4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
4YSZA 3NNEA 2GR2A 3ICTA 1JNRA 2X99A 3AYLA 2XCGA 2C73A 4Y4MA 2BC0A 1DJNA 2JB2A 2WPFA 3C4NA 1K4QA 2C7GA 3UP5A 2ZZCA 4C77A 2XVIA 1FEAA 3CPJG 2XVEA 3ALMA 4YTPA 4H4YA 2VRLA 1H83A 3LJPA 1TDFA 5J60A 2GF3A 4H2RA 2BS2A 2WP6A 4H4QA 1PJ7A 3RP7A 2YG3A 1NHSA 2C3CA 3EAOA 4EIQA 4M52A 3CN8A 3AXBA 1PXAA 5GSNA 3RNMA 2YLTA 3G5RA 1FCDA 4Z2UA 1DOCA 2X8GA 3LB8A 2C66A 1CF3A 4XWRA 3VRBA 4A79A 4JY3A 3CGCA 3RP6A 1K0LA 4K5SA 2XFNA 1S3BA 1GRBA 4IV9A 2Y6RA 3GRTA 2WHDA 3UTEA 5IQ4A 1YY5A 1YKJA 3AEFA 2EQ7A 2A89A 2GEWA 2WPEA 2C67A 1NG4A 1E6EA 1VRQB 2YLZA 3M12A 4NTEA 5IPYA 1PBCA 1DNCA 5FS7A 3D8XA 4NEWA 3UKPA 1VG0A 3AWIA 4IVMB 1P2EA 3ZYXA 4AT0A 2NPXA 3DK9A 2CULA 3AYJA 2XLSA 3GSIA 2YAUA 4J57A 4ZCDA 2WEUA 2W0HA 3GWDA 1NDAA 5HYMA 3CGEA 2BCPA 3DJEA 3E1TA 3FPZA 3IC9A 4C3XA 2XFPA 1GRHA 1KSSA 1RYIA 3NHOX 3UOYA 3UOVA 2A87A 2XLUA 3DMEA 3UTHA 4Z43A 3LZWA 1LQUA 3O0HA 2BK5A 1DXLA 2GQFA 2VOUA 2NVKX 4K2XA 1E1MA 2ZZBA 1L0VA 5KXJA 2PHHA 2X50A 3COXA 4C3YA 2FBWA 1TDEA 4LA1A 2E5VA 3CNDA 3REDA 1PJ6A 3QFBA 4FX9A 4A9WA 2BYBA 3RP8A 2YM2A 4JNAA 4NTCA 1TYPA 2BA9A 5JCMA 1VDCA 4B1BA 1ZOVA 3AEGA 3DGZA 2V3AA 2UZZA 4BV6A 3CNPA 2WESA 4FDCB 1PXCA 2YLXA 4KX6A 1GRTA 2V60A 1MO9A 1Y56A 2FJDA 3GYJA 4YKGA 1K0IA 2GMJA 4B69A 3V3NA 3UOZA 4NTDA 2J3NA 2XLPA 1PJ5A 1LQTA 4H4XA 4U2TA 4USRA 2RGOA 4OPDA 3K7TA 4CBQA 1B5QA 1Q1WA 4RSLA 1QO8A 3HZLA 1BF3A 3ZDNA 4PABA 3II4A 4NEVA 3P4PA 4X9MA 2VQBA 3Q6JA 1PDHA 3BHFA 4AP3A 3P4QA 3AE5A 2GVCA 4GDPA 2C3DA 3AYIA 1N1PA 4H4VA 4YTMA 4PAAA 4C5OA 1TDOA 4J2WA 2WOIA 4K22A 3UKHA 5KOXA 2DKIA 2Q0KA 4O5QA 4CNKA 4DNAA 2WDQA 5KRQA 5HXIA 1BKWA 3ATRA 1Z6LA 2X8HA 3AEDA 1GREA 3G5QA 2WQYA 3ALLA 1D4CA 2HQMA 3AEEA 3NYFA 2C70A 2H89A 3DJDA 4BK1A 3QVPA 1ZMDA 2I0ZA 3NYCA 2R4JA 3NYEA 3DA1A 1PBFA 