1O8XA

Mutant tryparedoxin-i cys43ala
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
GLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPARGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords TRYPAREDOXIN
publication title Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function
pubmed doi rcsb
source organism Crithidia fasciculata
total genus 44
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1o8xA00
1HNCA 5J41A 3TKSA 3GUSA 1A2MA 1OKTA 3VWUA 1AQWA 4IBPA 1G7EA 5IO2A 1OAZA 2IMIA 2CAQA 2GSQA 3APSA 1UA5A 2DMMA 4O92A 1M7TA 2IIYA 1LU4A 1TU7A 1BAYA 1DE2A 1UVZA 3IR4A 2F9SA 3W8JA 3TCOA 3DMLA 2WRTA 4ZILA 5AIVA 4PQIA 1XWBA 3NZNA 3BD2A 2VD1A 1K0AA 1SK0A 4HQZA 1TKDB 1GUMA 4YH2A 3KMOA 5J3RA 3VLNA 1MDKA 5IPHA 1GSQA 5CRGA 3FZAA 3C1RA 1NM3A 3VPQA 1XW9A 2IFQA 5IM9A 4PXOA 3Q19A 2EC4A 3ME8A 1W89A 5CRHA 4MABA 3FRCA 3UBKA 2RM6A 1YEXA 2WDUA 4V2MA 1SL0B 1XWKA 3L78A 1VGLA 3IK7A 2GSTA 3QCPA 3VK9A 3M1GA 4N11A 2FGXA 4WEYA 3ERGA 17GSA 4BVYA 1AC1A 2V6OA 4XCSA 1Z6MA 2X64A 3WGEA 3G7JA 2OE0A 2LRTA 3L9UA 4AJ8A 4PUFC 1SKRB 3WGDA 2HZFA 2H74A 1OC3A 2HSYA 4PGTA 1ACVA 4NV2A 1ZYQB 1T7PB 2P31A 5DQYA 4JR4A 1K3OA 1SK2A 2GQMA 3DWVA 3ZMLA 4DSQA 3QMXA 4IJIA 5AIXA 4D73A 1USBA 3VI7A 2VLUA 2HRNA 2RUEA 2PERA 4NWYA 4HOJA 3A2WA 2B6MA 2CVDA 5DAKB 2B5EA 2H6ZA 2XBIA 1F2EA 2H30A 3EURA 2OACA 3GH6A 4K6XA 1UC7A 3QAWA 5AGYA 4OO5A 2N5FA 2B1LA 2HNLA 4CDOA 2CX4A 2REMA 3I69A 3H79A 5LD0A 1ERWA 5ECKB 4AJ7A 2RM5A 3TRXA 3C7MA 3GH9A 3QAVA 1EOGA 2H8LA 3A3TA 5ABRA 5KN1A 2GSSA 1R7HA 2K18A 3F0IA 3I6AA 3IBHA 4L5OA 4IKHA 5HR1A 1GTAA 1S3AA 1F9MA 2PWJA 2VM1A 1G0TA 4BVXA 4KA0A 2MMZA 2H76A 5J4UA 4O32A 1XWGA 1R26A 3ED3A 4G10A 3FK8A 1SKWB 4HS1A 2LTKA 2H1DA 2IFQB 2M72A 1FW1A 2H71A 4POBA 1T00A 2K6VA 2FWGA 3SWLA 3HVXA 1K0BA 3EYTA 2X8CA 2H72A 2N5BA 3DXBA 5ECLB 3V1WA 3ISOA 1XVWA 4PQHA 4L0WA 1TRUA 1X0RA 3APOA 2FCHA 1SYXA 4OFNA 1NHYA 2KOKA 4TR0A 3KIJA 1HQOA 3A2XA 4TW5A 2JZRA 6GSUA 1BQ7A 1I5GA 5EPFA 3MNGA 2OKAA 2VIMA 5E4WA 4Q5RA 