2IIYA

Crystal structure of s-nitroso thioredoxin
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
103
Chain Sequence
b'MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDQDVASEEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Buried s-nitrosocysteine revealed in crystal structures of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 103
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2iiyA00
2CVDA 4HI7A 3D22A 3KM6A 3WD6A 1GUHA 4HEA2 2PPTA 5F0GA 1SK0A 1K0BA 4TW5A 1WPIA 4BPYA 3V1WA 3FK8A 1EP7A 3PGTA 1F37A 7GSSA 5ELAA 3CRUA 1SKWB 4NPBA 5C04A 3TRQA 4OO5A 1MD3A 3LEFA 2JSYA 2KUCA 3EE2A 1THOA 2H01A 1XOAA 5ECPB 2GGTA 3BD2A 2H72A 2DIYA 2JSZA 1GUKA 3IDVA 2L57A 1NHYA 5J3RA 2OJLA 1H4OA 1HNCA 4FH8A 1NSWA 1B9YC 1GWCA 3BOAA 2I3YA 4Q5RA 2CAQA 4IW9A 1TP9A 4F82A 5ECNB 1Y6EA 2DSAA 3F3QA 3H1NA 2YV9A 3WGDA 1O8XA 1USBA 4I6XA 1XVWA 5KN0A 2VCTA 4TRXA 5AGYA 2AYTA 3F6DA 2IMDA 3HY2A 5D9TA 4HUAA 5LD0A 2GS3A 2MBSA 5G5EA 3UBLA 4XS4B 2KP1A 3HA9A 2L5LA 3CYNA 4ACSA 1GLQA 4OO4A 4ZBAA 1YEPA 1ST9A 3M9JA 4I2UA 4PURA 3HKRA 1TU7A 1BX9A 2OE0A 1WRYA 1K0OA 1XW9A 4ZL9A 5IPHA 4ZB8A 1X9MB 2VLVA 2LNSA 4MF5A 5B8AA 3TKSC 4Q5FA 4XS6A 3MNGA 2B5XA 2C4JA 2LJKA 6GSWA 1S3DA 3CMIA 1NM3A 3GKNA 3C1SA 4KGIA 4HU7A 4KUNA 1TI3A 3GIXA 2DJ2A 1IYHA 1O7UA 3HHVA 4JR6A 4PQ1A 1M2DA 1ZYQB 2H70A 1QFNA 3ME8A 3WGEA 5JWRB 2VM1A 5F07A 2H0GA 2H76A 2V1MA 3L0HA 2K9FA 2EIOA 2GTUA 1UN2A 2K18A 3LYPA 1YQ1A 3G7IA 3HDCA 3TB2A 2HFDA 2K6VA 2B7KA 4BVYA 4POLA 2KOKA 4ECIA 1SKSB 2CX4A 1OC9B 2LSTA 1E2YA 3AY8A 16GSA 3DWVA 5ECSA 2MMZA 4NAXA 3TUEA 4DEJA 3L4NA 3EVIA 5AIXA 2V6KA 2HYXA 4PX1A 2RLIA 4ID0A 3ZVJD 1PRXA 3ZL5A 1ERWA 2B5EA 3G9BA 3APSA 2IMFA 2CZ3A 4NWYA 2OE3A 1YF0A 1EEJA 1THXA 2YV7A 2NDOA 4AJ7A 1AC1A 5JWQB 2E7PA 8GSSA 3EINA 1HD2A 5IMFA 3UVTA 4MZCA 2PU9C 1G6WA 4N11A 1K3OA 1PGTA 1VF1A 1M2BA 1Q4JA 1TK8B 5ECQB 2OADA 4PUAA 5ECHB 3UIWA 2GSRA 3E3EA 1JFUA 4GQCA 1MD4A 2H8LA 3GN3A 4FIWA 5IMZA 1SL1B 4F9ZA 1XCCA 1T4ZA 2AAWA 3ZFLA 2HLSA 1ABAA 