1U3AA

Mutant dsba
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
b'QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intriguing conformation changes associated with the trans/cis isomerization of a prolyl residue in the active site of the DsbA C33A mutant
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol: disulfide interchange protein dsbA
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 64
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1u3aA00
3C71A 4JEDA 2RIIA 1MDIA 4JR4A 2H1DA 5DBQA 4TR1B 2X8CA 4NWYA 1ZL9A 3KH9A 2V6OA 1HNBA 2HYXA 4OFNA 1V98A 2WZ9A 1FHEA 1QUWA 3BCIA 3MSZA 4I2TA 3SWLA 1WJKA 1SJIA 4HZ4A 2L6DA 3F4RA 4G2EA 1DSBA 2H73A 1YKAA 4DEJA 4YAVA 1OC8A 4WR4A 3FHKA 3FR3A 2OA7A 3GKMA 2GZYA 3E0UA 4MZCA 1B9XC 2WRTA 2C8UA 4XS1A 4K6XA 1GSFA 4WKWA 2VAFA 2OBIA 4Q5RA 1JFUA 4I2UA 1UN2A 4Q5QA 1XFLA 5FWGA 5IOWA 2CZ3A 4HUAA 4BWSA 5G1KA 16GSA 3BD2A 3WYWA 2MMAA 5ABRA 3FK8A 1K0OA 1ZYEA 4LL4B 1F37A 1GTBA 3J7Yb 3KTBA 3TCOA 4I6XA 3A2WA 4Z7XA 3GKNA 4IGJA 5CRHA 3MNGA 3IDVA 1Q98A 4J56E 1JZDA 1MDJA 2JZTA 3MAKA 4F9ZA 1WIKA 4WF5A 1EOGA 2YWIA 2MBTA 1XWBA 1GTAA 4IQ1A 3IK9A 1VF4A 3ZREA 2H19A 1PD21 3TKRA 4HJ2A 4RQXA 1TK0B 4LLRA 3WGEA 1F9MA 4IVFA 1YY7A 4MLYA 2E7PA 3UMAA 6GSWA 1R4WA 2PUKC 3CTFA 4QL7A 5LNKe 3QCPA 4WETA 1JHBA 2VLUA 3IBHA 3H8QA 2OJLA 3ERWA 5D9XA 5G5EA 3OR5A 1TK5B 2C3NA 5JWOB 1ACVA 2EC4A 3JCML 2B5YA 3HJOA 22GSA 4CW9A 4GSNA 3EINA 3KH7A 3TKPA 2NTOA 4GSSA 2YZUA 2FGXA 1A2MA 4YQUA 1SL1B 5ECMB 3S9FA 3LJRA 1VF3A 1YKCA 4K7IA 1SK2A 5HQPA 5D9TA 3RAZA 4EC0A 2P5RA 2FNOA 3I9V2 5CYYA 3UBLA 3HJPA 2XBIA 3TB2A 2JZSA 4K0NA 2CV4A 3AY8A 1NHYA 2VL3A 1XWKA 3BBYA 4OO4A 3O3TA 3TRQA 3Q6OA 2KHPA 3FW2A 5A4UA 5ELGA 1Z6NA 2AV4A 4QL9A 3HD5A 4OO5A 1E2YA 1G7EA 3ZLPA 3TJBA 3CSIA 3C8EA 2OACA 2FA8A 2NPBA 1GH2A 4OCFA 3KCMA 3TRXA 1YDKA 3ZMKA 1ZOFA 4XS4A 1SU9A 1K0DA 1TU7A 2FD3A 3DIEA 4KGIA 3M8NA 2VLTA 2B5XA 1TI1A 3GTUA 5DQYA 3U6VA 2YWNA 3U5RE 3ZYWA 2IFQB 1RK4A 4ZB6A 2LJAA 5J9CA 5IM9A 2R6KA 5EY6A 4MCUA 