1O8XA

Mutant tryparedoxin-i cys43ala
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
GLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPARGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Crithidia fasciculata
total genus 44
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1o8xA00
3ZRDA 2QKEA 2YP6A 5IO0A 1N8JA 4E8EA 2DJJA 3TKPA 3RPPA 5CP1A 1H4OA 1VF3A 1R5PA 1X0RA 1K0AA 4X1UA 2GQMA 1OVNA 1FG4A 2IFQA 4ACSA 4MF6A 2XPDA 2H73A 2NDOA 3ERWA 2FGXA 2JSZA 4XS6A 3JCML 2RM5A 5GSTA 2JZSA 4JU5A 3UEMA 1ZZYA 2HNLA 4CW9A 4XRDA 1F3BA 1R7HA 2VUPA 5DCGA 5E59A 1TXXA 3D22A 1AIUA 5IPGA 4K9ZA 1Z7PA 3HD5A 4ZB8A 3VI7A 4HEA2 20GSA 4FYCA 3AY8A 2A2RA 3FKFA 3GRXA 5DALB 5KN3A 5J9CA 5HFGA 2LV3A 2H0HA 4EUYA 1J9BA 2F9SA 3G9BA 2C3NA 5KN0A 4BWSA 3F4RA 2DSAA 1EV9A 4TR0A 3C8EA 1YY7A 4JRRA 4TW5A 2V1MA 5A4VA 3US3A 3ZMLA 4WETA 2CVKA 3RHCA 1XCCA 5ENUA 1PX7A 3A5WA 1OKDA 1MD4A 3KP9A 3GL3A 4V1Ap 4AJ8A 5LD0A 1JZRA 1GSEA 5EL8A 2CAQA 5JCWA 6GSSA 1TKDB 2E0QA 3C71A 2WRTA 1K0NA 3TJBA 1A2MA 1V57A 1A8YA 4RQXA 1NHYA 4G19A 4IHUA 3DVWA 3QR6A 3F0IA 1DBYA 1N2AA 3QFAC 4GCIA 3FEUA 5ELAA 1UN2A 4MZCA 3DEXA 1GLQA 1M99A 3RPNA 1T1VA 3ZIJA 1PL2A 1FB6A 4D73B 3KXOA 2LJKA 4ZXGA 2C3TA 3KZQA 5ID2A 4HOJA 1GSSA 1A24A 1U3IA 4FO5A 2ON5A 3F3QA 4OMVA 2R6KA 3UBKA 3GUSA 3U6VA 2IMFA 5HR2A 5ABRA 2YWOA 2VOCA 3Q19A 1MEKA 2B5YA 2FA8A 1EZKA 1HNAA 3H8QA 3D6IA 2HLSA 5HFKA 1WE0A 2GZYA 4MPGA 3G7IA 4KH7A 2HYXA 4IGJA 1B8XA 2X8GA 1EEMA 2YWIA 1GL8A 5GZZB 4KX4A 1K0BA 3GKMA 2HRFA 2IJYA 2GVPA 2I1UA 1FW1A 3LFLA 4N11A 2MMNA 2GSQA 4TKYA 2O89A 3EVIA 2VLVA 4IKHA 3HJOA 4WEYA 4JEDA 4TXOA 1SJZA 3A2VA 2D2ZA 3M9JA 1DSBA 1MD3A 5IM9A 3VLNA 3WGEA 4OO5A 1XXUA 2HZEB 4WKWA 1XWKA 1E2YA 2VCWA 3ZITA 2IFQB 1QMVA 2C0DA 2GZPA 4K1FA 2GQKA 4OCFA 2GGTA 4RUVA 3K8NA 1U6TA 1DUGA 5CRGA 2CVBA 3DYRA 1WIKA 2H1BA 2PMTA 4ZBBA 2C8UA 5ECOB 3APQA 3CMIA 2AYTA 1SD9A 2C1YA 4KNDA 2PVQA 2H70A 2IPAA 1OAZA 3EC3A 3TJGA 4GLTA 1LJRA 3LG6A 5EY6A 5HFIA 2GSSA 2H19A 