4WBRD

Structure of bradyrhizobium japonicum scoi with copper bound
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
AIGGPFQLTDQNGKAVTDKSLKGKPTLIFFGYTHCPDVCPTSLFEISEVLRAMGKDADKVNAIFISVDPERDTPATMKNYLSSFDPHLEGLSGDPAEIAKVITSYRVYAKKVPTKDGDYTMDHTALIYLMDRDGRFVSPFNLKRTPEEAAADLKRYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Blr1131 protein
publication title Structure of Bradyrhizobium japonicum ScoI with copper bound
rcsb
source organism Bradyrhizobium diazoefficiens
total genus 52
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wbrD00
3TJKA 4OWYA 4XTSA 3I43A 2CVBA 5L71A 3GN3A 1ST9A 2ES7A 2DBCA 2P31A 4K2DA 5E59A 3VFIA 4GSNA 4TR1A 5CAXA 2HRFA 5CRDA 3HDCA 1OC9B 1X9MB 1HNAA 4ZXGA 2L5LA 3RPPA 2CAIA 1QGVA 2N5BA 2L6CA 1NM3A 4CDOA 3CTGA 4DSSA 1R5PA 3TJJA 5H5QA 1TDIA 4F03A 2NVLA 4O92A 3LQ7A 2H1BA 2PVOC 1TRUA 3KM6A 4JE1A 5A4VA 2ZNMA 2MBTA 3OR5A 1FG4A 4K0GA 5DQSA 1A0RP 3VURA 3DVXA 1M9BA 2RIIA 4EF0A 3ME8A 4FO5A 2VM2A 2HLSA 1T3BA 4GTUA 2C0DA 2V6OA 5G1KA 3RPNA 5JWQB 2DLXA 4MPFA 2DMMA 1Q4JA 4HEA2 2VL3A 4PURA 3VWVA 2HT9A 1XXUA 4IN0A 4ZL7A 1G0TA 2H75A 2VD0A 4IVFA 4KDUA 3CSIA 2CX4A 4ACSA 5HQPA 1V57A 1M2AA 3IAM2 4MPGA 1KTEA 1X0RA 3HZ8A 1K0BA 5DCGA 4N30A 2IFQB 3HKRA 2L4QA 1GUKA 4K7IA 4ZL9A 1SK1A 2IMDA 2FWGA 4GRFA 2C0GA 3IHQA 5ECSA 1Q98A 3V1WA 4Q5FA 4N0ZA 1B8XA 4ML6A 2CAQA 1BAYA 4GF0A 5DALB 4EC0A 5JCWA 4JRRA 5ID2A 2VLTA 4FH8A 12GSA 1G7OA 4K7NA 4HU7A 3QMXA 3KTLA 3LYPA 4DVCA 3BJ5A 5HFKA 2EIOA 2REMA 4OO4A 4BWQA 2JZRA 3DXBA 3M1GA 2R37A 6GSYA 2DJ1A 3UEMA 3FW2A 1F9MA 3WD6A 1R5AA 3FR3A 1K0OA 2IMEA 3IC4A 4MDCA 1PX7A 4HJMA 1WWJA 3C71A 4OMVA 1ERUA 1TOFA 4OD7A 3PH9A 3UAPA 1BJXA 1VF4A 1N8JA 1XOBA 2BMXA 5ECMB 1X9SB 4PX1A 3FY7A 4MP4A 3WGDA 4I2UA 5D9WA 6GSVA 2VD1A 3SBCA 5DVBA 3C1RA 3F4RA 3ZVJA 3TOTA 3GHAA 1XWGA 2VL2A 4PUFC 1TTZA 4FIWA 2DJ3A 2HZEB 2LRNA 1YF1A 1RK4A 4KA0A 3ZMLA 1TU7A 1J9BA 1SENA 1SJZA 2LJAA 3D0ZA 2HSHA 2PGTA 5G1LA 5KEJA 2AB6A 4LMWA 3QFAC 1ERVA 2VM1A 1GUMA 3ZVJD 1XW5A 2IPAA 1V9WA 2HSYA 5CRHA 2K9FA 2YWIA 