5IMCA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f3
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 50
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imcA00
4KE3A 3S9FA 3VLNA 1B9XC 1TK5B 1Z5YE 2H76A 1TU8A 2HRNA 3VFIA 3QFAC 5INYA 4GSTA 2N5BA 3VK9A 3K8NA 3Q18A 2MMNA 3ZMKA 2RUFA 1PSQA 1AQVA 5IO0A 1PD21 2IMEA 3IPZA 3CMIA 3ZITA 2H8LA 3ME8A 3CTGA 2HZEB 3UMAA 2F3MA 1HYUA 4IELA 1PGTA 1G7OA 1KNGA 2C0FA 1GP1A 1A24A 5KEJA 1WP0A 5HFGA 4IW9A 3VURA 3HJPA 3EMPA 4GRFA 2MBTA 2VOCA 4GXZA 2MBSA 1V58A 3GYKA 2CT6A 3APOA 5HQPA 1SYRA 4G10A 1NHYA 5DQSA 2DJKA 5ELAA 2CX3A 1XCCA 4RQRA 1QFNA 1SKWB 5ELGA 3TJGA 1Y6EA 3E3EA 3GHAA 4AJ8A 2H70A 1AIUA 2C3TA 2MMZA 1XW9A 2OBKA 19GSA 3ZRDA 2KP2A 1W89A 2P5QA 2AHEA 3D0ZA 3CSHA 2H75A 3KGKA 1GUKA 3L0HA 3TOTA 5IO2A 3LQ7A 4Q5NA 3CSIA 4PUAA 1QQ2A 2E2MA 2F8FA 2AAWA 3P7XA 3ISOA 4KDYA 2F51A 4OFNA 2FWEA 3U6VA 4TKYA 1DE1A 2BJXA 2R6KA 2IMDA 1K0NA 3RPPA 3GKNA 4NWYA 3EMXA 1F37A 1KTEA 2R4VA 3GKMA 2K8SA 2V32A 4CDOA 2GSTA 2VL9A 3AY8A 2DSAA 4KB3A 17GSA 1A8LA 1NSWA 2O85A 2VCQA 3C7MA 3WGXA 4ML6A 3TKSE 1ILOA 3EE2A 4IP6A 1WJKA 4WF5A 4Q5FA 5G5EA 4N0VA 1WIKA 4QL9A 3QFBC 3GSSA 5E4WA 13GSA 3KTLA 2VD0A 3HZ4A 3FRCA 5ECKB 3F0IA 3QAGA 1MDJA 2PGTA 4X1UA 4F0BA 2YP6A 1K0BA 2FWFA 3TJFA 3ERWA 2R37A 2WFCA 5ECPB 3D5JA 2X8CA 4YAVA 2EC4A 4GQFA 2XC2A 3DVWA 3HYPA 1KBNA 2WRTA 2DMLA 5AIVA 4KCAA 5C00A 1M9BA 5LNKe 4KSOA 2HI7A 5FT3A 4LMWA 3FYGA 5ECNB 2PMTA 3UVTA 4WBJA 1TRWA 1MD3A 3ZREA 3KJYA 2L4QA 3ERFA 2GZPA 1X5CA 5JWRB 2JU5A 4XHMA 1A2LA 5D9TA 1AXDA 2GT6A 5AIXA 3G7IA 4PUFC 1A23A 1TRVA 2X64A 2KUCA 4TXVA 1QK8A 2YWOA 1F6MC 1WOUA 2CVKA 2K6VA 5DCGA 4I5QA 1TI3A 5COHA 5B7CA 2XHFA 3H79A 2A4VA 1CQHA 4FYCA 1XWAA 4OMVA 3C73A 1GTBA 2RM6A 3R2QA 4JZQA 3ZTLA 4TR4A 3TRXA 2FUG2 1UVZA 4I97A 3RDWA 1T00A 3TJBA 1EEMA 1Z7RA 4GF0A 2P5RA 1X0RA 1QGVA 1EP7A 1ZGNA 2VLVA 3IAS2 1U87A 2E2GA 4WKWA 1F9MA 5ECLB 5H5RA 2GSSA 4KX4A 3GTUB 3RHBA 2DLXA 2B7JA 2FD3A 1AQWA 