2IIYA

Crystal structure of s-nitroso thioredoxin
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
103
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDQDVASEEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Buried s-nitrosocysteine revealed in crystal structures of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 103
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2iiyA00
2PERA 1PA3A 5B8BA 3HJOA 4OCFA 3E3EA 1WWJA 1NHOA 3VPQA 1W89A 3F8UA 4EF0A 2VCQA 4O92A 3RDWA 2HSHA 1B9YC 2B5XA 2ZUPA 5JWQB 3I9V2 5H5QA 1I9DA 3VWXA 3HZ4A 2YNXA 5C04A 4HEA2 4EE0A 2TRXA 3DD3A 2H76A 2YP6A 2I1UA 3L78A 1USBA 10GSA 4RI6A 2LS5A 1GULA 1M2BA 2KP1A 5GSSA 4YAPA 3GRXA 1RK4A 3ZZXA 4J2FA 4DSRA 4N30A 1ZYQB 1EEJA 5ECOB 3UOMA 4KCEA 2H6ZA 3CYNA 2DMMA 2H72A 2HRNA 1QQ2A 2YWNA 5IOXA 5G30A 2VOCA 2GSTA 4E8EA 3QPMA 1XWGA 3ZMLA 5A5KA 4RUVA 4PNGA 4ISDA 4YH2A 2OADA 1GSQA 3GKKA 3DVXA 3ZLPA 4KUNA 3LFLA 4EO3A 5B8AA 5D9WA 1TI1A 4POLA 2GDRA 2VD0A 2VL3A 3VI5A 2TIRA 5G1LA 3AY8A 4X43A 1K0AA 1SKWB 2XBIA 3D22A 3LJRA 2VCVA 2HZFA 2EIOA 22GSA 4ECJA 4YAVA 2YANA 2C0GA 2VIMA 4HUAA 4XTSA 3M8NA 4IN0A 1X5DA 1VGLA 4F0CA 3CXGA 1SK1A 2EC4A 2JSYA 3VWWA 1HNBA 1GUMA 1OC9B 4HQZA 5J5NA 5J3RA 1LU4A 3L0HA 4FYCA 3QD9A 2D2ZA 1ZYEA 5ECKB 5IMDA 1N2AA 3QOUA 4AJ8A 4XRDA 1XPVA 4RQRA 1U87A 2L6CA 2H8LA 4L8EA 2JU5A 2HI7A 3IK9A 4ZL7A 4TW5A 4TR4A 1HNAA 3V1WA 1O73A 3KJYA 1GSDA 4HJ2A 4NHZA 4WETA 3ZVJA 4BVXA 1FAAA 2H19A 1BYEA 3IAS2 3UARA 1GSUA 1G6WA 1T7PB 4L0UA 1B48A 4XS4A 2F8FA 1TXXA 4TR3A 2GVPA 3QAGA 2YPMA 2V6KA 4TOPA 2GT5A 2E2MA 2A2RA 2C3NA 2B6MA 2FWEA 4NMUA 3CMIA 2XC2A 1G6YA 2GTUA 2XPEA 1BJXA 2C8UA 2MBSA 2YV9A 3UVHA 1SL2B 4GSTA 1UN2A 3KTLA 3N9JA 5D93A 3F6DA 2GQMA 2RM6A 3LQ7A 3ZL5A 2GSQA 2VO4A 1WRYA 3G9BA 3Q18A 1EV9A 4PGTA 3G7JA 1JZWA 4XCSA 4GLTA 1ERVA 3KIJA 2LNSA 4POMA 4EC0A 1XWKA 1MD4A 1ZMAA 3KH7A 2DJ0A 3HXSA 4XS1A 2X64A 1XBSA 3TJKA 2DMLA 2Z9SA 3JCML 1G7EA 2FA8A 2R37A 5CREA 5ENUA 4ZL9A 3TKQA 4N0VA 3LG6A 4XS4B 3WT1A 2FNOA 