4EXJA 4XTSA 2B1KA 4IJ3A 2N5BA 1Y25A 4O5RA 3ERFA 1R5PA 2VCTA 1QXHA 4K9ZA 5J9BA 1TU8A 1VF2A 5GSSA 3HVXA 5F07A 1FAAA 2H66A 3WGDA 1I5GA 3RDWA 18GSA 2H6ZA 4HEA2 3GH6A 1X9WB 3L4NA 1TJDA 3ZL5A 5G1LA 4K2DA 2AHEA 4MF5A 2X99A 3F3QA 2H30A 3LYPA 2X64A 4BPYA 3LXZA 1PA3A 5HR3A 3L9UA 1MD3A 3C1RA 2VIMA 2YOIA 4XRDA 6GSYA 5HR1A 1GSQA 3WT2A 1PRXA 3EURA 1QMVA 4POKA 3BCKA 4X0XA 2H01A 2HT9A 5HR2A 3KP8A 2GQMA 3HYPA 3I6AA 1XWAA 2PWJA 1M2BA 2L4CA 3APOA 1XIYA 5GAND 4L8EA 5AN1A 1GLQA 1PQNA 1URMA 3GV1A 2HXKA 2L6CA 3HZ4A 3GURA 1V2AA 2B1LA 2OE3A 2GZZA 4PURA 3IC4A 5H5QA 2DJ0A 2RUEA 2CAQA 1BYEA 3UVTA 10GSA 2VCZA 3LORA 2ALBA 1ZCPA 1Z7PA 2M46A 3LYKA 4ZL7A 3W8SA 2AAWA 2LNSA 1DE1A 2O8VB 4I8BA 5JCWA 14GSA 1M7TA 2LV3A 17GSA 4F2IA 3P2AA 1A24A 2PPTA 3EU4A 2O87A 4ZBBA 1ZYQB 2DLXA 4TXVA 3LEFA 1G0TA 1OC9A 3ZRDA 1SD9A 4TR4A 5ID2B 1T4YA 3SBCA 4PNFA 2DJ2A 3PGTA 4IW9A 5ECOB 1EV9A 3KZQA 1ML6A 4TKYA 4TXOB 4MABA 2RUFA 3HVVA 8GSSA 1GUMA 5DVBA 2LRNA 5J3RA 2GS3A 1PN9A 4L5LA 2V1MA 2PGTA 1O85A 5KN3A 3GRXA 4CHSA 1LBKA 2LEGA 2F3MA 4G19A 4HJMA 1X9SB 2B3SA 1XBSA 2C0DA 4I5QA 3EE2A 2ZNMA 3TKSA 3ZITA 1N8JA 3TKSE 3ZFLA 5D73A 2GVPA 4HZ2A 4XHMA 5DCHA 3DVXA 3GKKA 2OKAA 4OWYA 1BEDA 3US3A 4X43A 4ISDA 2VL2C 2YCDA 1BX9A 1WRYA 1G7OA 3PINA 2LJKA 3NZNA 3WT1A 1O7UA 1V9WA 5B7CA 2A4VA 5IPGA 4HOJA 5E59A 4K1FA 2ON5A 1KTEA 4POMA 5D9VA 1XXUA 3W8JA 4P3YB 2HNLA 4YQVA 1B9YC 5J5NA 3ISOA 1EZKA 2AJQB 3TJJA 4TR1A 5IMZA 3CBUA 3IXRA 5LCZA 2H0IA 1SKWB 5JWQB 3UARA 1YF0A 2HLSA 4KDYA 3FYGA 3G7JA 1O81A 4KCAA 2V6KA 3APSA 3QOUA 5DDLA 3VWVA 1HNCA 3LFLA 4XS6A 3UAPA 1G6YA 2I4AA 2P0GA 3L0HA 4KW6A 2HRFA 2PN8A 2VLVA 1QFNA 1S3CA 3A2VA 1H4OA 2GQLA 4K7NA 1XOAA 1O8XA 3UOMA 1RW1A 3O6TA 2KUCA 1EP8A 2C0GA 4MMMA 3H79A 1LJRA 3HCZA 1T8EB 5HFIA 1N2AA 3FZ5A 1Z3EA 1R7HA 4RQRA 4LA1A 5INYA 5CRDA 2KOKA 5EL8A 4IN0A 1SKRB 1TKDB 3KMNA 2HZEB 1V40A 3NOFA 2BMXA 4K0GA 2YWMA 2H76A 4ACSA 2CX4A 1ABAA 4F03A 2NVLA 3DXBA 3ZIJA 1TRSA 3FZAA 4TR3A 1G6WA 2R2JA 2G2QA 3D5JA 5ECPB 3FKFA 2K8VA 3UIWA 1BQ7A 2H74A 