3F3RA

Crystal structure of yeast thioredoxin1-glutathione mixed disulfide complex
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
HHHMVTQFKTASEFDSAIAQDKLVVVDFYATWCGPSKMIAPMIEKFSEQYPQADFYKLDVDELGDVAQKNEVSAMPTLLLFKNGKEVAKVVGANPAAIKQAIAANA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and kinetic analysis of Saccharomyces cerevisiae thioredoxin Trx1: implications for the catalytic mechanism of GSSG reduced by the thioredoxin system
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Thioredoxin-1
total genus 28
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f3rA00
1N8JA 3GHAA 1OC9B 2EIQA 2EC4A 2VCZA 3GH9A 3ERGA 2KOKA 2LRTA 3PINA 5J5NA 3D21A 4PX1A 3GRXA 3FZAA 13GSA 1TRSA 2DJ1A 1OAZA 3LXZA 2HFDA 3KP8A 4AJ8A 1ZMAA 2KUCA 3GTUB 1Z7RA 1Z6NA 4BVXA 5D73A 2GTUA 1ON4A 2JACA 4MZCA 3D22A 3TOTA 1A0FA 1VF3A 2H73A 3KZQA 4MCUA 5ID2A 2AAWA 2HZEA 5D9WA 4HZ4A 2N5BA 1TXXA 2LJRA 1K3LA 3NIVA 1FVJA 4KDXA 5G30A 3D4MA 1EP8A 2HNLA 2ZUPA 5JCGA 2H0GA 1GSDA 1GUHA 3RPPA 4IGJA 5ECHB 1O8WA 1JHBA 1EEMA 1SENA 3KH9A 4F82A 2C0DA 3DWVA 5IMFA 2O7KA 1MEKA 5D9VA 2MZCA 3MNGA 6GSWA 1SL0B 1T1VA 1BJXA 5DALA 3FR6A 2H74A 1HNCA 1GULA 1PKWA 2GQMA 4QL7A 1WP0A 4N11A 4HZ2A 1GH2A 1MDIA 3ZZXA 2N5AA 5F06A 2VIMA 3GKKA 2TRXA 5EL8A 4PUAA 3O3TA 5JWOB 4MH3A 2DJ3A 1PN9A 1TI1A 1TK8B 1TJDA 1AXDA 1R7HA 1XVQA 4I8BA 2YN1A 4IQ1A 2IN3A 2V2GA 3H1NA 2GQLA 3VK9A 1R5PA 3M1GA 1YEPA 4WR4A 1QQ2A 1TI3A 4TVEA 4XCSA 3HVVA 2OBIA 3ZLPA 2H8LA 1WJKA 3GL3A 2ON5A 3UIWA 2O8VB 3VWWA 5DCHA 4IW9A 3ZTLA 1HD2A 4PQHA 3WGDA 2JSYA 4DSRA 5G31A 1ILOA 5DBQA 4TR1A 3GFKA 2XPEA 3IAS2 1VF4A 2FWGA 2K8SA 2JL4A 2M72A 1JZRA 4OO5A 4MJCA 5D93A 4JE1A 1MD3A 1OC9A 4BVYA 3UJ1A 2V6KA 4Z7XA 4TXOB 2DMLA 2VCTA 2IWTA 2QC7A 3CSIA 2RM6A 2B5EA 1TP9A 4L8EA 2X8HA 1AQWA 2NVLA 2C0GA 1NHOA 2NPBA 2C80A 1ERWA 3RBTA 4KUNA 4H86A 3HYPA 2O89A 5F0GA 2RLIA 4WF5A 4ILFA 4RQXA 18GSA 3GTUA 3WGEA 3EURA 4EXJA 2EIOA 3K8NA 3EE2A 2YJ7A 5G2ZA 3C8EA 5HQPA 3P2AA 2LKUA 3S9FA 5H5RA 4N10A 3GKXA 4KSOA 5ECLB 2L57A 4QQ7A 1K3OA 