5AISA 4I2UA 1W89A 4YQVA 4P3YB 3KH7A 3WGXA 4FIWA 2F8AA 1EV4A 2H71A 5D9XA 4N30A 2PU9C 1IYHA 2V32A 4POKA 1XW5A 2WS2A 4V1Ag 3KMNA 2F51A 3KP8A 5DQYA 2PPTA 2EIQA 1SYRA 2R4VA 3LXTA 4HUAA 22GSA 4HQZA 4IJ3A 1YJ6A 1QFNA 3CRUA 1ACVA 1ZYEA 4PGTA 3UBLA 2IN3A 2H6YA 2CX4A 1OKTA 2FD3A 4XS1A 3IRAA 4IQAA 4MH2A 1PX6A 4TR4A 2C80A 4EC0A 2PGTA 5KN2A 4HJMA 4WF4A 2YNXA 5H5RA 5IMFA 4DSSB 3E3EA 1ABAA 4O5RA 1T4YA 3EMXA 4LMWA 2PVOC 3EU4A 1SL1B 3WYWA 5B6NA 2MBTA 4PQ1A 2P5RA 4ZL9A 1G0TA 3C7MA 5A4WA 4F0BA 5COHA 1ZOFA 3TKSA 4Q5NA 2B5XA 5KN1A 5L71A 5CRWA 4YH2A 2AV4A 3APSA 2ZCTA 1MDIA 3CSHA 1PQNA 3RHBA 1GTBA 4MPFA 3APOA 1GUMA 5D9WA 4KA0A 2VCQA 1Y25A 2J9HA 6GSTA 4IN0A 5B8BA 3ZTLA 3QMXA 2VCTA 4K7NA 1AQXA 5ECLB 1G7EA 5J41A 5CRDA 4ZB9A 2X64A 2HT9A 3KD0A 1AQVA 4K8MA 2ALBA 3HVVA 2IMKA 2P0GA 2YN1A 4DSRA 4MLYA 3VWXA 3FZ9A 1XWGA 2B7JA 2H6XA 2OADA 4F9ZA 1SENA 1R26A 1HNCA 4XS4B 4OFTA 3HDCA 3EMPA 4HI7A 1JZWA 4IQ1A 1I5GA 2LRTA 4H86A 2DMMA 2V6OA 4EL1A 3C73A 1K3YA 5DCHA 3EYTA 1ZMAA 3QDNA 16GSA 3PINA 4KDYA 6GSVA 2H6ZA 1K0OA 3EWLA 2X99A 4EF0A 2CZ2A 2HFDA 1X5CA 2LJRA 4TOPA 4O32A 1BJXA 4ZBAA 2A2SA 2O8VB 1G7OA 3EURA 2MYGA 5AN1A 2O87A 5AIVA 3N9JA 3TJKA 3D21A 4K0GA 3FYGA 5D93A 1IYIA 3UL3A 4Q5RA 9GSSA 3TUEA 1Z5YE 1URMA 3KTBA 3TRQA 1TP9A 3FW2A 4MJBA 1Z9HA 1A0FA 2LS5A 4MP4A 2IWTA 1JLWA 1B9YC 1O81A 5B7CA 2H01A 2X8CA 1HYUA 1NW2A 1A23A 4WXTA 3GTUA 1OC9A 3O76A 1EOHA 4IJIA 4PX1A 1R5AA 2VAFA 2WJUA 2YZUA 4YAPA 3U5RE 3LEFA 1GSUA 2OE1A 1J0FA 1TRWA 3FK8A 4NPBA 4O7HA 4PXOA 2MBSA 4ECBA 3G7JA 5JWRB 1WJKA 4I97A 5HR3A 1FAAA 4J2FA 2K18A 4ECIA 2OA7A 1LBKA 5EVOA 3QD9A 2R5GA 5DVBA 4POBA 3GIXA 1GNWA 5C04A 3IE3A 4PQIA 1XPVA 1PN9A 2GZZA 2OBIA 2GQLA 1S3AA 1UC7A 4OO4A 3TJJA 1GNEA 1ZGNA 3CTGA 1T7PB 1PL1A 3M8NA 5D73A 2NPBA 2CVDA 2O7KA 2R3XA 3GH9A 1XZOA 2YWMA 2IMIA 3KEBA 3KH9A 1VGLA 3ZL5A 2DIZA 3VI5A 3LGCA 1TK0B 3GSSA 3KGKA 5ECSA 1HD2A 1M7TA 4OD7A 1ZL9A 4G2EA 2YOIA 2VL2C 5IIZA 2VL3A 3DGQA 2WDUA 4JZQA 1SJ6A 2FWGA 3WGDA 5D9VA 