4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
2Y6RA 4H2QA 2GMJA 2VVLA 3G5SA 2YG3A 2O9ZA 2YVJA 4U8JA 1K0JA 4CY8A 1O95A 4OCGA 4WX1A 3LOVA 4YTMA 3GD4A 2CVJA 1TDOA 1JEHA 3AE2A 3E1TA 4DNAA 3C4AA 2TPRA 4B66A 5EB5A 3KU9A 5LV9A 3FPZA 4D03A 3K30A 1E7PA 2UZZA 4USQA 5FS7A 2B9XA 1N1PA 4RG3A 4BK1A 3NTDA 2HQMA 3KLJA 3UTFA 1H7XA 4H2PA 4U8MA 2B7RA 4AOSA 2C73A 1D4EA 3ATRA 1S2QA 4H4UA 4NEVA 4AT2A 2BACA 1BGJA 4ADWA 3AD8B 2WOIA 2R9ZA 5DBJA 2CDUA 3K7TA 2JBVA 2AAQA 2YR4A 3P4RA 3UOYA 3M12A 5FS8A 1KDGA 3D1CA 3PS9A 4K2XA 4K5RA 2AR8A 3Q6JA 1RSGA 4TM1A 3VQRA 4BJYA 1F3PA 1GEUA 3ITJA 4K7ZA 4H4PA 5IQ1A 4U8PA 3OC4A 1EBDA 3P9UA 1CC4A 4U8NA 3QSMA 3BHFA 4Z24A 1GESA 2Q6UA 2ZZ0A 2BC0A 2V5ZA 3RHAA 1GRBA 2C7GA 1JU2A 1TYPA 1SEZA 1M6IA 1CHUA 3SFEA 1F8RA 2GRTA 3IHMA 2BA9A 1D7YA 2GV8A 2ZZCA 3QJ4A 3QSSA 4CNKA 4MJWA 2Z5XA 2V3AA 1KSUA 1IUXA 4B1BA 2XLRA 2Q0KA 3DK8A 4O5UA 5BUKA 3V76A 1GSNA 2V61A 4Z2TA 3H4KA 1PJ7A 5TR3A 1E1LA 4NTEA 4LU6A 4B64A 1D7LA 1ZDLA 1REOA 5M0ZA 3D8XA 1NHSA 1XDIA 3GDNA 2EQ8A 3BI4A 4XXGA 1YKJA 1GRTA 1LJ1A 1VQWA 3R9UA 2EQ6A 4H4ZA 3CPIG 2OLNA 2BS4A 1DODA 2GQWA 2GEWA 4OPUA 4GRTA 2R45A 4D04A 3AEEA 2FJEA 2V3BA 3NNEA 3UOZA 1NEKA 3REDA 3KPFA 1P2EA 3RP6A 5KOXA 5J60A 3IWAA 3AE7A 4H4XA 5U63A 3PO7A 4WCTA 3NHOX 2FJAA 3AWIA 1IUUA 3C4NA 2JB3A 2Z5YA 3C96A 3VR9A 4ZCDA 2I0ZA 4B65A 1Y0PA 3COXA 2GAHB 1ZX9A 2ACZA 2XVJA 1L9CA 4B63A 1DOBA 2R0CA 4A99A 4OPDA 3M13A 4APNA 3O0HA 1F6MA 3F8RA 4A5LA 3UKPA 1GOSA 1NAAA 3ALLA 2YLZA 4UDQA 3K7QX 5FMHA 3ICTA 4UP3A 4E0VA 4KX6A 2GB0A 1EL5A 1VRQB 4LA1A 1DJNA 5HXIA 1GTEA 2BXRA 1O5WA 3V3OA 1PBBA 3CNDA 1AOGA 1CC6A 4A9WA 1TDEA 4BV6A 3GD3A 3VRAA 5FS6A 2C65A 5GSNA 1GNDA 2C70A 3KKJA 4H4VA 4EQWA 3P4SA 4EM4A 2IIDA 4YT0A 1PXCA 1BKWA 1KNPA 2Q7VA 1BWCA 1XPQA 2C75A 2YLXA 4H4TA 1E6EA 1NG3A 3ADAB 3AEDA 4K22A 4RG4A 3I3LA 2BXSA 3RNMA 3FIMB 4HA6A 2YM1A 1NHRA 2GQFA 1BZLA 1ZP0A 5HY5A 1PXBA 2QA2A 1B8SA 1NENA 4H4WA 2XFPA 1PBCA 1ZKQA 5U25A 3DA1A 2BK5A 3ISHA 2ZZBA 5JCKA 2GF3A 3DMEA 4JY2A 3VRBA 1JRZA 4TLZA 4B68A 2BABA 3DGZA 4U8OA 1PDHA 1CC2A 4AP1A 1TDFA 4TM4A 