3QAGA 1B9YC 4G2EA 2LEGA 2D2ZA 3EU4A 3A2WA 1K0NA 4HEA2 2LQQA 1OVNA 3ZVJD 1XWKA 2X64A 2FY6A 1CQHA 3UOMA 1HNAA 3L4NA 3G9BA 3KM6A 4O92A 2QSIA 3IV4A 2OE1A 1I5GA 2OACA 1XWGA 3BD2A 1QFNA 3TUEA 3VLNA 1B8XA 5DAKB 1GSUA 4MABA 3LFLA 4PXOA 2DJ0A 1PX7A 1T8EB 2VL9A 1BG5A 2WJUA 4XTSA 4X43A 2OKAA 3HDCA 5J9CA 3WYWA 3AY8A 1THOA 1FG4A 1X5CA 4BA7A 4XIHA 1GSFA 3D4TA 3DKSA 3U5RE 3MDKA 2IL3A 2H75A 4J56E 3APQA 4IQAA 4TR0A 4ZIJA 1GSSA 2WCIA 4GQCA 3TJGA 4ZL9A 2PVOC 1BYEA 4J57E 2YWNA 14GSA 1LBKA 2H0IA 2OADA 4Q5FA 2MMZA 5DDLA 3ISOA 2LSTA 1AIUA 5KEJA 4EO3A 4DSQA 10GSA 2WRTA 4DVCA 5J41A 1LU4A 4JR6A 2LRCA 1R5AA 3CRTA 5EPFA 1XWAA 3QDNA 4Q5QA 3I9V2 3FRCA 3D0ZA 2WGRA 2H1GA 1B4QA 1ACVA 1KNGA 1YEXA 2B1LA 4L5OA 1GL8A 4ZB9A 5IMVA 3ZL5A 3IR4A 4POBA 5G1KA 4LA1A 4EUYA 3IOSA 1DUGA 2CAIA 2DJ2A 3QPMA 1M9BA 2HZEB 4IVFA 2YWOA 4BPYA 3BJ5A 1VF1A 3JCML 2FCHA 2LNTA 2IMIA 1OE8A 3APSA 2O87A 3TJBA 4LLRA 3IDVA 4V2LA 5GSSA 4ZB6A 3TB2A 4MP4A 1WMJA 3KJYA 1AQVA 4MH2A 2I1UA 3L9SA 5CRHA 1PRXA 3CMIA 3E9JB 4NPBA 4TXOA 4DEJA 1IYIA 4N30A 3ERWA 3KTLA 3US3A 4PQIA 2GT6A 3TKSE 4EE0A 4IJ3A 2J9HA 1F3BA 3QFBC 1NSWA 2JZSA 2AV4A 16GSA 3WD6A 1PA3A 3P8WA 2V6OA 3GNJA 2NTOA 1SK2A 3DYRA 3LJRA 2IMKA 3HJMA 4ZILA 5H5QA 1ERVA 4POKA 3L0HA 4HOJA 4K0NA 4LMVA 2I81A 2G2QA 1SL2B 2WZ9A 5CYYA 1J0FA 3GYKA 4ECJA 4OO4A 3M0FA 2PN8A 1OC8A 4O7HA 3CYNA 3N9JA 2CZ3A 1MDJA 4IN0A 1EZKA 4YQUA 1JLWA 5DAKA 2H30A 2DMMA 2DIZA 1A0RP 2YZHA 1H4OA 1X5EA 1KEBA 4XS1A 3PGTA 5ABRA 2DC5A 1V58A 1Z5YE 3EU3A 1ST9A 1KTEA 1R26A 2HI7A 2M80A 3OR5A 4TKYA 5F05A 1GSYA 1TTZA 1G0TA 1V9WA 7GSSA 3PR8A 2VL2A 3O76A 3GN3A 1TKDB 3GA4A 1XZOA 20GSA 1FB6A 3LYKA 1A2JA 3IC4A 2FWHA 1RQMA 2VL2C 2K9FA 4KAEA 4KCEA 3ZMKA 4L0UA 1YDKA 1S3CA 4FYCA 4IELA 1TRVA 5B6MA 4WBJA 1XOAA 1V98A 4XS4B 5ELGA 5IO0A 1UN2A 2FHEA 1ML6A 5FT3A 1IYHA 1BAYA 1GTAA 3C71A 3ZFBA 3UVTA 3ZVJA 1GUMA 1SK1A 3P90A 4TOPA 1PMTA 1EOHA 1EV9A 3DEXA 3PH9A 3IK7A 4XHMA 4F2IA 2YPMA 1SYXA 5ECNB 1EGOA 5ECMB 2HT9A 5IMCA 1DE1A 4HUAA 3I43A 4HS1A 1ZYQB 2H01A 3FK8A 1M99A 1GTBA 1WIKA 2R3XA 