2HYXA 4K7OA 5HR3A 1X5EA 3AY8A 4I97A 5IQYA 3QDNA 1TW9A 2L5OA 3F6DA 2GSQA 3LFLA 4TR1B 4ULXA 4KDXA 4IP1A 3RDWA 1EGOA 1UC7A 2JU5A 2AJQB 4L8EA 5J9BA 2H74A 1A23A 1OE7A 4G2EA 4DSSB 4KDYA 1XVWA 5F0GA 1B4QA 1ZOFA 1EZKA 2HZFA 2O8VB 4GQFA 3A2WA 3FZAA 2GZZA 3GH6A 1S3DA 1MD4A 4JZQA 2L6DA 4YH2A 4D73B 1G6YA 1E6BA 4MK3A 1QQ2A 1O8XA 3EU3A 3TB2A 2QKEA 3GV1A 4KCEA 5IMAA 3EURA 3UBKA 4CW9A 2H8LA 3GUSA 4HJ2A 4TR4A 3ZLPA 1TK8B 2FY6A 4LL4B 2OBKA 1Z5YE 2XPDA 3GX8A 14GSA 3HHVA 3IRAA 3LJRA 3ED3A 4K9ZA 2B5XA 3BBYA 3K8NA 2PERA 2CZ3A 3CXGA 5CNWA 5DAKB 4O7HA 3IV4A 2A4VA 3HJMA 1K0MA 3F63A 3F8UA 4L0WA 2HI7A 5LCZA 4MA9A 4MF6A 3IXRA 2WRTA 1ACVA 3CTFA 4ILFA 6GSSA 1FVJA 1A0FA 3F6FA 5B7CA 2LS5A 1R7HA 5DDLA 1JZDA 3I69A 3WT1A 5JCGA 3IOSA 4FYBA 2YN1A 2C3NA 1WP0A 2F8AA 3H1NA 4NV5A 4LL1B 2JSZA 3UJ1A 2LNTA 3HCZA 4BL7A 3UMAA 1FHEA 2MBSA 2MZCA 2OBIA 2YZUA 2V2GA 2ON7A 2C3TA 3IA1A 3U6VA 4I2TA 1M0UA 5D8IA 1AUCA 1G6WA 2M72A 1TRSA 1GSUA 2P0GA 3PINA 1XWBA 2YPMA 1AQWA 2R6KA 2R2JA 5AN1A 3QR6A 5INYA 2GZYA 3ZTLA 1EGRA 2H1AA 4ZB9A 3D4TA 4NV2A 3HA9A 4WR5A 2LQQA 2OKAA 4OCEA 5ECOB 1U88A 4MMMA 1QFNA 4EDYA 4ECBA 5J9CA 3KZQA 3IR4A 1GSYA 5CYYA 2C0FA 3NZNA 6GSTA 3QAWA 2H76A 2YJ7A 2O85A 3QFBC 5EVOA 1LU4A 1N2AA 3UVHA 3HY2A 4JR6A 2K8VA 1KNGA 4MH2A 1THXA 1YF0A 1OC8A 2X99A 3Q19A 2NTOA 1ZYQB 4ZBDA 5ELAA 1GP1A 1JZWA 16GSA 2GS3A 2GTUA 1AC1A 2KOKA 4EE0A 4IQ1A 3KJYA 8GSSA 1GULA 4GSTA 1A8LA 3N5OA 1B48A 5AIXA 1Y25A 3VWWA 4J57E 1MEKA 3DKSA 3KMOA 4QL7A 1ZGNA 4KSMA 3ME7A 2GGTA 5EY6A 4BA7A 5KN1A 4F9ZA 2WDUA 1Z6MA 5HR0A 3ZITA 3BCIA 2JL4A 3DGQA 5AIVA 1YQ1A 3P90A 2YWNA 4RQRA 5F07A 2AYTA 1EP8A 2QGVA 1SD9A 3IAS2 5A4WA 2OE1A 5IO0A 3EINA 2MMNA 3L0HA 1PA3A 1FOVA 1HQOA 1SD8A 1J08A 3LGCA 5JCUA 1B9XC 2I4AA 1QUWA 2O87A 3CYNA 5IMZA 3FYGA 1PKZA 2DSAA 1BQ7A 4L5OA 2JZTA 3WGEA 5DBQA 2VCVA 4L5LA 3QCPA 3QAVA 4J56E 4IKHA 3HJPA 2GDRA 3CSHA 3R2QA 3TCOA 2F3MA 4KE3A 3IK7A 4KUNA 4PQ1A 2FA4A 1LJRA 1CQHA 3RAZA 4KX4A 2AAWA 1YDKA 3LSZA 4OO5A 4O32A 3G7YA 3Q6OA 5F06A 2VL2C 4MJCA 1FB6A 4J2FA 2QC7A 