3PR8A 5IMZA 4OWYA 4IGJA 4MABA 2REMA 2BMXA 1ERUA 2VLTA 5JCWA 4NHZA 5IIZA 5KN3A 4PQIA 2LEGA 4MF6A 3VWUA 1XVQA 4KH7A 3MWHA 1TRUA 3C1SA 3LG6A 3QAVA 1JZOA 2XBQA 4V2MA 2GT5A 2L6CA 3HJOA 3HZ8A 2YWNA 3RBTA 3IAM2 5DQYA 1LBKA 1O73A 3TCOA 2H6XA 1SJZA 4GQCA 2AUVA 3GURA 4ZBDA 1UC7A 4MH3A 3E0UA 1USBA 1IYHA 4IJ3A 3CBUA 2N5FA 3IOSA 3F3RA 2AB6A 2IIYA 1JZDA 1JHBA 1S3DA 2YZHA 3FK8A 1EP8A 3WT2A 4WR5A 4NXIA 3DGQA 4ECJA 5ABRA 5F05A 3Q6OA 3HVSA 1EV9A 2TIRA 1B48A 1WMJA 2IFQB 1K0OA 3PINA 4TVEA 3KD0A 4Q5RA 5IOXA 2YV7A 2EIOA 1GSSA 5F0GA 1MDKA 2JSZA 2VO4A 1DE2A 4MP4A 3GUSA 1BQ7A 4Q5QA 1PX6A 4KW6A 3QDNA 1J0FA 5ECRB 3Q19A 3FZ4A 1HNAA 1BEDA 3FKFA 4TR0A 1WWJA 2P0GA 4POLA 4OCFA 3C8EA 1HD2A 2WB9A 4MK3A 1GSQA 1OE8A 2JSYA 2NPBA 1BG5A 4K1FA 2LJKA 3HDCA 4L5LA 4WF4A 2O7KA 4V2NA 3DYRA 2PU9C 4RQXA 1VF2A 2FLSA 1V98A 12GSA 4QL7A 1XXUA 2VD1A 2DBCA 1BAYA 4XTSA 4IQ1A 2KHPA 2PVQA 1Q4JA 2H30A 2TRCP 4ULXA 2LKUA 1QXHA 4PQ1A 1XBSA 4NV5A 1S3AA 5DVBA 3HVVA 4ZBAA 4EE0A 3LGCA 3N5OA 3GRXA 3KP8A 1NW2A 2FWHA 4OFMA 1PL1A 4WBRD 1O8WA 1MD4A 4IJIA 3M9KA 4JR4A 3APSA 1B4QA 3A2VA 2LRCA 5LCZA 1ZL9A 1X9SB 4H86A 3TRPA 2GQLA 5LD0A 2JZSA 2IN3A 3SWLA 1OKTA 2JADA 2GSRA 2OKAA 4G19A 1LU4A 1A8YA 1XPVA 1ERTA 2YJHA 3VPQA 1B4PA 3D21A 4NAXA 4XRDA 3GL3A 1K0DA 3F3QA 2LRNA 3A2WA 3VWWA 4EVMA 2VCZA 4G2EA 2PUKC 1OC3A 2VUPA 2R3XA 4XCSA 4AJ6A 1HQOA 6GSVA 1I9DA 3I43A 1ZYEA 3EC3A 2HZFA 4TN8A 4AGSA 1GNWA 2CQ9A 1O8XA 5EVOA 1EEJA 1DSBA 2DJ0A 1KEBA 3E9JB 5EL8A 3FR6A 1GWCA 3GFKA 2G0FA 3P8WA 4DSSA 1U6TA 3BJ5A 1JLWA 2H71A 4RI7A 2O8VB 1K0MA 1TXXA 5J9CA 1GL8A 4AJ7A 1E6BA 2CZ3A 3MNGA 1YY7A 2C3NA 4HI7A 4ZL9A 4E8HA 1TJDA 3WGEA 1V57A 4PGTA 1M7TA 3KEBA 3FEUA 3IC4A 3DMLA 3LJRA 3RPNA 4ECCA 2RM5A 1K0AA 1SL0B 2L57A 3UAPA 3TB2A 1M2DA 2WGRA 2LTKA 2JZRA 2VIMA 2QGVA 2V1MA 3LYPA 1YEPA 5HR1A 2HSHA 2FY6A 4EUYA 5DAKB 1PRXA 4D73B 2GLRA 1B8XA 1GLPA 1VGLA 3LFLA 4N30A 4J57E 4BPYA 2QSIA 2V41A 1M2AA 1TRSA 3HXSA 1M0UA 3GSTA 1TOFA 2DJJA 