3H8QA 1V40A 1BYEA 1FOVA 4KB3A 1XWGA 2DMMA 2CAIA 2P31A 5D9XA 3TJJA 2QC7A 1XFLA 4WF4A 3QMXA 3GURA 1XWBA 1OYJA 3O76A 4EO3A 3PINA 4K0GA 2H1GA 3UVHA 1PL2A 2O8VB 1GRXA 5EL8A 3LSZA 2LNTA 1BAYA 4V1Ap 4RUVA 1FVJA 1GL8A 2VLTA 1M9BA 3IXRA 1J9BA 2OE1A 1U87A 5B8BA 1UC7A 4MH3A 1EOGA 4GF0A 5B7CA 2GQKA 10GSA 4WKWA 1FB6A 4NXIA 4WR5A 1N8JA 3QAVA 1K0AA 3US3A 2DMLA 1X9WB 3HCZA 1TJDA 2Z9SA 2B7JA 4J56E 3Q6OA 3IHQA 2H6XA 2ALBA 3IA1A 2N5FA 2WRTA 4KCAA 1E6BA 2O7KA 2DBCA 2VL9A 1KNGA 2IN3A 3CSHA 5D9WA 1FO5A 3KMNA 5D96A 2R3XA 1WP0A 4DVCA 17GSA 4POMA 4JZQA 1XWKA 4AF2A 2P5RA 1VF2A 5DAKA 3GYKA 1SJIA 5FHIA 4MP4A 4Q5NA 1SU9A 1S3AA 3TJBA 4MK3A 4HJMA 5F06A 3FR9A 1OC9A 1VRSD 2XPEA 1DSBA 3TDGA 3DGQA 3Q19A 3HVXA 5FT3A 5CAXA 2J9HA 4V1Ag 1VF4A 1B4QA 3VFIA 2FNOA 3FW2A 3KP9A 1U3IA 2WFCA 3KZQA 2MYGA 3C73A 3RBTA 2H74A 4FO5A 2FA8A 3CSJA 4ZILA 1TU8A 4EE0A 4GWRA 1J0FA 4WEYA 1PMTA 4IS0A 4OCEA 2HZEB 2WS2A 5ID2B 1G7OA 1YKAA 4LMWA 1F9MA 2VD0A 4NMUA 4IJ3A 2PGTA 3D5JA 3HJMA 4L8EA 5IPGA 2MMNA 2AJQB 1FHEA 1OC3A 1JZWA 4QQ7A 1XZOA 2GLRA 2EC4A 3UOMA 2REMA 1AAZA 3FZ5A 2JL4A 4N30A 3F3RA 1SKRB 1X0RA 3QCPA 1FG4A 4CDOA 4F03A 4TR1A 2M80A 4GXZA 4L5LA 4YQUA 6GSTA 3J7Yk 4KDUA 4DSRA 1JZDA 2WJUA 3QAWA 2RUFA 4P3YB 1PKZA 1M7TA 2PN8A 1Z3EA 2FD3A 3ED3A 3DEXA 5DCHA 3IR4A 3GTUB 4RQXA 1AW9A 3M0FA 2OA7A 1GSYA 1PKWA 2YPMA 5H5QA 1LBKA 4RI7A 3RHCA 4MH2A 4CHSA 3I43A 5DJMA 2DLXA 3LXTA 3TRXA 4K6XA 4ECCA 4K9ZA 2H0IA 3QPMA 4TXVA 2V32A 3LGCA 1MDKA 1YKCA 4Z7XA 1XVQA 2VD1A 4MZBA 3IC4A 3F6FA 3APOA 2HZFA 4WETA 1PX6A 2AHEA 3W8SA 3TJFA 3GSSA 3M3MA 2LV3A 4LLRA 2GQMA 2F9SA 4EF0A 3EURA 1YEXA 5ENUA 5HR1A 2H66A 5G1KA 3KH7A 1DBYA 4G19A 1YJ6A 2VCXA 3VWVA 2F8FA 3BCKA 1SK2A 3D0ZA 3KTBA 2C0GA 3S9FA 1ZL9A 2OACA 3N5OA 1WIKA 1SL0B 2LS5A 2R37A 2V6OA 1XXUA 3CSIA 3U6VA 2CZ2A 2GT6A 5CRWA 1JLVA 2YJHA 1GP1A 3ZRDA 3ZYWA 2BTOT 3GH9A 3QOUA 4NHWA 5G2ZA 5DALB 2VAFA 1PL1A 1XPVA 2GSTA 2WZ9A 2NPBA 3IRAA 3PR8A 5GAND 1T1VA 1O73A 3UBKA 4IVFA 5CNWA 1EWXA 2N5BA 4GSSA 3GRXA 1GNWA 1U88A 