5IMCA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f3
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 50
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imcA00
4OD7A 1VF2A 4OCFA 3H8QA 5AIVA 4PX1A 1WP0A 5ECRB 4TR1B 4WR4A 3TDGA 1WOUA 5A4WA 1ZZYA 5D9XA 2C80A 1OC8A 14GSA 4KA0A 5IMZA 6GSWA 1Z7PA 3N9JA 4WKWA 2ZUPA 2K6VA 3C71A 3UL3A 4IQ1A 4EKZA 4XTSA 4F9ZA 5FHIA 3PR8A 1Z7RA 3I6AA 5GSSA 1K0MA 2FLSA 2PERA 1N2AA 1GUHA 2MMOA 1EV9A 2DJJA 3GMFA 1Z6MA 4N30A 3K8NA 1OYJA 5CRHA 3WT2A 1PKZA 5DCGA 1G6YA 4L5LA 4X43A 1DSBA 3HVVA 1PKWA 1PGTA 4F0CA 2VD0A 4GTUA 2FWGA 4OMVA 2AV4A 4MJBA 2P0GA 4G9HA 4K1FA 1TKDB 2CAQA 4IVFA 1SKSB 1ERUA 5H5SA 1U88A 2FHEA 2GDRA 4ID0A 2G0FA 4EDZA 5L71A 4IP1A 1BX9A 3FZAA 2K9FA 1XBSA 3HZ4A 2LJAA 4RQXA 4HZ4A 4DSRA 2B7JA 1GH2A 2GQLA 1CQHA 1S3DA 1B4QA 2P5QA 1YQ1A 2DBCA 1K0DA 2WJUA 3C7MA 4ZBBA 5CRWA 2YP6A 2MBSA 2VCTA 4MZWA 2B5XA 2B7KA 2HXKA 3F3RA 4EDYA 2YPMA 20GSA 4D73B 2C0DA 2KUCA 3GX0A 3DEXA 2CZ2A 1K0AA 2WB9A 2GS3A 1O8XA 5ELAA 1SYXA 4MZCA 4GCIA 2PBJA 2YCDA 3LXZA 2H73A 5B8AA 4V1Ap 3HD5A 1DUGA 1F6MC 2GSQA 4NHZA 1AW9A 1PX6A 1H4OA 3P90A 3FRCA 1A24A 5JCGA 4MH2A 1ML6A 1PX7A 4TOPA 3BOAA 1OAZA 1Q98A 5INYA 10GSA 4G10A 2FWEA 2O89A 4FH8A 3EVIA 2G2QA 5G5FA 4ILFA 3CXGA 3QOUA 3WYWA 3TB2A 2HZFA 3EURA 1VF3A 2L5LA 2GQMA 2JADA 2VOCA 4OWYA 4BPYA 4WR5A 1XXUA 4MABA 4MMMA 1AC1A 4XS6A 4AF2A 4YH2A 2YWNA 3WD6A 1XWGA 3QCPA 1KEBA 4G2EA 2OE1A 1SK0A 3GURA 1ABAA 1FAAA 1URMA 3A2VA 1ZL9A 7GSSA 1XWBA 3NOFA 4MDCA 1FHEA 4ACSA 3ZITA 1WIKA 4Q5NA 5D9TA 4EVMA 2MZCA 3UJ1A 2PGTA 1GRXA 2RM6A 1KNGA 2H6XA 2RUFA 2R2JA 4J57E 3F9UA 4I2TA 3FR9A 1U3IA 9GSSA 4IQAA 1K0CA 2AJQB 3J7Yk 3E9JB 1VF1A 3A3TA 1T3BA 1X5CA 5IIZA 1O73A 1H75A 3F6FA 3Q18A 4MP4A 3GH9A 1GSUA 2O87A 3FR6A 1V9WA 5JCUA 1MDKA 1MDIA 3TKRA 3F3QA 2H19A 5IMCA 2C1YA 4KCAA 3FY7A 1FB0A 2C3QA 2F3MA 3LFLA 2L6DA 3BCKA 4MF5A 3C1RA 2FNOA 4ML1A 1A2JA 2YWOA 4YQMA 2AHEA 3VWUA 5CREA 1A0RP 2VL3A 3D5JA 2JZTA 