4PQIA 3ZIJA 3DWVA 1T4YA 4LLRA 1DE2A 4N10A 4D73A 1U6TA 1JFUA 4TRXA 4EUYA 3TUEA 19GSA 1WMJA 3L78A 1GLQA 5H5RA 2YP6A 3GFKA 1F3BA 4MZWA 2FWHA 1U87A 2RM6A 4N0VA 2PVQA 1OKDA 1OE8A 1XPVA 2RUFA 3D5JA 4FYCA 1WJKA 4MZBA 2G0FA 1NSWA 2PMTA 3US3A 2CVKA 2X64A 4RUVA 1GSFA 3APOA 1SL2B 3IK9A 4DSRA 4KSOA 1X9WB 5DAKA 1Y6EA 1A2MA 1RW1A 5ECLB 1LBKA 2H72A 4MF5A 3HJOA 5GAPD 3TGZA 17GSA 4KGIA 5F05A 1ZZYA 4ZL8A 4MZCA 5HFGA 3GX0A 3TKSE 4F0BA 1K0CA 3HVXA 3F4SA 2VO4A 4G9HA 3UARA 1XW6A 4IGJA 1I5GA 4PNGA 4ZBBA 1WOUA 4TOPA 1AQVA 4K8MA 4KCAA 3J7Yb 4NMUA 3RHBA 1ERTA 1JZRA 1NHOA 1Z3EA 4X43A 4PGTA 2Z9SA 3TJFA 4OFMA 4GWRA 3NIVA 2LRTA 2CQ9A 3ERWA 1YZXA 2VLUA 1YKAA 3EC3A 3E0UA 3CBUA 2H19A 5H5SA 2DIZA 3TRXA 1OVNA 4BVXA 3IE3A 4HZ2A 1AIUA 1ZMAA 2WFCA 3GIXA 5J5NA 3CMIA 1EOHA 2I3YA 1O73A 1GSQA 5CO3A 3CSJA 4KAEA 3LG6A 3P2AA 3E3EA 3VK9A 1GTUA 1V2AA 4QQ7A 2B5YA 2LJRA 5B6MA 1XVQA 3W8JA 3TKSA 3IDVA 1EEMA 3G7JA 4ECJA 4HQZA 5B8BA 1Z7RA 5ECHB 3WGXA 2YJHA 1WE0A 4IHUA 4PUAA 4IQAA 2PUKC 1AAZA 4V2LA 2VCTA 2KUCA 1DE1A 1SU9A 2EC4A 2LSTA 2B3SA 4GSSA 4NAXA 4TXVA 1R4WA 2VCWA 2LUSA 1EV4A 4WEYA 1PL2A 2GT5A 5ECNB 2IIYA 1T8EB 1TI1A 5C04A 1DSBA 3LXZA 5IMVA 4POBA 3TRQA 3A5WA 4NXIA 4YQUA 3KGKA 4EO3A 1NHYA 1XW9A 1USBA 1TRVA 1YEXA 2E0QA 2FD3A 2H66A 1GTBA 1VF1A 1A8YA 3KIJA 1XWAA 3TDGA 1ZL9A 4NWYA 3MDKA 4OFNA 4BWSA 1Z6NA 1IYIA 1R26A 3EWLA 4WBRD 3U5RE 2H0GA 3FKFA 2OJLA 2YV9A 3HD5A 1O85A 1OYJA 2IJYA 4E8HA 3FEUA 1GTAA 1FW1A 2C4JA 1ZCPA 3HXSA 18GSA 2N5AA 1SK2A 3LWAA 4GLTA 2IL3A 1OKTA 1FAAA 2AUVA 3DRNA 1QMVA 4IELA 5ABRA 5CRWA 4P3YB 5FT3A 2OE0A 4TW5A 3W6GA 4K0NA 2X8HA 2GVPA 3O76A 1YY7A 1OAZA 2NDOA 4MJAA 1GSEA 2H71A 2TRXA 5CREA 3CRUA 3SWLA 6GSUA 4MF7A 3ZRDA 3C7MA 3HZ4A 1UVZA 2J9HA 2MMOA 1T00A 1DBYA 2JACA 3H93A 2VCXA 4TR0A 3KTBA 1MDJA 1TK0B 4PQHA 1F3AA 5ELGA 4I5QA 4MABA 2H1GA 2HFDA 2K8SA 1Z9HA 1GH2A 3WT2A 5IMCA 1GSSA 1EOGA 5ECRB 3HYPA 2FHEA 1JZOA 1G7EA 4WKWA 2DMLA 3F3QA 2MYGA 1TJDA 2V1MA 3FR9A 2C8UA 5DQYA 4KNDA 3GTUB 1JLVA 4K1FA 2R5GA 2X8CA 3IBHA 1J0FA 5IM9A 4ZB8A 2E2GA 