3MSZA 3VWUA 1OVNA 4X1UA 5CRHA 2TIRA 5IO2A 2A2SA 4K7NA 4LA1A 3F4SA 12GSA 3A5WA 1SYXA 3NOFA 1F3AA 3KMOA 2VM2A 4WBJA 1ILOA 3GL3A 3VURA 5D73A 1YZXA 3CXGA 3LJRA 2LJAA 5J5NA 4IGJA 2R6KA 4PQIA 5G5FA 5HFGA 1WOUA 2IJYA 4MCUA 2H1DA 2H1BA 3GA4A 3P90A 3QDNA 3IPZA 3CBUA 1LU4A 3GL5A 1A24A 5DCGA 1N2AA 3KP8A 1R4WA 5FWGA 1MTCA 3DVWA 4O7HA 5IM9A 3W6GA 3HJPA 4PNGA 4BL7A 5JCWA 1XBSA 2NVLA 1PN9A 3FR6A 3IE3A 5ECMB 4G10A 1A2MA 5G30A 1QUWA 1HQOA 3FR3A 2H30A 5D9VA 2QKEA 5GAPD 5J9BA 5E59A 2KHPA 1BJXA 4LL4B 3LORA 2HRFA 5COHA 2PVQA 3UMAA 1J08A 2PWJA 4MDCA 11GSA 1UA5A 2KP2A 4AGSA 4DSSA 2IIYA 2H19A 2HXKA 2YZUA 3GX0A 1PQNA 1B8XA 3GX8A 2HSHA 1GLPA 3ZFBA 1G6YA 2JACA 4MABA 5IMVA 22GSA 4IHUA 1B4PA 3VWWA 5ECRB 2YWOA 1FW1A 3L9VA 2F8AA 4Q5QA 1X5DA 4MJBA 3OR5A 2RUEA 4EDYA 1Z7PA 2FCHA 5DALA 1XIYA 1XW5A 3PH9A 1HNAA 3H93A 2JZRA 3DD3A 3F0IA 1GSEA 5JCUA 2CVBA 1V57A 3LYKA 2A4VA 2O89A 1ON4A 1TXXA 4ZL7A 5INYA 3GMFA 4E8EA 4ML6A 1T7PB 2ON5A 4ZB6A 3NZNA 4TXOB 1PSQA 1C72A 1F6MC 2X99A 1TRWA 2DJ1A 1O81A 3C1RA 2CT6A 4L0WA 2YNXA 1OKDA 1TDIA 3K8NA 1HNBA 5DVBA 2FY6A 4N10A 4HOJA 3KGKA 2B1KA 2PERA 3R2QA 5F8BA 3KTLA 4PUFC 2FWEA 3DXBA 6GSSA 14GSA 4X0XA 1LJRA 5IQYA 1I9DA 4JBBA 1MDIA 2VL2A 4YQMA 2OBIA 2IWTA 1GTAA 2DC5A 2HI7A 3IAM2 1Q98A 2XPDA 1WMJA 1SJZA 5ECIB 1QMVA 4J2FA 2V41A 4NHZA 5J4UA 4XS4A 1Z6MA 1F3BA 4ZBBA 2WB9A 3ERGA 3I6AA 4GQFA 4JEDA 5GSSA 2FUG2 1OC8A 3D21A 2IL3A 2DJJA 2C80A 4YQVA 1A23A 1RK4A 3A3TA 5AIVA 4YAVA 3IAS2 1K0NA 2DJ3A 6GSUA 2C3NA 3FZ9A 1EV4A 4O32A 4OFTA 3IK9A 3GHAA 3L9SA 3M9KA 2PBJA 3ZMKA 2E0QA 4LL1B 4PQHA 2ON7A 1QK8A 2GVPA 3LQ7A 2F51A 1GTIA 3RPPA 2AUVA 4KDYA 2K8SA 2MBTA 2FLSA 5IMDA 3H4KA 1FAAA 5IMAA 2R4VA 1MEKA 5IO0A 1GNEA 2H71A 2H6ZA 3KCMA 3QFBC 4XCSA 1EZKA 4D73B 1TRUA 4FYUA 1TW9A 2LRNA 2C0FA 1NHOA 3TOTA 1W4VA 2WCIA 5CRDA 2OKAA 2FHEA 1ERUA 1UVZA 5IMCA 2ZNMA 3FRCA 3D4MA 4TR3A 4AJ6A 2HT9A 5JCGA 1OAZA 4MJAA 1BQ7A 4OD7A 3EMPA 5HFKA 5E4WA 3EU3A 3DRNA 2CV4A 3ZLPA 3ZREA 2A2RA 4MF6A 4HZ2A 3FZAA 3NIVA 5H5SA 3H79A 