2PN8A 1ERUA 1M2DA 3UVHA 1GRXA 3F6FA 4WXTA 1XCCA 3GHAA 1WIKA 1XIYA 1FO5A 2H1AA 3HJMA 4F03A 3W8SA 3W6GA 4WKWA 4F2IA 3DVWA 4OCFA 3KMNA 4D73B 3F3RA 4MMMA 3ZIVA 2XC2A 1Z7RA 2C3TA 2RUFA 2IPAA 4YQMA 2H75A 1Y25A 2YN1A 5JWRB 3VI5A 2LKUA 1LJRA 4HEA2 4KE3A 4RI6A 2DIZA 1MD4A 4XS4A 2L6CA 1FB0A 2JADA 4HU9A 1YQ1A 1QMVA 1YKCA 1AIUA 2CT6A 3ZFLA 2BMXA 2H6YA 2JU5A 5DVBA 3FY7A 5J5NA 4ZL7A 2TRCP 1YZXA 1VRSD 2L59A 4TXVA 4ULXA 2KLXA 5CREA 4WF5A 5G2ZA 3TGZA 2OA7A 3KTBA 4IS0A 5F06A 2YWIA 4ZB9A 2C0FA 3FW2A 1PRXA 1M9AA 1EP7A 3HCZA 1VF4A 1NHOA 1V40A 2VAFA 3ZREA 1HNAA 2J23A 1U88A 3P2AA 4KSOA 1XFLA 14GSA 2C1YA 1GLQA 4MH3A 2H19A 1GSDA 3H1NA 3F4SA 2OADA 4ZBDA 4ECJA 4K7IA 4ZB8A 4GWRA 1YF1A 2NVLA 4GLTA 2R6KA 1PSQA 2V6KA 2MZCA 3D6IA 1THOA 1S3DA 2X8GA 3E0UA 2NTOA 4ISDA 5ELAA 4KDXA 4KW6A 1X9MB 2L57A 1JHBA 3QR6A 4HU7A 4GXZA 1XW6A 1GSSA 5ECNB 4WR4A 2YJHA 1E6BA 5A4UA 4TXOA 4RUVA 3TRPA 2VCQA 2C3QA 3O3TA 2LRCA 2JSYA 2P0GA 1IYHA 20GSA 3QFAC 4WF4A 5ECHB 1Y6EA 3CRUA 2VCZA 2YCDA 4NHZA 2MBSA 5DCHA 1F6MC 3L0HA 4TVEA 2Z9SA 1FHEA 2RIIA 4PX1A 4XS4B 1J08A 1DSBA 2IWTA 3GN3A 4FO5A 1IYIA 2M80A 1GUKA 4AF2A 1AXDA 5HFIA 3GNJA 3KM6A 1GSUA 3KGKA 3RAZA 3M3MA 1TP9A 5B6MA 3FEUA 2EIRA 1O8XA 1QUWA 2JSZA 1T1VA 4ZXGA 3CYNA 2HYXA 5JCWA 5C04A 1SJZA 2MMNA 2L5LA 4MLYA 1QQ2A 3GV1A 4POMA 4BWSA 2LEGA 2AUVA 3CXGA 5CNWA 5DALA 1V98A 5IQYA 5LNKe 4OCEA 3VURA 2LJKA 2VL2C 5ECSA 2V32A 4GCIA 5JCGA 3TJFA 4K1FA 4H86A 1T4ZA 5F07A 2GLRA 4TOPA 1JZOA 1HD2A 4FIWA 2YP6A 4K9ZA 3I9V2 3LG6A 2H66A 3D4MA 2LS5A 3TOUA 4JR6A 2JZSA 1OVNA 3ERFA 3DIEA 3WD6A 1M2BA 3J7Yk 3EC3A 1G7OA 2R2JA 1Z3EA 1VF2A 2VCXA 11GSA 1A8YA 2P5RA 3P90A 2GGTA 2L6DA 1TW9A 1XVQA 3H4KA 4FH8A 5DBQA 1EOHA 3ZMKA 1K0DA 4MK3A 2DJ3A 4XS1A 4PNGA 1K0CA 4EXJA 1ZL9A 3HJPA 4WBJA 2H01A 1O6JA 3S9FA 5E59A 3MSZA 1WRYA 8GSSA 2O89A 2QC7A 4K0GA 1THXA 4TR1A 2GT6A 3FYGA 1TDIA 2YJ7A 3ZFBA 4TXOB 4ID0A 3DD3A 4OMVA 3M9JA 5C00A 3GYKA 4CW9A 1Q4JA 4EE0A 2LNTA 1ZYEA 3PINA 3VWVA 1EV4A 3E9JB 2JL4A 2LV3A 5CAXA 4MF7A 2FHEA 