4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
1YQ3A 2JBVA 3NK0X 1GETA 2B7RA 3DJGX 4J2WA 2YLTA 3B3RA 4K5SA 4JN9A 2OLOA 4LA1A 5EB5A 3G5SA 3GMCA 4YT0A 2VQBA 2WDRA 2YQUA 2DKIA 2PYXA 2C73A 3COXA 4H50A 4A9WA 1IUTA 2GMHA 2QA2A 1PXBA 3GDPA 3F8RA 2BA9A 1F3PA 5CQFA 4YKGA 1FECA 3ABVA 1O5WA 3QFAA 3DJDA 3ALLA 2HQMA 2XVFA 4JNQA 4RG4A 4K2XA 2Q7VA 1JRZA 1EL7A 2XLRA 4H4SA 5LV9A 1PJ7A 2BCGG 3ITJA 2IVEA 1H83A 3CTYA 4CNJA 2H88A 1XHCA 3ALMA 1GERA 2WU5A 4GDPA 3RP8A 1Y56B 4EMIA 3GWFA 3IF9A 3M12A 1NHRA 2ZZ0A 4YSYA 4U2LA 2JB3A 3DK9A 1GRGA 4B65A 4EM3A 3SM8A 1F8SA 3LXDA 1H6VA 2VVMA 2WEUA 4H2RA 1E1KA 1NENA 1ZMCA 2WS3A 3T37A 1ZMDA 3UP5A 3BI2A 5KOWA 2GVCA 2AQJA 1KSUA 3KVEA 4OVIA 1YY5A 4NTCA 4H4PA 1H7WA 4X4JA 2XFNA 2WP5A 2FJAA 1UKVG 4KPRA 3BHFA 4DNAA 4U8PA 4UDQA 2C75A 1O94A 4J57A 4U8IA 5BUKA 2ACZA 2C67A 3C4NA 1L9CA 1N1PA 1IJHA 1F6MA 5FMHA 2BCPA 1K0IA 3ISHA 4Z2TA 1KSSA 3DJJA 4H2NA 3UTEA 4U8NA 4KX6A 5HY5A 1S2QA 1M64A 1NHQA 2R9ZA 2XFQA 2GRTA 1BWCA 2V5ZA 2JAEA 2XLUA 2YVJA 3AE1A 4ZN0A 1COYA 2BK5A 2YWLA 4GF7A 4X9MA 4H2PA 2WPEA 1LTXR 3V76A 1PS9A 1JU2A 3AEDA 1PBDA 5U25A 4B68A 2NVKX 4I58A 3AE9A 4AP1A 2BK3A 1TDFA 4OPIA 1QO8A 2R4EA 4IVMB 2TMDA 4OPTA 2YLSA 1DOBA 4GCMA 1ZP0A 4GUVA 1DOEA 2JKCA 4NTEA 3UKAA 2GR2A 1CC6A 3L8KA 1Q9IA 3LB8A 5J7XA 5U63A 4C77A 4GRTA 3QVPA 3O0HA 3K7TA 1BGNA 4YTNA 2VVLG 3VRAA 4B64A 3QFBA 2BXSA 2JB2A 3AEGA 3FPZA 1KNPA 2V3BA 2ZZBA 4GR1A 5HYMA 4EMJA 3JSKA 3UKQA 4K22A 1NAAA 3AE2A 4TLZA 1DNCA 4YSXA 1D7LA 5BRTA 2YG4A 3UOVA 4A99A 1FOHA 4AP3A 2X8CA 3P1WA 4B66A 4YSHA 1KF6A 3AWIA 3D8XA 2Y6QA 3REDA 1D4CA 2VZ2A 5GSNA 1IUSA 2Z5XA 4EQRA 1GXFA 3EPTA 3P4SA 3AE8A 4C74A 3B6DA 1L0VA 1JRYA 2QAEA 2WDVA 3UTFA 2YLXA 4ADWA 1TDNA 2B9XA 5BVAA 4ZCDA 3ATQA 4U2TA 1FCDA 2XFUA 2QCUA 2B9WA 3FMWA 1E1NA 2YAUA 2WBAA 3AECA 4Z24A 3P9UA 1PBBA 3ICTA 3NHOX 4H2QA 4H4UA 3UOZA 4C3YA 2XLTA 4U8OA 3RP7A 1GREA 3GD4A 1GNDA 1EL9A 1VQWA 4FX9A 3SGLA 2WU2A 1Y0PA 4OPDA 3PVCA 5IQ4A 2XFOA 3VR8A 2RGOA 2NPXA 3KD9A 4PABA 3SFEA 2WOIA 4E0VA 2EQ8A 1E1MA 4OCGA 3AXBA 3NN0X 4FK1A 4UP3A 3ZYXA 2GR1A 3SQPA 