1GP1A

The refined structure of the selenoenzyme glutathione peroxidase at 0.2-nm resolution
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
184
structure length
183
Chain Sequence
RTVYAFSARPLAGGEPFNLSSLRGKVLLIENVASLGTTVRDYTQMNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFMLFEKCEVNGEKAHPLFAFLREVLPTPSDDATALMTDPKFITWSPVCRNDVSWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFLTIDIEPDIETLLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords GLUTATHIONE PEROXIDASE
publication title The refined structure of the selenoenzyme glutathione peroxidase at 0.2-nm resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Oxidoreductase(h2o2(a))
total genus 59
structure length 183
sequence length 184
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 1985-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gp1A00
3VWXA 3G9BA 4F03A 2CZ2A 1HNCA 2FGXA 4G9HA 5ID2A 4WBRD 2YPMA 4GSTA 2IJYA 4IP6A 4CDOA 3DVWA 3L4NA 2PUKC 5B6NA 2V1MA 5J9CA 3I43A 2FNOA 4KGIA 1GP1A 3HJMA 3EURA 4TW5A 1G6YA 3TRQA 3QPMA 2I3YA 2GGTA 3J7Yk 2AYTA 14GSA 5ELAA 2F9SA 1X5EA 1AUCA 2DMLA 3QMXA 1ZGNA 1B8XA 2FHEA 1XWGA 2OJLA 2REMA 2VCTA 1A0RP 3A5WA 3TKRA 2AHEA 2DJJA 3WYWA 2HNLA 1MD3A 1S3DA 3CSJA 3CRUA 4XRDA 1U87A 1EGOA 3TJJA 1XVQA 2DJ0A 1F6MC 1GTUA 4IVFA 3HD5A 3UARA 2H19A 3APOA 1X5DA 1FG4A 3F63A 1MTCA 2GSRA 3ZL5A 1GSQA 1B9XC 1ERTA 5GZZB 1F3AA 4AJ6A 2OBKA 4XTSA 2VL3A 4X1UA 1T1VA 1E2YA 3QOUA 3CBUA 4ZB8A 3M9JA 3D4MA 2IMFA 1T8EB 3QCPA 5F0GA 5D96A 4XS1A 4EUYA 4ID0A 2H74A 2L4QA 3DGQA 2NBSA 3GSTA 4JBBA 3GH9A 5AIXA 5CYYA 2DIYA 18GSA 2HI7A 4YAPA 2JZSA 2L59A 4L0UA 3UEMA 4BVYA 1J08A 2ZNMA 2V6OA 4QQ7A 1UA5A 1XIYA 3F4TA 1XPVA 5LNKe 1S3CA 2FWFA 2CQ9A 3IRAA 4D73A 3TB2A 2M46A 2JZRA 2XPDA 3APSA 3L78A 5HR1A 3E9JB 1YEPA 1M9AA 2PBJA 1XFLA 1ACVA 2RM6A 1QMVA 3ZITA 3VI7A 1BG5A 1TJDA 4WETA 1J0FA 3E0UA 4IJ3A 4G10A 5FHIA 2N5AA 4N11A 3SBCA 1K0DA 4KDXA 3KH7A 5LD0A 2IPAA 4IS0A 3NZNA 1ZYQB 1GNEA 4JZQA 1SL2B 2DSAA 3A3TA 4RQXA 1GLPA 1SL1B 4DEJA 3D21A 2YV7A 2B7JA 2K18A 6GSXA 4D73B 4MPGA 2C1YA 4YQVA 3HYPA 5EVOA 