3IAM2 1T3BA 3TKSC 1F2EA 3BOAA 1S3CA 3EU3A 5EVOA 3QCPA 5J9CA 1V40A 1XW6A 2XBQA 4N0ZA 1SENA 2C1YA 5DJLA 4ZXGA 1M7TA 3H93A 1GWCA 3IHQA 3IK7A 1DSBA 2WFCA 3DXBA 4KDXA 3ZMKA 2JSZA 1G0TA 4P3YB 4E8HA 3CTGA 1SJ6A 3GHAA 3DWVA 1WIKA 1EOGA 2H66A 1U3IA 2HXKA 2VLUA 4PUAA 1X9SB 2O87A 4HI7A 4EVMA 2C3TA 5IM9A 2L57A 2EIQA 1J08A 3DGQA 2IMFA 2H70A 1R4WA 3LXTA 4I5QA 5G5FA 3I6AA 1FO5A 2MZCA 5F0GA 5F06A 3ERWA 4IJ3A 5DVBA 2IL3A 5CRGA 2AYTA 4KSOA 2CQ9A 2JZTA 4BL7A 2IWTA 3KP8A 1GUHA 1SD8A 2CVKA 2L5OA 1A8LA 4BWSA 2GZZA 2WGRA 1RW1A 5DAKA 4CHSA 1FG4A 2WRTA 2BMXA 3GUSA 1XWAA 1PRXA 1Z6NA 5ECPB 1ZL9A 3C73A 2B1LA 4GQCA 1SL0B 2LSTA 4XRAA 5DQSA 2JL4A 3QAVA 3F6FA 4OD7A 1A8YA 2YJ7A 4MJEA 4QL7A 1EOHA 1PL1A 2JADA 2C0DA 2B7KA 1GLPA 3BJ5A 2PPTA 4IGJA 1QK8A 3VURA 1AW9A 2KLXA 1EP8A 4PUFC 2YWIA 4JBBA 5IMZA 5COHA 5HR1A 2OBIA 4JE1A 5AIVA 5DCHA 5JWRB 1R5PA 3APOA 3HVSA 4ECBA 2LEGA 2OKAA 4I97A 4TXVA 4EL1A 2F8AA 2F51A 2F9SA 3CSIA 1PKWA 2O89A 4K9ZA 1VF2A 4KCAA 3TJJA 4MH3A 4GF0A 2B5YA 1S3DA 5DAKB 2L5LA 1F9MA 2I4AA 1V57A 3FY7A 1J0FA 4TR0A 3A5WA 5IQYA 4BVYA 5IPGA 1AXDA 5CRHA 3LWAA 5DQYA 1JLWA 3US3A 2VLVA 4GCIA 2LV3A 1XW9A 4ZB8A 3VWUA 2MMAA 3FW2A 4MCUA 4TVEA 2H01A 4MABA 4IW9A 1SK2A 3Q6OA 4KW6A 3FRCA 3U5RE 4ZB6A 2K8VA 2X8GA 2GQLA 2H1DA 3LXZA 4WKWA 1F6MC 1YY7A 3TB2A 1QFNA 2IN3A 2C0EA 2E2GA 2VM2A 2YZHA 1ZGNA 1TTZA 2FA4A 3ZTLA 4OO5A 5F07A 3WD6A 3VPTA 1YQ1A 3FR3A 3UAPA 1KTEA 5AIXA 3D6IA 3F0IA 3ZVJD 2H1AA 1GLQA 4GSNA 1X9WB 4ZL8A 3MWHA 1JHBA 1RQMA 4WEYA 3EMPA 1JZRA 5HQPA 4ZIJA 5JWOB 3RBTA 2VM1A 2LTKA 5D8IA 2KHPA 4ECIA 2XPDA 1O8XA 3KTBA 4MK3A 2C4JA 3RHCA 4FIWA 2AAWA 2FLSA 3RHBA 2HSYA 4PNFA 1XVWA 4J56E 2ZNMA 4ECCA 2WDUA 1ACVA 2X8CA 5G31A 2B7JA 3MDKA 3EC3A 3P90A 1BG5A 1GTUA 3OR5A 4OFNA 2VL2A 2IMKA 5ECSA 4WR5A 3F3QA 1SJIA 2REMA 4IQ1A 3FR9A 5G1KA 2PBJA 3CSJA 1MTCA 3LYPA 2KOKA 2FY6A 2OE1A 1K0DA 2AUVA 5LNKe 3GIXA 4X0XA 2CX4A 4MP4A 3HJMA 5J4UA 3RPNA 3M9JA 1OC9A 1FVKA 4Z7XA 4F03A 3ZITA 3GNJA 3E9JB 2DIZA 3W8SA 2AV4A 2OJLA 4TR1A 2YV7A 