3IA1A

Crystal structure of thio-disulfide isomerase from thermus thermophilus
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
AVKPGEPLPDFLLLDPKGQPVTPATVSKPAVIVFWASWCTVCKAEFPGLHRVAEETGVPFYVISREPRDTREVVLEYMKTYPRFIPLLASDRDRPHEVAARFKVLGQPWTFVVDREGKVVALFAGRAGREALLDALLLAGADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thio-disulfide isomerase from Thermus thermophilus
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Thio-disulfide isomerase/thioredoxin
total genus 39
structure length 143
sequence length 143
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ia1A00
1FVKA 2C4JA 1EGRA 5CREA 1AXDA 1JZOA 2LRTA 3LYPA 4PQHA 4K0GA 1CQHA 3CSHA 4PUFC 4JRRA 3I43A 3TKSA 4IVFA 5IPHA 2FHEA 1XVQA 1XVWA 4QL9A 1GTAA 2VCVA 5DAKA 2AAWA 3QR6A 3QAVA 5CYYA 2OE3A 1K3LA 3U5RE 4EO3A 2VCXA 2WRTA 2F51A 2X64A 2G2QA 2RUEA 3ZL5A 2R6KA 5G5FA 3LORA 5ELAA 1X0RA 4PNFA 1ZL9A 4KSMA 2YJHA 1IYHA 3KTLA 1HD2A 2O85A 3HZ4A 3IV4A 2CAIA 3CMIA 1OE8A 1TRVA 1V40A 3CXGA 2MYGA 5J5NA 3VK9A 5D93A 2L4QA 2R2JA 1YQ1A 5EPFA 1TU7A 4HOJA 4MDCA 4HU9A 2R3XA 6GSTA 4AF2A 2H76A 1GSFA 3MNGA 5CRHA 3Q74A 3UBLA 3GTUB 4MPGA 1B9XC 2JZTA 4ZL8A 1BQ7A 2A4VA 1SD8A 4BA7A 1SK1A 5ECNB 1R5PA 3ZTLA 2IMIA 5HR0A 2H01A 1GSUA 3L0HA 2BMXA 2VIMA 3HVXA 1Z3EA 1TRUA 4OWYA 3K8NA 1ZZYA 1KNGA 1THOA 3N9JA 4GXZA 2XPDA 5JCUA 3UMAA 3TJBA 3M3MA 4WR4A 2REMA 3BCKA 4ACSA 1WRYA 4BWQA 2H6ZA 3P8WA 3SBCA 2LNTA 4CW9A 1M99A 3UEMA 2XPEA 3L4NA 3ZZXA 5LCZA 3D6IA 1GP1A 3ZVJA 3EYTA 4X0XA 2RUFA 4DVCA 2IFQB 2NVLA 3DD3A 1XZOA 2I9HA 2H74A 5IMZA 3F3RA 1WPIA 3FZAA 1AUCA 5H5SA 4ZB6A 4NXIA 2B5EA 3JCML 4L8EA 1GNWA 2HI7A 5ID2B 1GTBA 3EU4A 4KB3A 3ERGA 2LQQA 4F82A 3W6GA 5JCWA 2VO4A 1PQNA 3F6FA 3LWAA 3APOA 3GSTA 1X9SB 4PQIA 2DJ0A 4XRAA 4ZBBA 5F05A 5F06A 1SKSB 2F9SA 2VOCA 3HHVA 1BAYA 2IMKA 3QDNA 4ZB8A 1V58A 5ENUA 3VI7A 1ACVA 4ECCA 2AUVA 2YZUA 1AQWA 3M8NA 3GFKA 4KSOA 5ECSA 2B3SA 2DC5A 3IPZA 2IWTA 2N5FA 1JFUA 3MAKA 3DWVA 1VGLA 1G6YA 2IMFA 4I97A 1K3YA 3IDVA 4EUYA 5INYA 3W8SA 4IJIA 4ML1A 6GSYA 5ECPB 