4KDUA 5AN1A 4BL7A 2H8LA 4K9ZA 3GIXA 4WR5A 4HDEA 4MA9A 4QL7A 2C0EA 1JHBA 1M9BA 4K7IA 1PX6A 5A4UA 4EKZA 3S9FA 1G6WA 5IOXA 3EMXA 1AQXA 4PNGA 2WDUA 2LJRA 4QL9A 3H79A 4EVMA 4NAXA 1WMJA 3DRNA 2F51A 3QFAC 1AAZA 4I97A 4MF5A 3GRXA 1PX7A 4TXOA 3RBTA 1WE0A 4Q5RA 1PKZA 1GUKA 3IHQA 3VWVA 3OR5A 4GTUA 4J56E 4OWYA 5LCZA 2Z9SA 4K2DA 3F6DA 2J9HA 2H66A 3FZ9A 4PUFC 2GQLA 3ZFBA 3RHCA 2CZ3A 4IQ1A 4WR4A 3UVTA 3ZVJA 2CVDA 4IP1A 2X8HA 3DD3A 1TRVA 2PU9C 5EL8A 2PPTA 3TRXA 5FT3A 1A8YA 4IN0A 1TU7A 1TDIA 4KCEA 4TKYA 4WF5A 1ZOFA 2YANA 3IA1A 4ECJA 1PSQA 1PQNA 3L9UA 4TXOB 2L4CA 3EVIA 2LQOA 1U88A 1EP7A 2O89A 5J3RA 4TN8A 5B7CA 4RUVA 2EIOA 3APQA 3TJFA 2CX3A 3QAWA 2P0GA 2YJ7A 3EWLA 5JWQB 1OE7A 4PQHA 1AQVA 4HU9A 5DAKA 2HSYA 4MABA 4XS4A 5A4WA 3BBYA 1QFNA 4F0CA 2F3MA 3LXZA 5G1LA 1M0UA 3M1GA 5INYA 1A24A 1WRYA 3D6IA 3F6FA 4LMVA 2WGRA 2BMXA 2AV4A 1A2MA 3UOMA 3GA4A 1FHEA 4I5QA 1XWBA 2O85A 2L6DA 4LMWA 2WULA 6GSSA 3GV1A 2MMAA 2WS2A 4E8HA 3U6VA 1PRXA 4Q5FA 4BWSA 3P90A 4MPFA 1XZOA 1SL0B 2X99A 1R5PA 2C80A 1X9MB 2NPBA 1Z7RA 3EMPA 4RI6A 4TR0A 3ED3A 5DAKB 22GSA 3CSIA 5B8BA 2MBTA 3EC3A 4XS4B 5KN0A 2HZFA 4MF6A 1IYHA 2GDRA 2H6ZA 3A2XA 1PGTA 3C71A 4GXZA 2IMDA 4GCIA 1ILOA 2H72A 3KTBA 3N9JA 3H93A 1V98A 5DJMA 2R3XA 1AXDA 1FB0A 5ECIB 3EYTA 2H0HA 2PVQA 1BAYA 2I4AA 4YQMA 2WZ9A 3HJPA 2NVLA 2LV3A 1T3BA 2L5OA 4EDZA 3WGEA 1UN2A 5DCGA 1X0RA 2LEGA 1JZOA 2IIYA 3W6GA 1EOHA 2HZEA 3GH6A 2LNSA 2QSIA 3LQ7A 4ZBBA 3GX8A 3M3MA 1SD8A 2H71A 2H6YA 5ECRB 4ZB6A 4TR1A 6GSVA 1K3YA 2BJXA 3FHKA 5H5SA 5H5QA 3HHVA 4HJ2A 4DSSA 4KCAA 1B4QA 1ZCPA 3TKPA 4NHWA 4TOPA 2H73A 1TXXA 4XIHA 1F37A 4N0ZA 3IOSA 4FYUA 1M2DA 4PGTA 5IO0A 2ES7A 2GSSA 3I9V2 4IBPA 5JCUA 4I2UA 2DIZA 2E2MA 3CXGA 1XVWA 4TVEA 1XWKA 3BOAA 2B1LA 3MWHA 3QAVA 2HZEB 1YQ1A 4N0VA 8GSSA 2FWHA 3PR8A 3TCOA 1EWXA 1TOFA 3N5OA 4TR1B 3GX0A 5EY6A 2IN3A 3TOUA 4DSSB 5IM9A 3IK9A 4GSNA 1Q98A 4WF4A 2RUFA 4MJCA 1DSBA 1TRWA 4HQSA 1VGLA 4IW9A 4MP4A 4OFNA 2MZCA 2LRCA 4WXTA 2VL9A 3HZ4A 3TUEA 3IK7A 2H70A 2MMNA 2GQKA 1Z5YE 2YWIA 1Y25A 1XW5A 2C3QA 2LSTA 1YKAA 3C73A 4GSSA 1XW9A 5D9WA 3BCKA 5IMVA 4DVCA 