3P2AA

Crystal structure of thioredoxin 2 from yersinia pestis
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
145
structure length
145
Chain Sequence
NAMNTVCTACMATNRLPEERIDDGAKCGRCGHSLFDGEVINATAETLDKLLQDDLPMVIDFWAPWCGPCRSFAPIFAETAAERAGKVRFVKVNTEAEPALSTRFRIRSIPTIMLYRNGKMIDMLNGAVPKAPFDNWLDEQLSRDP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pestis
publication title Crystal Structure of Thioredoxin 2 from Yersinia pestis
rcsb
molecule keywords Putative thioredoxin-like protein
total genus 36
structure length 145
sequence length 145
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.20.28.140 Mainly Beta Single Sheet Rubrerythrin, domain 2 Rubrerythrin, domain 2 3p2aA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p2aA02
4OO5A 5ECLB 3WGEA 4KNDA 4IBPA 1U3IA 2IMDA 3P8WA 3LWAA 5B6NA 1DE2A 4I2TA 2IMFA 1ZCPA 3ZITA 2OE1A 3QFAC 1H4OA 3DGQA 5GZZB 4D73B 5JCGA 3F4RA 3SBCA 4O7HA 3KCMA 3TKRA 3O76A 1HNCA 5GSTA 1X9WB 5DAKB 2GGTA 1K0AA 5B7CA 2CVKA 2YNXA 17GSA 1S3AA 2JZRA 5A5KA 5F8BA 3ZLPA 4DSQA 4KGIA 2CX4A 2GTUA 1XW6A 2CZ3A 2WS2A 4FYCA 2LRCA 3P2AA 1KTEA 1EGRA 3L4NA 4MK3A 3HVSA 5D9VA 3CTGA 1SKSB 1THOA 2B1LA 2RUFA 2VUPA 2JSZA 1ERTA 2JACA 4QL9A 1WJKA 3GL5A 2VCXA 4GSTA 4WKWA 2H0HA 2ZNMA 3DVXA 1MDJA 1AAZA 3GMFA 3QAGA 4YQVA 2KP1A 5IPHA 2DMLA 2IIYA 3GURA 2HNLA 2H1AA 1KNGA 1ST9A 3KD0A 2B7JA 1VGLA 2DJ1A 4HU9A 5C04A 4IN0A 5ECQB 1U88A 3FR3A 1XW5A 3ZFLA 3KTBA 1X5DA 1LU4A 1DBYA 2B7KA 1EP8A 4MF6A 4V2NA 1JHBA 1XWAA 4IJIA 4XS4B 3DXBA 1YY7A 1FB0A 3BJ5A 4DSRA 5DDLA 3QPMA 4N11A 2GSQA 3FYGA 1TW9A 3VI7A 1O81A 4MZCA 2V6OA 3GA4A 1T4ZA 1R4WA 2AB6A 1Q4JA 2JSYA 2H75A 2HT9A 1XWGA 3IA1A 1Z6MA 1EWXA 3QR6A 2IN3A 2HZEA 5DQYA 1GUMA 4DSSB 