4IQAA 2IMDA 5IMDA 2ON7A 5COHA 2YWOA 2LJAA 5CYYA 1TRWA 3HVSA 3RHCA 2MYGA 1ABAA 2DJ0A 1X5CA 1SU9A 3TJJA 1RQMA 4JE1A 5DCGA 5KN0A 2MMAA 3WT1A 3BCKA 2YZUA 4PQ1A 4MA9A 3TJKA 1GTUA 5DALB 1Z9HA 2IJYA 1MEKA 1TJDA 1JFUA 2PGTA 2FA8A 2VCVA 3GL5A 3F8UA 4DSRA 4L5LA 4I2TA 2PUKC 5F8BA 3EVIA 4MJBA 4LMVA 2FLSA 1MD3A 5IMZA 1WE0A 4BPYA 3GFKA 1QK8A 1Q98A 5D93A 3CSHA 5GSSA 3LSZA 3ZTLA 3DKSA 3TKRA 3P8WA 4QL9A 4WETA 4YQVA 2HLSA 4XHMA 3BBYA 1FAAA 9GSSA 3GA4A 1Z6NA 1O7UA 1M2AA 2YZHA 1FG4A 1UN2A 3Q18A 3GURA 2WCIA 1M99A 5KN2A 4GSSA 2YWMA 3EU3A 3WGXA 5IO0A 3IE3A 1H4OA 1OKDA 2KP1A 1QXHA 4TR1B 4I5QA 1JZDA 3H8QA 3US3A 3VPTA 5IMFA 5A4VA 1URMA 2AYTA 1M0UA 1ML6A 1A8LA 4NPBA 1SENA 2B3SA 4IQ1A 4E8HA 2V2GA 4HI7A 4XRAA 4TKYA 2O8VB 3PR8A 3ZZXA 3I43A 1O85A 2BTOT 3N5OA 2F3MA 2A4VA 2WFCA 3AY8A 1K3YA 3C73A 3M8NA 3TJBA 2GSRA 3GX0A 4JU5A 2VOCA 2L4CA 3ZIJA 3ZVJD 3F4RA 1A2JA 3GKXA 3HJOA 2AAWA 2FA4A 3PGTA 3KP8A 1R4WA 2FWHA 2GT5A 4KDYA 2G2QA 2AJQB 4HJ2A 5IIZA 2AB6A 1WMJA 3DRNA 2TIRA 4X43A 2PVOC 2LSTA 5D96A 4EO3A 3LJRA 1RK4A 1X5DA 3GKKA 4EF0A 3IAS2 4POKA 4MF6A 2DIYA 5J9BA 2B5YA 1AQVA 1G6YA 4HJMA 4POLA 1XOBA 1BYEA 3M0FA 4LA1A 3BJ5A 2DC5A 2VCTA 10GSA 4G19A 3O76A 2H73A 4YAPA 2F51A 22GSA 2GVPA 3E3EA 4MZWA 16GSA 1T4YA 4RQXA 1T8EB 3KH9A 2OE1A 2C3NA 1GL8A 4F0CA 1U3IA 3LXZA 3EE2A 1AAZA 3G7IA 1X9SB 3TJGA 5G1KA 4GSTA 2A2RA 5ECMB 4L0UA 3HVVA 1K0NA 4GF0A 1WOUA 1B4PA 2C4JA 4IW9A 1KTEA 2I9HA 2PU9C 1PKWA 3F6DA 4K7OA 1EGRA 4JBBA 1PX6A 3RDWA 1OE8A 1TK8B 2K9FA 2B7KA 2TRXA 5IOWA 4HDEA 2JACA 2YOIA 2ON5A 2LQQA 2WULA 4F9ZA 4N30A 2CV4A 2GZZA 3C71A 2ZCTA 3N9JA 1WJKA 5G5EA 3WYWA 3ZVJA 4BWQA 3LEFA 4ML6A 2C0DA 2PMTA 2R5GA 4EC0A 3A2VA 5D8IA 5IMAA 2C8UA 1A2LA 3VWWA 1H75A 2H1BA 4HZ2A 3LYKA 6GSXA 1JZRA 1OC8A 3CBUA 5H5QA 1AW9A 5DJLA 4GQFA 1BJXA 4AGSA 2VL2A 1SL1B 3FZ9A 5ID2A 4RI7A 1HNBA 4IVFA 2GZYA 2HE3A 18GSA 5GAPD 1V9WA 3RBTA 3G7YA 1PA3A 2NBSA 4EKZA 5IMVA 2IL3A 2D2ZA 1N8JA 2VLVA 1GTIA 3EMPA 3ERWA 1TK0B 4KNDA 3CTGA 2EIOA 4YAVA 2WS2A 4TR3A 1JLVA 3FR3A 