1RQMA 1UA5A 2M72A 2R2JA 6GSSA 2YJ7A 6GSTA 4JU5A 3CTGA 4ZIJA 4ECJA 3APOA 4TXOB 1YDKA 2I1UA 1MDKA 2HSHA 1TRVA 3AY8A 1GTBA 4J57E 4EC0A 4WBJA 3L78A 1OC8A 2LTKA 1X9MB 3IRAA 3ZIJA 2VM1A 5FHIA 2YOIA 3HD5A 2BMXA 1UN2A 5A4UA 1M9AA 1VRSD 4V1Ag 3GL5A 3ME8A 1Q4JA 2OACA 1OC3A 4YAVA 4AF2A 2DJ1A 3PGTA 4PQ1A 2IIYA 1EOHA 1OKDA 1EEJA 2H30A 1Z3EA 4E8HA 1X5CA 3TJJA 3W6GA 1NHYA 2K8VA 4DSQA 3Q74A 1AQVA 5AGYA 3LFLA 4K7NA 9GSSA 1HYUA 3UBKA 2L59A 3GSTA 2LNTA 4WF5A 4MF5A 2OE1A 4X0XA 2OE0A 1BQ7A 5JWRB 1J9BA 4D73A 4ZL7A 1ERWA 3H8QA 2FLSA 2C3TA 2NPBA 3Q18A 2M46A 2BTOT 1M9BA 3K8NA 1YF0A 2FNOA 1NW2A 2VIMA 1T7PB 3GKKA 4O92A 4PUAA 1V2AA 5JCGA 3D0ZA 4TR1B 1BX9A 3LYPA 1N8JA 3C1SA 3HDCA 4HQZA 1ZMAA 3ZFBA 2DJ2A 4ZL9A 1M7TA 2VL9A 3U5RE 2MYGA 1Y25A 1VF4A 2NBSA 3DD3A 4FYBA 5J5NA 4RQRA 2L6DA 3F0IA 3DKSA 1G6YA 3LYKA 5D9TA 1FVJA 2F51A 3GURA 4LLRA 4XS1A 7GSSA 2FHEA 4ZB8A 1I9DA 22GSA 4KDUA 2YNXA 3GHAA 2GZZA 1FG4A 3CRUA 2P5RA 1ZL9A 4ZILA 1OAZA 1TW9A 1O6JA 1GP1A 2P31A 5ECMB 2MZCA 1U87A 3WGEA 3KTBA 4IP1A 1KNGA 1VF3A 3PR8A 5ID2B 1XWAA 5KEJA 4POLA 4K0NA 3W8JA 1W4VA 1YKCA 3QAGA 3IK7A 4GTUA 1BJXA 3ISOA 1B9XC 4X1UA 3KIJA 5DALB 3TOTA 2K18A 1X9WB 2CVKA 3KM6A 1R5PA 2DJKA 2IJYA 4DSRA 2I9HA 2B3SA 4FH8A 4ECIA 5CP1A 3DIEA 2VCWA 2XHFA 4WF4A 2CV4A 2LNSA 3DMLA 1O8WA 1TP9A 1Z7RA 4ILFA 2O7KA 1Z6NA 4LA1A 3QPMA 1Z9HA 2ALBA 3I9V2 3HY2A 4XCSA 4WXTA 5ECRB 5IO0A 1FW1A 4O5RA 1V98A 1TJDA 1XOAA 1GTUA 4NMUA 1T4ZA 3I6AA 3FYGA 5DAKB 2ON5A 3LSZA 1XWKA 2MMNA 5IIZA 4MH2A 4LMWA 3KJYA 3TRQA 4K8MA 2HLSA 4HS1A 1M99A 4MJBA 4N11A 3HHVA 3EINA 4ZB9A 5IMZA 2GS3A 2VCVA 5J3RA 4HJMA 4K9ZA 4TXOA 2VL2A 4TOPA 4I97A 1T3BA 3EC3A 3O76A 1OE7A 2VD0A 1V58A 18GSA 4NHWA 2MMZA 3CSIA 3F6DA 1EV4A 3QAWA 4KSMA 3GKNA 2RUFA 5EL8A 3A3TA 2C3NA 4EO3A 5FT3A 3GTUB 3F8UA 2XPEA 2KUCA 3I69A 3EWLA 2JL4A 1T1VA 2FCHA 4JRRA 4Z7XA 2EIQA 4P3YB 4WR5A 1ON4A 