4AF2A 4Q5RA 1V9WA 2VLTA 5CO3A 1K3YA 2WS2A 5DDLA 4NV2A 2L4CA 5IMCA 5F8BA 3WGEA 1AAZA 4WBRD 3GH6A 5EL8A 3D21A 2VL2C 1TK5B 2K6VA 3GSTA 1H75A 3UL3A 2O7KA 2DSAA 4ID0A 2QKEA 3BBYA 1B4QA 4K7IA 1MD3A 2R5GA 4MPGA 5HFIA 2MMOA 5ECQB 1VF3A 3F4TA 1QUWA 3RPPA 3J7Yk 1SYRA 1JLVA 4NWYA 3PGTA 2RUFA 3GYKA 3HY2A 4PX1A 3TJBA 2LKUA 2I9HA 2PVQA 5IOWA 5D96A 4F2IA 1AIUA 3W6GA 3DRNA 1YJ6A 1NSWA 2FHEA 1XW5A 1SJZA 2GZPA 4IVFA 4X1UA 4TR1B 1YKCA 4DEJA 3LEFA 4I8BA 2CAQA 1I5GA 2I81A 4L5LA 4GXZA 3BD2A 4HOJA 2CZ2A 5ID2A 2LNTA 3M1GA 3KXOA 3UBKA 2ON7A 1TJDA 1EGOA 1GSFA 2IMDA 4HZ4A 1TOFA 1F37A 4IQAA 3TRXA 3CTFA 2DJ1A 2CAIA 1GSEA 3R2QA 3FZ5A 4K7OA 3KD0A 2CT6A 2WJUA 1OKDA 1YF0A 3HKRA 3P8WA 4RI7A 2VCWA 2IIYA 3NIVA 1JZOA 3PR8A 1YF1A 2WB9A 5KEJA 2RLIA 3ZIJA 1SKRB 1GTIA 1ML6A 4POKA 3TKPA 4HU9A 2C3QA 3IXRA 1GNEA 2VD1A 3TKSA 3TKSE 4KNDA 4I2UA 4LMWA 2J9HA 5DALA 1URMA 3QR6A 2N5AA 3L4NA 2R6KA 4V2NA 1BAYA 2DBCA 5AGYA 2H73A 3D5JA 1O6JA 3WGXA 2GGTA 1G7OA 2HNLA 3SWLA 1O85A 5ID2B 3LGCA 2QSIA 5ECMB 3VWVA 2V32A 4MF5A 3ERGA 3GX8A 1K0NA 4JR4A 5G5EA 1TP9A 3LSZA 2N5BA 5C00A 5ECIB 5HR2A 2MMZA 2OBKA 1TKDB 4WR4A 1K0CA 2CZ3A 3GL5A 1THXA 3HZ8A 2FWHA 20GSA 4GRFA 1WOUA 19GSA 3CRUA 4ML6A 3GMFA 3WT2A 2GQKA 1YKAA 4G19A 5FT3A 4IS0A 4MJAA 2JZRA 3KZQA 1TU8A 2GLRA 1KBNA 5IIZA 1SK0A 5CRDA 3KGKA 1BQ7A 1PGTA 1HQOA 9GSSA 2IMEA 4MA9A 1PN9A 2DJJA 4BPYA 2H0GA 2EIRA 3O3TA 3EURA 3A3TA 4LA1A 5DALB 3GTUA 3H79A 2OACA 1J9BA 3P2AA 3BCKA 5IMVA 5INYA 1TRVA 1ERWA 1GNWA 1R26A 2AHEA 4TRXA 1T1VA 1QGVA 4YQUA 2OE0A 2MYGA 3F3RA 4V1Ap 3G7IA 2FCHA 1PKZA 2KP2A 2P31A 3LYKA 5ABRA 2DC5A 3M9KA 1BEDA 2LJAA 4EKZA 3ZIVA 4HU7A 2AB6A 1DUGA 1MDKA 1UA5A 4POBA 4ZBAA 2G0FA 1HYUA 3TOTA 1XFLA 2M80A 2YCDA 2FGXA 1WE0A 3FR6A 4GWRA 3NOFA 2LRTA 3LORA 4PURA 4MH2A 3P7XA 3ZRDA 1XZOA 3L9UA 4I2TA 2V2GA 2VCTA 1WJKA 1AC1A 4HJMA 1K3OA 3GTUB 3GN3A 1A2JA 1FHEA 5JCWA 1NW2A 2H30A 1A2LA 3QFBC 2VL9A 18GSA 3HJPA 1VRSD 2IFQA 3KM6A 3HVXA 3BCIA 3TDGA 4OO4A 4MDCA 4L5OA 4FO5A 4NAXA 1EZKA 2R4VA 