2C72A 1PXAA 2Q0LA 3CIRA 4H2NA 3SFDA 1RYIA 3CGCA 1LQUA 2B9YA 3NRNA 1D4CA 1EL8A 2WEUA 3B3RA 3IHGA 3L1RA 1GV4A 3NK2X 1S2YA 5KXJA 2WPEA 5HHFA 3ALJA 4IV9A 4CBQA 4EQXA 2WPCA 4C3YA 3AEGA 4ECHA 4AP3A 2W0HA 3CNTA 1K0LA 2XYOA 3NGCX 2XCGA 2GR0A 1H83A 2YLWA 1PJ6A 1BGNA 1ONFA 4H4SA 3URHA 4U2SA 3VRDB 4FDCB 3AE9A 3CN8A 3CGBA 4DSGA 3P4PA 2WP9A 3BHKA 1LTXR 1VG9A 2WQYA 4A65A 4CCRA 2PYXA 1L9DA 3DH9A 3DK9A 1PHHA 3NIXA 1PN0A 2ZBWA 4GDEA 4YKFA 2WP6A 3UCLA 2DKHA 1YQ4A 1Q1RA 3NKSA 3BI2A 5M10A 5U1OA 3UKKA 5JCLA 2GVCA 4CNJA 4A79A 4DGKA 2NPXA 1ELIA 5ER0A 1D4DA 1VDCA 1TRBA 4Z2RA 4EIQA 2WDQA 2XLUA 2YVFA 2GR3A 3UTEA 5JCIA 1Q9IA 1E1KA 3P1WA 4USRA 2E4GA 1B37A 3IC9A 1E1MA 1Y56A 3WE0A 1KSSA 2DKIA 3ABVA 4GUVA 2VQBA 2C64A 3RP8A 3M0OA 4H50A 2OAMA 3AE1A 2YG5A 2F5ZA 2Y6QA 3OZ2A 5C2TA 4AT0A 4X9MA 4Y4NA 2VRLA 2A87A 4YSZA 2A89A 1OJAA 1ZMDA 4ZCCA 1Y56B 2WESA 1YY5A 1OJ9A 4ICYA 4FX9A 3AEFA 3CGEA 4OPCA 1H81A 2XFNA 1H86A 3ATQA 2RGHA 3BNMA 3F8PA 4H4RA 5FS9A 1YQZA 3NN6X 4K8DA 4XWZA 1XANA 3PVCA 2C76A 4JDRA 1GETA 2QCUA 1FL2A 3AE5A 4M52A 2H89A 2X8HA 2VQ7A 1MXTA 2ARDA 3B6DA 3LZWA 1MO9A 4FK1C 4NZHA 4CRTA 1GREA 1CL0A 2BK4A 2WDRA 2XLTA 2IVEA 2BC1A 1ZY8A 2TMDA 3QVPA 2XVHA 4I59A 3EPTA 1K4QA 1NHPA 4P9SA 2WP5A 2YAUA 3GYIA 5EBKA 2R46A 1XHCA 3P4QA 1L0VA 4J36A 1QJDA 1JNZA 3AYIA 2GR1A 1YQ3A 1PBFA 1V59A 4NTDA 5JCMA 3HZLA 1NG4A 3NT6A 1F8SA 4IA6A 5L46A 3ICRA 4U8LA 3GRSA 4U8KA 2YWLA 3AD7B 3NTAA 3H8IA 3NYFA 4YSYA 3QSEA 4YKGA 1NHQA 1JOAA 3QVRA 4H2RA 4FK1A 3AE4A 4JY3A 2YG4A 5J7XA 3UKQA 1B5QA 3DJDA 4HB9A 3F8DA 3DJGX 2YR5A 1W4XA 5KWFA 1IUWA 3ALMA 1GRGA 3DJJA 3AECA 1F8WA 3KD9A 4N9XA 3NG7X 3NK1X 4C77A 1COYA 4Z2UA 4TM3A 2VRMA 2CFYA 2WU2A 2YVGA 2YR6A 4OPTA 2R4EA 2XFUA 4OPLA 4Z26A 3AE3A 4AOXA 3GYJA 3UOXA 4O5QA 3ICSA 4H4YA 1CF3A 4YTPA 5HYMA 1JNRA 1E1NA 5IQ4A 4J57A 2WOWA 2YLSA 5BULA 3GSIA 3LJPA 1DOCA 3KVEA 4LIIA 5EB4A 3QFAA 1H82A 3AEBA 3NLCA 2BS3A 5GRTA 2RGOA 3CNJA 3CNSA 1S3BA 2WS3A 4A7AA 3FG2P 2A8XA 2PHHA 3GWDA 2VVLG 2WETA 4X9NA 4IA5A 4REKA 3S61A 4UDPA 1ZOYA 4EM3A 2GR2A 4TM0A 1GALA 1Z6LA 1VG0A 1KF6A 3ZDNA 