1NSWA 1K0NA 2J9HA 10GSA 2I3YA 3DVWA 3GMFA 4BWQA 3EE2A 1X9SB 4KDYA 4L0WA 1QMVA 1ERTA 1Z6MA 2L6CA 1PL2A 2KLXA 3EU4A 2N5AA 2HSYA 2IFQB 5CRWA 1XWCA 1EWXA 4V2MA 1WOUA 3ED3A 1OYJA 5EPFA 2R37A 3RHCA 5CRHA 3P90A 3HCZA 2H1DA 1K0BA 1K3OA 1OE8A 3IR4A 1O73A 3ZZXA 2FWGA 4V2LA 2H0GA 3UVTA 4TR1A 4TR3A 5CYYA 4MF7A 3TJFA 3VLNA 4PXOA 5GSTA 1HD2A 5ECIB 4PURA 1PL1A 4YH2A 4NHZA 2X99A 2HT9A 1WWJA 2EIOA 5IOWA 14GSA 2B7JA 4EL1A 4OD7A 3H79A 3ZMLA 5GSSA 4DEJA 3ZRDA 5LD0A 1SKWB 2AB6A 1M2BA 2H70A 3ZVJD 2C1YA 1YF1A 3A2WA 1XOBA 1MDIA 2YANA 4EDZA 1GUMA 3QAVA 3UBLA 4RUVA 2GQLA 5ID2A 3UL3A 1A8YA 3M3MA 3DRNA 1SK0A 1WIKA 4KB3A 2DMMA 2JACA 5HFGA 2VL2C 1TKDB 2JU5A 4GLTA 5ECQB 1A2JA 4ISDA 1A2MA 3IBHA 4I2TA 3EYTA 5JCUA 5ABRA 3WT2A 5DALA 2VCZA 5AISA 3TJGA 3GN3A 1DBYA 2K8SA 4KSOA 2FWHA 2D2ZA 4ECCA 4QL7A 1F3BA 5CO3A 5F07A 2C8UA 3ZYWA 2OBIA 4GF0A 1SENA 3L0HA 1O81A 3LGCA 2WDUA 2QGVA 4O32A 2WS2A 1LU4A 1R7HA 3A2VA 1PKWA 1XZOA 3G7JA 1FAAA 3MWHA 2AUVA 1SL0B 2TRXA 1A24A 1GWCA 3G7YA 5ECPB 4XS4B 3GA4A 2B5YA 1J0FA 3RPNA 2O87A 3VI7A 5AN1A 2HRNA 5B7CA 2H6ZA 1W89A 5F0GA 2JSYA 3BJ5A 3VWXA 2DJ3A 4PNFA 4X43A 3GIXA 5A4VA 3TOUA 4MK3A 2JSZA 3OR5A 3R2QA 1HNAA 2YP6A 2BJXA 3GUSA 5G1LA 3H93A 1HQOA 2B1LA 2HNLA 2LS5A 4KDXA 3UAPA 4NXIA 1A8LA 4ZL8A 1OC9A 4ECBA 3LEFA 3DVXA 3VPQA 1GULA 5DCGA 2NDOA 1R4WA 3W8SA 3KGKA 5G2ZA 5F05A 4O7HA 1QK8A 4F03A 1MDJA 4G10A 3ZVJA 4OCEA 5DJMA 3GX0A 3G9BA 2CZ2A 5G30A 3FK8A 1JZOA 2WZ9A 4XRAA 3P7XA 3FZ9A 5HR2A 2LV3A 3WT1A 2LUSA 4GSTA 11GSA 2VM2A 2VCXA 1KTEA 4XIHA 1B8XA 2R4VA 4BVXA 1M2AA 2DBCA 2XBIA 1UVZA 1OVNA 1E6BA 4H86A 1BEDA 1MEKA 4FO5A 3TUEA 1SL1B 3M8NA 4V2NA 1R26A 2AYTA 2H71A 2VOCA 1EEMA 1SK1A 1ZOFA 2F9SA 4KA0A 4DSSB 1ZCPA 1WJKA 3DGQA 1F2EA 3VWWA 2DSAA 1EGOA 1GLQA 3BCIA 2WULA 5C04A 3TKRA 1V57A 2O85A 1TK0B 3IDVA 1IYIA 3C8EA 3Q19A 3IXRA 3EU3A 1XVQA 5JWQB 2B7KA 5ECLB 2I81A 