2VQ7A 3CPJG 4WCTA 2BACA 4BK2A 4U8MA 1GPEA 1SEZA 3GYJA 3NGCX 1K0LA 3F8DA 2C76A 1CBOA 3OZ2A 1YQ4A 4HB9A 1S2YA 4A7AA 2XVIA 1H81A 4H7UA 2BABA 2XVJA 1EBDA 2ARDA 4EQSA 5KOXA 1IUXA 5EB4A 4CY8A 1NDAA 2TPRA 2FJEA 2YM2A 4TM3A 5GRTA 1H84A 4IV9A 1GEUA 3NLCA 2R0CA 1AOGA 4ZCCA 4H4RA 2GR0A 3QSEA 5JCIA 3AE7A 3V3OA 1CC4A 1LQUA 3VRBA 4J56A 4AT0A 2R45A 1NHSA 1EL8A 3CPIG 1GRFA 3Q9TA 2F5ZA 3CNTA 4N9XA 2JK6A 2ZZCA 4XXGA 3VQRA 4BJYA 2YR6A 2R4JA 3NKSA 4Z43A 4JNAA 2YM1A 3EF6A 3PS9A 3NTAA 5DBJA 2XVHA 4U8JA 3UKFA 2A8XA 3DJEA 3NK2X 1GRBA 5ER0A 3RHAA 4DSGA 1RP0A 3CPHG 4A6NB 3BNMA 4BJZA 5JCNA 5JCMA 3GD3A 4TM0A 2J3NA 3I6DA 2UZZA 1K0JA 5J60A 3BI5A 1S3EA 4CY6A 4USRA 2W0HA 2A89A 3EAOA 1BKWA 1GT8A 2VRMA 3AE6A 4PAAA 3NIXA 4M52A 1X31B 2XCGA 4U8LA 2BC0A 4JDRA 4Z2UA 1ZX9A 1NG3A 4FK1C 3IC9A 1CJ2A 1NPXA 2WOVA 5U1OA 2CFYA 4RG3A 2YR4A 4B67A 2CULA 2QA1A 4H4XA 1JNRA 2C64A 3P4PA 3QSMA 1DJQA 1REOA 5FS9A 5KVHA 3LJPA 2PHHA 1L9EA 1XDIA 3D1CA 1N4WA 3L1RA 2H89A 3NYEA 4EQXA 2IVDA 1LPFA 1RYIA 2OLNA 5KXJA 5HXIA 3K7MX 3UCLA 1P2HA 4Z26A 2BC1A 1XPQA 3AD9B 1JNZA 4BURA 2VOUA 2YG7A 4NTDA 1W4XA 2B9YA 2GV8A 2XDOA 1E39A 2CVJA 1VG9A 1PXCA 2WETA 3DGZA 1YKJA 3S61A 2GAGB 4Y4MA 4XWRA 3IHMA 3CNSA 4BK3A 4Y4LA 4BV6A 3NT6A 1GRAA 2FJDA 4U8KA 1D7YA 4C3XA 3BHKA 3ATRA 1MOKA 3GSIA 2DKHA 1NHPA 4Y4NA 2X8HA 4J36A 3CNJA 1OJTA 2WOWA 3Q6JA 4X9NA 2I0ZA 3AEFA 3UTHA 3LZXA 1TYPA 1VG0A 1S3BA 4CCQA 1Y56A 3H8LA 4EMWA 3KA7A 1D5TA 1RSGA 4H4WA 1IUUA 4C5OA 3UP4A 4ICYA 3FBSA 4U2SA 1TDOA 2YVFA 5L46A 2WHDA 3UKHA 5FS8A 5TR3A 3BI4A 3NN6X 2C3DA 4JY2A 3SFDA 4H4YA 1BGJA 5M10A 1PN0A 4YKFA 4D03A 1ZY8A 5KRQA 4EIQA 5KWFA 3AEAA 3AD8B 2WP9A 3II4A 3VRDB 1GSNA 1MO9A 3K30A 2X3NA 1D4EA 1H7XA 4TLXA 3KKJA 5M0ZA 3RP6A 1E6EA 4YXDA 2O9ZA 3DGHA 3CNDA 1MXTA 3NH3X 3UKPA 1ZDLA 3GDNA 1N4VA 2WPCA 1ELIA 2BS3A 2X99A 5C3JA 3AE3A 2YVGA 1OJ9A 3AYLA 2BK4A 5JCLA 1F8RA 1DOCA 3CGBA 1KNRA 2EQ7A 1TDEA 2OALA 2YG6A 3AD7B 1GALA 1PHHA 1ZK7A 1H86A 1PXAA 2OAMA 4A5LA 2A87A 2Q0LA 2X50A 3HZLA 2YR5A 2YG3A 1JOAA 3UOXA 2RABA 4GDEA 2XYOA 4NZHA 4DSHA 4B1BA 3DK4A 1B5QA 1ONFA 