4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
b'AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
4BJYA 1TDNA 4TM0A 3GSIA 3AYIA 2QA1A 4XWRA 3AE4A 2BCGG 4J34A 4U8PA 2AR8A 2R45A 1GXFA 3Q9TA 4APNA 2AQJA 5KVIA 4KX6A 3AD8B 3M12A 3ZYXA 4K8DA 1PJ6A 4H4UA 2IIDA 4OPIA 3VR8A 4JN9A 4U8MA 2B7RA 4U2TA 1H7XA 2XLRA 1IUSA 1GT8A 1CL0A 2Y6RA 3UCLA 2PHHA 4H4TA 4K22A 1GREA 3G5RA 4K2XA 4H2RA 2WPCA 3BNUA 1ZDLA 2CVJA 2YVJA 3NG7X 4YTPA 5U63A 1FECA 3P9UA 3VRDB 4Z2RA 4D04A 1EL9A 3UOZA 5CQFA 4H4RA 2J3NA 1S2QA 3CGDA 3NH3X 3IWAA 4AT2A 3K30A 3FPZA 2DKHA 1H86A 3ISHA 4OPTA 3CGCA 1GOSA 2YLXA 3UOVA 1BF3A 5HXIA 4PABA 3UTFA 4EIQA 4RG4A 2X8CA 4BK2A 5ER0A 2XFNA 4FX9A 3DJJA 3M0OA 3GDNA 1PN0A 5GRTA 3F8RA 2VVMA 5U1OA 3ALJA 5GSNA 3SFEA 1YQ3A 1NG4A 3ADAB 3C4NA 2JK6A 1JU2A 3EANA 2APGA 3DJGX 1DNCA 4X9MA 1LTXR 1QLBA 3DK8A 2YR5A 1NPXA 1GETA 1ZOVA 1PBFA 2FJDA 5C3JA 2VZ2A 3P4RA 2FJAA 1Q1RA 2Z5XA 1GRAA 1H7WA 2GRTA 1VG0A 1E1NA 1GTHA 1NHPA 2WESA 4Y4MA 3AE9A 3V76A 1PXCA 3RHAA 2BC1A 2V3BA 1VG9A 2I0ZA 2Y6QA 3GYJA 3AE8A 4U2SA 1W4XA 1Z6LA 5L46A 1KNPA 1RSGA 2A89A 1YQZA 2BS4A 3UP5A 3KKJA 4IVMB 3BI4A 1EL7A 4J57A 4ZCDA 1CC2A 1D4CA 1H81A 3S61A 1Y0PA 4J2WA 4TM4A 5KOXA 2H89A 2QCUA 3GWFA 3AD7B 3QSMA 4H4WA 3NIXA 1O94A 4H7UA 4EM4A 4H4YA 3UOXA 1DJQA 2HQMA 2XYOA 4RG3A 3VRAA 4OPDA 4GRTA 4CBQA 1CF3A 2WOIA 2F5ZA 1L9CA 4REKA 4LIIA 2XDOA 1B5QA 1Q9IA 4JNAA 3NK0X 1BZLA 1PHHA 2XFUA 3VRBA 3RP6A 3C96A 3OC4A 2Q0KA 3GRSA 4UDPA 3IF9A 5FS9A 2R0GA 2XVJA 2GEWA 3UTHA 4A5LA 4X4JA 4TLXA 1XDIA 1N1PA 2WS3A 2BK3A 1F8SA 2B76A 1L0VA 2GAHB 3AECA 2R4EA 4GUVA 3DMEA 3KU9A 1REOA 3CIRA 3NN0X 1LVLA 4YXDA 5IQ1A 2OLOA 1O95A 4EM3A 5IQ4A 2VVLA 5JCNA 4OPGA 2GB0A 3F8DA 3AEBA 3GD3A 4C3XA 2BABA 3PO7A 4ADWA 2YWLA 3CGBA 3ICTA 4NEWA 5JCKA 3VR9A 1PXBA 1BGNA 1E39A 2WOWA 1PDHA 2XVHA 2JKCA 1XPQA 