1XCCA 2B6MA 4IELA 3QDNA 5D9WA 2LSTA 5CREA 1F3BA 2GQKA 3MWHA 1A0RP 4BL7A 5CAXA 2TRXA 4JR6A 2K18A 2WDUA 5IMVA 3LWAA 4K8MA 4MH2A 6GSXA 1GUHA 1TDIA 2AYTA 3ZFBA 4Q5NA 4ZXGA 3F6FA 3QFBC 1BG5A 4ZBAA 1WP0A 6GSUA 4L5OA 1THOA 1AQXA 3APQA 3CMIA 1JLVA 4H86A 4F82A 2RM5A 2PERA 2CVKA 4ID0A 4NAXA 2H6XA 1EOHA 3EVIA 4X1UA 5CRWA 2DJJA 2GSSA 4OFMA 1JLWA 2X8GA 4GF0A 3GN3A 1AIUA 2V2GA 5KN1A 1GSUA 1YJ6A 3KJYA 3I69A 2QKEA 1TXXA 1U3AA 2VO4A 5G30A 1VF1A 4EF0A 2GGTA 3F4SA 20GSA 2ON7A 1XW9A 4ZB9A 4E8EA 1J08A 5DCGA 1OE7A 4OFTA 4HQSA 1T7PB 3H1NA 2RLIA 4ZILA 4RI6A 1PX7A 4V1Ap 5FT3A 2IFQA 1UC7A 4NHZA 4FYUA 3KIJA 1GWCA 3ZZXA 4AJ6A 2VCVA 4NMUA 5DAKB 3MDKA 4EE0A 1J9BA 3VK9A 1QGVA 1PL2A 4AGSA 3KMOA 2CAIA 19GSA 5B6NA 1U3IA 1TW9A 4WR5A 4EUYA 4NXIA 2XHFA 3HY2A 2VD0A 1XVWA 3CXGA 4V2MA 3G7YA 2DIYA 2OBKA 1FB6A 1ILOA 3GIXA 4ILFA 4HS1A 3GL3A 2VM2A 3EC3A 1AAZA 2EIRA 4N10A 1GTIA 2GTUA 4ZL9A 3QFAC 1SKSB 3UBKA 2R37A 1K3OA 3GFKA 1ON4A 5J4UA 3HZ8A 4BVYA 3GHAA 1THXA 2NBSA 3D6IA 2DJ3A 2HSHA 3IHQA 1B8XA 3E9JB 4PXOA 2IJYA 1A8YA 4OD7A 4KCEA 2CA8A 2MZCA 1OC3A 3CSJA 2LQQA 3HKRA 1GULA 4FH8A 3D22A 3DD3A 1ERWA 2WCIA 4HU9A 3TJGA 1GUKA 5KN2A 1V58A 1PGTA 3M3MA 3DGQA 2IL3A 1PX6A 1YEXA 1EEMA 1HD2A 2MMOA 5B8BA 3RHBA 3IOSA 2I3YA 3CRUA 1FVKA 3A3TA 3KXOA 4OCEA 5D93A 2JACA 3D0ZA 5CP1A 2JSZA 2QSIA 4FO5A 3EWLA 4ZBDA 3TRPA 4IKHA 1KEBA 3KP9A 1I9DA 1XW6A 2MYGA 5ID2A 2OADA 4KA0A 3H93A 4LMWA 2F9SA 2WB9A 1OAZA 3WGXA 1AW9A 2IWTA 2O89A 2IMKA 4AF2A 4TXOA 2E2MA 2N5FA 1S3DA 4TR0A 1JZOA 4GSTA 2PVQA 4ECIA 2IPAA 3LG6A 2YWOA 2ZUPA 1VGLA 3LGCA 3F63A 3ME7A 1AXDA 2C4JA 4JZQA 5IOXA 2PU9C 3RPNA 1EEJA 2B7JA 5E4WA 3EU3A 13GSA 2HZFA 1K0AA 4Q5FA 2LRTA 1K3YA 1SJZA 1YZXA 3VLNA 5IPHA 3TUEA 3PH9A 3ZVJA 1A2JA 3F4TA 5D96A 2N5AA 2AUVA 2J9HA 1PL1A 4ULXA 4ECBA 3GSSA 5D8IA 5GSTA 2YJHA 4TRXA 2IIYA 3UEMA 2C0EA 6GSSA 1TRUA 1TRVA 5H5SA 3KM6A 3LQ7A 3HXSA 4MJAA 4BA7A 3DRNA 4F0BA 2DC5A 2IMEA 1WPIA 3GL5A 2P5QA 4L0UA 4NPBA 2DIZA 3K8NA 1FO5A 5ECIB 4PQIA 4V1Ag 2GSRA 3J7Yk 1SL0B 1MDKA 1DUGA 