4ZBAA 5DVBA 4N11A 4NWYA 5DALB 2H66A 2A2SA 3KIJA 2FWFA 2P5QA 4FO5A 3F9UA 3GKNA 1SYRA 4IHUA 5B8BA 2E2MA 5DQSA 1AIUA 2OJLA 3QOUA 4PXOA 2VLTA 4D73A 4ZILA 4CHSA 2PMTA 2MMOA 4IQAA 1FVJA 4PURA 2FY6A 2L6CA 2QKEA 2FUG2 2R37A 1XPVA 4MCUA 4JEDA 2CQ9A 5B6NA 4ECJA 4MLYA 2B1LA 3RPPA 1S3DA 5AISA 4E8HA 2JZRA 2PVQA 1U3AA 1LJRA 1UC7A 4JU5A 4TR4A 2RM6A 4NMUA 2GT6A 2AV4A 2IJYA 2I81A 2NBSA 1E2YA 1X5DA 3DMLA 1MD4A 4KE3A 1EV9A 4MA9A 2CA8A 4F9ZA 3LYKA 2HSHA 4N0ZA 3UVHA 3SWLA 1A2JA 2PBJA 3RHBA 3ED3A 1GUHA 3FR3A 3G9BA 2FWGA 4TKYA 4KA0A 4Z7XA 2C1YA 3D22A 5GAND 2X8GA 1OC9B 2WDUA 4PQ1A 3EWLA 4E8EA 1MD3A 5LD0A 3CTFA 3LJRA 3TKPA 1VF2A 3IBHA 1JZDA 2IN3A 1HNBA 2VCZA 3FEUA 1XW9A 4MF7A 2GSSA 3O6TA 5ECIB 2RIIA 2V6KA 5JWOB 4IJ3A 4ULXA 3QMXA 2ON5A 2OBKA 3BBYA 2CT6A 4V1Ag 1Y6EA 2GLRA 2VLUA 3IAM2 2VM2A 1XWCA 2GZZA 3EVIA 3IR4A 1AC1A 2XHFA 4GSSA 1YKAA 1NW2A 1C72A 4HQSA 1PSQA 2X99A 1YY7A 4MJAA 1QGVA 3C1RA 3I9V2 5KN1A 4KCEA 4F0CA 3EU3A 1PGTA 1YEPA 1TU8A 2L4CA 4XS4B 1FOVA 1JZWA 1NSWA 3UL3A 3TJJA 1W89A 1F6MC 3FZ9A 4YAVA 4EVMA 3TKSC 1WJKA 4JR4A 1O85A 3HYPA 5IOWA 3FR6A 2D2ZA 5ECOB 1XWGA 3ME8A 2M46A 3A5WA 1AW9A 3TRQA 4ML6A 2IMEA 2N5BA 4JZQA 5CRDA 2C3QA 2O7KA 1SKRB 2RM5A 1K0OA 1FG4A 1M9AA 4GF0A 4OFNA 1AAZA 3IE3A 4BWSA 4ECIA 2XC2A 3V1WA 4IQ1A 1B9YC 2KLXA 5EVOA 2EIQA 1JHBA 4ISDA 3Q19A 4HZ4A 3GYKA 2FA4A 3KXOA 5KN2A 1GUMA 1R26A 2PN8A 4I2TA 4OMVA 2TRXA 4DSSA 13GSA 3ZLPA 2R5GA 4TR1B 4K7OA 1WP0A 4IP1A 2CZ3A 1G7EA 4KW6A 2LUSA 3G7JA 5GSSA 3D4MA 3IRAA 1GH2A 1O8XA 1I5GA 1SJZA 3CSJA 1TK0B 1A0RP 3N5OA 4QQ7A 3RPNA 3ZFBA 2HYXA 4PX1A 2VL9A 3BD2A 1TK8B 4Q5FA 4IN0A 2TRCP 2G0FA 3IK7A 2GZPA 2LKUA 2CZ2A 3WT2A 5DAKB 1EOGA 3UARA 5B8AA 2KHPA 1WIKA 2H6XA 3EE2A 1BX9A 4KDUA 1F37A 3LXTA 1GNEA 4HS1A 1EOHA 5IO0A 4XHMA 3TOTA 2LS5A 3G7IA 2OA7A 1ZYEA 1KTEA 4IGJA 1XOAA 2HLSA 2JU5A 2O89A 4OFTA 2DJ3A 2FWHA 2L5OA 1JLVA 1MDIA 3LQ7A 1FB0A 3LFLA 5F0GA 5CAXA 2DJKA 1PKWA 1FO5A 2KP1A 3KMNA 5FWGA 2YWOA 4GQFA 3HXSA 2FD3A 5EY6A 1MDJA 1QMVA 3DEXA 2I3YA 5JWRB 1K0MA 2B1KA 4FH8A 2H72A 