3P2AA

Crystal structure of thioredoxin 2 from yersinia pestis
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
145
structure length
145
Chain Sequence
NAMNTVCTACMATNRLPEERIDDGAKCGRCGHSLFDGEVINATAETLDKLLQDDLPMVIDFWAPWCGPCRSFAPIFAETAAERAGKVRFVKVNTEAEPALSTRFRIRSIPTIMLYRNGKMIDMLNGAVPKAPFDNWLDEQLSRDP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative thioredoxin-like protein
publication title Crystal Structure of Thioredoxin 2 from Yersinia pestis
rcsb
source organism Yersinia pestis
total genus 36
structure length 145
sequence length 145
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.20.28.140 Mainly Beta Single Sheet Rubrerythrin, domain 2 Rubrerythrin, domain 2 3p2aA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p2aA02
5ECNB 2EIRA 4ZBBA 6GSSA 5J3RA 3ZMKA 2YNXA 1SJZA 4KE3A 2LS5A 3U6VA 4K6XA 2CVDA 5F06A 4QL7A 2AUVA 4RI6A 2QKEA 3ERWA 3VWWA 2LJRA 2V41A 3P90A 3LFLA 3CSJA 3N5OA 5B8AA 1SYRA 3ZFBA 4GSSA 2VIMA 1WMJA 1CQGA 3M3MA 5B8BA 3GV1A 1KTEA 3L0HA 2FCHA 5JWRB 2WGRA 1YF0A 2IFQA 10GSA 2LTKA 1EP7A 1TOFA 3ME7A 1OC9B 4XRDA 2VO4A 5EL8A 3ZL5A 1EZKA 1R5AA 3QCPA 4K7IA 2F8AA 3CTGA 3VWUA 3QFAC 2G0FA 1JLVA 4MH3A 4GQCA 1TK0B 3LQ7A 4JR6A 3KH9A 2LJKA 3TUEA 2JACA 2YWOA 3DXBA 2WULA 1A24A 2P31A 2JZSA 2YWNA 4V1Ag 4ZBDA 4RQXA 1QXHA 5F05A 1ZYQB 2DJ1A 2AAWA 5GSSA 2RM5A 4NWYA 4HOJA 4L0WA 2JL4A 5HFGA 2OE1A 2CAQA 4DSQA 4XS6A 5G1KA 3KTLA 3U5RE 3H1NA 3VFIA 4BWQA 1M2DA 4RI7A 3TOTA 2YZHA 1O6JA 2LNTA 1JHBA 2FA8A 4YH2A 1FAAA 2IFQB 1ACVA 5A4WA 2R5GA 2C6AA 3CRTA 4XS4A 3UARA 1EV9A 3GYKA 2CT6A 2KUCA 2FWGA 4K7OA 3WGDA 3IC4A 2IJYA 1V40A 2VCXA 2VL2C 4AGSA 2VOCA 4D73A 3KD0A 1ON4A 2VCZA 3KIJA 1GUMA 3G7YA 2YJ7A 2VUPA 2CVKA 1W4VA 