2NPBA 3RPNA 4KA0A 3GYKA 2ALBA 1F37A 4HQSA 2CT6A 3Q19A 3M8NA 3GN3A 2GQKA 5J3RA 1QXHA 1CQGA 3E0UA 1UA5A 3C1SA 3QMXA 4X0XA 3MWHA 1HNAA 1XVQA 1PQNA 4NHWA 2PU9C 4L0WA 5DALB 9GSSA 1FW1A 5HFGA 4ILFA 4IQ1A 5ECMB 6GSUA 4HOJA 4V1Ag 4AJ7A 1R26A 5IOXA 4MH2A 1FO5A 1UC7A 2V6KA 3Q18A 4AJ6A 1WRYA 1SU9A 3F4TA 2AAWA 4TR1A 3GTUA 2NTOA 2WZ9A 3KH7A 2OBIA 1J08A 1GSEA 5EY6A 3K8NA 4ZB9A 1GUHA 2ZCTA 3GNJA 4HU7A 4L5LA 3ZIVA 4MABA 3GKNA 1ZL9A 2C8UA 5IO0A 3DMLA 4TR3A 13GSA 4BVXA 2L59A 14GSA 1Z3EA 2WFCA 3APOA 3MSZA 1WE0A 5E4WA 1OC9B 2H73A 1X5EA 1KEBA 3TRXA 5H5QA 2KOKA 3DYRA 2YP6A 1GTAA 5IMDA 1EOHA 1YDKA 3ISOA 2PMTA 1U6TA 3EVIA 5F05A 2J9UB 1K3LA 4PX1A 4Q5FA 2XBIA 3LSZA 6GSWA 4ECBA 3RAZA 1IYIA 3Q6OA 3ZRDA 4K7NA 2A2RA 3EE2A 4IW9A 4HQZA 3W8JA 5KN3A 5ID2B 3UAPA 6GSYA 4ZXGA 2K8SA 4HEA2 4PUAA 1GL8A 4ZBAA 3TKSE 1PD21 4I97A 5G1KA 3J7Yk 1JZWA 4NWYA 3L9VA 3FKFA 2X8GA 1QFNA 4EF0A 4KSMA 2IMKA 4N10A 2KUCA 2DJKA 4KDUA 3HYPA 4ZIJA 3APSA 2GS3A 1UVZA 5LD0A 1Q98A 3H79A 1EEMA 3TKSA 4J57E 1B48A 5A4UA 2LJRA 1XW9A 4K7IA 4BWSA 3F6DA 3G7JA 2IMIA 3DVWA 1EEJA 1MTCA 4PQ1A 4FYBA 1NM3A 1JLVA 1FVKA 4N30A 1URMA 4Q5QA 1OC3A 3UOMA 3CRTA 3L9SA 5FWGA 4F0BA 2FWEA 2CAIA 2F3MA 1J0FA 2H70A 1AC1A 1WMJA 2IMEA 2VCQA 2A4VA 3I6AA 2BTOT 4KH7A 4ML6A 3J7Yb 2HSHA 1YF0A 3KGKA 3ED3A 4ZBBA 1VF3A 1JLWA 1YJ6A 6GSXA 4RI7A 2I9HA 3P90A 2HZFA 5AIXA 1FAAA 3WYWA 2C6BA 1MEKA 2LRTA 2QC7A 4K2DA 4P3YB 3TCOA 5G2ZA 4ISDA 2XHFA 2OJLA 3TJKA 2E0QA 3FRCA 4GSNA 2CX3A 2O89A 2I3YA 2H0IA 3F3QA 3US3A 5AN1A 1AUCA 3NIVA 2LTKA 3D22A 1XBSA 3HXSA 1T8EB 3CRUA 4PUFC 2FWGA 4ZILA 3VI5A 2DJ0A 3IE3A 3CYNA 4NXIA 1B4QA 2B6MA 1PGTA 3F3RA 2YN1A 2B5EA 4F2IA 2X8CA 3IK9A 1GSUA 2JL4A 2PVOC 1JZRA 1AIUA 2N5AA 2K9FA 1GTBA 2GT5A 4OWYA 