1GP1A

The refined structure of the selenoenzyme glutathione peroxidase at 0.2-nm resolution
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
184
structure length
183
Chain Sequence
RTVYAFSARPLAGGEPFNLSSLRGKVLLIENVASLGTTVRDYTQMNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFMLFEKCEVNGEKAHPLFAFLREVLPTPSDDATALMTDPKFITWSPVCRNDVSWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFLTIDIEPDIETLLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase(h2o2(a))
molecule keywords GLUTATHIONE PEROXIDASE
publication title The refined structure of the selenoenzyme glutathione peroxidase at 0.2-nm resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 59
structure length 183
sequence length 184
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 1985-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gp1A00
2PVQA 1GTBA 2J9HA 2K8VA 4J57E 1FVKA 3H79A 3ZVJA 2GQMA 2GZYA 1F3BA 3VI5A 3KIJA 2HI7A 4JR4A 4F2IA 5EY6A 3VFIA 2PMTA 4ZBDA 2MBTA 1F3AA 2VCVA 1AAZA 4WKWA 2CX4A 2QC7A 4G19A 1M2BA 1QQ2A 2YPMA 3BOAA 3IK9A 4WF4A 1FW1A 4OFTA 1F37A 2WFCA 4Q5FA 3KXOA 3CSJA 2E2GA 5IPHA 1Z6NA 1A0FA 1K0MA 4GCIA 1U88A 1ZZYA 4TXOB 3A3TA 1T8EB 1VF2A 2AB6A 2HE3A 1S3AA 5EL8A 3EE2A 3CYNA 5KEJA 3ZRDA 4AGSA 2IMDA 5CP1A 4IP1A 1V2AA 2XHFA 2GS3A 6GSWA 3KH9A 1XVWA 1OE7A 1X9WB 2VM1A 3QAGA 3P7XA 4ZL8A 3UBKA 2JZTA 2PGTA 2GLRA 2G0FA 1QFNA 4TR3A 4XCSA 4JBBA 3MAKA 1PN9A 2OA7A 2JZSA 3G7IA 1Z9HA 3LSZA 4BWSA 2PERA 2AYTA 1Z7RA 2CVKA 3LXZA 5ECPB 3GH6A 1XBSA 3NZNA 4G10A 1OAZA 4P3YB 2DMLA 4KE3A 4LMVA 2H74A 4ZIJA 1ML6A 2WRTA 4IS0A 3HYPA 3TJGA 3G9BA 1X9MB 1XVQA 4POKA 2QSIA 4OO4A 2XBIA 3DGQA 1SKSB 5G31A 2GT5A 3PR8A 4KDYA 3LJRA 1Z3EA 3TKSE 1O81A 2F8FA 3QCPA 5ELGA 1SD9A 1BYEA 1W89A 3GURA 2H73A 4BA7A 6GSUA 4XRDA 4JR6A 2WGRA 2VD1A 1XZOA 1XWCA 2NBSA 5D9TA 4IJ3A 5G2ZA 5DVBA 3NOFA 1X5CA 3HJPA 2KP1A 3IK7A 5FWGA 5IO0A 1Z5YE 5IOXA 3HJMA 5DAKB 2EC4A 1UVZA 1YF0A 3DD3A 2B5EA 4KSOA 5JCGA 2X64A 2FWHA 4HZ2A 1SJZA 2CVBA 1ZMAA 2NTOA 5ECOB 3RAZA 2NVLA 2C3NA 2JU5A 2GQKA 1OC9A 1XWGA 2LNSA 3HXSA 1GSFA 1PA3A 1SENA 