4I8BA 2MBSA 5H5RA 1VF4A 1AIUA 4TXOB 5GSTA 1V58A 3ZRDA 4XXBB 3E9JB 1T4YA 1USBA 3J7Yb 2X8HA 1V9WA 2OADA 3C1SA 3KP8A 5ABRA 5ECPB 3D0ZA 1JFUA 3TDGA 6GSUA 5G2ZA 5JWQB 4ZL8A 4NV2A 2X64A 1ERUA 3R2QA 2O8VB 4F0CA 1SENA 2B5EA 2C0FA 5JWOB 1GLQA 1TW9A 1Z6MA 3IA1A 2H01A 4NMUA 2ZNMA 1GRXA 5IO0A 2IMDA 4EVMA 1YF1A 1AC1A 4FH8A 2C0DA 4MF6A 2VM1A 5E59A 3ZFLA 1K3LA 3FEUA 2PUKC 4POKA 1H75A 5ECOB 5IMVA 1K0DA 4XS4B 3KMNA 1QGVA 1IYIA 1ZMAA 3CTFA 2HZFA 1DE1A 4MF5A 4G19A 1X9SB 4MJEA 2OE0A 2GQLA 3L78A 3BCIA 4LL1B 4EE0A 3F6DA 5GAPD 3WT2A 2O87A 2C1YA 3FHKA 3VI5A 5GAND 1UN2A 2WCIA 3UAPA 2JZTA 3FR9A 5CREA 3MNGA 1PMTA 1QK8A 3GMFA 5G1LA 4TR4A 2YJHA 1XW5A 1SD9A 1PL2A 4HS1A 4HZ2A 2H1GA 5D9WA 1U88A 4MZWA 3EWLA 2DJJA 5DQSA 3UMAA 3HJMA 4WXTA 5AIVA 4GWRA 2PVQA 2VD1A 2DJ3A 4TR0A 3F9UA 5C04A 2KP1A 5DALA 1MDIA 1T4ZA 2QSIA 5D93A 1G7EA 3ERGA 4J2FA 3FZ5A 5L71A 4EL1A 4J56E 1XIYA 3RBTA 5AISA 3WT1A 3DVXA 1R4WA 1WP0A 4IJIA 4ISDA 1SL2B 1HNAA 4KDXA 2E2GA 2IPAA 3C8EA 2O85A 2GZYA 4I97A 2LRTA 1BQ7A 3TKSC 4HI7A 4POBA 2PU9C 3GTUA 5ECSA 2XC2A 4EC0A 5ECIB 3KH7A 1A2LA 2E7PA 4CHSA 3TRPA 3A2WA 3DGQA 2A2SA 2F51A 4FIWA 1X0RA 2NVLA 3US3A 17GSA 4JEDA 1TRVA 2F8FA 2CQ9A 2IL3A 3TB2A 1PKZA 1DE2A 3HDCA 1X9MB 2TRXA 3GIXA 2F3MA 2L5LA 4TR3A 4GF0A 3UL3A 1KEBA 2H72A 1WIKA 5A4UA 3KXOA 1G7OA 5DALB 1XBSA 1Z7PA 4AF2A 2LKUA 4MZCA 3A3TA 4OCFA 3CYNA 2IMKA 5IMFA 4TKYA 5ECKB 4MLYA 3IHQA 2A4VA 5ID2A 3ZIJA 2WZ9A 2VAFA 3GL5A 2C0GA 3GKMA 2B5XA 1K3OA 1MDKA 2MMOA 2J9UB 1NHYA 5DDLA 2HSYA 1GSFA 1GNEA 1TI1A 1ML6A 2EIQA 4NPBA 2NPBA 1I5GA 1O73A 2ES7A 3TJJA 2K6VA 3GTUB 4BL7A 2ON7A 1R7HA 3UBKA 2H0HA 4PQ1A 1UA5A 4EXJA 5J9BA 1YJ6A 3GX0A 5ELAA 3ED3A 1LU4A 2GQKA 2MYGA 2YN1A 3F8UA 3VPQA 1NSWA 1JZRA 5ENUA 1RK4A 