4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
4EQRA 3KLJA 1IUUA 1KF6A 2DKHA 1TDEA 3URHA 4JDRA 5GSNA 3IWAA 4AOSA 4YTMA 3BHFA 1BWCA 1JRYA 1D7YA 4NTEA 1XPQA 1GETA 1D4DA 3GYJA 1GRHA 2V3AA 3RP6A 3GMBA 3IC9A 1ZOYA 3CPHG 4H4XA 4AT0A 3AEAA 3D1CA 3I3LA 1CJCA 1GTEA 4Z2UA 4BK3A 2E4GA 3LXDA 2YR4A 1F8SA 3Q6JA 3EF6A 4D03A 1XANA 4ZCCA 2R0PA 2FJDA 2AR8A 1QLBA 4CCRA 2V5ZA 5BVAA 2QA2A 1GALA 2Q7VA 5M0ZA 2RABA 2JKCA 4X4JA 3AEBA 4H4WA 3UTFA 2R46A 2WDVA 4ADWA 4U8LA 3H4KA 4JQ9A 3PS9A 1GOSA 1Q9IA 3QFAA 3DK4A 2RGOA 5M10A 1E1NA 1PBDA 5JCNA 2GR0A 4JY3A 2XCGA 5KOXA 2Z5XA 3NGCX 3NRNA 5CKUA 2J3NA 2EQ7A 3UTEA 4ICYA 4WX1A 3QSMA 2VVLA 1GTHA 1XDIA 4CNJA 4U8JA 5DBJA 3DH9A 3UKLA 2YLXA 3QJ4A 1DJQA 2YM2A 3DGHA 4EMJA 1H82A 4U2TA 1H83A 1YQZA 1NG4A 2VQ7A 4OPIA 3ALJA 2WU2A 4C5OA 1KFYA 1BZLA 3DJJA 1EL9A 2GAHB 5EBKA 1EL7A 4AOXA 1V59A 2H88A 3ZDNA 3NYEA 1Y56B 2VVMA 4UDPA 1GERA 4U8PA 2CULA 3GD4A 3RP7A 4B68A 2WP6A 3AB1A 2XFNA 4IA5A 4K2XA 1IJHA 3P4PA 3DGZA 1PN0A 4JNAA 3V3NA 2YLRA 2WOIA 1UKVG 2X3NA 3ALMA 3CPIG 4TM3A 4AP3A 3DJGX 2WEUA 3ATQA 3D8XA 2ZZ0A 3AWIA 4JN9A 1Y0PA 4OPDA 2BXSA 1LV0A 1H7WA 3UOYA 3ICSA 5IQ1A 5JCMA 1S2QA 1E39A 4H2NA 2R0CA 5U1OA 1O94A 4B67A 2E5VA 3AYJA 3CGCA 3S5WA 2X50A 5FMHA 2YWLA 1FL2A 1HYUA 1F8WA 2XFOA 4YTPA 3KVEA 4HB9A 1Q1WA 3K7QX 2XVJA 2OA1A 3P4SA 2BK4A 2YLWA 1OJCA 1PBFA 3CGEA 1BF3A 5U25A 4Z44A 4FK1C 2TMDA 5KRQA 4U2LA 2WHDA 2Z5YA 3ALLA 3FPZA 1QO8A 3AE5A 1H7XA 2YQUA 2C64A 3SFEA 1L9EA 3NNEA 3AYIA 1FEAA 1TYPA 2BXRA 2GR3A 3WE0A 2AAQA 3RP8A 4CRTA 3C96A 1K0LA 4RG3A 3IHGA 2WDQA 3AE7A 3QVRA 3VRBA 4A6NB 2GMJA 1QJDA 1RYIA 2XLUA 2Q6UA 3NK0X 4REKA 4GRTA 4H2RA 3R9UA 1CL0A 2VVLG 2YR6A 1GXFA 1F3PA 3CNSA 3FIMB 1PJ6A 1IUXA 2C67A 3BHKA 2XFPA 2H89A 1GESA 3NYFA 4GUVA 1H86A 1S3EA 1E1LA 1D5TA 3AE3A 1TYTA 2X8CA 4B64A 2YVJA 5IPYA 4BK2A 4EIPA 1PS9A 3CTYA 4UDQA 5J60A 4GDPA 2YVFA 2C73A 1NEKA 4K8DA 2C3CA 1N4WA 2WOWA 2XLTA 3RNMA 5C2TA 4N9XA 4EQXA 2QA1A 3B3RA 4NZHA 1Z6LA 1PJ5A 3BNUA 4J34A 1CHUA 2XLSA 3AE2A 1NAAA 3CPJG 1OJAA 3VQRA 1YQ4A 1ZX9A 3KU9A 4NTCA 3VRDB 3AE9A 1DOBA 