3ED3A 4EDZA 5G2ZA 1A24A 2PN8A 5ELAA 4CW9A 1ERUA 2B1KA 1GSSA 4KDYA 4KB3A 4RQXA 2ON5A 1OE7A 3H4KA 3QAWA 1GSYA 2H0HA 3I43A 3FYGA 3F9UA 2G2QA 3D4MA 4K8MA 3A2VA 5D73A 2P0GA 1ZOFA 1OVNA 3IRAA 3QDNA 3TKRA 2WZ9A 1UC7A 5HR3A 1R5AA 5DJMA 4PQIA 1BX9A 3EVIA 3F4RA 1T00A 1TDIA 1NM3A 3TRPA 1GTAA 2IJYA 1OKTA 3TCOA 2VUPA 4MMMA 4O7HA 5CRWA 1GRXA 5FHIA 3C7MA 5ECRB 2IFQB 3Q19A 16GSA 1Q4JA 4LL1B 1ERTA 5LCZA 3ZYWA 1E2YA 4K0GA 3I69A 2NVLA 3KMNA 3QFAC 3UIWA 2IMIA 3S9FA 1TU7A 2J23A 2V6OA 3G7YA 5KN3A 2PWJA 2RUEA 4MJBA 3VFIA 3J7Yb 3IOSA 2O85A 4K1FA 1XOBA 2ALBA 4JRRA 3K8NA 1MDJA 2PUKC 1E6BA 2VAFA 3TUEA 4EUYA 4IKHA 2K18A 1TK8B 4EDYA 2ES7A 4KDUA 2L59A 4JR6A 2H71A 3TGZA 1WP0A 5JCUA 1K0BA 2P5RA 5B7CA 1SD9A 5B6NA 4F82A 2L6DA 3FEUA 1A0FA 3HA9A 4ZBBA 5ECLB 3D4TA 5D9VA 5KN1A 4HS1A 2V41A 3ZREA 2DJ3A 1O81A 2GT6A 1FW1A 3APSA 1N8JA 1B9XC 1PX7A 1M99A 4GSSA 4ACSA 5DCGA 1WMJA 2B3SA 3IA1A 3E0UA 4L0WA 3EYTA 2PGTA 2NDOA 2R2JA 5IMAA 1T4YA 3HCZA 1SL1B 3GKMA 3C8EA 3SBCA 1M9AA 5J41A 2M46A 3FZAA 4DSSB 1GL8A 2VCZA 3N5OA 2NPBA 4KGIA 5HFKA 5IPHA 4XHMA 3GV1A 3GKNA 5GSTA 4KE3A 1AUCA 1U3AA 5J9BA 1PQNA 1X5CA 1VF4A 1MDIA 4TKYA 2HRFA 4N10A 5IO0A 1HNCA 4BA7A 4WF4A 1LBKA 1EV4A 3ME8A 3GA4A 5ELGA 2JZSA 2H0IA 3NZNA 3EU4A 4AJ7A 5A4WA 3HVVA 3DEXA 4K6XA 14GSA 2CX3A 1T4ZA 4EXJA 2WULA 5KN0A 4LLRA 3GL3A 3H1NA 1A0RP 2LRCA 2LRNA 1XIYA 2ZCTA 3DMLA 1XCCA 3DVWA 1HD2A 1OC8A 4FYBA 1SYXA 3ME7A 4NPBA 1EEMA 1R7HA 2LJRA 1U6TA 2DJKA 2GZYA 2DLXA 1TW9A 5CP1A 1NHYA 5HR0A 2FUG2 3DIEA 1DE1A 6GSXA 3D0ZA 2H1GA 1K3LA 4KSMA 2NBSA 5F05A 3GSSA 4NXIA 3QMXA 4DSQA 3VI7A 2MMNA 4H86A 2E0QA 4ZB9A 2FWFA 2C80A 17GSA 1TK0B 1TRSA 4WF5A 1CQGA 3TOUA 3F4SA 12GSA 5A4UA 3ZFBA 3O76A 1M2DA 1KEBA 1FB6A 1MEKA 3M0FA 1LJRA 3VK9A 4MLYA 5JCGA 3GH9A 1JZDA 5GAND 4I6XA 3UBLA 1Z5YE 1ST9A 1WPIA 4YQMA 3UMAA 2QC7A 4N11A 5EY6A 6GSYA 4G2EA 4KH7A 2O8VB 5E4WA 2H6YA 4ULXA 2FWGA 3HYPA 3ISOA 5D9TA 2CVBA 2YJHA 1QMVA 4K2DA 3IE3A 2A2SA 4F0BA 4ZBDA 2YWMA 3W8JA 4PQHA 4MZWA 2KUCA 1FVJA 1Z6MA 4IHUA 