1U6TA 1V57A 2K18A 1QUWA 1S3DA 1OYJA 1TTZA 4JU5A 4TR1B 4JE1A 3I6AA 4ZB6A 4NAXA 2V6KA 3HYPA 4ML1A 1TU8A 3CBUA 2IMEA 1TKDB 5DQYA 1SK1A 2C80A 1Y25A 1GUHA 1O7UA 1OE7A 1GSQA 3UOMA 3D4MA 3ZITA 4HQZA 4IVFA 5LD0A 3VK9A 2YV9A 1R26A 4DVCA 4BWSA 3CMIA 3JCML 1AW9A 1G6WA 3ZVJA 2OKAA 5ID2B 4IGJA 2V32A 3NOFA 1SK0A 3MSZA 3G9BA 2AHEA 1WOUA 4WR4A 4BPYA 5COHA 2L59A 1OVNA 3DRNA 1TDIA 3FK8A 3APOA 5IPGA 4OO5A 4XHMA 2PGTA 5CNWA 4JRRA 1V2AA 2WDUA 2GT6A 5B6NA 4FO5A 4IW9A 2ZUPA 4V2NA 2H66A 2HI7A 3L4NA 2C8UA 2LQOA 4PNFA 4KSMA 3P7XA 2OJLA 1GWCA 1AQWA 3FRCA 5J9CA 1A0FA 1FVKA 3TOUA 3IAS2 1FO5A 3O6TA 1AQXA 4I2TA 1XVWA 2M46A 3F4TA 5D9TA 3MAKA 2M72A 2AJQB 5IM9A 4I5QA 1WWJA 3UBLA 1ZGNA 2VL9A 2O7KA 2QGVA 2C0EA 1YKAA 4YAPA 1PGTA 1JZOA 3QFBC 1MD3A 4ECIA 4MF7A 1YEPA 1PSQA 9GSSA 5J4UA 4RQRA 1K0AA 4KAEA 3NZNA 1XW9A 2JADA 2N5AA 2H1DA 1Z3EA 4ULXA 5HFKA 4BA7A 3Q74A 2FWEA 4K0NA 3IV4A 3IBHA 3LEFA 1K0CA 1NM3A 1F3AA 1A2JA 1SJ6A 1N8JA 1A8YA 4V2LA 1THOA 22GSA 2GSTA 4LLRA 2MBTA 1TI3A 3NIVA 2PWJA 5KEJA 2CA8A 2WJUA 5ECLB 3GH6A 3QD9A 4YQUA 1XWAA 1FHEA 4GCIA 1WRYA 3LYPA 2LRNA 1M0UA 1GULA 2CZ2A 3C1RA 2LUSA 4YQMA 1ERWA 4ZXGA 3TGZA 4TXOA 2B7JA 5IIZA 2H1AA 3CSIA 1VF2A 4OD7A 4OFMA 4OFNA 1BG5A 1EEJA 5D9XA 3HJOA 3HVSA 3GNJA 1A0RP 5LCZA 2FWFA 1VGLA 3I43A 5FHIA 2HLSA 3KMOA 3QAVA 1K0NA 3KP9A 3TRQA 4GTUA 4IQAA 1X5EA 3GL3A 3DMLA 1QQ2A 1FVJA 1BAYA 3BCKA 3GH9A 3BBYA 1ZCPA 5JCWA 2R2JA 3PINA 3IOSA 5DVBA 5INYA 2H8LA 2ON5A 2I81A 3LG6A 7GSSA 1M2AA 1M9AA 1ILOA 4ZB8A 3TJBA 3F63A 3HZ4A 2V6OA 1XVQA 2H0IA 1PX7A 1M2BA 2I4AA 2MMAA 1O81A 4X1UA 2GSQA 3E0UA 4L5LA 4CW9A 3QMXA 2HXKA 2AV4A 2H6YA 3VPTA 3SWLA 2GTUA 3HA9A 2Z9SA 3F4SA 1XOAA 4ZBAA 2FNOA 3V1WA 2PBJA 1EV4A 2H30A 2PERA 1BX9A 1ST9A 3RDWA 