1EV9A 4XCSA 4HQSA 1SL1B 2A2SA 1YEPA 1THOA 4POMA 1XWKA 4KB3A 4DSQA 4WETA 1FO5A 4K6XA 1ML6A 3PGTA 1WRYA 1V98A 1HNCA 2OE3A 5D9VA 1PMTA 2YCDA 4OCFA 3FR6A 1ZYEA 3H4KA 2JADA 4HI7A 1GTIA 2F51A 3DD3A 2FNOA 5FWGA 1H4OA 4TXOA 1M2DA 4QL9A 1HYUA 2C1YA 4YQVA 3CRTA 2H1DA 2VIMA 1XIYA 1CQGA 2IWTA 1A2LA 1OC3A 1FB0A 1T7PB 3GRXA 1JLWA 2YWOA 4ID0A 1XBSA 2E7PA 4ECIA 3F4TA 3N9JA 5KN2A 1M2BA 2YZHA 3TKQA 3HVVA 1A24A 2V6KA 1SJ6A 1BEDA 4HUAA 4X0XA 2XBIA 1XCCA 3H8QA 3LYKA 1U3IA 3MWHA 5B8AA 3L4NA 1O7UA 2TRCP 2D2ZA 4Z7XA 3EYTA 2YANA 2CV4A 3TRPA 2O89A 3QAGA 2VCZA 3UVTA 2FUG2 2YV7A 3ZFBA 3FZ9A 5D9XA 2L59A 2FWEA 2G2QA 4AJ6A 1K3YA 3TKPA 4XRAA 1K0NA 5CRGA 5G30A 1AW9A 4FYUA 4XHMA 1SYXA 4GQCA 2GSTA 3DVWA 2H30A 5ECKB 1TP9A 3HVSA 1E2YA 5DCHA 1ABAA 1UA5A 3M0FA 3VLNA 3KMNA 3D4MA 2OADA 1AXDA 1U3AA 3DEXA 5GAND 3Q18A 3S9FA 3G9BA 1MTCA 3LEFA 2OA7A 2LV3A 2B7KA 4TN8A 3P8WA 5D93A 3C8EA 2H6XA 1SKRB 1TXXA 3LXTA 10GSA 5F8BA 3ZIVA 2O7KA 3KXOA 5JWRB 4MCUA 1T1VA 2B5EA 5ENUA 4AJ7A 3TKSC 2J23A 5JWOB 3ISOA 3MNGA 1T4ZA 2YOIA 1NW2A 5LNKe 3KD0A 3LORA 2ON5A 2IN3A 4F2IA 3F0IA 5LD0A 3RBTA 3FRCA 5E4WA 2HRNA 3L9SA 5CP1A 2WCIA 3C73A 7GSSA 3DMLA 3KEBA 3I6AA 2XC2A 4RQXA 1BX9A 4LMVA 3ZFLA 1VRSD 4GCIA 2F9SA 2H01A 13GSA 2H70A 2WGRA 1VGLA 3EMPA 4Q5RA 1UN2A 1FVKA 4ZILA 1GSDA 4OFTA 3MSZA 1WPIA 2KHPA 3GKKA 1DUGA 4POKA 2H6YA 2GT6A 1QXHA 6GSXA 2P5QA 2H6ZA 1GLPA 4MJBA 4N11A 1B9YC 1SYRA 1GWCA 3GH9A 2I1UA 2XHFA 5G5EA 1HNBA 2LKUA 4NPBA 1ERWA 4YQMA 1V58A 1SKWB 20GSA 2B6MA 1PRXA 3VI5A 3BD2A 4EKZA 3ZL5A 2FCHA 2PWJA 1EP7A 2NBSA 4V2MA 2JSYA 3VPQA 3L9VA 5DJLA 3M8NA 3EU4A 1JHBA 2L4CA 4BVYA 3C1SA 1SJIA 2VL9A 3GTUA 1GRXA 2C0EA 1B4PA 4XIHA 1ILOA 4TXOB 2V41A 5D73A 5AGYA 3ZYWA 3D6IA 3F9UA 3TJBA 1PQNA 3PR8A 2WZ9A 3DYRA 2YWMA 4XS1A 3J7Yk 4CHSA 1BG5A 2LRCA 2VOCA 4TVEA 5HR1A 3VPTA 2ZCTA 4MJEA 3L9UA 2V32A 1VF2A 2DJKA 1K0DA 3VI7A 5IOXA 4KW6A 3UBLA 1WIKA 2GQKA 1M99A 2B1LA 2FLSA 2GQMA 3UL3A 5HFIA 4XS4A 3BCKA 2PN8A 5ECIB 2H0HA 4JEDA 2LTKA 3QPMA 3P7XA 5D9TA 1X5CA 3GYKA 3M9KA 1PKWA 2H73A 5IIZA 