1PL2A 1V40A 2DBCA 1ZZYA 4GRFA 1AW9A 4POKA 4XTSA 2N5BA 4TW5A 3I43A 3APQA 1TI3A 2WRTA 2P0GA 3C7MA 2EC4A 2C4JA 2CQ9A 1XZOA 8GSSA 3VWWA 3FK8A 1EZKA 1XWKA 1MDKA 1F2EA 2IFQA 1GNEA 2JADA 2G0FA 2RUEA 1Z5YE 3H1NA 1SJ6A 4EUYA 2TIRA 4JE1A 2H66A 4HZ4A 1F3AA 5DCGA 3IPZA 3O6TA 3AY8A 3HJOA 4WETA 4IELA 1TK8B 2VL9A 1GNWA 4ZBDA 1V57A 2G2QA 1TP9A 2L4QA 2MBTA 3N9JA 3ZYWA 2REMA 3GL3A 1PN9A 2VLUA 4Q5RA 3IXRA 4NV2A 1MD3A 4JRRA 4CDOA 2IJYA 4V2LA 3S9FA 1G6YA 3M9KA 4LA1A 3BCIA 4K0NA 3WGXA 2YJHA 3UMAA 5ELGA 5FT3A 3GKXA 1N8JA 5D96A 3HVXA 2CA8A 2VCVA 5IIZA 5JWRB 4WEYA 3JCML 3W8SA 3LYKA 3HY2A 5JWOB 4GF0A 1ACVA 2H72A 4KCAA 5DCHA 4MPGA 5EL8A 3TGZA 1GLQA 2MMAA 2OA7A 1FB6A 2L57A 2H30A 1K0DA 1GSYA 2LRNA 1A2LA 3LJRA 2H01A 4J56E 3RHBA 3VPTA 4E8EA 1X5CA 2RM6A 2XPEA 5ENUA 1GTIA 1SD9A 2GZZA 1I5GA 1VRSD 4DEJA 1GRXA 4TXOA 1TRVA 4V2MA 3ZVJA 2HXKA 1OVNA 4YH2A 1V58A 1SYRA 2FUG2 1SK0A 1XWBA 1V2AA 1M2AA 4KSOA 3ERWA 3ZL5A 2ON7A 4I5QA 3QAVA 4CW9A 2LNTA 2WJUA 2H6XA 4JBBA 3KMOA 2NVLA 5CRGA 3HA9A 4YQUA 5LCZA 1Z9HA 2QSIA 5KN0A 2PPTA 2TRCP 2YZUA 1BEDA 1QMVA 2ZUPA 3CSIA 2RLIA 2LNSA 4E8HA 2HRNA 3WGDA 5H5RA 1GH2A 3PGTA 3UEMA 3ZZXA 4LLRA 1FOVA 1F9MA 5ECIB 2CV4A 1JZOA 2M46A 4NHZA 2YWOA 2LKUA 19GSA 3GHAA 3EMPA 4JEDA 3WD6A 4XRAA 2K18A 4RI6A 2P31A 1QQ2A 1T4YA 5A4VA 5IO2A 5KEJA 2O8VB 5J9CA 3PH9A 2L6DA 3UBKA 5L71A 2VIMA 3GUSA 4K0GA 5INYA 4MPFA 1BG5A 1TI1A 4BWQA 18GSA 3L0HA 2CVBA 1V9WA 2LJKA 4F0CA 1DE1A 3KIJA 4XXBB 3EYTA 1XCCA 4G2EA 4EL1A 2VAFA 2B3SA 1WOUA 2CZ2A 2O85A 3KH9A 4KCEA 4BA7A 12GSA 4ECCA 1YKAA 4TVEA 1SL1B 5IPGA 5J5NA 3UIWA 2P5RA 1O85A 4LL4B 3Q74A 2L6CA 1B9XC 4KE3A 3KP9A 3I9V2 2R2JA 3VFIA 4RQRA 1SENA 1ILOA 1M0UA 2E2MA 2H8LA 5LNKe 3GKKA 4O5RA 4JR6A 2GLRA 3ZVJD 