1OYJA 2QSIA 5ELGA 3DKSA 2OE0A 2V1MA 1OAZA 4IW9A 2VCQA 3J7Yb 2LSTA 3F3QA 3TJGA 2WB9A 3P90A 3PH9A 1M2BA 3QAGA 2K9FA 3VURA 1FW1A 5KN0A 4F0BA 4XTSA 4HJ2A 1G6WA 3L9SA 4AJ8A 4TR0A 3VWUA 4MPFA 3TKSE 2VUPA 1UA5A 5D9WA 1Z7PA 1WOUA 2P31A 2HZFA 2JZSA 4HZ2A 3PGTA 5CRWA 1A23A 5DDLA 1GLQA 1SK0A 2YWNA 2OE1A 1PKZA 1TDIA 1QXHA 2BJXA 1GUKA 3KGKA 4AGSA 5GSTA 3HJOA 4IP6A 1M0UA 2PGTA 1BG5A 4RQRA 1OC8A 2CVBA 4EE0A 3WYWA 2GQKA 4IELA 3NIVA 3G7YA 3TCOA 4MF5A 1GSEA 3QFAC 2JSZA 2MZCA 2C80A 3KD0A 4MMMA 1Q4JA 1K0DA 1RQMA 4K8MA 3GL5A 1XWBA 1ABAA 3KMOA 2RLIA 3ZYWA 4KAEA 4I2UA 2CX4A 4TXVA 1TOFA 1F9MA 4EF0A 3QFBC 3IK9A 2Z9SA 2VCWA 3C8EA 4IBPA 5IMVA 1SD9A 1I9DA 2LJKA 4HDEA 3TRPA 4K2DA 4DSQA 3ZIJA 5H5QA 1PA3A 5IMFA 3KP8A 2FA8A 2LQOA 3RBTA 4XIHA 2JL4A 1U87A 2DIZA 2HZEA 1T1VA 1SL0B 4BVXA 3HZ8A 2GSTA 3F4TA 1B4QA 1A2LA 1ON4A 3VWVA 4G9HA 1HQOA 3CBUA 2C8UA 2LJRA 1F3AA 5B7CA 1DUGA 5CO3A 2DJ2A 3KP9A 2H8LA 3OR5A 3P7XA 2IIYA 3F6DA 3C1SA 2B5YA 4WEYA 1SJIA 5B6MA 3LSZA 5ABRA 1O73A 2YWIA 5G31A 3WD6A 4WBJA 2L57A 1TI3A 4ZL7A 2L59A 5IO2A 3VWWA 1V2AA 2B6MA 1K0NA 4L5OA 1BEDA 3GNJA 2LRCA 18GSA 4EC0A 6GSVA 1WMJA 2X8CA 4K0NA 5F07A 19GSA 1ILOA 5J9BA 1HNAA 5AIVA 1T8EB 1M2AA 5E59A 3EURA 4GCIA 2H19A 1T7PB 5IPGA 1OKTA 3TGZA 2PVOC 4GRFA 1MDKA 4F2IA 4D73B 3WGDA 4LL4B 2R4VA 3H93A 1BYEA 1R4WA 1ERVA 3C7MA 4J2FA 4KGIA 1YDKA 3MWHA 4YAPA 3QD9A 3HVSA 3D21A 2B7JA 1PD21 4XRDA 1OE7A 5HFIA 1DBYA 3GUSA 3ZIVA 1YZXA 2JSYA 2FLSA 2GGTA 4ZL9A 5A4WA 5E4WA 5EL8A 3WGXA 2DJ1A 4KUNA 3HDCA 3RAZA 2CX3A 2H30A 1J9BA 1GL8A 2VCTA 5C00A 4Q5RA 1XFLA 1TKDB 1AQXA 4ZIJA 2KOKA 5KEJA 5AGYA 2H70A 4ZB9A 2WFCA 2CV4A 3EC3A 2VL2A 2M72A 4IS0A 3F4RA 2P0GA 1TRSA 2VD1A 1USBA 3KTBA 1K0CA 7GSSA 2YWMA 1ST9A 3TUEA 2GT5A 11GSA 4DEJA 3E3EA 2ZNMA 3D0ZA 1X9WB 4MF6A 3ZITA 1Q98A 3VPQA 4KDXA 5AN1A 3HY2A 2GQMA 1SKWB 3VFIA 2K18A 1EEJA 2V2GA 2VM1A 4O32A 1JZRA 1QUWA 3E0UA 4CDOA 3ZFLA 3FYGA 2MBTA 4J57E 1EEMA 2QGVA 4POKA 4MZCA 1ZOFA 4RI6A 4KDYA 1Z6NA 4OO5A 1SYXA 3D4TA 2ON7A 1H75A 1HNCA 3HVVA 2GDRA 3BJ5A 4I6XA 