2P0GA 2PPTA 2LEGA 4O5RA 4TN8A 4ILFA 2H76A 4EF0A 1Q4JA 2YANA 1O85A 2VCVA 3A2VA 4IQ1A 4Q5NA 3TKSE 3VLNA 2IWTA 4IELA 4AJ8A 5D9VA 3D21A 4LL4B 4GXZA 2JSZA 1U3AA 2FLSA 1X5CA 3EVIA 1HQOA 1PQNA 5FWGA 1GTIA 4ECBA 3DWVA 4WBJA 4IBPA 4ZILA 5IMDA 3I69A 1S3CA 4ZL7A 4NV5A 4KSOA 3ZREA 3ZIVA 2GSSA 2DSAA 4N10A 5EPFA 3P2AA 3QDNA 1YKCA 2KP2A 3RPNA 2YZUA 1K0OA 4HUAA 3RAZA 2LV3A 3H79A 4JR4A 1B48A 1MTCA 3DKSA 1OC3A 5A4VA 1U3IA 1SKSB 2HFDA 5CRGA 1FB0A 2DIZA 3ZZXA 5IMAA 4N11A 2H70A 5HQPA 1T00A 4HJ2A 4KH7A 1N2AA 2C3NA 4IN0A 1XOBA 3KTBA 4OO4A 4I6XA 3J7Yk 5CRDA 1GSSA 3FR6A 3IPZA 5G30A 4G10A 4GRFA 5A5KA 1CQHA 2YCDA 1TRSA 5ECRB 2K8SA 2KLXA 2XHFA 2VLUA 4GSTA 4KGIA 3EMXA 2VLVA 1SU9A 3TKPA 1T8EB 2WS2A 4E8EA 4MABA 2NTOA 4BVYA 4MJBA 3FZ4A 2R4VA 3Q19A 4JBBA 2GVPA 1HNBA 1LJRA 2O89A 5AN1A 1J08A 3E3EA 4DSSA 1RQMA 5DJLA 1M9BA 5JCGA 4GSNA 1FG4A 3DEXA 1FOVA 3CRUA 2NBSA 1GSUA 1ZL9A 5CO3A 2YPMA 2YWIA 4LA1A 2L4CA 1E2YA 2IMFA 4L5OA 3C7MA 4TR1A 2TRCP 1GNWA 4Q5RA 4NHWA 4MPFA 2GZPA 2CZ3A 2K9FA 4AJ7A 2C3TA 2GDRA 4GQFA 3WGXA 4IP1A 2FUG2 1T7PB 3Q6OA 4F9ZA 4PGTA 4N30A 1TRUA 3FZAA 3I9V2 4HQSA 5KN3A 4HU7A 2DMLA 2H74A 3FZ9A 3UEMA 2B1LA 3M9JA 5EVOA 4WF4A 1J0FA 1TK8B 1Y6EA 4MP4A 3ME8A 3MDKA 2H1BA 2OBIA 2PMTA 1FW1A 2GLRA 2WRTA 4MH2A 1EWXA 4DSSB 3GUSA 2ZCTA 3EU3A 3GFKA 2IN3A 4NXIA 2V2GA 1XZOA 4LMVA 3M1GA 1MDJA 3Q18A 4DSRA 3HKRA 3L9UA 4KCEA 4MJAA 2DJ2A 2NDOA 5G5EA 1SL1B 1TRWA 2XBIA 4K7NA 1PD21 3PH9A 3GA4A 5CP1A 6GSTA 2D2ZA 4OCEA 3UVHA 1VF3A 3O3TA 5IOXA 4MPGA 4ACSA 2EIOA 1C72A 2LJAA 4J57E 1Z7RA 5HR0A 3IRAA 1XWCA 1SKWB 3G7JA 4TOPA 3PR8A 1TJDA 1O8WA 1K0MA 2H73A 2GGTA 4PUAA 2DMMA 3PGTA 3TCOA 3GRXA 3DYRA 2OE3A 3IAM2 4ZB9A 4AJ6A 1ZYEA 3EINA 5IO2A 3C73A 3WD6A 3ZYWA 3D6IA 3ISOA 