4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
4D04A 4MJWA 4GR1A 4JDRA 3RNMA 3O0HA 4UDPA 2BS2A 2QA2A 1GRBA 5KVIA 1PBCA 2BK4A 5U1OA 1KSSA 3NK2X 4H2QA 4RSLA 1F8WA 2BK5A 3AYIA 4IVOB 2VQBA 4Z24A 2BC0A 1RSGA 2DKHA 2X8HA 1NHRA 3DGZA 4P9SA 1GRTA 3CPHG 4E0VA 2XVHA 2IVDA 1VDCA 1S3BA 2YLWA 3CPIG 4YTNA 2GMHA 2V60A 3AB1A 5J7XA 4O5UA 1CJ4A 2OALA 3H8IA 4K5RA 1IUTA 4Y4LA 5CQFA 1MXTA 1CBOA 4BK2A 5KVHA 2HQMA 2WS3A 3AE5A 3AD9B 4H2PA 2Q0LA 3GYIA 2XLPA 4Z2UA 1REOA 1COYA 4KPRA 3NK0X 3H8LA 4A6NB 4C74A 1PBDA 3QSEA 2C72A 2IIDA 3SQPA 2WESA 4HA6A 2VVLG 3LZWA 4ZCCA 4AP3A 2WOWA 4LIIA 3SFEA 2YQUA 4K22A 4OPGA 3NH3X 3NLCA 3KVEA 1XANA 1NENA 2ZZ0A 2OA1A 1E1LA 3CNDA 4BJZA 5C3JA 4B63A 1NEKA 2X3NA 2BK3A 4Z25A 2CVJA 2CDUA 2R45A 3P4SA 2E4GA 2C65A 4PAAA 4X4JA 1IUSA 3E1TA 3LZXA 2XLSA 1XDIA 3CNSA 2XFQA 4GUVA 4Z44A 2GR2A 4H4QA 3FG2P 1N1PA 1Z6LA 3VRBA 2GF3A 2TMDA 4BV6A 1AOGA 2WPFA 1ZMDA 3K7MX 4JY2A 1PJ7A 3UTFA 1M6IA 1QLBA 3UTGA 5EBKA 3G5SA 1CC4A 1YQ4A 3ISHA 2GVCA 4U8MA 4OPTA 4B69A 2YLTA 4H4VA 1GSNA 1BGNA 3P4RA 2QA1A 3WE0A 5DBJA 5FMHA 1JRYA 1QO8A 1K0IA 1E7PA 1TDKA 4CBQA 3IC9A 1GRAA 3B3RA 1KF6A 3LXDA 4H4RA 1FCDA 2I0ZA 1BKWA 1F3PA 2JB1A 5KWFA 2B9YA 2JK6A 1O95A 5FS6A 1P2HA 1H6VA 3AYLA 2GAHB 1NHQA 1ONFA 1TDFA 3IF9A 5U25A 3CNPA 1SEZA 4YXDA 1L9DA 1ZOYA 4BK1A 3GRTA 1VRQB 2YAUA 2IVEA 5KOXA 1D4EA 1E1MA 3ICSA 3RP8A 1Y56A 4Z26A 2C3CA 3GRSA 4REKA 1Y0PA 3KA7A 3QSSA 4USRA 1L9EA 2AQJA 3Q6JA 4J33A 2BYBA 1ZX9A 3C4NA 3P9UA 4EMWA 2Z5XA 3GWFA 3NNEA 2B7SA 1ZMCA 3K7QX 1MO9A 3GDNA 3M0OA 4NTDA 1RP0A 2JAEA 2AAQA 4RG3A 3GD3A 1IUWA 3DGHA 3UP5A 2X8GA 2EQ9A 2GR3A 2C66A 1GREA 4EIPA 4CNKA 2GRTA 3QFBA 3UOXA 4DSHA 4UDRA 2YR4A 1ZP0A 1H7XA 2PHHA 2YG6A 4B1BA 4PABA 1JRXA 5J60A 4A65A 5FS9A 3EF6A 3GDPA 2XCGA 3VRAA 2E1MA 2YM1A 1E1KA 2WDRA 5HYMA 3AE3A 4OPUA 2XVFA 2BC1A 3S61A 1H83A 4ECHA 4K8DA 3AEFA 1B37A 1F8RA 3KLJA 4YTMA 3AECA 4AOXA 3ATQA 2XFPA 2XFUA 2WP6A 3AEBA 1OJ9A 4UDQA 1O94A 3EPTA 3V76A 4NEWA 1Q9IA 4X9MA 5BUKA 3RP6A 3QJ4A 5HHFA 1GTEA 3ICTA 3GSIA 3UKAA 1E39A 2X8CA 4CCRA 2YWLA 1OJCA 1GERA 4TLZA 