4ZBDA 1AQVA 4K1FA 5CO3A 2BJXA 4I2TA 3TCOA 2K8VA 3FHKA 1ZOFA 1KBNA 2ZUPA 4ZXGA 1ERTA 2EIQA 1TKDB 4K2DA 4K7OA 2HRNA 1OKTA 4FYBA 4TVEA 5AN1A 4GLTA 2C3TA 13GSA 5EPFA 1JZOA 2TRXA 3TOUA 1URMA 2C0DA 2B6MA 5GZZB 4PNFA 4KW6A 3W8JA 2RM6A 3HJOA 1BG5A 2FWHA 5AISA 3GKXA 4JRRA 1GSFA 1TOFA 5DQYA 3D6IA 4TKYA 4F2IA 4MF7A 2YWNA 4NV2A 3EYTA 4WXTA 3ERWA 3F8UA 5GSTA 2OBKA 1YY7A 2B3SA 4TR0A 2ES7A 3FKFA 2DJKA 1GSQA 3TKPA 4KCEA 3GNJA 3GKMA 4OCFA 4I5QA 3FY7A 2HE3A 2GSSA 2NBSA 3QD9A 1K3LA 1R5PA 1SENA 5CYYA 6GSVA 1XWAA 5EY6A 1K3YA 1RQMA 1PD21 3CTFA 1OE7A 2H1AA 1FVKA 1K0MA 2D2ZA 2H75A 1ZCPA 4L5OA 4IP6A 4ECBA 2O87A 4TOPA 4G2EA 3FZ4A 4V2LA 3UARA 1DUGA 4MMMA 2VO4A 1XWCA 3GFKA 2HSYA 4OMVA 1ZZYA 3WT1A 4K0NA 1Z9HA 4PXOA 4D73A 2WULA 3BBYA 3TKSA 3KD0A 4IKHA 5A4UA 4YH2A 5KN3A 2YP6A 3DMLA 1YF1A 4XRAA 1TK5B 1A2JA 3EU4A 3TKRA 5G31A 1O8WA 2DIZA 3VLNA 2M72A 5EVOA 1TTZA 5KEJA 4HS1A 5HR0A 4MPGA 5B6MA 1O6JA 5A4VA 3O3TA 4OWYA 4MPFA 1KTEA 3LXZA 4KA0A 1EOHA 2PMTA 3TKQA 5G1LA 4POKA 3TRPA 5IOWA 2HZEA 5ID2A 3KJYA 3O6TA 4GTUA 1M0UA 1EGOA 1T00A 1TRSA 4IP1A 2VLUA 1ACVA 2L5OA 1T8EB 5CP1A 4MA9A 2PVOC 5J9CA 1V58A 4IBPA 5HFIA 1PX7A 2IPAA 2H0HA 2GQLA 3E9JB 2QSIA 1YDKA 3G7YA 19GSA 5A5KA 3WYWA 2GDRA 1OE8A 2FWGA 5CRGA 4HJ2A 4LMVA 3LG6A 3F9UA 3ZTLA 4E8HA 4KSMA 4H86A 1TK0B 3CRTA 2AV4A 2JZSA 4HQSA 4XRDA 2YZHA 2LRTA 1A8LA 3LWAA 2I9HA 1GSDA 3VPTA 2VIMA 3RAZA 3ZVJA 2B5YA 3GTUA 4WR4A 2XHFA 1A0FA 4NV5A 1XW6A 4KSOA 2VL3A 2HNLA 3UAPA 4EVMA 1SYRA 3GUSA 2EIRA 2GT5A 3BCIA 3FEUA 2YN1A 1T3BA 1GSSA 2VCQA 5D93A 2VCWA 1ML6A 9GSSA 2PUKC 2YWIA 2P0GA 1A2LA 2LUSA 2ZCTA 3RDWA 2L4CA 2C8UA 3EWLA 1ERVA 1GH2A 2B1LA 4EUYA 3MDKA 1XOBA 2FWFA 4KE3A 3TJGA 1S3CA 2KLXA 3WGXA 1VGLA 20GSA 2FA4A 1G7EA 2FGXA 5DQSA 1W89A 3HZ8A 1WWJA 2H73A 3KIJA 5H5RA 1GTUA 2LTKA 4L0UA 3ZITA 3ZIJA 4ZB9A 3M1GA 3QAGA 2TRCP 4N0ZA 5LNKe 5D8IA 3JCML 3RPNA 3E0UA 4BWQA 2E2MA 4IJIA 1EP8A 3SWLA 1HYUA 5IIZA 3APQA 1SD9A 2VCVA 1AUCA 1U3AA 5DAKB 4WF5A 4IN0A 2X8HA 3IK7A 3P2AA 18GSA 4PGTA 2VOCA 