4MPGA 1ZYEA 2P31A 5D9VA 4O32A 5ECNB 2ZCTA 4ZXGA 4PUAA 4FYUA 4EE0A 3FZ5A 3QMXA 2LS5A 1ERTA 5CRDA 2C0EA 5G31A 1V57A 5HFIA 5EVOA 1F3BA 4XCSA 4XRDA 2JSZA 4O5RA 1J0FA 1GLPA 5JWRB 1X9MB 4X0XA 5EL8A 3F0IA 3GUSA 2OACA 1B9XC 2PVQA 4HJ2A 1TK0B 1SJ6A 2GSRA 1A0FA 2NVLA 2VL9A 2VAFA 3CTFA 2DLXA 5HFGA 1TU7A 2REMA 5IMVA 1NHYA 2BMXA 3IBHA 1EEMA 3Q6OA 4K2DA 5D8IA 4HJMA 2I9HA 4BL7A 3HJOA 3FZ4A 1B8XA 2IWTA 5B6MA 4FO5A 3QPMA 4IP6A 6GSTA 4HDEA 1GSEA 5D9WA 3M9JA 3PH9A 3RPNA 1QXHA 2IMDA 1W4VA 16GSA 1ERVA 1JZOA 5ELGA 3GRXA 2LQQA 1DE2A 5H5RA 4AJ7A 1T4YA 3ZL5A 4P3YB 1EP7A 1X9SB 1OKDA 4JU5A 3D0ZA 1O6JA 3UBLA 1OC9B 3GV1A 3EU3A 4QL7A 1M9AA 4TR4A 4WBRD 5CAXA 4EXJA 1SJZA 2HNLA 3L9VA 4V1Ag 3KTLA 1HNCA 2YWMA 2IMKA 1HYUA 4KGIA 2AUVA 2H6YA 4K0NA 5ID2A 3EYTA 3L4NA 1RW1A 5IMDA 4IGJA 4N0ZA 1PRXA 4ZB6A 3FHKA 5HR0A 5D73A 1EV4A 4OO5A 4OCEA 2E7PA 2LRTA 4CHSA 5AGYA 2ZNMA 3HDCA 1V98A 4TVEA 3TJGA 4XRAA 2Z9SA 4MZBA 3KH7A 5A4VA 4K7NA 3ZREA 3GIXA 1QQ2A 4NPBA 4I97A 1JZDA 1OE7A 2YN1A 2RM5A 2LNSA 1OVNA 4WBJA 3WT1A 1U3AA 3GSSA 2O8VB 4NV2A 2VL2A 1E6BA 3GSTA 4TR3A 2DMMA 3I9V2 1BQ7A 5G2ZA 3HZ8A 3KZQA 3QR6A 2PUKC 4WXTA 1THOA 3TOTA 2GZYA 2H0IA 3TJFA 4DSSA 1GUKA 2R37A 2IIYA 1MD4A 3D22A 4IBPA 2PPTA 1ST9A 2VM1A 3MAKA 1O85A 2R6KA 1C72A 1PMTA 5ECSA 4ZL7A 2ALBA 2H74A 1OKTA 3PGTA 3M9KA 3APSA 4TR1A 3OR5A 1T8EB 1GP1A 1JHBA 3QAWA 2YZHA 1J9BA 4JZQA 4MF7A 1TXXA 5IPGA 5CNWA 4O92A 2GSTA 3CYNA 3KCMA 3ME7A 4ECCA 5COHA 1GUMA 5J9BA 11GSA 4MJCA 2B3SA 3IR4A 2E2MA 2YZUA 1YKAA 1GTUA 2GQKA 3ERFA 4KB3A 2DJ3A 5DBQA 2ON5A 5J9CA 4PQ1A 3GHAA 4MPFA 5DJMA 5IMFA 2H66A 2L6CA 3ISOA 4RQRA 4JE1A 4OO4A 1Z6NA 4MA9A 2GLRA 2HSYA 4EC0A 1YZXA 2P5RA 2YWIA 2FD3A 3LYPA 2C8UA 2XC2A 4EO3A 19GSA 2HT9A 4OFTA 1JZWA 3HY2A 4HUAA 3QAVA 3R2QA 1QGVA 1USBA 2VCZA 3KP9A 3LEFA 3LSZA 4J56E 1QUWA 2JL4A 1BJXA 3WGDA 4K7IA 5DCHA 4IN0A 3N5OA 4MK3A 2LRCA 1E2YA 1OC3A 5F06A 3ZTLA 4PQHA 4GF0A 2ON7A 4IS0A 2TIRA 3F4SA 1XWCA 1ERWA 1IYHA 4KDUA 