3IA1A

Crystal structure of thio-disulfide isomerase from thermus thermophilus
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
AVKPGEPLPDFLLLDPKGQPVTPATVSKPAVIVFWASWCTVCKAEFPGLHRVAEETGVPFYVISREPRDTREVVLEYMKTYPRFIPLLASDRDRPHEVAARFKVLGQPWTFVVDREGKVVALFAGRAGREALLDALLLAGADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thio-disulfide isomerase from Thermus thermophilus
rcsb
molecule keywords Thio-disulfide isomerase/thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermus thermophilus
total genus 39
structure length 143
sequence length 143
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ia1A00
3A2VA 2AAWA 1MDKA 5ECOB 1OE7A 5L71A 1SL2B 3M9JA 1EOGA 1YF1A 4J2FA 4JE1A 10GSA 2H8LA 1N2AA 1KBNA 2X8GA 5EPFA 4ECBA 1A0FA 5DVBA 2VCWA 1ON4A 3QDNA 1NM3A 2K18A 3MNGA 3SBCA 1GSFA 2OBIA 5ABRA 4V2MA 1TRUA 2IIYA 1URMA 1JZDA 4AJ7A 5HFKA 5CNWA 1ML6A 3HD5A 1K0OA 1SJIA 5IMFA 4WKWA 1GUHA 3MDKA 1OKDA 2X8CA 3HXSA 3GH6A 3ZMLA 1VF4A 1OC9B 2GLRA 5DJLA 3ERFA 4KSOA 1YQ1A 5J9CA 2P5RA 3CTFA 3ISOA 5J41A 3C1RA 1O73A 2YWMA 3QFAC 2HXKA 1GTUA 3TRQA 3GL3A 1GSQA 3ZVJD 1QQ2A 1J08A 2H74A 3WGEA 5JCWA 3GKXA 2N5FA 1ZGNA 2LEGA 3I69A 5DCHA 5H5SA 1LJRA 2Z9SA 3BOAA 4G2EA 3FK8A 4IBPA 2F3MA 4EUYA 2B6MA 1E2YA 2IWTA 3O76A 3WGXA 2HE3A 2DIYA 4CHSA 2I4AA 5B7CA 2FLSA 5IMAA 2PVOC 4N0VA 1F3BA 1Z3EA 5C04A 3D5JA 5CRDA 1ZYQB 5HFIA 2I1UA 19GSA 2R37A 2KP2A 5ECPB 3HY2A 4K2DA 4KAEA 1A0RP 1A8LA 1ILOA 6GSUA 2VM1A 2C3QA 3LGCA 3ZRDA 3Q74A 3J7Yk 2J9HA 4ECJA 1XFLA 4ZBBA 1R5PA 1A2LA 2A4VA 2FA4A 2PVQA 1SL1B 1A23A 3RHCA 5D93A 3GN3A 3ZLPA 6GSTA 1AIUA 3BJ5A 2RM5A 4ECIA 4RI6A 4TKYA 1DSBA 12GSA 1YF0A 4G9HA 2VUPA 2H30A 3CRUA 4YQVA 2F8AA 2F51A 3GNJA 2RM6A 1XOAA 3M1GA 2IFQB 5IPHA 3GTUA 2KHPA 1PSQA 3APOA 4Q5FA 1A8YA 1YDKA 1OYJA 3L4NA 3IAS2 2FD3A 3J7Yb 4NV2A 3FYGA 4EDYA 3UARA 4MF6A 5D9VA 3EVIA 1TP9A 2LS5A 3M8NA 3LXZA 3FR3A 4TOPA 2GSSA 2ON7A 5HFGA 14GSA 2VL3A 3LFLA 2CVKA 4J56E 3MSZA 2IMDA 2L4QA 2HSHA 2H70A 2K8VA 2VL2A 3GX8A 2DJ0A 1YKCA 2V32A 1WE0A 4WEYA 4ACSA 1WJKA 1F37A 