3A2VA 4TR4A 5A4WA 3KXOA 3N9JA 3HXSA 3Q18A 1WE0A 2IFQB 4IQ1A 2BMXA 4BVXA 4GSTA 4KDXA 2VUPA 2GZPA 3M8NA 3QFAC 5DJLA 1TI1A 2XBIA 2NTOA 4QL7A 4JE1A 1V9WA 3TKSE 5KN1A 2YWMA 1R7HA 3CTGA 5HR3A 4BA7A 1CQHA 2LJRA 3VI7A 4F0BA 1QQ2A 6GSXA 2YCDA 2E2GA 3ERFA 2WGRA 4GCIA 4EXJA 3FYGA 5ECOB 2X64A 3LFLA 4HDEA 4KH7A 3GH6A 3SBCA 2LRCA 1GSUA 3GSTA 3VPQA 3Q74A 4DSQA 2L4QA 2YANA 1FB0A 4V2NA 2G0FA 1QGVA 5B6NA 2IMEA 4TR1B 2P5QA 1QXHA 4KX4A 3UEMA 3DIEA 2MMAA 4ECJA 1DE1A 1AQXA 2I81A 4BWSA 4K8MA 2DJ0A 1JLWA 5F05A 4AJ8A 4IELA 5CREA 3C8EA 4ISDA 1V2AA 1X5EA 2LEGA 4ML1A 2H6YA 3A2XA 1F2EA 4JU5A 4ULXA 1ZMAA 2M46A 1Z7RA 3GV1A 1SD8A 2YOIA 1DE2A 1JZRA 2LKUA 4ZL8A 4XS1A 3C71A 3BJ5A 3P7XA 2CX3A 4RQRA 3F63A 1M9AA 5LCZA 2JU5A 3D4TA 5ELGA 4N0VA 2MMOA 3ME7A 1SK1A 4MJCA 3KH9A 2CVKA 2LQQA 4OFMA 3MAKA 2VCZA 1U6TA 1M99A 1IYIA 2RIIA 1NW2A 3ZMLA 1SL2B 2GSQA 4EC0A 2F3MA 2V2GA 3RHBA 4XTSA 3DKSA 3F4RA 3U5RE 1V98A 3HVVA 2G2QA 3J7Yb 3EMXA 4MZWA 1O85A 2IMKA 2X8CA 4GSNA 2C3QA 1TRVA 3VI5A 1H75A 2LQOA 3A2WA 2C0EA 2XC2A 4CW9A 4EL1A 3ZZXA 2C1YA 5JWOB 4O92A 1M2AA 2XBQA 3GKKA 3QR6A 4MJEA 3MWHA 1B9XC 1GULA 2IFQA 2L6CA 3IOSA 2AB6A 3DVXA 3UL3A 5L71A 2QGVA 1R5AA 4K7IA 1VF3A 3L78A 4TXOA 4HZ4A 3HZ4A 5J41A 5HR2A 4V2MA 1PA3A 1T4YA 2VL2C 1AQWA 3L9UA 4POBA 1I5GA 4ILFA 1A0RP 3KEBA 5ECLB 3ZIVA 4XIHA 5C00A 4F0CA 4TN8A 4I97A 1A8YA 4QL9A 1Z5YE 4GRFA 1CQGA 2I4AA 5DBQA 3ISOA 2JZTA 3G7JA 3TJKA 2J23A 3VK9A 4OFNA 1ZGNA 1JHBA 2GZZA 1Z6NA 3P8WA 1G0TA 4JR4A 3C7MA 4EKZA 6GSYA 5HQPA 2L6DA 4HQZA 1K0DA 1ZYEA 2IMIA 4O5RA 3F4TA 2CQ9A 1RW1A 5KN2A 1GUMA 4XHMA 2R2JA 1GTBA 3HD5A 1X9SB 3UJ1A 1WJKA 2O85A 4EDZA 1EGRA 1AIUA 1X5CA 4YAPA 3HVSA 4KNDA 1EEMA 3VWXA 2R5GA 3I69A 3TGZA 3WT2A 3HYPA 5ABRA 2RM5A 3I9V2 4IQAA 1AXDA 4G9HA 2JADA 3DYRA 2X8GA 1SJ6A 4WBRD 1B48A 2GZYA 3IBHA 5ECKB 2I1UA 4MLYA 2CA8A 1KEBA 4FYCA 2MZCA 5IOXA 2L59A 1MDJA 3IV4A 4RI6A 2YJ7A 4ZIJA 2WDUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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