4ZBAA 3GIXA 3J7Yk 3RHBA 1T3BA 3MAKA 3C73A 4MF5A 3VWVA 3QMXA 5CP1A 2QGVA 1XWBA 4O5RA 12GSA 3TKQA 4ZBBA 1THXA 3RDWA 1E6BA 1JFUA 1F9MA 1JZDA 3TJKA 1DBYA 2VAFA 4NV5A 4ZL8A 3LYPA 1TRUA 3Q19A 2GSRA 3HJPA 3A2VA 2JZRA 4K7OA 1K0CA 1URMA 1O73A 4KX4A 2VOCA 1XWCA 1F37A 3M3MA 3NZNA 2LTKA 1T4ZA 2KP1A 5H5SA 5ECOB 2GVPA 1DSBA 1RK4A 4KE3A 2A2SA 4RUVA 5CREA 2K6VA 4I97A 4MPFA 4AF2A 3F4RA 2F51A 2I3YA 2OBKA 3WT1A 2C3TA 1M7TA 4HJMA 3VFIA 2VLUA 3VWXA 1FHEA 2NBSA 4AJ7A 5HFGA 1EP7A 5CO3A 3IXRA 5CRGA 1Q98A 5HR1A 3HCZA 2IPAA 3LEFA 4OWYA 3ZMLA 2LV3A 1GTIA 2VCWA 4K9ZA 1XW5A 4LL1B 4FH8A 3VPTA 4NHZA 5AN1A 1GP1A 1B9XC 1ZZYA 1G7EA 1K0DA 4NHWA 2G0FA 2OE0A 1ZL9A 2WFCA 2MYGA 3DIEA 4WEYA 2LNSA 3KD0A 2FNOA 1OKDA 4GTUA 2F9SA 1JLVA 2L5LA 5KN3A 2GZZA 3DXBA 1GTUA 2EIRA 1S3AA 3IAM2 3QFAC 4I2UA 17GSA 1SL1B 1GRXA 1W4VA 1XVWA 2LUSA 3IK9A 3UMAA 4J2FA 4MPGA 2Z9SA 1PX6A 2TRCP 2C0EA 5EY6A 2MBSA 4X1UA 1F6MC 2H66A 1SJZA 4XS4A 2C1YA 3ZREA 3HJOA 3HVXA 3QAVA 4ACSA 2JU5A 4ZL7A 1ERTA 1FOVA 1AQXA 2ZNMA 1KBNA 4JZQA 5KN1A 1BEDA 3EMPA 2AJQB 4HU7A 3ED3A 1V40A 3KTBA 2DJKA 2GZYA 1WPIA 5CNWA 3MSZA 5KN2A 3F6DA 5IM9A 3KMNA 9GSSA 3F0IA 4ID0A 1SKWB 2P0GA 1M2DA 19GSA 2LRNA 2L4CA 3FHKA 4OFNA 5ECRB 4KCAA 4OD7A 5HR2A 4BWSA 3C1RA 2YV7A 4DSSA 2H0HA 4WF4A 1YZXA 4FYBA 4K6XA 2VUPA 4GCIA 2TIRA 3EMXA 1AUCA 4XS6A 3TRPA 4OCFA 4P3YB 4K8MA 1JZOA 4OMVA 1XOBA 1WWJA 2QKEA 3M8NA 1XIYA 4QL9A 4F0BA 3TKSA 4KSMA 4E8HA 2B6MA 1I9DA 5COHA 4BL7A 4TRXA 4GSNA 3H8QA 3ZIJA 3GSSA 4AJ6A 3F4TA 2WS2A 5G1LA 2PPTA 2VD1A 2H1BA 2JSZA 1PSQA 1K0MA 2REMA 5ELAA 2F8AA 1A24A 5ECIB 2HLSA 1YF1A 2B5YA 2GT5A 4PNFA 3SBCA 1YKCA 2FA8A 3GX0A 4IJIA 2P5QA 1GSEA 2HSYA 2L4QA 1Z7PA 4NXIA 5GSTA 5GAPD 1XBSA 2R4VA 3WGXA 1WRYA 4WXTA 5IIZA 4I6XA 5ECKB 4GRFA 1USBA 1E2YA 1O85A 1A8LA 3BBYA 3IRAA 2B5XA 4MA9A 3LWAA 2YWMA 5DQSA 2B1KA 3MWHA 4AGSA 1G6WA 4GXZA 1VRSD 3HD5A 2VD0A 4IBPA 2CVKA 1YQ1A 4KDYA 3BOAA 4O32A 5D9TA 3IA1A 3E0UA 1PL2A 2GSQA 1A23A 2CQ9A 2A4VA 3D6IA 1C72A 1SJIA 2AHEA 4JR4A 4IP1A 4YQMA 5AIVA 3IHQA 4D73B 3ZFLA 2BJXA 3H79A 