4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
2C75A 1ZX9A 1PBBA 4IVOB 1EL7A 3DH9A 1O5WA 1FEAA 2V3AA 5KRQA 3DK8A 1QJDA 3UP4A 2E1MA 4EMWA 4J33A 3FBSA 4ZCDA 2YVJA 4U8JA 1ZK7A 2Q7VA 5BVAA 3M0OA 2JKCA 1PBFA 4X9NA 4LIIA 4M52A 4AOSA 1RYIA 2GVCA 1MXTA 1F3PA 1NG3A 1TYPA 2X99A 2XLPA 4GCMA 4O5QA 5CQFA 4YSYA 4A5LA 3LZWA 1L9DA 4Z26A 4RG3A 2BS2A 4U8KA 2VRLA 1ZP0A 2APGA 2AQJA 4D04A 4XWZA 3CTYA 4ZN0A 1B5QA 1PBDA 4OCGA 2XLRA 1GREA 3QSSA 4IVMB 4KPRA 3ISHA 4CCQA 5HYMA 2ARDA 5FS9A 1OJDA 3NGCX 5FS6A 4FDCB 1YKJA 3GDNA 3ITJA 1IUSA 3ADAB 3NHOX 2C73A 3NTAA 3NT6A 3P9UA 4BURA 3RNMA 2Q0LA 1GNDA 5KOXA 4YXDA 1Q9IA 4NEVA 1MOKA 1EL5A 3SFEA 1RSGA 4H4XA 2CFYA 1CC6A 2R46A 3AE6A 3SM8A 4ECHA 1P2EA 2EQ9A 2WS3A 1GERA 3CNSA 3AEFA 3QFBA 3UOYA 2A8XA 4Z43A 1H84A 3KD9A 4B68A 2W0HA 3ALMA 4H4TA 4OPDA 4U2SA 2WOVA 1KFYA 3DJGX 4A6NA 4TM0A 1DNCA 1VG9A 5BUKA 2VRMA 4H2PA 1GSNA 2GMJA 3FMWA 3VQRA 4NTDA 3SFDA 2GMHA 1H82A 1CF3A 4AP1A 2WESA 3P4RA 1TYTA 4X9MA 5J7XA 2B7SA 4U8NA 4J34A 3GWFA 2ZZ0A 3ABVA 4A9WA 5ER0A 1PJ5A 2WDVA 1PXCA 3LADA 1PDHA 3AD7B 1DOEA 5KXJA 2EQ8A 5FS8A 3B3RA 2XCGA 3ICRA 1ZMCA 1DODA 2V60A 4YKFA 1EBDA 3REDA 1GXFA 5IQ4A 1CL0A 1NPXA 1OJ9A 1S2YA 4DSHA 3D8XA 3FG2P 4B69A 3PS9A 3GRSA 4TM1A 3QJ4A 2Q0KA 1CC2A 2EQ7A 2XVIA 3CGBA 2B9YA 5U25A 4H4ZA 1O95A 2BXSA 5C2TA 4B67A 2RGHA 4AP3A 1H7XA 5IQ1A 2GH5A 3UKPA 3O0HA 1XDIA 3R9UA 1ZOVA 5KVIA 4APNA 4CCRA 2RGOA 2V6OA 3DK9A 3NYFA 2R0GA 1E1MA 1VRQB 3G5RA 4FX9A 2X8HA 3CNJA 3H8IA 1VDCA 3CNDA 4J31A 1NDAA 3ICSA 4WX1A 3P4QA 4B64A 4B63A 2YVGA 3P4SA 4CNJA 1NG4A 2BACA 1NAAA 4EMJA 1F8WA 1BZLA 1GRGA 1KDGA 4YSHA 1KNPA 2BCPA 3AE9A 4JQ9A 2XYOA 1ZKQA 2QA1A 2WU5A 3BI2A 1Y56B 1N4WA 2CDUA 2C66A 4PABA 3UTHA 1CC4A 2XVJA 4BV6A 1D4EA 2B9WA 1P2HA 3K7TA 3UKHA 2Y6RA 5JCNA 1F6MA 3QFAA 1OJAA 2YR5A 1DXLA 3P4PA 1OJCA 1CJCA 2YLRA 3B6DA 3AYIA 2JB3A 1GTEA 4J56A 1LJ1A 1SEZA 