4ULXA 4EXJA 3GX0A 2GSRA 4ML1A 5CREA 4KAEA 1YQ1A 2JZSA 4TR1B 3GTUB 4EE0A 4KX4A 1LBKA 1PX7A 4HZ2A 2VO4A 5AGYA 4EC0A 4K8MA 3NZNA 4POMA 2IPAA 1V98A 2YWIA 3QAWA 5IMVA 3M1GA 3IAS2 1JFUA 4MJCA 3HDCA 1EV9A 3IHQA 1R5AA 1YKCA 2FD3A 1G6WA 1HD2A 3G7IA 2I4AA 1ERVA 2PGTA 5IMAA 3FR9A 1EV4A 4LL1B 3CTFA 2O87A 2J9HA 2B1KA 4GCIA 2MMNA 5IOWA 2PN8A 4IHUA 1WIKA 5GAPD 2GZYA 3KJYA 3RBTA 2NDOA 2YOIA 2C0GA 2X99A 1A24A 5D8IA 1TTZA 3MAKA 5COHA 4QL7A 4MH3A 3HCZA 3HZ8A 3E3EA 1Z6NA 2WULA 3HZ4A 5JWQB 2N5FA 1Z7RA 4PNGA 2VLTA 3TUEA 3LG6A 3C8EA 2BMXA 2PWJA 4V1Ap 2YCDA 2H19A 1E6BA 2F8FA 2GSSA 2EIQA 4BPYA 3TOTA 3FY7A 2DLXA 4OFTA 2L5LA 4IP1A 3FZ5A 2C3TA 4MA9A 5HR3A 5D93A 2VM1A 2WB9A 2D2ZA 4IP6A 1S3DA 4JR4A 4MLYA 4G19A 3DD3A 3IOSA 4PNFA 3WT1A 2LSTA 3TKSC 1S3CA 3DIEA 4WF5A 1K0BA 4OD7A 1TRWA 3KXOA 2IWTA 1GSDA 1NHYA 4NV5A 1SYXA 5D9TA 5ECPB 3D6IA 2FA4A 1TRUA 3D0ZA 3EC3A 1F3BA 3TKQA 1X9MB 5G30A 5D9XA 3KEBA 5IMFA 4RQXA 1YEPA 2GZPA 4KDXA 2FLSA 2H6YA 4X1UA 2VL2A 3IR4A 4EKZA 4GWRA 3U5RE 4F03A 5B8AA 1EOGA 1FG4A 1R7HA 1B9YC 4PURA 5ECNB 3KZQA 4XRDA 3TJBA 3H4KA 1K0MA 2GVPA 5DBQA 2H71A 3FEUA 4TR4A 4TRXA 3FHKA 5CO3A 5J9BA 3VWVA 1TU8A 3QFBC 5HFIA 3ZMKA 1DSBA 1NW2A 1X9SB 4XHMA 2C6AA 5ECKB 1A2MA 16GSA 5ECOB 1HNBA 3F9UA 1TRSA 3EU3A 1RW1A 1NSWA 5AISA 5HR1A 3HJPA 1OE8A 2M80A 5GSSA 1GTUA 3GSTA 3UARA 1SJZA 1THXA 3VK9A 1TKDB 1NHOA 4POLA 4MCUA 2WCIA 3VLNA 3A2XA 2KLXA 1XIYA 3CSHA 2PERA 3A3TA 4YAVA 5G5EA 1MD4A 5D9WA 3KMNA 4IQAA 2C0DA 4DVCA 4IVFA 1WP0A 2R5GA 2YPMA 3VWUA 3IK7A 2RM5A 4CHSA 5D73A 4XIHA 3OR5A 4WF4A 2FNOA 5ABRA 5JCWA 1O6JA 3KP8A 1G7EA 2VM2A 2XPDA 2IFQB 3ERFA 2L5OA 4TN8A 5IMZA 3ZMLA 2M72A 3BD2A 3EINA 3ERGA 1XWCA 5J41A 4OCFA 3EMXA 3B08B 5HR0A 1VF1A 4K9ZA 1EGOA 2BJXA 