1K3YA 3A2XA 2E2MA 5CRWA 1A2LA 2DIYA 4XRAA 4LMWA 4K7IA 5F8BA 2KHPA 4WBRD 5HFKA 1X0RA 5JCUA 2VLVA 3HXSA 2IMEA 4HQSA 1XW6A 3F8UA 5C00A 3CXGA 2OA7A 4TN8A 2RIIA 4MMMA 5ECSA 3VURA 4NV2A 2CZ2A 2E0QA 4POLA 6GSUA 4JBBA 3GURA 1A2MA 1T7PB 1QGVA 2V1MA 3HVSA 3LG6A 4OFTA 3TKPA 2CAQA 1HYUA 4EDYA 6GSSA 1GLPA 3RHCA 1TDIA 3ME7A 1QK8A 1XW9A 5B8BA 5CAXA 4V1Ag 3TGZA 3GKMA 1TU8A 3QOUA 3A5WA 2YOIA 2M46A 3N5OA 1UC7A 2FWEA 5IPHA 3G7JA 4MLYA 3W8JA 2PUKC 4HDEA 2LJAA 3HZ8A 1J9BA 4V2MA 2X99A 4G10A 2VCXA 2XPDA 4MF6A 3UVHA 2P5RA 2IMFA 1DE2A 2HE3A 3KXOA 2C4JA 1SYRA 3EINA 3FR9A 2A2RA 1G7OA 2NDOA 4EL1A 2FUG2 3ZIVA 2KLXA 1SKRB 3ME8A 4IHUA 4F03A 1MTCA 5DCGA 5DJLA 1V2AA 2B3SA 2V32A 4EC0A 1NHYA 4GWRA 4KNDA 4KDUA 1WOUA 6GSVA 3FYGA 3LQ7A 1SD8A 4PUFC 1T4YA 4ZB8A 2E7PA 3APOA 1B48A 5A4WA 3UBLA 1TK5B 1OC3A 5HFIA 3DMLA 1XCCA 4LL4B 1O7UA 1GSQA 4MDCA 3EC3A 4ZBDA 4F9ZA 2C8UA 4POMA 3GV1A 4MJAA 2FA4A 2CX3A 3CBUA 1NM3A 3HKRA 2RUFA 2WULA 6GSXA 2J23A 4JRRA 4L5LA 3U6VA 2YWIA 2GQKA 2I9HA 1ABAA 2C3QA 1EWXA 4JEDA 1OKTA 3GMFA 4K2DA 1T00A 4DSSB 1H75A 4V2NA 3H4KA 1Y6EA 3DRNA 2FWFA 1VGLA 2BTOT 4ZXGA 11GSA 3HY2A 2VO4A 1GUKA 4D73A 4E8EA 4Q5NA 2ZCTA 1J08A 3CSJA 1W89A 3L9VA 1JZWA 2PWJA 3Q6OA 3TRQA 1NW2A 2P31A 3D5JA 3GL5A 2IJYA 1YKAA 2X8GA 2WB9A 1PGTA 1FVKA 5IMZA 3F6FA 3G7YA 2OJLA 3QCPA 2VCQA 1O81A 2MMOA 5CRDA 2HYXA 2H71A 2XHFA 5J9BA 3F9UA 1PL1A 2DSAA 4IS0A 2VM2A 2H6ZA 3F63A 4KH7A 2KP2A 5JCWA 2AUVA 4K0GA 1BQ7A 1U3AA 3IE3A 3ZITA 4EKZA 5LNKe 3VPQA 2HSHA 4RQRA 4WETA 4PURA 5GAND 1MDKA 4G9HA 4KW6A 1Z9HA 5E59A 4RI7A 1A8YA 5IPGA 3I6AA 1V57A 1Q4JA 4YQVA 2H1DA 4WR5A 1FW1A 3KEBA 1EV4A 2C3NA 3EYTA 3TJJA 3W8SA 3QD9A 2R2JA 1GLQA 1PD21 1ZYEA 4IKHA 5ECPB 4YAPA 2ALBA 4BWQA 3TKRA 3V1WA 2E2GA 3Q74A 4FYUA 2GGTA 4K1FA 1QXHA 2F8FA 5GZZB 3UL3A 1Y25A 1QMVA 3M9JA 3ERFA 3BCIA 3RPNA 2OE3A 1OYJA 1K0AA 3W6GA 1X9SB 2PBJA 3UAPA 3J7Yb 4HU9A 1HQOA 3F3QA 5ECQB 3GSTA 3TOUA 4YAVA 5G5FA 4MZWA 3FZ4A 4PQ1A 4ML6A 5DJMA 1YY7A 4HQZA 5AIXA 2ON7A 2CVDA 5INYA 5L71A 2MBTA 3GH6A 4FIWA 3F3RA 4NAXA 4EF0A 