2XC2A 2NTOA 5FWGA 4YAVA 3KCMA 3IPZA 4GXZA 3WT2A 2BJXA 1KNGA 3S9FA 3FR3A 4OFMA 1XWCA 1YQ1A 3IXRA 2FHEA 3DVXA 3TB2A 1EEJA 1QGVA 3O3TA 3QAVA 1OC3A 2LNSA 3IDVA 3FZ5A 1ON4A 1U88A 2OKAA 2H8LA 1XWAA 3UARA 1GTAA 1TRSA 2GSTA 2I3YA 4EDZA 3SWLA 4XCSA 5G2ZA 2LJAA 4IELA 3GHAA 1XVWA 3QCPA 5JWQB 2L57A 3TKRA 2J23A 2N5FA 4MJEA 3ERFA 3TGZA 2LTKA 2H1DA 4ML1A 1NHOA 1CQGA 2GT6A 4X43A 2EIOA 2H30A 1ZCPA 2EC4A 4AGSA 2B3SA 3HKRA 3A2WA 4MZWA 5ECIB 4LA1A 2QSIA 2M80A 3BJ5A 4NHWA 4IVFA 3LSZA 1RK4A 1TRUA 2GTUA 4F03A 4KB3A 1E6BA 4PQHA 1Z6MA 4MF7A 2DMLA 4IW9A 2LRNA 1SYXA 2FWEA 4RI6A 1PGTA 3IK7A 4MZBA 4L0UA 2L4QA 4TR1A 4AJ6A 1V2AA 2B1LA 2X8HA 4J56E 2RM6A 2OACA 4MH3A 1FVKA 1GLPA 2L5LA 1LU4A 1YKAA 4ULXA 1GUKA 2QC7A 2IMEA 3M3MA 4Q5QA 3HHVA 1OC9B 4WBRD 2NVLA 5HR0A 2VM1A 2JZRA 3A3TA 3VWVA 1THXA 4HDEA 4POMA 5H5SA 3H79A 2EIRA 1ERVA 4F0CA 1O85A 2B5EA 1JZDA 6GSXA 2C0GA 3TRXA 2L6CA 1V58A 3FZ4A 2HZFA 1Z3EA 2C3QA 3IA1A 4KDXA 2IIYA 3FRCA 4HU7A 4GSTA 3M0FA 1K3LA 4QL9A 3VPTA 3F6DA 1B48A 3P90A 2LNTA 1K0CA 3C1RA 3J7Yk 3DKSA 5CNWA 4OCEA 2DJKA 1M2BA 1TW9A 4TR3A 1DE1A 4G10A 4GQCA 2LUSA 3EINA 2XPEA 1TRVA 1SL2B 3P8WA 4KE3A 2WFCA 2GSRA 1O7UA 4ML6A 2JACA 2K6VA 5C00A 1QXHA 1NM3A 1G6YA 3LWAA 3QFBC 2P5QA 1TU7A 2YWNA 5FHIA 2JADA 5B8AA 1OC8A 1FB0A 2HI7A 1TJDA 2F3MA 1G6WA 3BCIA 3PH9A 2C0FA 2REMA 2FLSA 4F2IA 2L5OA 2H72A 3UAPA 5CREA 3EU3A 2F8FA 1GH2A 3UIWA 2KOKA 2DIYA 1TI3A 3KIJA 1W4VA 5F05A 3IK9A 5GSSA 5GAND 4I8BA 1XFLA 2VL2A 1OYJA 4EE0A 1AAZA 5F06A 4ECCA 4JBBA 1B4QA 1PSQA 1GSYA 2H0GA 4K7OA 2VO4A 5H5QA 4BA7A 5JCUA 18GSA 4IP6A 1GTUA 1PA3A 2CT6A 1USBA 3VWWA 3GA4A 4L5LA 1XOAA 12GSA 1O8XA 4TN8A 2DJ3A 1A2LA 3UOMA 1FVJA 2MMZA 2MZCA 1X9MB 2LEGA 2PERA 2VM2A 4RQRA 3QAWA 5IOWA 4L5OA 3RAZA 2XHFA 5DBQA 5G31A 3R2QA 1A0RP 4DVCA 4HQSA 3CSJA 4N0VA 1X5EA 3HXSA 3NIVA 1A8LA 1AW9A 4POLA 3VK9A 1M0UA 2H0IA 2GLRA 1F6MC 14GSA 3MAKA 2AJQB 5J4UA 3HYPA 3GX0A 1EGOA 3DIEA 2WB9A 5ID2B 3GKNA 4WBJA 5DJLA 1MDKA 2LKUA 2H1GA 2MMAA 4LL1B 4WR5A 