2WOIA 2YLZA 4N9XA 4UDRA 2GR3A 4U2TA 3ATQA 5M10A 5U1OA 2B7RA 1GRTA 2DKIA 1PBCA 4EM4A 2B76A 2Z5XA 3NK1X 4AT0A 4C74A 4XWRA 1L9EA 2YAUA 3AE7A 1TDEA 3DMEA 2QA2A 2XFPA 3H4KA 4I58A 4YKGA 2H88A 2WOWA 1FECA 2ZZCA 1N1PA 3NG7X 3NLCA 3PO7A 1IUTA 1XANA 4K5RA 3DK4A 3DGZA 3CNPA 4GF7A 4H2NA 2GAGB 4D03A 3NYCA 1JU2A 4P9SA 2BC0A 2QAEA 4A99A 1B4VA 2GB0A 4BK1A 2ZZBA 2XDOA 1UKVG 1K0LA 3BHKA 3KPFA 2GQFA 3RP8A 1H81A 2IVEA 1O94A 3H8LA 5GSNA 3CNTA 2JAEA 4H4RA 4WCTA 2XFNA 5BRTA 3C4AA 3UKLA 3AE3A 2C3CA 5BULA 4YTMA 1Q1WA 3AYJA 2GEWA 1RP0A 1GPEA 2BK3A 1GRFA 4KX6A 4DGKA 2GV8A 4C3XA 3BNMA 4TLXA 3COXA 2RGJA 3AD9B 1REOA 1GRAA 4JY3A 4B1BA 1DOCA 3BI5A 2GQWA 3V76A 1ONFA 1VQWA 2RABA 2WU2A 3AYLA 3GMBA 3UOVA 3ALJA 3VRBA 5LV9A 2WBAA 2WDQA 3ICTA 1FL2A 1GTHA 3AE2A 1BGNA 4JN9A 3EPTA 3QSEA 4BJYA 3AE1A 5FS7A 5JCMA 1KNRA 1ELIA 4H7UA 3UKQA 3UTGA 1ZY8A 1L9CA 4OVIA 1CJ4A 4OPUA 5JCKA 1NHSA 4BK2A 1M6IA 3KKJA 4YTNA 4H4PA 2YG4A 5U63A 3E1TA 4DSGA 3LB8A 4H4QA 1PS9A 4Y4LA 4IA6A 4H4YA 1EL8A 1QLBA 4GRTA 1YQ4A 4YSXA 2BABA 3F8PA 1TDOA 3C96A 1E6EA 1GOSA 2OALA 2VQBA 2YG6A 3GRTA 3AEEA 1FCDA 1PXAA 4H4VA 1D7LA 3GWDA 4IV9A 3RP7A 2E5VA 4MJWA 1MO9A 1D7YA 4NTCA 4OPTA 4OPIA 2GR0A 2HQMA 1K0JA 4K7ZA 4H4UA 2JB1A 1N4VA 2X3NA 3CPIG 3KVEA 4Z2TA 2C3DA 4NTEA 1TRBA 3QVPA 3S5WA 1GV4A 3LZXA 3ZDNA 1YY5A 3NH3X 4DNAA 4FK1A 4YSZA 2BK4A 4U8LA 3UP5A 2WPEA 2VVMA 4J57A 3NRNA 4GDPA 4GR1A 4OPLA 4REKA 1LQTA 2BK5A 4EIPA 1NEKA 2JK6A 3L1RA 4PAAA 4BK3A 3G5SA 2YLSA 2JB2A 1IUWA 5EOWA 1TDKA 5KVHA 3V3NA 1COYA 1JRYA 1YQ3A 2WEUA 2CULA 3VR8A 1DJQA 1LV0A 1JNRA 2WP5A 4NEWA 4Z44A 3CGDA 3EAOA 4GUVA 3QVRA 3NK2X 1ZOYA 4K8DA 5HHFA 3WE0A 3T37A 5JCIA 1CBOA 3BNUA 1KSSA 1GETA 4RG4A 2B9XA 3GYIA 1F8SA 3AE5A 4H2QA 2C65A 4U8IA 2ACZA 4Z25A 1GEUA 3EF6A 1LTXR 3CPHG 3M12A 2VOUA 3ATRA 4UDPA 3V3OA 2YG5A 1PBEA 2XFUA 2C76A 3GSIA 3NKSA 4A79A 1KSUA 2YM2A 2AR8A 