5DCHA 4MMMA 2VCWA 2L57A 3LSZA 3EU4A 3KM6A 3ZMLA 5D8IA 4KDYA 3UIWA 2VM2A 2FHEA 1A23A 1DBYA 1B8XA 4L0UA 1YY7A 2FD3A 2VD0A 3UJ1A 6GSYA 4ECCA 4KB3A 2E0QA 1T3BA 2RM6A 2G2QA 3BJ5A 1YEXA 5F8BA 4EDYA 1GSYA 1EOGA 4Q5FA 2YOIA 1AXDA 2OACA 2E2MA 1XWKA 4POLA 4KW6A 4HDEA 1SK2A 1GL8A 1B4PA 2PVOC 3F6FA 5KN0A 1PA3A 5KN1A 2KOKA 1NHOA 1KNGA 2N5FA 5DCGA 3HHVA 1QFNA 4BVXA 4ZIJA 2R3XA 3LGCA 2R37A 3IXRA 3ZLPA 2M80A 3H93A 4WETA 3W6GA 4WBRD 1ZZYA 2L5OA 3ZTLA 3IDVA 4K2DA 1HYUA 3L9VA 1GSDA 2MMZA 3HJPA 3VI7A 1EGOA 4FYCA 1WPIA 1W89A 4K1FA 2WB9A 4MDCA 3F3QA 1MD4A 5B6MA 3GKXA 1SL0B 4TW5A 4XS1A 2MZCA 3SBCA 3CSHA 3APQA 4EKZA 2HSHA 4P3YB 1YZXA 1ABAA 3GKKA 3VURA 3H8QA 1QMVA 5F0GA 3W8SA 3FW2A 3HZ8A 2LQQA 4PXOA 2IMIA 5CAXA 3EE2A 2B7KA 1XCCA 1DUGA 1XWGA 2DIYA 2J9HA 6GSWA 1K0BA 2JZRA 3TJFA 3M0FA 2L6CA 1PN9A 1F6MC 2X99A 2TIRA 1VF1A 2JSYA 1B4QA 1WJKA 4DEJA 1OKDA 4KCAA 5HR3A 4KX4A 1GSEA 1WE0A 5D73A 4OWYA 4HU9A 3DIEA 14GSA 2GSRA 4Q5QA 4PQIA 5F07A 1JLWA 2HT9A 4XRAA 3GURA 5CYYA 2GZZA 5H5QA 3QAGA 4HEA2 2DJ0A 5HR1A 3HCZA 3WGEA 4EUYA 2KHPA 4MZBA 1BJXA 1EP8A 4ML6A 2FWHA 4N0ZA 5IMCA 4LMWA 1JZDA 3M9KA 1PRXA 3M8NA 4TVEA 1EEMA 2F9SA 8GSSA 2XPEA 1RW1A 2RUFA 4F0BA 2H0GA 1A8LA 1GUKA 1AUCA 19GSA 4N0VA 2BTOT 1EGRA 2AYTA 1X9WB 1SKRB 4G9HA 5ECMB 1Q98A 1FB6A 2DC5A 4O7HA 3K8NA 4YQVA 5LNKe 3F0IA 1UVZA 2DLXA 5HR2A 1SJIA 2J23A 4KUNA 4X43A 4ZL9A 1M7TA 2C6BA 4O92A 1HNCA 1GTUA 1ZOFA 3QOUA 2GS3A 3IR4A 2H75A 2P5QA 18GSA 1KBNA 1LBKA 2XPDA 1K3YA 3B08B 1XW6A 4KDUA 4H86A 1BEDA 4O32A 3B0AB 1XXUA 16GSA 1I9DA 3WYWA 2BJXA 3GKNA 3HD5A 4IHUA 3A5WA 3DD3A 3VWXA 4Z7XA 3D5JA 2H6ZA 1U87A 3IK7A 3BOAA 4QQ7A 5EY6A 4K0GA 2HZEA 2LNSA 2L6DA 2FA4A 3HY2A 1XPVA 2H19A 2MMNA 3EYTA 3L9SA 4F82A 1AAZA 3N9JA 