2FWGA 5D73A 1G6YA 2OKAA 2KLXA 2WJUA 3I9V2 3QAGA 5EL8A 3TCOA 2K6VA 2CX4A 3TJJA 4XS4B 1BQ7A 2CVDA 3FW2A 5ECNB 4L0WA 1HNCA 2H1BA 4TN8A 1Y25A 1Z9HA 5CYYA 1GNEA 4OFTA 2YWIA 2C3TA 2VCZA 2YWOA 5B8BA 2LSTA 3ED3A 3FZ4A 4N30A 2C0DA 4MJBA 1MTCA 4PURA 3F6FA 4TR0A 3FZ5A 4IELA 3DWVA 4ZB6A 4GLTA 22GSA 2M80A 5IO0A 4X43A 3TOTA 2PGTA 2PPTA 4PGTA 1TW9A 1SK0A 4WF4A 5LCZA 1PX7A 4I5QA 3DGQA 1XWBA 1ZMAA 4V1Ag 1BX9A 3CBUA 6GSYA 4L8EA 6GSVA 2EIOA 4HDEA 5IM9A 1PA3A 2RLIA 5ECLB 4F82A 3CTGA 3VI5A 4PQHA 4TR3A 4EL1A 2DJJA 4GSNA 3KH9A 3KZQA 1XWAA 3P7XA 2V41A 3D21A 4KUNA 1K0DA 3W8SA 1Z6MA 3IC4A 1EP8A 4IJ3A 5CREA 2LJRA 3UMAA 2HYXA 4PNGA 3LJRA 4MA9A 2H6ZA 4IHUA 1U87A 1RW1A 1AQWA 4HJ2A 4D73A 5A4UA 4ISDA 4K6XA 1TRVA 4X1UA 4GWRA 4POKA 1ZL9A 1K0CA 2TIRA 4NXIA 1DUGA 3ZZXA 1ZCPA 2VLTA 3HHVA 3MWHA 2K9FA 4ZL8A 1OAZA 5CRGA 4L5OA 1HNAA 3H4KA 3TGZA 5AIXA 2CV4A 4KNDA 3QMXA 2ZNMA 4ZXGA 5ECIB 3TKSA 1HQOA 4ZL7A 4EDZA 3G9BA 4IKHA 4GCIA 4O92A 1B9YC 4L5LA 5CAXA 4HZ4A 2DJ3A 1CQHA 1ERTA 4MZBA 1T8EB 3GKKA 3ZYWA 5AN1A 1GULA 2HT9A 2IMIA 1NHOA 4KDXA 3I43A 1K0NA 2AB6A 4MZCA 1SD8A 4MABA 3KP9A 2R3XA 1XOBA 2MYGA 2OBKA 2E2GA 4ZIJA 1UC7A 3IBHA 5FT3A 5ECSA 3ZFBA 2DLXA 4P3YB 3TDGA 4EKZA 3F4SA 3RPNA 4ZILA 1X0RA 5B6MA 1TK0B 1V40A 4BWSA 3LEFA 1Y6EA 3L0HA 1SYXA 4IS0A 2YPMA 4CDOA 3ERGA 2CX3A 2VD1A 2DJKA 4DSSA 2CQ9A 2RIIA 3LYPA 1F2EA 1ERWA 2G2QA 3SWLA 2LNSA 1XWCA 1VF1A 2VL2C 2LRCA 5HR3A 3BCIA 1MDJA 4I8BA 2F8FA 2MMNA 3UL3A 5HR2A 1PKZA 1R7HA 3ZTLA 1GTAA 2WGRA 5ECQB 1MDIA 3EU4A 3DMLA 2HLSA 4MF5A 4EC0A 1O6JA 2FWHA 1TU7A 5LD0A 2I3YA 1AUCA 1NW2A 3FKFA 2H0GA 2J23A 3HJPA 3RBTA 2DMMA 1JZOA 3GA4A 1ERUA 2HZFA 2OJLA 1OC9A 4YAVA 2XPDA 4ULXA 3D4MA 2I9HA 3LWAA 5COHA 3MAKA 5J5NA 2PN8A 1M7TA 1MD3A 1GP1A 2GQKA 3ZITA 3QAVA 3IOSA 3ME7A 3R2QA 5ELAA 4TRXA 1QGVA 2CVBA 4BPYA 1Z6NA 3M0FA 4MDCA 1U3IA 5D8IA 1YY7A 2BMXA 1X9SB 4IJIA 1K0AA 4HOJA 1I5GA 3UAPA 5A4WA 2REMA 2M46A 1HYUA 4MMMA 2C4JA 3UOMA 5DQYA 2C0GA 3QFBC 3TKSE 1V2AA 4F2IA 4TXOA 1XIYA 2VLUA 2OACA 2XBIA 3TJFA 1GTBA 5IOWA 4I6XA 2NDOA 2V1MA 1MEKA 