4V2LA 2F8AA 2YWOA 1K0OA 2DC5A 4HQZA 4MCUA 1HYUA 2FD3A 3O6TA 5DVBA 3IC4A 2RM5A 3UVHA 5J5NA 4FIWA 1EEJA 1JZWA 3HVVA 2TRXA 5ECNB 2BTOT 1OE8A 2OBIA 1OAZA 4FYCA 2B5EA 1LBKA 4KAEA 3CSHA 4HOJA 4O7HA 2CVBA 2V6KA 2L57A 1NW2A 3UJ1A 3M0FA 3GUSA 4POLA 1AQWA 1BYEA 4ML6A 1O8WA 2L6CA 1ERUA 2HSHA 4RI7A 1FB6A 4HZ2A 1V9WA 4TRXA 2P31A 3LYKA 1RW1A 5ID2B 5IMZA 1A0FA 1CQGA 3GYKA 1GSYA 5F05A 3ERFA 1T7PB 10GSA 1OC3A 1U3AA 1K0BA 4CW9A 2XBIA 1W89A 1VF4A 1O7UA 2HRNA 3D5JA 2IFQA 3C1RA 1G7EA 5EPFA 3U5RE 4ZILA 4CHSA 3O76A 17GSA 4BWQA 2VCXA 4NV5A 2KHPA 2AAWA 5DQSA 3PGTA 1GUMA 1USBA 2B3SA 2RIIA 4NPBA 3IV4A 2OADA 3TKSC 1GSFA 5F07A 3FZ4A 1C72A 1EV9A 3F4RA 1GULA 4Z7XA 5B8AA 5CP1A 3UBKA 4WBJA 1GTIA 3F3RA 4XHMA 4K0NA 1IYIA 3ME7A 1V58A 2H01A 4Q5NA 1X5CA 2D2ZA 1Z6MA 3VWUA 1N8JA 2HYXA 2OE3A 3DMLA 5D9TA 2YCDA 4G19A 2XBQA 2OA7A 3RDWA 4ULXA 3TKQA 3TKSE 4EF0A 1BEDA 2B1KA 2M80A 2JU5A 2IMKA 2K8SA 2KUCA 2PMTA 2FA8A 4ZXGA 3KZQA 2MYGA 5KEJA 2HE3A 1G0TA 2C0GA 3P8WA 4EDYA 4XRAA 1TW9A 1TTZA 4X0XA 3KP9A 1DE2A 1YJ6A 2VD0A 4EL1A 3IAS2 2YN1A 5AISA 3AY8A 4ZB9A 4NMUA 5HQPA 3FK8A 3H4KA 5ENUA 1YZXA 1XWAA 3KTLA 5COHA 3WT1A 5H5RA 3GL3A 1GSUA 2OACA 2CX4A 4KUNA 2VO4A 2MMOA 4FH8A 2PN8A 1YY7A 4YH2A 1PKWA 3F0IA 3ISOA 5A5KA 4MH3A 2GT5A 2XC2A 3HXSA 3HY2A 4KX4A 2VLUA 5F8BA 1FOVA 3WD6A 4YAVA 2VAFA 2HFDA 4ISDA 5IMCA 2CV4A 5IPGA 2R5GA 4KDYA 4HEA2 2O7KA 2WFCA 4OFTA 1HNBA 2X8CA 1JLVA 1Z7PA 1TKDB 3H8QA 19GSA 1QK8A 2H1AA 1ZZYA 2K9FA 5CAXA 3MSZA 11GSA 5GSTA 3BCIA 1Y6EA 4I2TA 5CREA 3ZLPA 3GHAA 1KEBA 1M2AA 4DSRA 1GH2A 2IWTA 3ERGA 4L5LA 1LU4A 3FR3A 4NWYA 13GSA 2R2JA 3KIJA 3WGXA 1JLWA 5F06A 3GNJA 4OO5A 1H4OA 4ILFA 3VFIA 1QQ2A 2QC7A 2LUSA 2OE0A 3ME8A 1OC8A 3RAZA 3IPZA 3VI5A 3G7JA 5J9BA 5IIZA 3WT2A 3RPNA 2YP6A 3GTUA 4K7OA 5D73A 1M99A 3F3QA 4K7NA 2H76A 4MZBA 2MMZA 3DEXA 3KH9A 1FAAA 2C3NA 4F82A 4POKA 1OYJA 2H0GA 1OVNA 4GLTA 1KNGA 2V41A 1FVJA 3GKXA 3EINA 3FW2A 3TJBA 5ECHB 2J23A 4MJAA 3IBHA 4P3YB 1TU8A 5KN1A 4V1Ap 3LSZA 1O8XA 2P5QA 3LG6A 2B7KA 4MJEA 3Q6OA 3UIWA 1QGVA 4MK3A 5G5EA 5D9VA 4GF0A 1MDIA 3GTUB 2DJ2A 3HCZA 2TRCP 1A2JA 4YQUA 