4X0XA 1A2MA 1GTBA 3LORA 4MJCA 1BYEA 1GTAA 4FYBA 2I3YA 2B1KA 2VL3A 1AQVA 2FGXA 1OC8A 4PURA 4I2UA 1V98A 3FR3A 4D73B 5ECQB 1TP9A 4JZQA 1F2EA 4TXVA 3RHCA 5J41A 4WF5A 2ALBA 2YWMA 3HVXA 1TU7A 4XTSA 1EOHA 5G5FA 3D22A 3KJYA 3TKQA 4WR5A 3GSTA 3C71A 4F03A 2EC4A 5KN2A 3S9FA 1ERVA 4IKHA 2HE3A 3EMPA 3TJKA 1S3AA 3EURA 5DJMA 2GT5A 1XWBA 13GSA 2VL2A 2HNLA 4G2EA 3LJRA 2DBCA 4KA0A 3IK9A 2X8CA 4WKWA 5JCUA 5FT3A 5GZZB 2CV4A 3DVWA 1VRSD 11GSA 3VWVA 4MCUA 4MK3A 3KGKA 2OA7A 4QL9A 3EC3A 2HZEB 2VCQA 3TJGA 1THXA 2LSTA 3OR5A 2GQMA 5DBQA 2IIYA 4ECJA 3W8JA 4EO3A 3ERFA 3GHAA 3APSA 4TRXA 5ELGA 4CDOA 1IYHA 5IOWA 1YDKA 1YQ1A 3QR6A 3QPMA 2K8VA 4L8EA 3G7IA 2C3QA 4OMVA 2N5BA 3KCMA 1M99A 2AB6A 2BMXA 4XCSA 3P8WA 6GSXA 3LXZA 4V2MA 3GN3A 2HYXA 4GLTA 4PUFC 1SD8A 2LRCA 3F4RA 3TRXA 3H4KA 3RPPA 1URMA 1DSBA 5CRHA 5DAKA 4IP6A 1G6YA 3IE3A 4PQHA 1GH2A 2FY6A 1Z5YE 1PKWA 1OE8A 2I9HA 3LYKA 2HRNA 1TXXA 4KNDA 1F3BA 5E4WA 1GLPA 4NHZA 2VLTA 1TK5B 1H4OA 1G0TA 3LWAA 5AGYA 4EDZA 4ID0A 3D4TA 5HFIA 1T1VA 2RIIA 5D96A 3KZQA 4K8MA 5B7CA 3CXGA 2HRFA 3RHBA 2B6MA 5IMZA 12GSA 3TKRA 2H6XA 5J5NA 3KEBA 3QAWA 4E8HA 4PNGA 1ERTA 3A2XA 2H71A 4FYUA 2X8GA 1NW2A 2L4QA 3O76A 4F2IA 4V1Ap 2DJKA 4HZ4A 3BD2A 3MWHA 1MEKA 3FYGA 4PX1A 2VCTA 3UVTA 4POMA 2JU5A 2RUEA 5H5SA 5C00A 5IQYA 5ECHB 1J9BA 2B3SA 1X5DA 1GP1A 4MA9A 2V1MA 1F37A 1JZWA 2OBKA 4OFTA 3TKSA 1HD2A 3LXTA 3GX8A 5DAKB 1F9MA 2A2RA 2PN8A 1XFLA 2RLIA 4IJ3A 1B9XC 1O8XA 4K9ZA 3AY8A 2C4JA 1PX6A 4IS0A 5IPHA 2QC7A 2B5YA 4WEYA 1UC7A 4HJMA 2YP6A 2P5RA 1E6BA 1OC9A 1SYXA 2CX3A 3FKFA 1R5PA 2WFCA 20GSA 3HVVA 2XBQA 1B9YC 1Z9HA 2CVBA 3HXSA 3F3RA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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