1OKTA 3CBUA 1BAYA 4EDYA 3BOAA 3H93A 2VCZA 4HDEA 3LFLA 1TOFA 4MJAA 3TRQA 1FHEA 3DEXA 2YJ7A 1PRXA 4EO3A 3G9BA 3UVHA 2PUKC 2E7PA 1IYHA 1T1VA 3FW2A 4POBA 5B8BA 4GTUA 2QGVA 2OACA 4MJEA 5DJLA 4YAPA 3IBHA 4PGTA 2GSTA 1K0CA 1GWCA 4F9ZA 1Y25A 1K3OA 4EDZA 4FH8A 5CRWA 3E9JB 3C1RA 4YQMA 3IAM2 2GQMA 3CMIA 4LMVA 2F8AA 4OMVA 5E59A 5CRDA 1O7UA 2AYTA 3ZREA 1AQWA 1ERWA 4TR0A 4MMMA 2V1MA 1GLPA 2YANA 2B5XA 1M2BA 4PXOA 4TXOB 4G9HA 3GX8A 4OO4A 2V41A 5JCUA 4G10A 3DRNA 3FZAA 3H8QA 1ZGNA 3GFKA 3I69A 2NBSA 4D73A 4MZWA 1PSQA 4J2FA 4K7OA 4OFNA 1GSFA 3UBLA 2J23A 3PINA 4AJ8A 3IRAA 5DAKA 1A0RP 1A0FA 3UVTA 3M0FA 5CP1A 2WGRA 1Y6EA 2IL3A 3GV1A 3ZTLA 4NAXA 4PQHA 3U6VA 1HQOA 2H1DA 2LQQA 1B4PA 2LJAA 4BL7A 3F8UA 2V32A 4IS0A 3IV4A 4OCEA 5H5SA 5DVBA 1A2JA 1VF2A 3HHVA 4ZL9A 4GQCA 4AGSA 2YWNA 3ME8A 1U87A 4KUNA 4ECIA 6GSVA 2P5QA 3TRPA 1ZOFA 4AF2A 2K6VA 1PX6A 2H74A 2AUVA 1BQ7A 5DJMA 3L9UA 3C73A 2VCWA 3VURA 4N0ZA 4ZB8A 2H0GA 4Q5NA 2MBSA 3QCPA 4IJ3A 5KN2A 2DJ2A 4RUVA 5C00A 2C80A 1M7TA 3ZIJA 2B5YA 4HS1A 3BBYA 2LUSA 4ECJA 2C3NA 3D5JA 1ABAA 3RDWA 4XS4A 2H76A 3GKMA 3FR6A 2HZEB 5AIVA 2R37A 1M9BA 1N2AA 1W4VA 1WPIA 1PKZA 4EVMA 4O32A 1Z7PA 4FO5A 1GSSA 5ECRB 3GRXA 2KHPA 5HR2A 2HFDA 2I1UA 4K1FA 3F6FA 2DJJA 2AV4A 3D21A 2FGXA 3TB2A 4O92A 3N5OA 22GSA 2MYGA 3HD5A 4DSSA 3W6GA 1X0RA 3EU4A 3RPPA 3BCKA 3V1WA 1W89A 3F0IA 2EIOA 2HSYA 2C1YA 3DKSA 2VD1A 1PA3A 2I81A 5CNWA 2DIYA 2YV9A 5DALA 5CYYA 1XFLA 2R4VA 3LEFA 1AXDA 2OADA 1SD8A 1YF1A 3CXGA 1XVWA 5ECHB 3MDKA 4XS6A 2H1GA 3DWVA 2CAQA 1EP7A 4XS1A 3A5WA 4WBRD 1T7PB 4TOPA 1M99A 1HYUA 2CVDA 4TKYA 1GP1A 1H75A 11GSA 2KP2A 4I6XA 3A2WA 1QGVA 4WR4A 4ZB6A 1C72A 1TJDA 2VD0A 1VF4A 2GT6A 3M9JA 3UL3A 4TXVA 1SL2B 3LXTA 2H1BA 1OC9A 3NOFA 3GIXA 