3AE2A 2WBAA 4O5UA 1E1KA 2AQJA 1H86A 4A7AA 2XVHA 4U8PA 2JK6A 2WS3A 3CGBA 3LXDA 3M0OA 2YR4A 3NK0X 1YQ4A 3BNMA 4J56A 4BJYA 2YR6A 1GTEA 2CFYA 3CPHG 2XVJA 4IVOB 2ARDA 5BRTA 1E1NA 1CC4A 5FMHA 4OPUA 3L8KA 4DSHA 2XFOA 4TLZA 2IIDA 3NRNA 4HB9A 4XXGA 4H7UA 2R0GA 2APGA 1HYUA 1E1LA 2WOWA 2R4EA 4YSXA 5KOWA 1D4DA 5JCLA 4EQSA 2VVMA 4E0VA 1H84A 2V5ZA 3SGLA 1TDNA 1S2YA 3UKQA 3P1WA 2C75A 5GRTA 3VR8A 4AT2A 2CDUA 2PYXA 3GDPA 4Y4LA 4YKFA 5C2TA 5CQFA 4X9NA 1IUWA 2BS3A 4LIIA 2C65A 4TLXA 5CKUA 5C3JA 2WP5A 3FBSA 2GRTA 1GETA 3BNUA 3BI2A 4MJWA 1XANA 4TM4A 2GH5A 1OJTA 1IUSA 4OVIA 2WU2A 3RHAA 1S3EA 4N9XA 3CIRA 4APNA 3GMBA 1KF6A 3I6DA 4IA5A 3VRAA 1X31B 1ZY8A 2OALA 3DJGX 4IA6A 1D7YA 3AECA 4A6NB 4B68A 2GR3A 3QSEA 2YM1A 1GRAA 2XVFA 1GTHA 3UKKA 2BXSA 3EANA 1CBOA 3R9UA 3NKSA 1Y56B 4U2LA 4K7ZA 3EPTA 2TPRA 2ACZA 1O95A 3ITJA 4JQ9A 4B64A 2YVJA 1V59A 4OPLA 1GOSA 4GR1A 3L1RA 3S61A 4EQWA 4TM0A 1LPFA 1GRFA 1LV0A 1ZKQA 3H8LA 2GR1A 4AP1A 1IUTA 1F3PA 1JRXA 2GAHB 3CNJA 3F8RA 1NAAA 3NGCX 2YQUA 3SFDA 4B67A 4CRTA 3AD7B 1PXBA 2Z5XA 1F8SA 1F8WA 1JOAA 1DOBA 4CNJA 5JCIA 4TM1A 1GV4A 2V3BA 1XPQA 4WX1A 3JSKA 3K30A 1Q9IA 1H6VA 3AE1A 2DKHA 3GMCA 1RP0A 3H8IA 3QSMA 1K0JA 1KDGA 3UKAA 5L46A 4ECHA 4CCRA 4BURA 5FS8A 1IUXA 3NG7X 3I3LA 3AB1A 1JEHA 1REOA 3CPIG 4TM3A 4U8MA 4B63A 3SFEA 2O9ZA 5TR3A 2Q6UA 2YLWA 4H4SA 4EQRA 4FK1C 2GMHA 1NEKA 3CNSA 1Y0PA 3M13A 4UDPA 3NTDA 3C96A 5LV9A 1BGNA 2AAQA 4B65A 4ZN0A 3ADAB 5M10A 3K7MX 1BWCA 1NPXA 1ZDLA 4U8IA 4OPTA 1TRBA 1XDIA 3IHGA 3DK4A 5EBKA 2VQ7A 3UTFA 3BHKA 1W4XA 4DGKA 3NK2X 1NHRA 2Q0LA 3KVEA 3OC4A 1TDKA 4REKA 4BK3A 3IF9A 4D04A 1BGJA 3NN0X 1PS9A 1L9DA 4ZCCA 1VQWA 2RGJA 3AE6A 1EL8A 3Q9TA 5DBJA 5FS6A 4Z2TA 3CGDA 1FECA 4KPRA 4EM4A 2XYOA 4U2SA 2FJBA 4YWOA 3LOVA 4FK1A 2B7RA 4YT0A 1MOKA 4U8KA 1FL2A 2B7SA 4A99A 3ABVA 