1F8RA 4H4SA 2ACZA 1TDOA 2V60A 1D7LA 2PHHA 2XFQA 2XLPA 1B37A 1LTXR 2JK6A 3CIRA 4GCMA 4H7UA 4NTDA 1S2YA 5JCLA 3ABVA 1TDFA 2YG7A 4IVMB 4U8IA 4O5QA 2BS4A 1JU2A 3RHAA 3ICTA 2JB3A 2TPRA 2QAEA 4USQA 1B5QA 4YKGA 4YWOA 4A9WA 2XVFA 1K0JA 1REOA 3ATRA 1DOEA 1KDGA 2GV8A 1LQUA 4LU6A 4AT2A 4U2SA 4B69A 1PBEA 3GMCA 3LJPA 1GRFA 2EQ8A 2YG6A 2A8XA 3LZWA 4XWRA 3IF9A 5BULA 3NN6X 2C70A 2RGHA 1E6EA 2B9WA 3DK8A 3ICRA 4OPLA 1MXTA 2GEWA 1IUSA 1O95A 2JB1A 4Z2TA 2C72A 1TRBA 2Q0KA 1KSSA 5J7XA 1ZKQA 4DSHA 1P2HA 2BYBA 2B7RA 3BI2A 4H50A 2C75A 3P1WA 1CC4A 4C3XA 4D04A 3NKSA 1GPEA 4H4QA 4OPUA 2YAUA 2DKIA 4B1BA 4M52A 4NEWA 3K7MX 1IUWA 2GB0A 2OLNA 1B4VA 4DSGA 3KD9A 1GV4A 1XHCA 2NVKX 2WPCA 4EM3A 1GREA 1O5WA 3GD3A 3UKKA 1ZY8A 3AEFA 4H4VA 4RSLA 3UKPA 3L1RA 3NIXA 4K22A 1PDHA 2R0GA 1S3BA 1ZDLA 2BK5A 2WESA 4TM0A 2A89A 3FBSA 2C76A 5KWFA 5EB4A 3C4NA 3NN0X 1DXLA 3DMEA 2XYOA 3PO7A 4B66A 4RG4A 3AYLA 5CQFA 4E0VA 4CY8A 1H81A 2B9XA 4YSXA 4IA6A 5JCIA 4OCGA 4FK1A 3NK1X 3ITJA 1FECA 4OPCA 4BJYA 4TM4A 1JRXA 2R4EA 1ZMDA 3NH3X 3FG2P 2WU5A 3GRSA 2XVEA 5GRTA 1FOHA 4B63A 1NPXA 3AXBA 1OJDA 4I59A 1X31B 2VOUA 2WP9A 4Y4MA 2JBVA 2GMHA 4APNA 5BUKA 4H4PA 3CNDA 2CFYA 1EL8A 1EBDA 2UZZA 1GSNA 3UOVA 1BGNA 2BS2A 2JAEA 3UP5A 1PXCA 3GYIA 2FJBA 2WPEA 2YM1A 3FMWA 3IHMA 3SFDA 4Z43A 1CJ3A 3DA1A 4X9NA 3DJEA 3CGDA 4X9MA 1M64A 4NEVA 3CNJA 5C3JA 2WDRA 4YXDA 5KOWA 2O9ZA 2XVIA 2B7SA 3DK9A 4OVIA 3UKAA 1EL5A 3AE1A 2BABA 2I0ZA 2BC1A 2WS3A 1CJ4A 1E1KA 2WQYA 3NYCA 3VR9A 5KVHA 2CVJA 4A65A 1NENA 2X8GA 4H2PA 4DNAA 1VQWA 3NG7X 4XXGA 3AD8B 2YR5A 3UTGA 4LIIA 2FBWA 1GRGA 4OPTA 3F8PA 1YQ3A 3P4RA 1CJ2A 2GAGB 3T37A 1D4CA 1H84A 1GT8A 2GR1A 4LA1A 4A5LA 1CF3A 1COYA 1P2EA 2EQ9A 3AEDA 1SEZA 4J56A 4J31A 1DNCA 3M13A 1ZK7A 2ARDA 2WP5A 1YY5A 4EMIA 2YG4A 3NHOX 1Y56A 5FS8A 4YT0A 3UKHA 4H4RA 1L0VA 2AQJA 2OAMA 1M6IA 1LPFA 1K4QA 1AOGA 3HZLA 1B8SA 2YVGA 1KSUA 4TM1A 5BRTA 3KA7A 5L46A 3LB8A 4YSZA 3Q9TA 2V3BA 5KXJA 2FJAA 4JNQA 4B65A 2WETA 2HQMA 4BK1A 5FS6A 4H4ZA 2ZZCA 2CDUA 3M12A 4C74A 5U63A 1ZP0A 4H4UA 4GDEA 3B6DA 2A87A 2X99A 3AD9B 3C4AA 3GDNA 