3F4SA 2OE3A 3P7XA 4ACSA 4GLTA 2PBJA 1UN2A 2C3QA 3L78A 1A8LA 3TDGA 3LQ7A 5DQSA 5HFKA 1PL1A 1YEXA 3B0AB 2FWFA 3GH6A 4FYUA 3VWXA 5J4UA 2LS5A 1O73A 1SL0B 3SWLA 2E2GA 1ERUA 2YV7A 1K0OA 5F06A 4I2UA 1SKWB 1USBA 2Z9SA 3FZ9A 4MP4A 2PVQA 2L4CA 5ID2A 4L8EA 1KBNA 1ON4A 4FIWA 2RIIA 3EWLA 1TXXA 3WT2A 4Z7XA 2HI7A 1GUKA 1R5PA 1YZXA 3G7YA 3TJJA 1XXUA 2F51A 2VOCA 2EIRA 2YZHA 2VL3A 2GQLA 1OKDA 2YWMA 3KTLA 2GDRA 2DJ3A 2K8VA 1AQXA 3LGCA 4KDYA 4QQ7A 4IKHA 3QDNA 4HI7A 2HE3A 1TK5B 1A23A 1K3YA 1SKRB 1SK2A 2DC5A 4OFMA 1TDIA 3O3TA 1QUWA 4GSSA 2AJQB 4XCSA 1BX9A 3GSSA 3VPQA 2HRFA 2VL2C 5ECSA 4HUAA 1OAZA 4GXZA 3IC4A 1T00A 2FCHA 3IDVA 2JZTA 2C0FA 2XBQA 1E2YA 2X64A 1TU7A 4LMWA 1A8YA 2OE0A 4MDCA 2X8HA 1GULA 3LXZA 4KB3A 5EVOA 1F6MC 1M2DA 2R6KA 4GQFA 3F63A 2H6ZA 3A2VA 4N0VA 4ZL7A 5HQPA 3HKRA 5G1LA 2MMZA 3CSJA 1G0TA 1FVJA 3D4MA 2WDUA 3QD9A 1B8XA 3HJMA 5G31A 1JZDA 2QKEA 3TJGA 5B6MA 3GH9A 5A4WA 2AHEA 1PKWA 4MJBA 4HJMA 5ELAA 2MMOA 1XOBA 4X43A 2F9SA 3RHCA 1OE7A 3EURA 6GSTA 3KM6A 4MF5A 1OC8A 4F82A 4WXTA 1LJRA 4NMUA 3R2QA 4I8BA 2DIZA 4L0UA 3UJ1A 1GSQA 3M3MA 1ZYEA 4MZBA 4HJ2A 5CAXA 4KW6A 2ES7A 2LEGA 1RK4A 1ZYQB 1ML6A 1AQVA 2JU5A 3D4TA 1PMTA 2DSAA 3LORA 3TOUA 2XC2A 5F0GA 2TRXA 2VCTA 1M9AA 2V2GA 2A2SA 2LV3A 5G5FA 4WBJA 1TK0B 1ZMAA 3FZ4A 5EPFA 7GSSA 1CQHA 4PQIA 1BJXA 1MDIA 2VLVA 2HYXA 3QOUA 4H86A 5KN1A 2C0EA 2DMMA 2FHEA 1BYEA 2FA8A 1OYJA 4ZL8A 1XOAA 4NPBA 2MZCA 5CRHA 5IM9A 2FY6A 1WWJA 2HLSA 3TJFA 1I9DA 1J9BA 2OBKA 3ME7A 3TKPA 6GSSA 2LQOA 4MF7A 1K0NA 3MNGA 4K6XA 4IGJA 1XPVA 1U3AA 1O8XA 1G7OA 1DUGA 5GAND 4JZQA 3ZFBA 1O8WA 1SK1A 4JU5A 3C71A 4BVYA 4ID0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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