1ERVA 3BOAA 2KLXA 4TW5A 5ECSA 3ZIVA 1A2LA 1ERTA 4F0CA 2OE0A 5ECRB 1M0UA 4E8HA 4JU5A 1SK1A 2IMIA 3ZTLA 1GNEA 5CRGA 3ZMLA 5IQYA 2FY6A 2R4VA 1USBA 2BJXA 2JADA 4MJCA 5AISA 3GUSA 3H4KA 5IO2A 5ELAA 4MPFA 1SENA 2BTOT 2H0HA 1NSWA 2OE1A 3DMLA 1RQMA 2FLSA 4ECJA 1LU4A 2H6YA 1K0CA 2L5LA 3P90A 1HYUA 5HFGA 1B4PA 2FCHA 3IAS2 2HI7A 1X5DA 1NM3A 3R2QA 2JZRA 2G0FA 2DMLA 3FRCA 1PMTA 3GMFA 4MZWA 1FW1A 1PKWA 5JCGA 3TJKA 3W6GA 3GKXA 3DKSA 2E0QA 2HZEA 2VUPA 3VFIA 3IR4A 2GT6A 2DJ1A 2GLRA 2WULA 4TOPA 4KDUA 2YJ7A 2H72A 5ENUA 3Q18A 3F6DA 4DSSB 2YP6A 3LXTA 1GSEA 3ERGA 2E2GA 1QQ2A 3KEBA 1YEPA 2FWGA 2JSYA 1DBYA 3V1WA 3G7IA 2YNXA 1Z5YE 3FZ4A 3FZ9A 4PQ1A 1GNWA 4POLA 4PUFC 3IK7A 5F05A 2XC2A 4IQAA 2QC7A 3GX0A 4OMVA 4IP1A 2P31A 2TIRA 2CZ2A 1Q4JA 2H1AA 3FR9A 3A2XA 3GX8A 3L9VA 3VI5A 2VM1A 1C72A 4G9HA 2EIOA 1O8WA 2F51A 3GYKA 4HU7A 2R5GA 5DQSA 9GSSA 1T00A 2H71A 2MBSA 2M80A 1TRWA 2CVDA 3IRAA 1WWJA 5ECHB 4PNGA 2VOCA 2A2SA 1VRSD 3EMPA 2H1BA 3ZVJD 4XIHA 2AB6A 3GH9A 5A4VA 4AJ8A 5CNWA 5G5FA 2C1YA 1B48A 2TRCP 1GSDA 11GSA 3TGZA 1R5AA 1M9AA 3N9JA 1SYRA 2DJKA 2O7KA 1O73A 1AQVA 3VWUA 5J41A 3HDCA 4TN8A 1WE0A 12GSA 1PSQA 1JZWA 3IPZA 2D2ZA 1W4VA 3TKSC 4ZIJA 1FOVA 1KNGA 3QAVA 2JL4A 5AGYA 4I97A 5DALA 4D73A 2O85A 2X8HA 3VPQA 1XZOA 2CVBA 3FR6A 4AJ7A 6GSTA 1ZMAA 1EWXA 2PMTA 1UVZA 1AQWA 4BWQA 5HR0A 4MP4A 2CQ9A 4N11A 3M9KA 3UJ1A 4JRRA 5H5RA 3VURA 2FUG2 4RUVA 5DAKA 5FHIA 4V2NA 4MK3A 3IE3A 3F0IA 3RHCA 2FWEA 4YAPA 1X5CA 3KTLA 4EDYA 4GWRA 1KBNA 1XW5A 1F6MC 3QD9A 4RI7A 2FWHA 2LNTA 2H0GA 3TKQA 2EIQA 5ECKB 2DSAA 2REMA 2I81A 4GTUA 1TP9A 1TOFA 5DALB 4D73B 4BVXA 1M2AA 2HFDA 3C7MA 3CTGA 2PVOC 1CQGA 1GLPA 3M1GA 5ECQB 4GCIA 1GRXA 4WBJA 2LUSA 5ECNB 3WD6A 5KN0A 4EVMA 1BJXA 1EGOA 1T1VA 2B5EA 1MEKA 4MJEA 4V2LA 4KSOA 6GSVA 2VCQA 3EYTA 3KGKA 2HSYA 4IP6A 2GSTA 3Q74A 4ZB8A 3UL3A 5B6MA 1GSYA 5G31A 1M99A 1MTCA 4NV2A 4IJIA 1Y6EA 4KNDA 1GP1A 2LKUA 2WS2A 4PX1A 1MD4A 3TDGA 1J0FA 1ZZYA 4ZL8A 1XVQA 5IMDA 3DWVA 4ML6A 1M2DA 1T3BA 2IMDA 2QGVA 3RPPA 2JU5A 1GSSA 5EPFA 