4G2EA 4BPYA 1F6MC 3NIVA 1SU9A 2LJKA 4GSSA 4F82A 2PN8A 2RM6A 2LRTA 4EE0A 1ABAA 1AQWA 1AW9A 2I4AA 2PVQA 1U6TA 5LNKe 4JBBA 2DMLA 3CSHA 4ML6A 2FA8A 4XTSA 3C73A 1EZKA 1ILOA 4JE1A 2H01A 1PN9A 3MAKA 2VLTA 1X0RA 1ZZYA 2YZHA 3HYPA 3C71A 3IAS2 2H1BA 2AJQB 1FB6A 2CA8A 2HZEB 1C72A 5B8BA 3TGZA 3C1RA 2IMEA 5J9CA 2KP1A 1A0RP 4G19A 2VL3A 4NAXA 3L9VA 4IKHA 2ON7A 3A5WA 2A2SA 3HJMA 2RUEA 3IC4A 3QCPA 1QQ2A 4ML1A 4AJ6A 1GSUA 3E3EA 1ZYQB 2ZUPA 4KW6A 3FKFA 2CVDA 3H4KA 1TI3A 2RIIA 2GSRA 4J2FA 1THOA 4F9ZA 2M80A 2AHEA 2GGTA 5F8BA 5AIXA 1KBNA 2GDRA 3I43A 5D93A 5ENUA 3Q6OA 4HU9A 2CAQA 4K7OA 3F3QA 1FVKA 1SK2A 4XS4A 4PUFC 4CDOA 1A2LA 2A2RA 2F8AA 4HEA2 4OO5A 5HR0A 5ECHB 3PINA 4L8EA 2VLUA 1URMA 2Z9SA 2QC7A 2C4JA 2LJAA 5CREA 3HVSA 2O89A 1USBA 4RI6A 3VFIA 6GSVA 1G7EA 2QSIA 5ECOB 3UIWA 1EGRA 3HVXA 3TJKA 4G9HA 3RHBA 1YEXA 4NPBA 1PX7A 4J56E 3GNJA 2CX4A 2AV4A 2WB9A 2VO4A 2LQOA 2GVPA 4HOJA 4MJEA 1XW6A 4HQSA 1A23A 1FOVA 3DWVA 2K9FA 3L9UA 4HUAA 5INYA 2E0QA 1PA3A 2GSSA 4KCAA 2JZSA 3D21A 8GSSA 4YQMA 3FEUA 3UOMA 2F8FA 5ELAA 1HNCA 1EOGA 4MABA 4IJIA 2H0IA 2YZUA 4CHSA 4E8EA 3ZFLA 4PQIA 4HJ2A 3VI5A 3EVIA 4TR0A 1E2YA 1RW1A 2YCDA 5IMDA 3IA1A 4TXVA 4ZXGA 4FYUA 13GSA 1FB0A 2C0GA 5F06A 1JZRA 3HA9A 1I5GA 5HR3A 2VCQA 3M1GA 4POBA 3CSJA 2C80A 1R5AA 3HJOA 1YQ1A 3LG6A 1ZYEA 4K2DA 5D96A 4DSSA 2JADA 2PBJA 6GSYA 1SKRB 2LRCA 2MMAA 1GLPA 5JWOB 2IN3A 3ZREA 1YY7A 3QMXA 5D9WA 3TKSA 1T4YA 4WETA 5DQYA 5IOXA 1JZDA 1Y6EA 2PMTA 5HQPA 1WP0A 4K7IA 5HR1A 3KMOA 3ZL5A 3IOSA 3P2AA 2YV9A 2V2GA 4MMMA 2G2QA 3WD6A 2DC5A 4KGIA 2IMDA 4KE3A 3QFBC 5C00A 3F3RA 3KP8A 2HZFA 4QQ7A 1K0CA 1H75A 2YPMA 2GT5A 1XBSA 3HXSA 1V9WA 2GQKA 1PX6A 1TOFA 1G0TA 4EVMA 3KCMA 2OBKA 1QXHA 2H6XA 2HXKA 4IQAA 2H75A 4JR4A 1MTCA 4D73B 3SWLA 3MNGA 4IQ1A 4Q5NA 3TKSE 3ZITA 2FWEA 3D6IA 2FD3A 3O3TA 2P5QA 3TKPA 3CMIA 4HDEA 1GSDA 1YJ6A 1Z5YE 1F9MA 1NM3A 