5AN1A 2HYXA 3DKSA 1YEPA 1H4OA 4JEDA 1TI3A 1DBYA 3EWLA 1Y25A 3CSHA 2MBTA 2YWOA 4LMVA 2M72A 13GSA 3KMOA 1Q98A 1GH2A 3WGDA 1M2AA 1TRWA 4G10A 1KNGA 6GSUA 1PSQA 2K9FA 4KX4A 3FK8A 4MJCA 2NTOA 2LQQA 1YZXA 4MZBA 6GSVA 1JFUA 2P5QA 3MSZA 4NHWA 2GSSA 1OYJA 1XWCA 3O6TA 4J57E 4OWYA 5H5SA 3KP9A 4WXTA 3RAZA 4IJIA 2C0FA 2BJXA 5DBQA 1M0UA 4Q5NA 5AISA 1FB0A 1PL2A 3CBUA 3IC4A 2N5FA 1X9MB 4ZILA 2R3XA 1ILOA 1DE2A 4AGSA 4TN8A 2HE3A 2K8SA 4O32A 5ECHB 3TJGA 3FZ4A 5HFGA 3M3MA 5CAXA 3WYWA 2QGVA 1V98A 4OFTA 5H5RA 3GFKA 4JZQA 1SKSB 4PXOA 1XWBA 3ERFA 3HHVA 1PX6A 4NV5A 3UJ1A 1EWXA 5CNWA 5GZZB 4V2LA 5A4VA 4IELA 2HZEA 4D73A 6GSWA 2RM5A 1A23A 1FOVA 1X0RA 3IPZA 2E7PA 2LQOA 4G9HA 1O7UA 1T8EB 3FZ9A 4GTUA 4MF7A 4XIHA 3VLNA 1QXHA 3HDCA 3IDVA 2A4VA 3H8QA 4TXOA 5B6MA 6GSTA 1K0MA 1GP1A 4IBPA 3GKXA 3IV4A 3GURA 2GS3A 4DVCA 1OC3A 4BWQA 1Z3EA 3CRTA 2DIYA 3C71A 2TRCP 4AJ6A 1XVQA 1W4VA 2IPAA 5FWGA 3KH9A 3A2WA 4MF6A 2WCIA 4CDOA 4HZ2A 1CQHA 4V1Ag 4PQ1A 3U6VA 3TJFA 1Z7RA 3UVTA 1M9BA 4MPFA 2HT9A 3EINA 2LJKA 2V1MA 3PINA 2HZEB 3EMXA 4D73B 2X8HA 2DJ2A 2F3MA 1AQXA 2JACA 2H74A 2BTOT 2VCXA 3APQA 2OE3A 3IR4A 2L4QA 2PMTA 2CA8A 1TRUA 1YEXA 1Z7PA 1ZCPA 4TXOB 11GSA 1Y6EA 1OAZA 1V58A 3L9VA 1PD21 4O5RA 3KEBA 5CYYA 2AJQB 3HD5A 1F3AA 1O8WA 2PU9C 2YOIA 3A2XA 3DYRA 3FKFA 1A2MA 3F63A 3ZFLA 1F3BA 4Q5FA 5EPFA 2GSRA 1OE8A 5E59A 1S3AA 2PVOC 3L9SA 5KN2A 7GSSA 2B5EA 2I3YA 3TRQA 2H6XA 2HLSA 1AQVA 2RIIA 1ZZYA 1GUKA 3MNGA 1EP7A 1UVZA 3EE2A 1IYHA 1THOA 4HDEA 5D9XA 1Z9HA 4XS6A 3C1RA 2YN1A 5LD0A 1GTBA 3C1SA 1ABAA 2CVDA 2H75A 4F9ZA 5ECNB 1XOAA 1B8XA 4GQFA 4QL9A 4IP6A 1V2AA 1YDKA 4KAEA 2LUSA 2X99A 3UEMA 3FHKA 6GSSA 2CV4A 2YZUA 1AQWA 4OFMA 4FYUA 5GAPD 2HFDA 4OCEA 4ILFA 1EGRA 3Q74A 1VF1A 4WBJA 5IO2A 4QQ7A 4DSSA 4Q5QA 4JU5A 4KA0A 5IMFA 4ML1A 1SU9A 4V2MA 4LL4B 8GSSA 2FD3A 4K7NA 2H1BA 2XHFA 4FH8A 4YQVA 1C72A 3GX0A 1PMTA 1X5EA 3PH9A 4MZCA 2OA7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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