1H7WA 1YKJA 5HY5A 3SGLA 3QFAA 3DMEA 4JN9A 4BK3A 2WDQA 2AR8A 1GPEA 3DK8A 1IUXA 4LU6A 4C5OA 3G5QA 4XWRA 2TPRA 1K0LA 1LJ1A 2JB2A 1GESA 4APNA 1FEBA 1VG0A 4WX1A 4A7AA 4U8OA 2WDVA 2VVLA 3OC4A 4FK1A 1JNRA 3DA1A 1NHSA 1TDNA 4OPLA 3OZ2A 2YVJA 1Y56B 2XLRA 3COXA 2C7GA 4U8IA 1S2YA 4YSZA 2R4JA 1CC2A 3EAOA 1E1NA 2V61A 1NAAA 3NIXA 4TM4A 1GXFA 1VG9A 1CJ2A 4JQ9A 3UOYA 2XFOA 2YVFA 4EQRA 1PHHA 2R9ZA 3AEEA 1GRHA 2OLOA 3ADAB 4A5LA 2BS3A 5IQ1A 3ZDNA 1CC6A 3GMCA 2VQ7A 2A89A 1TYTA 4H7UA 1KDGA 2JB3A 1N4VA 1D5TA 4JNAA 3AEAA 2ZBWA 3DJDA 3P4QA 3ALMA 4OPIA 3G5RA 3GWDA 4YSXA 5ER0A 3NHOX 3LOVA 2XLTA 3NT6A 2APGA 1EL7A 4ADWA 5JCNA 3UTEA 1PXBA 1F6MA 1OJTA 4EIQA 3CGEA 4YSYA 2EQ8A 4D03A 2GR0A 4TM0A 1GT8A 1QJDA 1DXLA 2EQ7A 3V3OA 2BACA 4GRTA 1NG3A 1GTHA 1NPXA 3H4KA 2Q7VA 1KSUA 3GD4A 4ZCDA 3SM8A 4B67A 1H81A 2WPEA 4H2NA 1LQTA 1GEUA 1PBEA 3NGCX 4TM1A 1DJNA 1IJHA 2GV8A 5C2TA 3AEDA 2FJDA 4DNAA 1GNDA 2B9XA 3DK4A 3VR8A 2WU2A 3FPZA 4ICYA 3ATRA 3AWIA 1NDAA 3KD9A 2V6OA 2WP9A 4U8JA 3AE9A 5BVAA 5JCIA 1BF3A 3ICRA 3UKHA 2XVIA 1YQ3A 2Y6RA 4OPCA 2WQYA 4H4WA 2BABA 2JKCA 4U2TA 4U8PA 4H4YA 2YLRA 1CF3A 2FJEA 5FS8A 2ZZCA 3F8PA 3NG7X 2CULA 3M13A 2C70A 3IHGA 4XWZA 4EMIA 3BNMA 4AT0A 2A8XA 3UKKA 2BCGG 2W0HA 4YTPA 5TR3A 3NKSA 3PVCA 1PN0A 1TDEA 4H4XA 1JEHA 2WU5A 2C76A 1BWCA 4NZHA 2BXSA 4GCMA 1LPFA 4C77A 4Z43A 1E6EA 2VZ2A 3IHMA 1B8SA 3CGBA 3UKLA 2QCUA 3K7TA 4Z2TA 1S3EA 3GMBA 3QSMA 4NTCA 2YG4A 4U2SA 3UKPA 2X99A 3M12A 2CFYA 5GSNA 4A79A 2YLXA 3GYJA 4YT0A 2RGJA 3NRNA 1N4UA 1PBFA 4BURA 4DSGA 2WBAA 3HZLA 1FOHA 3AD8B 3CTYA 3VQRA 2YM2A 4RG4A 2C75A 4N9XA 2B7RA 3LB8A 2ACZA 2O9ZA 2XDOA 3BI2A 2XVEA 2VRMA 1JNZA 2J3NA 3D8XA 4B68A 5LV9A 3AE2A 4AOSA 1EL5A 1KFYA 2C3DA 1N4WA 4H2RA 4EMJA 1TYPA 2BA9A 2V3AA 2GEWA 2C64A 1YY5A 4J57A 1Q1WA 1MOKA 3CGDA 1FL2A 3I6DA 3URHA 1D4DA 3CIRA 2GMJA 4O5QA 1D7LA 1YQZA 5U63A 4K7ZA 5M0ZA 3RHAA 3L1RA 2UZZA 2WOIA 2FBWA 3AE6A 4YSHA 2ZZBA 5IPYA 4U8LA 1GRFA 3BHFA 3V3NA 2V5ZA 5KOWA 1H84A 1M64A 1ZK7A 1PJ6A 4TLXA 2YVGA 3UKQA 3UOZA 3PO7A 3UCLA 2B9WA 5JCMA 4H50A 4FK1C 2R0GA 4OCGA 1F8SA 4CY6A 