1GERA 2H88A 1E39A 1JRYA 1EL7A 2WHDA 3GMBA 4PAAA 5KVHA 1N4WA 3LB8A 4C5OA 1P2HA 2VVMA 1IJHA 4NEWA 3UKAA 1LV0A 2C3CA 3CPJG 4OVIA 1S3EA 2OLOA 2J3NA 1CBOA 3AE8A 3JSKA 4OPIA 4JNQA 2GMHA 3FBSA 1GTHA 4DSHA 3UOVA 2XFQA 3Q9TA 5KVIA 1CJCA 2XLSA 2AQJA 2V60A 2WPFA 1L9EA 1PS9A 1OJDA 3K7MX 4Z44A 1TDKA 2GH5A 1GPEA 2R4JA 2E5VA 4A6NA 1O94A 1QO8A 4BK2A 4J31A 2XVFA 2RABA 4H7UA 5CKUA 4NTCA 3SGLA 4EMWA 5IPYA 5C3JA 2FJDA 4C74A 3AEAA 1GXFA 1KFYA 2B9WA 2XVIA 2OA1A 4UDRA 4A6NB 2JKCA 1B4VA 3UKLA 1ZMCA 3IF9A 4EMJA 1GRAA 1H7WA 3II4A 1RP0A 3RP7A 4YXDA 2JB2A 2XVEA 4JNAA 1N4VA 4X4JA 1ZK7A 2WDVA 4GF7A 1X31B 4JN9A 4PABA 3UP5A 4KPRA 4BURA 2R0GA 1TDNA 3NYCA 2YG6A 3LZXA 4J2WA 2FBWA 1BF3A 4U8IA 2WBAA 4ZN0A 2X3NA 1DOEA 1FECA 3UTGA 4EMIA 4TLXA 1PBDA 3NK0X 2BS2A 1OJCA 3G5QA 4IVOB 1GRHA 4IVMB 1HYUA 1PJ5A 1TYTA 2BYBA 2C66A 3L8KA 2YLTA 3NN0X 4OPGA 3UP4A 3AYJA 4B69A 4EQRA 4JQ9A 5EOWA 1FCDA 1H6VA 4CCQA 2XFOA 3UTHA 2YLRA 3GWFA 3BI5A 3UKFA 1FEAA 3KA7A 2E1MA 2GAGB 4H4QA 2EQ9A 3NYEA 3QFBA 5JCNA 4U2TA 5BRTA 4J34A 4YWOA 1H84A 4EIPA 4GDPA 2X8CA 4GR1A 2QA1A 4I58A 1MOKA 1IUVA 2X99A 3BNUA 2VOUA 3LXDA 2IVDA 3AB1A 1QLBA 3CPHG 3H8LA 2JK6A 4BK3A 2WU5A 3AE6A 2BCPA 3T37A 1ZOVA 4Y4MA 2C3DA 1Q1WA 1CJ3A 4U2LA 2RGJA 3DJEA 1FEBA 1LVLA 2XLPA 2JB1A 3AYLA 1UKVG 3S5WA 2WOVA 3CNPA 2YG7A 3GMCA 5KOWA 2NVKX 3EAOA 4YSHA 1K0IA 4CY6A 2XDOA 2X50A 3CGDA 3UKHA 3EANA 1D5TA 3ZYXA 4C3XA 3LADA 1N4UA 2BK3A 4Z25A 2B76A 5CQFA 3FMWA 4BJZA 3AXBA 5BVAA 4Z43A 1PBEA 1CJ4A 5KRQA 3SQPA 2OALA 2JAEA 1DJQA 1GT8A 1NPXA 1DXLA 1EL9A 2FJBA 2EQ7A 1LQTA 2BCGG 2YQUA 4GCMA 1NDAA 1JRXA 3GRTA 1DNCA 1KNRA 4J56A 3NH3X 2VZ2A 2APGA 2QAEA 2X8GA 1IUTA 3AD9B 3VR8A 2B7SA 3EF6A 4RSLA 1IUSA 3CTYA 4XWRA 3DGHA 4B67A 3DK4A 2V6OA 4EQSA 1OJTA 4Y4LA 3V3NA 4K5SA 3GDPA 1M64A 3SM8A 4J33A 4YSXA 2C67A 4YTNA 1CJ2A 1LPFA 3I6DA 3G5RA 2R0PA 1GRFA 2YM2A 1FOHA 2CULA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y6RA 4H2QA 3G5SA 1M3IA 1M2AA 5BMUA 3CQFA 3A2WA 3KCMA 4DNAA 2K8VA 1FHEA 4B66A 3HKRA 2CZ2A 4QL9A 1Q4JA 4KA0A 2B3SA 1SU9A 2DJ0A 4MPGA 4H2PA 2B7RA 