2FY6A 3CMIA 4ZL8A 5J41A 5CP1A 1SJIA 1XWKA 1PQNA 2WCIA 1M7TA 3V1WA 3RAZA 1TP9A 1PSQA 3H1NA 3VURA 5IO2A 2V6KA 3ZMLA 4ECBA 1TRUA 4LLRA 2XBIA 3UARA 5AIXA 5HR3A 4IKHA 5J4UA 2R5GA 5KN0A 3M1GA 3US3A 3D4MA 2VCWA 1XZOA 2LSTA 1K3OA 3IAM2 1BYEA 4E8HA 3TUEA 3G7IA 4TXVA 3ERGA 2R4VA 1NM3A 4CW9A 1I9DA 1XCCA 1UVZA 1EOHA 3RHCA 4DVCA 4F03A 4F82A 1SD9A 2JSYA 3KEBA 2QSIA 4JRRA 2X8HA 3UOMA 5ABRA 5F0GA 5G30A 3U6VA 2H30A 2PMTA 2GVPA 2YJ7A 2EC4A 1GULA 2L4CA 1U6TA 3UBKA 4IJIA 5A4UA 3QD9A 4EL1A 4HEA2 2LNTA 2HI7A 2IJYA 1LJRA 1XWAA 1PD21 3ZZXA 5J5NA 1M2AA 4HQZA 1B4PA 2OBKA 2VCQA 1TI1A 2FA8A 2H76A 4IELA 2IL3A 4LMWA 3H4KA 2H0GA 1R26A 2DJ0A 1GLQA 1U87A 4FIWA 2M80A 1K3YA 3TJJA 4AJ8A 4HQSA 2R3XA 5EY6A 3TRXA 3ERWA 1R7HA 2HYXA 2I1UA 3FZ9A 2B5YA 2HZEB 3HHVA 4L0WA 3APOA 1XW9A 1WPIA 1S3AA 5IO0A 2VLVA 4L5OA 2HLSA 2B5EA 2CX3A 3Q74A 4E8EA 1DBYA 1W89A 2WRTA 2KP1A 1XW6A 2LJKA 1K0NA 1FO5A 3GKKA 1GTIA 2LRNA 3LXTA 3HKRA 1MDJA 1ZGNA 4MF6A 3CRUA 4PURA 3C73A 4XS4B 3A5WA 4IW9A 4MLYA 5CRGA 1TK5B 1F37A 5KEJA 6GSSA 1V40A 2GZPA 4PGTA 2I4AA 2DJ2A 2H6ZA 1EWXA 3TKPA 1FOVA 2CVBA 3EINA 1M99A 2CAIA 3FYGA 3ZFLA 1PA3A 2NPBA 3IDVA 4KSMA 2FWHA 4OFMA 3ZIVA 18GSA 1KTEA 2XHFA 4QL9A 4AGSA 3P8WA 1GL8A 2D2ZA 1YKCA 4TRXA 3IOSA 4MJEA 1VF4A 3MDKA 3C8EA 2BJXA 1TW9A 5C04A 3EC3A 2YV9A 3CSHA 5IQYA 2A2RA 5C00A 1F9MA 4XS1A 1M0UA 3HJMA 3M3MA 2DJKA 5FT3A 2DJ1A 4KH7A 4ZB8A 2AAWA 3CRTA 2IMIA 3CSIA 3HA9A 4KUNA 1EGOA 1TTZA 3KM6A 3KXOA 4K6XA 2B1LA 3LQ7A 5DALA 5DJLA 4XIHA 2QGVA 3QDNA 2AYTA 2PU9C 2TRCP 2A2SA 4TN8A 4I8BA 4Q5RA 3DVXA 1S3CA 1ZCPA 4JR6A 1QK8A 4GRFA 2PVOC 1G7EA 4HI7A 2PN8A 3P7XA 5DAKA 4POMA 3TKSC 3KMNA 3E0UA 2L59A 3APQA 5AISA 1NHOA 1X5DA 1SENA 2XBQA 4ISDA 1SL2B 4TKYA 1AAZA 1JLWA 1CQGA 5JWQB 2C4JA 4PNFA 1ON4A 4FYBA 5ECLB 2H72A 2VM2A 3ZVJA 2FWFA 1F2EA 1FB6A 4TW5A 1YY7A 1YJ6A 5KN3A 2A4VA 2I3YA 3G9BA 3DIEA 3WGEA 5B6NA 5B7CA 3EMPA 4ZIJA 2V1MA 4HU7A 1WRYA 3DVWA 1GSDA 4I2UA 3GTUB 1YF1A 1SK1A 1Z9HA 