4KCEA 4MJAA 2JZRA 1V40A 3F4RA 3RPPA 1B48A 1MD3A 4TRXA 3APQA 5KN1A 3KTLA 2JZTA 4YQVA 5KN2A 3E9JB 2CZ3A 2HE3A 2FUG2 5JCWA 1X5DA 4AJ8A 1SD8A 4OWYA 5B6MA 4OFNA 1TU7A 1AAZA 4OMVA 3HJPA 4LL4B 2O8VB 2F3MA 2H73A 4JEDA 4MZCA 5CRGA 2H6YA 3IE3A 3LORA 2H8LA 4MDCA 2AAWA 1SYXA 3CXGA 2KP2A 2H72A 1GUKA 4MP4A 4MPFA 3G7IA 4EUYA 2B6MA 3JCML 2CAIA 5CNWA 3UMAA 1XFLA 2H76A 2N5FA 3RBTA 1K0OA 2V41A 3F9UA 1BAYA 5DAKA 2R6KA 2H1GA 1U88A 3TKSC 5IMAA 1DUGA 4EKZA 2IPAA 3ERWA 2LKUA 2R5GA 1AIUA 3D22A 1TI1A 2PWJA 1TK5B 12GSA 4IW9A 1IYHA 5D73A 5CRDA 2NVLA 4FIWA 4EF0A 1MD4A 5IPHA 2GLRA 3UARA 1CQGA 2A4VA 5IO2A 2VAFA 3C7MA 4ZB6A 4LL1B 3TRPA 1WE0A 1SL2B 3GTUA 2QKEA 5J4UA 2V6KA 3TJBA 4JZQA 4XS6A 2CVBA 5DDLA 1ERUA 4CW9A 3TDGA 4GQFA 4ULXA 3WYWA 4I2UA 2B5XA 5FWGA 4TR4A 3M9KA 4QL9A 4IGJA 1O8XA 4N0VA 3IPZA 2EIRA 3KH7A 3VWUA 6GSWA 4EXJA 4TVEA 1GSEA 4N10A 2IFQA 1Q98A 5EY6A 2YWNA 17GSA 2L4CA 3GKXA 3ME7A 1GTIA 1M0UA 1EV9A 1TRUA 5GZZB 4PNGA 2H74A 3IAM2 2PERA 5G31A 1JHBA 3WGXA 2PVOC 3FZ5A 1GL8A 2FY6A 3GSSA 3HKRA 1B4QA 4IJ3A 3UJ1A 4GSNA 1S3DA 2E7PA 2C0EA 5GAPD 4MH3A 1XW9A 2XBQA 2PGTA 3US3A 3U6VA 4K0GA 1WRYA 3UVHA 2MBSA 4L5LA 1AXDA 5KN0A 5IMCA 4ID0A 1PGTA 1H4OA 3CYNA 2H66A 3ZMKA 5A4WA 4BL7A 2L5OA 2GSTA 3P8WA 4WKWA 2CX3A 3F63A 3IK9A 2DLXA 2LJRA 2N5BA 3EMXA 3HZ4A 5H5QA 4IS0A 4TW5A 3TRXA 3GV1A 2WFCA 3QOUA 1B4PA 3F4TA 3QDNA 4PX1A 1K3YA 1O7UA 1XCCA 4OFMA 3GYKA 2OE3A 1PRXA 3GFKA 1DE1A 3D4MA 1TRWA 5COHA 5LCZA 1SD9A 1TXXA 3TKQA 1GNWA 2HI7A 2HFDA 2L5LA 5HFKA 1AQXA 4K6XA 5GAND 4BA7A 4ACSA 16GSA 2DJ0A 2C0DA 3WGDA 2CQ9A 2X64A 4KH7A 2IMIA 4DVCA 5ECSA 1A0FA 4Q5FA 4PGTA 6GSXA 2H0HA 3IHQA 3LWAA 2V32A 3LXZA 1TK8B 2VD1A 3S9FA 4AGSA 3O6TA 3M9JA 3DYRA 1XVWA 4ZBAA 5D8IA 5AIVA 3GH6A 3BD2A 5D9VA 1GSYA 4V1Ap 3ZLPA 4MJCA 3NZNA 3TB2A 4GWRA 1K0AA 1U3AA 1DSBA 1AUCA 2DIYA 4BWSA 3GKMA 4RQXA 2NTOA 2FGXA 4YQUA 4MZWA 