4KW6A 4K0NA 3KM6A 2AHEA 3KXOA 5LNKe 2ES7A 1NSWA 1EGOA 5JWOB 3L9UA 4K7OA 5GAPD 2FA8A 1WP0A 3FRCA 2VCTA 2IMKA 5D96A 3HYPA 3H93A 3GSSA 4Q5QA 3FZ9A 4OO5A 2GTUA 2I81A 1KNGA 4TXOB 2CA8A 1GSUA 2BTOT 4WETA 5JWQB 3A5WA 3Q6OA 1H75A 2OA7A 1OC8A 4DSQA 1LBKA 5G5EA 2LRNA 1XZOA 3NIVA 3TKPA 5KN2A 4GQCA 2TRXA 3RHBA 2ZUPA 3F9UA 5G1LA 3UVTA 3EMPA 1A2JA 2YN1A 2PERA 3RPPA 1EV9A 3K8NA 1TDIA 4FIWA 1QMVA 2GT6A 3GFKA 3IDVA 2IFQA 2JSYA 3GMFA 4EVMA 2MMZA 4ZBAA 5G2ZA 2L5LA 4N11A 4KH7A 3H8QA 5CRWA 1X9MB 1UVZA 3GYKA 2HNLA 4XIHA 3FR6A 1SU9A 3VWVA 8GSSA 5DALB 2EC4A 1SJ6A 2O87A 4K0GA 1J9BA 3C73A 5KN0A 2VLVA 4PUFC 2XBQA 1GRXA 2VM2A 2GT5A 2LNTA 1DBYA 1F6MC 5INYA 4OCFA 3IA1A 2H73A 4OWYA 2JZSA 2YWNA 3PH9A 1TOFA 2IMFA 2NTOA 4K7NA 3F3QA 4XRAA 1TRSA 4J57E 1J0FA 1WRYA 1YJ6A 4I97A 4XS4A 3LXTA 2PBJA 4MH2A 2PUKC 1R4WA 3EINA 4V1Ap 1JHBA 1ZYEA 3TKQA 4IN0A 5G31A 2M72A 3D22A 2IL3A 3QPMA 1T1VA 3IHQA 1FO5A 1EEMA 5AGYA 2CT6A 5ID2B 1K0BA 5GZZB 4ECCA 2V6OA 1U6TA 2LV3A 5JWRB 4I2UA 5IMCA 4F0CA 3EWLA 4NWYA 2YJ7A 2C0EA 3LSZA 3TJKA 4YQUA 5ECKB 5IMZA 4FYUA 4GQFA 2GVPA 4POMA 3VWXA 4AF2A 4QQ7A 2WDUA 2H75A 1H4OA 3VK9A 4HZ2A 3UBKA 5IPGA 4TR4A 2ALBA 3IV4A 4XTSA 2IPAA 4KA0A 3GKNA 2L6CA 1FOVA 1JLVA 5IOXA 3F8UA 1YEPA 1G7OA 1FB6A 4OFMA 2CZ2A 1XVWA 4XHMA 3L9SA 3IAM2 4LMVA 2JSZA 4IQAA 2A2RA 2N5BA 1GUKA 1B4PA 1W89A 3CYNA 2H1DA 4QL9A 2L5OA 1SKRB 1FVKA 4MK3A 5J9BA 2CZ3A 3GRXA 1EZKA 3QD9A 2DMLA 3HZ4A 3CSHA 2FHEA 4ILFA 3UJ1A 4BL7A 4WBRD 1M9BA 2VCXA 3D6IA 3IK9A 2QC7A 2HRNA 1SL0B 1K0MA 3F3RA 2L6DA 3A2XA 2DJ1A 2VL9A 2LKUA 4YAPA 1YZXA 1QFNA 3CSJA 5EY6A 3IRAA 1FAAA 2B3SA 4ID0A 1YKAA 3HVSA 2ON5A 1TI3A 4Q5NA 3HVXA 4EO3A 4N0ZA 3VLNA 3FEUA 4BA7A 3DVWA 4YH2A 1WIKA 2AYTA 2H0IA 1G0TA 4DSRA 2V2GA 3UIWA 5AIVA 1XW9A 2C8UA 3HJOA 3EE2A 1O81A 5G30A 20GSA 1O8XA 1JLWA 5J4UA 3BD2A 2HZEB 3IK7A 1K3OA 1T00A 2V6KA 1Z5YE 1K3LA 4KSMA 3BBYA 3OR5A 2P5QA 2R4VA 4H86A 2GZZA 4POBA 4NMUA 1TJDA 3C8EA 4PQ1A 3I6AA 4WR4A 1M0UA 2YZHA 3KJYA 5F07A 4AJ8A 4XRDA 4NAXA 3W6GA 1FW1A 1R5AA 3PR8A 3QOUA 2OE1A 2LJKA 3VURA 3C1SA 