3ZITA 2V41A 3IOSA 4MZCA 2DJ1A 1DE1A 1KNGA 4ZBAA 1O81A 1A23A 1YDKA 4I97A 3UARA 3FHKA 1GH2A 4K7NA 2DBCA 3TDGA 2FWFA 2L5OA 1PX7A 1RW1A 2WZ9A 3KTLA 3TKQA 1QFNA 1TXXA 3UAPA 3HY2A 3HA9A 5IOXA 4XTSA 3GX8A 1R5AA 2O87A 5ECQB 2FD3A 5HR3A 5CRDA 1W4VA 3LORA 4X1UA 4N10A 2YANA 1A0FA 4NXIA 3UL3A 1DUGA 3KZQA 3UEMA 5D9XA 2X8HA 3KEBA 4AJ6A 1A0RP 1XWAA 2HSHA 4BL7A 2HXKA 1S3CA 1MTCA 3LYPA 2GS3A 4WR5A 2VD0A 4TRXA 4HZ4A 1PMTA 1EV9A 4MZBA 2O85A 1TRSA 5H5RA 1NSWA 3O6TA 4ECCA 1WWJA 1GSFA 3F9UA 3GTUA 1GSYA 1X5EA 5G5FA 1ZZYA 1J9BA 2ZUPA 5GSTA 2X99A 3MDKA 6GSVA 1TTZA 2CVKA 5ELGA 3HZ4A 5ID2B 1FOVA 4IN0A 3IK9A 4QL7A 5B8BA 1DBYA 2H0GA 4XS6A 2H0IA 3QFBC 1B4QA 3D0ZA 4LLRA 1F3BA 3WT2A 2MMOA 5DQSA 4J57E 3Q74A 2JZTA 2BJXA 4EUYA 1TRVA 3R2QA 4IP1A 4HUAA 1SK1A 2LQOA 4F82A 2QGVA 3GSTA 5INYA 3EU4A 2DJ2A 2KHPA 5ENUA 3GRXA 2WGRA 1U87A 1JZWA 3HYPA 13GSA 2XHFA 3VWXA 3IC4A 4Q5NA 3EINA 4XRDA 1ERTA 1EEMA 3C1SA 4O7HA 5DAKA 5A5KA 2C0EA 1BEDA 1FVJA 3TB2A 5KEJA 2CAIA 4MJAA 2IMKA 2HRFA 1SD8A 3SBCA 1EP8A 1XWCA 1V58A 4GSNA 4J56E 4KH7A 2VCWA 5FT3A 3EWLA 5IMCA 3F63A 6GSTA 1U3AA 2OBKA 3HHVA 5KN3A 4Z7XA 4ILFA 4WBRD 2QKEA 1GNWA 4ECIA 1I9DA 3GTUB 5GZZB 3IPZA 3EMXA 1B48A 3IXRA 3IHQA 1YKAA 1PL2A 19GSA 5GAND 1R5PA 5DJMA 3LGCA 4MJCA 1CQGA 1F37A 3UOMA 1O73A 5IPGA 4MP4A 3ZRDA 1MDJA 3BOAA 2V1MA 3LQ7A 4IJ3A 2HFDA 1CQHA 2IN3A 4V1Ap 1TK5B 5HFGA 3DYRA 2DJKA 3HKRA 3ZYWA 5AN1A 2DJJA 4GRFA 2R4VA 1B8XA 3GSSA 4MCUA 3TKSC 4BA7A 2I81A 4ML1A 1NW2A 2EIQA 3HXSA 4XIHA 2MBTA 7GSSA 3QD9A 4NAXA 5G1LA 4IP6A 5DDLA 3ME7A 2E2GA 3U6VA 1VF3A 5D9WA 5EY6A 4HQSA 2L4QA 4I6XA 5D9VA 4KAEA 1TU8A 2P5QA 5D73A 3UIWA 3GL3A 1TOFA 2CVBA 5HQPA 5B6NA 2AV4A 3KXOA 2OBIA 4P3YB 5CO3A 3CTFA 1GP1A 3CSIA 2DMLA 4Q5QA 4ZL8A 4TR4A 3JCML 5G31A 2E0QA 2GQLA 12GSA 4O5RA 4DEJA 1KEBA 1X9WB 2KUCA 3OR5A 4MPGA 2F8FA 3HZ8A 1MDIA 3D22A 4N0ZA 1PN9A 3KD0A 5B8AA 3PH9A 2A2SA 2FUG2 3IDVA 4J2FA 1YY7A 3C8EA 5F05A 4YQUA 2XPEA 2YNXA 1JLWA 3L9SA 2IMFA 5B7CA 2FY6A 4KDUA 4NV5A 4L8EA 1V57A 2HZEA 2O7KA 4PUAA 