4HZ2A 1SYRA 3HZ8A 3DEXA 2IMKA 2RM5A 2TIRA 3LQ7A 5ECKB 2EC4A 2WRTA 2IL3A 19GSA 2PU9C 5L71A 2GZYA 3APSA 4RI7A 1O85A 3L9SA 4IN0A 3FW2A 4MCUA 4JR6A 5J9BA 2LSTA 2RLIA 4MLYA 2B5EA 4MZBA 4KUNA 1GSFA 1XIYA 4I8BA 5DVBA 1JZWA 4POMA 3D4TA 3BBYA 2OJLA 4IP6A 4L0UA 5DQSA 3F4SA 4GRFA 4TN8A 2OKAA 3N9JA 4TKYA 3ZIVA 1J08A 3D5JA 3VK9A 1SJ6A 3E0UA 1PSQA 4KNDA 1T00A 3L4NA 1VGLA 1OKTA 1T8EB 1Z7PA 2MMOA 2E2MA 1ML6A 5HFIA 2X8GA 3FR9A 5EVOA 3KP9A 1PQNA 3KH9A 3ZTLA 1QGVA 3KZQA 1G6WA 1DE2A 4FYCA 5H5SA 4YAPA 2E2GA 2HRFA 2WCIA 4IBPA 2ZCTA 1XW5A 2OADA 5DCHA 2REMA 1THXA 1JLVA 5DBQA 3QR6A 1XWGA 1NHOA 4F0BA 3V1WA 3GRXA 4N0ZA 5IPGA 1CQHA 4OFTA 3J7Yb 1X5EA 1OC9B 3VURA 1AC1A 4KAEA 4HI7A 2MBTA 1PMTA 4EDYA 1U3IA 1UC7A 5ELGA 4WR4A 4F2IA 3QFAC 3FZ4A 20GSA 3H1NA 5B6NA 4K1FA 2GQMA 4N30A 2G0FA 2X8HA 5H5RA 1QFNA 1S3CA 1F3AA 3KD0A 2H19A 2L57A 3LXTA 5IMVA 1BYEA 1XPVA 3FY7A 1G7OA 4MA9A 1PD21 5IM9A 1FO5A 2TRCP 3HVVA 3PH9A 1LJRA 1ST9A 2ES7A 2LQQA 4IVFA 4GQCA 1VF1A 1JLWA 2GT6A 4GXZA 1K0DA 1TDIA 4BVYA 4MF6A 1FHEA 1BG5A 3MSZA 3J7Yk 3IV4A 4NV2A 3FR3A 2VLVA 2P0GA 2GSQA 1EP8A 2H1AA 1WMJA 3UEMA 4HU7A 3CBUA 4I6XA 4WEYA 2V1MA 1F37A 3TCOA 5KN3A 3CTFA 1HNBA 2V6OA 2HZEA 5IMFA 2YJHA 1ZGNA 1GTAA 2WGRA 1YKAA 1ERVA 2KHPA 1XWBA 1M2DA 4OO4A 1TU8A 1SJZA 3RAZA 1XXUA 5E59A 5ECNB 2VCTA 1KEBA 4Q5RA 4IELA 2ZNMA 4WBRD 4Q5QA 1ACVA 3QD9A 4XHMA 2C0FA 4XRDA 1YEPA 3ERGA 3FR6A 1VF2A 1N2AA 3F6FA 2CT6A 3DXBA 3RDWA 3MDKA 1GUHA 3VPTA 4OCFA 2B1KA 1QUWA 2XPDA 3CRTA 1GH2A 1K0MA 5J41A 2PPTA 4MPGA 2DJJA 5IQYA 4NWYA 1JFUA 3KEBA 4HZ4A 1RK4A 1K3LA 2YN1A 2GZPA 4L5OA 4F0CA 3SBCA 1GRXA 2HYXA 3EURA 5DJLA 3VWVA 3KMNA 2OA7A 1PKZA 1SKSB 5G5EA 4IHUA 3LJRA 2R3XA 2C3QA 3GX8A 1YZXA 5E4WA 2LEGA 6GSUA 1TTZA 3EMPA 3FZAA 1S3AA 4ZBDA 4KX4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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