2L59A 5F0GA 3EC3A 4WXTA 2FWFA 2GQLA 3E0UA 4MZWA 3L78A 3HJMA 4ML1A 4F9ZA 4MPFA 3Q19A 1AXDA 1BEDA 1TK8B 2C80A 2X99A 3G7YA 2NVLA 4RQRA 2YJHA 1WWJA 4DEJA 2H6YA 16GSA 2XC2A 1B48A 3VWUA 4MJCA 1JZWA 3WT1A 1BAYA 4K9ZA 4LL1B 3DVXA 5DAKA 4XCSA 1IYIA 3IPZA 2VCVA 2WB9A 1ERVA 2B5XA 5HR1A 4DVCA 4JBBA 3KTLA 4IP1A 1PQNA 5JCUA 5ELGA 1GLPA 3ERWA 2GSRA 2PU9C 2VIMA 4GSTA 1EEJA 2B5EA 1T3BA 2H76A 4K8MA 1EWXA 2A2SA 1PMTA 3AY8A 2YCDA 1GSDA 4EF0A 6GSWA 5DAKB 2MBTA 1VF2A 5H5QA 2RUEA 3GV1A 4OO4A 4LLRA 2GDRA 3LG6A 5DDLA 13GSA 9GSSA 5ENUA 1HD2A 3PGTA 2VOCA 2C3NA 4Z7XA 3ZMKA 1JFUA 4HS1A 1SD9A 1RK4A 2H1AA 2B7JA 2HRFA 3IE3A 3ZVJA 5D9TA 1E6BA 1IYHA 1TK5B 3GKMA 4OFNA 4TW5A 1EOHA 4POLA 3ZREA 2VO4A 3G7JA 3FZAA 2AUVA 4O7HA 2B1KA 3E9JB 2GQMA 3EU3A 3UEMA 4PX1A 5F06A 3P90A 1QK8A 1BJXA 1M2AA 1SJZA 4IGJA 4V2LA 5EVOA 3RAZA 4E8EA 4CW9A 2MMOA 3KCMA 2IMEA 1ABAA 3GHAA 2R5GA 2FGXA 3GX0A 1XXUA 4K7IA 3DEXA 1WOUA 2JZRA 1EGRA 4G10A 1CQGA 1K3YA 1PX6A 2FY6A 2H0HA 4JR4A 4MLYA 4TR1A 4HI7A 3JCML 4QL7A 3KIJA 3EURA 2DBCA 3KMNA 3ZIVA 3IR4A 7GSSA 2YV7A 4RI7A 2AJQB 3H1NA 3US3A 4TVEA 1ZOFA 2C0FA 3D4TA 2WZ9A 5A4VA 1XWGA 2P31A 1AC1A 3QCPA 1SENA 3CSIA 3P2AA 5KN1A 3M9KA 3KP8A 1QUWA 5HQPA 4KDYA 3TRPA 3KH7A 3KD0A 1SK2A 5JCGA 4HU9A 3CRTA 1ACVA 4TR1B 1M2BA 2EIQA 4TXVA 3FHKA 2WULA 2QKEA 5FWGA 1BG5A 3V1WA 1XPVA 3VWWA 2YP6A 1KTEA 2JZTA 4MCUA 4XS1A 3DYRA 1Z7PA 4OD7A 4KE3A 2WCIA 4KB3A 1GUMA 2VD0A 3P8WA 2MBSA 2P0GA 2KP1A 5A5KA 5GSTA 2H72A 3NZNA 3O3TA 3S9FA 5DALA 1QXHA 1T4YA 2EIRA 4KGIA 2TRCP 3C71A 4O5RA 2O7KA 4FH8A 1JZRA 1F9MA 4OMVA 4FYCA 4IVFA 3F0IA 4LMWA 3TUEA 3HCZA 1UA5A 3TKSC 2WRTA 4AJ6A 2O85A 2DSAA 1AW9A 1PN9A 4K1FA 2YANA 5J3RA 4NV5A 1M9AA 3GUSA 4IQ1A 1XBSA 5FHIA 1DE2A 3F4RA 3HKRA 1PL1A 4NHWA 5IIZA 2NPBA 1PKWA 4PNFA 2IN3A 1TKDB 2OE0A 1AQVA 1WMJA 1B9XC 1THOA 1A2MA 5DCGA 1B4QA 1RQMA 2YV9A 1GSYA 2JU5A 5ID2A 5IMDA 3EYTA 5ECHB 4V2NA 4KCAA 3GSTA 4E8HA 5DJMA 2FWEA 4HQZA 2LTKA 4JEDA 2GZYA 2JACA 4NHZA 1X9WB 1W4VA 2O8VB 1UN2A 2RUFA 3D0ZA 3FR9A 4GSSA 5C00A 2YNXA 2LJAA 4KDUA 2KUCA 4RQXA 