2KLXA 2A2SA 3UL3A 3HJOA 3TRPA 1WP0A 1YDKA 3G7IA 3IR4A 2GLRA 5C04A 5JCWA 4RQRA 1ON4A 3K8NA 5B6MA 4MMMA 2B6MA 1SENA 4OCEA 4ZL9A 4OD7A 1V2AA 2I1UA 3D0ZA 1SU9A 5IOWA 4K8MA 4NV2A 2VCQA 3IAM2 4O92A 1NSWA 1Z9HA 5E59A 1N2AA 3VPTA 2QGVA 5ELGA 4L0WA 2G0FA 2C8UA 4L5OA 2WRTA 1PN9A 4HS1A 1QXHA 4IJIA 4PUAA 1HNAA 3GFKA 3CMIA 4ZBDA 3GKKA 4KH7A 2YV9A 3M8NA 5J41A 2E2GA 1R26A 4F0BA 2FWGA 4PQIA 2DMMA 5ECLB 4O5RA 2NTOA 2WB9A 4EO3A 1W4VA 1SJ6A 5ECQB 5GSSA 4ML1A 2VUPA 3C7MA 2LQQA 4ECIA 2TIRA 2HRFA 5ECPB 3FZAA 2N5FA 4JU5A 1A2LA 2H0IA 3LXTA 1GTBA 1VRSD 2H30A 3Q74A 3HA9A 3KM6A 4F9ZA 1SK0A 4F2IA 1T4ZA 2N5BA 6GSUA 4ECBA 4I8BA 2LRNA 3MNGA 4J57E 1THOA 3SWLA 1A23A 4ZL8A 3Q18A 2VCVA 5JWOB 5IO2A 1WOUA 4PQ1A 3ERWA 2KOKA 3LORA 7GSSA 3I6AA 4LA1A 1BX9A 1QUWA 5HFGA 4MJBA 1OC9A 2VM2A 6GSWA 1AW9A 20GSA 3EU3A 5ABRA 3D22A 2IMEA 2K8VA 1GUHA 4KW6A 2YZUA 2C0DA 2LTKA 2X64A 1XOBA 1SD9A 3FZ5A 3TGZA 4MH2A 2VOCA 4N30A 3VLNA 4KB3A 5GAPD 2GZPA 1XBSA 4H86A 1T00A 5AGYA 1JZDA 1S3AA 3GSSA 1MDJA 1TI1A 1YF1A 1U6TA 2R4VA 2LS5A 2H1GA 2GSTA 2H1DA 4TR3A 1R5AA 2DJ3A 4POMA 1LJRA 1EZKA 1TI3A 4KSMA 2LJKA 2VCZA 3FR6A 2VCWA 1WPIA 3C1SA 2LRTA 1OC9B 5DDLA 4IHUA 4LL1B 1YKCA 3GKMA 3MDKA 3DIEA 4K0GA 3UBLA 4DSQA 2P5RA 3KD0A 1HQOA 1GWCA 1BJXA 2YOIA 1BQ7A 1GL8A 3QFBC 2B5YA 2RLIA 3FR9A 1TK8B 1X9SB 2RUEA 2JL4A 3US3A 3I69A 1ZL9A 2C4JA 4K1FA 1SKSB 5G5FA 5HR0A 1A8LA 4EC0A 2B5XA 3TKSA 2XHFA 2MBSA 1G7OA 1M2BA 4Q5QA 3FEUA 3KP8A 4WKWA 3EE2A 2DBCA 3VWWA 1WIKA 3KJYA 1NHOA 2GTUA 5DQYA 2JSZA 2FUG2 3ZVJD 2EIRA 5J4UA 1PMTA 4GRFA 2DJKA 6GSYA 1SYRA 1SJIA 5L71A 2AB6A 1SKWB 4PXOA 1VF2A 3FYGA 3M9KA 1F2EA 2PWJA 3R2QA 2V2GA 1K0NA 1WJKA 4EXJA 1E6BA 1JZRA 2GZYA 4LLRA 3BD2A 4ACSA 5D8IA 1GRXA 1UVZA 4PX1A 3HVSA 4BPYA 2KP2A 4IKHA 4JR4A 3IDVA 4NXIA 1F3BA 2GSQA 2JSYA 3FY7A 1VF3A 3DWVA 1V57A 2QKEA 3CTFA 3RPPA 5CNWA 2IFQB 1KBNA 2CAIA 1PD21 1UC7A 1K0AA 2GVPA 3GMFA 4AGSA 1X9WB 3KEBA 1FW1A 1CQHA 2I9HA 2IMIA 2YWMA 1ERWA 2DLXA 1K0MA 1SK2A 1EEMA 2E0QA 3UMAA 1YF0A 1O73A 3A2WA 5D93A 2M72A 3DYRA 2GZZA 3HZ8A 1XWCA 1FVKA 4HU7A 4MLYA 5GAND 1XW6A 3QAGA 3H1NA 5CRGA 