3ZZXA 3A2XA 2NBSA 3CBUA 1THOA 3L4NA 4ZL8A 3LORA 2LRCA 1Y6EA 2YPMA 4L0WA 1M2DA 5DALA 4BPYA 4QL7A 2MMOA 4HS1A 4GSNA 1VF4A 2CV4A 2L59A 4L8EA 4AJ7A 1O6JA 1WMJA 2VCVA 2YANA 1SKRB 3TKSE 2WGRA 3TOUA 5DJMA 4GTUA 3GNJA 1ML6A 3IAS2 4NAXA 5AIXA 4ID0A 1M2AA 1SD8A 4MK3A 5J5NA 4MA9A 2XBQA 1U87A 4TXOB 1TK8B 3GURA 1PRXA 4PURA 3HJPA 2I81A 2Z9SA 3TDGA 3GKXA 5F0GA 4GQFA 1K3OA 1PMTA 3NOFA 3LQ7A 2RLIA 1EP8A 1O8WA 3P2AA 5IMVA 3HVXA 4PUAA 1QQ2A 1FHEA 4OWYA 1V9WA 5ECKB 3ZVJA 2VIMA 5CRHA 4GRFA 1T00A 1XW9A 2M46A 1AUCA 2GDRA 2ZNMA 2L6DA 3ZMKA 1YF0A 4NHZA 1AC1A 4MABA 2VL9A 3UVHA 2H66A 3IAM2 2YV9A 5LCZA 4HJ2A 5ECQB 2DC5A 1BX9A 4CDOA 2IMDA 4GF0A 4ILFA 1CQHA 1YKCA 3GV1A 5IO2A 1ERUA 3IBHA 3CTFA 5J9BA 4FYUA 3KJYA 3VPQA 1GSFA 1VRSD 3BBYA 3DWVA 2DJ2A 5HQPA 3E0UA 3NZNA 1WWJA 3CXGA 3ED3A 4N0ZA 3TRPA 3PGTA 1YZXA 2DJ0A 3F6FA 1KBNA 3ZFLA 3F8UA 4NWYA 1F2EA 1JHBA 2GT5A 4YQUA 1TK5B 4N10A 3DXBA 3I9V2 1EP7A 2K8VA 2FWFA 1KEBA 1SK1A 5ECRB 2HZEA 2RIIA 3HZ8A 3IV4A 5DAKA 4CHSA 4Z7XA 1BQ7A 4IS0A 4NV2A 1RQMA 5ECNB 3P7XA 3H4KA 1X9SB 2HE3A 1X5DA 1JLVA 2WCIA 2ON7A 3MDKA 5CAXA 4NV5A 4LL4B 4XHMA 1GUHA 2P31A 1YEPA 1H75A 1YDKA 4LLRA 5A5KA 2CA8A 1PKWA 2FUG2 4ZILA 1ST9A 1XBSA 4J57E 3I69A 3Q18A 1Z6NA 5ECPB 4HZ4A 3TJFA 3HVSA 3HCZA 3ZFBA 3LYPA 3G7YA 2FCHA 2B1KA 2TRCP 1T3BA 3D4MA 1A2JA 7GSSA 6GSWA 2KLXA 1UA5A 1QUWA 4GSSA 2R2JA 4KCAA 3DRNA 4AF2A 4EO3A 2FWHA 3F63A 4K7IA 4EXJA 3F3RA 1T8EB 2YJHA 1TOFA 1RW1A 1C72A 3GN3A 1UVZA 3W8SA 1BAYA 1YF1A 2LQQA 2CX3A 3GFKA 1Q98A 3ME8A 3N5OA 1F3AA 3BCKA 4K6XA 5J3RA 3C1SA 4IP1A 2HRNA 4YQMA 4ZBDA 3UMAA 1EWXA 1F37A 2OBKA 4FYBA 2FA4A 3FR6A 1ERWA 1WPIA 5GAPD 1S3CA 2VLTA 2BTOT 3HZ4A 2H75A 4V2NA 5HR1A 3TKSC 3KMOA 3QPMA 6GSUA 1BEDA 3TKQA 1XWBA 5INYA 3RBTA 4BVYA 1GTIA 4BWQA 4DSSA 2FY6A 4EKZA 5LNKe 2ES7A 3LYKA 1JZOA 3V1WA 4DEJA 4QQ7A 5G1KA 3TCOA 4JE1A 5G30A 1PD21 4KDUA 4ZIJA 1V98A 1KTEA 3W6GA 3M9KA 1XOBA 4Q5FA 4LMVA 2TRXA 5F8BA 2KP2A 4HU9A 4O92A 3LJRA 17GSA 3IR4A 4PUFC 4WR4A 3CSIA 