1MD4A 1VGLA 3DD3A 3GH9A 5D9XA 2WFCA 1EV4A 2H19A 1I9DA 4F0BA 6GSSA 2C1YA 1ST9A 4WF5A 3GTUB 3A2WA 2NBSA 2E7PA 1PL2A 3VI7A 3PINA 1HNBA 1USBA 4AGSA 2B7KA 3WT2A 1X5DA 3O6TA 1S3DA 5KN3A 2PWJA 1FG4A 18GSA 2CAQA 5KEJA 1THXA 2HSYA 4MH3A 3DKSA 3EMXA 5E59A 4ZBDA 1U3AA 4HU7A 2PMTA 2VCQA 2X8HA 4Q5RA 2L57A 5ECRB 2HI7A 4MF7A 4LL4B 2N5AA 1U88A 1T4ZA 3F63A 1FVJA 4HUAA 2GS3A 4PQIA 3N5OA 4KX4A 4BVYA 4EE0A 1OVNA 1O85A 3TKRA 4XS6A 1AQXA 2IJYA 2O89A 2B1LA 3C7MA 3RDWA 2GGTA 4PUAA 1M2DA 2GSTA 4HJMA 1XW5A 2D2ZA 3H79A 1PGTA 5DBQA 5HR0A 5CO3A 1GL8A 1C72A 3QR6A 2GZPA 3WGDA 1Z7RA 5AISA 3UBLA 2HZEA 5GAND 3LORA 1O8WA 4WBJA 2HFDA 5CP1A 1EP7A 3Q18A 1KEBA 4N10A 2GSQA 2H6XA 1XW6A 2OADA 1BYEA 4LA1A 1ZZYA 2R6KA 2X64A 1V98A 3FY7A 4GF0A 3HDCA 2FCHA 4JZQA 4KCEA 2L4CA 2BJXA 3ZL5A 1V9WA 2WS2A 4WR5A 1PRXA 2FNOA 5DQSA 4YQMA 1XCCA 1LU4A 3KEBA 3BCKA 5B6NA 3GIXA 2H1GA 1F3AA 5H5RA 4JRRA 2K8SA 2LQQA 3WD6A 1TTZA 3TRXA 2FUG2 2JADA 1FHEA 2G0FA 5G1KA 4MJAA 4O32A 1V58A 3HVVA 4BWQA 2YOIA 4L0UA 3TJGA 4ZB8A 1SKWB 1GSSA 1YEXA 4EXJA 3UVHA 4MJEA 2DIZA 2MMAA 4MPGA 5E4WA 1S3AA 5B8AA 1GTIA 1R26A 4OCEA 3CMIA 3TOUA 4D73B 3VFIA 17GSA 2CAIA 4PXOA 1WPIA 1N8JA 5G5FA 3CXGA 4JU5A 2OE3A 2JL4A 4GRFA 1AAZA 2DC5A 4NPBA 3DRNA 4ZB9A 4RUVA 1A24A 2XHFA 3M3MA 5IO2A 2XPEA 1TI1A 2KOKA 5F05A 3KGKA 11GSA 4BVXA 3U5RE 3E3EA 3QAWA 5GSSA 2VAFA 4I2TA 3LQ7A 3KMOA 3GURA 3DIEA 4G19A 3HA9A 3N9JA 4FO5A 3NOFA 5IQYA 1XVQA 1OC3A 1PD21 1TXXA 2F9SA 3TB2A 3APQA 1V57A 5F8BA 2E2MA 3APSA 2YZUA 2H71A 3HZ8A 5ECMB 1SKSB 1GNWA 3F4TA 4GXZA 4HQSA 3WYWA 1SK1A 1GH2A 5IMVA 1FB0A 1GSEA 4ML6A 1X5CA 3DXBA 1GWCA 1SYRA 1X5EA 2R2JA 1OE8A 1TU8A 1G7EA 1OKTA 3VPQA 3L9VA 1TRWA 4X0XA 1XWKA 1Q98A 3TJBA 1VF3A 2LUSA 3A3TA 2E0QA 3G7IA 3ME8A 5CRHA 4MP4A 4HEA2 6GSXA 1O7UA 3LYKA 4F03A 2ZCTA 4IW9A 1T7PB 1VRSD 3VPTA 2H01A 1B8XA 1Q4JA 2B5YA 4IP6A 2QSIA 2QGVA 3W8JA 2MZCA 2AV4A 4DSSB 3IXRA 1GLQA 1NHYA 2LQOA 5D9WA 3ZFLA 2LRTA 1M99A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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