4ZXGA 4NPBA 2DJJA 1V57A 3DRNA 1ERUA 1T3BA 3GMFA 2DLXA 1GRXA 4XS1A 3LGCA 5CRGA 2V6OA 5JWQB 2IMDA 2KUCA 3KH9A 5D73A 1GULA 4HI7A 2MMZA 4K6XA 5GZZB 1B48A 1OKDA 2WZ9A 3ZMLA 2MMAA 2ZCTA 4J56E 4HJMA 4N0VA 3BCIA 1FAAA 1V9WA 2NTOA 3TOUA 5G1LA 4K1FA 2GTUA 4F03A 5JCGA 2VAFA 3CSIA 3ZMKA 3VLNA 1FHEA 3A2VA 4LMVA 4PGTA 4K7NA 1MTCA 2OACA 4KX4A 4RUVA 4PNGA 4V2LA 4TR3A 3D5JA 1XXUA 3LG6A 4WXTA 5G30A 1VF1A 3GURA 4JR6A 2JADA 1TXXA 1IYIA 1NHOA 2F8FA 1EZKA 2FNOA 3TKQA 2OADA 4PUAA 3BOAA 1O7UA 3F0IA 4V2MA 4FYCA 1GLPA 1X5EA 4H86A 4KH7A 1GTIA 2BTOT 3HA9A 4LA1A 3F8UA 1Z7RA 4DSSB 3C71A 4HEA2 2H1BA 5KN3A 4HU7A 3GKXA 2FCHA 3H1NA 2I1UA 4POLA 5GAPD 4MZWA 3AY8A 4TXOA 4GTUA 1UVZA 3UOMA 2H0GA 2K6VA 1S3AA 4G19A 2IL3A 4EDYA 3UJ1A 4O92A 4LL1B 3GHAA 3WT1A 2HT9A 2C0DA 1TK5B 1XCCA 2WCIA 1J08A 1A8YA 2C3TA 4AJ7A 3WGEA 5G5EA 2LV3A 4K7IA 2PPTA 3CTGA 10GSA 17GSA 3KCMA 3IXRA 1GSYA 2YANA 1YF1A 3M9KA 3ZRDA 2HRNA 2F3MA 1GSQA 2DMMA 4NHWA 5A4VA 4TRXA 1TRWA 2WJUA 5A5KA 3DIEA 20GSA 4V2NA 4WR5A 1RK4A 1T4YA 4NV2A 5IMDA 5D8IA 5DCGA 1EP7A 1A8LA 2GQLA 1SL2B 3M1GA 14GSA 4MJBA 5ECRB 3TB2A 3MSZA 2LJAA 4BPYA 1PMTA 2HFDA 1VF3A 3PR8A 1SENA 5ECMB 1PX7A 2GSRA 1QFNA 2GS3A 4POMA 5D9XA 2OBIA 1ERWA 1ZYQB 3IOSA 3QPMA 4FYBA 3QAWA 2F8AA 1TW9A 1AQVA 3L78A 4ZBDA 3FKFA 1ZCPA 2HNLA 2VD0A 4G10A 2WS2A 1O8WA 4EKZA 2MMNA 3FW2A 4DSRA 1H4OA 1K3OA 3O3TA 4FIWA 3RHCA 4G2EA 1FB6A 3M0FA 2H0HA 5J41A 4ILFA 2PU9C 4MH2A 3HJMA 1X9MB 3FK8A 3S9FA 2KP2A 1R5AA 1XWKA 5D9TA 1T4ZA 2DSAA 4YH2A 1Z9HA 5J4UA 2PWJA 4HQZA 1MEKA 2YCDA 4OCEA 3F63A 4JE1A 2C0GA 3TRXA 2B5XA 5COHA 3GTUA 4MJEA 2K8SA 1ERTA 1NHYA 3GH6A 3KZQA 1A0FA 4L0UA 2AHEA 2H1GA 4OD7A 2L6DA 4JBBA 5HFGA 5HR1A 3GSSA 1YJ6A 5DBQA 5H5RA 3L9UA 1S3CA 3TJKA 3F4SA 4I5QA 3QCPA 2H0IA 3L9VA 2YOIA 1EP8A 3H4KA 3RDWA 2K8VA 5AIXA 2N5AA 3DVWA 5CP1A 2YV9A 3DXBA 5IOXA 2H71A 4WETA 1SL1B 5J3RA 2C0FA 3HD5A 1TTZA 4QL7A 5A4UA 2HZEB 3IC4A 5DCHA 1YEXA 4O7HA 3IA1A 2YZHA 2DBCA 2LRNA 1G7OA 5IIZA 3VPTA 4FYUA 5L71A 4IKHA 2P5RA 4P3YB 2HXKA 2YNXA 2VLVA 5F8BA 3KEBA 