1V2AA 1TRVA 3EE2A 5GAPD 4NXIA 3GA4A 5ECKB 1K0OA 4IJ3A 1BAYA 3DD3A 1SU9A 4GLTA 1B48A 1G6WA 4LL4B 5E4WA 3O3TA 3BD2A 2M72A 1QFNA 1ZYQB 22GSA 1A2MA 5JCWA 4I5QA 3GL5A 3VI7A 1BG5A 3TKSA 4HU9A 3RBTA 4KDXA 3KJYA 1Z3EA 3ZYWA 2IMFA 4GWRA 3ZVJD 3JCML 4HS1A 3FR3A 3RDWA 5HQPA 4KCEA 1GSSA 1AQXA 1XFLA 1PL1A 4WF4A 3UVTA 2B1KA 3SWLA 3IAS2 4JBBA 4JR4A 4RI6A 2YJHA 4TXOB 1GSFA 1YEXA 3BBYA 1V58A 3DXBA 3VI5A 1TJDA 3GL3A 2HRFA 3FEUA 1Y25A 2F9SA 3KIJA 3DYRA 5F05A 1SKRB 2X8CA 1YDKA 1SK2A 2F8FA 3VPTA 2O7KA 1O7UA 6GSXA 2GGTA 3QAGA 2KHPA 2KLXA 1UC7A 3O6TA 2WULA 4V2LA 1YF0A 2LJRA 3HYPA 1T00A 2E0QA 2MMZA 1OE8A 3IA1A 5GAND 4LA1A 3IK7A 1T1VA 2IFQB 1AQVA 3WGXA 1NW2A 3HXSA 4PUFC 2IN3A 1ZOFA 1AUCA 2EIRA 3IRAA 3TJKA 3LG6A 5LD0A 3BJ5A 4F2IA 3TRQA 1XIYA 1GNEA 3EMXA 1GNWA 4GSSA 3C1SA 1WMJA 3VLNA 2CA8A 4PXOA 4IHUA 4BVXA 3DGQA 3H79A 3I69A 4F0BA 2LQOA 3S9FA 3HJPA 1GWCA 3O76A 3ZRDA 3VWXA 6GSUA 5G1KA 2H71A 4POKA 2H8LA 4Z7XA 2H1BA 3RPPA 4ZBAA 5DQYA 3G7JA 2WDUA 5B8BA 3DRNA 4KSOA 1TK8B 8GSSA 3MNGA 3KP8A 4YQVA 5DVBA 5F07A 2V32A 3GNJA 1HNAA 2GSSA 3GX8A 2WS2A 3EU4A 2VUPA 3VWWA 1VGLA 2JZRA 4K8MA 3J7Yb 1UN2A 3P2AA 1MEKA 1WE0A 3D6IA 1KBNA 2MYGA 3MSZA 2XPDA 2H0HA 2LV3A 1Z5YE 4POBA 4YAVA 5J3RA 3W6GA 1ILOA 3L0HA 3F6DA 3CTGA 5HR1A 2HFDA 3KGKA 4WEYA 3UMAA 2H01A 2DIYA 4KW6A 5KN1A 2CV4A 2E2GA 2HSHA 1EGRA 2X8GA 1XVQA 3GH6A 1EZKA 3L78A 3FK8A 2LUSA 1EP8A 1TI3A 1A23A 4D73A 2C0FA 3F63A 1GSYA 4ECIA 2X99A 2KP2A 3KMOA 4KAEA 13GSA 4KE3A 2IMEA 1IYIA 1XW5A 2PWJA 2QC7A 6GSYA 2H1AA 2OE3A 2CT6A 2WFCA 1Q4JA 4KNDA 1TRSA 1AQWA 2OBIA 4KDYA 3GFKA 2FUG2 3ZIJA 2XPEA 2CVDA 4K9ZA 4HZ2A 3VK9A 2V41A 4O7HA 1RQMA 2TRXA 4LMVA 4RI7A 2FCHA 1SL1B 2H1GA 3DWVA 2GT6A 4N11A 3NZNA 2IPAA 4J2FA 1A2LA 3HCZA 3A2XA 5ECPB 3IPZA 2J9HA 1THXA 1G0TA 4CDOA 1GTBA 2HZEA 4JEDA 3FW2A 5HR2A 4ZL9A 1YEPA 5EPFA 4MH3A 5GZZB 3G7YA 1JFUA 1BEDA 1N8JA 2VLUA 3F4TA 3F8UA 3TGZA 1XOAA 1ACVA 1XOBA 2RUEA 5DDLA 2DSAA 3DKSA 3TCOA 4PNGA 1O81A 