4BWQA 1Z7PA 3C1SA 4YQMA 5KN3A 2K18A 1TU7A 2N5FA 5JWQB 4TW5A 3DXBA 4HQZA 4Q5QA 1SL1B 1G6YA 4ZILA 5A4VA 3EWLA 2V41A 3L78A 5DCGA 3DEXA 3GTUA 3GHAA 1SKRB 3UBLA 4MZWA 5INYA 2LSTA 2A2RA 3WYWA 4IJIA 1AQVA 2CX3A 5A4UA 1PL2A 4MZBA 2FD3A 4F82A 4FIWA 2HNLA 4NV2A 5KN1A 2KOKA 3I9V2 3L9VA 2DJKA 1USBA 2YV7A 4G2EA 2H76A 2C8UA 3KMOA 1JLVA 3DIEA 1PQNA 3RDWA 5IOWA 1DE1A 1TW9A 5FHIA 4FH8A 2TRCP 1WPIA 4YQUA 3GH9A 4IQ1A 4V2LA 5B6MA 1SL0B 3WGEA 4IHUA 2V32A 1OC3A 4OD7A 2FCHA 3UVTA 2Z9SA 3RPPA 5L71A 1V40A 2H6XA 3G7YA 1AC1A 3RBTA 3GKMA 4IGJA 2NDOA 3KP8A 3UMAA 5CAXA 1MD3A 1O8XA 1A2JA 5C04A 2NPBA 2KUCA 1VF1A 2XPDA 3F3RA 3GL3A 1MD4A 5CO3A 3ED3A 3DWVA 4IKHA 3MDKA 4K2DA 1TI3A 4IQAA 1WJKA 4O92A 3N5OA 3ERWA 1XXUA 5D93A 4K6XA 4WXTA 5JWRB 3CSHA 2M46A 2P5QA 1XW5A 5JCWA 5AIXA 4V2NA 4K8MA 1SJIA 4NAXA 1A2MA 3GKKA 4GQFA 1BEDA 4Z7XA 2VCWA 2X8HA 1QXHA 3W6GA 1DSBA 3A5WA 3ZFBA 1GWCA 1Y6EA 4L8EA 4DVCA 1X5EA 1TOFA 2MMNA 8GSSA 1Z6MA 2DIYA 3UL3A 1E6BA 5IMVA 1V58A 2PWJA 4CHSA 3F6FA 3O6TA 3D5JA 1Q4JA 5DCHA 1HQOA 2LJKA 2I3YA 4X1UA 2L5LA 1WWJA 4GLTA 2YWOA 4MZCA 3DRNA 4K7OA 4KAEA 1WP0A 5ENUA 4EDYA 4PXOA 2CVDA 3D4MA 3HKRA 3AY8A 3KMNA 4HEA2 2DBCA 2H1DA 1EOHA 1GUMA 1TI1A 3U6VA 3GIXA 4WBJA 5HFIA 4K7NA 2GZPA 3L0HA 3F4RA 3IRAA 4YAPA 4PQHA 4XHMA 3ZL5A 5J9BA 2HLSA 2WZ9A 2IMIA 1URMA 1LJRA 4GSSA 4L5OA 2EIOA 3VWXA 4KUNA 18GSA 1WRYA 2R6KA 1ERTA 5CYYA 2RUEA 3I43A 1RK4A 1TRWA 3GYKA 3KTLA 3EINA 2XBQA 4E8HA 3HVSA 5JCUA 5GSTA 4BVXA 1PL1A 2L5OA 3MSZA 2VCZA 3KM6A 5ECLB 5E4WA 3ZYWA 2PU9C 4V1Ap 2H66A 1SJ6A 1TU8A 3HHVA 5ECIB 3QAWA 3ZIVA 2OJLA 4I2TA 3GUSA 3GSTA 3HA9A 4MF7A 4Q5NA 5IM9A 1M99A 2C0DA 1XFLA 2VLVA 3TJFA 5D73A 1JZOA 4ACSA 2H1AA 1FG4A 2H8LA 2VO4A 5D9VA 1LBKA 4KGIA 1N2AA 5J5NA 2FNOA 2WS2A 1GSEA 3FR3A 2REMA 2C80A 2IMEA 4XS4B 1DE2A 5HR2A 2GQLA 2HFDA 1XPVA 2B7JA 4HS1A 4KCEA 1K0CA 1WE0A 5B8AA 2H72A 4V2MA 5CREA 1OC9B 1ZGNA 1MTCA 1DUGA 4JEDA 1GLQA 4DSRA 2DJ0A 2R37A 4ZL7A 4MH3A 4LL1B 4MF6A 1GP1A 2LRTA 1PMTA 5LD0A 3M3MA 4MDCA 3D0ZA 3IPZA 4ECCA 2YWNA 1YEPA 2FGXA 4TR1B 1DBYA 2LJAA 1SD8A 2LNTA 1GUHA 3LG6A 3F0IA 4QL7A 3US3A 