3PS9A 1EL5A 2QA2A 3BI4A 4H4ZA 4YSHA 2WU5A 4H4TA 4Z25A 1DODA 2YG6A 2R46A 2Q7VA 2E1MA 2YVFA 1GEUA 1CJ3A 2A8XA 3DK8A 3KKJA 2B9XA 4H2QA 1UKVG 5JCKA 4YSYA 4GUVA 4EQXA 4H2NA 2JAEA 3B6DA 1SEZA 1CC2A 4OPGA 3AE4A 3UOXA 2EQ8A 2QA1A 4XWZA 1OJCA 2GAGB 1PBEA 4U8LA 3VR9A 1H82A 2WPCA 3GRSA 2YG5A 1QJDA 1NG3A 2R9ZA 1O5WA 1IUUA 1GALA 3AD9B 3KPFA 3WE0A 4NZHA 4BJZA 2EQ9A 3UCLA 3IWAA 1JRYA 1N4VA 4B66A 2XLRA 3QVRA 5M0ZA 4YXDA 4Z26A 1GXFA 5FS9A 1EL9A 4WCTA 3UTGA 2TMDA 4C74A 1L9EA 4D03A 1EL7A 3DJJA 3V3OA 4AOXA 4K8DA 5BULA 4CY6A 3NH3X 3PO7A 1NHPA 1KNRA 4GRTA 1CJ2A 2BACA 2B9YA 2GB0A 4EMIA 1GERA 1KSUA 1E7PA 1FEBA 2IVEA 3V76A 2X3NA 1P2HA 1ZMCA 4U8OA 5EOWA 3NK1X 2WOVA 1CJ4A 1COYA 3QSSA 1H81A 3KLJA 5KVHA 2H88A 2VZ2A 4CCQA 1ZP0A 3H4KA 5HHFA 2RGHA 5U63A 4H50A 3QJ4A 5BVAA 4H4RA 3EF6A 4Y4NA 2BK4A 2Y6QA 3AE7A 5J7XA 1GNDA 3AEAA 3GDNA 4U8NA 1CL0A 4JY2A 3AE9A 1H7WA 3G5SA 3FMWA 1M6IA 2GR0A 1IJHA 2V61A 4UDRA 3PVCA 1JRZA 1D5TA 1ZK7A 2BCGG 1LJ1A 1AOGA 1N4UA 1F8RA 2E4GA 4EIPA 4J34A 1DJQA 3DH9A 1LTXR 1XHCA 3QFAA 3GD3A 2IVDA 1Q1RA 2JB3A 4GF7A 3OZ2A 3NT6A 3FG2P 4Z24A 1L9CA 3SQPA 2YG7A 3ISHA 4UP3A 5EB4A 3AE3A 2V6OA 2BXRA 3SM8A 3UKFA 3CNTA 4J31A 2BK3A 1ONFA 4YTNA 5KWFA 3P4SA 1B4VA 2F5ZA 3BI5A 4X4JA 2BABA 2JB1A 4RG4A 2XFQA 4H4UA 1TYTA 3ICRA 1NENA 4J36A 1ELIA 2FJAA 3LZXA 5EB5A 2B9WA 2YR5A 1NHQA 2QCUA 4K5RA 4AOSA 3DGHA 4BK2A 5JCNA 4HA6A 1E39A 3K7QX 3ALJA 2GV8A 1GSNA 2YLSA 3GD4A 1PBBA 2ZZ0A 2OA1A 4EMWA 1PN0A 1RSGA 1M64A 1ZOYA 2XLTA 2OLOA 1PHHA 3AE8A 4RG3A 1QLBA 1H7XA 1CHUA 3NLCA 3NTAA 4OPCA 2FJEA 5BUKA 4DSGA 4A5LA 1B8SA 4GDEA 2JKCA 1ZX9A 3KD9A 4EMJA 2Z5YA 2C72A 4I59A 4JNQA 4A6NA 1CJCA 1LVLA 2B76A 2WDRA 4ADWA 2C64A 4CY8A 4H4PA 5U1OA 1OJ9A 1GRGA 2EQ6A 1EBDA 1KFYA 2QAEA 5ER0A 1GPEA 4H4WA 2JBVA 4J33A 3F8PA 4Z44A 4GCMA 2RABA 4H2PA 3VQRA 