2C67A 4CY8A 3AB1A 1XHCA 3ZYXA 4K5SA 1JEHA 4AOXA 1FEBA 2BXRA 2GR1A 3NIXA 4I59A 4EQRA 3SQPA 2YWLA 1CHUA 3AEDA 2BC1A 1LPFA 2NVKX 4U2LA 4XXGA 4ADWA 1K0IA 2R0CA 3IWAA 3DJJA 1GT8A 3GD4A 1Q1RA 1GESA 3NTDA 2WHDA 3L8KA 1KF6A 2GRTA 2J3NA 2OAMA 4A7AA 2GF3A 3RP6A 1E7PA 4EMIA 4EQXA 2YLTA 1OJTA 4CBQA 1GALA 2EQ6A 2GAHB 4BJZA 3IF9A 4TM4A 2XLTA 2WDRA 1D4DA 3KLJA 1Y56A 2X50A 2R9ZA 4LU6A 3NK0X 2R4JA 1X31B 2WP6A 4Z2UA 3M13A 3CGCA 3GMCA 1NHRA 2BS4A 4NZHA 4TM3A 1L0VA 3JSKA 2PHHA 5FMHA 3AD8B 1DJNA 2CVJA 3OZ2A 1E1KA 2VVLG 2NPXA 2TMDA 2VQ7A 2XVFA 3Q6JA 1NHPA 2YR6A 4HA6A 1S3BA 1K4QA 4CRTA 4ZCCA 2XLUA 1ZMDA 2O9ZA 5J60A 1PJ6A 4H4WA 4E0VA 2YVFA 1GRBA 2OLNA 4K2XA 2Y6QA 4U8OA 5EB5A 2FJEA 4USQA 3AWIA 1D4CA 4UP3A 5EB4A 3VRAA 4YWOA 3IHGA 2VVLA 4A6NB 2C72A 3DGHA 1B8SA 1VG0A 2X8CA 2FBWA 5HXIA 3GD3A 1AOGA 3FIMB 4LA1A 1PXBA 3K30A 4Y4MA 4J36A 5L46A 3I6DA 2XFQA 2PYXA 3NYEA 4JNAA 1BWCA 2FJDA 3UTEA 1NENA 2A87A 4FK1C 5GRTA 4C5OA 2XLSA 3CPJG 1V59A 3SGLA 1QO8A 3BHFA 2C64A 4J2WA 2C7GA 3UKAA 4GDEA 2IVDA 2H89A 1CJ2A 1IUVA 4O5UA 1FOHA 4H50A 2C70A 2R45A 3UKFA 1BF3A 3VR9A 4UDQA 2YR4A 2AAQA 3S61A 3UOXA 1CJ3A 2WP9A 2YLWA 3NNEA 5DBJA 3CN8A 1LVLA 1PJ7A 4EQWA 1PHHA 1S3EA 1YQZA 1Y0PA 2I0ZA 4C77A 4OPGA 1W4XA 2Z5YA 1H86A 5M0ZA 1Z6LA 1JRXA 3AEBA 4RSLA 1H6VA 4K22A 3UKKA 5HY5A 4B66A 1EL9A 1B37A 3D1CA 4TLZA 1IUXA 5C3JA 1ZDLA 2R4EA 3P1WA 2WQYA 4EIQA 4U8MA 5CKUA 3EANA 3NN6X 4ICYA 2JBVA 1HYUA 1IJHA 2OLOA 1D5TA 3AE4A 4EM3A 2V3BA 2TPRA 3UTFA 3IHMA 3AEAA 4JNQA 4JDRA 3URHA 2BA9A 2DKHA 3GDPA 2WETA 3UCLA 3VRDB 2V5ZA 3F8DA 3GYJA 5JCLA 4Z2RA 3DJDA 3DJEA 2BYBA 2FJAA 3F8RA 4USRA 4EQSA 1JNZA 2WPFA 1F8RA 2OA1A 4HB9A 2YLXA 1JOAA 3C4NA 3ALLA 4YTPA 2Q6UA 4Z24A 3CIRA 2XVHA 4IA5A 2E4GA 2FJBA 3KA7A 4YT0A 4X4JA 2YG3A 3HZLA 4AT2A 3Q9TA 4B65A 3LXDA 4C3YA 1LQUA 4CY6A 1JRZA 1M64A 5IPYA 1E1NA 3K7QX 4OPCA 3NN0X 1NHQA 4Y4NA 4H4SA 