4FYUA 3LWAA 5ECOB 1B9XC 2HI7A 2RLIA 3UBLA 1T3BA 2R3XA 2LNSA 2YV7A 4K2DA 1XBSA 2NDOA 1C72A 1YJ6A 2M46A 5F0GA 2WJUA 6GSWA 4MDCA 2VL9A 3GIXA 1EEJA 3UJ1A 1YEPA 3VFIA 1GTBA 2YWNA 3D21A 1BX9A 3MAKA 3FZ5A 4DVCA 1GSEA 2GZPA 1B9YC 5JWQB 1GNEA 4ECBA 2H6XA 5H5SA 1XOAA 3TRQA 4JEDA 4MJEA 3IRAA 1AUCA 5LCZA 4DSSA 4KCEA 4Q5FA 3APQA 4NMUA 4KB3A 5HR2A 4ZB6A 2I3YA 3KH7A 3QDNA 3M9KA 4PNFA 4I8BA 1F3AA 3K8NA 3LXTA 3CMIA 1G6WA 1XZOA 3F4TA 1PKZA 1ST9A 1XXUA 2FNOA 2J9HA 2XPDA 2LUSA 3UVTA 1PD21 5G30A 1YF0A 1K0MA 5ECIB 2CZ2A 2ALBA 3FZ4A 2DLXA 2I4AA 2NPBA 1ON4A 3HDCA 1Z5YE 2YPMA 2WB9A 3UMAA 2OJLA 4OWYA 2H0HA 2K8SA 4MF5A 4OFMA 1XW5A 3LFLA 1SYRA 1GULA 2H1GA 3FR6A 2CX3A 1PGTA 1U6TA 1QGVA 2B7JA 1OC9A 2VLTA 2PPTA 2GQKA 5D9TA 3A5WA 3D4TA 4V2NA 2GDRA 4G2EA 4LMWA 2R37A 4JRRA 2PBJA 4OD7A 1PQNA 2HZEB 5CRWA 4K8MA 1HYUA 4KSMA 2B5XA 3L9VA 3FKFA 1TI3A 6GSYA 4IHUA 5J9CA 4N0VA 3GKMA 2FWEA 4LL4B 1OE7A 1FVKA 1J0FA 2ZNMA 3F3QA 1O8WA 5JCUA 5FHIA 4JZQA 3TUEA 2YV9A 4OO4A 3IAM2 4IGJA 1FB6A 2ES7A 1VF1A 3IA1A 3Q6OA 5FWGA 3L4NA 3TKPA 5HR0A 2N5AA 2VUPA 2PVQA 4KCAA 3D5JA 1ZCPA 3DEXA 4RQRA 5AISA 6GSSA 5L71A 3RPPA 1SJIA 4DSSB 4EL1A 1A24A 1XPVA 1GLPA 3TKSE 3TOTA 5CP1A 2CZ3A 4QQ7A 3QOUA 2C80A 1LBKA 2B1KA 2DSAA 2F8AA 3G9BA 3CSJA 4ACSA 4ZIJA 1K0OA 1M9BA 1N2AA 4KX4A 4MPFA 1BG5A 1OYJA 2XBQA 1ILOA 4EDYA 3GMFA 4PURA 4K0NA 2IMEA 4FYBA 2VO4A 4TN8A 1SD9A 2OE3A 3H93A 2KP2A 1EZKA 4NHWA 1E2YA 3U5RE 3KJYA 4EDZA 1TI1A 2E2MA 4I2UA 3KP9A 2C0GA 3FR9A 3DGQA 4FYCA 1GWCA 2QSIA 2HT9A 3GKNA 2GTUA 4G9HA 4ZL9A 5ECRB 5EL8A 1ZMAA 4IELA 1WPIA 4F0BA 3NOFA 1OC9B 1SKSB 1ZGNA 2LJRA 3IV4A 3RPNA 3QAGA 2E7PA 1WP0A 2VL3A 4V1Ag 5A4WA 3CRTA 1SL2B 1AQXA 3QPMA 4KUNA 3HD5A 1PL1A 4LL1B 1V2AA 2LRNA 3MWHA 3NIVA 4E8EA 3P7XA 4KGIA 3J7Yb 2VM2A 2CQ9A 1GUHA 1ERVA 1SJ6A 3BCIA 3KCMA 1EWXA 2I1UA 5ECPB 2G0FA 2K8VA 4GQCA 4X0XA 2H70A 3DVXA 4OFTA 1EGOA 5JWOB 3ZL5A 3ZLPA 1KBNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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