4MJAA 1THOA 2DC5A 2B1LA 2HFDA 2DMMA 2C0EA 2AJQB 2CV4A 3F4RA 1ABAA 1EZKA 4DSSB 1V40A 1OC9A 4XS1A 1SD9A 4IKHA 3HHVA 5IMVA 3ZFLA 1AQXA 1EOGA 3MDKA 5CRWA 3EURA 4GSSA 5CP1A 22GSA 2VL2C 2M46A 2ZCTA 3H1NA 2NTOA 3TJKA 4ACSA 2WDUA 1ST9A 3VI7A 4K0GA 4HS1A 2M72A 4MJCA 5GSTA 3EU3A 4PNFA 4BVYA 4TR3A 5AISA 2H66A 1K3YA 2V6KA 2CAQA 4BVXA 1SKSB 2H1AA 1A2JA 1X9WB 3ERGA 3ZMLA 1VRSD 2B6MA 5IPGA 3GH6A 4YQVA 2FGXA 4E8EA 4EKZA 2H6ZA 1XWKA 1SK2A 1ZOFA 4FYBA 3WYWA 2ON7A 1FVJA 3BD2A 3UOMA 2L6DA 1YF0A 1OC9B 4ZB8A 4NHWA 3UARA 11GSA 2V2GA 3G7YA 2QKEA 3ZZXA 4MZWA 4V1Ap 2X8HA 1X5DA 4PX1A 2A2RA 4YH2A 2D2ZA 2ON5A 2NVLA 3FW2A 1U3AA 1GSYA 2V6OA 4OCEA 1F3BA 3GTUA 1Z6NA 4O7HA 5HR0A 5IM9A 1J9BA 1G6WA 14GSA 3ZL5A 5ID2B 1K3OA 4MA9A 2LJAA 2IMFA 1FHEA 4V1Ag 1N2AA 3GX8A 2PVOC 3D22A 5ECOB 4MF5A 3TJJA 5JCGA 3PH9A 3CXGA 1TK0B 1GH2A 3NOFA 2K8VA 2RLIA 3Q74A 3H4KA 3IR4A 5HFIA 5G30A 1JZRA 3L9VA 2C0DA 5DCHA 1VF3A 5B6NA 6GSYA 1GSDA 2B7KA 4TOPA 3UEMA 3L4NA 2LNSA 2JL4A 1SU9A 4NPBA 2JZTA 4JE1A 1V9WA 3IRAA 1PX7A 3TUEA 4K7OA 3F4TA 4YQUA 3LWAA 1JZWA 5ECSA 3LXZA 1FB0A 4HU7A 1URMA 2NBSA 5CO3A 4ID0A 3MSZA 1R26A 2EIQA 4FO5A 1F3AA 2FA4A 2IMIA 5J5NA 5D8IA 3KMOA 2IFQA 2PERA 1AW9A 1Z6MA 4I2UA 2GVPA 3KTBA 18GSA 2F9SA 4HUAA 3ZLPA 4ZIJA 1EGOA 3TRQA 3TOUA 1SD8A 3F63A 2C0GA 4PQHA 5ECQB 3ZIVA 3QMXA 3TDGA 2FNOA 4XS4A 5D96A 5HR2A 2LSTA 4WXTA 1G7EA 3J7Yb 1GTIA 3I9V2 5EPFA 4YAPA 1XW5A 1RW1A 1U3IA 2NDOA 4K8MA 4KNDA 4KDUA 2TRXA 1YDKA 2ZUPA 2IPAA 1Z9HA 5D9WA 3KCMA 2WS2A 2H1GA 3EINA 4IN0A 4TXOB 3IBHA 2HXKA 1ERVA 3GKKA 1NHOA 3H93A 1T7PB 2C3QA 2DIYA 4OD7A 4K0NA 5CRGA 3KP9A 4OO4A 4FIWA 2YWMA 4TRXA 4F82A 2LNTA 2CVBA 3NIVA 5FHIA 4EF0A 2PWJA 4ZILA 4HQZA 1I5GA 5KN2A 2YV9A 5HR3A 5GAPD 2DJ3A 2YJ7A 2BTOT 3SBCA 4RI6A 2OE3A 2ZNMA 3DKSA 2HYXA 1SJIA 2MZCA 2VL3A 4XS4B 2B5EA 3F8UA 2ALBA 1MEKA 4JU5A 4ILFA 4JRRA 2OA7A 4DEJA 1CQGA 4IVFA 1O81A 1YQ1A 4EO3A 2MYGA 1N8JA 2L59A 1BX9A 1EOHA 5J4UA 5CRHA 1EWXA 4CW9A 1YZXA 4HOJA 2GGTA 1T4YA 1O85A 1UN2A 4PNGA 3BBYA 3GIXA 2I3YA 4K9ZA 3IHQA 3D4MA 4HU9A 1G6YA 4O5RA 5GSSA 4PXOA 1GULA 1MDIA 2LV3A 2VLUA 1SJ6A 1K3LA 1VF1A 1V2AA 4DSQA 3H8QA 5CAXA 1T4ZA 1M9AA 1TTZA 1A0RP 3O6TA 3DRNA 5A4WA 1FAAA 4WEYA 1SENA 4F2IA 4MPFA 4IS0A 1C72A 3TKSC 4IP1A 5H5SA 1R5PA 1FB6A 3GL5A 5ECMB 1WPIA 4N0ZA 1WRYA 4EXJA 4AF2A 4GLTA 5G5FA 4Z7XA 4NV2A 5CNWA 3O3TA 4XIHA 9GSSA 5IQYA 5A4VA 5C04A 3CSJA 4X43A 1A2MA 3TKQA 1OVNA 2HSYA 3GMFA 4MJEA 4N11A 3QR6A 5GZZB 1GUMA 4IHUA 4BWSA 1SKRB 3LEFA 1RQMA 5D73A 5DAKA 4D73A 4POKA 1HNCA 2PBJA 2FWGA 1TU7A 3WGDA 4MPGA 1TK8B 2H6YA 1YJ6A 1R4WA 5DJLA 1ZCPA 1ZZYA 2YN1A 4ZXGA 4MDCA 1Y25A 4K6XA 3GV1A 5IMCA 1PL2A 3VPTA 5ECIB 3KH7A 2YNXA 2X99A 1LJRA 2WULA 3GA4A 3F6FA 2KOKA 5F07A 1GNEA 1TDIA 2RIIA 4ZBBA 4OO5A 3ZFBA 4CHSA 1VF4A 2ES7A 3FZ5A 3QAWA 5GAND 5HFKA 2XBIA 2IMKA 4O92A 5A4UA 1DBYA 2EIRA 2HRFA 1Z3EA 4P3YB 3DIEA 5CRDA 4KAEA 2I4AA 4LL1B 2H73A 2H72A 2FCHA 3RHCA 2I1UA 4HQSA 5H5QA 3I69A 4GTUA 1XIYA 3CTFA 3APQA 5AN1A 3DVXA 4J2FA 4BA7A 5F8BA 1NM3A 2MMAA 3A5WA 2VCWA 4HEA2 1PQNA 3EWLA 1EGRA 4F0CA 4ZL7A 1SYXA 5IMFA 2E0QA 3CRUA 1OKDA 2H0HA 1PN9A 3D4TA 3HJMA 5FWGA 2CZ2A 1E2YA 2LUSA 3EU4A 4I8BA 5F06A 1YKCA 1PMTA 1K0CA 1XOAA 4ECIA 2PPTA 1OC8A 1ML6A 2VAFA 5EY6A 1XZOA 1BJXA 2OACA 3V1WA 3HA9A 1TKDB 1BYEA 1RK4A 5E59A 3KH9A 3LXTA 4MMMA 4MZCA 2WZ9A 5L71A 1U88A 2VCVA 4ZL8A 3RAZA 4FYUA 5DALA 4O32A 1X9MB 1AC1A 2L4CA 1A0FA 1SL1B 4HDEA 3VI5A 2R5GA 1HNBA 5JWOB 2H74A 3W8SA 4L8EA 2LQQA 2DJ2A 5ID2A 3UVHA 3TKRA 5KN1A 3CYNA 4MLYA 3C71A 2C80A 3EYTA 2CX4A 2VM1A 4LLRA 2H0GA 5B6MA 2G2QA 1GSUA 4POBA 1FG4A 2LJRA 2AV4A 3L9SA 1PKZA 2XPEA 4KGIA 5D93A 4L5OA 4LL4B 4BWQA 1X5EA 4KCEA 6GSUA 3FZAA 1H75A 2B5YA 2QC7A 5G1KA 4EC0A 3O76A 3GKXA 2P31A 4KSMA 3OR5A 5D9XA 3DD3A 2VM2A 3ZVJA 2FHEA 5J3RA 2DJ1A 1T3BA 5DALB 3ZIJA 1DUGA 4GWRA 2Z9SA 4K2DA 1FO5A 1S3CA 2M80A 2YWIA 1XWBA 2E7PA 4GCIA 2GZYA 5ENUA 4LA1A 3DWVA 3IA1A 2HLSA 2GTUA 2OE1A 3VWVA 1H4OA 