1H83A 4CNKA 1DOBA 2YQUA 1GRHA 2GR2A 3I3LA 3K7MX 3UOZA 1E39A 3FPZA 1XPQA 4U8PA 2IIDA 1S2QA 3QSMA 2A89A 3LOVA 2V61A 5KOWA 2YG7A 2YM1A 2ZBWA 1TDFA 3CGEA 2WPCA 1N4UA 2BS3A 1BKWA 3DA1A 3IC9A 3OC4A 5TR3A 2VZ2A 3AEGA 1E1LA 1TDNA 3KU9A 2X8GA 3AECA 1IUUA 1H7WA 4H2RA 1PN0A 3II4A 2UZZA 2XVEA 2XFOA 3AE8A 2BCGG 3LJPA 3PVCA 4JY2A 3BI4A 3RHAA 4A65A 2F5ZA 5EBKA 2R0PA 1BGJA 5KWFA 3G5QA 2QCUA 3AXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FWHA 4IVOB 4POMA 1EL7A 1O5WA 3DK8A 1OE7A 2LJKA 1TOFA 2LKUA 4J33A 4ZCDA 3GTUB 4U8JA 4IP1A 1ZK7A 4ZB9A 1YKAA 5C00A 3M0OA 3MYDA 2JKCA 16GSA 1VF1A 2JADA 2XLPA 1EZKA 1MXTA 3W8JA 5AGYA 2QGVA 1TYPA 5CQFA 5IO0A 4TXOA 2QC7A 3SZ0A 3LZWA 1L9DA 3RHCA 1FB0A 4MJBA 2XLRA 5FS9A 1OJDA 3NGCX 2VCWA 3MNGA 1GNEA 3A5WA 3C1SA 2A2PA 1YKJA 1K0AA 2V41A 3GA4A 4WBJA 2Q0LA 4OFNA 4XRDA 1ZYPA 3HZ4A 3SFEA 4XS1A 4I5QA 3F3RA 2CFYA 1CC6A 4BVXA 5B6NA 2NVLA 2WS3A 3CNSA 4F82A 2CZ2A 1M2DA 3LYKA 3CSIA 4OPDA 2DJJA 4GCIA 1KFYA 4A6NA 4MH3A 3P7XA 5D96A 2L5OA 1DNCA 1SK0A 4GLTA 2LEGA 4PQ1A 1GSNA 1XZOA 2GMJA 1CF3A 4AP1A 2A2SA 5J7XA 4U8NA 4J34A 2ZUPA 2H01A 3GWFA 4TR0A 2K6VA 3ZREA 1LJRA 4GWRA 1DOEA 4PURA 3B3RA 2XCGA 3ICRA 1ZMCA 1DODA 1EBDA 2WRTA 1V57A 2E2MA 1U87A 1NPXA 1O8XA 1S2YA 3FG2P 2FA4A 1B9XC 1XCCA 4Q5QA 1MDKA 5IPHA 1O95A 1ZOFA 2RGHA 4FYCA 5IQ1A 2GH5A 3UKPA 2L4CA 1T8EB 3R9UA 1ZOVA 4ZB8A 4APNA 3DK9A 4ZL9A 2R0GA 1E1MA 2GT5A 3H8IA 1VDCA 1NDAA 3ICSA 1K0CA 5J9CA 3P4QA 4B64A 3C8EA 3P4SA 4CNJA 4EMJA 2BACA 2XPEA 1F8WA 1GRGA 1GTBA 1B4QA 3KCMA 4JBBA 3TB2A 3DRNA 3AE9A 1I9DA 2QA1A 3AY8A 4ILFA 4HU9A 3IAS2 2PPTA 2VCTA 2XVJA 1XVQA 1P2HA 5BMUA 4IKHA 2DJ0A 3P4PA 1JZOA 4IP6A 3W6GA 1VGLA 1LJ1A 2LJRA 5U1OA 3ZIJA 3PGTA 3KM6A 4RI7A 5IIZA 1PBCA 4C74A 4PNGA 3HYWA 1H4OA 2YAUA 1SK1A 1TDEA 3DMEA 1PSQA 2QA2A 4YKGA 2WOWA 3GNJA 1N1PA 3PO7A 1IUTA 2YZUA 1OYJA 1XANA 4HU7A 4N0ZA 3NYCA 3SZWA 3V1WA 4ML6A 5DALA 4TVEA 3LWAA 1UKVG 4V2MA 5KN3A 3BHKA 3KPFA 3CNTA 1V2AA 4HEA2 5AISA 2XFNA 4H4RA 1VRSD 4FYBA 3C4AA 1JLWA 2O87A 3UKLA 1XOAA 2LQOA 3AYJA 3TJBA 3VURA 2BK3A 4KX6A 4HOJA 4LL4B 3KEBA 4C3XA 4TLXA 4MZWA 4IGJA 13GSA 1T00A 1DOCA 3V76A 2DSAA 2IMIA 1PFOA 2RABA 1GL8A 3ALJA 1YF1A 1BGNA 3EPTA 2BRYA 3AE1A 3TOUA 4MJCA 2AB6A 3HYPA 5GAPD 2O89A 5D9VA 1ZYQB 3J7Yk 4KDYA 1CJ4A 4K1FA 1PKWA 1NHSA 1M6IA 3KKJA 2FCHA 3VI5A 4WBRD 4H4PA 5U63A 1M3IA 4H4QA 2TIRA 2R37A 1EL8A 4GRTA 2BABA 2EIOA 1E6EA 2OALA 2YANA 2H19A 1VF2A 3LEFA 3T2YA 1J0FA 4G9HA 2NBSA 2E5VA 4MJWA 1MO9A 1D7YA 2MYGA 2DIZA 4OPIA 2HQMA 1K0JA 3TOTA 2C4CA 1N4VA 3KVEA 2IIYA 2C3DA 4HJMA 1YF0A 2HZFA 1GV4A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FWH A;  4IVO B;  4POM A;  1EL7 A;  1O5W A;  3DK8 A;  1OE7 A;  2LJK A;  1TOF A;  2LKU A;  4J33 A;  4ZCD A;  3GTU B;  4U8J A;  4IP1 A;  1ZK7 A;  4ZB9 A;  1YKA A;  5C00 A;  3M0O A;  3MYD A;  2JKC A;  16GS A;  1VF1 A;  2JAD A;  2XLP A;  1EZK A;  1MXT A;  3W8J A;  5AGY A;  2QGV A;  1TYP A;  5CQF A;  5IO0 A;  4TXO A;  2QC7 A;  3SZ0 A;  3LZW A;  1L9D A;  3RHC A;  1FB0 A;  4MJB A;  2XLR A;  5FS9 A;  1OJD A;  3NGC X;  2VCW A;  3MNG A;  1GNE A;  3A5W A;  3C1S A;  2A2P A;  1YKJ A;  1K0A A;  2V41 A;  3GA4 A;  4WBJ A;  2Q0L A;  4OFN A;  4XRD A;  1ZYP A;  3HZ4 A;  3SFE A;  4XS1 A;  4I5Q A;  3F3R A;  2CFY A;  1CC6 A;  4BVX A;  5B6N A;  2NVL A;  2WS3 A;  3CNS A;  4F82 A;  2CZ2 A;  1M2D A;  3LYK A;  3CSI A;  4OPD A;  2DJJ A;  4GCI A;  1KFY A;  4A6N A;  4MH3 A;  3P7X A;  5D96 A;  2L5O A;  1DNC A;  1SK0 A;  4GLT A;  2LEG A;  4PQ1 A;  1GSN A;  1XZO A;  2GMJ A;  1CF3 A;  4AP1 A;  2A2S A;  5J7X A;  4U8N A;  4J34 A;  2ZUP A;  2H01 A;  3GWF A;  4TR0 A;  2K6V A;  3ZRE A;  1LJR A;  4GWR A;  1DOE A;  4PUR A;  3B3R A; 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