1DUGA 1RQMA 2XPEA 1U3IA 2PERA 1SJZA 5AIVA 4G2EA 3TOTA 1SYXA 3J7Yb 5KN3A 2A2RA 2CT6A 5JWRB 3FRCA 2LNTA 1GTAA 4MF7A 2EC4A 4WEYA 4KSOA 4PURA 1K3LA 1NM3A 1AC1A 4EE0A 2WJUA 2E7PA 5HR2A 1OKDA 4O32A 3O3TA 3VK9A 2KP1A 4I6XA 2AJQB 4TXVA 3ZTLA 4FO5A 2H1BA 3IXRA 3ZRDA 4ZIJA 4AJ8A 3W8JA 3KMOA 1EP8A 1TK0B 1M7TA 5CRWA 1T4YA 1J9BA 4HZ4A 4BVXA 1OKTA 2VM1A 5G30A 2VLTA 2JZTA 3L9SA 2GT6A 1SK1A 3UAPA 3ZREA 3WGDA 4ZL7A 1O85A 1ST9A 3D4TA 1GSEA 4ECCA 1FO5A 1URMA 12GSA 2VLVA 1F9MA 5FWGA 3PINA 3F4SA 3C8EA 3PH9A 1Z6NA 3A2VA 1AIUA 3HDCA 2FA4A 2CVKA 5IMAA 16GSA 1I5GA 3QD9A 2ZUPA 1DBYA 3F8UA 3LJRA 5A4VA 4KE3A 5IMFA 1TK5B 4KA0A 3NIVA 2VL2A 1R7HA 1TP9A 3IE3A 5ECKB 1V40A 2LKUA 2PVOC 5CO3A 4GWRA 3CRTA 5G2ZA 4K6XA 2YNXA 3ZMKA 2YWNA 2AUVA 4V2MA 2F8FA 3JCML 5KN2A 1WWJA 3LEFA 4JRRA 2ON7A 5HR3A 5HFKA 4JEDA 5IQYA 1ABAA 1H75A 3GURA 2HT9A 4IELA 2VIMA 1O6JA 5DCHA 2OKAA 3HVXA 4X43A 3ZIJA 4PNFA 3GKNA 2LJAA 3TJGA 3DVXA 4POBA 1EOGA 2ON5A 2VL2C 4HJMA 1TRSA 5C00A 5G1KA 4HUAA 2H6XA 1B9YC 1GLQA 2V32A 4IGJA 2CAQA 2PGTA 2FWEA 1MD4A 5IPHA 5ECSA 1HD2A 1XXUA 4V2NA 3RHBA 1TRUA 3QR6A 2G2QA 4OMVA 2CA8A 2IL3A 2WCIA 3ZZXA 3ZIVA 4KNDA 3VURA 4OCFA 3L0HA 3ZFLA 3P7XA 3TJKA 1KTEA 2L5LA 1ERVA 1MEKA 2C3TA 4HI7A 1XCCA 2O8VB 4AJ7A 5IMDA 1Q4JA 1ML6A 4TR4A 4JE1A 3GN3A 2I81A 2EIQA 1SKRB 2FY6A 6GSTA 4GQFA 5HFIA 2JADA 3EU4A 2YJHA 3ZMLA 3CYNA 3TDGA 1XOAA 4MZWA 1YEXA 2GS3A 1NHYA 3LFLA 4MZCA 5D9XA 2O87A 4OFMA 1EV4A 3L9VA 3G7YA 1GSDA 3LGCA 1Z3EA 1O81A 3E3EA 2H75A 2ALBA 3KMNA 2C0FA 4JR6A 3KGKA 5JCGA 4XCSA 1DE1A 1PL2A 3MAKA 3CTGA 3QDNA 1I9DA 1R4WA 2JACA 2YZHA 5G31A 3KXOA 1K3OA 5E4WA 1VF1A 3KCMA 4J2FA 4NHZA 4XS6A 5DBQA 3DXBA 2FCHA 1K0CA 5DALA 2R6KA 1GNWA 5ECOB 4FYBA 4BA7A 2FLSA 3HKRA 4MDCA 1PA3A 3W8SA 4V1Ag 3ZYWA 2VD1A 2HLSA 2R37A 3GL5A 9GSSA 4AF2A 4OO4A 4IQAA 3NOFA 3Q19A 3BJ5A 5CRHA 5DJLA 1MDKA 3F9UA 1JFUA 1THXA 1B4PA 2ZCTA 3LWAA 4E8EA 4ZBAA 2OE1A 4LL4B 3LYPA 1ZMAA 2NDOA 3DKSA 4GQCA 1GSSA 4N10A 3FKFA 1RK4A 1PL1A 3VPQA 1EGRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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