1YKCA 3KJYA 1VF4A 4TW5A 2IFQA 2LEGA 1R7HA 1EWXA 1PN9A 4GLTA 4X1UA 1N2AA 4Q5QA 2JACA 4L5LA 5LNKe 2YJ7A 2LNSA 1BJXA 2HE3A 3I69A 3FZ4A 2VL2C 2IPAA 4I8BA 4EDZA 2GZYA 2L5LA 5ID2A 2WGRA 2HRFA 2E2GA 4WBRD 1QK8A 4OCFA 1KEBA 1A24A 3NZNA 1TJDA 5G1KA 3J7Yk 3HKRA 3DGQA 1LU4A 9GSSA 1OC3A 4NV5A 4N30A 2EIRA 5D96A 2AJQB 3CRUA 6GSWA 4L0WA 6GSSA 2NDOA 4AJ6A 4GWRA 1T00A 3FRCA 4O5RA 2DMLA 3Q18A 4K9ZA 4OO4A 5ECLB 5D9VA 4BL7A 2GSQA 5HFKA 3KH7A 4HUAA 3IAS2 1GWCA 5ECHB 1GSSA 3TJFA 4MABA 5DALA 3DYRA 5HR2A 1HYUA 4NAXA 1XWAA 3GIXA 1F3BA 2C3NA 2EC4A 2OKAA 2FWEA 5HQPA 1SJ6A 5ECKB 3P2AA 1X5CA 1XW6A 6GSUA 4EXJA 2EIOA 3APQA 1XW5A 2YV7A 4TN8A 1PL1A 3APSA 3VWXA 4POBA 5HR3A 1KBNA 1Y25A 3GRXA 4EL1A 1EGOA 1JLWA 5IMAA 1DE1A 3PINA 3GV1A 3TKRA 1PX6A 3GX8A 5IMCA 4WF5A 5J9CA 1E6BA 3TDGA 3H8QA 2LTKA 1M7TA 3Q6OA 4ID0A 1TI1A 3U6VA 1URMA 2AB6A 2YN1A 1Z6MA 1ZGNA 1LBKA 4RQXA 2CAQA 1EV4A 1QQ2A 1YF0A 3A3TA 4X43A 1U88A 2YPMA 22GSA 3GKMA 1G0TA 2M80A 5DJLA 2NPBA 1U3IA 3GN3A 3I6AA 3GL3A 1M9BA 2TIRA 2H1DA 2YP6A 2DIYA 3FHKA 2WULA 1U6TA 1TP9A 4WKWA 1V98A 4WF4A 2O8VB 1OC9A 5DQYA 1GTUA 2B7KA 3CRTA 3HJPA 1ML6A 1W4VA 3EMXA 3LXZA 3ZREA 4N10A 3DVXA 4Q5NA 3LEFA 2GVPA 3NOFA 5FT3A 1CQGA 3FY7A 5IQYA 1J0FA 2CVDA 2V32A 2MBSA 1A2MA 1WWJA 3EINA 1K0AA 2J23A 4YQUA 2E0QA 3A2XA 3IHQA 4LLRA 2ES7A 1F2EA 2ALBA 2FGXA 4MK3A 4YQMA 1RW1A 3W8JA 2H6YA 2ZUPA 1PRXA 2O87A 5G2ZA 1SK2A 3FZ5A 4KNDA 1Z5YE 2XBIA 5DJMA 3E9JB 4XS4A 16GSA 4V1Ap 3R2QA 5IM9A 3GKKA 1PL2A 3H79A 4GSNA 12GSA 3KM6A 2H1AA 4MP4A 2V41A 4YQVA 2AYTA 2X8HA 4MH3A 3UAPA 3M9JA 1XBSA 3ERFA 3GA4A 1M2DA 5C04A 4MZBA 6GSXA 1K0BA 2J9HA 3GX0A 3C73A 4TXOB 1OVNA 1THXA 1B8XA 1DSBA 4RI7A 1VRSD 4TVEA 3UIWA 2HSYA 4ECBA 3ERWA 3VI5A 1DE2A 1N8JA 2H73A 2H75A 4MJCA 3O76A 4XS6A 1O6JA 4GSTA 4GQCA 2C0EA 3UVTA 5ECQB 4LMWA 1NM3A 2XBQA 8GSSA 4KCAA 3EMPA 4NHZA 3MDKA 3FR9A 2QC7A 5FHIA 3US3A 3GH9A 4TOPA 4TR1A 2PERA 3ISOA 1B4PA 1SU9A 4XCSA 4OFMA 1XOBA 1GSDA 1UN2A 2I4AA 3A2WA 2E7PA 2VL3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite