5IMCA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f3
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
b'TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 50
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imcA00
5F07A 1OVNA 2RUEA 4K9ZA 1GSDA 1YEPA 2FWEA 5F0GA 1M9AA 2GVPA 1M2DA 3KMOA 3LYKA 3W8SA 3KMNA 4IELA 4WR5A 3GX8A 1XIYA 4MF6A 3IE3A 2PWJA 3Q6OA 3QAGA 2OE3A 3N9JA 2C3TA 3US3A 3HA9A 4V1Ag 1LJRA 2CT6A 4L5LA 1M99A 1TJDA 3TJFA 2DJJA 1U3AA 3F4TA 1VF2A 2KHPA 5A4UA 3DKSA 1J9BA 2GT5A 2XC2A 2GSSA 3GRXA 1SJIA 2RLIA 4POLA 3BOAA 4TN8A 2IMIA 2C3NA 1XPVA 3GH6A 2VCVA 4ULXA 1TRWA 3EE2A 5ECLB 2PERA 3GSTA 4MZWA 3TKQA 3HYPA 1XWBA 4HQZA 4L0WA 2EIRA 3ME7A 3IC4A 2HFDA 2VL2A 3VK9A 2K6VA 1TOFA 5D9XA 16GSA 2LNSA 5J41A 3CSIA 4QL7A 3K8NA 3CSJA 1EOGA 2B6MA 3L9SA 2C0DA 4O5RA 1WIKA 2EIQA 2GQKA 1PL2A 3CSHA 4ZL8A 2LEGA 5G5FA 2FA4A 2PVQA 5JWRB 4MJCA 4BWQA 2CZ2A 2H19A 5B8AA 4K0GA 2M80A 3I6AA 2BMXA 4ECBA 3OR5A 2QSIA 1FO5A 2IL3A 2F51A 6GSSA 2FCHA 5ECKB 1YEXA 1GLQA 1J08A 1K0NA 3UAPA 4NHZA 1EEJA 1M7TA 4N10A 2E0QA 2IWTA 2CAIA 2DSAA 3PINA 4NPBA 5ENUA 2FWFA 1MDJA 5J4UA 4L8EA 4WXTA 5CAXA 1XWGA 3FKFA 4CW9A 3FZ9A 3QPMA 1F6MC 4KNDA 2KP1A 1JLWA 4ACSA 3D21A 2CA8A 3TKRA 3HVSA 3TKSE 4GSSA 3DGQA 2ZCTA 2PMTA 3L4NA 2OACA 3GX0A 3IK7A 3RHCA 1NHYA 1G6WA 3E0UA 3FZ5A 4AJ7A 4K0NA 3LJRA 2R4VA 1AQXA 5ABRA 4IP1A 3LFLA 2V6KA 2C0EA 1THOA 2A2SA 1QQ2A 3F3QA 3ZZXA 2HLSA 3KTBA 1WWJA 4FYBA 5J9CA 2P0GA 4OD7A 2HT9A 4NMUA 1K3OA 3F6DA 3C8EA 2MZCA 2A2RA 4POKA 1O6JA 3LSZA 3GKKA 2H8LA 1GSEA 5A4WA 2HYXA 1FAAA 4ZB8A 2YWMA 4K2DA 3UIWA 5DDLA 2LNTA 3D0ZA 3L9UA 3QOUA 3KZQA 3SWLA 4MZCA 4I2TA 19GSA 1XW9A 4ZBDA 5INYA 3PR8A 4PXOA 3VPTA 1XWAA 1DBYA 2B1LA 5J3RA 1R5PA 4XIHA 2JSZA 11GSA 5G30A 3QMXA 4TR4A 4XTSA 2DMMA 3H1NA 1Z3EA 3LORA 3A2WA 4HEA2 1TW9A 5CRDA 1RW1A 1I5GA 2O7KA 2AHEA 5CREA 2VUPA 4OCFA 4OCEA 3QAWA 3A2VA 3O3TA 1TXXA 1V98A 2FNOA 1B4QA 2WULA 1A2MA 4OFMA 2GS3A 4DSQA 4K6XA 5KEJA 1OC8A 1XVWA 4Q5NA 5GAPD 2VO4A 3FZ4A 1BYEA 5ECNB 5G1LA 1GULA 4O92A 5DAKA 3DMLA 2FUG2 1IYIA 3HJPA 3TKSA 5DAKB 3UARA 3HVVA 5AISA 2P5QA 2J9HA 4JE1A 2GZZA 3TDGA 1H75A 2H30A 5HR3A 2KOKA 3P7XA 3Q18A 1QFNA 1F37A 1BAYA 5CP1A 1GTIA 2C80A 5DCGA 1SKSB 1MD3A 4NXIA 4MF5A 5F8BA 3KM6A 1TU7A 5CO3A 1OAZA 3IRAA 4MK3A 1OE7A 1O81A 5ECMB 1ERUA 3G7JA 4XS4A 4Q5QA 4AJ8A 4XS4B 4XRAA 3A3TA 3APOA 4MZBA 2I81A 3FK8A 2HXKA 3MAKA 2D2ZA 2YOIA 3J7Yk 5ID2A 2LRTA 1YQ1A 1M2AA 1WE0A 2AYTA 3BCIA 4AF2A 5ID2B 4GRFA 1TI3A 2P31A 5B6MA 4GTUA 5JCUA 5JCWA 5C04A 1TK5B 1ABAA 1AXDA 4FYCA 3CMIA 3LG6A 4BL7A 2O87A 5IMZA 3I69A 1BG5A 2IPAA 5F05A 2VM2A 1SKWB 4WBRD 4KB3A 1HYUA 2YPMA 4K8MA 2VL3A 3RPNA 3M3MA 3KXOA 2C1YA 3D5JA 4BVXA 2YJ7A 1R5AA 3GMFA 4PNGA 1YY7A 4LL4B 3DWVA 2JZTA 5JWQB 4EXJA 4MH3A 1M2BA 4D73A 2K9FA 2R37A 1PL1A 4YAVA 1PMTA 3GHAA 4TXOB 2L59A 4D73B 2H75A 1DE2A 1AW9A 5AGYA 3O76A 4PQHA 2B1KA 2HZFA 2H0IA 3C1SA 2H72A 4OFNA 4GLTA 2AB6A 2WCIA 1IYHA 1GH2A 2B7JA 3ZVJA 1O8XA 1OKTA 4HJMA 20GSA 1GSUA 5ECPB 4WKWA 5AIVA 1JZOA 1PRXA 1NSWA 4IW9A 3FR9A 4KX4A 3UBKA 5EVOA 1LBKA 3EU3A 2VD0A 4ZL9A 3ED3A 14GSA 6GSVA 1FVJA 2PPTA 3P2AA 3ZIJA 4EDZA 1U6TA 3TOUA 1R7HA 2X8CA 1AIUA 4WF4A 2WB9A 4EUYA 2REMA 1XCCA 2LRNA 4G9HA 1EZKA 1GL8A 4ZXGA 1S3CA 3C7MA 3VWUA 5AN1A 1B4PA 4O32A 2C4JA 1VF1A 2K8SA 2VL9A 3BBYA 3IAS2 1GUMA 2QGVA 1A2LA 1UN2A 3H8QA 2H76A 4KA0A 4YQVA 1VGLA 4PURA 5FHIA 1TI1A 1J0FA 2L5LA 1EGRA 5DQSA 1EV9A 1HNBA 4KSMA 1BEDA 2ON5A 1YJ6A 1YF0A 1PD21 2AAWA 4HZ4A 3UEMA 1ZYQB 1ZYEA 2NVLA 5KN3A 1GSYA 1QUWA 3EINA 6GSYA 1O73A 2HE3A 4N0ZA 1THXA 5IO0A 1X5DA 2RIIA 4KH7A 2B7KA 1EOHA 1SENA 3IR4A 5B6NA 1UA5A 1Z6NA 3ZL5A 2VLUA 5ECOB 1AQWA 1X5CA 3ME8A 4K7NA 1ZGNA 5IPGA 2DJKA 4KDYA 2GT6A 4BVYA 4PNFA 2JZSA 2HSHA 4EC0A 3QFBC 4PQIA 4MDCA 4ZB9A 4Q5RA 1USBA 1FB6A 2LV3A 1X0RA 10GSA 2H74A 4OO5A 3CXGA 2OADA 4JEDA 3QAVA 4JU5A 2B3SA 2V2GA 2YZHA 2GTUA 3IAM2 3HD5A 1PQNA 4PUAA 4I5QA 5LNKe 5HR1A 1T7PB 1ZCPA 1XOAA 2H6ZA 2C0FA 1S3DA 3FRCA 3TJKA 3F4RA 5DJLA 1G7EA 1EWXA 4I8BA 1K0DA 4ISDA 3VI7A 3Q74A 4CDOA 1Z6MA 3FR3A 1B48A 2NDOA 5COHA 4F9ZA 6GSUA 1SK2A 3TB2A 3BJ5A 2H1BA 2R6KA 1QK8A 2CZ3A 1Z9HA 1TK0B 2PVOC 4HU9A 2GZPA 4V1Ap 4KW6A 2FLSA 4TKYA 1Z7RA 3I43A 3ZTLA 3ERGA 1XXUA 3HJMA 4ZBBA 2DBCA 4IS0A 1GSQA 1ACVA 1AAZA 5KN0A 3GNJA 2IMEA 2N5BA 3HJOA 4GSNA 1U3IA 2EC4A 1TDIA 2IFQA 2V41A 2PBJA 1GSSA 4TRXA 2IFQB 1JZDA 1GNEA 2OKAA 4J56E 2V1MA 4NV5A 2FY6A 1GWCA 2WZ9A 1EP7A 4WEYA 4F2IA 3PGTA 5DCHA 1K3YA 4QQ7A 2CVDA 3GKXA 1M0UA 1A8LA 4I97A 1OYJA 2CVKA 2WFCA 2X64A 3WT2A 5IQYA 5DBQA 3KP9A 5ECQB 1ZZYA 2WS2A 3EYTA 5J9BA 1FW1A 3QDNA 1VF3A 3QD9A 3TOTA 3LXZA 5HFKA 3KH7A 4EL1A 3GFKA 2MMZA 1X9MB 4KDUA 1YKCA 3TJGA 1SYRA 6GSTA 4WBJA 3ERFA 3GL3A 3QR6A 2PU9C 4TVEA 4TR0A 2F8FA 3FW2A 2VM1A 3IHQA 18GSA 2KLXA 5HFGA 1I9DA 4LA1A 1JFUA 3DVWA 1JHBA 2H6XA 1SJZA 3WD6A 4KCAA 3NZNA 4QL9A 2MMNA 4RQRA 1G7OA 2VLTA 2M72A 5HR2A 5G31A 1T4YA 4DVCA 3DIEA 5ECIB 5JWOB 3RBTA 3LXTA 3HY2A 4POMA 1SJ6A 3BD2A 3PH9A 2P5RA 4WR4A 1CQHA 2O8VB 1SD8A 5D8IA 1ZMAA 2YWOA 2JU5A 4GF0A 3CYNA 4HQSA 4RI6A 3EVIA 5G5EA 4NV2A 2LQOA 3U5RE 4MH2A 4G19A 2DIZA 4MJEA 4IQ1A 1KBNA 3F4SA 2XBQA 1YKAA 4IQAA 1WJKA 1KTEA 3LYPA 2NBSA 4X43A 3O6TA 1Y25A 3GH9A 3GTUA 1XFLA 5FWGA 2KUCA 3M0FA 3GA4A 1W4VA 3GTUB 4AGSA 4DSRA 1ON4A 3GURA 3VWXA 5G1KA 1E2YA 4ZBAA 4XHMA 2IIYA 1U88A 2DMLA 3LQ7A 3D6IA 1Y6EA 2YV9A 3RPPA 3GUSA 2YZUA 4FH8A 1XZOA 4JRRA 3ZIVA 2AUVA 4EVMA 2VCQA 22GSA 4YQUA 5CNWA 5A5KA 2PUKC 1TRUA 4KAEA 1K0AA 3MWHA 5L71A 4F0BA 4LLRA 2XHFA 4JBBA 3NIVA 1T3BA 2LSTA 4IBPA 5CYYA 4Z7XA 1SD9A 3NOFA 9GSSA 4XRDA 3UJ1A 1K0OA 1MTCA 2F8AA 4JZQA 1M9BA 2FGXA 2FHEA 2YV7A 2GQMA 1XVQA 1WP0A 1T00A 2H0HA 4AJ6A 2I9HA 1OKDA 2H1DA 3ZRDA 3ZMKA 5IO2A 3ZFBA 5H5SA 1ERTA 2B5EA 1RK4A 2GLRA 1A23A 1O85A 2LJRA 4I6XA 2CVBA 1EGOA 1O7UA 3I9V2 3H79A 1WPIA 5ECRB 2VLVA 5D93A 1PA3A 2KP2A 3M9JA 3P8WA 3ZVJD 4HJ2A 2K18A 5KN2A 2QC7A 3WGEA 1EV4A 13GSA 3TUEA 2BTOT 2DJ0A 4E8EA 4HOJA 1RQMA 2DJ2A 2YJHA 3WGXA 2MMOA 2HRNA 4ECJA 1OE8A 4L0UA 5LD0A 4N0VA 1EP8A 2HRFA 3N5OA 5IPHA 3IXRA 3LWAA 2YP6A 4YH2A 4MPGA 2LUSA 3F3RA 2OJLA 1GRXA 2R5GA 3G9BA 1WOUA 2LQQA 1DUGA 3ISOA 4TXOA 3P90A 3ZYWA 3V1WA 1V58A 2LTKA 2VIMA 2YWIA 2OBKA 5JCGA 3L0HA 3FZAA 3D22A 3J7Yb 1TRSA 4POBA 2MBTA 1ZOFA 2DLXA 4H86A 3ZITA 5A4VA 3VWWA 2ALBA 5D9VA 2WRTA 3UVTA 1T8EB 2JZRA 4KGIA 1FHEA 4J57E 1B8XA 3RDWA 3WYWA 4ZILA 4IGJA 1TTZA 2RM6A 4MCUA 5IMVA 1A0FA 4I2UA 4YQMA 4N11A 4X0XA 4F0CA 2VCTA 1URMA 3HCZA 1MEKA 4ECIA 4MP4A 3CTGA 1GNWA 1SK0A 3DRNA 1NW2A 1G6YA 1Z7PA 1MDIA 2EIOA 3MSZA 3GKNA 4HDEA 4DSSA 2PN8A 4DSSB 1ERVA 2I4AA 3CRTA 4ILFA 2VCZA 1JLVA 5C00A 2JSYA 2MYGA 4MABA 1BQ7A 3TJBA 3RHBA 4ML6A 2B5YA 2K8VA 3D4MA 3EMPA 17GSA 1A2JA 4BPYA 3UL3A 1K0BA 3IPZA 2GSTA 1SK1A 4KCEA 4P3YB 2HZEA 5IIZA 3L9VA 3GIXA 4FIWA 3BCKA 3KP8A 1Z5YE 3KEBA 1BX9A 4RUVA 1QXHA 2GZYA 1HNAA 2HZEB 3QFAC 4KSOA 4MF7A 4NWYA 3VFIA 2JACA 3ZREA 3CBUA 3KGKA 3VURA 2LS5A 1GLPA 2X99A 4IVFA 4BA7A 1TU8A 1SL2B 4LMWA 3TRQA 2E2MA 2VOCA 2H70A 3VLNA 1QMVA 3IBHA 2LRCA 4EO3A 5ECHB 1LU4A 3IV4A 1NM3A 3F6FA 4DEJA 3HZ8A 3DXBA 5B8BA 4MJBA 4WETA 1VRSD 1HNCA 5J5NA 1FVKA 1H4OA 3UBLA 3SBCA 3F9UA 3TGZA 2VCXA 5DALA 4O7HA 5GSSA 1F9MA 1FG4A 1GSFA 2RM5A 5AIXA 5DALB 2BJXA 4XS1A 1UVZA 1AC1A 2GDRA 3A5WA 3E9JB 2PGTA 1NHOA 2AJQB 4F03A 5E59A 2L4QA 5IM9A 1SU9A 3EURA 2J23A 3HDCA 1R26A 5IOWA 3U6VA 1HD2A 4F82A 4RI7A 1K0MA 3IK9A 2AV4A 5H5QA 4G10A 1HQOA 4ML1A 2XPDA 5HR0A 4ZIJA 5FT3A 2I1UA 1FB0A 1XWKA 3TCOA 3DVXA 3GL5A 2LKUA 2XBIA 2ES7A 1V2AA 4EF0A 1C72A 1A0RP 1SL0B 1MDKA 4PGTA 1B9XC 2G0FA 3UVHA 1PSQA 1PGTA 4IN0A 3GN3A 1A24A 4EE0A 2CQ9A 4MMMA 2F3MA 1GTBA 1PX7A 2HSYA 4OFTA 3EU4A 1XOBA 1OC9A 2ON7A 4IKHA 3L78A 4GQFA 1EEMA 6GSXA 1OC9B 3APSA 3ZLPA 1XWCA 1UC7A 5B7CA 3JCML 2I3YA 1PKZA 2ZNMA 5IOXA 3F0IA 3GSSA 2GGTA 3UOMA 1V40A 2IJYA 3C71A 3GYKA 5G2ZA 1ST9A 2L4CA 1JZWA 5GZZB 2OE0A 4MLYA 5D9WA 5DJMA 3TKPA 4NHWA 2DC5A 4KUNA 3KD0A 1X9SB 2H6YA 2V32A 1AUCA 1DE1A 1PKWA 2JADA 4PUFC 1ML6A 4JR4A 2VL2C 3FY7A 3MNGA 2FWGA 3FHKA 4X1UA 2OE1A 5IMCA 1F3BA 4JR6A 3VWVA 2C3QA 1F2EA 2H71A 5ELAA 3RAZA 2MBSA 3ZFLA 1T4ZA 2FA8A 1A8YA 3IOSA 2IMKA 4ZB6A 5DQYA 2JL4A 3VPQA 5ELGA 4GCIA 1ERWA 1E6BA 3KCMA 1OC3A 4TW5A 2CX3A 2XPEA 4GSTA 1GTUA 6GSWA 5IMDA 4IJIA 3APQA 3LEFA 2TIRA 1XBSA 2C8UA 3TRXA 3HVXA 1SKRB 4CHSA 3AY8A 4IJ3A 2G2QA 2IMDA 4V2MA 1O8WA 2LJKA 1U87A 1TK8B 1WMJA 3FR6A 3M9KA 2L57A 5IMFA 1TP9A 4TR1A 1V9WA 4TR1B 2OBIA 5IMAA 12GSA 3C73A 3HKRA 2M46A 4HS1A 4V2NA 3FYGA 4HUAA 2L6CA 3GV1A 2YN1A 1KNGA 2TRCP 3W8JA 2X8HA 4EDYA 3HHVA 3WGDA 2L5OA 3CTFA 4PQ1A 5F06A 1S3AA 5HQPA 1G0TA 4OWYA 2E2GA 3F8UA 5CRGA 3IA1A 2ZUPA 3LGCA 3UMAA 3KH9A 4WF5A 4RQXA 2R3XA 1SL1B 3A2XA 2H0GA 1Q4JA 1T1VA 1X5EA 4GXZA 2CV4A 3TRPA 4GWRA 3G7IA 5D9TA 2H1GA 3EMXA 3TJJA 2N5FA 4YAPA 7GSSA 2GSQA 2R2JA 2YCDA 4KE3A 1TKDB 2O89A 3G7YA 3C1RA 1VF4A 2VD1A 4K1FA 1AQVA 4GQCA 1FOVA 3Q19A 1N2AA 4N30A 3HZ4A 3DD3A 4PX1A 2H66A 2DJ3A 2LJAA 1B9YC 1GUHA 5EY6A 2X8GA 2WDUA 4OO4A 2C0GA 4FO5A 2H73A 5E4WA 2YWNA 3HXSA 5H5RA 1YF1A 4HU7A 4BWSA 1XW5A 1QGVA 2B5XA 4NAXA 2RUFA 3M1GA 1K0CA 1GP1A 8GSSA 3W6GA 4K7OA 2CAQA 2E7PA 1CQGA 1X9WB 1N8JA 3EC3A 4E8HA 1JZRA 1K3LA 2DJ1A 1TRVA 2N5AA 3ERWA 2A4VA 4KDXA 3CRUA 2TRXA 2FWHA 2IMFA 2GQLA 1YDKA 3R2QA 2WGRA 5CRHA 3M8NA 1KEBA 2O85A 1GTAA 1WRYA 5EPFA 1PN9A 1MD4A 4ECCA 2V6OA 2L6DA 5LCZA 4V2LA 3EWLA 1Q98A 4EKZA 3E3EA 2HI7A 1ILOA 2H01A 3DEXA 3TKSC 1XW6A 2NPBA 3IDVA 5D96A 2OA7A 4HI7A 3WT1A 1R4WA 2WJUA 4TXVA 4ZL7A 2MMAA 3S9FA 2YNXA 2Z9SA 1ZL9A 3H4KA 3H93A 4FYUA 5ECSA 4MPFA 2HNLA 3KIJA 4MA9A 4LL1B 1V57A 3KTLA 1BJXA 4IHUA 4XCSA 1DSBA 2CX4A 1SYXA 4L5OA 2H1AA 2DIYA 4LMVA 1F3AA 4MJAA 5EL8A 2FD3A 4OMVA 5D73A 4J2FA 1GUKA 2VAFA 3QCPA 4Q5FA 5DVBA 5GAND 1PX6A 1YZXA 3KJYA 3MDKA 4K7IA 3FEUA 4XS6A 4ID0A 5HFIA 2F9SA 3DYRA 3F63A 1W89A 5CRWA 4HZ2A 4G2EA 4TOPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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