4NMUA 1A8YA 1I5GA 4DEJA 3PINA 2OADA 3HVSA 5IMAA 2O85A 1QMVA 1A8LA 4XS4A 1LU4A 4ZBDA 2RIIA 2N5BA 5D93A 4PQIA 2YANA 4ULXA 3TRPA 3ZFBA 4DSQA 3GYKA 2MMAA 2VO4A 1GTAA 2H70A 1WJKA 2JACA 2K18A 3GKMA 2OA7A 5A5KA 2VD1A 2C3NA 1T4ZA 2YNXA 4BVYA 1M2DA 3AY8A 2I81A 1Y6EA 4BWQA 1G7OA 5D96A 5ECQB 5ECIB 4ML6A 4H86A 1SD8A 4XHMA 5JWOB 3UVHA 4Q5QA 4L8EA 2L57A 3TKQA 3IK9A 4L0UA 12GSA 3U5RE 4EF0A 2KOKA 3NIVA 1TU8A 5LCZA 1FG4A 2QKEA 1FVKA 1JZRA 3D21A 1FVJA 4TR0A 5LNKe 2LKUA 3TJBA 4YAPA 2N5AA 2F51A 4NHWA 1X9WB 3CSJA 5CO3A 3M0FA 1K0BA 4MCUA 1XPVA 3KH9A 5IPHA 2C0GA 4OFNA 5HFKA 3IC4A 2EIOA 2RLIA 3EWLA 1J08A 2F8AA 1K3LA 5GSTA 3UEMA 2NBSA 3QFAC 1VRSD 5H5QA 2MBTA 4LL1B 3DMLA 2OJLA 1B9YC 4BA7A 3M8NA 3MWHA 1EOGA 1SKWB 2HE3A 4I6XA 4V2NA 1GSQA 2K8VA 1XVWA 5DALB 4N10A 4WF5A 1TOFA 3L9UA 5IOXA 3RHBA 1TDIA 5KN2A 2N5FA 2V2GA 5ECMB 2B6MA 2DIZA 4AJ6A 3GKXA 2FGXA 2JZSA 3W8JA 3ZMKA 5FWGA 3BCIA 1O8WA 1SL0B 2AB6A 1AIUA 2ES7A 1M2BA 1HNBA 4ZB9A 2V6OA 4G19A 3GTUA 2CZ3A 1PL2A 3F4RA 5DAKB 3IHQA 1OC9A 2LEGA 3H93A 4MJAA 2CQ9A 2J23A 2OE0A 2BTOT 5AN1A 3I43A 2NTOA 4GQFA 1R5AA 3QFBC 1M9BA 2VCVA 4V2MA 4N0VA 5ENUA 1F3AA 4NV5A 1MD3A 3TOUA 3GN3A 1NSWA 5F8BA 3HVXA 3IXRA 3VPQA 4EUYA 1TRWA 4POLA 1EEJA 4YQUA 3Q19A 1HD2A 2VL2C 5ECHB 1AXDA 2L4QA 3W8SA 2L5OA 3IE3A 1LBKA 3ED3A 1WWJA 2DC5A 1FW1A 2EIQA 1MTCA 4TXOA 3GKNA 2DMLA 1RK4A 2MMNA 6GSVA 1HQOA 3A2WA 4WETA 3D4TA 2WZ9A 2FA4A 2K8SA 3ME8A 5G1LA 3ZLPA 3VFIA 5ID2B 1T7PB 5CYYA 1ZMAA 4BWSA 2M46A 3FKFA 5IM9A 3SBCA 3E3EA 2VCXA 3IV4A 1R4WA 4GXZA 4NWYA 2YV7A 4GSTA 1UA5A 2H1DA 1DE1A 4GQCA 2GZZA 5ECOB 2JU5A 2VLTA 4X1UA 4NAXA 1X5EA 2CX4A 3LGCA 2YOIA 4GSNA 2IFQA 2H75A 3UIWA 3LORA 4ZILA 1SYRA 3UAPA 3L9SA 5G5EA 4HOJA 3KD0A 3LYKA 4K0GA 3KTBA 2WGRA 2NDOA 2CVKA 4KX4A 4Q5FA 4ECJA 1X0RA 3TKSE 2GT5A 2VIMA 2LTKA 4RUVA 1JLVA 5E59A 3VWVA 3LWAA 3CBUA 2GTUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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