1XZOA 2GSRA 1ON4A 2FWFA 4GXZA 2VAFA 2GLRA 5IOWA 3DIEA 4RI6A 4EXJA 1W4VA 1I9DA 2B7JA 2BTOT 1K0AA 5HR2A 2FA8A 3KH7A 5ECPB 5J4UA 3GSSA 4YAPA 2M80A 4HOJA 4V1Ap 4WF5A 3EE2A 1MD3A 4WF4A 2GZPA 5EPFA 2P5RA 3W8SA 1SKSB 3APQA 5J3RA 3BOAA 2I9HA 5D96A 1F37A 2GQLA 1O6JA 3G7IA 2WJUA 4ISDA 3APSA 3F3RA 2LJKA 3TKRA 1A2JA 2VLVA 2XPEA 4ZBAA 3GNJA 2WULA 3UOMA 4WBJA 4F0CA 3E9JB 3VWUA 5FHIA 5G5FA 1C72A 2H0IA 5A5KA 1PN9A 3GL3A 4XS6A 1GNWA 2HE3A 4ZB6A 4JR4A 2HXKA 5KN3A 4AGSA 2EIQA 1K3OA 3FZ4A 3O3TA 2LQOA 4Q5QA 4HZ4A 3GKMA 2R3XA 3QD9A 4O5RA 1MDIA 5IPHA 1BYEA 2MMAA 4X1UA 3NOFA 1PL1A 2IMIA 2LEGA 1M7TA 1PX6A 5IPGA 4HU9A 2CZ2A 3QOUA 1EWXA 2IMFA 3O6TA 3KP8A 1OC9A 4JBBA 3MAKA 5G2ZA 3IPZA 1XFLA 2HNLA 3VWXA 3UIWA 2KLXA 11GSA 2PPTA 2OACA 3GURA 4MLYA 4BPYA 3ERGA 3GA4A 1GL8A 3TJGA 3GMFA 2DJJA 1V40A 2ZUPA 1K3LA 3JCML 1AQXA 4I6XA 4EVMA 2KP2A 2IMKA 2R4VA 4RI7A 1KEBA 2DC5A 4I8BA 4IS0A 2WS2A 1S3AA 4V2NA 1KBNA 3GSTA 1PSQA 3WYWA 1Z7PA 1GUHA 4DEJA 3ZREA 1IYHA 2QSIA 5DJMA 3TOUA 1HD2A 3ZMKA 3I9V2 5KN0A 2XBQA 3EMXA 4KH7A 5ID2B 4F82A 4IJ3A 3M9JA 4NHWA 2DJ0A 2F8FA 2K18A 1TKDB 2EIRA 6GSWA 2C3QA 2YNXA 2E2MA 5C00A 2DIYA 3ERFA 2WB9A 1PD21 2IFQA 2K6VA 2C80A 2RUEA 4G10A 2RM5A 4ML1A 4EDZA 4TR3A 5AISA 1TK5B 2VUPA 1PGTA 4HDEA 3EVIA 3KH9A 3Q74A 4MH3A 4V1Ag 4E8EA 3D21A 2A2RA 1YKCA 1O8WA 5DALA 5IMFA 5IMDA 4AJ8A 3FHKA 5COHA 2AHEA 4IBPA 1M9AA 4XS4B 5A4UA 2NPBA 4YAVA 4XRDA 3A3TA 3ZZXA 1TU8A 1QK8A 4LA1A 4AF2A 5GZZB 2PBJA 4WXTA 4NHZA 2MMZA 3A2VA 4L0UA 2X8GA 9GSSA 1S3CA 4WR4A 1SK0A 1SL0B 3KP9A 4ZIJA 4JU5A 3GKNA 2I81A 1XWCA 5G31A 1VF3A 3A2XA 1F6MC 1EEJA 2KP1A 2LNSA 4IJIA 5GSTA 5IO2A 2RLIA 4TKYA 4H86A 2N5FA 3H79A 4IW9A 4Q5NA 4ECCA 3RHCA 2PU9C 2L57A 3FK8A 2GSSA 1RQMA 1MDKA 4PNFA 4POLA 2CVDA 1TI3A 1F2EA 2CT6A 1TRWA 2FGXA 3GL5A 4EL1A 1H75A 2ALBA 1X5DA 5GSSA 4G19A 1XOAA 3M3MA 5B6NA 2JZSA 2HZEA 3FZ5A 5J41A 2AV4A 3KCMA 5ECQB 1O81A 2CX3A 2TIRA 3D22A 3GKXA 4IP6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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