1NEKA 1KFYA 2RGHA 4MJWA 2R0PA 2APGA 2GQFA 2AAQA 5C2TA 2C70A 5FS6A 4D04A 1GRTA 1DXLA 3KLJA 4H4VA 2BYBA 2ZBWA 3UOYA 4CBQA 4UDPA 3FG2P 4BK1A 4CNKA 3NTDA 4OPLA 4B63A 3FIMB 5CKUA 5EOWA 4TM4A 3URHA 3I3LA 4FDCB 2V3AA 3AE4A 1IUWA 3R9UA 2FJBA 1CJCA 2V6OA 1DJNA 2R0GA 2JB1A 3C4AA 2GF3A 4WX1A 4XWZA 2FBWA 1LQTA 2Z5YA 4JQ9A 5FS7A 1TDKA 3M0OA 1PDHA 4K8DA 2XLPA 1CC2A 4CRTA 2BXRA 4NEWA 1PJ5A 1M6IA 1BZLA 2E4GA 4JY3A 4EQWA 2C72A 3KU9A 4A79A 3CN8A 2C65A 1P2EA 3WE0A 4YTMA 1CHUA 3ICSA 4UDRA 3AEBA 3H4KA 3IWAA 2GB0A 2WDQA 2XFPA 2GH5A 3GRTA 3E1TA 4K7ZA 3G5RA 1PBEA 1Q1WA 3VR9A 2VRLA 4B69A 4IA5A 5EBKA 5HHFA 2WPFA 3AYIA 4Z44A 3NRNA 2Q0KA 3LADA 3NK1X 4O5UA 3UKLA 1IUVA 1PJ6A 3ZDNA 4USQA 2IIDA 1L9DA 1VRQB 4H4TA 3C96A 1FEBA 3CGDA 3LZWA 4H4QA 4RSLA 3DA1A 3AEEA 4Z2RA 1LJ1A 4AOXA 3EANA 1GESA 2BS4A 1ZOYA 2EQ9A 4OPCA 4YWOA 3ALJA 1OJDA 3NNEA 1OJCA 3AYJA 1B37A 3NG7X 1CJ3A 1H82A 4HA6A 2GAHB 4LIIA 3QVRA 1QJDA 4APNA 2Q6UA 3ICRA 4J34A 1GV4A 1JRXA 4EIPA 1EL5A 1XANA 3CGEA 3S5WA 2XVEA 3ADAB 5IQ1A 2B76A 2GEWA 5JCKA 2E5VA 4I59A 1PBFA 3F8PA 3UTGA 4AT2A 1DODA 2WQYA 4LU6A 3P4RA 3KPFA 1LVLA 1K4QA 1V59A 4P9SA 4Z25A 1GOSA 4NEVA 4YSZA 1CL0A 2GQWA 2AR8A 4EM4A 1O95A 2RGJA 3CIRA 5KVIA 3LOVA 2GR3A 1F8WA 3DMEA 1LV0A 4TM1A 1B4VA 3NYCA 1NG4A 3GWDA 2V61A 4A65A 3CNPA 3RNMA 1E7PA 2CDUA 2C7GA 4DGKA 1VDCA 1ZKQA 2YG5A 5BULA 1ZOVA 4AOSA 3AB1A 2C3CA 3UKKA 4O5QA 1KDGA 3DH9A 2E1MA 3QJ4A 1D4DA 1FL2A 2B7SA 2WP6A 3P4QA 3PO7A 2R46A 1CJ4A 1N4UA 2YLRA 1FEAA 1TRBA 3GYIA 2BS2A 4CCRA 3NYFA 1YQZA 4YTPA 3IHGA 5IPYA 4A6NA 4J33A 3OC4A 3V3NA 3G5QA 2OA1A 3H8IA 3CGCA 1GTHA 1E1LA 3AE5A 1OJAA 2EQ6A 3QSSA 3M13A 3GRSA 4H4ZA 4IA6A 2VVLA 1JEHA 2YLWA 1B8SA 3GMBA 2V60A 1GTEA 2WESA 4OPUA 3BNUA 1BF3A 2GMJA 1TYTA 2C66A 2YLZA 1PBCA 4J31A 2Y6RA 1Q1RA 4REKA 1GRHA 1Z6LA 4K5RA 2XLSA 4OPGA 3DK8A 4IVOB 1HYUA 1CF3A 1QLBA 2X8GA 4ECHA 3K7QX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VWWA 4HU7A 5HFKA 3NK0X 2WFCA 1GETA 2YLTA 3D4TA 4LA1A 4HU9A 1YKAA 4RUVA 1TU8A 1A23A 2L5LA 2B7KA 2YQUA 4H50A 4GAVA 1ZYEA 3F8RA 3ZIJA 3BCKA 4FYBA 