1LU4A 2GSSA 2VLTA 2LS5A 4ZBAA 4N10A 4AJ6A 5ECMB 3O3TA 5J9CA 5H5SA 1EV4A 3FRCA 4FYUA 3SWLA 4GXZA 3GX0A 2LKUA 2YOIA 5EVOA 4PURA 5IMFA 1KEBA 2LTKA 1AXDA 3TKSC 4IVFA 1PGTA 3D4TA 3VWUA 2ZCTA 4TR4A 2IL3A 4QL9A 2MMZA 2MMAA 2B3SA 5GAPD 2F9SA 3P90A 3WT1A 3UAPA 4OFNA 4G9HA 2HT9A 4LLRA 1EP8A 4MABA 4CW9A 3F4SA 3CRTA 5H5RA 2E2MA 2PN8A 3W8JA 2LQOA 4MPGA 1T1VA 2B1LA 1B48A 1FHEA 1M9AA 3EU4A 1FB0A 1TP9A 4PNFA 3FHKA 1ABAA 1SU9A 1X9SB 1A8LA 1EEMA 3DMLA 2VUPA 4OCFA 5CRWA 5J3RA 3BCKA 2O87A 4NHWA 1A23A 3D21A 1RW1A 4JU5A 4J2FA 3D6IA 3ERFA 11GSA 5GSSA 1YKAA 1GLPA 4HDEA 3V1WA 3EU3A 1THXA 1BJXA 2L4QA 1V98A 5COHA 4POBA 2LQQA 3HVVA 3LYKA 3C73A 2HSHA 1H75A 1XWKA 5G1KA 4BPYA 3J7Yk 4TVEA 2C1YA 1YZXA 1V9WA 6GSSA 2KHPA 2KP2A 1VGLA 3E9JB 1ILOA 3F6DA 4PNGA 1G0TA 3N9JA 1GSQA 2VIMA 2VL2A 4Q5RA 3TDGA 3VWWA 5IPGA 2A2SA 2R5GA 3FK8A 4GSNA 3A2WA 4KNDA 4F0BA 1M9BA 2YANA 1GTUA 3PH9A 2HRNA 1R7HA 4EO3A 1BG5A 1K3YA 4MJAA 4L0UA 2KLXA 5ID2A 1JZDA 2HZEA 4HI7A 3H4KA 4KW6A 2FA4A 3FZ5A 2H70A 3H8QA 2VOCA 4YQVA 2K9FA 4POMA 2CA8A 4HJ2A 1A2LA 4YAVA 3KEBA 4HU7A 1R5AA 3TKRA 2TIRA 5DJLA 5ECQB 2IFQA 1VF3A 2H6YA 2I1UA 4FYBA 5DALA 4EVMA 1NM3A 2ES7A 1OYJA 4N0VA 4JZQA 1WOUA 3TKSA 5IO2A 4PUFC 3F3QA 1TRUA 2GGTA 2X8GA 3APSA 1MDIA 2H19A 2VCTA 1T4ZA 4DSSB 1SKWB 2QKEA 1F9MA 1NHYA 4GRFA 2IN3A 3QFBC 1B9XC 2WCIA 4ID0A 1HNCA 3QR6A 2MBSA 2L4CA 4PQIA 2J23A 2H1GA 1B9YC 4OWYA 3GRXA 3QAVA 2GVPA 5D8IA 4N11A 2ON7A 1X5DA 2JSZA 3SBCA 5ECRB 4F03A 1HNBA 4TXOA 2BTOT 3VK9A 3TB2A 3CXGA 3ZTLA 5IIZA 2O89A 4IW9A 1QUWA 4GQCA 3GSSA 4EXJA 1THOA 2C3TA 4ZB9A 3KJYA 1JHBA 4X0XA 2FWGA 3GX8A 4F0CA 5ECKB 3TJKA 3UJ1A 5ECNB 3TOTA 5B8BA 2P0GA 3U5RE 3Q18A 5F0GA 2FUG2 1JZWA 3S9FA 2VD0A 3LXTA 5HR1A 1F2EA 1GTAA 3ZLPA 6GSTA 5CRDA 2JZRA 4TXVA 2I4AA 2YV9A 3PGTA 3TGZA 5CRHA 3ISOA 3DYRA 4AF2A 3HVXA 1EGRA 3QDNA 4MJCA 1SYXA 4OCEA 2ZNMA 4TN8A 2OE0A 4KDUA 1NHOA 4RI6A 2P5RA 4NV5A 20GSA 3DVWA 4HZ4A 4MH2A 3KGKA 1ACVA 3IR4A 3H1NA 1XOAA 1M7TA 2V1MA 3H93A 1MEKA 1OE8A 5IMZA 1A0RP 3UIWA 1BQ7A 3HCZA 13GSA 4BVYA 1EP7A 5F06A 2CT6A 4WF5A 1R5PA 1ERVA 10GSA 2QGVA 3FKFA 1I5GA 