2H88A 3BHKA 4XXGA 2E5VA 4EM4A 1K0JA 2RGOA 4A99A 2GQFA 2R46A 1OJDA 3AE7A 4YKFA 2NVKX 1XPQA 3LADA 2YLZA 1DOEA 3R9UA 4CNJA 4H4UA 5KXJA 5KRQA 3IWAA 3AD7B 3P1WA 4EQXA 5L46A 2PYXA 3NTAA 3FBSA 4BJYA 2EQ6A 4J36A 2WHDA 2YLSA 1FEAA 1TDOA 1PBBA 2B76A 2DKIA 1L0VA 2OLNA 4J31A 4Y4NA 4C3YA 2A87A 3F8DA 3T37A 4H4PA 4B65A 2H89A 2R4EA 4X9NA 3BNUA 2X50A 1JU2A 1KNRA 4Z2RA 1PXAA 2GB0A 3NYCA 2JBVA 2RGHA 4FX9A 3S5WA 1K4QA 2QAEA 1LQUA 2YG3A 2BXRA 1ELIA 2RABA 4KX6A 1JOAA 2XVJA 3CNTA 1EL8A 1FECA 3AE1A 3KKJA 4H4TA 3P4PA 5JCLA 4TM3A 1TRBA 1LVLA 4U8NA 4AT2A 3II4A 3K30A 4GDEA 4J56A 3QVPA 3F8RA 1ZY8A 3PS9A 1BGJA 3BI4A 3JSKA 1GRGA 1DOCA 1NG4A 2BCPA 2VVMA 2Z5YA 3NK1X 1H82A 4HB9A 4GDPA 3FMWA 2YR5A 2BS4A 4OVIA 5JCKA 2XYOA 3ALJA 1EBDA 3UKFA 3BI5A 1NHPA 3AEGA 5M10A 2OAMA 4NTEA 1OJAA 4FDCB 4EQSA 1CJ3A 4J34A 4J2WA 3CPJG 5FS7A 3VRDB 2WEUA 1ZDLA 5IQ4A 4USQA 4B64A 3LJPA 4ZN0A 4AP1A 1CJCA 1W4XA 2WP5A 2R0CA 3C96A 2ARDA 3I3LA 4I59A 4NEVA 1B4VA 1V59A 3ZYXA 1X31B 2FJAA 3REDA 1DNCA 5EB4A 3NYEA 2F5ZA 3SFDA 1B5QA 1DJQA 4U8KA 1O5WA 5GRTA 4U2LA 4A9WA 4I58A 4YWOA 4EM3A 3CN8A 3ABVA 1CL0A 4LA1A 4M52A 3DH9A 3FIMB 3B6DA 2C67A 3UTHA 2WETA 5EB5A 1L9CA 1CHUA 4IV9A 4YKGA 2FJBA 1RYIA 4IA6A 3VR9A 3DK9A 1D7YA 3UOVA 2YG5A 4A6NA 2VRLA 3Q9TA 4JNQA 1GV4A 1EL9A 2YG7A 1IUUA 3CGCA 1ZKQA 4CY8A 2GAGB 4K5SA 1S2QA 2GR1A 1BZLA 3L8KA 1VQWA 1KNPA 4WCTA 3DJJA 3KU9A 4Y4MA 1GETA 1P2EA 1Q1RA 2GQWA 3ITJA 1JRZA 3NN6X 2V3BA 4C3XA 4H4SA 5CKUA 2YR6A 1XHCA 2GH5A 3NN0X 1H86A 4UP3A 4GF7A 2NPXA 4IA5A 1DOBA 1GOSA 3AXBA 2Q0KA 3UP4A 1DODA 4OPDA 2WOVA 1GALA 2C73A 3NYFA 4IVMB 4EQWA 4DGKA 2Y6QA 1LTXR 1PXCA 4CRTA 4B66A 3AE8A 5EOWA 3C4AA 2XLUA 4K2XA 1IUVA 4H4ZA 1HYUA 1D4CA 1UKVG 3AE4A 3DJGX 2Q6UA 4CCQA 5BRTA 1PDHA 2VOUA 1ZOVA 3ALLA 3AYJA 1PJ5A 3RP7A 3QVRA 3CNJA 1LV0A 2WPCA 3DJEA 1PS9A 3EANA 3D1CA 3NTDA 2R0PA 5BULA 5HXIA 2XFNA 4JY3A 3KPFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T7PB 2WCIA 3RNMA 2DLXA 2DMMA 3L9UA 4GXZA 4IW9A 5D8IA 5U1OA 1SKRB 4USSA 1SK0A 2P0GA 4NV5A 5G2ZA 4Z24A 4GSSA 1XBSA 3IPZA 4E0VA 2B1LA 5KMSA 