2DJ1A 3GTUB 5JWOB 2OE0A 3M1GA 2H74A 2I9HA 2L4CA 3MNGA 1U3AA 2YZHA 1XVQA 1K0DA 1TTZA 1BG5A 2A4VA 3D0ZA 1SK0A 5DDLA 2FNOA 4F82A 3L9SA 4KSMA 4KSOA 3TOTA 1TU8A 2HSYA 4KW6A 4RI7A 5B6MA 2CQ9A 4FH8A 3O6TA 1DE2A 4XS4A 5IMZA 3GL5A 4MCUA 1FO5A 11GSA 3EE2A 10GSA 3J7Yb 1VF2A 3HA9A 3CRTA 3FY7A 4TRXA 1GRXA 3ZVJD 2E7PA 4XTSA 4TXVA 2LQOA 4DSQA 1HQOA 3OR5A 1SKWB 2WULA 3WD6A 3F4SA 5JCGA 4KAEA 4NXIA 5DAKB 2VCXA 3FHKA 3RDWA 3ERGA 1GSDA 3QAGA 5AGYA 3I43A 1O73A 1JFUA 4ZB6A 3ZIVA 1F9MA 5IOXA 5FT3A 2G2QA 3KTLA 2E2MA 3IHQA 4MJAA 1TI1A 3DMLA 1WRYA 3H93A 3D4TA 5ECHB 1SJIA 4K2DA 5D9TA 1GWCA 4ECJA 3HY2A 4EDYA 3CYNA 2JU5A 5E4WA 2N5AA 1QK8A 1GULA 5IMCA 2WZ9A 3PR8A 3SBCA 1B9XC 3IOSA 3GX8A 2CZ3A 2OE3A 4ISDA 3LXZA 2JZTA 5EPFA 3WT1A 2TIRA 4XRAA 5IMAA 3D5JA 4BVXA 1SK2A 3F9UA 3I6AA 4BL7A 1ZYQB 5G5EA 4MF5A 2LSTA 4KGIA 4HZ2A 4V2MA 2DBCA 4G9HA 2AUVA 2RUEA 4ZL7A 1FOVA 3FZAA 1AXDA 4JR4A 2G0FA 2QGVA 2PBJA 2VD1A 3VFIA 5DQSA 2R37A 4JR6A 1R4WA 2M72A 3GMFA 5A4UA 4OFNA 2XBIA 3BD2A 1EOGA 2V2GA 4MJCA 4KCEA 3H1NA 3VURA 2VD0A 4KUNA 4MDCA 2BMXA 2OJLA 1EGRA 2HSHA 2VLUA 5D8IA 2O85A 3HJMA 4TR1B 2E2GA 2V41A 2V6KA 4I5QA 5G5FA 1MDJA 5IMDA 1SU9A 1WOUA 5CYYA 2HXKA 2YJ7A 1XW6A 3KM6A 3BOAA 2AB6A 3ME7A 13GSA 1T4ZA 1Q4JA 2N5BA 2KP1A 3FR9A 5CO3A 1Z7RA 1GP1A 5KEJA 4MMMA 1J08A 3DD3A 4X0XA 1NSWA 2C0EA 1PKZA 5ECMB 3MWHA 2ZUPA 3MSZA 2PN8A 1MTCA 1GSQA 1YEXA 3L9UA 2H76A 1X9WB 1HNBA 3ZYWA 2AHEA 3GH6A 1XIYA 1I9DA 2DLXA 4IBPA 8GSSA 1SL0B 2C4JA 4PNGA 3UVTA 2CAIA 4PNFA 3L9VA 1B4PA 1V40A 3F4TA 1ERTA 4NMUA 3QOUA 1AQWA 2PUKC 4I2TA 4D73A 2VCZA 2K9FA 4I6XA 2K8SA 4GWRA 2B6MA 1K0MA 4TVEA 2KUCA 5IPHA 3GKKA 2JSYA 3E9JB 2IL3A 1TDIA 3L78A 2RUFA 1OE7A 3IC4A 2YCDA 1ILOA 2YV7A 1M9BA 2GS3A 19GSA 4K0NA 1BYEA 1OE8A 2AAWA 6GSYA 2I4AA 3L0HA 5D96A 5ELGA 5F07A 2KHPA 3Q6OA 1S3DA 3VWUA 4E8HA 1WP0A 3ISOA 3GSTA 3UJ1A 2H1AA 4WF5A 3ZLPA 1M9AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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