1Y56A 2QA2A 2BA9A 3EPTA 2YG4A 2ZZ0A 3L8KA 4H4XA 1QO8A 2H88A 4EQXA 3CNPA 4UDQA 1FL2A 2BACA 2C64A 3I6DA 2E4GA 4EMIA 3T37A 3LJPA 2WHDA 5C2TA 4YKGA 4U8KA 3AE2A 2RGOA 4K5SA 3UP4A 5BVAA 5EB5A 3GMCA 3NGCX 3GWDA 3ABVA 3OZ2A 1OJTA 1FEAA 1YY5A 2TMDA 4IV9A 4TLZA 3UKQA 4I58A 4C77A 3HZLA 5HYMA 3NK2X 4DGKA 2PYXA 2A8XA 3CN8A 3KD9A 4H4ZA 1LQTA 4C74A 2C72A 4J33A 1S2YA 2EQ6A 4H2PA 3E1TA 3JSKA 4EQRA 1F8RA 1H83A 1OJ9A 1NHSA 3LADA 4IA5A 2GH5A 1V59A 2WP9A 2XLUA 3KPFA 4NEVA 1EBDA 5LV9A 1IUXA 2ZZBA 3L1RA 1GSNA 4U8LA 5CKUA 4C5OA 2RGJA 2EQ7A 2YR6A 2C75A 2ZBWA 2X8HA 4DSGA 4A6NA 3NT6A 3IC9A 1E7PA 2YLSA 5KRQA 2VQBA 4CRTA 2C65A 3NRNA 4CNKA 4JQ9A 1OJCA 3O0HA 4BURA 1CC6A 1CJCA 2JB3A 3AYJA 2UZZA 4CY8A 1ONFA 1GV4A 4U8IA 3ICRA 1KSSA 2DKIA 4B64A 4A65A 4AP3A 1M64A 1P2HA 5BUKA 1L9EA 1F8WA 2XLPA 3GMBA 5KXJA 5IPYA 5JCLA 3AE5A 3FG2P 1DOEA 2X50A 2B9WA 4FK1C 4U2LA 1TYTA 1ZMCA 4WCTA 3DH9A 1B4VA 1N4UA 4H50A 4OPCA 1K4QA 1EL5A 3CTYA 4GCMA 4OPUA 4B67A 2YLZA 3IHMA 3URHA 4BV6A 2C67A 1PBBA 2WP5A 3D1CA 1E1MA 1JRYA 2WOVA 2B7SA 1AOGA 2WQYA 3REDA 1GRBA 4EMJA 1NENA 3LB8A 4B68A 3UKLA 2IVEA 2GAGB 3SFDA 3RP7A 5DBJA 2OAMA 4U8JA 1X31B 1P2EA 4TM1A 3ALMA 3AEGA 1KNRA 1YQ4A 2V5ZA 2TPRA 1CC4A 3CGEA 3P1WA 4H4PA 5EOWA 4DSHA 1M6IA 2BS2A 1H84A 2V3AA 1OJDA 2GQWA 3AE1A 1EL8A 3CPHG 4GR1A 3QVPA 1H6VA 1GRTA 1PBEA 1GNDA 2FJBA 1ZY8A 4K5RA 2C73A 2WBAA 1PBCA 1E6EA 2B9XA 4H4QA 4Z2TA 2GR3A 1K0LA 3H8LA 3AD9B 1E1LA 4XWZA 3ICSA 1TDEA 1LV0A 2BK4A 2VQ7A 4CCQA 4A99A 1QJDA 1HYUA 3D8XA 4K7ZA 3G5SA 4NTDA 4YWOA 1BWCA 3CPJG 2YLWA 4ECHA 2VOUA 3DK9A 2E5VA 3GRTA 4X9NA 1K0JA 4H4SA 4B66A 4H4VA 4J36A 1MOKA 2ZZCA 2YAUA 1OJAA 2Z5YA 1GRFA 4CCRA 1MO9A 3BHKA 4YT0A 5KVHA 4OCGA 5J60A 3FBSA 1FEBA 1GEUA 4EQWA 2WDVA 4HB9A 2C66A 1GTEA 3VQRA 4XXGA 3KA7A 3QJ4A 4FDCB 2YG6A 4GF7A 4H2QA 2RABA 1KDGA 3GD4A 