1VDCA 4KF9A 1S3BA 20GSA 3RAZA 1AUCA 2GT5A 3EU4A 4ID0A 4O5UA 3KMOA 2OALA 1WOUA 3P8WA 4Y4LA 4EF0A 4MCUA 1CBOA 1GULA 3HVSA 3AE5A 1JFUA 1TTZA 5KMRA 4EKZA 5J3RA 3H8LA 4XRAA 1IYHA 1XOBA 2A2SA 3LXTA 3SQPA 3L0HA 5DJLA 3LZWA 2HSMA 2DSAA 2WOWA 4G9HA 2H6YA 2YQUA 4K22A 5KMPA 3NH3X 3NLCA 4GAPA 1XANA 1WIKA 2OA1A 1E1LA 4BJZA 5C3JA 5G30A 1NEKA 2X3NA 4Z25A 2CVJA 2R45A 4PAAA 4X4JA 1Q4JA 1O7UA 3LYPA 5DQSA 3T2YA 1TU7A 4ZBAA 2XFQA 5KN2A 4Z44A 4Q5RA 1AQVA 2NVLA 1WPIA 2KOKA 2OJLA 5GAPD 3UVTA 3ZTLA 3ZL5A 4BV6A 4F2IA 2WPFA 2YZHA 2FLSA 4V1Ap 1PJ7A 4WKWA 1QLBA 4IBPA 1CC4A 2I9HA 1EOHA 2C0DA 3SZWA 3WE0A 2FWEA 3PINA 3APOA 1TDKA 3GL3A 2H1BA 5CRWA 5ECRB 4WR4A 1BKWA 2C8UA 3HZ8A 2FHEA 1P2HA 4BVYA 1NHQA 3TJFA 1ONFA 1TDFA 4I5QA 4TXVA 3CNPA 1SEZA 4IN0A 1JHBA 4Z7XA 1SJ6A 2J9HA 1VRQB 1ABAA 4WBRD 5KOXA 1D4EA 1Y56A 3CTGA 4QL9A 1SL1B 4PUFC 3KM6A 5C04A 4PQ1A 1Z6NA 4YQMA 2BYBA 3P9UA 1NSWA 2YWMA 1ZMCA 3LW9A 1MO9A 4IJIA 3M0OA 5AN1A 4ECIA 1M7TA 3CBUA 1IUWA 1GSYA 4OO5A 3D5JA 1GTUA 2M46A 5B7CA 4O92A 2C66A 4MMMA 1ZYNA 4EIPA 1VF4A 4CNKA 4GQCA 5HR0A 3UOXA 3WGDA 2HRFA 4O32A 2JL4A 2YV9A 2XCGA 2YP6A 2J23A 1JLVA 2YM1A 2H73A 4KE3A 2VCXA 5HYMA 4OPUA 1S3AA 3C1SA 4K8DA 1B37A 1EZKA 3QAWA 4HI7A 1G6YA 1OAZA 3TJJA 2LQOA 3C73A 2YWOA 3APQA 4K7OA 3LXZA 3HDCA 2WULA 5BUKA 2DBCA 4KDXA 5DJMA 2HSHA 5DAKA 1GTEA 2E2MA 3RHBA 1E39A 3ICTA 2LUSA 2YWLA 3UKAA 4CCRA 1H7WA 3FR6A 3QFAA 3DMEA 1M9BA 1PQNA 3FZAA 2LKUA 5ENUA 5DCGA 3LJRA 4LMWA 2GDRA 1F9MA 4C5OA 4XWRA 1RK4A 5J41A 4OFNA 1FEBA 4WX1A 1SD9A 1ZOFA 4A7AA 5G1KA 3VLNA 2QSIA 1NHSA 1TDNA 1SYXA 3IR4A 2AAWA 3WT2A 1CC2A 4TR1A 3EAOA 2V61A 3TOUA 1B9YC 3WYWA 1GXFA 2CA8A 16GSA 2VL3A 3LYKA 4IKHA 5CRDA 1VG9A 3T14A 1KTEA 1PHHA 5ECPB 4MH3A 3ERFA 3G7YA 3ADAB 2BS3A 5HR3A 1TYTA 1N4VA 1D5TA 5GAND 5CREA 3GSSA 4BL7B 2ZBWA 4JNAA 4OPIA 3ZVJD 2ZCTA 3V1WA 3LOVA 4V2NA 4ADWA 5JCNA 1F6MA 4EIQA 4K0NA 5GSTA 1CQGA 2IL3A 4JRRA 3GKKA 4L5OA 1NPXA 4MF7A 1FVJA 4ZCDA 3SM8A 2WPEA 3FKFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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