3GMFA 1J0FA 2V6OA 1XWBA 3RPNA 1R26A 2H1BA 3QMXA 4MPFA 4CDOA 1GNWA 1YY7A 4V1Ag 1EZKA 3APOA 2GSRA 2IWTA 3EURA 1OKTA 3NIVA 1ZYQB 5HR3A 3TOUA 5B7CA 2C0EA 1T4YA 1Y25A 2GDRA 3LFLA 4NMUA 1XIYA 3E0UA 3VWVA 1O8WA 1IYIA 1UA5A 4MLYA 7GSSA 5DAKA 4H86A 2G2QA 1GNEA 2JSYA 2OADA 2B5YA 3FZ4A 3GA4A 1PX6A 3EC3A 1ERUA 5CRGA 2GZZA 4NHZA 2C3QA 5KN0A 1K3LA 1AQWA 3VI7A 3HDCA 4O5RA 3C7MA 1ON4A 2WULA 2O8VB 5IMCA 1R4WA 4OO5A 4HJMA 3IAM2 2HZFA 4DEJA 3Q6OA 1V57A 5IMDA 3IOSA 4JE1A 3IE3A 3IDVA 1K0BA 2X99A 3LORA 1EV9A 3L9UA 3ZREA 3VLNA 2V6KA 1FOVA 2MMOA 4TRXA 5G30A 1PX7A 4MK3A 2X8CA 5FT3A 6GSVA 4ISDA 1YQ1A 2GTUA 1YKCA 4ZB8A 3Q74A 3W8SA 2FA8A 1NW2A 2RLIA 1OKDA 4K0GA 1YJ6A 1T7PB 4XS6A 2VAFA 1XW9A 2FLSA 1PKWA 2B7KA 1GSYA 3UEMA 3VURA 3ZIJA 3TKQA 2C4JA 5C00A 2L57A 3GL5A 5EPFA 2HZEB 1E2YA 5LNKe 3CRUA 2C0GA 2DLXA 1JFUA 2OE3A 1GSUA 4MP4A 2DJ2A 1W4VA 2VL2C 3KP9A 2OBKA 1AQXA 2O85A 1ZOFA 3TRQA 3ZMKA 17GSA 5HFKA 1TK8B 3EMXA 4PX1A 2CZ2A 4MA9A 2VM2A 3BBYA 5ELAA 2N5BA 3FEUA 3BCIA 2FHEA 2IFQB 4LL4B 1TK5B 2YZHA 4OFMA 4HOJA 3UOMA 2L59A 3P8WA 3IBHA 4KB3A 1UN2A 4IELA 1A8YA 1J08A 1TDIA 2JADA 4TOPA 3KCMA 1JLWA 4I8BA 1RQMA 3MNGA 3QOUA 1SL2B 3UARA 1GULA 4TR0A 3FYGA 3GTUB 3TUEA 4IN0A 5J4UA 1T00A 2FWEA 2DJJA 1GTIA 6GSXA 2WDUA 2YN1A 2E7PA 3WGDA 3J7Yb 5CNWA 3HJOA 12GSA 3QPMA 3ERGA 5DJMA 1UC7A 3DKSA 3QD9A 1O7UA 2EIQA 1CQHA 2V2GA 1K0OA 4KCAA 3TJJA 4MCUA 2R2JA 1NSWA 2YNXA 2AAWA 1XWAA 4KH7A 4RQXA 3F63A 2WB9A 3R2QA 4IBPA 3HZ4A 2MZCA 1ZCPA 4XRAA 3HZ8A 2YJ7A 4MJEA 1TTZA 2TRXA 1B4PA 2B5XA 2A4VA 1XOBA 1IYHA 1XCCA 1VF4A 4ZL9A 1KTEA 1U6TA 1GL8A 4ULXA 3I69A 1JZRA 1GRXA 4ZB6A 1TRVA 2YCDA 5AIVA 3IHQA 4ECJA 5HQPA 3CSIA 4DSQA 1EEJA 3RHBA 3MWHA 1HYUA 3TCOA 4QQ7A 1S3CA 3OR5A 1VRSD 2K8SA 4LMWA 2BMXA 1MDKA 1ZYEA 1FAAA 4GWRA 2DSAA 3QFAC 1PSQA 3GFKA 5G1LA 1B4QA 4MF5A 2FWFA 4HUAA 1YDKA 3D22A 2H71A 1TXXA 2YP6A 2PVOC 1K0NA 3F8UA 4PGTA 4OMVA 2VCQA 4ECIA 5A4WA 3P2AA 4L0WA 3KTBA 1T3BA 2HSYA 3ME8A 2AUVA 2F8AA 2ALBA 3IAS2 4HQSA 3O76A 3GNJA 2PUKC 2IMKA 3IXRA 2DC5A 2H01A 2PPTA 3UVHA 4NPBA 3FZAA 3BD2A 3M8NA 1SK1A 2P31A 1GUKA 2LJRA 