3P7XA 1U87A 1YF1A 4YH2A 1H75A 4MJBA 3C1SA 4GLTA 1ERUA 1F3AA 4JE1A 4IS0A 1NHOA 2VCWA 3VWXA 5G2ZA 4GXZA 1OKTA 2KP1A 4K7OA 3BJ5A 5F8BA 2NDOA 4WBRD 1M9BA 4JBBA 4MF6A 4GQFA 5DJLA 2DBCA 4XRAA 4EDZA 1K0BA 1BAYA 4KB3A 2YPMA 2ES7A 4QQ7A 1IYHA 3TJFA 2Z9SA 5IO0A 2WJUA 1SJ6A 3IV4A 4XCSA 2K8SA 3IA1A 3TOUA 5CO3A 2XPDA 4MDCA 2C0FA 2RM6A 1TI3A 2VL2A 2L4QA 2C3QA 3GNJA 3NIVA 5HFKA 2L57A 2C3TA 4XS4B 4L0WA 3QAGA 2M72A 5F0GA 3KD0A 4EKZA 3GTUB 2J23A 2CT6A 2A2RA 1FVJA 3FEUA 5IMCA 5C04A 4MF7A 4KE3A 1HQOA 4TVEA 4MZBA 4KAEA 2K9FA 3I43A 2H70A 1XPVA 2VL9A 3DVWA 2LQOA 2PBJA 4O92A 1AUCA 5LD0A 2GZPA 1SK0A 3QMXA 4CDOA 3VI7A 2CX3A 1Z7RA 5A4WA 3GA4A 4YQMA 2C80A 1OE8A 4WXTA 2K6VA 4HI7A 1QK8A 3HJMA 1DE2A 5IMAA 3CYNA 2F8FA 3L9SA 4KX4A 1JZRA 5COHA 4IHUA 3F8UA 3Q19A 4N30A 1A0FA 3E3EA 2B7KA 1A8LA 2YANA 2I9HA 4N0VA 1ZGNA 1CQHA 3M9JA 2IMFA 2V32A 3HA9A 4MPGA 4FYCA 1K0MA 3VWWA 2LTKA 1X0RA 1K0NA 4KDXA 3ED3A 1EP7A 2KP2A 3D21A 5AIXA 2WFCA 3M0FA 1SYXA 2FHEA 3RBTA 5A5KA 2H1GA 3D4TA 4EL1A 2R3XA 4ML1A 4KUNA 2MMNA 5L71A 2H75A 3G9BA 2LJRA 1FB0A 3QPMA 3P8WA 4LL1B 7GSSA 3DYRA 3UVHA 4HQZA 3ME8A 1OVNA 1NW2A 1UA5A 5JCUA 4J2FA 2YN1A 4GRFA 1K3LA 1PKZA 4LMVA 4DSRA 2YZHA 1R26A 4WF4A 1SD8A 3LSZA 1X9MB 1S3AA 2FWFA 2MMZA 3F3RA 4GQCA 1TTZA 2IN3A 2GT5A 4DSQA 1GTUA 5GAPD 3N5OA 2FA4A 5GZZB 4DSSA 1WOUA 4O7HA 4PQHA 5IMFA 4MH3A 1Z6MA 4IBPA 4O32A 4DVCA 1TK8B 1T4ZA 2H8LA 2L59A 3FY7A 4POBA 2F8AA 3CRTA 4KH7A 3O76A 2GSQA 5B8AA 1X5EA 3CSHA 2VD1A 1OC9B 2L5OA 2YV9A 4MA9A 3A5WA 2DMMA 1OYJA 4NV5A 4EO3A 2HE3A 4HDEA 3QR6A 2VCXA 1O6JA 4PUAA 2XBQA 4NHWA 4ECCA 4FYBA 2V41A 1IYIA 4G10A 3TOTA 5KEJA 3L78A 1A23A 3QAWA 1SL2B 1XWGA 2ZCTA 5EVOA 5F06A 2LRCA 1V57A 3HVSA 1AC1A 3F9UA 4WEYA 1E6BA 1YQ1A 5IIZA 2WGRA 1XWCA 4KSMA 4FIWA 2YV7A 5JWRB 2HRNA 5C00A 2I1UA 3C73A 1F2EA 1EV4A 3EMXA 3GSTA 1Z9HA 1U6TA 1HNAA 3PR8A 3HHVA 3DEXA 3VPTA 2GDRA 1FG4A 1B4QA 1OKDA 4PGTA 1ST9A 1W89A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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