2XBIA 4K2XA 1PJ7A 3C71A 1X9SB 3ITJA 2IVEA 3H93A 2H88A 2KOKA 4IQAA 3ALMA 2WU5A 4EMIA 1MDKA 3U6VA 4YSYA 4AF2A 1TW9A 1GRGA 2LRCA 4B65A 4AGSA 3KH7A 3T37A 1ZMCA 2WS3A 4JU5A 3UIWA 2YP6A 4N0ZA 2DMLA 2AQJA 4XS1A 1Q4JA 3SZWA 3FW2A 3MWHA 1KTEA 4H4PA 2IIYA 4X4JA 2WP5A 1AUCA 3L9SA 1X9MB 4PUAA 4EDYA 2V2GA 3G7IA 2K8SA 4ZBAA 4U8PA 4UDQA 5KN2A 1JZWA 3TKPA 1H4OA 3GSTA 5CRDA 5FMHA 2BCPA 3ISHA 3DJJA 1K0NA 1NSWA 2H70A 3VPTA 4XRAA 3UTEA 5HY5A 2XFQA 2TRXA 20GSA 4GWRA 5GAND 2GRTA 2JAEA 4DVCA 2C80A 2V5ZA 1COYA 2XLUA 3TB2A 2WPEA 1LTXR 4B68A 1JU2A 4MK3A 4G0IA 22GSA 4I58A 3AE9A 4AP1A 2BK3A 4OPIA 1F9MA 1O6JA 4NTEA 1HD2A 2GR2A 3LB8A 1ERTA 4ECJA 1SKRB 2GZYA 1GTAA 4YTNA 2VVLG 3LG6A 3JCML 5KMRA 4L0WA 3Q74A 1PX6A 3QFBA 4KA0A 1M3IA 1KNPA 4EMJA 3UKQA 1C72A 3AE2A 1DNCA 1D7LA 1DUGA 4WR5A 1FOHA 4AP3A 3P1WA 1KF6A 2IN3A 2IMIA 1CQGA 3IK9A 3DVXA 4EQRA 1GXFA 4J57E 3FR3A 1TP9A 1TDNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3VWW A;  4HU7 A;  5HFK A;  3NK0 X;  2WFC A;  1GET A;  2YLT A;  3D4T A;  4LA1 A;  4HU9 A;  1YKA A;  4RUV A;  1TU8 A;  1A23 A;  2L5L A;  2B7K A;  2YQU A;  4H50 A;  4GAV A;  1ZYE A;  3F8R A;  3ZIJ A;  3BCK A;  4FYB A;  2XBI A;  4K2X A;  1PJ7 A;  3C71 A;  1X9S B;  3ITJ A;  2IVE A;  3H93 A;  2H88 A;  2KOK A;  4IQA A;  3ALM A;  2WU5 A;  4EMI A;  1MDK A;  3U6V A;  4YSY A;  4AF2 A;  1TW9 A;  1GRG A;  2LRC A;  4B65 A;  4AGS A;  3KH7 A;  3T37 A;  1ZMC A;  2WS3 A;  4JU5 A;  3UIW A;  2YP6 A;  4N0Z A;  2DML A;  2AQJ A;  4XS1 A;  1Q4J A;  3SZW A;  3FW2 A;  3MWH A;  1KTE A;  4H4P A;  2IIY A;  4X4J A;  2WP5 A;  1AUC A;  3L9S A;  1X9M B;  4PUA A;  4EDY A;  2V2G A;  3G7I A;  2K8S A;  4ZBA A;  4U8P A;  4UDQ A;  5KN2 A;  1JZW A;  3TKP A;  1H4O A;  3GST A;  5CRD A;  5FMH A;  2BCP A;  3ISH A;  3DJJ A;  1K0N A;  1NSW A;  2H70 A;  3VPT A;  4XRA A;  3UTE A;  5HY5 A;  2XFQ A;  2TRX A;  20GS A;  4GWR A;  5GAN D;  2GRT A;  2JAE A;  4DVC A;  2C80 A;  2V5Z A;  1COY A;  2XLU A;  3TB2 A;  2WPE A;  1LTX R;  4B68 A;  1JU2 A; 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