2XPEA 3JCML 4D73A 4K1FA 3APQA 2VL9A 1FO5A 1GSDA 1GSSA 2VL3A 2DJ3A 4MJBA 3ZMLA 4L5LA 3TRPA 4ML1A 1J9BA 1O73A 5DDLA 3F4TA 4XS4A 5IMAA 4ECBA 1ST9A 3HY2A 5F05A 1EOGA 2OKAA 1AUCA 2AJQB 1S3DA 5J41A 2E0QA 1ZL9A 3I6AA 3KD0A 1QMVA 2I81A 1TRSA 2R3XA 5E59A 3CTFA 5AISA 1CQGA 3LWAA 4PQ1A 3BJ5A 2CAIA 1C72A 4RQRA 4XS1A 2CV4A 2LRNA 4XTSA 5LCZA 2F51A 3M1GA 4N0ZA 3DVXA 3C8EA 4TR1A 4NXIA 3VPQA 2HYXA 2H0GA 4E8EA 4I6XA 4KDXA 4X43A 3KH7A 3Q19A 2EIRA 1EGOA 3A2VA 2VCXA 2YJHA 3CTGA 3EVIA 4I97A 1TJDA 3IA1A 5D9XA 3PINA 4ZXGA 1PKZA 4KX4A 1EWXA 2AV4A 2OACA 3C71A 3CBUA 4K9ZA 3M9JA 1WMJA 2WJUA 2L6CA 1BX9A 4MMMA 3HD5A 3WD6A 2LRCA 5ABRA 1X0RA 2F3MA 2M72A 1KBNA 1M2AA 2CZ3A 1U3AA 3FR6A 4RI7A 2FY6A 3ME7A 16GSA 3LGCA 2K6VA 2H0HA 1ERWA 3IC4A 1AW9A 5F07A 1TKDB 2YWIA 1K0DA 4XIHA 1QK8A 4AJ8A 2H6ZA 4I5QA 4KSMA 4GTUA 22GSA 4LA1A 1PRXA 1U3IA 2YWMA 1XW6A 2RM6A 2CQ9A 3GV1A 6GSYA 3TJBA 4HU9A 4O7HA 1H4OA 4O32A 3TKPA 3ZVJD 4EF0A 2IJYA 3EMPA 4IP6A 4WR5A 4TKYA 2DIZA 1OVNA 3RHCA 1YF1A 3M0FA 2R4VA 2AHEA 1FB6A 1SK2A 2I9HA 1SYRA 2D2ZA 1OC8A 1KNGA 4PUAA 2IPAA 3FR9A 1G7OA 2C0FA 1O6JA 3A2XA 3FY7A 4ML6A 5HFGA 1B8XA 3TRXA 2H75A 4YH2A 4N30A 1F6MC 4NWYA 2B1KA 4EL1A 2DMMA 5DQYA 2VLUA 1K3OA 5JWOB 3GKXA 4RUVA 4EUYA 4KA0A 1HNAA 4FO5A 5GAND 2YZUA 5DQSA 5KN2A 3ZITA 2JACA 2OBIA 5G5FA 3F9UA 2XC2A 5DBQA 4J56E 4EDZA 4EE0A 2DJ1A 3E3EA 3WT2A 4GF0A 2LUSA 1FVJA 3ZZXA 2LV3A 3KZQA 2IIYA 4WEYA 3GKNA 4POLA 2OE1A 2GSTA 5B6NA 4F9ZA 2PBJA 4WR4A 4GSTA 1G7EA 3WGXA 5D96A 5H5QA 5AGYA 1I9DA 3EYTA 2RM5A 4JRRA 3M9KA 1N8JA 2HRFA 3LYPA 5GZZB 1BAYA 1WIKA 4AJ7A 2H30A 2MYGA 3IV4A 4ZBBA 4K0NA 1G6WA 1U87A 5A5KA 1K0AA 1M0UA 1GH2A 4BL7A 4ILFA 3CMIA 2RUFA 5ECSA 3G7JA 3FZ9A 4WBRD 2H0IA 2M80A 4DSSA 2N5AA 3LEFA 2GT6A 3GN3A 2O7KA 4K7IA 2GSQA 3C1RA 2LEGA 5D9WA 5ID2B 1MDJA 1PD21 2ON5A 3LQ7A 2HXKA 1YEXA 1TK0B 3ZFLA 5G5EA 1QGVA 2JL4A 2IMFA 4WETA 14GSA 3VPTA 4EC0A 5HR0A 5AN1A 2RIIA 3K8NA 9GSSA 5ECHB 19GSA 4FYCA 4EKZA 4D73B 4I2UA 3FW2A 1HD2A 2B6MA 1SK0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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