4USQA 2WP9A 4OPIA 3S5WA 3P9UA 2GQWA 3AD8B 5IQ1A 5U25A 2YLRA 1B37A 3T37A 1MXTA 5HY5A 1YQZA 3IHMA 2AR8A 4A65A 3GYIA 1CC6A 3GWFA 1JU2A 1OJDA 2VVLG 2ZBWA 3C4AA 1PBDA 2VRMA 3ATQA 3NN6X 1FOHA 3NIXA 1DOEA 1IUVA 2BS4A 3AEBA 2YWLA 1S2QA 4LU6A 2R0PA 4ICYA 2YVGA 3F8DA 3B3RA 1BZLA 3LADA 4OCGA 5KVIA 3CTYA 4I58A 3UP4A 2X8CA 2XDOA 3VRDB 3URHA 1JNZA 4EM3A 2OLNA 1O94A 1YQ3A 1GESA 1D7LA 2WETA 2C76A 1OJAA 2YG4A 2WDVA 2XFUA 3KA7A 2R45A 1VG9A 3P4RA 1KNPA 3UKLA 4U8JA 2R0CA 1D4EA 2CVJA 1F6MA 4JDRA 2BC1A 4Z2RA 2OAMA 1N4WA 3ICSA 4UDQA 4P9SA 3D1CA 3FIMB 3KU9A 2VVLA 1GT8A 4JN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NNEA 2GR2A 3ICTA 1Z5YE 3U5RE 1R5AA 3LW9A 4XTSA 1H4OA 2JB2A 4Y4MA 4GRFA 1K0CA 1FEAA 5CYYA 2DIYA 5F06A 1DE2A 1A0FA 1J9BA 3APSA 2GF3A 2BS2A 5J41A 2IMEA 2H1GA 2CVBA 3EAOA 1M9AA 1TRVA 1PXAA 3AXBA 3G5RA 1FCDA 4Z2UA 2MMOA 1DOCA 3LB8A 3HJPA 3W8JA 4RQRA 4V2MA 3VRBA 2X64A 4N10A 3EYTA 2OE3A 4BPYA 3CGCA 2LEGA 4K5SA 3TKSC 4IV9A 4JBBA 3GRTA 4IBPA 3L9SA 2KUCA 3VLNA 2VCXA 5IQ4A 1YKJA 2MMNA 3DGQA 2EQ7A 2F51A 2HZEB 2WB9A 2IMFA 1WJKA 4WXTA 1E6EA 2D2ZA 4XHMA 2YLZA 3F9UA 1U6TA 1A24A 4LMVA 4Z7XA 4GQFA 3D22A 2DC5A 1FVJA 3TRQA 5D73A 3ZYXA 4AT0A 2A4HA 1XWBA 2H6YA 5AIVA 3DK9A 4EO3A 2EIQA 2LQQA 1NDAA 3CGEA 2BCPA 1G6YA 4KB3A 2XFPA 5IPGA 2GZPA 3UOYA 1AQXA 3RPPA 2A87A 1GH2A 3DMLA 3O0HA 2GQFA 4K2XA 1T8EB 1A2LA 1SJ6A 1K3LA 2RUEA 4KCEA 1YKAA 1GTUA 5J3RA 3CNDA 3NIVA 3H8QA 2GQKA 1EGOA 1F37A 3FR3A 4XS4A 1TRWA 5INYA 4KX6A 3T2ZA 4LL1B 1YKCA 5IO2A 2V60A 1MO9A 4O92A 1ZOFA 1OC9A 1GNEA 4NTDA 2J3NA 2JZTA 3IOSA 4KH7A 1EV4A 3K7TA 1Q1WA 4RSLA 1QO8A 3HZLA 2FCHA 2MMAA 2H1BA 4TXVA 5JCUA 4NEVA 2HRNA 3Q6JA 5ECLB 2B5EA 1XWKA 4KDYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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