1IJHA 1O5WA 4A7AA 4HA6A 3BHFA 3Q6JA 4A9WA 3FMWA 2AAQA 4ICYA 3NTAA 3BI5A 3RP8A 1N4WA 2BXRA 3H4KA 1TRBA 4OVIA 3QVRA 1TDOA 3UKHA 1D7YA 4GDPA 3SQPA 1CJ2A 5EBKA 3LZWA 2YVGA 2WETA 3QFBA 2BS3A 3PS9A 3LXDA 1D4DA 4IVOB 1RP0A 1JOAA 1ZMDA 3UOYA 4JDRA 3AE3A 2IVDA 1Q1WA 3NYFA 2GR2A 1LQUA 2YVFA 2R46A 1PS9A 2WEUA 3B3RA 2BC0A 2XFOA 3AEEA 4YSZA 1GRHA 4AOXA 1DJNA 4AP1A 4AOSA 3DJEA 4BJZA 3P4QA 1D4EA 1ZKQA 4J56A 1JRZA 2YG7A 3G5QA 4B65A 2YR4A 5EB4A 5FS7A 4JY3A 4YSXA 2GR1A 3II4A 2R0PA 2WU5A 4Z2UA 3IHGA 1ZX9A 2ACZA 3CNJA 4IA6A 4MJWA 2GV8A 2GR0A 1NDAA 1PJ5A 3CNSA 2XVEA 3AB1A 3H8IA 4PAAA 4C3YA 2C70A 2CFYA 1H82A 5FS6A 3BNMA 1S3EA 4I59A 2Q7VA 3K7MX 4U8OA 2R4JA 1K0IA 3NTDA 5TR3A 3UTGA 1TYPA 3RNMA 2Q6UA 2GMJA 3DGHA 3AEDA 3AEAA 4B63A 3ITJA 1LPFA 4YTNA 3KVEA 4JY2A 4UP3A 3GDPA 4JNQA 3EF6A 1IUTA 2XFQA 2FJEA 1B8SA 2X99A 2BCPA 1UKVG 3DK4A 4YKFA 3V3OA 2OALA 2JBVA 1ZK7A 4LU6A 1VQWA 3QSEA 2XLTA 1CBOA 1NAAA 3NYEA 3AE6A 4O5UA 2FBWA 1D5TA 5FMHA 2WPFA 4Y4LA 3K7TA 2WU2A 4D03A 3LOVA 3F8PA 3EAOA 3COXA 4Y4NA 1LJ1A 1CJ3A 2R9ZA 2X3NA 3P4PA 1Y56B 3I3LA 3UTEA 2YLTA 4ZCCA 1MXTA 2WDRA 1F6MA 1DOCA 2WPEA 4J31A 2JB2A 5KWFA 2EQ8A 2XVIA 4EQSA 3B6DA 2BYBA 5HY5A 2NPXA 1DODA 2GMHA 1COYA 3GYIA 4N9XA 4NTEA 2C3DA 2JB1A 1PJ7A 1BKWA 3V3NA 3NK1X 4EMWA 2YG5A 2O9ZA 1JNRA 4CY6A 3UKAA 4Z43A 2EQ9A 1DXLA 1D7LA 2B9YA 2C7GA 4CNJA 3NHOX 4B1BA 3DJDA 3AEFA 4E0VA 4M52A 3S5WA 5JCIA 3AYLA 1NHQA 2Q0LA 3WE0A 2XVFA 4Z24A 2GVCA 4KPRA 4BK1A 3FIMB 4LA1A 5FS8A 1ELIA 2V60A 3ALLA 3C4AA 1JRXA 3AXBA 3QSSA 2WDQA 1KF6A 3K7QX 1JNZA 2YM1A 2GF3A 4NZHA 4RSLA 3NLCA 1FCDA 3NYCA 3QFAA 3CPIG 4OPLA 5BRTA 4TM3A 4Z26A 1FOHA 2RGHA 3M13A 3PVCA 4UDRA 5J7XA 3KLJA 4A6NB 1N4VA 4U8NA 3UKPA 4USQA 4AT0A 3ATQA 4B69A 1KFYA 3CNTA 5HHFA 2A87A 3BI2A 4USRA 5U25A 4A79A 1NG3A 1XANA 1PBDA 2VVLG 3ATRA 2OA1A 3DA1A 