2LEGA 2C73A 4AT2A 2HRFA 2CX3A 2HFDA 2J9HA 2JBVA 2AAQA 2YR4A 3M12A 3D1CA 2AR8A 1A8LA 2VL2C 4TM1A 1JLWA 1GWCA 3D4MA 4K7ZA 5IQ1A 3PGTA 4U8PA 4OFMA 4U8NA 3QSMA 2Q6UA 5IQYA 2BC0A 4Q5RA 1YKCA 5E4WA 2C7GA 3QAVA 3TRQA 5COHA 2CAQA 1F8RA 2OA7A 5CRWA 2HSMA 1D7YA 5GAPD 2OE1A 4CNKA 3WGDA 1DBYA 1Z6NA 2V3AA 1X5CA 1KSUA 4HOJA 4NV5A 4ML1A 3FR9A 3PR8A 1BAYA 1GSNA 3P2AA 4Z2TA 5IMDA 5TR3A 4B64A 1SK0A 1THXA 1REOA 4XXGA 2IMDA 2EQ8A 2C3TA 1V57A 1VQWA 1TK0B 5ECMB 2EQ6A 4H4ZA 2OLNA 3MNGA 1E2YA 2LSTA 1DODA 4HSCX 5HFIA 1JHBA 3RP6A 5KOXA 3IWAA 2PVOC 1VF2A 3PO7A 4WCTA 2FJAA 3AWIA 1IUUA 3C4NA 2Z5YA 2I0ZA 1ZX9A 2GDRA 3LJRA 4H86A 1DOBA 4OPDA 4APNA 3IBHA 2JL4A 5FMHA 3CXGA 4GSNA 4E0VA 4KX6A 4ZL8A 4LA1A 2DMMA 3M1GA 1O5WA 3V3OA 3HYPA 2FY6A 5GZZB 2C4JA 1EV9A 4L8EA 4EL1A 1XW5A 3WYWA 1SKWB 2IMKA 3KKJA 1M3JA 2CX4A 3IAS2 3KGKA 1KNPA 2Q7VA 1K3LA 3HVNA 3D4TA 1NG3A 4IS0A 3ADAB 3AEDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2Y6R A;  4H2Q A;  3G5S A;  1M2A A;  5BMU A;  3A2W A;  3KCM A;  4DNA A;  2K8V A;  1FHE A;  4B66 A;  3HKR A;  2CZ2 A;  4QL9 A;  1Q4J A;  4KA0 A;  2B3S A;  1SU9 A;  2DJ0 A;  4MPG A;  4H2P A;  2B7R A;  2LEG A;  2C73 A;  4AT2 A;  2HRF A;  2CX3 A;  2HFD A;  2J9H A;  2JBV A;  2AAQ A;  2YR4 A;  3M12 A;  3D1C A;  2AR8 A;  1A8L A;  2VL2 C;  4TM1 A;  1JLW A;  1GWC A;  3D4M A;  4K7Z A;  5IQ1 A;  3PGT A;  4U8P A;  4OFM A;  4U8N A;  3QSM A;  2Q6U A;  5IQY A;  2BC0 A;  4Q5R A;  1YKC A;  5E4W A;  2C7G A;  3QAV A;  3TRQ A;  5COH A;  2CAQ A;  1F8R A;  2OA7 A;  5CRW A;  2HSM A;  1D7Y A;  5GAP D;  2OE1 A;  4CNK A;  3WGD A;  1DBY A;  1Z6N A;  2V3A A;  1X5C A;  1KSU A;  4HOJ A;  4NV5 A;  4ML1 A;  3FR9 A;  3PR8 A;  1BAY A;  1GSN A;  3P2A A;  4Z2T A;  5IMD A;  5TR3 A;  4B64 A;  1SK0 A;  1THX A;  1REO A;  4XXG A;  2IMD A;  2EQ8 A;  2C3T A;  1V57 A;  1VQW A;  1TK0 B;  5ECM B;  2EQ6 A;  4H4Z A;  2OLN A;  3MNG A;  1E2Y A;  2LST A;  1DOD A;  5HFI A;  1JHB A;  3RP6 A;  5KOX A;  3IWA A;  2PVO C;  1VF2 A;  3PO7 A;  4WCT A; 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