3FW2A 4K7NA 3QR6A 4MF7A 2H70A 3A3TA 2DLXA 2ES7A 3HHVA 4CHSA 1TW9A 2IFQB 4TW5A 4NWYA 3R2QA 1GNEA 3G7IA 4OFMA 4GF0A 2LQOA 1ERUA 2GDRA 3IPZA 4CDOA 4EDZA 1Z3EA 2V41A 5D8IA 5IO2A 4IP6A 5A4VA 1B4PA 2F3MA 5D96A 2XC2A 1ZOFA 2VL3A 2L6CA 3DD3A 1SJ6A 5DQYA 5F07A 1U88A 3E3EA 1M9AA 1PKZA 2B7JA 4CW9A 5G5EA 3L78A 2GSTA 4PNGA 2L59A 2CX4A 4KGIA 4OCEA 2DJJA 3BCKA 4GSTA 1G6YA 2PGTA 1XFLA 2YV9A 1EOGA 3TKSC 5C04A 3ZRDA 3LXTA 6GSYA 3RAZA 2GZPA 2PERA 3KIJA 1QUWA 3F4SA 2BMXA 5IMDA 1FB0A 2YZUA 1MD4A 2LJKA 1SKSB 1TOFA 5HR3A 2HZFA 1Z6MA 4MJBA 4MZBA 3TJFA 3SWLA 2R37A 1ZGNA 2X8CA 2H1AA 4YH2A 3KP9A 3LSZA 4V1Ap 3FR3A 2AYTA 1WE0A 2GLRA 1PQNA 5HR0A 1K0BA 3C7MA 3CRUA 3FKFA 4L0WA 8GSSA 3VI5A 2PU9C 4KB3A 1N2AA 3TRXA 2PVQA 2FGXA 1LJRA 1O6JA 4EVMA 3I69A 5IQYA 2XBIA 3LGCA 2R5GA 5DVBA 1GNWA 2HXKA 2YP6A 2IIYA 2MMNA 1CQGA 3DVXA 2VCVA 5EVOA 1VF2A 5ENUA 3M9KA 2N5FA 3UARA 5KN0A 1X5DA 1YF0A 4GSSA 2FD3A 3DVWA 1TK0B 5A5KA 2HRFA 5B6NA 1O8XA 1SU9A 3CSHA 1SD9A 1FO5A 4I2TA 2LS5A 2H19A 1XXUA 5ID2B 4MK3A 3KGKA 4GLTA 3TCOA 2H72A 1TU7A 2C0FA 1BX9A 3IBHA 2O85A 3UEMA 5A4UA 5JWQB 2L5OA 6GSTA 3P7XA 4NMUA 2RUEA 4N0VA 1HNBA 4FO5A 3VI7A 2WDUA 2DBCA 1GWCA 3Q18A 5LD0A 4G19A 2CVBA 2IMDA 4ECBA 1U87A 5J4UA 3ZYWA 4I5QA 1F3AA 3H93A 3QAWA 1EEJA 5AISA 4JU5A 1XPVA 2IFQA 1F2EA 2YCDA 1M0UA 1TRWA 1K0OA 2GS3A 2YJHA 4ECIA 2JZTA 3HA9A 3EVIA 5DALB 1X9WB 4ML1A 5J3RA 2CT6A 1M2BA 4KA0A 3GUSA 5B7CA 5IOXA 5D9XA 3KCMA 2L6DA 5FWGA 1YJ6A 4TR4A 22GSA 3FY7A 1U6TA 1AC1A 1AW9A 2MMAA 3NOFA 3KH7A 5IMAA 5B8AA 4MJEA 1X9MB 3C1SA 1UA5A 4ULXA 4ECCA 1EGRA 3O6TA 2XBQA 5JWRB 5LCZA 3GKNA 3HZ4A 1M2AA 4TXVA 4HI7A 5IOWA 4HJ2A 3L9UA 4X0XA 3DGQA 3LORA 4PGTA 4XRDA 1S3DA 2RM5A 2K18A 2CV4A 1FAAA 5FHIA 1ZCPA 2FLSA 4GQFA 3CTGA 1OE7A 2H6XA 3EWLA 5AGYA 4ISDA 1SK0A 1RW1A 4N0ZA 3WT2A 2R6KA 4WKWA 2HRNA 3UBKA 1AAZA 4TR3A 3FEUA 3FZ9A 3FZ5A 2CA8A 1U3IA 1UVZA 2YNXA 2VM1A 4F0CA 2H6YA 2K8VA 4RI6A 3KMOA 2VLTA 4Q5RA 3VWUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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