3AE7A 4YSYA 2JAEA 4P9SA 3SGLA 1F3PA 1SEZA 3LZXA 4ZN0A 2YLRA 1XHCA 2CDUA 2X8GA 5M10A 2R0CA 2YM2A 4NTCA 1DOBA 1TDFA 1RYIA 1VRQB 1GALA 5BULA 1PXAA 2XCGA 3NNEA 4FK1A 5M0ZA 2VRLA 4YSHA 4Z44A 4YTMA 4WX1A 2CULA 1L9DA 1NHRA 3NKSA 2BK5A 4BK3A 2E1MA 3ZDNA 2XFPA 2NVKX 4Z25A 2YG3A 1S3BA 1VDCA 1E1KA 2BXSA 2V6OA 1TDKA 2QAEA 2C3CA 2VRMA 2C76A 3DGZA 1IUWA 2GQFA 3SM8A 5JCMA 1ZOYA 3CNDA 1GRGA 1IUVA 1CHUA 2YQUA 3R9UA 3UKKA 1CJ4A 1YKJA 1IUUA 1GERA 1KSUA 3AWIA 2V61A 1JEHA 2ARDA 2W0HA 3NN6X 4GDEA 4O5QA 2OLNA 4EIPA 5KOWA 1GPEA 1NEKA 1BGJA 3P4SA 2XLSA 3UKFA 1B37A 4DNAA 4H2NA 1GESA 1ZP0A 2WP6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JZSA 4U8PA 5CYYA 1T4ZA 5KVIA 2B5XA 1R4WA 4KX6A 2RIIA 4ECCA 2IIDA 4IP1A 4JN9A 4H2RA 2RLIA 1ZDLA 3CTGA 4KSOA 2YVJA 5U63A 3FZ9A 4Z2RA 3UOZA 3G9BA 5CQFA 4H4RA 3LSZA 4WR4A 1S2QA 3K30A 2IMDA 1XOBA 1YEPA 4PQIA 3HKRA 2RUFA 4ECBA 1QUWA 2KOKA 4ULXA 1BF3A 4PABA 3UTFA 5DBQA 14GSA 4FX9A 3M0OA 2YWMA 3VFIA 4G73A 3GDNA 2PWJA 2AB6A 2LQQA 1NG4A 1Z9HA 2JK6A 3DJGX 1YKAA 3TJJA 3DK8A 3A5WA 5FHIA 1SJ6A 2V2GA 2C3NA 1U3AA 13GSA 4JEDA 3VI7A 1Q1RA 4TW5A 3HYPA 1VG0A 4Y4MA 4N0ZA 3QDNA 2LRTA 2V3BA 2K8VA 4WBJA 3AE8A 2DIZA 2J9HA 4EL1A 5L46A 2O85A 3UP5A 3KKJA 2H0GA 3FW2A 4USSA 3S61A 1Y0PA 4TM4A 3IOSA 2DMLA 5KOXA 2H89A 2QCUA 3SY4A 4KE3A 4G9HA 4ACSA 2HQMA 2G0FA 4RI6A 4G6HA 1B5QA 1Q9IA 2RUEA 3ZZXA 4FO5A 4JNAA 2R3XA 1BZLA 1TU8A 2GZZA 2MMZA 1S3CA 4HOJA 3W8JA 3C96A 2CVKA 5ECNB 3ERWA 5FS9A 2XVJA 2AJQB 2J23A 5B8BA 2DIYA 4OD7A 2V41A 1XDIA 1N1PA 3ZIJA 1V58A 1F8SA 1L0VA 3T2ZA 4MF6A 1AW9A 4XHMA 3KU9A 3PH9A 1USBA 3D21A 5IQ1A 1PGTA 4K0GA 3ZMKA 4G19A 4OPGA 4K7IA 4POLA 5D8IA 3ZL5A 1G6YA 3CGBA 1XVQA 5JCKA 2C0FA 2KLXA 1BGNA 1PDHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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