3VWXA 5G1LA 1TW9A 20GSA 3J7Yk 2L5LA 5B8AA 3F9UA 2WJUA 4ZB6A 3BCKA 7GSSA 2GZZA 1YF1A 4MF7A 3QD9A 1AAZA 4TW5A 2HNLA 2GS3A 1J08A 2OE0A 4G9HA 5B8BA 2J23A 1GRXA 1ZMAA 3G7JA 1PA3A 2YCDA 1R5AA 4FH8A 2O89A 4HZ4A 3DXBA 1GUHA 3UBKA 1F2EA 2A2SA 2IWTA 2CA8A 4F03A 2H19A 1R7HA 3P2AA 3D6IA 4HZ2A 4MCUA 2IJYA 3UL3A 1T8EB 4TR1A 5DJMA 4TXOA 3HCZA 5IMDA 4IBPA 1SK0A 1ERWA 3IXRA 1XFLA 2B3SA 3LORA 1GSFA 4HJ2A 5J41A 4ML1A 3DEXA 3ZVJD 1ACVA 4DSRA 3P90A 1OE7A 1Z7PA 3NZNA 3UIWA 3FR9A 1YKAA 16GSA 2VCXA 1GTUA 5KN0A 4N10A 3MAKA 1B9YC 4XRAA 2GSQA 2H0IA 3GX0A 3TKSA 2LQOA 3QCPA 1TP9A 5ECHB 2GQKA 1OYJA 4JBBA 2C4JA 5J9BA 3HY2A 4PURA 3M3MA 4IQAA 1G0TA 4DVCA 4BL7A 2H01A 1OAZA 1XW6A 4V2LA 1YEXA 3C1RA 1AUCA 5G2ZA 2C8UA 3IK9A 3HVXA 3TKPA 3BOAA 1XWGA 4MZBA 4TR1B 1EV4A 3QOUA 1QUWA 3N9JA 3IK7A 5JCUA 4JR6A 4XS6A 3L9UA 3HKRA 4OFTA 3M9JA 1XWCA 5D9VA 3KMNA 4ISDA 3US3A 2VCTA 6GSXA 3A2XA 1GTAA 3L78A 2YPMA 5IMAA 4KUNA 3M8NA 4MH2A 3A3TA 1PKWA 3PGTA 2AYTA 1ZYQB 5DBQA 2WCIA 3WD6A 2I9HA 3W6GA 3UJ1A 4EDZA 1ON4A 2B1KA 2LRTA 2X8GA 2KLXA 4I2TA 3IDVA 2RUEA 4L0UA 4EDYA 4I6XA 1W4VA 4K7IA 3GN3A 2JACA 5CYYA 3CRTA 1IYIA 4RUVA 2YOIA 3M0FA 2OJLA 4JEDA 1GLQA 2GQMA 4KDXA 6GSWA 3F6DA 2YZUA 2FA8A 1WE0A 1SK1A 1O7UA 6GSSA 3IV4A 1FOVA 2IL3A 1M2BA 4WETA 4X0XA 2DIZA 4EL1A 1O6JA 2J9HA 10GSA 2KP1A 3FZ9A 3LYKA 1TI1A 3ED3A 1XOBA 2PN8A 3EVIA 2MMOA 2B5XA 3ZYWA 3M1GA 2XPDA 6GSTA 2HT9A 4HJMA 1T1VA 3KM6A 4WR4A 3ME7A 4YQMA 2H1BA 5JWQB 3UBLA 3GNJA 3U5RE 4MJBA 3JCML 1GSEA 1SL2B 5AGYA 2F8AA 3F4SA 3FHKA 1JLVA 3G9BA 3HD5A 2VL2A 2O87A 2I81A 1Q98A 4K7NA 3WT1A 2K9FA 1FW1A 2OBIA 8GSSA 2HZEA 3FY7A 4F9ZA 2H1DA 3LSZA 4ECBA 5DDLA 5G31A 4NMUA 5A5KA 3KIJA 4LMVA 2CAIA 4KA0A 1M99A 4POMA 4ZB9A 4QQ7A 1XVWA 4L0WA 5IPHA 1FVKA 2YANA 2N5AA 2LS5A 2CVDA 2OADA 2C1YA 5CREA 3GH9A 2L5OA 3KZQA 3IE3A 1JFUA 1UA5A 4GSNA 5IOWA 1QMVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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