2BC0A 4Z2RA 3ISHA 3UCLA 4Z24A 1VRQB 4CCQA 1OJTA 4YTNA 3NTDA 3BNMA 4OPGA 1Q1RA 2IVEA 2Y6QA 2E1MA 4CY6A 2GQWA 4J36A 4JY2A 1JEHA 3LADA 4H4TA 3V76A 4PABA 4BURA 2R9ZA 1JNRA 2C3DA 1JNZA 4A79A 2C7GA 3OC4A 4A99A 1BGJA 2R45A 2APGA 3KKJA 4K5RA 1VDCA 3ZYXA 1K0IA 3GWFA 1KNRA 2GVCA 3OZ2A 3P4QA 1PXAA 1NDAA 4A6NA 3EAOA 3EANA 2RGJA 4IVOB 4TLZA 1VG9A 4C3YA 3GDPA 4YKFA 1H6VA 4J33A 1GEUA 2BK3A 5HYMA 4FDCB 2JB2A 3PVCA 1GRBA 4CBQA 1D4EA 4U8NA 1E1MA 4IV9A 3M0OA 4GR1A 3AEEA 3LOVA 2GRTA 2XLRA 5HY5A 2Y6RA 1ZMCA 5ER0A 1VG0A 3UKFA 3VRAA 2XDOA 3K7TA 3KPFA 3JSKA 1IUVA 1MO9A 2EQ6A 3UKQA 4EQSA 1N4VA 3S61A 4CNKA 2OALA 2VQBA 2ZZBA 2FJEA 1GNDA 2Q0LA 2V6OA 1KNPA 2B9YA 2C66A 3SM8A 2YG3A 2BS3A 1NHQA 2C65A 2GF3A 5HHFA 4O5UA 3EPTA 4K5SA 5IQ4A 2GH5A 2VRLA 4AP1A 4FX9A 1TDKA 2IVDA 3QSSA 4GF7A 3COXA 2BA9A 4J57A 4PAAA 2NPXA 1LVLA 1NHRA 2XFUA 3I6DA 3QFBA 4EQWA 1JOAA 4ZN0A 2BACA 1NHPA 2VZ2A 3K30A 4U8MA 4EM4A 1NG3A 2PYXA 4J2WA 4WCTA 3UP4A 3NK2X 3P9UA 4C77A 1N1PA 3AE8A 2YLZA 3NLCA 3O0HA 4P9SA 2OLOA 2YLTA 3VR8A 3AD7B 2XVHA 4UDRA 2WBAA 1ONFA 4ZCDA 1PXBA 1LQTA 4A7AA 3F8DA 5EOWA 1PJ7A 3V3OA 1W4XA 5EB5A 1ELIA 4YSHA 2X8HA 1PHHA 4XWZA 5HXIA 1DOCA 3DJDA 3BI5A 3G5SA 3UOXA 5TR3A 2QCUA 4U8OA 4U8KA 4KPRA 4MJWA 4EIQA 1MOKA 3E1TA 1GRAA 1PBCA 1TDNA 3QVPA 2V61A 1F6MA 2W0HA 4K7ZA 3SGLA 3F8RA 2IIDA 4I58A 2F5ZA 1ZOVA 3NTAA 2GR2A 3GRTA 1CBOA 3QSEA 4Y4NA 4BJZA 3ADAB 2B76A 4EMWA 3L8KA 4UP3A 1CC6A 1NHSA 2ZBWA 4H4YA 1FCDA 4Y4LA 3UTHA 5FS7A 2YLSA 1FEBA 4DGKA 3UOZA 3GWDA 4TLXA 4KX6A 3CGBA 2VRMA 3AE6A 2BCGG 2GQFA 1L9DA 1LJ1A 4HA6A 1N4UA 2WOVA 3REDA 4Z26A 4BV6A 3G5RA 3CNPA 1RP0A 4YSYA 1E7PA 1RSGA 3G5QA 1OJ9A 4USRA 1IUTA 3BI4A 2YG5A 2WPFA 3H8IA 3NT6A 3SQPA 3AEGA 3CN8A 3LZXA 5LV9A 1DJNA 2BCPA 1YKJA 1L9CA 5KVIA 4Z25A 3AE4A 3II4A 2R4JA 4ECHA 3AECA 1DODA 3CNTA 1BKWA 1PBBA 3GSIA 5JCKA 1CC2A 4H2QA 1GRTA 1JRZA 3H8LA 5FS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EQRA 2VCTA 2P31A 3KLJA 3HVXA 1J0FA 3GKKA 4JDRA 3LFLA 4LMVA 4ZXGA 3IWAA 2OBIA 3W6GA 3F3RA 1FG4A 1B9XC 2HRFA 3CXGA 5CRWA 3IHQA 3KZQA 2B1KA 2ZCTA 3RAZA 2LTKA 1D4DA 4XCSA 2V3AA 2C0EA 4BIKA 1ZOYA 3AEAA 4BK3A 4Z2UA 1GULA 1JZDA 3EF6A 4D03A 1XANA 4ZCCA 3LORA 4KW6A 4G9HA 4K7OA 3IA1A 3OR5A 2GVPA 2RM5A 2RABA 2H1BA 3AEBA 4TRXA 2C0GA 3GX8A 3M3MA 3CSHA 3PS9A 1GOSA 2ON7A 3TKSE 1ERVA 4IQAA 5JCNA 1TU8A 1DE1A 2VCWA 5KOXA 2GR0A 3HYVA 2KP2A 2YOIA 2WRTA 1ZYEA 3VWXA 1GTHA 1XDIA 4WKWA 3P2AA 3QJ4A 2VUPA 4HOJA 3UL3A 1YQZA 3E3EA 3TKSA 4MJAA 4KX4A 1BZLA 3DJJA 1M2DA 1PKWA 1EL7A 4AOXA 2H88A 3KPKA 1QFNA 4UDPA 2CULA 1LJRA 2AJQB 1IJHA 3P4PA 3DGZA 1PN0A 4JNAA 3V3NA 2WOIA 4TM3A 1C72A 4AP3A 3S9FA 3ZIJA 2C80A 3TGZA 4ULXA 3QAVA 1GSYA 2MYGA 4IBPA 3TUEA 1BEDA 3UJ1A 3C71A 2GQLA 3RPNA 3DEXA 1S2QA 2R0CA 2A2PA 3HVVA 1GSUA 1O94A 2E0QA 1WPIA 4FO5A 1GTUA 1WRYA 2FHEA 1HYUA 1FL2A 4YTPA 3KVEA 4MLYA 5KMSA 2REMA 1OJCA 4L5LA 4FK1C 5KRQA 4U2LA 5GZZB 3FPZA 1VGLA 3SFEA 3CTFA 1TYPA 2BXRA 3RP8A 4ACSA 1K0LA 18GSA 2GMJA 2WULA 1WJKA 4H2RA 1QXHA 1GXFA 3CNSA 2J23A 2C67A 2OE1A 3P8WA 2H72A 1TYTA 5AN1A 4B64A 5IPYA 5HQPA 1PS9A 3CTYA 5J60A 2YJ7A 1XZOA 4GDPA 1S3RA 2YVFA 2VCZA 2C73A 1NEKA 2V6KA 4K8DA 2C3CA 1NW2A 3EVIA 1N4WA 3NIVA 5ELAA 4N9XA 1UN2A 4WF4A 3B3RA 3IDVA 2GTUA 3CRTA 1MD4A 5CREA 4LMWA 5D9VA 2XBQA 1NAAA 1H75A 3KMNA 3VRDB 3GMFA 2R2JA 1TJDA 2ALBA 3SX6A 4AGSA 3GL3A 2KHPA 1LTXR 4NTDA 3ABVA 2YG7A 5C00A 4PXOA 4WETA 4MABA 4USQA 1K0JA 1TRSA 4TXOB 2GV8A 1A0RP 3G7JA 3LJPA 5GAND 2YG6A 4G74A 5BULA 1BG5A 2FD3A 2H0IA 1G6YA 2MMNA 2GEWA 4Z2TA 2IMIA 2OKAA 5JCUA 1TRBA 1V98A 2IIYA 1ZKQA 5E4WA 3LG6A 2BYBA 1JLVA 3P1WA 1CC4A 4D04A 3IK7A 4KDYA 1GPEA 4H4QA 4NEWA 1IUWA 3KIJA 4NPBA 1UC7A 3C1SA 4EKZA 2PUKC 4H4VA 4RSLA 5HR1A 3F0IA 3E9JB 2R0GA 2WESA 4TM0A 4IS0A 5KWFA 2FCHA 2RM6A 2XPDA 5EB4A 4G10A 2XYOA 4B66A 2HRAA 5CQFA 2R6KA 4GSTA 3KEBA 4XS4A 4FK1A 3GSSA 4BWQA 1T8EB 3ITJA 1A2LA 1JRXA 3IC8A 1ZMDA 3FG2P 4I6XA 2LKUA 3O3TA 4HQSA 3A3TA 1JZOA 1HNBA 4D73B 3VRAA 1OJDA 4APNA 2H6YA 4KH7A 2GMHA 3QR6A 3UOVA 4XIHA 2YM1A 3DA1A 3CMIA 4X9NA 1YF1A 3DJEA 4X9MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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