3IDV | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	235
structure length	235
Chain Sequence	DDLEVKEENGVLVLNDANFDNFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIANILKDKDPPIPVAKIDATSASVLASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGSRTQEEIVAKVREVSQPDWTPPPEVTLVLTKENFDEVVNDADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSKRSPPIPLAKVDATAETDLAKRFDVSGYPTLKIFRKGRPYDYNGPREKYGIVDYMIEQSGAAAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
source organism	Homo sapiens
publication title	Structure of the Catalytic a(0)a Fragment of the Protein Disulfide Isomerase ERp72. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Protein disulfide-isomerase A4
total genus	67
structure length	235
sequence length	235
ec nomenclature	ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date	2009-07-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3idvA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3idvA01

4DEJA 2LV3A 4IELA 1W4VA 2K8VA 1NHYA 4HQZA 2WULA 3HJPA 2HSYA 3DD3A 4EUYA 4YQVA 2H70A 3D6IA 1SYXA 1T1VA 3HY2A 3IAM2 3R2QA 3HJMA 5C00A 1EV9A 1BYEA 1GUKA 2KP1A 2HSHA 3D22A 4MCUA 1O8XA 2L6CA 4L8EA 3F4RA 2C1YA 1GUMA 4CDOA 3KMOA 1GSUA 2DBCA 3LJRA 1N8JA 2CT6A 2OADA 1SL2B 3DWVA 3EMXA 2EIQA 3D4TA 1UVZA 1YEPA 5CREA 1PKZA 4EDZA 5IOXA 9GSSA 3QR6A 4QL7A 1EOGA 2H0IA 3UVTA 3KXOA 1RK4A 1GRXA 3G9BA 1TKDB 3H79A 2VCTA 4L5OA 3EYTA 3TRXA 1OE8A 2F51A 4POBA 3P2AA 2H1GA 1F3AA 3GN3A 1A2JA 3TKPA 4ZBBA 2OKAA 1MD4A 3APSA 1SYRA 1J0FA 4POKA 5CYYA 2VIMA 4BVYA 4ECBA 2TRXA 4FYCA 3ME7A 1Q98A 3F3QA 1SKSB 5IMAA 1M2DA 2GQMA 3HYPA 3L9UA 1SL1B 1Q4JA 2GVPA 1QK8A 1K3LA 4RI6A 3GFKA 4TRXA 3P7XA 4Q5QA 3Q6OA 1GH2A 1CQGA 4PX1A 1SENA 3GA4A 1SKWB 1LU4A 2HYXA 5DDLA 2LQOA 5B6MA 1FAAA 4OCFA 1Z7PA 1R5PA 3H93A 1QQ2A 5CRDA 1EGOA 3CSHA 2YJHA 4OFTA 1CQHA 3D21A 3J7Yk 5IMFA 4XRAA 4FYUA 3LEFA 3L4NA 3VWUA 3IR4A 2DMMA 4KSMA 2WDUA 2FWGA 1BX9A 5CO3A 2REMA 2DIZA 1V58A 1WJKA 4MA9A 4PURA 4L0UA 3ZLPA 3FR6A 3ZVJA 4X43A 4RQRA 4L0WA 1FG4A 1FW1A 1PN9A 1M99A 3NIVA 3VWXA 3C1RA 2WB9A 4LMVA 1QUWA 1GSFA 2DJJA 4I2UA 1B8XA 2FY6A 1WWJA 3LXZA 2P31A 2IN3A 1O8WA 2C0FA 4KAEA 3GKMA 1O6JA 2CA8A 1XFLA 2AHEA 1FVJA 3QOUA 4NHZA 2H66A 2KLXA 2RIIA 4XCSA 1M0UA 3FZ4A 5ECPB 2H72A 4X1UA 2QKEA 1K0MA 3F9UA 5DCHA 4JR6A 4I8BA 2E2GA 2JU5A 3UIWA 1PGTA 4GRFA 1E2YA 1F6MC 2YP6A 3FZ9A 4IGJA 4MPFA 3EURA 2LSTA 2IFQA 1YQ1A 1XZOA 3HKRA 2JSZA 3QFBC 1V57A 3APQA 1XVWA 3I69A 1WIKA 3IXRA 3GSSA 2XBIA 1EWXA 1O7UA 4KNDA 3VFIA 3IK9A 5G5EA 2J23A 1UC7A 2AYTA 4J56E 5D9VA 1X0RA 4EL1A 3E3EA 4QQ7A 2GZYA 4TR4A 4I6XA 3U6VA 3J7Yb 1SJ6A 2L6DA 2DMLA 1EP8A 2GT5A 2HZEA 3GX8A 5J41A 2NPBA 1A8LA 2H1DA 4FIWA 3ZVJD 2NDOA 5HQPA 3DYRA 2LQQA 2FCHA 2WGRA 4XS1A 3GTUB 4TOPA 2CZ3A 2VUPA 2I4AA 5KN2A 2AV4A 5J4UA 3FHKA 4I5QA 4MZBA 2E7PA 3LXTA 1PSQA 2F8AA 2GS3A 3F63A 3ERWA 4WXTA 3TKSC 3M9JA 6GSVA 4N0VA 4TR0A 4ILFA 3WYWA 5ECRB 5KN1A 2DLXA 2X99A 5J5NA 1SK0A 2ZCTA 4AJ7A 5J9CA 4POLA 2OE1A 1GSSA 3IOSA 5FWGA 3KP9A 1U3IA 5D73A 1ERTA 4GSNA 4TXVA 3GHAA 2A4VA 4N11A 3HVSA 1SJZA 5CAXA 4AGSA 1XW6A 2OE0A 4GTUA 3KD0A 1PL1A 1S3AA 3KMNA 4ZL8A 2LEGA 3RDWA 1MD3A 3TRQA 4IN0A 1K3OA 3RPNA 1Z3EA 4LA1A 3IAS2 3G7JA 3H4KA 2VCQA 1ERVA 2D2ZA 4H86A 4HS1A 4WR5A 4E8EA 4PQ1A 1WMJA 1BQ7A 1LJRA 2V6KA 1TRVA 1THXA 5HR1A 4KGIA 1TRSA 2R4VA 3HD5A 2VM1A 3IK7A 1ZOFA 1IYHA 4GQCA 5IO0A 4IVFA 3WGXA 1MDKA 4OFMA 1XWCA 1XWGA 2VCWA 1G7EA 3M0FA 4NMUA 2TRCP 6GSWA 3QAWA 1JFUA 3TJKA 1HNCA 3CXGA 1MDJA 2ON5A 3GX0A 4PGTA 2HXKA 2C3QA 2V2GA 4MH2A 2MMZA 5AIVA 3IC4A 2IJYA 4YQUA 3L0HA 1HNAA 1WRYA 4Q5RA 1E6BA 4TR3A 2X64A 3QD9A 2GSRA 5G2ZA 5CRGA 2G0FA 1B9XC 1PA3A 2HRFA 22GSA 4K1FA 1U88A 2FUG2 2X8HA 5D9WA 3W8SA 4MZWA 1TP9A 1PL2A 2C0DA 2H01A 4Q5FA 3HXSA 1DUGA 3CYNA 2QSIA 4ZIJA 1NHOA 4TN8A 4E8HA 3TOUA 3RPPA 3FW2A 2R5GA 5ELGA 2VOCA 5G5FA 1A2LA 4BA7A 3ZMLA 2N5BA 1XXUA 5ELAA 3Q18A 2MYGA 6GSSA 2RUEA 4V1Ap 5ABRA 3VI5A 1GTAA 3A2VA 2H75A 1RQMA 1MEKA 3C1SA 4KCAA 1B4PA 1ZZYA 1GSYA 3O76A 2Z9SA 2PPTA 3WGEA 5JWOB 4MP4A 2C3TA 3ME8A 1A2MA 4MZCA 3W6GA 1A8YA 5GSSA 4IBPA 4MJCA 1S3CA 5EPFA 1HYUA 5HR3A 1FB6A 1OAZA 2I3YA 4F9ZA 3QDNA 3N5OA 2OA7A 4YH2A 1SD8A 1BAYA 4EF0A 3L9SA 4ZB9A 2YANA 2EIOA 3FEUA 3ZFLA 2VL3A 4Q5NA 4IJIA 4L5LA 3DEXA 4ID0A 5HFGA 1G6YA 2IMIA 5DVBA 2CX3A 2OE3A 2LRTA 3E9JB 1GP1A 2X8GA 3EU4A 2YZHA 4ZXGA 5IPHA 19GSA 5D8IA 1TU8A 2AB6A 4ECJA 1K3YA 1K0NA 3ERGA 4CHSA 4OFNA 2VAFA 4NXIA 1TXXA 3LGCA 3A5WA 1GLPA 2RLIA 4MH3A 1GWCA 2H0HA 1Z6MA 3TKRA 6GSUA 5EVOA 5F05A 3ED3A 1XW5A 3VLNA 1EEMA 2GDRA 6GSXA 1N2AA 3OR5A 4K7NA 4KDXA 4KCEA 1B48A 4O7HA 4ZB8A 5A5KA 5GAND 3PINA 5B7CA 4BWSA 2H19A 2GQLA 2IFQB 4KDYA 3MWHA 3LORA 3BJ5A 4FO5A 1F37A 3BCIA 1R26A 1SD9A 3W8JA 4KW6A 2KHPA 3HZ4A 1W89A 3P8WA 3V1WA 1ZYEA 2MBSA 3AY8A 1V40A 3FKFA 1GTUA 4IQ1A 1ZCPA 5D9XA 4ECIA 3MDKA 1EZKA 2L5LA 1G7OA 3WGDA 3E0UA 5DBQA 2NBSA 4BL7A 4FYBA 4G19A 3DGQA 2WCIA 2B1LA 2J9HA 2HZEB 2CX4A 2IPAA 4JRRA 5G1KA 4K0NA 1FOVA 2WRTA 2CVKA 3GIXA 1AXDA 1KTEA 2JL4A 3UBLA 5IPGA 1URMA 4JE1A 2PGTA 2GTUA 2VLTA 2XPDA 4MLYA 5EL8A 2H73A 8GSSA 3TKQA 4MF7A 1TK8B 1VF2A 3CRTA 1F2EA 3D5JA 3SWLA 1YKAA 2GZPA 2MMAA 3MSZA 2H6YA 2YWMA 2FA4A 3GUSA 5CP1A 5GSTA 2HZFA 3O6TA 3A2WA 1TJDA 5HR2A 2ES7A 2B3SA 3VURA 1G6WA 2B6MA 2L4CA 2XC2A 5C04A 1DE2A 4OO4A 2H1AA 7GSSA 2IMKA 5B6NA 1XOAA 2YNXA 16GSA 4DSQA 1VRSD 4LMWA 3IV4A 5IMCA 3KIJA 2CVDA 1DE1A 3A3TA 4DSSA 2LJAA 1OKTA 4EC0A 4GQFA 3GH9A 1XCCA 3ZYWA 5IMDA 3ZIJA 2R37A 1K0AA 1GULA 2BMXA 2MMNA 4YAVA 3TRPA 3VWVA 1DBYA 2MBTA 2GZZA 3F0IA 1M9BA 3F6DA 3ZITA 3GYKA 1XIYA 2V1MA 3UBKA 1DSBA 5DAKA 4MF6A 2RUFA 2K9FA 3GSTA 3KH9A 3UMAA 4IP6A 1T4YA 3G7IA 3PH9A 2HRNA 3VI7A 5A4VA 2LRNA 4N10A 4EVMA 2E2MA 2L4QA 1UA5A 5ECKB 1X9SB 2CZ2A 4P3YB 6GSYA 1JZRA 5IOWA 4K9ZA 5ECIB 5D9TA 2TIRA 5FHIA 1PKWA 1HNBA 5KN0A 3HJOA 4XRDA 4DSRA 2C4JA 2B7KA 4WBRD 3LYPA 1TOFA 4PUAA 5KN3A 4HZ2A 1SK1A 1A23A 3ZREA 1B9YC 5L71A 1TRWA 3TDGA 1TDIA 5F0GA 3TJGA 3C8EA 1U87A 5F06A 1H75A 4IHUA 4LL4B 3IBHA 4K6XA 1IYIA 3HZ8A 3WT1A 3VPQA 3N9JA 3TUEA 5DJLA 5ENUA 1ZL9A 4XTSA 17GSA 3TJBA 4MABA 3LQ7A 1TW9A 5IO2A 2KUCA 3I9V2 3IA1A 5IMVA 2B1KA 2LRCA 4GXZA 3ERFA 1XWBA 3GKNA 3S9FA 4K0GA 2HLSA 3FZ5A 5E59A 2DJ1A 4IW9A 3A2XA 2H6ZA 1SJIA 5JWRB 3F8UA 1TI3A 1SL0B 3GKKA 1FVKA 4V1Ag 2HE3A 1ST9A 1PMTA 1F3BA 5G1LA 3ZZXA 3F4SA 1XVQA 2K8SA 1ML6A 3IPZA 2AAWA 4QL9A 2YV7A 1MDIA 2PERA 3US3A 3C73A 3D4MA 2P5QA 4TR1A 2O85A 1TK0B 3GMFA 1S3DA 4ACSA 2FWHA 2H30A 4HZ4A 4GF0A 2HI7A 5HFIA 5LNKe 2IIYA 5H5QA 4OWYA 1OVNA 2O8VB 4O32A 1BG5A 4D73A 1K0CA 1YDKA 3WT2A 3BOAA 1O73A 1EEJA 2V6OA 5J3RA 2R3XA 2WJUA 2VLVA 3EWLA 3H1NA 14GSA 3EVIA 2C3NA 3HCZA 5IM9A 1Z5YE 2CQ9A 4WETA 5ECLB 1V98A 4RUVA 5ECNB 3CSIA 3CMIA 4O5RA 4ML1A 1SU9A 1GLQA 3BBYA 3M1GA 1X5EA 5CRWA 2OJLA 2GSSA 5CNWA 1JHBA 4JU5A 4IS0A 2VCZA 3ZL5A 5JCWA 3DVWA 2HNLA 4HQSA 1J9BA 2GSQA 3BD2A 4MJAA 3PGTA 2PVOC 5AGYA 2H74A 1BJXA 5EY6A 4GSTA 2YWNA 2NVLA 4AJ6A 2VD0A 5ID2A 2PBJA 2LUSA 3KEBA 2C0GA 1WE0A 2C8UA 1XBSA 2DJKA 3JCML 2LJKA 4EE0A 20GSA 3IHQA 5ECSA 3HVVA 1XW9A 2KP2A 4JR4A 3KJYA 1AIUA 4NWYA 4HU9A 1T8EB 2RM5A 2O87A 4HJ2A 2H0GA 2V41A 3DVXA 3TOTA 2K18A 3CRUA 2CV4A 1I9DA 3FZAA 2I9HA 3GL3A 3CSJA 1YKCA 1QGVA 5B8AA 2WFCA 5B8BA 1TK5B 1X9MB 2ALBA 2LNSA 1U6TA 1HQOA 2FLSA 2CAQA 4OD7A 5D93A 1OC9A 4PXOA 2DC5A 1B4QA 5CRHA 2VO4A 4WKWA 5DALA 4F2IA 1T7PB 2H6XA 3IRAA 5JCGA 5AISA 1XPVA 2FA8A 3K8NA 1SKRB 2MMOA 4OMVA 2F8FA 2IMEA 3QAVA 2FD3A 3ZFBA 1OKDA 2M80A 3NOFA 1ILOA 1VGLA 12GSA 5ECMB 3F6FA 2YWOA 5INYA 4ZB6A 1T00A 2GGTA 2YJ7A 1NM3A 2LNTA 3GURA 1GTIA 3KTLA 3L9VA 4TXOA 5ECQB 3RHCA 2KOKA 1M9AA 1PD21 3ZTLA 2VL9A 4GSSA 3G7YA 1OE7A 4XS4A 3ISOA 1V2AA 4G10A 2XBQA 5AN1A 5IIZA 4TW5A 5FT3A 3DXBA 3UOMA 1GTBA 2PUKC 2JZRA 4N0ZA 4NV5A 4RI7A 4HJMA 4JBBA 4KB3A 3EU3A 4DSSB 4RQXA 3UL3A 5LD0A 2YWIA 2PVQA 4YAPA 4AJ8A 1A0FA 3P90A 3APOA 4MJEA 3UARA 2JACA 1OYJA 2OBIA 2DJ3A 3QFAC 2P5RA 2N5FA 3EINA 1GNEA 3LWAA 4N30A 4BWQA 5LCZA 4NAXA 1K0BA 1V9WA 5F8BA 3VK9A 1M7TA 4HOJA 1C72A 1GSDA 1G0TA 4ML6A 1VF4A 2VM2A 5ECHB 4EXJA 4TVEA 5DAKB 4K8MA 1J08A 1EP7A 3C7MA 4HDEA 2BTOT 3M3MA 3NZNA 4IKHA 3VWWA 3EMPA 4HUAA 3UJ1A 1F9MA 2B5EA 4KA0A 1JLVA 2VL2A 1ERWA 1ZYQB 2IMFA 1TTZA 1YF1A 1ABAA 2QC7A 1ACVA 3FRCA 2IL3A 5A4UA 3TKSE 3QCPA 1A24A 1NW2A 4GLTA 2M46A 10GSA 5E4WA 3O3TA 1OC3A 3QMXA 1UN2A 3TB2A 1M2BA 2FWEA 4JEDA 2VCVA 2F3MA 1X9WB 11GSA 2A2SA 5DCGA 1AC1A 2K6VA 2YZUA 3UEMA 4GCIA 2A2RA 4XHMA 1Y25A 3TJJA 3LYKA 3TCOA 4MDCA 4F03A 2V32A 1HD2A 4TKYA 3MNGA 2PWJA 1VF1A 2AUVA 5A4WA 1U3AA 1Z6NA 4OCEA 1GUHA 1PQNA 3MAKA 3TJFA 4WR4A 5DQSA 1FHEA 1QMVA 1WP0A 3VPTA 4K7IA 3WD6A 3D0ZA 1I5GA 2JSYA 5GAPD 1KNGA 3GH6A 2OACA 3I43A 3ZRDA 3HDCA 2JZTA 3GNJA 4KX4A 3PR8A 4BVXA 2H1BA 1R4WA 3CTGA 2WS2A 1WOUA 4NV2A 4F0BA 2VLUA 4JZQA 4KUNA 2ON7A 1GSQA 1EV4A 2R6KA 2E0QA 3KGKA 3HHVA 1PX7A 1JZOA 3SBCA 1JLWA 1NSWA 5G30A 3RHBA 3BCKA 3GL5A 1FO5A 2DIYA 4K2DA 1GSEA 3FYGA 3KP8A 4IP1A 2NTOA 2RM6A 4EDYA 4WF4A 3L78A 3FY7A 2L5OA 4IQAA 4K7OA 1ZGNA 2HT9A 4Z7XA 2AJQB 1XWKA 1R5AA 13GSA 2L59A 3I6AA 4PQHA 3Q19A 1SK2A 3UAPA 4TR1B 4ZBDA 2GLRA 1Z7RA 2EIRA 4I2TA 1XOBA 2H71A 2PN8A 4CW9A 2M72A 2B5YA 4J57E 3C71A 4D73B 1YZXA 3RBTA 6GSTA 2H8LA 2LS5A 4ECCA 1OC8A 5DQYA 2YV9A 3M9KA 1O85A 5J9BA 4F0CA 1YF0A 5COHA 2JZSA 3LSZA 3DKSA 5H5RA 2N5AA 2L57A 4NPBA 1R7HA 4LL1B 2JADA 4PNFA 2YOIA 1Y6EA 1T4ZA 4GWRA 3ZIVA 4WBJA 3H8QA 1T3BA 4PNGA 2GSTA 1JZWA 3IE3A 4YQMA 5G31A 5JCUA 1LBKA 2HFDA 4V2MA 1ON4A 2EC4A 1ERUA 1BEDA 4DVCA 4F82A 1QXHA 2DJ2A 5ID2B 3FR9A 1O81A 3HA9A 3KH7A 5F07A 4XS6A 2LKUA 3CTFA 1VF3A 4ZBAA 5GZZB 3DRNA 4ULXA 2XHFA 18GSA 1TU7A 4ZILA 1PRXA 3KM6A 4MF5A 3DIEA 1AQWA 2H76A 4MMMA 3CBUA 1YY7A 1K0DA 1RW1A 5HFKA 4ZL9A 2XPEA 2ZUPA 4ZL7A 3GV1A 3LFLA 5D96A 1THOA 2DJ0A 1QFNA 5JWQB 2PU9C 1K0OA 4XIHA 4ISDA 3KTBA 2P0GA 4WEYA 1AAZA 2YCDA 2FHEA 1USBA 4OO5A 3IDVA 1OC9B 1XWAA 2FNOA 2X8CA 4IJ3A 2I81A 5DALB 3QAGA 3GRXA 1EGRA 1EOHA 2O89A 4X0XA 4FH8A 4I97A 3ZMKA 4HI7A 1AQVA 2VD1A 5KEJA 4BPYA 1PX6A 1X5DA 3FK8A 4MPGA 2CVBA 2YPMA 4EKZA 2LJRA 3KZQA 2F9SA 1AQXA 2IWTA 1FB0A 3HVXA 4O92A 3DMLA 2IMDA 2GQKA 4POMA 4HEA2 4KE3A 4TXOB 3LG6A 3KCMA 4NHWA 1A0RP 3Q74A 4G2EA 4KSOA 4KH7A 2PMTA 4PQIA 1X5CA 4KDUA 3UVHA 4XS4B 4MK3A 3GKXA 5ECOB 1M2AA 3TKSA 2FWFA 3GTUA 1YJ6A 2BJXA 2QGVA 1AW9A 5H5SA 1GNWA 1H4OA 2C0EA 2C80A 5IQYA 1AUCA 4PUFC 3TGZA 3EC3A 3EE2A 5DJMA 3M8NA 3F4TA 5HR0A 1WPIA 2MZCA 2CAIA 2B5XA 4J2FA 2GT6A 1KEBA 2I1UA 4EO3A 3FR3A 1YEXA 2OBKA 1ZMAA 5IMZA 2YN1A 4G9HA 3RAZA 4V2NA 2LTKA 4AF2A 4LLRA 2FGXA 4V2LA 1GL8A 1TRUA 2R2JA 2O7KA 2VCXA 4WF5A 2G2QA 2ZNMA 1Z9HA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chain Sequence

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